1ZBLA

Bacillus halodurans rnase h catalytic domain mutant d192n in complex with 12-mer rna/dna hybrid
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
133
structure length
133
Chain Sequence
EEIIWESLSVDVGSQGNPGIVEYKGVDTKTGEVLFEREPIPIGTNNMGEFLAIVHGLRYLKERNSRKPIYSDSQTAIKWVKDKKAKSTLVRNEETALIWKLVDEAEEWLNTHTYETPILKWQTDKWGEIKANY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal Structures of RNase H Bound to an RNA/DNA Hybrid: Substrate Specificity and Metal-Dependent Catalysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 5'-R(*GP*AP*CP*AP*CP*CP*UP*GP*AP*UP*UP*C)-3'
molecule tags Hydrolase/rna/dna
source organism Bacillus halodurans
total genus 41
structure length 133
sequence length 133
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2005-04-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1zblA00
2VG7A 4NCGA 1LV5A 4OPKA 4CK3A 3AVAA 4FJNA 4FLXA 1WSJA 3RRGA 4E19A 4FK4A 4RW7A 4CJLA 1D8YA 2E4LA 2X6NA 3AVHA 4LH5A 3QEXA 3LP0A 1BI4A 3DLEA 3ITHA 1KVBA 1KRPA 5J2NA 1NJWA 3DLKA 2Z1GA 1RTJA 3OYNA 4FLYA 1RT3A 3SV4A 4H8KA 3LANA 5SZTA 2EX3A 2VG6A 3NHGA 4OKJA 3NH2A 3D0PA 3P83D 4KHSA 4CEDA 1BGXT 1RDBA 2A1RA 4C8LA 3PO4A 1TVRA 3B6PA 4JRPA 1S1VA 3QEIA 4NCBA 1KFDA 3AVJA 2D5RA 3VQ4A 3QEWA 5D3GA 1RDCA 1UA1A 1U48A 3ZSYA 4CHPA 3V81A 2W42A 4M3ZA 3AVNA 4CEQA 2Z1JA 1RTDA 4W5QA 1XC9A 4QCLA 3RR8A 3AA5X 3TAFA 3DI6A 4PUOA 1S1XA 3ZT1A 2DY4A 3TI0A 4J2DA 3OYKA 4K8ZA 2G8HA 5HRNA 3HSTB 3SQ4A 4DFJA 1IG9A 4FZXC 1BHLA 4JS5A 3HPHA 4ELVA 4OGCA 1FXXA 1EKEA 3O3GA 4AHCA 2IGIA 4NYNA 1TKDA 4CHNA 1JLGA 1S9GA 1C1AA 4CEFA 4LH4A 4AILC 3HP9A 1Q8IA 1S1UA 4OVLA 4Z0UA 3SI6A 4FJIA 2ITGA 3DYAA 3VN5A 4O0IA 4KI6A 3SZ2A 1CLQA 4CGGA 1RT5A 4I7FA 4DQSA 4Y1CA 1B9FA 2YNIA 3JSMA 4E3SA 3KD1E 1ASWA 4B9NA 4LSLA 3AVBA 1JLCA 2KW4A 3MXJA 4IG0A 3ZSQA 4PQUA 3VQPA 1X9WA 4DLGA 4DQIA 3KLEA 4YNQA 4E7IA 4F2RA 