1V4SA

Crystal structure of human glucokinase
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis for allosteric regulation of the monomeric allosteric enzyme human glucokinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords glucokinase isoform 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 162
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2003-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1v4sA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1v4sA01
1H1VA 4H0OA 3VEYA 2QWRA 4FL9A 2I7NA 5AQUA 3O5BA 2W41A 1LCUA 1YAGA 3DWLA 3C0BA 3FZKA 3MN9A 3AAQA 5AQMA 2Q97A 2ASMA 2Q2RA 1NGEA 3J8AA 3LL3A 1QZ5A 5I9EB 1KXPA 5AQVA 1T44A 3L0QA 4CZHA 2AP1A 4FSVA 1QQMA 2ASOA 4BRAA 1BO5O 1BG3A 1WOQA 3ENOA 3DXMA 2IIRA 1CZAN 3VEWA 3VETA 3WXIA 4B1XB 2A40A 2EWSA 3H1VX 3WXKA 2E8AA 5AZJA 4WQ5C 3VEVA 5AQRA 2V51B 1X3NA 2GELA 4IZ9A 5LJVA 4FO0A 1DEJA 2QWPA 5AQWA 1HJOA 3U9DA 1SAZA 4CJ7A 2ZF5O 3D2EB 1GLFO 2A5XA 1BA1A 1ATRA 1X9JA 2GWKA 5ADXA 2E1ZA 3EN9A 2E2QA 4CBWA 3MCPA 5EXWA 2NLXA 2IVPA 3KZBA 3O8MA 5EVZA 3VESA 4MO4A 3S41A 3U4LA 3O1WA 2DPNA 3SMSA 3FZMA 1K8KA 4IWVA 2A3ZA 3ULEA 3VF4A 4M7YA 3M6GA 3ZETA 4QS9A 1NMDA 4MLEA 5BPMA 1HPMA 5F2RA 3VGMA 4BRMA 5EOYA 1ZXOA 1NGDA 5BPNA 2VWBA 1LOTB 5LJWA 4I6MA 3RSEA 4WYBA 3ZEUA 5FPDA 4J8FA 3AAPA 3GG4A 4H5RA 4E1JA 4BG9A 3VERA 2CGKA 2P9NB 3CERA 2HMPA 3GBTA 1S22A 4A2BA 4H0TB 3P4IA 3UB5A 1U2VA 5KPZA 4BREA 4H5TA 1T6CA 5AQSA 1NGBA 3IDHA 3AARA 1YXQA 4H0PA 1DKGD 3ATUA 3O80A 2GEMA 3KVGA 5AQXA 1NGHA 3WEEA 4BC2A 5AQNA 4A2AA 2WUSA 4JNEA 5JICA 1MWMA 4FWOA 1RFQA 2I7PA 3BP8A 4BC3A 2ZGZA 5BPLA 3L6QA 5JLHA 5AQQA 4PL8A 1QQNA 2HF4A 3DXKB 3FGUA 1TUUA 2P9KA 1BOTO 4BC5A 1QZ6A 3MMVA 2IVOA 4FWQA 4M63C 4BRKA 2Q36A 3CJ9A 2YCHA 3R6MA 2GWJA 3ENHA 1QQOA 3CI5A 4RTFD 2QWLA 1GLAG 4NB4A 3HM8A 4FOEA 2CH5A 2V7YA 3MK6A 5BN8A 4BR2A 2AA4A 4K42A 4M7XA 3VEXA 4CZKA 2CH6A 2YJFA 3WQTA 1X3MA 3H3NO 1T6DA 3A5MC 3TPQA 1GLBG 1GLEG 4BRIA 5AQYA 3HBTA 5JLFA 3R8EA 3H46O 4GNIA 2E2NA 2IVNA 1NM1A 3DXMB 4IXCA 4H0YB 1TYQA 