1WLJA

Human isg20
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
173
structure length
168
Chain Sequence
EVVAMDCEMVGLGPHRESGLARCSLVNVHGAVLYDKFIRPEGEITDYRTRVSGVTPQHMVGATPFAVARLEILQLLKGKLVVGHDLKHDFQALKEDMSGYTIYDTSTDRLLWREAKLVSLRVLSERLLHKSIQNSLLGHSSVEDARATMELYQISQRIRARRGLPRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of human ISG20, an interferon-induced antiviral ribonuclease
pubmed doi rcsb
molecule keywords interferon stimulated gene 20kDa
total genus 53
structure length 168
sequence length 173
ec nomenclature ec 3.1.13.1: Exoribonuclease II.
pdb deposition date 2004-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00929 RNase_T Exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1wljA00
4UQGA 4F3TA 3P1GA 3AO4A 2HW3A 4KREA 3U3GA 1XI1A 3IRXA 2KZMA 1ASUA 4FXDA 4FLWA 3KKRA 3AVFA 3PX0A 3SNNA 4OVLA 4BE0A 3UIQA 1ZYQA 1C1CA 3VQQA 4J2EA 4DF4A 1KCFA 1S9GA 3KK1A 1D9DA 3AVIA 4CJ4A 4BDPA 1NOYA 5CYMA 4HCCA 3KD1E 3OS0A 2DTUA 3NGYA 4RW8A 4CHOA 1WN7A 3VQ7A 4KB1A 3LPUA 2HHQA 2YNGA 4HUFA 4I9QA 4CJRA 4RW6A 4M3RA 1QSSA 4FK0A 1BIZA 4H4OA 3JYTA 1JL1A 1VSDA 4FLZA 1A5WA 2XRIA 3AVKA 4NCGA 3ZSXA 3SV4A 4N47A 3F73A 1DLOA 4ID1A 2A1RA 4KO0A 5CY4A 1ZBIA 2LSNA 1D9FA 4AHTA 2IAJA 5JS2A 4CEBA 4JS4A 1NK0A 1CXQA 3LAKA 3V1OA 4CGIA 4CFDA 4DMNA 1S9EA 1RDAA 1TL1A 3RMDA 1C6VA 1WLJA 3ZSYA 2PY5A 2OYQA 3OYCA 3L3UA 4NYNA 4CK2A 1TKXA 1TVRA 4GW6A 4DTJA 2XY6A 4F4KA 5J1EA 3AO1A 3M8QA 1A5XA 1JL2A 4FZXC 2HMIA 3KLGA 3L2QA 2XHBA 1T03A 4FLTA 1ASVA 3AA3A 3OS2A 1I3AA 4AHCA 3HK2A 4FJ5A 3DI6A 3ISNC 4HUEA 2JLEA 2ZD1A 4KAZA 4FJGA 2B4JA 3SI6A 5T7BA 1SKRA 1LWCA 2YNIA 4CJSA 3QEXA 1FKOA 3VQPA 3KK2A 1U48A 4N41A 4FJMA 3NH2A 4CFBA 3AA5X 2QK9A 1D5AA 3HPHA 4E0DA 3O4NA 4CIGA 4KHQA 1RBSA 3QETA 1VSHA 4PA1A 3NFAA 4K8XA 