1V4SA

Crystal structure of human glucokinase
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis for allosteric regulation of the monomeric allosteric enzyme human glucokinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords glucokinase isoform 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 162
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2003-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1v4sA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1v4sA01
4JN4A 3MN5A 3O08A 2FLOA 2E2QA 3FZKA 4PL8A 2WUSA 3DJCA 3SMPA 4AM7A 1RGIA 2ZGYA 4CBXA 3ZX3A 4BQZA 5F0XA 1HKBA 3FLCO 3SLCA 5BRHA 4WQ4A 2GELA 1T44A 2A6AA 3BUZB 3QBWA 3R9PA 3CJ1A 2ASOA 1HUXA 5AQGA 3A5NC 3QICA 4YDUC 4QS9A 1CZAN 3BEXA 4CBUA 4BRLA 4EHTA 4F9OA 4NB4A 4FWSA 4RWTA 5F2RA 4FWKA 2BUPA 3ID8A 4RTFD 4B1ZA 4EIAA 1Y64A 1KAXA 3CJAA 3UKRB 4BRPA 5AQHA 4C23A 3A5LC 4ISGA 2KHOA 1K8KA 4ISFA 3MCPA 4EAHD 5AQKA 3WXJA 2W40A 3GBTA 3UE5A 1BDGA 1BU6O 4IJAA 3FFKB 1MA9B 3LM2A 3M6GA 5AQYA 3EL2A 2IVOA 1X9JA 2HF3A 4MLHA 2UYTA 3VEWA 4BR7A 3DXKA 5EX5A 4FWLA 3MK6A 1Z6RA 3FZLA 4H0VB 4BR4A 4WYBA 1ATNA 1XQSC 2CGJA 2A3ZA 3LDLA 5BN8A 2ASMA 3FGUA 3H46O 3S41A 4BG9A 2A41A 2Q31A 2ZGZA 3VEOA 3VF2A 4JNEA 1K8KB 4FWPA 1NGJA 5AQXA 2HMPA 2Q0UA 3JXUA 5JICA 1Q18A 3SJHA 4BR5A 4YDUA 1YUWA 1EQYA 1YXQA 4FPBA 1Z05A 2F9WA 1BO5O 3BF1A 4BVPA 1U2VA 4JD2A 4H0TB 1MDUB 1ZBSA 3H1VX 3A8YA 2E1ZA 3DXKB 3C7NA 4DB3A 1BA0A 5KQDA 3MN7A 1MWKA 1NGCA 1J6ZA 1P8ZA 3TU5A 1NWKA 3CQXA 3CERA 5BR9A 1NBWA 4B1XB 1BWFO 4DCHA 2QWLA 4JAXA 3DXMA 2QXLA 5KPZA 3GG4A 4B9QA 5KPTA 4M7YA 4QS8A 3KZBA 1SQKA 1BUPA 3VOVA 2GWJA 3QFPA 3VENA 2D1KA 5BRFA 4FPAA 2EWSA 4BRHA 4Z94A 1U2VB 4CZEA 4JD2B 1G99A 3W0LA 2VCPA 4A61A 3W3DA 3VEVA 2P9SA 4XEIA 3I33A 1QZ5A 1T6CA 3VEYA 4O5FA 2I7PA 3EO3A 1T6DA 2PAVA 4IZ9A 3G25A 3CJ9A 4BREA 3GL1A 2FXUA 2A5XA 3ATVA 3HTVA 4A2AA 4HTLA 4CZGA 2E88A 4GNIA 3O4WA 4MO4A 5AQNA 3D7EO 3DXMB 4M7XA 4CZMA 5AZJA 3L0QA 5BPLA 3WEEA 4BC5A 4CZIA 4B1VA 3U4LA 1YVNA 5AQSA 2QWNA 3A5MC 1GLEG 1ATSA 3ENOA 