1WLJA

Human isg20
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
173
structure length
168
Chain Sequence
EVVAMDCEMVGLGPHRESGLARCSLVNVHGAVLYDKFIRPEGEITDYRTRVSGVTPQHMVGATPFAVARLEILQLLKGKLVVGHDLKHDFQALKEDMSGYTIYDTSTDRLLWREAKLVSLRVLSERLLHKSIQNSLLGHSSVEDARATMELYQISQRIRARRGLPRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of human ISG20, an interferon-induced antiviral ribonuclease
pubmed doi rcsb
molecule keywords interferon stimulated gene 20kDa
total genus 53
structure length 168
sequence length 173
ec nomenclature ec 3.1.13.1: Exoribonuclease II.
pdb deposition date 2004-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00929 RNase_T Exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1wljA00
3M8RA 4M41A 3QEPA 1BIUA 3H08A 3QNOA 3ZSXA 3OYCA 1N5YA 3VQ5A 3SUPA 2ZD1A 4CEAA 3O4NA 1BCMA 2G8IA 3LAKA 4DSEA 1WN7A 5K14A 3DRSA 1KCFA 4CJUA 3RRHA 4CEDA 4CHNA 1FXXA 1LAVA 3AVNA 2VWJA 2KQ2A 2VG5A 3AVBA 3V9ZA 5J2QA 3SPYA 2G8HA 1SL0A 2IS3A 4FJIA 4RW8A 1SUQA 3KK3A 3V1RA 4M3TA 3C6UA 3WNEA 4MFBA 4CJ4A 4KREA 1UAXA 3M8SA 4KHNA 4K8ZA 2HNDA 4C8KA 2X74A 4IG3A 3O3GA 2O4IA 2KZMA 2VG6A 2FBXA 3HP9A 2ZQBA 4OPKA 5J2PA 1L3SA 4DG1A 1BI4B 2ITGA 4HHTA 4AHSA 4NYNA 3KTQA 1RDDA 3QIOA 1NJYA 4KHUA 5CYQA 2FC0A 3PX4A 3U6FA 1C0UA 4Z4HA 3K5MA 1QSSA 4E3SA 3RRGA 3LP3A 1T8EA 4E89A 3QETA 3NH2A 4DWIA 3AVMA 3QEVA 1XHZA 4K8XA 1X9SA 4PQUA 1HNVA 4HUFA 1KLNA 1ASWA 4CF0A 4KTZA 5HBMA 3PX6A 1NJXA 4HUGA 3S3NA 2OPSA 4Z4IA 2XRIA 4I2QA 2D0AA 5T7BA 3U3YA 1NK0A 1YTUA 2HHVA 4B9NA 2JGUA 5JS2A 4CHQA 4PUOA 4F3TA 4CEFA 1LW0A 4Y1DA 4CCHA 3MXIA 3VQ6A 1XWLA 3RMAA 1D9DA 4HCCA 4CFCA 1SL1A 2Z1JA 3E01A 4KTQA 2PY5A 4OKJA 4R5PA 2BE2A 4F3OA 1ASVA 3V9SA 2R7YA 1UWBA 3P1GA 2EHGA 3IRXA 3MECA 4M45A 1VSDA 2YKNA 3CFOA 4AHRA 3VQBA 5J1EA 