3DM2A 3KD5E 3A2FA 1LW0A 1B9DA 4B9SA 1NKCA 2OPRA 4EP5A 3NGIA 3JSMA 4YNQA 1ZBFA 2B5JA 3RMBA 1TK5A 5I3UA 2HHUA 3EY1A 4DQPA 1NK9A 2F8TA 1QHTA 4NCAA 4Z4HA 3HT3A 4BE1A 4PQUA 3TABA 2IGIA 3BDPA 3SQ4A 4ELUA 5HROA 3LZJA 1IKWA 2Z1HA 1SL0A 2DFHA 3O3FA 1SL1A 1W0HA 4QCLA 1HNIA 4CGDA 1ITGA 3O3GA 1S1VA 1RBTA 3OYDA 3K5LA 1BCOA 2Q3SA 4KHYA 1NK4A 3KLHA 1UWBA 3RRHA 4DTUA 1C0UA 1U47A 1HJRA 3VA3A 1HPZA 4OLAA 2E6MA 3DLRA 4DTNA 3DLEA 3NGZA 1EX4A 2KTQA 3DRRA 4CEZA 5KRTA 3CQ8A 2YKNA 3MXMA 2KFZA 2OPQA 2HVIA 1GOAA 5KRSA 4E7KA 2O4IA 4AHUA 3QERA 1CLQA 4W5TA 2EHGA 3AV9A 1IKYA 3DLGA 4CJ5A 4XIUA 4C8KA 3TAFA 4FZYA 4G1QA 4ZTFA 4M3ZA 4KKOA 4EZ6A 2RN2A 4CFCA 4CHQA 4N56A 2IS3A 4CJPA 1BQMA 4BDZA 1NK5A 4CF9A 3AVJA 4I9LA 4W5RA 1TGOA 3RR7A 2F96A 5FROA 1C0TA 3NF8A 4FM2A 1CZBA 2PYLA 3LP2A 1RDBA 2X6SA 4M41A 3DLBA 3VA0A 3V1RA 5CZ2A 1HQEA 3VQ9A 4BDYA 1Q9YA 4K8ZA 1S5JA 2HB5A 3ALYA 3ZT1A 2WOMA 1Z25A 2HNYA 3THVA 1D8YA 3ZSOA 3AA4A 1WSJA 1XWLA 1B92A 1YT3A 1X9MA 1RBUA 2BDPA 3AO3A 4KTWA 3SQ1A 4FZZA 3M8PA 3S3NA 1JXEA 3V6DA 1WSHA 3TWHA 1Q9XA 1CZ9A 1Y97A 2D0CA 4PUOA 3HYFA 4BWMA 4ZHRA 4CK3A 3L2RA 3U6FA 4JRPA 4M3TA 3HJFA 3IG1A 4B9NA 1IKXA 2YNFA 1TL3A 3QEWA 2XY5A 1L3UA 3DYAA 1RILA 3MAQA 1LW2A 4IG0A 3KJVA 4LSLA 1TKZA 3AVAA 3V4IA 3QEPA 3DLHA 1R0AA 1L3TA 4B9VA 1DTQA 3M8SA 1LWFA 3HPGA 3LP3A 5FDLA 3O3HA 1SKSA 2P1JA 2HNDA 3EZ5A 2OZSA 4IKFA 1HYSA 1FXXA 4CK1A 3OYIA 4E7JA 3AVHA 1U45A 2HHSA 4HHTA 3KKSA 4RW9A 2XO7A 3NH0A 4FW1A 1WNSA 1YVUA 3DLKA 4IBNA 1QSYA 4I7FA 3RMAA 5J2QA 3OYBA 4AILC 4KI6A 2BE2A 3TR8A 4CF2A 4Q5VA 4HCBA 1EXQA 3OYMA 3VQAA 4KPYA 4L8RB 4Z4CA 1NJXA 2OPSA 3KLFA 2VWKA 1RT5A 1TKDA 3VQCA 3B6OA 2Y1JA 4C8OA 4DTMA 4Y1CA 4AH9A 4FCYA 2OA8A 3SUQA 4AHRA 4DTXA 1RBRA 2QXFA 1NJZA 4DSJA 2BANA 1RT6A 4FJXA 1C1BA 3NH1A 2P5GA 1U4BA 1VK0A 1ZBUA 