1RNHA

Structure of ribonuclease h phased at 2 angstroms resolution by mad analysis of the selenomethionyl protein
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
151
structure length
151
Chain Sequence
LKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
publication title Structure of ribonuclease H phased at 2 A resolution by MAD analysis of the selenomethionyl protein.
pubmed rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE HI
total genus 43
structure length 151
sequence length 151
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1990-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rnhA00
4Z4GA 3AVLA 3TAEA 4FK2A 2D5RA 2KFZA 4DF8A 1R0AA 1DTTA 1FK9A 3HVTA 5C24A 4IG0A 2RF2A 4OPJA 1D8YA 1VRUA 4J2AA 4CHNA 3F73A 1VSHA 1SV5A 2XO7A 2PYJA 4FJKA 3AO3A 2GBZA 4CFBA 3V1OA 3RMDA 4NCAA 3LAMA 1U4BA 1TK8A 2Z1IA 3OJUA 3OJSA 3K59A 2XY7A 2F96A 4M3TA 3WNGA 1JXEA 4CF2A 1CXQA 4RW8A 5HLFA 4ID1A 1LW0A 3K5NA 4FLUA 3QLHA 3V9XA 2HHVA 4W5NA 1W0HA 5DK5A 3ZSRA 1WAJA 2NUBA 1L5UA 4Z0UA 1BCOA 1U47A 2EHGA 3TI0A 2XY8A 3CFRA 2G8HA 3L2WA 1TV6A 3LWMA 3NHGA 3V6DA 4KTZA 5HRNA 4B9LA 3TR8A 4LH5A 3OYHA 2FBYA 4DS4A 2GUIA 4RW4A 3NGZA 3PUFA 3OYNA 3KLGA 5KRTA 2PY5A 1TKXA 1RNHA 4B9TA 3AVBA 1X1PA 2X78A 1Z25A 1HNIA 1RBRA 1RT4A 3NF6A 4FVMA 4ZTJA 3HT3A 2PYLA 3AVFA 3C6TA 3P1GA 2BDPA 1ZBIA 3AO2A 3S9HA 3LWLA 1W9HA 4KHSA 3F9KA 1RTDA 3BGRA 5FROA 4FW2A 3LP1A 4CF9A 2E6MA 3VA0A 4ELUA 4DSIA 4CFDA 4TSXA 4KHNA 3QEPA 3KLEA 1L3VA 4CEFA 4I7FA 2VG6A 2ZQBA 3CM5A 2VWJA 4DQQA 5HROA 4IBNA 2JLEA 1B92A 3A2FA 3B6PA 4B8CA 4BDPA 4FJJA 1YVUA 3RRGA 4FJXA 1RT1A 3AVHA 3PO5A 3NF9A 1UA0A 4CHYA 4ELTA 3NH1A 1ASWA 3D0PA 1L3SA 4KHYA 3NF7A 2P5GA 4BDZA 5K14A 2Y1JA 3QINA 3T1AA 2PZSA 1KFSA 3ZT0A 3V9SA 2X6NA 3VQ7A 