3CQ8A 3EY1A 3TAFA 5SWMA 4TSXA 3M8QA 3V6DA 4F2SA 4FJ9A 2GUIA 3WNHA 4FCYA 3RTVA 3HSTB 4FJ7A 2YHAA 3QINA 1JLFA 4E19A 3NCIA 4KAZA 1S1WA 1D5AA 4AHCA 4M3WA 4Z0UA 5J2NA 2ATQA 1IKWA 1JXEA 3DMJA 2OA8A 3VQEA 3SCXA 5FRNA 2DFEA 3DRPA 3KKSA 1U49A 1CLQA 3LP1A 2YHBA 4B9VA 4B08A 4IKFA 1KVAA 5CZ1A 3VQPA 2FBTA 4NYFA 3OYEA 3NF7A 4IG0A 4I2PA 4YNQA 2YNGA 3G0ZA 1QSYA 4BACA 4H8KA 3O3HA 1TKTA 2A1RA 3K5LA 3QEXA 4FJMA 4ICLA 4ELUA 2QKBA 1HYZA 4CEBA 4KI6A 3L2UA 3HPOA 1TL3A 1C0MA 2WONA 3NF9A 3HK2A 2QXFA 4RW4A 2QK9A 1MU2A 4DTUA 1VRUA 5HRSA 5HROA 2HW3A 1L3TA 3OYIA 4Z4FA 4CEOA 4CGIA 2XY5A 1NK5A 2PYLA 3VQ7A 4CJPA 2X6NA 4FZYA 5DK5A 1HQUA 1HJRA 1TK0A 3MXJA 4FK2A 4N56A 4QOZB 3VN5A 3OYAA 5I42A 1LWFA 3V9XA 2RF2A 5KRTA 2PYJA 1RBUA 3HJFA 2P51A 3OYNA 4L8RB 4FW1A 4RW7A 1NOYA 1WSGA 4B9MA 3AVGA 1B9DA 4KKOA 4E1NA 5CYMA 4BWJA 1CXUA 3HM9A 3AVJA 3LPUA 1WAJA 2EX3A 3PO5A 2OPRA 2Z1HA 3VQDA 2HHXA 1SL2A 4W5QA 4J2DA 3KKRA 4B9LA 1KLMA 3RWUA 4M3RA 3KLFA 3ALYA 3LWMA 1WSIA 4ZTJA 2FBVA 3NDKA 2YKMA 3SV4A 1F21A 2E6MA 3LDSA 3OY9A 1HMVA 2HNZA 1BI4A 4CEQA 4DQRA 1S5JA 4CEEA 1JLCA 1ASUA 1VSIA 4BDZA 1WSHA 5JS1A 4CK3A 1QE1A 1VSEA 4Z4CA 3S3OA 1U47A 1KSPA 5FDLA 3OYMA 2OYQA 1WLJA 1QQCA 2HB5A 3LP0A 1BCOA 4CJKA 4DFPA 2XY6A 4CJ5A 3NGZA 1T7PA 1YTAA 1YVUA 1NKEA 3P5JA 1WSJA 1ZBIA 2GBZA 3NE6A 3VA3A 3CG7A 4DLGA 1D8YA 3NGYA 1TKXA 4FZXC 3IG1A 3MEGA 1JXBA 2RKIA 3HYFA 5KGWA 3AA5X 3NBPA 3ZSOA 4FLWA 4OJRA 4DF4A 4M3YA 3OYKA 3EYZA 1NK4A 1BGXT 4IFVA 1FKPA 4I7FA 1IG9A 3NAEA 4J2EA 4KI4A 2B6AA 2ETJA 1J54A 3I0RA 3SQ4A 2KZZA 1BISA 3KLIA 2YNIA 3L8BA 4E7JA 4FJKA 5HLFA 4MQ3A 1UA0A 3EZ5A 1EKEA 4CF8A 3MXMA 4E0DA 4CGFA 2IAJA 3DRRA 1S1XA 4FLVA 3OYLA 4KO0A 3HPGA 1QHTA 1NK7A 1RCHA 1S9EA 5EU7A 4CFDA 2QKKA 3LZJA 3TWHA 3SJJA 2I5JA 1UA1A 1I39A 1ZBUA 2YV0X 1O1WA 3OYHA 1TVRA 