3ZCMA 1JLAA 4CEOA 2YHBA 4FW2A 4CEQA 5SWMA 4YFUA 1S1UA 3CYMA 1HYZA 2VG7A 3WNHA 4CEDA 1RCHA 3OYKA 3SZ2A 3SUNA 1XHZA 1BGXT 4FJNA 4BE2A 2P5OA 4M45A 3PX4A 1VSKA 1LAWA 3SYZA 4DWIA 1L3VA 1VSIA 1IH7A 3PO4A 1SKWA 3HSTB 5CZ1A 1KSPA 2YNHA 2G8WA 2IC3A 3K2PA 3ZSQA 4CESA 4Y1DA 4B8CA 4DTRA 1C1AA 1X9WA 1XHXA 2D5RA 3AVGA 4CGGA 1K6YA 3DRPA 4KTZA 1O1WA 4KHNA 3ZT4A 4FJLA 3C95A 2OPPA 3LPTA 2G8FA 1TV6A 3KLIA 3KK3A 3CFPA 1JLGA 1ZBHA 1A5VA 4DTSA 2Z1IA 2G8VA 4R5PA 2HNZA 1HQUA 3QIPA 4FJ8A 2G8IA 1WSGA 2PZSA 4CEEA 2XY8A 4DSIA 2RKIA 2VG6A 4JRQA 4FJJA 2HHXA 3DOKA 1LV5A 3OYAA 3RRGA 1IO2A 4E1MA 1LWEA 1JXBA 4O44A 3OYEA 3EYZA 1GOCA 3HPOA 3AVNA 4MFBA 1KFDA 3V9ZA 1QSLA 3AO5A 2E4LA 4QAGA 4CIFA 4CEFA 3T1AA 3HP6A 2NUBA 4FLYA 4DQSA 4CJ3A 2E6LA 2R7YA 4DS5A 1BCMA 4CGJA 3HP9A 4H8KA 4CHPA 1X1PA 4FM0A 2Z1GA 3SQ2A 4GVMA 4JS5A 2FBXA 4OKKA 3K5OA 1FKPA 1UA0A 1RT1A 4E19A 4OKEA 3RR8A 3NF9A 3K5MA 4OKJA 3C94A 3TANA 2FC0A 3QIOA 2KFNA 1ZBLA 1TK8A 1RT7A 1TAQA 3V1QA 3SPZA 4C8MA 1J53A 4LD0A 1N5YA 1C0MA 3T19A 1IG9A 1TK0A 3OYNA 4N76A 3MEEA 1VSEA 1HMVA 4DLGA 3PY8A 4CFAA 1RTIA 4O0IA 3QO9A 2YHAA 4IDKA 4O55A 3E01A 1LAVA 4Z4EA 1RDDA 3V9SA 4MQ3A 4CECA 4LSNA 5EU7A 4FVMA 2W42A 3AA2A 2DFFA 3AVLA 5KTQA 3QNNA 3RMCA 3HVRA 4W5QA 5FRNA 3HVTA 1ASWA 4LH5A 4M42A 1SV5A 4ID5A 4CJKA 3WNFA 4KRFA 5KGWA 1RT2A 3NAEA 3PO5A 3PV8A 4FJHA 4J2DA 5HBMA 3G0ZA 1RTJA 2GBZA 3NBPA 4FLUA 3H08A 4FM1A 4DSFA 1NK8A 4E3SA 4ZTJA 3HXMA 1HRHA 1RTDA 2P51A 3AO2A 1S1TA 1RT4A 4IG3A 3IS9A 3D45A 3RTVA 3U3YA 3FFIA 4J2BA 4B9MA 4ELTA 1YTUA 2KQ2A 4HTUA 4B9UA 5E41A 2FBYA 3WNEA 4KHWA 3LWMA 1T8EA 3AVMA 5HRRA 3ZSWA 3LALA 1EKEA 1TAUA 3MEGA 4OGCA 4CGFA 3HL8A 1MU2A 4OPJA 4E7LA 3C6UA 3OVNA 1BQNA 1WSFA 4C8NA 5HLFA 2A1SA 2D0AA 1BIUA 1KVCA 1U49A 1SL2A 4M3YA 1U04A 3MEDA 1XC9A 4O0JA 4CJUA 2DY4A 