1WSEA

Co-crystal structure of e.coli rnase hi active site mutant (e48a*) with mn2+
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMALMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKARGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Identification of Single Mn(2+) Binding Sites Required for Activation of the Mutant Proteins of E.coli RNase HI at Glu48 and/or Asp134 by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ribonuclease HI
molecule tags Hydrolase
source organism Escherichia coli
total genus 44
structure length 155
sequence length 155
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2004-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1wseA00
5CZ1A 1NKBA 4HUEA 1NK6A 3M8PA 1KLNA 4NCAA 3AVAA 3THVA 5J2QA 4CJEA 4KHQA 3KKSA 3QESA 1FKOA 1Q9XA 3TARA 4M3YA 3LWLA 1RILA 1Z25A 1VK0A 4OPKA 4E19A 4KHSA 5CZ2A 2VG6A 1S6QA 1QQCA 5C42A 4DQPA 4CJFA 3OS0A 4B9VA 3RR7A 1B92A 1RTHA 4PUOA 3MXMA 3HM9A 3DLRA 3HYFA 3ZCMA 4OLBA 1BCOA 1NK4A 1N6QA 3LAMA 4FK4A 3WNGA 1TAQA 4BE2A 4DLEA 1S1WA 3BGRA 1YT3A 1VRTA 3FFIA 4CK2A 5J1EA 4FLTA 3NGIA 2HNYA 3DOKA 4E7KA 1NJWA 3F73A 1IG9A 5KTQA 4Z4FA 4CF2A 3WNFA 2G8HA 3NBPA 3DLBA 5FRNA 2VG5A 4Z4CA 4L8RB 1JXBA 4CEZA 1T8EA 1RT7A 3ZSOA 4CFBA 3AVIA 1XC9A 1QSLA 3NF7A 1UAXA 1S9GA 4LSNA 2O4GA 2IDOA 3VA3A 1A5VA 4N76A 1VSDA 1RT4A 1WSJA 4ELUA 3T3FA 1IKWA 3ZSRA 1RT3A 2G8WA 4FM1A 4DG1A 3K59A 3QNOA 2D5RA 4I9LA 1NK5A 1NK9A 4FJLA 4N56A 4M3RA 4CJQA 4F3OA 5FRMA 3NF8A 4CESA 3DOLA 3TAFA 3SCXA 4FLVA 2HHWA 2Z1IA 4KTZA 3K5LA 2RKIA 4CEBA 2VWJA 4DSFA 4DFJA 3VQ4A 5EU7A 4KRFA 2HHTA 3OYIA 3CG7A 4CJTA 4KI6A 3E01A 3KK1A 4CCHA 3DLKA 5CY4A 3ZSWA 4R5PA 3RRHA 1SL2A 2RF2A 4RW8A 4CFAA 4HHTA 3SQ4A 3DLHA 4TSXA 2KFNA 2ATQA 3PX0A 1VSEA 3HP6A 3TABA 2DY4A 2IGIA 