3F73A 2W42A 4DLEA 4KHYA 1KFSA 1S1VA 4CFAA 1Z26A 3DLGA 3ZSVA 2XHBA 4Q5VA 2PZSA 3RMCA 4RG8A 4DQPA 4FJNA 2D5RA 3I8DA 1T03A 3AVCA 4FLUA 4DTXA 4G1QA 4NCAA 4CJLA 3A2FA 4OGCA 3TARA 1ZBHA 1GOBA 4UQGA 3KJVA 3L2WA 4DSJA 3HT3A 1DLOA 3VQ4A 1NOZA 4CGHA 1RT3A 1Q9XA 1Q8IA 3MAQA 4FJ5A 4DQQA 1JL1A 1FK9A 3OS2A 4EZ6A 4N76A 1RNHA 1SV5A 1J9AA 3AA3A 3P83D 4GW6A 4JRPA 3NH0A 4EZ9A 1KVBA 1X9WA 3MEDA 4E7LA 4FJHA 3WNFA 1I3AA 3HVTA 4CJQA 4O0IA 3T3FA 3T19A 4FK0A 1W9HA 3LAMA 4PA1A 2G8UA 3RR7A 3ZT3A 3OJUA 3KLGA 4DS4A 1RTHA 2IOCA 1CXQA 4FLXA 3JYTA 2E6LA 2OPQA 2P1JA 2G8KA 3B6PA 2JLEA 4HUEA 4KHQA 4I9QA 3DLKA 1IH7A 1JKHA 1UOCA 4NCGA 4CESA 1NKBA 4DFJA 1TKZA 1D9FA 4Q0BA 3PUFA 4HCBA 4CJVA 2DY4A 3AVAA 3AO1A 3OS0A 3SI6A 3K57A 1JL2A 4YFUA 3PY8A 4CECA 4FLTA 5CZ2A 4CJWA 4ELVA 3DLRA 4CGJA 2X6SA 2P5GA 4O55A 1DTQA 1KTQA 4Y1CA 2RPIA 2DFFA 3OYDA 4FW2A 4DQSA 2Y1JA 1TV6A 5HRPA 4CHOA 3HO1A 3BGRA 4IBNA 1RT2A 1XI1A 1LAWA 2KW4A 3KIOA 4FJLA 4M3ZA 2HHUA 1VSHA 2HHWA 1Y97A 1Q9YA 4B3OA 2Q3SA 4DFKA 3SQ2A 2HHSA 1N6QA 1WNSA 5SZTA 1L3UA 1WSFA 1RBRA 3ZT4A 2OZSA 1RTIA 2IC3A 3KK1A 1EXQA 2NUBA 4LY7A 4ID5A 4B8AB 2OZMA 4CERA 3TI0A 4FYDA 3I0SA 4DTMA 2BDPA 3DM2A 4DF8A 1IKXA 4B9SA 4AH9A 1S1TA 3KLHA 1C1AA 4CIFA 3U3GA 3QIPA 3K2PA 4W5NA 1U48A 3QO9A 1C1CA 4CF9A 5FROA 3F9KA 4KHWA 1NK8A 1B92A 4W5OA 1J53A 1HYVA 4FM1A 4DTNA 1BIZA 3TAMA 4OLAA 3V4IA 3AV9A 3OYFA 3K58A 3D45A 3QEWA 3V81A 2Z1IA 3M8PA 2F96A 3L2VA 3QERA 4W5RA 1QSLA 4OGEA 1U45A 4FXDA 4E7IA 3TAPA 1BHLA 1X9MA 3AA2A 1BQNA 1A5XA 3UIQA 4JS5A 4ELTA 2A1SA 4OKEA 3HP6A 4H4MA 1EETA 1NK6A 4B9TA 4DFMA 2XO7A 3HPHA 5KTQA 4Z4GA 5KI6A 1B9FA 3LZIA 1HYSA 4CK1A 3DYAA 1TK8A 4FJ8A 3AVIA 1RBTA 3DOLA 5DMRA 3L2RA 4C8NA 5C25A 3OYJA 3NGIA 1U04A 1NKCA 4PWDA 4N47A 5C24A 3C94A 4FVMA 4DTPA 2F8SA 2X78A 3SQ0A 4C8MA 3AO2A 