1TUYA

Acetate kinase complexed with adp, alf3 and acetate
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
MKVLVINAGSSSLKYQLIDMTNESALAVGLCERIGIDNSIITQKKFDGKKLEKLTDLPTHKDALEEVVKALTDDEFGVIKDMGEINAVGHRVVHGGEKFTTSALYDEGVEKAIKDCFELAPLHNPPNMMGISACAEIMPGTPMVIVFDTAFHQTMPPYAYMYALPYDLYEKHGVRKYGFHGTSHKYVAERAALMLGKPAEETKIITCHLGNGSSITAVEGGKSVETSMGFTPLEGLAMGTRCGSIDPAIVPFLMEKEGLTTREIDTLMNKKSGVLGVSGLSNDFRDLDEAASKGNRKAELALEIFAYKVKKFIGEYSAVLNGADAVVFTAGIGENSASIRKRILTGLDGIGIKIDDEKNKIRGQEIDISTPDAKVRVFVIPTNEELAIARETKEIVETE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Methanosarcina thermophila
publication title Structural and Kinetic Analyses of Arginine Residues in the Active Site of the Acetate Kinase from Methanosarcina thermophila.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acetate kinase
total genus 132
structure length 399
sequence length 399
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2004-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuyA02
2E2OA 2D0OA 1XQSC 4A2AA 5BN9A 3B8AX 4H5VA 3HSCA 3EKSA 3WEEA 1YAGA 4CD1A 1HKGA 2ZF5O 3U8XA 5FPMA 5AQFA 1U6ZA 3FR0A 2WUSA 4FWPA 3IUCA 3VPZA 3UKUA 2A5XA 2P9IA 3VESA 1TYQA 4FL9A 4H5WA 4IXCA 4JD2A 1P8ZA 4BRHA 1MDUB 4BRCA 5B8HA 1JCFA 3BUZB 3SJHA 4FWKA 3VF4A 4CBXA 5EXWA 4B1VA 5I9EB 4FWRA 3RSEA 2CGKA 4BC4A 1QZ5A 2I7NA 4I6MB 3D2EA 5AQHA 2FSJA 4JNEA 4XH1A 1NBWA 1ESVA 3QDKA 4FWQA 4YDUA 1LOTB 4ISFA 1GLLO 3CJAA 3A5OC 3ATVA 4BRNA 3O4WA 3SLCA 1ZC6A 2P9SA 5AQQA 4QS9A 4K43A 2VWBA 5JLHA 1G99A 2NZTA 4O5FA 4PKHA 1J6ZA 3DXKB 3HZ6A 4H5RA 4BGAA 5BRDA 3G25A 5EOYA 3A0IX 5AFUA 2HMPA 3O8MA 3WQUA 3FZLA 5AQNA 3W3DA 2IVNA 2A41A 1Q18A 3HM8A 5F1XA 3J8AA 1Z6RA 3O1BA 1K8KA 4K25A 4BRLA 5EY4A 2QWOA 3D2FB 3VENA 4BRGA 1X3NA 1NWKA 2D0PA 3H6EA 1U2VB 3WXKA 4BRIA 4O8KA 4BGBA 3P4IA 3CETA 3FZFA 3WXLA 4C23A 5AQSA 4BC5A 1IG8A 4Z94A 1NGJA 3DXMA 3QFUA 5E84A 2P9PA 2V7YA 4FSVA 3WEEB 3VF2A 4BREA 4FWLA 1HPMA 3F9MA 2ZWHA 3FZMA 5AQGA 4CJ7A 4H0PA 5KPRA 4BR5A 5FPEA 4BRDA 4WQ4C 4QS7A 4FWSA 3UKUB 4EHTA 2P9IB 3BP8A 5LJWA 4MLEA 2YI1A 4JD2B 3CIPA 3FFKB 3U9DA 3VETA 3QBWA 3RSEB 4EIAA 4H0OA 3IFRA 1TUYA 3D2EB 3AAQA 1XUPO 