3DRSA 4B9SA 5E41A 1U48A 1FXXA 1TK0A 1HNIA 2P51A 4DLGA 1BIZA 3O3FA 3NFAA 2HNZA 1TL3A 4B08A 2HHQA 1L5UA 3VQ6A 5J2PA 1KVAA 2DFEA 4F8RA 3U3GA 2YKMA 5SZTA 3C95A 4M3XA 3AO2A 1JLAA 3VQCA 4BE1A 2R7YA 1VRUA 1XI1A 3PY8A 4UQGA 1KSPA 4JRPA 3CQ8A 3NH2A 4FVMA 4KFBA 1J9AA 3AVCA 3SZ2A 4J2BA 4EP4A 4B9LA 1HJRA 4Z4IA 3I0SA 4FJMA 3KD5E 4OKJA 3PO5A 4OGEA 3HP9A 1TGOA 4ZTFA 1Q8IA 3JSMA 4BWJA 1C0MA 1SKSA 3M8RA 4KPYA 2Y1JA 2D0BA 2JGUA 2OPQA 4DU3A 1ZBFA 2X6SA 4JS4A 4EZ6A 5D3GA 2Z1HA 3LZJA 2G8UA 3RMDA 4ZTJA 3OYKA 3ZT0A 4NCBA 4Y1DA 4DSJA 3VQ5A 4DU4A 2PZSA 4DF4A 4OPJA 1HNVA 1RT5A 2WONA 1EP4A 4FJNA 1I3AA 2YHAA 3SJJA 3K5OA 4CJ3A 4W5NA 2IS3A 1RCHA 4E1NA 4BDPA 4ELTA 1WNSA 4M45A 1ITGA 3AO3A 4FJ5A 4DFPA 3VQQA 3CM6A 3NDKA 1TKXA 1RBTA 2YKNA 1BHLA 3ZSQA 3AVFA 3NH1A 4B9TA 4AHUA 2HNDA 4Y1CA 4CEEA 2P5OA 4JRQA 4HCBA 3OS2A 3M8QA 3KK2A 3L2QA 1HYVA 3NF9A 4I2PA 1R0AA 3ZSZA 2PYJA 3I8DA 1U49A 4F4KA 1CXUA 4LH5A 3SUPA 1HQUA 3D45A 4F2SA 4DQIA 4KHWA 4O4GA 3HK2A 2YNFA 3VQ9A 2Z1GA 1KVBA 3S9HA 1VSKA 3OYLA 2B4JA 3OYAA 3OYGA 2HHVA 3LZIA 3MEEA 1CXQA 1YVUA 1C6VA 4CGHA 2XY5A 4G1QA 1ZBUA 5JS2A 4Z4GA 3L3UA 1BISA 3T19A 3OYHA 3HPHA 4CF0A 1T7PA 1RDBA 4PY5A 1BQMA 2ZE2A 3VQ8A 4Z4EA 5C24A 3OYCA 2RPIA 3OJUA 4CJ4A 1N5YA 3NGYA 4AHRA 4OVLA 1QE1A 4E7HA 3AVJA 1CZBA 4DSEA 1X9SA 1L3UA 3KIOA 3VQ7A 1WSGA 1C1CA 3P83D 4CHPA 4YFUA 3DMJA 1U04A 3KJVA 3ULDA 4DTPA 4DTUA 1KLMA 2OPRA 3D0PA 1VSHA 3SI6A 1XHXA 1GOCA 3SV3A 1NKEA 1TAUA 5HBMA 3MXIA 4RW7A 3QNNA 3V4IA 4M3WA 2HVIA 4BDZA 3AO1A 2PY5A 1TK5A 1HRHA 2Y1IA 2D0AA 1D9DA 5JS1A 4FYDA 1UWBA 1DTTA 1C1AA 1S1TA 5KRTA 1IKVA 1HYZA 2B6AA 4CF1A 2XY6A 2OZMA 4KB0A 1ZBIA 3CFOA 1HYSA 4CIGA 1X9MA 3SPYA 4FZXC 1X9WA 1QHTA 2P5GA 4C8OA 4IBNA 3S3MA 1WSHA 3NHGA 2HW3A 4B9MA 4FLYA 4BACA 1RDAA 3O4NA 4HVJA 4AILC 3JYTA 1KFSA 