1V4SA

Crystal structure of human glucokinase
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis for allosteric regulation of the monomeric allosteric enzyme human glucokinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords glucokinase isoform 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 162
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2003-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1v4sA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1v4sA01
3D7EO 4CZIA 1NGHA 1ESVA 1GLDG 5AQJA 1Z05A 3ULEB 3A5MC 2E2PA 3O1WA 5B8HA 5AQIA 2ZGYA 3C7NB 1DGKN 4XH4A 3VERA 2F9TA 3DAWA 4CJ7A 4BG9A 4DCHA 5F2RA 2Q0RA 4M7YA 1R59O 4BR7A 3SLCA 2PAVA 2VWBA 4K42A 4CZKA 4CI6A 1BG3A 3H45C 4BQZA 2P9IA 4CD1A 1BO5O 1YUWA 3FZKA 4IJNA 3LDPA 5AQFA 3AARA 3MN5A 3QFUA 5AQXA 1T6DA 4H5NA 2P9NA 3DXKB 4HWIA 1ZBSA 2HOEA 1P8ZA 1BWFO 3MDQA 3VESA 2Q31A 3U9ZA 2QW9A 3IMXA 4EHUA 2J4RA 5AQZA 3ATVA 1BA0A 3D2FA 4K41A 2E1ZA 1NGCA 4FPBA 1HKCA 4ISEA 2I7PA 2CH6A 4MLEA 5KPZA 4ISFA 5LJWA 3CQXA 2A5XA 1KAXA 2IVPA 4FWPA 4BRIA 5BRFA 1JCFA 4WQ5C 3D2EB 4FWKA 1C0FA 4CZLA 3VPZA 3EKSA 1YXQA 1WOQA 5EVZA 3MMVA 4FOIA 2FXUA 4BRFA 3MK6A 3UE5A 1GLJO 1KXPA 2FSJA 2PBDA 1BUPA 1GLAG 5AFUH 4MLHA 3EO3A 1MDUB 5JMVA 1CZAN 1QQNA 1WUAA 2I7NA 1NGEA 3DJCA 4PKIA 4GNIA 5KPRA 3OHRA 4JD2A 3QMLA 2EWSA 5AZIB 3I8BA 5F1XA 4BRAA 1H1VA 4AM6A 2D0PA 1Q18A 5BRHA 4JAXA 2E2OA 2Q36A 4CBWA 1T44A 3VGLA 1ZC6A 2W40A 3W0LA 2VCPA 2KHOA 1GLBG 3BF1A 4IO8A 1TUUA 5AQKA 5AQOA 4JHDA 3O8MA 3U9DA 5AZJB 4BG8A 5ELZA 3MN7A 4CZJA 4FWSA 3TU5A 2YI1A 4B1WB 3EL2A 5AQRA 2A6AA 3W3DA 3LL3A 4FL9A 1SAZA 3LDQA 5BN9A 1ZXOA 1MWMA 4BRKA 4BQLA 5CE3A 2IVOA 3QDKA 3ZX0A 2P9PB 4WQ4C 3VEVA 5BPMA 1KAZA 3KVGA 5EXWA 2UYTA 4FWOA 4I6MA 4MO5A 4H0PA 2FLOA 1U2VA 4A2BA 3R9PA 4RWTA 3SK3A 3EKUA 5BREA 1E4GT 2BUPA 3HBTA 3MN6A 5E26A 3CI5A 4BR5A 2P9LB 1NGGA 2E88A 5E84A 1TYQA 3GL1A 2FF3B 3ID8A 4WQ5A 2ZGZA 2HF3A 3DXMB 3WXIA 4BRQA 3HM8A 4FSVA 3WEEB 4CZHA 4FWNA 5AQQA 4BR0A 3A8YA 2Q97A 1NM1A 2F9WA 2P9UB 3FZHA 3H1QA 