4N5SA 5J2QA 2DFHA 2KZMA 4E3SA 4MFBA 3AV9A 3H08A 3E01A 5EU7A 1UOCA 2Z1HA 4DLGA 4DU3A 4DTNA 4HCBA 1QSSA 4B3OA 3M8SA 3ZT2A 4FJIA 4K8ZA 2ITGA 4H4OA 1WSJA 4Q5VA 5KGWA 4NYFA 1LAVA 4OKJA 3QEVA 1KVBA 1RDCA 4F2SA 4FZYA 2B5JA 3LZIA 4I9QA 2YV0X 1NJYA 4O0IA 1HPZA 4CK2A 3QIOA 3OYGA 1L3TA 1BIUA 1KLNA 3SUNA 4JS5A 4KI4A 2WONA 3LP2A 1HRHA 2Q3SA 4BWJA 4DTUA 4C8NA 4OLAA 2O4GA 2HHSA 1ASUA 2KQ2A 3G10A 3ZT1A 5I42A 1TAUA 1VSIA 2YKMA 5JS1A 3V9WA 4GW6A 1X9SA 4C8OA 2HNZA 4CEOA 1VK0A 1VSMA 3IG1A 4PA1A 3ZT4A 3QEWA 4ICLA 2G8WA 4CGJA 4HUFA 3L8BA 4CJQA 2OPPA 3SNNA 3TAMA 2D0CA 1EX4A 3AA4A 4EP4A 4FCYA 3MEDA 1K6YA 1LWEA 5HP1A 4I2PA 2WOMA 4F4KA 2HNDA 4FJ9A 4F3TA 1CZBA 1IG9A 3VQPA 2JGUA 2AJQA 1RT2A 4QOZB 4F2RA 4CJ4A 4CJUA 2G8VA 4L8RB 4CJPA 3OVNA 1JLAA 4CK1A 4OKEA 5CY4A 1FKOA 2HNYA 3VN5A 1S1TA 3RR8A 4OKKA 4CEEA 1S9EA 1WSIA 3HPGA 2Z1JA 5KI6A 3OS1A 1JL1A 3K58A 3C6UA 4CERA 4CGDA 1BCMA 2HHQA 3U3YA 3SUOA 2IOCA 1LWCA 2KZZA 2IGIA 3V81A 1TK0A 3OYDA 4GVMA 1GOCA 3VQBA 4B8AB 3RMBA 1U49A 3RRHA 3HK2A 1C0UA 3OS0A 4KB1A 1TAQA 4CHOA 5KGXA 4FLZA 4CEZA 4HUEA 3L3UA 1Q9YA 1D5AA 3DLEA 1A5XA 1QE1A 1IKYA 1TGOA 3QO9A 4OGEA 4UQGA 1U48A 1DLOA 1RDAA 1NOYA 2F8TA 3QNNA 3SI6A 4CJKA 1RBUA 2EX3A 4B9NA 4RG8A 3IAYA 4DQIA 3NE6A 2GV9A 3V9UA 2YNHA 3L3VA 3OYJA 1QS4A 4CJRA 5SZTA 3NH0A 4KHWA 3WNFA 3DLBA 3C94A 1NK5A 4JLHA 2HHUA 3VA3A 3TABA 3FFIA 5C42A 3OYMA 4ID5A 4FZXC 2XY5A 1KCFA 3MXJA 2YNGA 3U3GA 2KW4A 1NKCA 3S3NA 3KLIA 3M8QA 3THVA 4AHVA 1NK7A 4BDYA 1SL0A 2HHTA 1U45A 3LPUA 1O1WA 2OPSA 3LAKA 3NF8A 1B9DA 4KAZA 4CGFA 4E7JA 3DRSA 4CEAA 3O3HA 3PO4A 1BGXT 1I3AA 4BWMA 5I3UA 2FBVA 2LSNA 3V9ZA 4J2BA 1VSEA 5JS2A 1IKXA 4CF0A 4HHTA 1HQUA 3SQ0A 4ZTFA 1XI1A 4AHTA 3B6OA 3HPOA 3HPHA 3T3FA 2HVIA 1KTQA 4DSJA 4M3ZA 1L3UA 3DMJA 4E7LA 3ZSQA 4CIFA 