1TUYA

Acetate kinase complexed with adp, alf3 and acetate
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
MKVLVINAGSSSLKYQLIDMTNESALAVGLCERIGIDNSIITQKKFDGKKLEKLTDLPTHKDALEEVVKALTDDEFGVIKDMGEINAVGHRVVHGGEKFTTSALYDEGVEKAIKDCFELAPLHNPPNMMGISACAEIMPGTPMVIVFDTAFHQTMPPYAYMYALPYDLYEKHGVRKYGFHGTSHKYVAERAALMLGKPAEETKIITCHLGNGSSITAVEGGKSVETSMGFTPLEGLAMGTRCGSIDPAIVPFLMEKEGLTTREIDTLMNKKSGVLGVSGLSNDFRDLDEAASKGNRKAELALEIFAYKVKKFIGEYSAVLNGADAVVFTAGIGENSASIRKRILTGLDGIGIKIDDEKNKIRGQEIDISTPDAKVRVFVIPTNEELAIARETKEIVETE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Methanosarcina thermophila
publication title Structural and Kinetic Analyses of Arginine Residues in the Active Site of the Acetate Kinase from Methanosarcina thermophila.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acetate kinase
total genus 132
structure length 399
sequence length 399
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2004-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tuyA02
1EQYA 4BROA 4H5WA 4IJAA 5TKYA 1JCGA 3L4IA 3VGKA 3MDQA 1QZ5A 4BRDA 5B8HA 5BR9A 4JAXA 3SJHA 3ULEB 1D4XA 5AZIB 5AQRA 2ASOA 4B1YB 5KPRA 3CIPA 3WXLA 3H3OB 3VEXA 2E20A 2FXUA 4PL8A 3U9ZA 2Q36A 3LDNA 3VF4A 3O08A 5F1XA 4H0PA 3BF1A 3ENHA 4IO8A 4FO0A 2ASPA 1ATNA 2BTFA 4BQZA 3A5OC 1HKBA 2P9IB 5AQUA 4JHDB 2P9SA 2IVNA 3QBWA 4CZKA 2BUPA 2FSNA 1S22A 1BG3A 4H0VB 4H5TA 5AQMA 3WQUA 4DCHA 1BWFO 4FWOA 5AQLA 5LJWA 2ZGYA 2QWRA 3ID8A 3CERA 4H0TB 4CI6A 1NBWA 3D2FA 4BRPA 1V4TA 1QQNA 4I6MA 2WUSA 1T6DA 4BRMA 2GWKA 4EHUA 4RCHA 2FF3B 2E88A 5EXWA 2P9SB 4BRLA 2IVOA 4H5RA 2W41A 4H5NA 2Q0RA 1JCFA 4FL9A 1TYQA 1YXQA 3SMSA 3U9DA 5JLHA 1SAZA 3W0LA 2QXLA 1LOTB 3M1FA 2GWJA 4XH5A 2FSKA 4CBUA 5JICA 1KXPA 3M6GA 3LDOA 3FR0A 2V7YA 2NRHA 2HF4A 1X9JA 2VWBA 2QM1A 2ZWHA 4BR9A 3D2FB 4I6MB 3JS6A 5AQQA 2AA4A 4K43A 2CH5A 3EKSA 4BR4A 3MMVA 4M7XA 4Z94A 3C7NA 3MK6A 3O80A 1TYQB 4CBWA 3L0QA 3GL1A 4B1UB 2QW9A 1NGCA 2A5XA 5AFUH 3EO3A 4YDUA 2NZTA 5BPMA 1Y64A 1Z05A 4BVOA 3F9MA 1E4GT 4IZ9A 3LL3A 3CQYA 1RFQA 4K42A 1X3NA 2E2PA 3BF3A 5BPNA 3EL2A 4MLHA 4ISEA 4FWKA 3R6MA 2E1YA 2FF6A 2GEMA 3FZFA 