3EY1A 1JLQA 1EX4A 3OYFA 4DSJA 4AHSA 5CZ2A 1NK9A 4W5OA 3MECA 4IFVA 3M8QA 4UQGA 1NOYA 3QERA 2G8WA 3VQBA 4FJGA 1VSKA 3M8SA 5T7BA 3RR7A 3ZSWA 3QINA 3K58A 4DFMA 3TAEA 3LP1A 4F8RA 4M42A 3HK2A 2KFZA 4AHVA 5FRMA 3OYMA 4FJKA 3LP3A 1RT6A 4XIUA 4E7LA 5FRNA 1IH7A 3QEPA 3NFAA 4M3TA 2KZZA 3NF8A 2PY5A 1NK0A 1SL0A 2D0AA 3CM6A 1QQCA 2ZD1A 3IG1A 3T19A 3JYTA 3KKRA 4E89A 4N76A 3E01A 4CHQA 3KLHA 4I2PA 4CJUA 1ZBHA 4DTPA 1QSYA 4FJ7A 4KKOA 3KLFA 4OGEA 4JS4A 3DOLA 3AVMA 3L3UA 3ZSVA 4DSLA 1L3SA 3LPUA 1HYZA 1VSEA 3OJSA 3KK1A 4DTSA 5HRRA 2DTUA 3PX4A 1BCMA 4DQPA 1SUQA 1J9AA 1D5AA 3WNFA 1Z26A 1NK6A 4Y1DA 5KGWA 1KLNA 2OPSA 4DF4A 1RCHA 4GW6A 3TAQA 3ZSXA 1T05A 4KHYA 3NGZA 4W5NA 4KFBA 3VQ8A 2WOMA 3C6TA 4E1MA 3L2WA 3KIOA 1NK4A 3T3FA 1QSLA 4G1QA 4EP4A 4DFKA 3HXMA 3RRHA 3AVGA 1IKWA 3NGYA 4JLHA 3HP6A 1WLJA 4RG8A 1YVUA 2E6LA 1TKZA 3OYEA 2HHSA 2Q3SA 4KTWA 2GUIA 4CJPA 4KV8A 3V1RA 3LAKA 1BISA 1NJZA 1SV5A 3OYBA 3QIOA 2YNHA 4HUFA 5HROA 2FBTA 4K8XA 4KHUA 1KTQA 1VSLA 4IBNA 3KD5E 4CJ5A 4Z4EA 4KREA 3ZSRA 4C8OA 3HO1A 1J54A 1RTHA 5KRTA 3NF7A 3VQEA 4FJMA 2A1SA 2Z1IA 4Z4CA 4M3RA 4O44A 2G8UA 4CIFA 3HT3A 1L3VA 4GMJB 4CIGA 5HBMA 3AVLA 5CYQA 3QESA 3S9HA 4GVMA 4B8CA 3K5LA 4F3TA 5C24A 1J5OA 2I5JA 3NF6A 1HMVA 4M41A 2RPIA 2ZQBA 3K2PA 1EXQA 1RBVA 4FVMA 3RMBA 3TAPA 3KTQA 4EP5A 4Q0BA 1Y97A 1RT7A 2OPRA 4M3YA 3OS0A 3HL8A 1CZ9A 1ZBUA 2YV0X 2AJQA 4DU3A 2ATQA 3S3OA 3RMAA 2YHBA 1D9DA 4B9VA 4KPYA 4ELUA 2F96A 4IG3A 3I8DA 3LZIA 2R7YA 2PYLA 3AA4A 3G0ZA 3O4QA 1JLEA 4DQRA 2BANA 2O4GA 5SWMA 3ZCMA 4DG1A 4JRQA 3SUOA 1N5YA 3IAYA 1VK0A 1RILA 1VSDA 3DOKA 1VSIA 4H4MA 4ICLA 5J1EA 3O3FA 1U04A 4DTMA 4FZYA 2JGUA 3V9XA 1J53A 1Z25A 1R0AA 3B6OA 3OYDA 3LWMA 1WSHA 1X9MA 2FC0A 5KGXA 1LWFA 4DU4A 3NDKA 3L8BA 1BQNA 1RDDA 3VA3A 3QEVA 1T8EA 3QO9A 4DU1A 3TABA 3AV9A 1BIUA 1NKEA 4FYDA 1WSIA 3KKSA 4HUGA 4KTZA 1XI1A 4L8RB 4N56A 3ASMA 4CK1A 1CXUA 4CHYA 3QLHA 