1BISA 4CECA 2HW3A 3G0ZA 2G8FA 3ISNC 3AVKA 4KHUA 3TAQA 4Z4CA 4FK4A 1REVA 4E1MA 3KLFA 2E4LA 1VSFA 1J9AA 5HRSA 4CHPA 3KK1A 3CQ8A 3VQEA 3PX6A 3DOKA 4Z4EA 1SL1A 3L2QA 1C1CA 3ZSOA 4DTMA 4FJ7A 4LH4A 3AVNA 4PWDA 4KHQA 3ITHA 4ELVA 1GOBA 4I2QA 3DLGA 2P5OA 3L2UA 4DQRA 1YTUA 2FC0A 3NGYA 4AHSA 3AA2A 1T03A 2IDOA 1XHZA 3WNEA 1N6QA 2R7YA 4DQPA 2OZSA 3RMAA 1SKRA 1RBVA 4KO0A 4FXDA 1SL2A 3AO1A 1RTJA 4FJ5A 3MXMA 1UA1A 3SV4A 3QNOA 1RILA 3ZSXA 1X9WA 1TL1A 1TKTA 3TARA 3DRPA 1WNSA 1S1VA 1BHLA 2VG7A 1J53A 3KIOA 1JLFA 4E19A 4PQUA 4EP5A 3HXMA 3P83D 5T7BA 3SYZA 4JS4A 4FM1A 5FRMA 1C0MA 1I39A 4H4MA 4DTRA 3EYZA 4CJ3A 4DU1A 4AH9A 4AHUA 2DY4A 2OPRA 2YHBA 4RW9A 1C6VA 2DTUA 1IKWA 4CJWA 3LPTA 3K5OA 4M41A 4CF1A 4CGGA 5J2MA 4DTOA 3PV8A 4DS5A 2QKBA 3KD5E 3U6FA 3NAEA 4ZHRA 3C95A 4OJRA 3KK2A 3KLHA 2HHXA 3V1QA 1JLQA 4FJMA 1S6PA 4IFVA 1XWLA 3NFAA 1IO2A 3K5MA 2XRIA 3KKRA 3LP0A 4GMJB 1RTHA 2OYQA 1HNVA 2YHAA 4B9SA 4M3UA 4DFKA 4CFAA 3OYFA 1KFDA 3LALA 3AA3A 1Z26A 2RKIA 3DI6A 3HYFA 4BACA 4FJNA 3TAPA 4FM2A 1S1XA 1D9FA 4OGCA 2FBXA 1WN7A 4JRQA 1NJZA 4DMNA 1Q8IA 1NKEA 4Q0BA 1Q9XA 4DTXA 2E6LA 3KJVA 4B9MA 3AA5X 4M3XA 1XC9A 1EETA 4DU4A 4N47A 3QESA 1NJWA 4AILC 3EY1A 1NK6A 2W42A 1VSKA 3P5JA 3LDSA 3I8DA 4CHQA 3LANA 3QEXA 1RT7A 4DSFA 5CYQA 5J2PA 4N76A 3VQQA 1RT3A 3OY9A 3O3FA 4Z4HA 1JL2A 3D45A 2P51A 4HVJA 3TAFA 1NK4A 2OA8A 2OZMA 3RTVA 2XY6A 3TAGA 4C8LA 1T05A 1JXBA 2BE2A 3AVGA 2YNIA 1C1AA 3NDKA 2XHBA 4DF4A 4FJ8A 2HHWA 2D0AA 1C0TA 4MQ3A 1LAWA 1BQMA 2B6AA 3SCXA 1NJXA 1HYSA 4R5PA 4G1QA 1FXXA 1WSHA 1D9DA 2QXFA 2ATQA 4OLBA 4LD0A 1TKDA 1VSLA 3OYIA 4NCGA 2P1JA 1Y97A 4OVLA 3OYBA 1TKZA 4N56A 3DOLA 3L2RA 2KFNA 4FYDA 1RBSA 1BI4B 2KTQA 4M45A 4B08A 5FRNA 3SQ2A 3SZ2A 1KVAA 4CGHA 4FM0A 2IAJA 1EXQA 3SUQA 4B9UA 3OYLA 3AO4A 3ZCMA 