1SAZA

Membership in the askha superfamily: enzymological properties and crystal structure of butyrate kinase 2 from thermotoga maritima
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MFRILTINPGSTSTKLSIFEDERMVKMQNFSHSPDELGRFQKILDQLEFREKIARQFVEETGYSLSSFSAFVSRGGLLDPIPGGVYLVDGLMIKTLKSGKNGEHASNLGAIIAHRFSSETGVPAYVVDPVVVDEMEDVARVSGHPNYQRKSIFHALNQKTVAKEVARMMNKRYEEMNLVVAHMGGGISIAAHRKGRVIDVNNALDGDGPFTPERSGTLPLTQLVDLCFSGKFTYEEMKKRIVGNGGLVAYLGTSDAREVVRRIKQGDEWAKRVYRAMAYQIAKWIGKMAAVLKGEVDFIVLTGGLAHEKEFLVPWITKRVSFIAPVLVFPGSNEEKALALSALRVLRGEEKPKNYSEESRRWRERYDSYLDGILR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of butyrate kinase 2 from Thermotoga maritima, a member of the ASKHA superfamily of phosphotransferases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable butyrate kinase 2
molecule tags Transferase
source organism Thermotoga maritima
total genus 114
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature ec 2.7.2.7: Butyrate kinase.
pdb deposition date 2004-02-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1sazA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1sazA02
4PKGA 4EHTA 2P9NA 3LDPA 3ULEB 1GLLO 5EX5A 1BDGA 4WQ4A 3CI5A 5BN8A 4BQZA 4BRCA 4M63C 4L3QA 1NGJA 1K8KA 1BG3A 4K42A 3VGMA 3W0LA 3L6QA 2Q97A 2ASOA 3TU5A 1D4XA 3A5NC 1NGDA 3UB5A 3AAPA 4Z94A 3HZ6A 3QFPA 5FPMA 2VWBA 3BF3A 3VESA 5CE3A 3D2FB 2ZGZA 2QWOA 2QM1A 2E2PA 4AM7A 3CJ9A 4FL9A 2YI1A 1GLAG 4CD1A 5JMVA 4GY2B 3UKRA 4ISGA 3FZFA 3ZETB 3BP8A 2E1YA 3AY9A 4WQ5C 1V4SA 1G99A 3UKUA 4A2AA 3CJBA 3ZX0A 1RFQA 4FWPA 4O8KA 4BREA 1HKBA 2I7PA 3VEXA 4CZHA 2IVPA 1HPMA 4BG8A 1GLFO 1NWKA 2NZTA 4CBWA 1SZ2A 2GWKA 4WQ4C 2QWNA 3BF1A 5BPNA 2QWMA 4H5TA 5AR0A 2NRHA 3C7NB 4I6MA 4IJNA 4KBOA 4BR0A 2D0PA 2W41A 5FPNA 4H0OA 1QQMA 4BR2A 1TUUA 1LOTB 3O6WA 3EL2A 3WXJA 2P9KA 3L4IA 2A40A 5LJWA 4CD3A 1GLJO 2V7YA 3MCPA 1JCGA 4F9OA 2FF6A 4CJ7A 5AZJB 4DQ8A 3MN5A 4HTLA 3ZEUB 4A62A 3J8AA 2P9UB 1KAYA 1S3XA 1C0GA 1NBWA 1BA1A 1BA0A 1QQNA 5BPLA 3GG4A 3M1FA 2Q1NA 3D2EB 3CJAA 4BRLA 5JLHA 1HX1A 4LC9B 3VENA 3A5MC 3O1WA 5EY4A 1NM1A 5AQZA 3WEEB 3CERA 1NGCA 4B1XB 2FF3B 4H03B 4A2BA 2P9PA 4BC5A 4CZJA 4JAXA 3LDQA 5AQNA 