3ISNC 2HHXA 3V81A 2YV0X 1RBVA 1KCFA 1RT6A 5K14A 3L2VA 3S3NA 2IC3A 4AHTA 4RW9A 4YNQA 4O55A 4DTRA 4DTMA 3RWUA 2KFZA 4CHZA 4DQQA 4LSLA 4B8AB 1CLQA 3O4QA 3VN5A 4C8MA 4DF8A 3U3YA 3TAQA 1S1UA 1IKXA 5DMRA 4DSIA 3NGZA 4FJXA 3OYBA 1JLCA 2AJQA 2FBYA 1KVCA 1NOYA 1NJYA 4M41A 4RW6A 2HHUA 4J2DA 3B6PA 1JLFA 3G10A 2DFFA 4HCCA 3AO4A 1A5WA 4ID1A 4CEFA 2FBTA 5FDLA 1TKDA 2D0CA 1ASVA 1S5JA 4DQSA 4M42A 3ALYA 4CERA 3QETA 3ZSYA 5SWMA 1CZ9A 1L3TA 3QINA 4CJVA 2PYLA 5HRPA 1T05A 4M3UA 4IG3A 4CGGA 4FW2A 4CK3A 2ZQBA 2RN2A 4CJWA 4IDKA 1ZBHA 1LWCA 1RT1A 2X78A 2YNIA 3V9XA 4K8XA 3QIPA 3NH0A 4GW6A 2HMIA 4FK0A 4DTNA 3LP0A 4LH4A 3ZSXA 4N41A 3QEXA 3OVNA 1LW0A 4LD0A 4CGFA 5KGXA 1S9EA 1QSYA 2P1JA 3EYZA 3RMAA 3G0ZA 3DYAA 4IG0A 4B3OA 3IAYA 1BQNA 1BCMA 1RBUA 3HVTA 3K5NA 4H4OA 5J2NA 1S6PA 3TR8A 3S3OA 3C94A 4O0JA 1RNHA 3UIQA 2E4LA 3AVHA 1WAFA 1NJXA 3HSTB 4CF8A 4N5SA 3QO9A 4KREA 1SV5A 3AA3A 4H8KA 4AH9A 2F96A 2KTQA 3NE6A 3QERA 4KV8A 2G8VA 4IFYA 3RMCA 4DSKA 3OYFA 1L3SA 2B5JA 2QK9A 4K8ZA 4CEOA 1SUQA 1LAWA 1QSSA 1FK9A 3PX6A 1FKPA 3DM2A 4O0IA 3K57A 3A2FA 3V1RA 3TAGA 4FJGA 4QOZB 4I7FA 1UA1A 1BI4A 4CE9A 3AVLA 3OYJA 3HT3A 4FLUA 2X74A 3EZ5A 3V9UA 3TAPA 3P5JA 4OKEA 4C8LA 4J2AA 3V6DA 4AHSA 4CHYA 4KI4A 2BANA 1NKCA 5CYQA 4FXDA 1LWFA 1HMVA 2HHSA 3SPZA 4DTJA 4B9UA 1T03A 3AA5X 3SUQA 1BGXT 4PA1A 4GVMA 3MEGA 3WNEA 1U4BA 1YTUA 3ASMA 1WSIA 1MU2A 3I0RA 1WLJA 2E6LA 2NUBA 3LP1A 1TV6A 4FM0A 3QEVA 4FJ9A 2EX3A 4KTWA 4MFBA 4CGJA 2VG7A 4CHOA 3OS1A 3KLFA 3K5MA 1SL1A 3WNHA 3TI0A 3HVRA 3KLIA 4DSLA 1X1PA 3ZT1A 4KHUA 1SKRA 1LAVA 3HPGA 3AA2A 3VQAA 2KZMA 4M3ZA 1I39A 3O3GA 4Z4HA 1NJZA 4GMJB 3L3VA 5I42A 1VSIA 1KTQA 2W42A 4ELVA 3VA0A 1HQEA 4MQ3A 4OGCA 3V1OA 4DTSA 1RBSA 1O1WA 1JLEA 4CJKA 1JXEA 4FM2A 3KTQA 2KW4A 4E7LA 3RMBA 5KRSA 1LWEA 1KRPA 2BGGA 