3O1BA 3UKRA 2E1YA 5AZJB 1TYQB 3VF6A 2FF3B 4BQZA 4DCHA 4IJAA 4KBOA 3EO3A 3HSCA 5AZIA 4K25A 1WUAA 5FPMA 5AQFA 2HF3A 2Q0RA 3FR0A 3VF2A 2FSJA 1KAXA 3EZWA 3FZLA 1P8ZA 3QDKA 3BUZB 4K43A 2BTFA 3HI0A 2P9IA 5AQPA 4H5WA 4FWSA 1NGIA 3A5OC 3SLCA 2E88A 2FF6A 3VOVA 4B1WB 2FSNA 5EX5A 2QWNA 3CQYA 3ZX3A 4PKIA 3VGLA 2ZGYA 3B8AX 1BUPA 2A6AA 3W0LA 5LY3A 4CBUA 1K8KB 3CJAA 2FSKA 1J6ZA 3GOIA 3WXJA 2A41A 1Z6RA 3CJ1A 3SJHA 1ZBSA 3ULEB 1KAYA 5JMVA 5TKYA 2FXUA 4FWMA 3GL1A 4RWTA 3ZETB 1NGAA 5CE3A 3MN5A 2D4WA 3A5NC 4ISGA 1U6ZA 4BQLA 2D0PA 1NGGA 4FWLA 5BRDA 4JHDA 2P9PA 4I6MB 3RSEB 3LM2A 3ZEUB 4PKHA 3IUCA 4BVOA 4EHUA 4CZJA 4H5NA 3GE1A 4CZIA 4PL7A 2Q31A 4BRDA 4H0VB 3WUHA 4IO8A 5AQJA 4F9OA 3QBWA 3O08A 3TU5A 5KPRA 2E2PA 1U2VB 4EIAA 1KAZA 5B8HA 3WQUA 5AQZA 5FPNA 3WT0A 5AQGA 3GDQA 3I33A 3AY9A 1E4FT 4CZMA 4BRNA 2V7ZA 1JCEA 4ISEA 3M1FA 4MLHA 1YVNA 3H1QA 4B1UB 1E4GT 1XUPO 3WEEB 4RCHA 4XEIA 4BGBA 3FE1A 1HUXA 5AQIA 4L3QA 3JXUA 1NGJA 1XQSC 1BWFO 2KHOA 1OKJA 4CD1A 2PBDA 4CZEA 5BRFA 1ATSA 4EAHD 1DGKN 1MA9B 4JN4A 5AQOA 1G99A 2QXLA 4FWRA 1NLVA 3LDOA 3EKUA 5ADXH 3CETA 2P9KB 3VEOA 4BRHA 1GLCG 3U9ZA 1HLUA 4BVPA 3UKUA 3H3OB 4DHYA 3MN7A 3SK3A 4WQ4A 3IMXA 3LM9A 4BC4A 5AQKA 5AQLA 3FZFA 2W40A 4YDUA 3O4WA 4BR9A 3O6WA 1ATNA 3CJ7A 2QWOA 4QS7A 1JCFA 4CI6A 3H45C 5BREA 1Z05A 4B9QA 2E2OA 1HX1A 2ASPA 3LDNA 3F9MA 4C23A 5ELZA 2YHYA 4MO5A 3VEZA 1BA0A 1QHAA 4FWNA 2PAVA 2D0OA 3UKRB 2Q0UA 4O5FA 1HKCA 2HOEA 2QWQA 4EFHA 2F9TA 5AZIB 4EHTA 3D7EO 1YUWA 3A5LC 5FPEA 3SMPA 1BU6O 3LDLA 4XH5A 3UE5A 3U8XA 1IG8A 4AM7A 1SQKA 2NRHA 4HTLA 1EQYA 4JD2A 3DAWA 4B1YB 4XH4A 2P9IB 2ZWHA 2QW9A 2BUPA 4JD2B 3VGKA 1BDGA 1XC3A 3D2EA 1Q18A 4BRLA 4FOIA 1V4SA 4IJNA 1GLDG 3FZHA 5BRHA 1ZC6A 2GUPA 2Q1NA 3CQXA 2QWMA 3D2FA 4H0XB 4CZLA 3C7NA 2P9UA 3QICA 4WQ5A 1D4XA 2YJEA 4H5VA 4BR0A 3D2FB 2F9WA 5F0XA 3C7NB 2P9UB 3A8YA 4GY2B 5AR0A 5AFUA 1R59O 3H6EA 4FWKA 4ISFA 3ZX0A 1MWKA 3FLCO 1NGCA 3A0IX 2YI1A 3QMLA 4CBXA 4NO7A 1GLJO 3QFPA 4JHDB 4BRCA 1C0GA 2P9PB 3W3DA 3EL2A 4K41A 5KQDA 4H03B 4O8KA 5AFUH 4CZGA 3I8BA 