3KZBA 3UB5A 4B9QA 4EIAA 3GDQA 4A61A 4H03B 1NGFA 1RFQA 1T6CA 1SZ2A 3GG4A 4PKHA 1QQMA 3VOVA 1J6ZA 2YCHA 3DWLA 1RDWX 3UKUA 5BPNA 3L4IA 1OKJA 4A2AA 2V7YA 3A5NC 3H3NO 1SQKA 3SMSA 2QWOA 1XQSC 4WYBA 3TPQA 3ZEUA 4BVPA 2OANA 3P4IA 5AFUA 4CZEA 4RCHA 1GLLO 4PL8A 1DEJA 4FPAA 4L3QA 4CZGA 3WT0A 2FSNA 3WXJA 5JICA 2E20A 3CIPA 4H0YB 4B1ZA 1HKGA 2A42A 4YDUA 1NMDA 1NGAA 3CJAA 3L0QA 3AY9A 3S41A 1BOTO 2BTFA 4AM7A 2D1KA 4EFHA 3WQUA 5BN8A 2CH5A 3VEWA 1NGBA 4FO0A 4IJAA 5LJVA 2QWMA 4BR2A 5JLFA 5F0XA 3IUCA 2ZWHA 2P9IB 2P9KA 5AQHA 3ZETA 4B1UB 3R8EA 3CHWA 5AZJA 3LM9A 4LC9B 4Y0WA 4Z94A 4H0TB 3BUZB 2P9NB 4NB4A 2D0OA 1HUXA 1NLVA 3EZWA 4A62A 3I33A 2NZTA 2ZF5O 3SJHA 1G99A 1K8KA 4BVOA 2GWJA 4C23A 2YJEA 3IDHA 3UKRA 3R6MA 1LCUA 2P9SA 2Q1NA 3HTVA 3U8XA 1TUYA 3ATUA 2E2QA 3A5LC 4BRPA 3VEXA 3QB0A 3D2FB 2HMPA 2YHXA 3FZFA 4BROA 3QBXA 3GE1A 3WQTA 4PL7A 4DB3A 2FSKA 3FR0A 4BGBA 2E1YA 3ULEA 1NGDA 1LOTB 3LDNA 2Q0UA 5AQNA 5AQYA 5ADXH 3CJ7A 5FPNA 5KQDA 1V4TA 2V7ZA 3GBTA 1X3NA 3VEOA 3C7NA 2QWLA 3O5BA 4IZ9A 1BDGA 3GOIA 3VF4A 2CGLA 1XUPO 1QHAA 4M63C 2QWRA 4XEIA 4GY2B 3AAPA 2GEMA 4BC3A 3FLCO 2HF4A 3VF6A 2H3GX 3MN9A 3VEYA 5JLHA 1QZ6A 2P9UA 2GUPA 5AQWA 1NGIA 4JD2B 5AQPA 4BR4A 3HSCA 4CZFA 3DXKA 3F9MA 1U6ZA 5EY4A 3VENA 5LY3A 5AQTA 4BGAA 3AAQA 3H1VX 1GLEG 2CGJA 3VGMA 3RSEB 2CGKA 1YAGA 3H3OB 3O08A 3WXKA 4FOEA 5EOYA 3VETA 4K25A 3CERA 3CQYA 1HJOA 2IVNA 2QXLA 3QFPA 4O8KA 2GWKA 4CZMA 4JHDB 4XH5A 5KPTA 2V52B 4BC2A 1X9JA 4CBXA 4ISGA 2Q2RA 3JXUA 2IIRA 4QS8A 1NGJA 4RTFD 3D2EA 4BC4A 3HI0A 2GELA 5AQVA 1HKBA 1JCEA 1NBWA 5AQGA 5AQSA 4BRHA 5EX5A 3FFKB 1GLCG 2D4WA 3BEXA 4EHTA 4DHYA 3U4LA 4DQ8A 1NWKA 2A40A 2QWQA 4I6MB 4IXCA 4JNEA 1U2VB 3IFRA 3O6WA 1QZ5A 4K43A 4PKGA 4BREA 3FZMA 3G25A 3KHYA 4FWRA 1HX1A 2ASMA 5AZIA 3VGKA 4H5VA 3CJCA 1HPMA 3H46O 1JCGA 1TYQB 3VF2A 2E8AA 2QWNA 2YHWA 3CJ9A 1E4FT 2QM1A 2GTDA 3A0IX 3LDLA 3QBWA 2WUSA 4E1JA 5FPDA 3LM2A 4WQ4A 2A41A 4BR9A 2A3ZA 3A5OC 1DKGD 1BU6O 1RGIA 1IG8A 3CJBA 5ADXA 1BA1A 3MCPA 4H5WA 4H0OA 5AQMA 1XC3A 2AA4A 2VYPA 3UKUB 1X3MA 