5F0XA 4H5VA 1GLLO 3HZ6A 2PBDA 2ITMA 3C7NB 1TUYA 4FSVA 3GOIA 1NMDA 2I7NA 2GELA 4BRGA 2E2QA 1NGGA 4B9QA 4PL7A 4FWQA 4IWVA 1HUXA 4BRKA 4GNIA 3D2EA 1S3XA 4O5FA 3WXJA 4BC5A 2UYTA 3MN7A 3VERA 3CJ9A 1DEJA 4B1VA 1ZXOA 5LY3A 2P9IA 2VYPA 3VF6A 3A5NC 3ATUA 3SK3A 3O4WA 1U2VA 1WOQA 4NO7A 3I33A 3BUZB 2A40A 4M7YA 4CZIA 3R8EA 1GLFO 3WQTA 2QWPA 5EY4A 4Y0WA 1XC3A 3S41A 1HKCA 3RSEA 3D2EB 2V7ZA 3B8AX 1WUAA 5KQDA 4WYBA 3CHWA 4FWPA 3I8BA 3H6EA 2E2NA 4XEIA 2AP1A 1KAYA 1CZAN 3DXMA 1U2VB 1XQSC 1KAXA 5FPEA 4FPAA 3HBTA 5AQJA 3GBTA 3WT0A 2I7PA 1ESVA 4JN4A 1ATRA 4CD3A 2F9TA 5AQXA 3RSEB 5E84A 1GLCG 4L3QA 2D1KA 3SMPA 5FPDA 3BEXA 3UE5A 4BR5A 2Q1NA 1P8ZA 1RGIA 3HM8A 3MN5A 3TPQA 3MN9A 1NGIA 4DHYA 2P9UA 3QFPA 5AQVA 3ZX0A 3DXMB 5KPZA 4BGAA 2D4WA 4BRIA 4RTFD 3DJCA 4BREA 4HTLA 2Q31A 4EFHA 3A8YA 3EN9A 3QBXA 5ADXA 4BRQA 2Q0UA 5BRFA 1LCUA 3AAQA 3R9PA 2P9PA 4PKGA 3QMLA 1U6ZA 5I9EB 4CJ7A 4WQ5C 2CGJA 1BO5O 1KAZA 1NGBA 3A0IX 5BRDA 2HOEA 4FPBA 4XH4A 3WUHA 1DGKN 1HLUA 3CI5A 4KBOA 2P9UB 3QFUA 4O8KA 1QQOA 4H0YB 4BR0A 5BREA 4PKHA 3FE1A 1GLAG 4BVPA 4EIAA 1TUUA 5AQSA 2A6AA 4XH1A 3LDPA 3H45C 2YHXA 4K41A 3VETA 1HPMA 2YJFA 2FLOA 5LJVA 2QWLA 2P9PB 3O1WA 3VOVA 1NGHA 4BRAA 4FOEA 3QICA 3H46O 3KZBA 4A61A 4CZGA 4B1ZA 4H0OA 3SLCA 2E2OA 2CGLA 4QS8A 3ZX3A 1QQMA 3W3DA 3FLCO 3U4LA 1R59O 1MDUB 3EZWA 3WEEA 2YHYA 4MLEA 5AQWA 1BUPA 3GDQA 3A5MC 3JXUA 4CZFA 2YI1A 3ZETA 3IMXA 3AAPA 1SZ2A 2QWNA 1BA1A 3FGUA 3VENA 4CBXA 3CJBA 4CZLA 2GTDA 4BC3A 2ZGZA 3VEVA 4A2BA 4LC9B 5BPLA 2J4RA 4A2AA 1QZ6A 4C23A 5AQPA 3LM9A 1SQKA 4GY2B 3FZKA 4BRHA 1NWKA 4CD1A 3A5LC 4MO4A 1JCEA 2QWMA 2IVPA 1GLEG 3FZMA 1MWMA 4QS7A 5KQ8A 4EHTA 5F2RA 4FWMA 3WEEB 5FPNA 5AQGA 4BG8A 4JNEA 2EWSA 4BR2A 3CJ1A 1NGDA 2D0OA 2Q97A 3ZETB 4BQLA 5AQHA 1GLJO 4CZHA 2CGKA 5AQTA 3UB5A 4BG9A 5AFUA 2Q2RA 3LDLA 4F9OA 3VESA 5AQOA 4BC2A 2W40A 3IUCA 1XUPO 3HI0A 4J8FA 4IXCA 4BRCA 5BN8A 3UKRA 2YJEA 1HKGA 3H3NO 3H1QA 2D0PA 3BP8A 4BRNA 3WXIA 1MWKA 1NGAA 4EAHD 3VEOA 1ZC6A 2P9NA 4WQ4A 3QB0A 5ADXH 3O1BA 3ZX2A 3CQXA 2P9LA 3MCPA 3HSCA 5AQIA 4WQ5A 3LDQA 4QS9A 5AR0A 4K25A 4FWLA 1NLVA 5JLFA 3GG4A 3UKRB 4BR7A 3KVGA 4CZJA 4CZEA 5FPMA 2V52B 