4PWDA 3IG1A 1EETA 5KGWA 2GUIA 4E0DA 4KO0A 1GOAA 1L3VA 1K6YA 1TKZA 1VSJA 1LW2A 3VQPA 3RR8A 2IAJA 4HTUA 1UA0A 1W0HA 4W5TA 4XIUA 5HP1A 4N47A 1JLBA 4HUFA 3LP3A 4DFKA 4E1MA 1WAJA 3NCIA 1C0UA 4BE0A 3T1AA 4W5OA 3NAEA 4C8NA 3RTVA 1RDCA 3AVMA 1D5AA 4IFVA 4E89A 4F3TA 3LPTA 1EXQA 3MAQA 3U6FA 1B9DA 4CK1A 2EHGA 4CECA 3HXMA 4FJ8A 3CFRA 2GV9A 4FLWA 4CHNA 1XWLA 1J5OA 1U45A 2FBVA 1LV5A 4DS4A 4M3TA 5HRRA 4KB1A 2OYQA 3C6UA 4CJUA 3CM5A 4CGDA 4E7IA 1ZBLA 1RDDA 2XY8A 2YNHA 1Z26A 4ICLA 4FJJA 2ETJA 3MEDA 4DMNA 4E3SA 4KHNA 4DQRA 3AV9A 3QIOA 1ASUA 4OJRA 3ZT4A 3SV4A 4CF9A 1S1VA 3OJSA 2KQ2A 4O5BA 2F8SA 1HPZA 3K2PA 1VSMA 4BWMA 1NK0A 2BDPA 2ITGA 3KLEA 2HB5A 4W5QA 1D8YA 3QEIA 3DLGA 3P1GA 3C6TA 3TANA 4J2EA 3PUFA 1NK8A 1RT2A 3KK3A 3L2UA 2XHBA 3TAMA 3LDSA 1GOBA 1VSFA 5T7BA 2XY7A 1NOZA 1ASWA 4I2QA 3DI6A 3HPOA 2OZSA 3AA4A 4FW1A 4CFCA 3RRGA 3QLHA 2DTUA 1JLQA 4KHYA 3BDPA 3MECA 3IS9A 4CEAA 3K58A 4FJHA 4KTQA 1NK7A 3EY1A 1BI4B 2FC0A 3SQ1A 4KAZA 3LAKA 3PV8A 3M8SA 2YNGA 3OY9A 4DS5A 5HLFA 3L2WA 2XRIA 4O44A 4DTXA 1RBRA 3VQBA 3KLGA 3ZT3A 1TK8A 2GBZA 3DLEA 4LY7A 3ZT2A 1W9HA 2Q3SA 4KKOA 4CEDA 3DRRA 4CJLA 3L8BA 4E7JA 1Q9YA 4OKKA 2FBXA 2I5JA 4Q0BA 2OPPA 2A1SA 4DWIA 3KD1E 4CEQA 4FJIA 5CYMA 3ITHA 3QEWA 4CJ5A 5HRSA 1EX4A 1IH7A 3ZSVA 1RTDA 1JL1A 4CJPA 3TWHA 1EKEA 1D9FA 3SNNA 4FK2A 1IKYA 1WN7A 2DFHA 2QXFA 2O4IA 4CIFA 4NYFA 5I3UA 1DTQA 3LWMA 1DLOA 2KZZA 3SYZA 2VWKA 1TVRA 4CJRA 1BL3A 1SKWA 3HJFA 3H08A 3V1QA 3SUOA 2G8KA 5FROA 2JLEA 4FLZA 1C0TA 1SL0A 2E6MA 2QKKA 3AVGA 4JS5A 2WOMA 3KKRA 4FCYA 3AVBA 4ID5A 3V9ZA 4B9NA 2G8IA 4JLHA 1G15A 1ZYQA 4I9QA 4FZZA 2F8TA 4QCLA 3DRPA 4CHQA 2Z1JA 4Q5VA 4ZHRA 3IRXA 3MXJA 2XO7A 4RW4A 4PQUA 3AO5A 1WSFA 1B9FA 2LSNA 4CFDA 4EP5A 4DTOA 1QTMA 2QKBA 1UOCA 5J2MA 3SQ2A 1U47A 3O3HA 1WSEA 4QAGA 3TAEA 3PX4A 