4PKGA 1HKGA 5AQTA 2CGJA 4BGAA 4DB3A 2VCPA 3VENA 3BF1A 3MDQA 3ZX2A 3HTVA 1SZ2A 3VPZA 2UYTA 2VYPA 1C0FA 3KHYA 4LC9B 2H3GX 1MDUB 3LDPA 4BRGA 2ITMA 2V52B 5E26A 1ESVA 3QFUA 1NWKA 1V4TA 2YHWA 4DQ8A 5BN9A 4A62A 2P9NA 2P9LA 2P9SA 5KQ8A 2D1KA 5F1XA 2YHXA 4FPAA 2P9LB 2P9SB 3MN6A 5AQHA 1TUYA 3FFKB 3BEXA 3BF3A 3CJBA 3JS6A 3EKSA 5KPTA 3M3ZA 3ATVA 4AM6A 1GLLO 2A42A 2E20A 4Z94A 1NGFA 3HZ6A 4B1VA 4CZFA 4WQ4C 2CGLA 4FWPA 3ID8A 4CD3A 4A61A 1IJJA 1NBWA 1Y64A 3G25A 2GTDA 3QBXA 4JAXA 4YDUC 4BRFA 5EY4A 3QB0A 4BR7A 4FPBA 1RGIA 3L4IA 2QM1A 3WXLA 5E84A 5BR9A 4BRQA 4BR5A 1HKBA 1RDWX 4BROA 1S3XA 3OHRA 4B1ZA 4BRPA 3CHWA 2FLOA 2J4RA 3DJCA 3UKUB 4HWIA 3R9PA 3DXKA 1JCGA 4QS8A 4XH1A 3LDQA 2NZTA 2OANA 3CJCA 4BR4A 4BG8A 3IFRA 4Y0WA 3CIPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VWJA 1XNQK 1H1VA 2Q3SA 3O5BA 4CJTA 4OX9K 4B9SA 3C65A 1JLBA 4ICLA 1XHZA 4C8MA 5J2QA 3CPWM 3SAFA 1IBKK 3CCEN 4CHYA 1QQMA 3K59A 4CHQA 1BG3A 4DKWA 2P1JA 3OYIA 3VETA 4A5AA 1A5WA 2EWSA 3H1VX 3T69A 2D0AA 2V51B 3R1XA 4IZ9A 4RG8A 5FROA 3M8RA 2Z1HA 1X9WA 4FJ5A 1SAZA 2UXBK 1GLFO 3VA0A 3NH0A 3VN5A 3O9TA 5K14A 1ATRA 3ZCMA 3CM5A 3NH1A 3K0SA 2GWKA 1HNXK 4K8XA 4CBWA 3V4IA 5EVZA 1BIUA 4N5SA 1WSIA 4DLEA 3FZMA 1K8KA 4M41A 4IWVA 2G8KA 4KHYA 4O55A 2G8HA 4MDAA 1L3SA 3NMUA 1EP4A 3CYMA 3OBYA 4CJ4A 1NMDA 5F2RA 4BRMA 4LSNA 4DTOA 1EETA 3ZSVA 4AHUA 4E89A 1NJXA 1EWRA 1LOTB 4IG3A 1WLJA 4I6MA 3NAEA 4WYBA 1G15A 2YHAA 3ZEUA 5C24A 3AAPA 1C0UA 2XY7A 2O4GA 4H5RA 1VQON 4DLGA 4E1JA 2NRTA 1TL3A 1W0HA 4I2PA 2O8EA 3LP1A 3KK7A 1MU2A 3QNNA 1WNSA 1YJ9N 4DV4K 5KPZA 3HOTA 3VQ6A 1CXQA 4CJUA 3KD1E 1T05A 1OH8A 5AQSA 1NGBA 1BQNA 3G10A 3K5LA 2F96A 3ZSOA 3MWTA 3DLHA 3V6DA 3ATUA 4B3OA 2Z1IA 3HXMA 3V81A 5TKWA 2KZZA 3QO9A 1KVCA 4JV5K 5AQNA 3B6OA 4DR7K 4FW2A 4DV3K 4FJ8A 4FWOA 1N33K 2I7PA 5BPLA 4F3OA 4Z4IA 4CJLA 3THXA 5JLHA 4JI8K 4PL8A 3DXKB 1L5UA 3THXB 1QZ6A 1B9DA 2IVOA 4E7KA 4FWQA 4CEQA 1K6YA 2G8FA 2RHKA 1QQOA 2HBKA 3E1YA 5M1KA 5C12A 4JK8A 3HM8A 2CH5A 1BCOA 3VQ8A 4B3RK 4DTNA 4CF1A 1FKOA 3VQAA 1CZBA 