4MO5A 5EX5A 5E26A 1HJOA 4IJNA 4FWRA 2ZF5O 3D7EO 2P9NB 4E1JA 3AARA 4BC4A 3KHYA 2P9LB 4A62A 1BA0A 5BRHA 1J6ZA 3ATVA 3FZHA 3DWLA 4M63C 1QHAA 4WQ4C 4B1WB 1GLDG 3IFRA 4JD2A 1GLBG 3O5BA 1OKJA 4CZMA 2PAVA 3VF2A 2YCHA 3AY9A 3M3ZA 1DKGD 4ISGA 3CJCA 1RDWX 5ELZA 2GUPA 3DAWA 2E8AA 3CJAA 2A42A 5AQKA 3O6WA 2E1ZA 3OHRA 4RWTA 4FWSA 1NM1A 1YVNA 3O8MA 5AQNA 1HX1A 3QDKA 1E4FT 3CETA 3C0BA 2A3ZA 5BN9A 1Q18A 2V51B 2CH6A 2P9KA 4FWNA 2F9WA 3VGLA 4JD2B 3VGMA 3ZEUA 1NGEA 2H3GX 2QWQA 5CE3A 1C0GA 1V4SA 1H1VA 1NGFA 4BRFA 1IJJA 3TU5A 5EVZA 1G99A 3DXKA 3ENOA 3LM2A 3H1VX 1Z6RA 1BDGA 2FSJA 4B1XB 3VPZA 2DPNA 3WXKA 1YUWA 4AM7A 3GE1A 3P4IA 3VEZA 1BOTO 2P9KB 3J8AA 4HWIA 3ZEUB 4AM6A 3U8XA 2VCPA 4ISFA 3UKUA 2KHOA 5AQZA 1K8KA 5AZJA 3IDHA 1X3MA 3VEYA 5JMVA 4BGBA 4H03B 1BU6O 3FZLA 3DXKB 4H0XB 4PKIA 5AQFA 1YAGA 3VEWA 2IIRA 2HF3A 3ULEA 3FFKB 5AZIA 2QWOA 5AQYA 3HTVA 3G25A 1MA9B 4DQ8A 4NB4A 1C0FA 1NGJA 5EOYA 2HMPA 4YDUC 3L6QA 2A41A 5KPTA 1T6CA 1ZBSA 3MN6A 3UKUB 2ASMA 3EKUA 1K8KB 5AZJB 1IG8A 2YHWA 2NLXA 1T44A 2OANA 3CJ7A 4JHDA 4FOIA 4DB3A 1ATSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C1NI 1BIZA 3QNNA 3SJHA 3HSTB 3ULEB 4DR3K 1EETA 5AZIB 4B1YB 3CG7A 3H3OB 2E20A 1WN7A 3RVCA 3OVNA 3R1XA 4ILJA 5F1XA 4YNQA 2UU9K 1BISA 4EZ9A 1VRUA 1IBLK 2F7TA 2ASPA 3DRRA 1ATNA 2P9IB 1Q8IA 1YVUA 2P9SA 3G71N 3ZT4A 3TWHA 2RN2A 4AILC 1VSMA 1C1BA 1U47A 2FSNA 1XHXA 2VQEK 5FRMA 5AQMA 1UWBA 1VK0A 4DF4A 1Y97A 1QS4A 1BWFO 4IEEA 5LJWA 4DU3A 4E19A 2QWRA 3CERA 1HQUA 4O55A 4CI6A 1RBVA 1U04A 4BRMA 4M3TA 2GWKA 4EHUA 1N6QA 3I55N 3P5JA 4IOCL 3PX0A 2P9SB 2FBTA 1YJ9N 2IVOA 3KK1A 1SL0A 4H5RA 2UXBK 3U9DA 4KV8A 3DYAA 3C6HA 3MWPA 3CF5L 1T3VA 1LOTB 3ULDA 3C6UA 4GW6A 3HOSA 5KTQA 1NK4A 4IDKA 5JICA 5C10A 3LDOA 3ZSVA 2VWBA 4FCYA 2PZSA 4DR4K 3CFRA 4DTOA 4IFEA 3JS6A 5AQQA 5M1PA 4K43A 4B9TA 1DTQA 1KFDA 1KRPA 5A2QO 4J2EA 4M7XA 1Q82O 1YTUA 3C7NA 3O80A 3LALA 3ZSRA 3GL1A 4B1UB 3G4SN 1P90A 3E9LA 2O8EA 1HNWK 4F8RA 4OPKA 4K42A 3OYDA 4Z4EA 4MLHA 1X1PA 4ISEA 4DWIA 1U49A 2E1YA 5F0XA 1BL3A 1S1XA 4JKBA 1OVQA 2IC3A 3BZKA 2ZD1A 3HZ6A 5HRRA 1WSEA 3C7NB 4FVUA 3LPTA 1TUYA 1VSLA 3TANA 4F4KA 5FDLA 