1X3MA 4M7YA 2P9IA 2YJFA 2QWQA 5BRDA 3CJCA 3GL1A 2ZGYA 1YXQA 4M7XA 2A6AA 4FSVA 4FWMA 5JICA 3VEOA 3O08A 3SJHA 3LM2A 1QQOA 3ENOA 4CBUA 3GBTA 2I7NA 3LL3A 3BEXA 3VPZA 3CETA 3QICA 1Z6RA 1GLCG 1U2VA 4BRKA 3H45C 3EN9A 4YDUC 1NGGA 2P9NB 2Q2RA 1X9JA 1X3NA 4PKHA 1H1VA 3FZHA 1IJJA 4QS9A 5AQPA 3LDOA 1ZC6A 4MLHA 1NLVA 3IFRA 2A42A 4H5WA 3MN7A 3VGLA 2J4RA 2A3ZA 3F9MA 1K8KB 1NGIA 3QFUA 5JLFA 2YCHA 1HLUA 3WT0A 3W3DA 5AQFA 1OKJA 4IO8A 2V7ZA 4FOIA 4BROA 2IIRA 1NGBA 1GLBG 3WUHA 4H0TB 4FO0A 3UKRB 3GE1A 3VF4A 1ATRA 1MWKA 3QMLA 4BC3A 1DKGD 1BU6O 3UKUB 4BGAA 1Q18A 1Z05A 3ULEA 2P9SA 4IZ9A 4NO7A 1QZ5A 3JS6A 3KHYA 4FOEA 5BRFA 4AM6A 4FWQA 2Q36A 3P4IA 5AQIA 2V51B 3A8YA 3I33A 2DPNA 2W40A 3GDQA 4FWOA 3WXIA 2E2NA 1ZBSA 1SAZA 4I6MB 3SK3A 3LDLA 3QBWA 1NGHA 4BR5A 1NGFA 2KHOA 4B1UB 5AQGA 1LCUA 3C0BA 2FLOA 3OHRA 5AQMA 2AP1A 3WQUA 3DXKA 5ELZA 3FZKA 1HUXA 1DGKN 1U6ZA 3SLCA 4CZLA 4EHUA 2D0OA 4BRAA 2P9LB 4H5NA 4FPBA 1ZXOA 2EWSA 4BRHA 2BUPA 1DEJA 3BUZB 4JD2B 3HTVA 1IG8A 2FSNA 2F9WA 4XH1A 4BC2A 4YDUA 5KPTA 5AQUA 4FWLA 2E2OA 4H0YB 3U9ZA 4H5VA 5EXWA 2BTFA 4DHYA 4BR4A 2E1ZA 4K43A 3HSCA 2VYPA 1XUPO 3ATVA 4EAHD 5BPMA 1GLDG 2OANA 2P9PB 4CZMA 1EQYA 3FFKB 2CGJA 4XH4A 3JXUA 3VEVA 3O5BA 3C7NA 2YHWA 1WOQA 5AZIA 2P9IB 3B8AX 5BN9A 3R6MA 1T44A 5KQDA 4B1YB 3DAWA 3CQYA 2GWJA 2Q0RA 4BRFA 3H46O 3RSEA 5EOYA 2HMPA 3H3OB 2FXUA 5F2RA 4B1ZA 4O5FA 5I9EB 3A5LC 1JCFA 5AQVA 3EKSA 1U2VB 3GOIA 4JHDA 2D1KA 3HBTA 2IVNA 3QDKA 3O4WA 3S41A 4WYBA 4ISFA 4BRIA 2HF4A 2AA4A 3DXMA 3U4LA 5AQSA 3VETA 4BRGA 2A5XA 2QWLA 3H3NO 4NB4A 2F9TA 3EZWA 3IMXA 2GTDA 2VCPA 4H5RA 4J8FA 5AQJA 3VGKA 4CZEA 1QHAA 3WEEA 1TYQA 3M6GA 4BRNA 3SMPA 3WXLA 1RGIA 3WQTA 4K41A 4FWNA 3KVGA 4DB3A 1GLEG 2QWPA 1KAZA 3FZLA 2QWRA 3VERA 4E1JA 2UYTA 4QS7A 4GNIA 2E2QA 4JNEA 2H3GX 2QXLA 1ATNA 5BR9A 4FPAA 1YVNA 4ISEA 2FSJA 3DWLA 5AFUA 3DJCA 3R8EA 3VF2A 3MN6A 1BOTO 4IWVA 5FPEA 5AQKA 2P9SB 4RWTA 4IXCA 4BG9A 1Y64A 1J6ZA 5ADXA 3R9PA 4RCHA 4BVPA 4EFHA 1ATSA 1NGEA 3EO3A 3CHWA 4BR9A 1MWMA 5KPZA 1KAXA 4B1VA 2ZWHA 5FPDA 2GUPA 2ITMA 4DCHA 1BO5O 4BRMA 4CI6A 4CZGA 3O1BA 5F1XA 1S22A 4BRQA 3FE1A 2E20A 2Q31A 1T6CA 1E4FT 3M3ZA 2CGLA 2A41A 3DXKB 3ENHA 1E4GT 5AQLA 4BRDA 2YHYA 1T6DA 3QB0A 5B8HA 