1NJWA 1BL3A 2KW4A 4F8RA 4B8AB 3P5JA 2D0BA 4BACA 5HRNA 4DQRA 3OY9A 4Z4GA 3SCXA 2I5JA 3DRSA 4KV8A 2BGGA 3OYGA 4FJ7A 3C6TA 3ZT0A 2DFEA 1JLEA 3NCIA 1JLFA 1J54A 4DFKA 2ZQBA 4H4MA 3VQ6A 3OS1A 4NYFA 5I42A 3VN5A 1VSMA 2GUIA 2O4GA 2VG5A 4F3OA 4EZ9A 3HO1A 3ASMA 3ULDA 3NE6A 5HP1A 4CERA 4M3UA 4CHNA 1KVBA 4CE9A 1I39A 1FK9A 5HRSA 3MXIA 4FYDA 2HHVA 1RDCA 1WAFA 1NK6A 3KTQA 1JKHA 3QEIA 4J2AA 3WNGA 3LAMA 3VQ8A 4DQQA 3SPYA 4CJFA 4CF8A 1NKBA 4F2RA 5HRPA 3TI0A 2JGUA 3V9UA 4BWJA 3BGRA 1UA1A 2KZZA 4KFBA 3SJJA 2X78A 3L2WA 3LDSA 4CHZA 1S1XA 5J2PA 1GOBA 5DK5A 3L8BA 4FLXA 2RPIA 3VQ5A 5C42A 3P83D 3OJUA 4KTQA 4KHUA 4RW4A 3CG7A 3LZIA 4DSLA 3LP0A 3SUOA 4PY5A 3K5NA 3TAQA 3OYLA 1JLCA 4O5BA 1KRPA 1NJYA 3DMJA 1W9HA 3QESA 4DU3A 4PWDA 1RNHA 1Z26A 4O4GA 4AHVA 2G8HA 4CF1A 4DSEA 4C8LA 4E7IA 1DTTA 4DFMA 3K59A 4QOZB 2RF2A 5JS1A 4CEAA 4DLEA 3S3OA 3V81A 2Z1JA 2ITGA 3KIOA 3VQDA 3KLEA 3QNOA 4W5NA 1WSEA 4KHSA 1RBVA 3QLHA 5DMRA 1WAJA 3CM6A 1Q8IA 4E1NA 4DF8A 1RTHA 4FK2A 3AVCA 2YV0X 4OPKA 2Y1IA 2X6NA 2FBVA 1JLBA 4RW7A 3VQEA 4LY7A 3OYJA 3LWLA 4LH4A 3NDKA 3OJSA 1VRTA 3I0RA 3HM9A 1JLQA 5CYQA 3QEVA 4E7HA 1KLMA 3SQ0A 4KI4A 4B08A 4FK4A 4CIEA 3TAPA 1VSFA 1N6QA 2VWJA 1BI4A 1B9FA 4DS4A 4CJEA 3ZT2A 1QQCA 1S6PA 2PYJA 2F8SA 4W5OA 1T05A 1S6QA 4FJIA 5FRMA 3NF6A 3ZT3A 3F9KA 4NCBA 1QTMA 4I2QA 4IFVA 4CGHA 3PX6A 4GMJB 3NF7A 2HVHA 3L3VA 1L3SA 3LP1A 3DOLA 1RT3A 4EP4A 5SZTA 1SUQA 3I0SA 1WSIA 3G10A 4IFYA 5J2MA 2QKKA 3ZSRA 1KVAA 4F2SA 4DG1A 3L2UA 4HUGA 1NOZA 5J2NA 5KGXA 1J9AA 2X74A 4KB0A 4TSXA 1EP4A 4OGEA 2IDOA 4CJWA 3ITHA 3D0PA 2FBTA 4OJRA 1REVA 4M3WA 3CFRA 3RWUA 3B6PA 4CF0A 4ICLA 1EETA 3MECA 4CJQA 1VSLA 3L2VA 2QKBA 4RG8A 1T7PA 2HHWA 1HYVA 1YTAA 5C24A 3VQBA 2ZE2A 3LANA 4DTPA 3TAMA 4DSKA 4FJKA 4B9LA 1KLNA 1UOCA 1BI4B 3NHGA 3VQ4A 2G8UA 4Q0BA 1QE1A 