1VAZA

Solution structures of the p47 sep domain
Total Genus 10

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
10
sequence length
76
structure length
76
Chain Sequence
ERRRHSGQDVHVVLKLWKTGFSLDNGDLRSYQDPSNAQFLESIRRGEVPAELRRLAHGGQVNLDMEDHRDEDFVKP

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS4 (62-67)S1 (11-17)TIV2 (23-26)TI1 (30-33)TIV1 (17-20)S2 (20-23)S3 (26-30)AH1 (35-45)AH2 (50-55)TIV3 (56-59)TI2 (68-71)TIV4 (69-72)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lipid binding protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Structure, dynamics and interactions of p47, a major adaptor of the AAA ATPase, p97.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NSFL1 cofactor p47
total genus 10
structure length 76
sequence length 76
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-02-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.210 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1vazA01
1VAZA 1SS6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UE5A 1V4TA 3AVKA 3LZJA 3K2PA 5AQZA 3EY1A 1BQMA 4BRCA 5AQGA 1RT4A 2WONA 3ULDA 3THXA 3FZFA 1LWEA 3M8SA 3EE8A 1L3SA 1L3TA 5AQYA 1GLFO 1YI2N 5HRRA 2Q97A 3NDKA 2GWKA 2O8DA 3CJBA 5HROA 2O8BB 3VOVA 3SQ1A 4LF9K 2HBMA 4KH4A 4LFAK 5B8HA 2KLAA 5E26A 4CGDA 5SZTA 3C7NB 5ADXH 4YOWA 4E19A 4FJ5A 1OH5A 1OVYA 4X66K 1TUYA 3MWPA 1MDUB 4H0PA 2XY6A 3RTVA 1T6CA 4BG8A 4FLVA 2VG6A 4MO5A 4CEAA 3CJCA 4BVPA 4RW6A 4KHPK 5J2PA 1C1BA 4CF1A 5AQHA 1WBBA 4B9VA 3CQXA 4Z4GA 3LWLA 1XNRK 3A2FA 4MLEA 1RT1A 3EO3A 3HI0A 3ITHA 1YITN 4DCHA 3V9XA 4JKCA 1N33K 3NF9A 1RTJA 1QHAA 2QM1A 3AVHA 3K57A 1SL0A 1V4SA 1J6ZA 3C6HA 3O9RA 2P9PA 1YF5L 3HM8A 5EOYA 2KHOA 5BRDA 4FJJA 4H0XB 4YOTA 1QQMA 1RT6A 4IKFA 1WSHA 3L8BA 4A61A 4CF2A 1VQ7N 2Z1IA 3MECA 4C8OA 2OA8A 2G8HA 4K8XA 2OANA 3S3OA 3R8EA 4V19S 1JLQA 2F9WA 3HO1A 1NK8A 4RG8A 4KH5A 1NK4A 1KFDA 1KFSA 