4BGBA 2ASMA 4XEIA 4BQLA 2P9KB 3AARA 3FGUA 5AQXA 1QZ6A 2GELA 5BREA 1XC3A 1BUPA 2WUSA 1TUYA 4QS8A 2PAVA 4BRPA 3D2FA 1RDWX 1NMDA 2E8AA 2HF3A 2ZF5O 3H1QA 3U8XA 2Q0UA 4H0XB 4Y0WA 4A61A 3ZX3A 3ZETA 4PL8A 3VEZA 4XH5A 4BR7A 1HKGA 4EIAA 1WUAA 3FZMA 5AFUH 4C23A 3AAQA 3L0QA 3ID8A 3VEYA 4CZFA 4H0VB 5E84A 3TPQA 3VOVA 4FWSA 5AQYA 5AZIB 5ADXH 3CJ1A 3IUCA 1HJOA 1C0FA 3MDQA 3A0IX 4B1WB 4H0PA 2IVOA 5BRHA 4JN4A 3G25A 4CZKA 5LJVA 2FSKA 3RSEB 2CGKA 3HI0A 4CBXA 4K25A 1P8ZA 1BWFO 2CH6A 3VEWA 4B9QA 1MA9B 3ZX2A 2ASPA 2QW9A 3ATUA 2V52B 4JHDB 2P9LA 3D7EO 3O8MA 1R59O 4FWKA 3KZBA 4JD2A 3O80A 4BVOA 2YHXA 3VF6A 5EVZA 3UE5A 2D4WA 3CJ7A 3DXMB 1KXPA 4HWIA 1JCEA 1XQSC 4IJAA 1V4TA 5AZJA 4MO4A 5AQQA 3ZEUA 2P9UA 5KPRA 4PKIA 3MN9A 3H1VX 1TYQB 3CIPA 3LDNA 3D2EA 3A5OC 5AQWA 5TKYA 3FR0A 3MK6A 4RTFD 1HKCA 3IDHA 3WXKA 2GEMA 3H6EA 3CQXA 2YJEA 3FLCO 2HOEA 2CH5A 5AQRA 4PL7A 3SMSA 3HM8A 1NGAA 5AQOA 4FWRA 5LY3A 4CZIA 5KQ8A 5E26A 5AQHA 1ESVA 1MDUB 3QBXA 1SQKA 2NLXA 4BC4A 5F0XA 3LM9A 1YAGA 2E88A 4WQ5A 4MLEA 1YUWA 1CZAN 3I8BA 3EKUA 3U9DA 2PBDA 4MO5A 3MMVA 5AQTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G6EN 1VRUA 3ULEB 3EE9A 2X78A 1VSIA 5EX5A 4CCHA 3OS1A 1LV5A 3CI5A 3HXMA 4NYNA 4CJ5A 2NRVA 1VRTA 3NBPA 1JL1A 1C1AA 5GIOA 4NYFA 4C8KA 2AJQA 1YJWN 2ASOA 4B08A 1D4XA 2Z1IA 1RTIA 1FXXA 1NGDA 3AV9A 3MEDA 3RWUA 1HNZK 3AAPA 4X62K 5FPMA 3EY1A 5CE3A 2OPRA 4DTMA 3QESA 3PO4A 4R5PA 1KLNA 5JMVA 3FZFA 3BP8A 1L3SA 3SV4A 4FJ5A 3PUFA 3QIOA 1V4SA 4A2AA 3CJBA 1RT7A 4IFVA 3ZSYA 4FWPA 2E6LA 2FBYA 2IVPA 1HPMA 4BG8A 4B9VA 5C12A 3OYDA 1J54A 2KQ2A 2NZTA 4NLBA 1D9DA 2QWNA 3BF1A 3VTIA 1VQON 5AR0A 1RDUA 4BR0A 2W41A 2E5LK 1QQMA 1ZBFA 4YOVA 3KLFA 3RMAA 1LOTB 4OLAA 3SUQA 1Q82O 4HVJA 4PWDA 2VG5A 3L4IA 3DOKA 4CESA 3LP2A 4FJLA 4E19A 3MCPA 3KIOA 1JXEA 3HO1A 4FJGA 5AZJB 1CZ9A 4HTLA 1S1UA 4A62A 4B8AB 1TGOA 2P9UB 4B3SK 3S3NA 2HBMA 3KD1E 1BA1A 4JI4K 4IEIA 1EWRA 4A59A 2IGIA 1JKHA 3V1OA 4BRLA 4K0KK 4J2BA 3O1WA 5EY4A 3CERA 1NGCA 2IAJA 2FF3B 3MX5A 4JAXA 3H08A 1HNIA 4JS5A 4M7YA 3KKRA 2I5JA 4CK1A 4IDKA 3QEWA 3CJCA 3CM5A 1TK0A 4FM0A 4B8CA 4FWMA 4FSVA 5M1PA 5JICA 4FVUA 3VEOA 3SJHA 4LD0A 3ENOA 3F73A 2I7NA 3HVRA 3BEXA 2YKMA 3MXMA 1RCHA 1GLCG 