4N5SA 1VSJA 1BHLA 4ELVA 2IOCA 3V9WA 3V9XA 4DFPA 3QINA 4I2PA 4B9TA 4WE1A 3M8RA 3I8DA 3S9HA 1X9SA 2GV9A 2AJQA 1S1WA 3OYHA 2HHTA 4CJLA 3ZSZA 1QS4A 3AVBA 3CM5A 3O4QA 4CJTA 4B3OA 3TARA 4AHSA 1IKVA 3T3FA 3S3MA 5C25A 5K14A 1KTQA 4E89A 3K58A 4DU1A 1NKEA 2OZMA 4OLBA 1F21A 1VRUA 4JLHA 3OYFA 3SV3A 4DFJA 3TAGA 3TAEA 1NK7A 3K57A 4M3XA 4Z0UA 2XY7A 4FLVA 4Z4IA 1G15A 2EX3A 3IAYA 4FJ9A 1BISA 1J5OA 3PUFA 3MXJA 3SUPA 4DTOA 1HNVA 2B6AA 1KFSA 2WONA 5D3GA 3CFOA 1UAXA 2ETJA 2G8KA 4DQIA 2ATQA 4DU4A 4HVJA 4CHYA 4CJVA 1CXUA 5KI6A 2YKMA 3ZSVA 1L5UA 4CCHA 4Z4FA 1TKTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D2EA 5HOOA 4UQGA 3P1GA 2E1YA 3U3GA 3MX5A 4KREA 1ASUA 4H0XB 1N36K 4JNEA 4OVLA 3TSQA 1QQNA 1Q7YO 3KK1A 4BDPA 3P38A 1NOYA 2DTUA 4JK7A 2W6LA 4RW8A 1WN7A 4U67L 4HUFA 5KPRA 4CJRA 4FK0A 1YJ9N 4BRFA 3AVKA 5AQMA 4ILGB 3F73A 4IJNA 5CY4A 4V19S 1ZBIA 1HNWK 4AHTA 5JS2A 4JS4A 3LAKA 3V1OA 4CGIA 4CFDA 2UXBK 1RDAA 3ZSYA 2OYQA 4B3SK 3CJ1A 4DTJA 2XY6A 3FFKB 5J1EA 4F4KA 1VAZA 1Y64A 1FW6A 3KLGA 3CC4N 4FJ5A 4HUEA 4KAZA 1TUYA 3SI6A 5T7BA 1LWCA 3QEXA 4N41A 1U48A 2WTUA 1XNRK 2WC9A 5F0XA 4CFBA 1BO5O 1CZAN 2QK9A 1D5AA 2W6KA 4E0DA 3O4NA 4CIGA 4KHQA 3O80A 4WFAL 3QETA 3NFAA 1B9DA 2VCPA 4AM7A 4EP5A 1ZBFA 2B5JA 3K0SA 5I3UA 5EVZA 3EY1A 2F8TA 1QHTA 4H0VB 2FLOA 4Z4HA 1VQ5N 4BE1A 3SQ4A 4ELUA 3LZJA 2DFHA 4QCLA 1ITGA 3O3GA 1S1VA 3ULEB 1DT9A 3ZYYX 3O1WA 4A5AA 3TTCA 4FVUA 2VGNA 3VA3A 4FWKA 3DLRA 3KZBA 5BR8K 1EX4A 1GLCG 5AZJA 2ASMA 2YKNA 2OPQA 3CCRN 1GLBG 1K8KA 2OCEA 4CJ5A 4ZTFA 4EZ6A 2RN2A 4CFCA 4WFNL 3IUCA 1U2VB 3RR7A 4BR7A 2O8EB 4FM2A 3DLBA 4GVEA 3VQ9A 4BC2A 1Q9YA 3DXMB 2WOMA 1YITN 5AQYA 1D8YA 3LM2A 3D7EO 5EX5A 3Q7CA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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