3D7EO 3SUNA 3LDQA 1QVGM 5LY3A 1SAZA 4CJVA 3H6EA 4N56A 1NBWA 4XH4A 1HNVA 3ULEB 5FRNA 4DTXA 1SQKA 2PAVA 3I56N 3CCRN 1NK6A 4H5RA 2UXDK 3SUPA 3OA9A 1KQSM 1EKEA 4I7FA 1VHXA 3VN5A 3D2FA 4MLHA 5H1SQ 4DG1A 4CJKA 3CQYA 4RW9A 4WFBL 1VRUA 1R0AA 4FSVA 5JS2A 1CZ9A 3VF4A 2LSNA 2QKBA 3WXMB 2IGIA 1IKVA 1TK8A 1NGEA 1BA0A 2F8TA 3RRGA 2ATQA 1YVNA 3KKRA 4AH9A 2NNWA 4BDZA 3B6OA 4F9OA 1XUPO 3DMJA 4N47A 3LDOA 1LCUA 4F3OA 3CCQN 5J2NA 3VPZA 2ASMA 3OBWA 3PUFA 4LY7A 3FZHA 3BY5A 1RT5A 4BRHA 2RHKA 1JLEA 4IWVA 4F2RA 2O8CB 3ZX3A 1QSSA 1DTQA 4JI1K 1W97L 2HBJA 3WXLA 3EZWA 1HYSA 1HQEA 3BUZB 3JYTA 1XHXA 3D45A 2FSNA 1GLLO 4CJ5A 2WBNA 4HVJA 1NK9A 1HLUA 1A5WA 4YOXA 3HM9A 4JEPA 4AM6A 5I42A 4B1UB 2ZF5O 3LM2A 2P51A 3C65A 1QSLA 3C6UA 4O5FA 4KHWA 3E66A 3AV9A 5LJWA 4E7KA 2HVHA 4QCLA 3HTVA 4GV3A 4JI0K 4IEIA 4IDKA 1K8KB 5M1PA 2D0OA 4FJHA 5FLXO 3IS9A 2QKKA 2KFZA 2GELA 1HNWK 4DV2K 3DM2A 1TK5A 4CZGA 2KZMA 2NUBA 1TV6A 2BDPA 2QW9A 4NO7A 4IJAA 3SUOA 4DTJA 5FROA 1UWBA 3SAGA 3MXIA 2P9SA 1X9MA 5DK5A 5FDLA 3WT0A 4RTFD 4MDAA 4CZLA 3I8DA 4CZIA 3M8PA 3OVNA 1SKSA 1S1UA 2YX6A 3SCXA 3TTCA 4LFCK 3K0SA 1DEJA 3G71N 2A41A 2Q36A 3WNHA 4BVOA 2UUAK 3VQCA 3R3LA 3AO1A 3QBWA 3MEEA 3T1AA 2QWLA 4OPJA 1U47A 3TABA 4ID1A 4JS4A 3N4PA 3O9SA 3ZT4A 5AFUH 1D9DA 4BDYA 4MFBA 2XO7A 3T3FA 1XNQK 2H3GX 2VWJA 3SNNA 4CFDA 1RNHA 5KRTA 1QTMA 1MWMA 1QSYA 3P5JA 4CGFA 5AQVA 3W0LA 3GE1A 1U6ZA 4DQPA 3OY9A 1OKJA 2EX3A 3D2EB 4A59A 3MN7A 2ZM6K 4BE1A 3C6TA 4IEEA 5CZ2A 2EHGA 1GLJO 4FWRA 3LP0A 1VQKN 4B9MA 1IV0A 3CCMN 5HRSA 2IVNA 3TTFA 1EETA 4ELVA 5IT9O 2D0CA 4CGHA 3AAQA 4H5NA 4OKEA 3F73A 4KB0A 1BCOA 4CF9A 2YHWA 1HNIA 3KK1A 3QB0A 4O0JA 4ZHRA 3ID6A 2ZJPL 3KWIA 3O4NA 3ZSXA 2HHVA 3J81O 3NH1A 5BREA 3NBPA 4GVEA 4E7IA 4Z4HA 1YAGA 3U6FA 1IJJA 1S1XA 2DFFA 1CZBA 3CPWM 1NJWA 2HNZA 1N6QA 4A5AA 3PX4A 1K8AO 5TKYA 3SV3A 5HOOA 5AQLA 5AZJA 4OKJA 3OYBA 4OLAA 1TL1A 1ASWA 3QIPA 2HBLA 3O9QA 3EN9A 5C0YA 4Z4CA 