3AVJA 1WLJA 4LSNA 3LZJA 4W5OA 1WSGA 4Y1CA 3KTQA 4E0DA 3CM6A 1RTIA 3O4QA 4FLXA 4OPKA 4LY7A 4DTSA 1KVCA 3HSTB 1BL3A 3JYTA 2IS3A 3AVIA 3SV3A 1WAFA 4O4GA 3DLRA 2Y1IA 4PY5A 2X74A 4KV8A 1QHTA 2HMIA 3AVAA 3K57A 1ZBFA 1JKHA 4CIEA 1IKVA 2VG5A 4IDKA 2DFFA 4IFYA 1RDBA 1MU2A 3VQ6A 4AHRA 3QETA 2RN2A 5HBMA 5KTQA 1N5YA 4WE1A 3VQAA 4DSLA 1HMVA 4HCCA 3HJFA 2HVHA 4KFBA 4H8KA 3HP6A 4FZZA 1LV5A 1SUQA 4RW6A 4DQSA 4YFUA 3DM2A 1NKBA 3IRXA 3T19A 3PX4A 4DLEA 4KTQA 1KRPA 2BANA 1HJRA 4CEQA 1S1UA 4KRFA 4I9LA 1QSYA 4CGIA 1WSEA 1YTAA 3AVCA 4EZ6A 3ULDA 3DLHA 4DTPA 5KRSA 4CJTA 3HM9A 3QERA 1QSLA 1GOAA 3MEGA 1VSDA 4CJEA 4FW1A 2G8IA 4E7KA 4EZ9A 1S9GA 4AHCA 4M3YA 3ZSWA 4LSLA 3HL8A 3VQDA 4N41A 2F8SA 1RCHA 4F3OA 1A5VA 5D3GA 1S1WA 4IKFA 4M42A 4RW7A 4DFMA 4B9VA 1NK8A 2G8UA 1S6QA 4HTUA 1JLGA 3VQ4A 2G8KA 3PY8A 3VQ8A 4NYNA 3M8PA 1T8EA 4M3RA 3CFPA 3RWUA 1LW2A 1LWFA 4DG1A 4E1NA 1EKEA 2DFEA 4Z4IA 3I0SA 2OPQA 4CCHA 1TL3A 3SJJA 2ZE2A 4J2DA 3CFOA 3RR7A 2A1SA 2X6SA 4O0JA 5CYMA 1TK5A 1UAXA 3OYKA 1RDDA 3ZSYA 4Y1DA 4FLTA 3NH2A 3CG7A 3KD1E 4KPYA 1ZBLA 4E7HA 4FK0A 4KREA 3OYEA 3WNHA 4C8MA 2QKKA 1HYVA 3AVMA 1G15A 4FJHA 1JLBA 4KKOA 3ALYA 2YNFA 1UWBA 4Z4FA 4M3WA 1WSFA 2YKNA 5J2NA 4HUGA 1J54A 1NK9A 4YNQA 4DSKA 3SPYA 3SQ1A 4BE1A 2FBTA 3O3GA 1BQNA 1HQEA 5J1EA 3QIPA 1C1BA 1HYZA 3VQ9A 4E89A 5DMRA 1A5WA 4CK3A 1EP4A 3PX0A 4CJLA 2ZD1A 4CF8A 1JLCA 1TVRA 3S3MA 3MAQA 4CEDA 4CHZA 4DSEA 3SQ4A 1RT6A 3RMCA 1SKWA 3BDPA 5HRPA 5E41A 1ZBUA 4W5RA 1KLMA 4IG3A 3OYAA 3IS9A 2BGGA 4DFJA 3K5LA 4W5QA 4KI6A 1XHXA 1BI4A 3I0RA 5SWMA 1J5OA 3SPZA 4CE9A 4F8RA 1ITGA 4QAGA 4C8KA 4CEBA 2B4JA 3MEEA 1KSPA 2QK9A 3OYCA 2RPIA 4FLVA 3CYMA 4DTJA 3QEIA 4DWIA 3VQ5A 4KB0A 4E7IA 1B9FA 2IC3A 4CJSA 3MXIA 3S3OA 4JRPA 3NGIA 3OS2A 3AO5A 2O4IA 1CLQA 1F21A 4O44A 