3M1FA 4BRDA 3ENOA 2DPNA 2NRHA 4IWVA 5AQLA 3JS6A 4H0XB 1EQYA 4O5FA 3QICA 3O1BA 3ZEUB 2FF6A 4BRCA 4HTLA 1Y64A 3FE1A 2P9PA 1HLUA 2AP1A 3BP8A 2NLXA 4M7XA 5TKYA 3C0BA 1V4SA 3FZLA 3WUHA 4BRGA 3B8AX 2ASPA 3FGUA 3VEZA 1S22A 4FWMA 2ITMA 1GLFO 2P9LA 4J8FA 1MWKA 4H0VB 1IJJA 4QS9A 1KAYA 3ENHA 1YVNA 5KQ8A 3BF3A 4EAHD 3CJ1A 2YJFA 3DXMA 4BC5A 3CETA 3M6GA 4NO7A 3RSEA 3ZX2A 1C0GA 1QQOA 4XH1A 4BRNA 1S3XA 2QWPA 3WEEA 3ZX3A 3J8AA 3L6QA 4CBUA 3M3ZA 2P9KB 3ZETB 4FWLA 5BRDA 1ATSA 1ATRA 1D4XA 5FPMA 4YDUC 4B1VA 4H5TA 1ATNA 2YHYA 3O4WA 4JN4A 2E2NA 3HZ6A 5AQUA 5FPEA 3LDOA 4QS7A 2W41A 5I9EB 2ASOA 4B1XB 1MA9B 1K8KB 4BRMA 4BRLA 5BPLA 1Z6RA 4CD3A 3UKRB 4F9OA 4H5RA 2P9SB 3EN9A 5AR0A 3H6EA 3SMPA 4B1YB 3O80A 4FWQA 2V51B 5BR9A 3WXLA 4KBOA 4MO4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D7EO 4Z4FA 1TAQA 3OYDA 1HNWK 3IKMA 3IG1A 5GIOA 4HUFA 2HHUA 4A59A 5HROA 2ZGYA 3O4NA 3C7NB 2F9TA 2O8BB 3CCSN 4OKJA 5F2RA 1W7AA 1LAWA 3CC2N 3KD1E 1BHLA 1WN7A 2VWJA 2PAVA 4G1QA 5JVHL 2UXCK 3ASMA 3TAQA 4BQZA 3RR7A 5HRSA 3ZSWA 3SPZA 4FJNA 4GV3A 4WFNL 5AQFA 1GOCA 2P1JA 3QFUA 4B9VA 3KLHA 4CGHA 2P9NA 1NJXA 3AO1A 3CG7A 2HOEA 1P8ZA 1BWFO 2Q31A 3RR8A 3AA2A 4Z4HA 2QW9A 4EHUA 5AQZA 3ATVA 3ZSOA 1BA0A 1KLMA 3D2FA 3VQQA 2E1ZA 3E66A 1NGCA 3VMFB 4CEFA 1HKCA 4JS4A 2CH6A 3PO4A 2UXBK 5KGXA 4FLYA 3NHGA 1U48A 1B9DA 1VSDA 4W5QA 3AVKA 3HPHA 3SBTA 3MX5A 3LANA 4AHRA 2BGGA 3D2EB 3O9SA 2X74A 4LH4A 5SZTA 4LSLA 2BE2A 3K5LA 3EYZA 4E89A 4DWIA 1BUPA 2OCEA 1GLAG 1NK5A 4JI7K 2PZSA 1L3SA 2I7NA 2X78A 1EXQA 4B08A 1NGEA 3DJCA 5KPRA 1VHXA 4CJUA 3QMLA 4NCGA 2UUCK 3LWLA 3OBYA 5AZIB 5HP1A 5F1XA 4CF8A 4AHTA 5IT9O 4OKEA 3THVA 3TSQA 3SAGA 5C2DA 5BRHA 1NK6A 2E2OA 4Z4EA 3VGLA 3EE9A 1SL1A 4K8XA 4JKDA 3DLRA 2KHOA 4IO8A 2YNHA 5AQOA 3ZYYX 2F8TA 3U9DA 4RW4A 4BG8A 1NOZA 4R5PA 4CZJA 3HXMA 2YI1A 3EL2A 2NUBA 4IBNA 4DR5K 3QEXA 4E7IA 2A6AA 3W3DA 2VGNA 4FL9A 4RW9A 5HLFA 4YHHK 5BN9A 4CJQA 4FK2A 3QIPA 2QEXN 3QDKA 3L2QA 5SWMA 2UXDK 3VEVA 3KVGA 1IBMK 1BQNA 4O8UA 4FWOA 3ZSZA 3CXCM 4JKFA 3R9PA 3SK3A 1D9FA 4JI3K 