4BWJA 3O08A 1HKCA 3KK7A 3S9HA 1VQ8N 4JKAA 1S1VA 1BI4B 2VQEK 5CYMA 3DLEA 2P9UB 4KTZA 3IFRA 4LH4A 1RBSA 3ZSOA 4Y0WA 2O8FB 2E6LA 4AHUA 4XH5A 3KJVA 4DLEA 1N5YA 4H4OA 4NCBA 3I0RA 3CHWA 3VENA 3P1GA 3WQTA 5M1KA 4AHVA 3QNNA 4RWTA 4HUEA 4CBXA 3THXB 3SZ2A 1IO2A 3O6WA 3LWMA 4BE0A 1N8RO 5AQRA 3NE6A 5KTQA 4BRDA 3TSUA 1X9JA 2O8DB 3JS6A 3CCSN 3O5BA 4WE1A 4FK2A 1KTQA 5AZIA 3ZT1A 1RTDA 1VQ5N 4GNIA 2BUPA 3ZEUA 3JAMO 2B5JA 3F9KA 4CVNE 4O4GA 3RR8A 1YJWN 3L0QA 3G6EN 3VEXA 2IVPA 3KLEA 4BQZA 1T6DA 3TARA 3DJCA 1BISA 5DM6L 4Q5VA 3OYNA 3V9SA 3QEPA 3RSEA 5AQJA 3TAEA 4DR4K 3QFPA 2KQ2A 5JS1A 3PV8A 2EWSA 1JL2A 4DV1K 4Z4FA 4MDBA 5AQNA 2BGGA 4IOCL 1BOTO 4DSEA 5EX5A 2UUBK 3FFKB 2KKZA 3MN6A 4H0OA 3HRGA 1Z05A 3N4QA 4NCAA 2QK9A 4LSNA 4PKIA 4M45A 5ADXA 1KAXA 4CEOA 3D0PA 1VQNN 3PLAA 5KRSA 5DM7L 3ZETB 1GLBG 1ZBSA 1C0FA 2QWNA 1B92A 2OZSA 2ZWHA 4GKJK 4C8MA 3W3DA 1OVQA 1NGAA 5K14A 1IKYA 1X3MA 2QWMA 2P9NB 4PWDA 2X6SA 1EX4A 4W5OA 1NOYA 4UY8O 1T05A 1S1TA 1P90A 3VGMA 2B6AA 2KW4A 3CFPA 4JS5A 4ELTA 4FWLA 3U9ZA 1HPMA 3K5LA 1LOTB 3L2VA 4N41A 3A8YA 3K58A 4DF4A 4FWPA 4RW4A 4BRAA 4JHDA 5MLCQ 2A1SA 3D6RA 1VSIA 3NF8A 4FJ7A 4CGGA 2VQFK 4CZJA 4LC9B 4CIFA 4FZXC 1ILYA 1FXXA 3K5OA 4CF8A 5M1FA 4JI7K 2YV0X 1GLEG 3CJAA 4FLZA 3MMVA 1YUWA 4JKHA 2E1ZA 4I2QA 4N76A 1YTAA 1D9FA 4FLYA 1UA0A 4CBUA 2VGNA 3KLHA 2F4VK 4DU4A 2RN2A 1WAJA 1XC3A 4BC4A 4OKKA 4GKKK 1GLCG 2NRWA 3HJFA 1ZXOA 4WYBA 3O3HA 4PKHA 5AR0A 4FJIA 3CCEN 4I2PA 1RT7A 4R5PA 3LDSA 3MN5A 1JXEA 2NLXA 4K25A 3QNOA 3OYDA 1SKRA 2E5LK 1ESVA 4EHTA 2D4WA 1NMNA 4DS4A 4RW7A 3WUHA 2YHXA 4KTWA 4DU3A 2YKMA 3A0IX 4M3RA 1CXQA 3AVCA 3Q7BA 4E1JA 3TAQA 4FXDA 4U7BA 2GX9A 3J7ZO 4Y1DA 3V1OA 2PYJA 3BEXA 3MAQA 1KAZA 4IG0A 1K9MO 3P4IA 1QQNA 2A1RA 4OPAA 3QIOA 3VERA 3KD1E 3VEVA 1Q9YA 5LL6Z 4W5NA 4FJKA 4B3SK 1MA9B 3HSCA 1VSEA 1FW6A 1VSDA 1S1WA 4PHTX 1Q9XA 4IOXA 1VSLA 5GIPA 3OYJA 3VGKA 4CGJA 4KH6A 1VAZA 3OJUA 3LALA 4JI5K 4BRIA 