4DU3A 3O3FA 4BDPA 4CJTA 1GOAA 1KVCA 3L3VA 1LV5A 3DI6A 2IDOA 3HVRA 3ULDA 4QAGA 4DTOA 3SUOA 4N5SA 3TABA 4CJ3A 2BGGA 1XC9A 4AHUA 4B9UA 1TKDA 1KFDA 5C42A 3QEIA 4FJGA 3LALA 1U4BA 4FJXA 4JS4A 3SUNA 1T05A 1YT3A 1A5VA 1S1UA 3DLEA 4KTWA 1RDCA 3D0PA 2P5OA 4EP4A 5HRNA 3K5OA 3HXMA 4FM2A 4GMJB 4B8CA 4CE9A 2DFHA 3BDPA 4RW9A 1SKSA 1ITGA 2BANA 3AA4A 4BE1A 4KB1A 4IFYA 1EX4A 4AILC 3MEEA 4CJFA 3AVKA 2E4LA 3LWLA 4ZTFA 1HPZA 2Y1IA 2VWKA 1K6YA 1CZBA 3C6TA 3OYBA 4CJSA 1W0HA 4DTRA 1WAFA 2LSNA 3SNNA 4E7HA 4NCBA 1X1PA 3FFIA 2D0BA 2GV9A 4AHTA 4GVMA 3SQ1A 3VQAA 3TANA 1RDAA 1VSFA 3RR8A 5I3UA 1ZBLA 3O4QA 3LANA 1QTMA 4C8OA 1VSKA 2HVHA 1JLBA 1RT1A 1VSLA 2VG7A 2KFZA 4LSLA 4FLZA 1J5OA 3V1OA 3KLEA 1HNIA 3OVNA 3JSMA 3AVFA 3ISNC 1L5UA 2KTQA 2YNFA 4BE0A 4N41A 4DTJA 3AO3A 3CFRA 3SV3A 3TAEA 2HHTA 1G15A 4O5BA 4PY5A 4EP5A 3PX0A 3S3MA 1EP4A 4CEZA 3ZSZA 3IAYA 4DQIA 1IKYA 3RMBA 1C1BA 4CHYA 3S9HA 4LH5A 4I9LA 2O4GA 1TL1A 3OYGA 1NK9A 1RT6A 3AVHA 4OPJA 4XIUA 4KRFA 2HNYA 4DSFA 4DSLA 1RT5A 4Z4EA 4LSNA 1RT7A 4CGGA 1RBSA 2XY7A 1A5WA 1JLQA 1NJWA 4DSKA 3L2QA 3VQCA 3NH1A 1RBVA 1JLGA 4O4GA 4ZHRA 4WE1A 3AO4A 4CIEA 4E1MA 3LPTA 2YNHA 3NF8A 2Z1GA 3KK2A 4BDYA 4C8LA 1HRHA 1FKOA 1Z25A 3NFAA 4O44A 4ID1A 4CF1A 4BE2A 1TK5A 1S6PA 1VK0A 3IS9A 3ZT2A 3VQQA 4CFBA 3VQ9A 1WSEA 1S9GA 4CJRA 2G8WA 1S6QA 4OKKA 3OJSA 4DMNA 4HVJA 2RN2A 4H4OA 1LW2A 4LD0A 3DLHA 1CZ9A 1RILA 3ITHA 3T1AA 4AHVA 4IDKA 2HMIA 3CYMA 4CHZA 1RT4A 4FLYA 3PV8A 4CJEA 3KD1E 4DS5A 4KHSA 4F8RA 1JLEA 4M3UA 5D3GA 1C0TA 3C95A 4CGDA 4FJJA 2AJQA 1C6VA 3QLHA 4M42A 3ZCMA 3WNGA 4J2AA 1DTTA 2G8FA 3THVA 5E41A 2HHQA 4CK2A 3G10A 3K5NA 5J2MA 1QS4A 3LP2A 4F2RA 3QNNA 2FBYA 3L3UA 4M3XA 1JLAA 3AO5A 4LH4A 2G8VA 3ZSYA 4KB0A 1ZBFA 4HTUA 4DU1A 5FRMA 2D0CA 4OVLA 4CF2A 5HP1A 2OPPA 4KFBA 4CHPA 2B4JA 2B5JA 4J2BA 