3LALA 2OPSA 1RTIA 3VQEA 3V9WA 4EZ9A 4FJKA 3L2RA 1A5XA 3V9SA 5HROA 3OYEA 4CGIA 3LANA 3LPUA 1TKTA 1J53A 3PO4A 1XHZA 2X6NA 3NF6A 3OYDA 4IKFA 3B6OA 1RTJA 4F2RA 2BE2A 4BDYA 4C8KA 3HL8A 3HO1A 1KFDA 3CYMA 3F9KA 4CIEA 4NCGA 3OYMA 1Y97A 4NYNA 1REVA 4AHVA 2YHBA 4Z0UA 4DFMA 1C1BA 1VSLA 3SUNA 1JLGA 3AVNA 4W5RA 1BIUA 4HUGA 3SQ0A 2G8FA 4OLAA 1JL2A 1TL1A 2IOCA 4H4MA 1QS4A 1YTAA 3AVKA 5DK5A 3VQDA 4FLXA 3QEPA 2OA8A 5C25A 1F21A 3OYNA 2HVHA 3CFPA 3LP2A 4RG8A 4AHCA 1S1XA 4CJSA 4B8CA 1JKHA 1IO2A 2A1RA 1J54A 4FZYA 5HRNA 4FJ7A 4DU1A 5KI6A 3KLHA 4WE1A 2ZD1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HUEA 1QZ5A 4NCAA 4CJEA 1FKOA 4B3SK 4EIAA 3LWLA 4WF9L 4OPKA 4E19A 2YJFA 3OS0A 4B9VA 3RR7A 4PUOA 3HYFA 4PHTX 4WFAL 2VCPA 4BE2A 3BGRA 1YT3A 3FFIA 4FLTA 1TUUA 1NJWA 2Q31A 2G8HA 4JKGA 3DLBA 2VG5A 4Z4CA 3F2KA 1XC9A 3EO3A 1NJIO 1HNXK 4OPHA 3A0IX 4ELUA 3T3FA 1IKWA 3ZSRA 1RT3A 2G8WA 4FM1A 2QEXN 4IEEA 1NK9A 1NK5A 2PAVA 1VQ4N 3O1WA 4CESA 1WOQA 3DOLA 4FWOA 4JI0K 2HHWA 4CEBA 4YY3K 3C6HA 1XMOK 2HHTA 2F9TA 3MWPA 4KI6A 3E01A 3KK1A 4B1YB 2HOEA 3CD6N 3PX0A 2YI1A 3RSEA 4FWSA 3NMUA 3FZMA 3O3FA 2HNZA 1TL3A 4YOVA 3IKMA 4M7YA 3I55N 5SZTA 3AO2A 3VQCA 4BE1A 3N4QA 1YF5L 1GLDG 3AVCA 3CJ9A 3EKSA 2JWKA 4K42A 2O8CB 4DR1K 1HJRA 4OKJA 2BUPA 3PO5A 3EKUA 4ZTFA 1Q8IA 4BWJA 1N8RO 3UKUB 5AQZA 2UUAK 2IIRA 2OPQA 4BG8A 2X6SA 3H3OB 3OYKA 4NCBA 1RT5A 2WONA 3HOSA 4BRMA 1I94K 1WBBA 4W5NA 2IS3A 3SLCA 4BDPA 4M45A 3TPQA 4DFPA 3F5TA 3CM6A 2QTDA 5AQOA 2HNDA 4ISEA 4HCBA 3M8QA 4B3RK 2O8CA 3NF9A 2P9IB 2PYJA 3I8DA 2NRHA 3HZ6A 4F4KA 3D45A 5AQFA 3TTCA 4DQIA 4F2SA 2Z1GA 3UKUA 3MX5A 5E26A 3OYGA 4MLHA 2XY5A 4G1QA 3ZETB 4CZKA 3M3ZA 3OYHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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