4KFBA 3L2UA 3SLCA 2XHBA 4IO8A 3I33A 1NG9A 3TTDA 2P9SB 5AQSA 2ZJQL 4DWIA 1NK0A 1C6VA 4HHTA 1JKHA 2JWKA 4O8KA 1U49A 3WXJA 5AQUA 5JLHA 5T7BA 3L4IA 2RKIA 4FVUA 4OGEA 2UYTA 2QEXN 2GEMA 4LF5K 4E7LA 1U45A 3OW2M 3QMLA 4KREA 3KIOA 3CYMA 3TU5A 5JMVA 4YFUA 5ELZA 5AQTA 3BP8A 1KAYA 1KSPA 4DTPA 1U04A 3QDKA 1XI1A 1OH7A 4CFAA 4FM0A 4DR2K 4E89A 3O3GA 5BRHA 4YDUA 3M3ZA 2BE2A 1R59O 3ZSVA 1VQLN 3CIPA 3AO4A 2GV9A 5C25A 4MO4A 3CC4N 4FLTA 4FOEA 4OVLA 3R9PA 4YOYA 3RMAA 3DXMA 4BC5A 1UA1A 2ZQBA 2HHWA 5LMUK 3CMEN 1KLMA 1WB9A 3TAPA 3E9PA 3M5RA 3F2KA 4QOZB 5JLFA 4OJRA 1BQNA 2DPNA 2PZSA 1HMVA 3PIOL 4JD2A 3E9OA 4DQIA 2A40A 2Z1HA 3F5TA 5AFUA 1VSJA 3TSPA 1T8EA 2YNIA 1RILA 4M7XA 4DUYK 3NF7A 4FPBA 3SAHA 4LH5A 3THYA 1S5JA 3ID8A 2RF2A 4FZYA 5BN8A 4H0TB 1RTHA 4FK0A 1U4BA 1BIZA 4BACA 3WQUA 5FPEA 4BRLA 3V9ZA 3L3UA 2RPIA 1T44A 1CXUA 5AQFA 3PX6A 1KVCA 3JXUA 1NGFA 2FBTA 5AZJB 4A62A 4CZEA 3CCVN 4B3TK 4NB4A 3V9UA 1Q82O 4YY3K 3RMBA 3UKRB 4XIUA 3AO2A 2I7PA 4DR1K 3LP1A 4CFCA 1YT3A 3V81A 1S9GA 4ID5A 4IJNA 2IS3A 4FM1A 4H8KA 3FR0A 2HOEA 4WFAL 2PFUA 2HHHK 4CERA 3B6PA 4A2AA 5I3UA 1TAQA 3VGLA 3C95A 1ZC6A 4WQ5A 4LD0A 3U3YA 3WNFA 4E1MA 3KZBA 1VSHA 4K41A 1RT3A 4IO9L 3CJ7A 3FZLA 4CF0A 4CIEA 3DLRA 3O4WA 3C6AA 1QS4A 3K9JA 4KKOA 3VTIA 3VQBA 4JI6K 3FLCO 3AVBA 3NFAA 3MK6A 4WQ4A 3WEEA 3OYHA 3H1QA 3VQDA 3O1BA 3HVTA 1S6QA 1ATSA 1DLOA 1EP4A 3S3MA 3ZEUB 4FZZA 1TL3A 3TANA 2ZD1A 3BGRA 1C0MA 3O9TA 3CMAN 2QXFA 4JKDA 2DY4A 2P9KA 1X9WA 4BG9A 4BRKA 3HXMA 1HUXA 1DT9A 3OYKA 2QTDA 4J2AA 3KD5E 1JLFA 3O80A 2G8FA 3WNEA 3VEYA 4Z4EA 3V1QA 3QESA 1Z6RA 3VF2A 4ILJA 1U2VA 3QEVA 1T3VA 4CD3A 5CZ1A 3VA3A 2FSJA 5CHIA 4B3MK 1ZBIA 2KZZA 2R7YA 1ASVA 4DV6K 3PO4A 4FLXA 3VQPA 3AA3A 1WOQA 1NLVA 4BQLA 4FJXA 2FC0A 2QWPA 3UIQA 4IBNA 1CLQA 4DR6K 1L3VA 2YNFA 1JLBA 1TKDA 1G15A 3OYEA 1B9DA 3TWHA 1RDUA 3HK2A 4Z0UA 1WNSA 2E2PA 2HB5A 3EKSA 3Q7CA 3THWA 5AQIA 4BC2A 2A3ZA 3O4QA 3ZX2A 3VQ4A 1TGOA 