3SYZA 3SZ2A 4OLBA 3VA0A 3V9UA 4RW6A 5CY4A 3TR8A 2F8TA 3RMDA 3OS1A 4JLHA 1VRTA 3AVLA 1SKWA 1XHXA 3CM6A 3NHGA 3ASMA 1VSJA 1IO2A 3DLBA 3PO4A 4QCLA 2HVIA 2XY8A 4E7KA 3QESA 4CIGA 3SPZA 1LWEA 3ZSRA 1HQEA 1R0AA 3B6OA 1NJZA 1BL3A 5KGXA 3V1QA 2WOMA 1ZYQA 4FK4A 1KRPA 4KPYA 1RDBA 3VQ8A 5KRSA 3ZT1A 3CM5A 5HRRA 4BWMA 3HL8A 3TAQA 4W5TA 2IGIA 3KD5E 1IKVA 3V9WA 4DTSA 2KFNA 3NF6A 4DU4A 1GOCA 3K59A 1BQMA 2ZE2A 1RTDA 3ZSQA 3ZSWA 4FZZA 1TGOA 3ZT0A 1TAQA 1SKRA 1L3VA 4KV8A 3DOKA 3CFPA 1REVA 1TAUA 1LWCA 4DSIA 4F4KA 4JRQA 4O0JA 3SUQA 1VSMA 4FM0A 2DTUA 3TAGA 1RTJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AFUA 4FPBA 3E9OA 4NXMK 2J4RA 3GL1A 4O8UA 5AQKA 3LAKA 3O9SA 1WN7A 4CJUA 4CEDA 2KQ2A 3V9ZA 3AVBA 4JK7A 4BVOA 1HKCA 1GLJO 3WNEA 1N8RO 1RDWX 3UKRA 4YOUA 3M8SA 4KHNA 4C8KA 2O4IA 2KZMA 4A61A 2ZQBA 5J2PA 3T1YK 4A5AA 1BI4B 1RDUA 2GTDA 4JKGA 4NYNA 4AHSA 5CYQA 4CZJA 1QSSA 3RRGA 1VAZA 4E89A 4H5NA 3QETA 3AVMA 4BRGA 2D1KA 2O8BB 3OHRA 4Z4IA 1YTUA 5T7BA 2D0AA 4K41A 2IVOA 2JGUA 4CEFA 1LW0A 3MXIA 3FFKB 1D9DA 4HCCA 4CFCA 3EEQA 1SL1A 2F9TA 2Z1JA 3E01A 1YITN 5AQZA 4JI0K 3V9SA 2CH5A 3CFOA 5J1EA 3CQ8A 4TSXA 1JLFA 3NCIA 1TUUA 5DM7L 5J2NA 2ATQA 1IKWA 3CERA 1JXEA 2P9UA 3SCXA 3LP1A 4BREA 5FPEA 3NF7A 2YNGA 3G0ZA 4XEIA 4BACA 3DWLA 3K5LA 3QEXA 4ICLA 2QKBA 4BY9C 1QVGM 4CEBA 4KI6A 3HPOA 3U8XA 1C0MA 3HK2A 1MU2A 1NGAA 5HROA 4NO7A 1NGIA 2XY5A 4DUYK 3CI5A 1TK0A 3MXJA 4QOZB 3VN5A 5I42A 1LWFA 2PYJA 4CZMA 2PBDA 1RBUA 3CHWA 3HJFA 2VQEK 4FW1A 1NOYA 1P8ZA 1WSGA 3AVGA 4B9MA 2W6LA 1WAJA 2EX3A 2OPRA 2Z1HA 3VQDA 1KD1O 3VF4A 1OH5A 3LDPA 1YXQA 5LMUK 3THYB 3KLFA 1QVFM 3CCUN 3O8MA 4ZTJA 4NXNK 1ILYA 1VQ5N 3LDSA 1HMVA 4CEQA 1BI4A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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