1X3MA 5AQRA 4FWRA 2Q36A 1TYQA 3EKSA 3AY9A 4A62A 1SZ2A 4FWNA 2YHYA 3QMLA 3HBTA 2E1YA 4FOIA 5AQZA 2QWOA 1NGEA 3HSCA 3R8EA 4BRDA 3CIPA 4PL7A 2P9SB 3LDPA 2P9NA 3ZX2A 5FPDA 2Q2RA 1NGIA 2E2PA 3GDQA 3L6QA 4FOEA 3LL3A 4L3QA 2V7YA 3H6EA 2ITMA 2P9PA 5CE3A 5KQ8A 2VWBA 2P9KA 4BR0A 1XC3A 5AZJB 3QB0A 3WEEB 2FSJA 5EOYA 4B1YB 3UKUA 2FF3B 3VF4A 4BRMA 1C0FA 5AQIA 1KXPA 1TYQB 3M1FA 3I8BA 4BRFA 4BRNA 4QS7A 3BF3A 3H1QA 5AQVA 3WXKA 4BG8A 4MO5A 4CJ7A 1V4SA 5AQJA 2P9NB 1RFQA 2QWPA 2J4RA 2F9TA 3O6WA 1QHAA 1YAGA 4BGBA 5JLFA 4I6MA 1X3NA 2GTDA 1BG3A 3O8MA 2P9PB 4BROA 2P9KB 3LM9A 4FO0A 4BVOA 5ADXH 5ADXA 2NRHA 3WXIA 2HOEA 3VF6A 5BPMA 1D4XA 4O8KA 4RCHA 3VESA 1NGBA 3UKUB 3P4IA 5AQLA 4CZFA 4CD1A 2NLXA 3IDHA 3A0IX 5F1XA 5BN9A 3EKUA 4J8FA 2E2NA 4HWIA 4H0YB 4CZHA 5AQOA 2GUPA 1WOQA 5JLHA 4E1JA 5FPMA 2CH5A 1DEJA 2A42A 3CJCA 4H5NA 2QM1A 3ZEUA 1NGGA 1QZ6A 2FSKA 2H3GX 4CI6A 4I6MB 2P9IA 5BPNA 3CQYA 3H3NO 4CD3A 4BC2A 1S22A 4CZLA 1TUYA 1KAZA 2D0OA 1HPMA 3MN6A 1NGFA 2YJEA 4B1WB 3CI5A 1E4FT 5AR0A 3JS6A 1NGDA 5AFUA 3ZETA 1QQNA 1NM1A 3SK3A 4BQLA 3O1WA 3R6MA 1JCEA 4H5WA 1IG8A 3C7NB 3KHYA 2CGKA 4H03B 4BC4A 4BR9A 3VERA 4FSVA 1HJOA 3VEXA 4H5TA 2D4WA 5LJVA 2IVPA 3FZHA 3MN9A 5AQMA 3FZFA 2CH6A 4IXCA 3D2FA 3EN9A 3WXLA 4BRKA 3IFRA 1HKCA 3BP8A 3CJBA 3ZEUB 2BTFA 3DWLA 3J8AA 1GLDG 2P9IB 3U8XA 4BGAA 4Y0WA 1RDWX 1LOTB 1BA1A 3TPQA 3L4IA 1C0GA 5AQPA 4XH4A 3O80A 1NLVA 3VEZA 3CHWA 2QWQA 2GWKA 1IJJA 3VGKA 1GLLO 2CGLA 1JCGA 3GE1A 1R59O 2E20A 3VETA 1WUAA 2YJFA 3FE1A 4NO7A 3ZETB 2E2OA 2FSNA 3D2EA 3DAWA 3ENHA 4CZJA 1ZC6A 3RSEA 4ISEA 2W41A 4H5VA 5EVZA 3AAQA 3ULEA 1GLCG 4H0OA 2P9LA 1MWMA 4BRAA 1JCFA 5KPRA 5LY3A 2ZF5O 3D2FB 4FL9A 2VYPA 1ZXOA 1SAZA 3B8AX 1BOTO 4WQ5C 1GLBG 4XH1A 5AQWA 4BRGA 2QWRA 1LCUA 4BRIA 3CJ7A 5AQFA 3VGMA 2QW9A 1H1VA 4PKIA 2ZWHA 3WUHA 3M3ZA 1NGAA 5BRDA 2V7ZA 3FR0A 2YHXA 4JHDA 2D0PA 3ZX0A 2E8AA 2GEMA 3D2EB 3WQUA 5AQQA 3RSEB 3MDQA 3FZMA 2P9UA 3QDKA 3WQTA 2IIRA 4K25A 3ULEB 4CZKA 2P9LB 5AZIA 1TUUA 5BREA 3KVGA 3WT0A 4H5RA 3UB5A 5E26A 4H0XB 3MMVA 4EFHA 5I9EB 