2W41A 1FKOA 4GY2B 4RW8A 3IG1A 4DSLA 2YKNA 4KAZA 3DLHA 1E4FT 2IAJA 2QA4N 4KPYA 5J1EA 1NGHA 2IDOA 4EZ6A 4JK8A 1G99A 4E1NA 4Q0BA 3AO3A 2A6AA 4YORA 4CJUA 1RBUA 3OYCA 1JXBA 3SQ4A 4BC3A 4H03B 2WTUA 3CG7A 3P38A 3TAGA 2FF6A 2NRHA 2WOMA 3VEZA 4M42A 3BF1A 3RVCA 1M90O 2HNYA 4JKFA 4JHDB 3AA4A 5CR4A 3BZCA 4EFHA 1RCHA 3KLFA 1Q8IA 5J2QA 4IZ9A 4CHYA 1YIJN 2F7TA 4A2BA 2KTQA 1LAWA 3CD6N 3SAFA 5C2DA 3MXJA 3T1YK 2V52B 5JICA 3C7NA 1XHZA 2VG5A 1WN7A 1GOCA 1BA1A 2I5JA 5C12A 4PKGA 4H4MA 4ZTJA 5BR8K 4CJWA 3CPEA 4CJLA 2Q0UA 5GAEP 4FWSA 3H46O 1RDBA 4J2BA 5EXWA 2OYQA 2OZMA 3LDPA 3AVJA 1IBKK 4M3UA 1VRTA 1KD1O 2I7NA 3CFRA 5KQDA 3C94A 1EXQA 2FF3B 1VSMA 4M3WA 4X65K 5KQ8A 5IWAK 4LF7K 2HNDA 3G25A 1RTIA 4ICLA 2OCEA 2CH5A 1BHLA 2OPPA 1UOCA 4DFKA 3OYMA 4FWOA 5FPDA 4DV4K 1NMDA 4CJSA 4B3OA 2BTFA 5TKWA 2Q3SA 4IFVA 1TYQA 3NMUA 4M63C 3AGKA 3OYIA 2W42A 1VSKA 3DAWA 4NCGA 4KHSA 3HPOA 2CGKA 4GW6A 3T19A 4CEFA 3AVIA 3TAMA 1JL1A 4CHZA 3ZYYX 4BWMA 3LANA 3LPUA 3JSMA 3DI6A 1SZ2A 3THVA 1TVRA 4YDUC 2O4GA 2YHBA 2YHYA 1BO5O 2OPRA 4Y1CA 4DQQA 4GV9A 3OS0A 4DS5A 4K8ZA 3K5NA 2X74A 3MCPA 4CI6A 2OPQA 2Q31A 1GLAG 1WSGA 3HOSA 1JJ2M 3CM6A 3OBYA 4H5WA 1GOBA 1RBVA 1HQUA 4A57A 4K0KK 4FW1A 4HWIA 3P31A 4I6MA 1VQ6N 3L2QA 3MX5A 4DLGA 2YNHA 4DTOA 1OH6A 3EL2A 2V7YA 1HR0K 1T03A 4JK9A 1D4XA 4JI4K 1BL3A 4JKBA 4CE9A 1HYVA 1TAUA 4AHRA 4ISGA 2Z1GA 3G10A 3VQ9A 4KBOA 3EYZA 3SPZA 1D8YA 2JGUA 4OLBA 3VETA 2XY8A 3DLGA 1MU2A 3PX0A 2HMIA 1HPZA 3LP2A 1RDWX 3AVGA 4JI8K 3QINA 3RR7A 3H1VX 4H0VB 4EP5A 4E7JA 4BRQA 3H08A 4BR2A 4BROA 2E2OA 1NJYA 4KHNA 3O3FA 3DXMB 2QWOA 4C8NA 2YJEA 3DXKA 2QWRA 5M1OA 3H3NO 2J4RA 4AQYK 1BIUA 3J8AA 2IOCA 4TSXA 2P9LA 4F3TA 2Y1IA 4X64K 1SL2A 1GOAA 4C23A 4DKWA 4JD2B 2P9PB 3E9LA 4WQ5C 4EIAA 3L3VA 1YXQA 3ZX0A 4AILC 4FYDA 1RDDA 1K8KA 3THYB 2GWJA 3H3OB 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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