3OW2M 4KFBA 3EN9A 1RTDA 1TKDA 4JS4A 3LALA 1NJIO 4QS9A 3VQ8A 4BE0A 1ZC6A 3G10A 3IFRA 2A42A 4CE9A 3ITHA 1IKXA 3O3FA 3MN7A 3OYAA 3G0ZA 1NGIA 2O8EA 3V9SA 3QFUA 1KVAA 3CMAN 1L3TA 5GAHP 4CEBA 4FOIA 4DUYK 3LP1A 1RDAA 3RRGA 1GLBG 3GE1A 2HVHA 3QERA 1TAUA 3HOTA 1S1TA 4W5RA 5DK5A 1OH5A 3CCEN 1HQEA 4AHUA 4BGAA 2KW4A 1WB9A 1FK9A 1B9FA 4KHPK 3E1YA 2P9SA 1ITGA 4HCBA 4FWQA 4G1QA 3P4IA 3SI6A 3DLLL 3A8YA 1BCOA 1EO1A 4FWOA 3GDQA 1W9HA 1ZBSA 4O44A 4BE1A 4BR5A 4C8OA 1NGFA 3NVMA 1KC8O 3LWLA 4CFCA 4KHUA 1DT9A 3JSMA 3OS2A 3DXKA 1HUXA 3Q7CA 3LP0A 4CZLA 2PYLA 4EHUA 3RRHA 3NGIA 5I3UA 1KVCA 4I9LA 1RTHA 3HT3A 2EWSA 2HHUA 4GMJB 4BRHA 4DF4A 4HTUA 3NH2A 2FSNA 4BC2A 4CFAA 2NRWA 3LPUA 4YDUA 5KPTA 4OKJA 2E2OA 2DFFA 3U9ZA 4M3YA 4H5VA 5E41A 5EXWA 2BTFA 1REVA 1BIZA 1SL2A 3AGKA 4OX9K 3EEQA 2UUBK 2O8BA 1D8YA 5BPMA 1GLDG 2OANA 2NUBA 3FFKB 1IBLK 2CGJA 3JXUA 1RBVA 3VEVA 1N33K 3C7NA 2YHWA 4Q0BA 4KH5A 5C15A 3CXCM 3ZT4A 3AO4A 3VQPA 3J7AP 5SWMA 4B9LA 3AVKA 4B1YB 3NDKA 2ZD1A 1E3MA 2ETJA 3TANA 1FKPA 1SKSA 4AHTA 2YNFA 4B3RK 3NGYA 4WE1A 4OKEA 3CFOA 1BI4B 4JHDA 4JI8K 4DWIA 4KHSA 2BGGA 3HBTA 2VG7A 2IVNA 1ZYQA 4ISFA 4B3MK 1C6VA 3PIPL 5AQSA 2NRRA 4MDBA 2QWLA 4NB4A 3EZWA 3IMXA 2GTDA 3VGKA 4J8FA 1KLMA 4CJUA 4F3TA 3ZSQA 3RR8A 2O8EB 1RGIA 4DB3A 2QWPA 3FZLA 3PIOL 2UYTA 5IWAK 4CJSA 4JNEA 4ELVA 4LF9K 4B9SA 5BR9A 4FPAA 3WNGA 4KB0A 1TKXA 3R8EA 3K58A 3V9XA 3MN6A 3C94A 4CECA 3HPOA 4IWVA 4FK2A 5KGWA 2P9SB 1NOYA 1TK8A 3L2UA 4BG9A 2HBLA 1ATSA 5J1EA 4N76A 1WAJA 4ELUA 3PSFA 4DR6K 1LAVA 1Q9YA 1X9WA 4CW7B 4CZGA 2HW3A 1S22A 4IDHA 1UA0A 3FE1A 4CHNA 5H1SQ 1D9FA 3NH0A 1SV5A 1QSLA 3C6UA 3L2RA 1RDBA 3DLKA 3DXKB 1J5OA 1E4GT 4CJ4A 1LW2A 1T6DA 5B8HA 2P9KB 3AARA 3FGUA 5BREA 1XC3A 2WUSA 4JI3K 4BRPA 3D2FA 1UWBA 1RDWX 3OYGA 5JVGL 3CM6A 3H1QA 3OYMA 4H0XB 3I8DA 4Y0WA 4OPJA 4DQSA 4BR7A 1HKGA 1WUAA 5AFUH 1RBSA 1T3VA 2O8BB 3AAQA 4H0VB 4KHNA 1WSJA 4FWSA 4ILJA 3AO1A 1S1WA 3KWGA 4I9QA 2FBTA 3SNNA 4FZZA 1C0TA 4BDYA 5ADXH 1HJOA 1C0FA 4FYDA 5BRHA 2IVOA 1SKRA 5LJVA 2FSKA 3HI0A 2CH6A 3NFAA 4QCLA 3M8PA 4PY5A 2ASPA 2W42A 4JHDB 3CD6N 2VWJA 2HNDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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