1HX1A 3IMXA 5AQUA 2Q1NA 4IWVA 2HF4A 3SMSA 4PKGA 2AA4A 3HM8A 1QQMA 5B8HA 2Q97A 1E4GT 4K43A 3GOIA 4JHDB 3HI0A 5E84A 4K41A 1V4TA 3IUCA 3QBXA 4DQ8A 2P9UB 3ATUA 3AARA 2V52B 3C0BA 4KBOA 4MLEA 3VGLA 3LDQA 3LDOA 4WQ5A 3H45C 1KAYA 1QQOA 1U6ZA 2QWMA 2YCHA 4B1UB 5AZIB 3LDNA 1OKJA 5ELZA 1S3XA 4A2BA 1NMDA 4WQ4C 3CETA 2A40A 4IJNA 5AQTA 4FWOA 2IVNA 3EZWA 2I7NA 3HZ6A 4GY2B 1ATRA 5EXWA 3VPZA 5AFUH 3O1BA 4BRCA 2AP1A 4FWMA 4LC9B 3O5BA 1HLUA 2Q0RA 3H3OB 4IO8A 3F9MA 4BC3A 2V51B 4CBWA 4DHYA 5JMVA 2ASPA 3QFUA 5TKYA 1ESVA 2FF6A 1GLJO 1GLFO 3AAPA 5FPEA 1HKGA 4K42A 4PKHA 4BR2A 1GLAG 5FPNA 4H0PA 3U9DA 5LJWA 4M63C 2PBDA 5EY4A 2DPNA 2YI1A 2NZTA 4AM6A 2OANA 4BRQA 1DKGD 3A5OC 1DGKN 4XH5A 1XUPO 1NGHA 2YHWA 4EHUA 4FWQA 3U9ZA 3OHRA 3UKRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KTWA 3CD6N 3KD5E 1K9MO 3MN5A 1REVA 3T1HK 3O08A 4FJLA 2WUSA 2XY7A 1RGIA 2OZSA 5F0XA 1HKBA 5KI6A 4WQ4A 2GELA 3ITHA 4I2QA 3BUZB 3QBWA 3CJ1A 3K5OA 3TAFA 3LP1A 3QICA 3L3VA 3AVBA 3LZIA 3HXMA 4BRLA 4NB4A 1Q7YO 1R0AA 4F3OA 4FWSA 2GV9A 3NF7A 2KLAA 4AHVA 1IKYA 4RTFD 2BANA 3T19A 1S1WA 4W5RA 2YX6A 4M3TA 1KLNA 1VSLA 4W5OA 4DQQA 1RCHA 1K8KA 1VSFA 3CFRA 3TWHA 3N4PA 3IG1A 4EAHD 3WXJA 4GVEA 4IBNA 2XHBA 4BDZA 1BDGA 2OCEA 4DTMA 1BU6O 4Q0BA 2Z1IA 2IVOA 4AHUA 2KZMA 2QI2A 4ICLA 2UYTA 3VEWA 4BR7A 3DXKA 1IBKK 3ID6A 4NYFA 3DLKA 5J2NA 4B8CA 4CEBA 3LDLA 3QEXA 1VQMN 5BN8A 3T1AA 1D9FA 4EP4A 1S9EA 1UA0A 2A41A 2UXBK 3VEOA 1WAFA 1RNHA 2A1RA 3F2KA 4BACA 3K5LA 4LFCK 4MFBA 3OBWA 3LAMA 4B3TK 1Q18A 1U47A 4YDUA 5MLCQ 3TANA 1YXQA 4FPBA 1Z05A 2DFFA 1SUQA 3LWLA 3NMUA 4N76A 4G1QA 3BF1A 3V9UA 3OYCA 2Y1JA 1MDUB 3PY8A 4E7LA 2HBMA 3TABA 3SI6A 1G15A 4DB3A 1BL3A 5GIOA 2HNDA 2YNIA 1NGCA 4DU4A 1T8EA 3TU5A 4DR6K 4B1XB 1BWFO 2QWLA 4JAXA 3THXA 2QXLA 4HUGA 3VQDA 1LAVA 3RTVA 5K14A 3VOVA 4FJ5A 4FJNA 3QFPA 2D1KA 1CZ9A 4OPKA 1NNEA 4Z94A 1U2VB 2RPIA 3AA5X 4CFAA 4IO9L 2E4LA 1HNZK 5FRMA 4IZ9A 4CIGA 3KLFA 4B3MK 4M42A 3GL1A 2FXUA 1N5YA 1U45A 4E7KA 4CZMA 3L0QA 3ZSWA 3WEEA 4CZIA 3OY9A 3HO1A 3LALA 1HQUA 1UOCA 