3VEXA 4FLVA 1X3MA 1S1XA 3OY9A 1GLEG 3O9SA 4ILJA 3HVRA 5AQYA 4KTWA 2PYJA 3R8EA 3TAGA 3H46O 4WE1A 4JKAA 4JKDA 1DT9A 1N6QA 4K0KK 2E1YA 3ASMA 4KI4A 2GV9A 4FK4A 4KO0A 1U48A 1JLGA 3KLHA 3EO3A 3HSCA 5AZIA 4DV5K 1RTDA 4DTUA 5AQFA 5BR8K 1HQUA 4BE1A 1P8ZA 1RCHA 5SZTA 4K43A 2BTFA 2KKZA 3HI0A 4JKEA 1RBRA 4FWSA 1NGIA 3LWMA 3SLCA 1DTQA 2FF6A 1VQ4N 4DR2K 1Q9XA 3CQYA 2O8FA 1N32K 4ZHRA 4CE9A 2ZGYA 2HVIA 1BUPA 3AVBA 3J7AP 4CBUA 4JI3K 2PY5A 1J54A 3WXJA 4CEDA 3KD5E 1VQ7N 5TKYA 4FWMA 3GL1A 1LWCA 3P83D 3ZETB 4LF7K 4Q0BA 5CE3A 4JKGB 3SYZA 3SJJA 4BQLA 1U6ZA 1RT1A 2D0PA 3MXJA 3AA4A 4JHDA 4AQYK 4B08A 1VQNN 3EY1A 1RTJA 1SKSA 2G8UA 3T1AA 4PL7A 1R0AA 1LWEA 4H0VB 4FVUA 2E5LK 2DFEA 2KFZA 3O08A 4AHSA 3CCUN 3MEDA 4X66K 3AY9A 4CJFA 1E4FT 2O8DB 1NK6A 3AO4A 3MCAB 3RMAA 5CY4A 4LF4K 2HHVA 1RNHA 3S3OA 4HUGA 1XMQK 4B3MK 1TKDA 4G1QA 1E4GT 4NCGA 1XUPO 3TR8A 1ZBHA 4I9QA 3JYTA 1VQ6N 4C1NK 3VQ4A 3LALA 2YV0X 3KKRA 2PBDA 3R3LA 1U45A 4LFCK 1ZBFA 1MA9B 5FDLA 3SUPA 4DTMA 3NVMA 4FWRA 1NLVA 3Q7CA 4E19A 4BY9C 2UU9K 5DMRA 3CCRN 2P9KB 3SBGA 4LH4A 3UKUA 4DHYA 4B9LA 3E01A 5JS1A 4EP5A 3SK3A 3OJSA 3THWB 4FJLA 3FZFA 1JLCA 1S9GA 3O4WA 3O6WA 3D0PA 1IO2A 3CJ7A 1WSJA 5JVGL 4CI6A 3SAGA 4YNQA 2KTQA 4CGDA 3ITHA 3ZT0A 2BGGA 1JL2A 1SS6A 4C23A 1ILYA 2ZJPL 4FLWA 3SQ2A 2D0OA 5C15A 4O5FA 1VSDA 1IBMK 1HKCA 3EE8A 4EHTA 3K5MA 3KWIA 3SMPA 3LDLA 2BANA 1RDAA 3UE5A 4Z0UA 4ELVA 3C95A 1IG8A 1LV5A 3J80O 1RT6A 2NRHA 1EQYA 4HTLA 3DAWA 4B9MA 3OYLA 4AILC 1KCFA 1TL1A 4C8LA 4O4GA 4QCLA 2OPQA 4KKOA 2IGIA 3VGKA 1BDGA 3IG1A 4FJMA 3OA9A 3G71N 1BQMA 3KWGA 3M8SA 3HOSA 4JLHA 4RW8A 3CQXA 2G8WA 3VMFB 4DR4K 2DFHA 2OCEA 4BR0A 2XY6A 5F0XA 1TKXA 3KLFA 1WSEA 3H6EA 2ITGA 4B8CA 5DM7L 1TK0A 4RW9A 1VQ5N 3RRHA 3QFPA 2X6SA 2P9PB 4DSFA 4PKGA 1HKGA 4BGAA 3BF1A 1SZ2A 3CC2N 2UYTA 1QS4A 4LC9B 2RE2A 2VGNA 3LDPA 4DSEA 1NKEA 5E26A 3QFUA 4DV0K 4M45A 4HTUA 4FZYA 1XNRK 2P9SA 1WN7A 4YORA 2RPIA 2YHXA 1VHXA 2P9SB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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