1VQMN 4PQUA 1TYQA 2FF3B 4KV8A 2HF3A 3CCLN 1T05A 3SQ2A 3HSTB 1RT3A 3IS9A 2HBJA 4FJJA 4BY9C 3AV9A 5HBMA 3KZBA 1VSJA 2OA8A 4M3YA 1TL1A 4AQYK 3GG4A 4MDAA 2V7YA 3C95A 4JRPA 4B9UA 5J2MA 1XQSC 4WYBA 1Q86O 2GX9A 2UUBK 4H4OA 1IKWA 2RPIA 4JI6K 1T8EA 1DLOA 3J7AP 3WT0A 5JICA 1QSSA 4B1ZA 1HKGA 4OJRA 4FVUA 4ID5A 4ILHA 3CJAA 1XNQK 3EE8A 1NK7A 1NU0A 2B6AA 4RG8A 4EFHA 3AVGA 4DSJA 3VEWA 1WB9A 4IJAA 1QTMA 2WONA 4BE2A 3VQPA 4BR2A 5F0XA 4Z4GA 1HR0K 4GW6A 3KLFA 3D45A 3DLBA 2IAJA 4DMNA 1I39A 2GUIA 4ID1A 1B9FA 4FM1A 4FZZA 3O3HA 1JLBA 4B9SA 2Y1JA 2P9NB 2HBMA 3SJHA 2GWJA 4F3TA 3IDHA 2OTJN 3UKRA 4HVJA 3DOLA 2P9SA 4Q5VA 1TUYA 3A5LC 4BRPA 3D2FB 1NMNA 1FKPA 1HRHA 2YHXA 3L3VA 3MXJA 3GE1A 3VQ5A 2HHWA 3SAFA 2FC0A 5I42A 3BZKA 3DYAA 2G8WA 2FBYA 3ZSQA 3LWMA 3LP2A 5KQDA 1V4TA 3O5BA 4YOVA 4E7KA 1BDGA 1NKEA 3LP0A 3NVMA 2O8CA 3L4QA 4XEIA 4KHNA 4GY2B 2QA4N 1XHXA 5C0YA 1KSPA 4X65K 3DRSA 3S3NA 2G8VA 4CESA 2GUPA 3WNEA 5AQWA 3THXA 2VQEK 2Z1JA 1ILYA 2Z1HA 1QVFM 1BI4B 4IEEA 3F9MA 1U6ZA 3H08A 4BGAA 1UA0A 3VGMA 3BZCA 1L5UA 2OPSA 4B9NA 3L2RA 2D0AA 4OPKA 1UWBA 1W2BM 1HJOA 1LV5A 3SUOA 2GWKA 1VQ4N 4V19S 4FLXA 1C6VA 3P31A 4CEEA 5KPTA 4DFPA 2YNIA 4CBXA 4ISGA 1HYZA 4FW2A 1QSLA 2O8DA 1LW0A 3OBWA 1SKWA 1HKBA 1UAXA 1JLQA 5AQGA 2NNWA 5AQSA 4BRHA 3K57A 3SJJA 4BWJA 4U67L 1S9EA 1SKSA 4DHYA 4DQ8A 1X9MA 4JNEA 2RE2A 4NXMK 1VQNN 3DMJA 4E7JA 2YV0X 2XY8A 2F8SA 4FWRA 3KHYA 3HYFA 4CK2A 1VAZA 3I0RA 1HPMA 3H46O 1JCGA 1TYQB 4E19A 3OYBA 2PYJA 4FLUA 3CM5A 1WAJA 3K5OA 3QBWA 1RT6A 4OKKA 3HRGA 3V9ZA 4ZTFA 2WUSA 3TTFA 3LM2A 5IWAK 4OLAA 2A41A 3A5OC 1T3VA 1BA1A 3MCPA 5AQMA 3HM9A 2X6NA 2OYQA 1Z26A 4BRDA 3KKSA 4GMJB 2B4JA 4FCYA 1GOBA 4O5FA 3QICA 3NF7A 4FJGA 4BRCA 3BY5A 4HTLA 3KWIA 5GAHP 2AP1A 4M7XA 4W5OA 5TKYA 4DSKA 2DFHA 4JI1K 4BRGA 4YOXA 3KK1A 2ZE2A 2ASPA 4PA1A 3AO3A 3AVLA 2O8EA 3C6TA 1TL3A 5C24A 4BDYA 3KLIA 2BH1A 4EAHD 3CJ1A 4JI5K 4FM0A 3CETA 4NO7A 3RSEA 1S5JA 2G8FA 3WEEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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