3HRGA 4NCAA 5HRPA 4U67L 2E4LA 2YKMA 4FZZA 2O8EB 4DG1A 1NMDA 3VTHA 4AHRA 1RTJA 1QHTA 4GNIA 3D2EA 3OBWA 1XNRK 4BC5A 3MN7A 2EHGA 4I2QA 1JJ2M 3CJ9A 1BI4B 1ZXOA 2VYPA 3A5NC 3ATUA 3SK3A 3C6AA 4F3OA 3BUZB 4CZIA 1VQON 3QERA 3R8EA 4DTJA 3OYHA 3K5LA 1HRHA 1WAJA 2O8BA 3PX6A 2Z1HA 4W5QA 4OKJA 3D2EB 3O3FA 4BWJA 4B8CA 4Y1DA 3P38A 4E7JA 4N41A 2E2NA 4XEIA 3WNEA 1CZAN 2UUBK 4CJWA 1EO1A 1XQSC 5AQJA 2KFZA 3GBTA 4CJVA 2HBJA 5D3GA 3AVIA 1KD1O 4JN4A 3ZT2A 3EY1A 2O8BB 4I7FA 1GLCG 4L3QA 4Z4HA 2D1KA 1ZBLA 4DQPA 3SBTA 4DV1K 4PWDA 3HM8A 2P9UA 4I9QA 3ZX0A 3EYZA 3IRXA 4HCCA 1NJWA 2G8VA 5KPZA 2ITGA 4RTFD 2Q31A 3WNGA 3A8YA 5C15A 2G8IA 1M90O 5BRFA 4FJGA 4DS5A 1BO5O 1KAZA 4CGIA 4XH4A 3MX2A 2XRIA 3CI5A 1ASVA 2P9UB 1S1WA 3UIQA 4O8KA 1QQOA 1JLCA 4CF2A 4PKHA 4FJJA 2GV9A 2XY5A 1KVAA 4XH1A 2HNDA 2W6KA 2YHXA 2HVIA 2UXCK 2FLOA 3AVGA 4W5OA 3CMAN 1YJWN 4DR7K 4BRAA 3QICA 3SUPA 2KZMA 1ZBFA 2CGLA 3FLCO 3U4LA 1R59O 3LDSA 3V1OA 3ZSXA 4FJKA 4LY7A 4HCBA 1SKRA 3TAEA 2YI1A 3AAPA 4CJ5A 4JS5A 1SZ2A 2LSNA 3FGUA 3VENA 3AO4A 3CM6A 4CBXA 3CJBA 4CZLA 4GVEA 2GTDA 4BC3A 1RT1A 3VEVA 3MWTA 4LC9B 4YOVA 1RBUA 2J4RA 4WCEL 4KH5A 4C23A 1SQKA 4GY2B 4HUFA 2D0AA 1NWKA 3A5LC 3O3HA 2VWKA 2QWMA 1FJGK 2IVPA 1A5XA 5SZTA 1VQKN 5KQ8A 1RDAA 2FBVA 5F2RA 4EHTA 4FWMA 5FPNA 3TAGA 1KQSM 4JNEA 4BR2A 1VQ8N 2RF2A 3VQ9A 1VQPN 2ZQBA 5AQHA 1GLJO 2Q2RA 3AVFA 4DV0K 3SQ4A 2YNIA 1RBTA 1VSEA 3O9UA 4IXCA 5BN8A 4ILHA 3OYKA 2YJEA 4RW8A 4IDHA 3H1QA 2QKKA 1MWKA 3LP0A 3HJFA 4JI3K 4EAHD 4WQ4A 3O1BA 4IG0A 4FLTA 3L8BA 2JWLA 1NK0A 5C2DA 4DV4K 1FKPA 1NU0A 2X6SA 4K25A 3B6OA 3DRSA 4GVMA 5J1EA 5GIOA 4CEEA 4BDYA 3AGRA 3GG4A 4CZEA 5FPMA 2V52B 1IG9A 1QSLA 2YNFA 1HJOA 4IJNA 3AGKA 4KHYA 4FWRA 3IAYA 3QEWA 2DY4A 1NOZA 3DLLL 2B5JA 3TAQA 4WQ4C 4M63C 4B1WB 3MEDA 1M1KO 3HL8A 3IFRA 3SQ0A 5IWAK 4EP5A 1DKGD 4JKFA 3CJCA 4C8LA 5K14A 3ZSOA 3QO9A 1UA1A 1LAVA 4JKEA 4ZTFA 4FJNA 1TK0A 2Q3SA 2FBXA 1HX1A 3TTCA 1E4FT 3CETA 2O4GA 1RT2A 2CH6A 3EE9A 3ZEUA 2H3GX 5CE3A 2ZJRL 1VQ9N 1HR0K 4M3RA 3JAMO 1H1VA 1NGFA 4JKCA 4CJUA 4LF7K 1XMQK 3AVNA 1Z6RA 2FSJA 3CCSN 4B1XB 4FXDA 4CGJA 1NKBA 1W0HA 3HOTA 2UXDK 2DFEA 3WXKA 3LZIA 3AV9A 