4CESA 1FKPA 5FDLA 3O4NA 5HRRA 1NK0A 3EZ5A 4FJLA 1ZBHA 1VSJA 3V4IA 1RBTA 2A1RA 1T7PA 3L2VA 2ETJA 3JSMA 4J2EA 2I5JA 3K2PA 3M8RA 3DLKA 3NBPA 3HVRA 1S5JA 4XIUA 1ZYQA 3MECA 3DYAA 3NCIA 1X9MA 1QTMA 4QCLA 3KK3A 3HO1A 2D0BA 1JLEA 3ASMA 4CIGA 3ZSZA 3TANA 4NCBA 3HP9A 5CZ2A 1VRTA 3UIQA 4CJ5A 3ZT3A 4KTWA 4K8XA 1ASVA 4CJVA 4CJFA 1BIZA 1RT5A 3TWHA 4FLYA 5C25A 3DRRA 4DFPA 1QQCA 4O5BA 2VWKA 3KKSA 1IH7A 2Z1GA 3V1RA 4CFCA 3SUPA 3LP3A 1YT3A 1CZ9A 4O55A 4W5TA 1CXUA 5CZ1A 4FLWA 4FJGA 1SKSA 4BE0A 4BE2A 3ZSVA 1DTQA 3VQCA 1NOZA 2HB5A 4PUOA 1U04A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K0SA 3O9QA 3AVLA 3F2KA 3TAEA 4WFBL 1DTTA 3HVTA 2P9KB 3TU5A 3HRGA 1D8YA 4H0VB 4H0OA 4CHNA 3F73A 2PYJA 3AO3A 4IXCA 3V1OA 3KHYA 3OJUA 3OJSA 3K59A 2XY7A 2YI1A 3BEXA 3WNGA 3VF6A 1JXEA 4B3TK 4RW8A 1NLVA 2QWNA 3V9XA 2HHVA 5DK5A 3R9PA 1BCOA 4H5VA 3NHGA 3V6DA 2VQEK 1TUYA 4B9LA 4LH5A 2FBYA 4DS4A 5EX5A 3R3LA 4FPAA 4CZKA 3CCVN 1NMDA 5KRTA 2PY5A 1TKXA 4WQ4A 1Z25A 3CCSN 4FVMA 4YOWA 3H45C 1ZBIA 3AO2A 1VQ6N 1W9HA 4BY9C 3F9KA 3R6MA 4FW2A 3LP1A 3VA0A 4KHNA 4BRFA 3QEPA 1L3VA 4CEFA 4I7FA 2VWJA 4IBNA 3L6QA 1B92A 3A2FA 4B8CA 5B8HA 3C6AA 5C2FA 1GLAG 2WFBA 3D0PA 3NF7A 3WQTA 1O13A 3QINA 4MLHA 1SQKA 5AZJB 1KFSA 3ZT0A 3V9SA 5J2QA 5AQGA 2KZMA 3N4PA 4DLGA 4DU3A 1X3NA 4K8ZA 4H5WA 4Q5VA 3FFKB 5KGWA 4X65K 3CXCM 5LY3A 1LAVA 3QEVA 2B5JA 4JI6K 4I9QA 3IMXA 2YV0X 1XQSC 4O0IA 4CK2A 4JKCA 2YX6A 3SUNA 2WONA 1IBKK 3IDHA 1VQNN 2Q3SA 4RCHA 3G10A 1E3MA 5JS1A 4GW6A 3FZMA 3K9KA 2IVOA 3F5TA 2HF4A 4K0KK 3TAMA 4LF9K 3AA4A 1BA1A 4BC3A 3LDOA 2HNDA 3CCQN 1IG9A 2AJQA 4KH4A 4JI1K 4CJUA 4L8RB 4YOVA 1FKOA 1S1TA 3CPEA 2NRVA 2OANA 1VHXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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