3IDHA 3FLCO 2E2PA 4DB3A 1V4TA 5LY3A 4BG9A 3O80A 3LM9A 4WYBA 5AQIA 2YHYA 5AQKA 2CH5A 3D7EO 1EQYA 5BPNA 4EAHD 2BTFA 4FO0A 2ASPA 2P9SB 4CZHA 5KPZA 4H5NA 3ENOA 1MWKA 2ASMA 3GE1A 2P9NA 4IJNA 4M7XA 5AZJA 2E20A 4EHUA 2HF3A 3VGMA 3TU5A 3MK6A 3VEWA 2OANA 3H1QA 2QWPA 1KXPA 1RDWX 3QB0A 3VERA 4BVPA 3SK3A 1IJJA 3H45C 1DEJA 1RFQA 1K8KB 5F0XA 4CD3A 5EVZA 5BR9A 1BO5O 4H0XB 4H0VB 4FOIA 2GWJA 3VEOA 5CE3A 1ZBSA 5FPNA 3MN6A 4YDUC 2YCHA 4CI6A 1NGIA 2Q97A 1MWMA 2FSNA 3DXMB 2P9LA 2P9PB 1NGGA 3U9ZA 3JS6A 3GG4A 3SMPA 1KAYA 3DAWA 5JLFA 1LCUA 4RTFD 4BR2A 1BWFO 3CJBA 3ZETA 3AAPA 4CZKA 1HUXA 2F9WA 3HI0A 3AARA 1HKBA 3BF3A 2E1YA 4K41A 3TPQA 3VGKA 4BQLA 3R8EA 4MLHA 3I8BA 3DJCA 4IJAA 5E26A 5BN8A 3BEXA 3WUHA 4CZIA 5BPMA 1SAZA 2ZGYA 3FZHA 3H46O 4MO5A 3R9PA 3M3ZA 3IMXA 2FLOA 3QBXA 1HX1A 3QFPA 5AZIA 3VEYA 1KAZA 5AQTA 4BR4A 2ZGZA 2ITMA 1GLFO 3M1FA 5EX5A 2J4RA 4A2BA 3LDNA 1ATRA 2V7ZA 2QWNA 3O1WA 1NGCA 1NGHA 2EWSA 2P9NB 2GELA 4HWIA 2A42A 3SMSA 3M6GA 5AZJB 2AP1A 3MDQA 4KBOA 3JXUA 3MN7A 1CZAN 3VOVA 1BU6O 1HLUA 2YJEA 4PL7A 4FPBA 5AQVA 2P9KA 4JAXA 4DQ8A 4BG8A 2BUPA 5KQDA 3CQYA 3ATUA 3ENHA 3EKUA 1R59O 3GOIA 1Z05A 2E2QA 4MO4A 3KZBA 1BG3A 4BRQA 2GWKA 1TYQB 4FPAA 1YUWA 4CZJA 5BPLA 4IO8A 1YXQA 4BRPA 3WXJA 3DWLA 2P9LB 4BRAA 1QQNA 4B1ZA 1SQKA 3MCPA 4HTLA 1GLJO 1NGFA 3GL1A 3WQTA 3H3NO 2QM1A 3CI5A 2ASOA 3ZETB 3R6MA 4JN4A 1H1VA 4CBWA 3FGUA 5JICA 5AQUA 1GLCG 5KPTA 2AA4A 4BR9A 1HJOA 4CZLA 5FPDA 3A8YA 4CZEA 5JMVA 4IWVA 1T6CA 1ATNA 3ZEUA 3UKRA 3UE5A 4PL8A 3EL2A 5BREA 2W40A 2E88A 2F9TA 2QW9A 3OHRA 3A5MC 4XH4A 4ISEA 1BUPA 4CZMA 1XC3A 2NLXA 4GNIA 2VYPA 4K42A 1JCGA 4WQ5A 3A5NC 3FZKA 3W0LA 1V4SA 2IVPA 2QWQA 4LC9B 2A3ZA 4B1WB 2Q1NA 4H0TB 2YHXA 2DPNA 2NRHA 3A5LC 4FOEA 1T44A 5ADXH 4FWMA 2H3GX 3O08A 1HKCA 1NGAA 2QWMA 3CJ9A 2PAVA 3C7NA 2GUPA 3LDOA 4QS8A 3CJCA 4BR7A 4BR0A 3MN9A 4BVOA 4RWTA 1KAXA 4CZGA 3L0QA 3MMVA 3HTVA 3ZX0A 1S22A 1GLBG 2P9KB 5AQLA 1MA9B 2E2NA 3C0BA 5AQZA 2I7PA 4A62A 2GTDA 2V52B 1WOQA 2CGLA 2QWLA 4BC3A 2VCPA 3S41A 3HBTA 1GLEG 3WXIA 3EN9A 4RCHA 3KVGA 3UB5A 5AQOA 4AM6A 2P9UA 1X3MA 1OKJA 5KQ8A 3H1VX 3LDQA 1GLAG 3GBTA 2FXUA 1JCEA 1QHAA 4JHDA 2HOEA 4DCHA 1NM1A 4ISGA 1T6DA 