2QWNA 3AVJA 2O4GA 4IG3A 2O8EA 3D6RA 3ENOA 1X3MA 4CHNA 4FWRA 1QSYA 3AY9A 3EKSA 3NF8A 1SZ2A 3CCMN 4Z4EA 2E1YA 5J2PA 4DR2K 1EKEA 2QWOA 1NGEA 2VG7A 4DS5A 4BRDA 3LDPA 1OH7A 3KIOA 2Q2RA 1NGIA 2E2PA 1EP4A 3L6QA 3DOKA 4L3QA 4UQGA 1JLBA 5M1NA 4JI4K 3AO3A 4PUOA 4B3SK 5GAEP 1TKZA 1XC3A 5AZJB 1QS4A 4NLBA 2OPQA 4BDPA 2KZZA 2G8VA 1JXEA 4CHZA 1W0HA 1GOCA 4IOCL 4E19A 3OYMA 3M1FA 3I8BA 4JI6K 4BRFA 4QS7A 4R5PA 1BQNA 3IAYA 5AQJA 1TVRA 5IT9O 2P9NB 1RFQA 2QWPA 4KO0A 2PYLA 3VQAA 4ILHA 4BGBA 5JLFA 3THWA 2OPSA 3HOSA 3AVAA 1I39A 4A5BA 1BG3A 4KHYA 3O8MA 2P9PB 4BROA 2VWKA 4KH4A 3BZKA 3TSUA 5ADXA 2NRHA 1L5UA 4DF4A 1D8YA 2HMIA 4DFMA 3VQ9A 3M5RA 2E6MA 5BPMA 4O8KA 4W5TA 2ATQA 3VESA 2OTJN 1NGBA 3TTFA 5AQLA 1RILA 5F1XA 3OVNA 4IOXA 3EKUA 2VG6A 1CZBA 3OYFA 4CZHA 5AQOA 4A57A 3SQ0A 5C15A 4FYDA 5FPMA 2F8SA 4F2RA 2QM1A 1QZ6A 1TAUA 2P9IA 2D0BA 1C6VA 4YOWA 4JI8K 4JRPA 5JVHL 4BC2A 5LMUK 1KAZA 4CF0A 1BHLA 1IG9A 1QVGM 1E4FT 1EX4A 5AR0A 5AFUA 4JYAK 1QQNA 3SK3A 4BQLA 4FLZA 3O1WA 3R6MA 1BI4A 1RTDA 1WBBA 3OTOK 1IG8A 5HRRA 3VQCA 3VERA 3OW2M 3T1YK 2UXDK 3V9ZA 2D4WA 1IKXA 4FLYA 3MN9A 3FZFA 2CH6A 4IXCA 1VQPN 1N36K 4BRKA 2KFNA 4YORA 4DV2K 3J8AA 3PIOL 3LANA 3MEDA 4CJ3A 4JI2K 5KRTA 3L4IA 3SYZA 4PQUA 3NE6A 1NLVA 3VEZA 2QWQA 3DRSA 1VQLN 4B9UA 4C1NK 4CJ5A 3RMAA 1JCGA 2YJFA 4YY3K 4V19S 4NO7A 4LD0A 1NMNA 2E2OA 2P1JA 2ZM6K 2FSNA 4CF9A 3OS2A 4OLBA 4NYNA 4ISEA 2PZSA 3VN5A 1S1TA 4U7BA 3R3LA 2FBYA 4M3ZA 5LY3A 3CCSN 3WXMB 4FL9A 3IRXA 2VYPA 4FJ7A 3B8AX 1BOTO 4WQ5C 2ZJRL 1GLBG 4FXDA 5AQWA 3SNNA 2QWRA 1NK6A 2HBLA 3R1XA 5AQFA 3T7ZA 1CXQA 1VRUA 3SUNA 1ASUA 2V7ZA 4JHDA 2OPPA 3KD1E 1F21A 2E8AA 2GEMA 3OYEA 3LP2A 3EE8A 3MDQA 3QDKA 3P38A 3KLEA 1HJRA 5BREA 5M1PA 2Q3SA 4CF1A 3MX5A 4GKJK 4H5RA 1JLCA 1C0TA 5SZTA 3HP9A 3VMFB 3MMVA 4EFHA 3KK3A 5I9EB 3V9WA 3IMXA 4CJVA 4JKEA 4IWVA 2HF4A 3SMSA 1A5XA 4AHCA 2ZD1A 2Q97A 1M1KO 4K43A 5FRNA 2LSNA 3MEEA 1YTAA 2NRVA 3QBXA 4DQ8A 4O0JA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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