3P4IA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3CCR N;  1QQC A;  3ZT0 A;  3SAF A;  4CHZ A;  5AQP A;  4BRH A;  3FZK A;  4B3T K;  4MO4 A;  1JCE A;  3OA9 A;  3RWU A;  1G15 A;  1GLE G;  4DV5 K;  4CEA A;  4QS7 A;  1Q86 O;  1L3V A;  3RR7 A;  1KC8 O;  1L5U A;  3T3F A;  1YIJ N;  1BIU A;  1YT3 A;  2NRZ A;  2CGK A;  3LAM A;  5AQT A;  4JI4 K;  3UB5 A;  2ZE2 A;  3VES A;  4JI7 K;  5AQO A;  1VQ6 N;  2W40 A;  3IUC A;  1QVF M;  3HI0 A;  4ELV A;  3HM9 A;  1WSF A;  4J8F A;  2VWJ A;  3THY A;  3VQ4 A;  1S1T A;  2E6L A;  1NGA A;  3L4Q A;  3T69 A;  1ZC6 A;  4XIU A;  2D5R A;  3QB0 A;  1MU2 A;  4AH9 A;  4KHN A;  3DM2 A;  1IBK K;  4FJI A;  2DFH A;  2P9L A;  1TL3 A;  2UUA K;  3PSI A;  1HYZ A;  1YF5 L;  4WQ5 A;  3LDQ A;  2XHB A;  2D0B A;  5AR0 A;  4R5P A;  1RBR A;  1WBB A;  3ASM A;  1YJN N;  2QTD A;  3O4N A;  4KTQ A;  4CZJ A;  3ISN C;  4DV7 K;  1Q81 O;  3THY B;  1HNX K;  2VGM A;  5EX5 A;  1T05 A;  2HBL A;  1VHX A;  1VSH A;  5J2P A;  4FZX C;  5KRT A;  1X9M A;  1ASW A;  2P9L B;  3DLG A;  1C6V A;  4A62 A;  3AVH A;  5BRH A;  1CXQ A;  4YOT A;  4M3W A;  4JD2 A;  2HHU A;  4CZM A;  3VF2 A;  2YCH A;  3AY9 A;  3V81 A;  3M3Z A;  4DFM A;  1UA0 A;  3MXM A;  4HUG A;  1RDW X;  4JK8 A;  3CJA A;  1RT5 A;  5I42 A;  3O6W A;  4FWS A;  4OPJ A;  1NM1 A;  3V9S A;  2PYJ A;  1GOB A;  3FFI A;  3OYB A;  2V51 B;  4FWN A;  4CEO A;  2F9W A;  2VG5 A;  4JD2 B;  1K8A O;  4A59 A;  3L2V A;  2E6M A;  1RDD A;  2R7Y A;  3U3Y A;  1IJJ A;  4YY3 K;  5CHI A;  2HHS A;  3SZ2 A;  1VSI A;  3DRP A;  4ZHR A;  2XY8 A;  3ZCM A;  4I2P A;  3DI6 A;  4OGE A;  1YUW A;  3VQ5 A;  5FLX O;  3ZLJ A;  3KK7 A;  1IO2 A;  3WNH A;  3DLK A;  1VQ7 N;  3UKU A;  2DTU A;  1HPZ A;  3AO2 A;  1SS6 A;  4DR5 K;  3T19 A;  3CCM N;  3ULE A;  5AZI A;  2QWO A;  2HST A;  1NK7 A;  1MA9 B;  2YHB A;  1BCO A;  1T7P A;  3K5N A;  1NGJ A;  1A5V A;  2HHX A;  5C42 A;  4YDU C;  1ZBH A;  4IOX A;  1VQM N;  1DTT A;  1ZBS A;  3UKU B;  2NLX A;  2OAN A;  3P39 A;  1JKH A;  5M1N A;  5HL7 L;  1ZBI A;  3AVB A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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