4BROA 4B1XB 1NLVA 3LM2A 3VF6A 4NB4A 3QMLA 3ID8A 5ELZA 3ULEA 4DHYA 3U4LA 4IZ9A 1QQOA 4H03B 4B9QA 5AQYA 2Q0RA 2FF3B 3VEXA 1S3XA 3O6WA 5BRFA 4BC2A 3ZEUB 5AQWA 3UKRB 4CZFA 1BA0A 5AQRA 2A40A 1Y64A 3LDPA 1BDGA 5AQMA 1QZ6A 4E1JA 2QXLA 3L6QA 4AM7A 2D4WA 2CH6A 5LJVA 2YJFA 4PKIA 1E4GT 4B1YB 2QWRA 4BRMA 3O5BA 4BQZA 5AQXA 3EZWA 1C0FA 1SZ2A 3CJ1A 1GLDG 4EFHA 3CJ7A 2YHWA 1ZXOA 2IIRA 4L3QA 3I33A 4M63C 4FWOA 3L4IA 4FWNA 3H3OB 2FSKA 4J8FA 1BOTO 3ZX3A 3C7NB 4BRKA 1WUAA 2IVOA 3CERA 4I6MA 1D4XA 2E8AA 1BA1A 5AQJA 3EO3A 2CGJA 1DKGD 5AQPA 5AFUH 1NGEA 2Q2RA 1X9JA 1C0GA 1YVNA 3KHYA 5BRHA 5ADXA 2V51B 3AY9A 3WT0A 3LL3A 4H0YB 4A61A 3VGLA 4GY2B 2HF4A 3BF1A 5AR0A 1DGKN 2GEMA 4H5TA 4M7YA 3VEZA 3QICA 2Q31A 2FF6A 4WQ4A 1E4FT 3DXKA 2A6AA 2KHOA 3LDLA 3GDQA 2P9UB 5TKYA 1QQMA 4XEIA 3VEVA 4WQ5C 3MN5A 2D1KA 4NO7A 4B1UB 2UYTA 4CBUA 2Q0UA 2W41A 3CHWA 4JHDB 1NGDA 5AZIB 3FE1A 4BRFA 3ZX2A 3D2FA 4Y0WA 2PBDA 1NGBA 5F2RA 2E1ZA 4PKGA 1U2VA 1NMDA 1TUUA 3ULEB 1ATSA 4XH5A 1RGIA 4F9OA 2Q36A 3CQXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2B4JA 2E2OA 3E9PA 4A2AA 5HRNA 4H5VA 4E7LA 3HSCA 3EKSA 3PO4A 4CD1A 1KCFA 3O4QA 2PYLA 1TVRA 3AO4A 5AQFA 2BGGA 3T69A 4X64K 1A5XA 1HRHA 2WUSA 5KRSA 2XY5A 4JV5K 3NVMA 1TV6A 4CF1A 3KKRA 1KC8O 1RT5A 1TYQA 4JD2A 4LH4A 1MDUB 3M8PA 1SKRA 5FDLA 3L3UA 5EXWA 4B1VA 4CJLA 4DWIA 4IDKA 2I7NA 3N4QA 3F5TA 4N47A 3ZCMA 3SZ2A 4DTSA 5J2NA 3E9LA 4JNEA 2E6MA 3O3GA 1C0TA 1XC9A 3QDKA 4B9NA 3WNFA 5JVGL 1EKEA 3A5OC 2P9SA 5AQQA 4CIGA 3SQ0A 5HRSA 2LSNA 1TKZA 2O8EB 3PIOL 5JLHA 3B6OA 3UIQA 2NZTA 5FLXO 2HNYA 4X66K 5EOYA 1LAWA 1W7AA 3FZLA 5LL6Z 1JL2A 3W3DA 4EZ9A 4KH5A 2IVNA 4CGGA 3QINA 1L3VA 5IWAK 3LAKA 1ZBIA 1Z6RA 3O1BA 1K8KA 1NK0A 5FRNA 5KTQA 1X3NA 1NWKA 4FJ8A 4LY7A 1X9MA 3K9KA 3CETA 1RBUA 2F7TA 5LMUK 5JS2A 2RE2A 2HMIA 1WBDA 3WEEB 1LWFA 3CC4N 4CF2A 3ZT4A 4FWLA 5C12A 4C1NI 1L5UA 4DV6K 3JYTA 1CXUA 3SPZA 4ID1A 3FZMA 5AQGA 3J7ZO 4FM1A 5J2QA 2W6LA 5FPEA 2OA8A 4WQ4C 4FZYA 3UKUB 3BP8A 1RTJA 4KRFA 5IT9O 1FJGK 3CIPA 3FFKB 2XO7A 2PY5A 4EIAA 4H0OA 3IFRA 4U7BA 3OYCA 1S1UA 1XUPO 3IDHA 3RVCA 3FLCO 1QSLA 3PO5A 3HP6A 5LY3A 1KFSA 1IKVA 3OJUA 2KFZA 2CH5A 4EAHD 2BTFA 2YKNA 4CJPA 2HHUA 3EZ5A 2ZM6K 3OYGA 1NK8A 3HO1A 4H5NA 1MWKA 3BGRA 3V9WA 3L8BA 1JLBA 2E20A 4IG0A 2HF3A 1VQMN 1S1WA 3SUQA 1TKDA 3AO2A 3H1QA 2QWPA 3LPUA 3VERA 3NHGA 1BO5O 1VQPN 1IV0A 5FRMA 1VSKA 1TKXA 4DR4K 4GW6A 3LANA 2O8CB 2YCHA 2NRZA 3LDSA 3AVMA 2Q97A 1MWMA 1VQ4N 3NH1A 3U9ZA 4DLEA 3CCMN 3ZSXA 5JLFA 4BDYA 2EHGA 3RWUA 2Z1JA 4KTQA 3CJBA 3HPGA 3ZSWA 2F9WA 3ZYYX 4KH6A 1G15A 1EWRA 1JLCA 3AARA 4E7JA 4M3YA 2UXCK 1KTQA 2VG7A 1LW2A 3QLHA 2NRWA 3LP0A 4B3RK 3I8BA 4B08A 4FLTA 2G8FA 2VGMA 3OBYA 4E7IA 4IJAA 5E26A 4AF1A 3BEXA 1WN7A 4DTJA 4F3OA 1W97L 3R9PA 1DTTA 3IMXA 4B3SK 4YORA 2OTJN 4BR4A 3HM9A 5CHIA 2ZGZA 3M1FA 2O8FA 3QERA 2RKIA 4OKEA 3SJJA 2QWNA 2KW4A 1BL3A 2GELA 5H1SQ 4LFBK 3M6GA 2AP1A 3VOVA 3CC7N 3E66A 4BWMA 2P51A 4LH5A 1A5VA 4FPBA 4IFEA 3K57A 2P9KA 4JAXA 4DQ8A 4A5BA 5KQDA 3C6HA 1WSGA 1KVCA 3OW2M 3GOIA 4V19S 1Z05A 2ATQA 3R1XA 4J2BA 4IFVA 4MO4A 3R3LA 4KI4A 2UU9K 2GWKA 4JKGA 1I94K 4Z4IA 4KO0A 1YUWA 3RR7A 1RDCA 3ENBA 3PX4A 5BPLA 3HJFA 2P9LB 1JLGA 4PY5A 4CEQA 1C6VA 3EYZA 3K58A 1NGFA 4E0DA 2QM1A 1N5YA 3AO1A 4WE1A 1OH6A 1YJNN 4IWVA 1T6CA 4O0JA 4OJRA 2I5JA 4PL8A 5BREA 3SI6A 4B9SA 2WC9A 4XH4A 4ISEA 4IG3A 4CFAA 1S1VA 2P1JA 2NLXA 4LF9K 4K42A 1RBRA 2OCEA 3A5NC 3FZKA 1A5WA 4W5TA 3MAQA 1SL2A 4MDBA 5ADXH 1T44A 4KHUA 3O08A 1Q81O 3VQ6A 2QWMA 3A2FA 3EE8A 4QS8A 1RDBA 3TR8A 4A5AA 2QKKA 4BVOA 1KLMA 3IKMA 1KAXA 1BI4B 3PUFA 4BY9C 3CFPA 1MA9B 3TTCA 1NKCA 4IOCL 4A62A 1OVQA 2V52B 4BC3A 3T1AA 2VCPA 3S41A 4F4KA 1EXQA 1GLEG 3CMAN 2P5OA 3KVGA 4AM6A 4B8CA 3QESA 3THYB 1QE1A 1Q8IA 1VSJA 1VHXA 2WTUA 3VQ8A 3DRRA 2HOEA 1NM1A 4DV5K 3SV3A 4J2AA 2XY6A 3LM2A 3OJSA 3DI6A 4CF9A 2FBVA 4YY3K 1QQOA 4H03B 3AGKA 4B9QA 3TAFA 3C95A 2Q0RA 3EY1A 5I3UA 3SQ4A 4BC2A 3ZEUB 3AVIA 1O13A 5AQRA 2QXLA 4YOTA 2D4WA 2CH6A 3VMFB 5LJVA 4B1YB 4E3SA 3VA3A 4BQZA 3P31A 1C0FA 1GLDG 3KK2A 4IEIA 3ZSYA 1REVA 3DLGA 4DMNA 4J8FA 3ZX3A 1BOTO 1QVFM 4BDZA 1VK0A 2BDPA 1VSMA 5AQJA 4DQQA 3SYZA 3NVKA 4F2RA 1K6YA 2BANA 5ADXA 2V51B 3AY9A 1BCMA 1LAVA 4FJ5A 1UWBA 1T3VA 4N76A 2O4GA 1ASWA 2Q31A 4HHTA 2HVIA 4JK8A 3DXKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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