1XHZA 4O4GA 4DSEA 1QTMA 1A5VA 3LDSA 1BL3A 3DRRA 1TAQA 4N47A 4OKEA 3THVA 1B9DA 4CESA 2HHQA 3HVTA 1IKYA 4OKKA 2KFNA 1VSHA 2VWKA 2XY7A 3U3YA 4DWIA 3OVNA 4CK2A 4BACA 3DLRA 3HPGA 1SL2A 2HVIA 1FK9A 1HPZA 4AHRA 4DSFA 4CGFA 3K59A 3KLIA 4KB1A 1TKXA 1WN7A 4FJXA 2EHGA 4M3UA 1RBSA 1REVA 1CXQA 3DM2A 1NKCA 2YNFA 4CEEA 4O55A 2WONA 2O4IA 3AVKA 1C1BA 3BDPA 3BGRA 4TSXA 2XO7A 3KLGA 1N6QA 1S9EA 3TAGA 2KQ2A 2HHVA 2OPPA 2ZE2A 3V9SA 4F4KA 4DTNA 4CJEA 2B6AA 1DTTA 1S6QA 4E7KA 4C8KA 2FBXA 1JLAA 1KFSA 3CFPA 4M3XA 4HVJA 1JXEA 2HHWA 1GOBA 2HHTA 1RT2A 4F3OA 3MXMA 2Z1HA 4M3WA 2Y1IA 3SQ0A 4WE1A 5FROA 4KAZA 3QNNA 5J2MA 4FK0A 1C0UA 1TV6A 1WSFA 3WNEA 1NOZA 4HHTA 1TK8A 3SPZA 3TR8A 1ASVA 2PYJA 4DMNA 3KK2A 1XHXA 1DTQA 1S5JA 4OPJA 2RF2A 2OPQA 4W5RA 4DTOA 1U47A 4Z4FA 4LY7A 4BWMA 2BGGA 4FM2A 3KJVA 1K6YA 4DS4A 1QSSA 1LWCA 3VQ9A 2ETJA 3WNGA 2B4JA 1D9FA 4BE0A 3ALYA 3FFIA 4DSKA 3VQDA 3ZT3A 4HUEA 4FJJA 4FJ8A 3NH1A 4BE2A 1QHTA 1HRHA 2QXFA 3AO4A 1SL1A 2IC3A 3K5NA 3G10A 2XHBA 3RMDA 1VRTA 1HJRA 3O4NA 1KVCA 4CJRA 1SKWA 4BDYA 2BDPA 3DLBA 2HNDA 3ZT4A 3HJFA 4CF9A 1JLFA 4NCAA 3AO2A 5HP1A 3OS2A 4HCBA 3NF9A 3SUNA 4B9MA 1UA0A 3V9UA 4KTQA 4J2AA 3KK3A 1ITGA 3OYAA 3RWUA 2KZMA 5KI6A 2FBYA 2YHAA 3SQ1A 1TKTA 5CYMA 4CGIA 1RTIA 1YTUA 2B5JA 3OJUA 3ZSOA 2G8VA 1CZBA 5HRSA 3TAMA 1U49A 2F8TA 3F73A 5DMRA 1U45A 3U6FA 2FBVA 1ZBFA 3AA3A 2F8SA 4DTUA 1GOAA 1BQMA 4KRFA 1T7PA 1ZBIA 3RTVA 3HM9A 1UAXA 4E1NA 3IS9A 4YFUA 1KSPA 3AO3A 4FW2A 4Q5VA 4H4OA 4Z4GA 2G8IA 1ASUA 2HNYA 4DQQA 1RBRA 1NKBA 3L2UA 1GOCA 3IRXA 1ZYQA 4CGHA 2RKIA 4CJTA 2IDOA 3SQ2A 4ZTFA 2IAJA 3C6UA 4CJFA 3SCXA 4CF8A 3H08A 3DRSA 1NJYA 4CJVA 4OLBA 1YT3A 4DFPA 3LWLA 1WNSA 2G8FA 3HPOA 4OJRA 4C8MA 4B8AB 1C0MA 5HRPA 4FLUA 4DTXA 1S1WA 1BI4B 3TANA 4ID5A 2XY8A 1O1WA 1WAFA 4CEOA 5HLFA 4CECA 1W0HA 1RBUA 2YKMA 4CHOA 4FJ9A 2HVHA 4RW6A 2HHUA 4LSNA 3P1GA 3O3HA 4KHNA 4DSIA 3PX6A 3AA2A 3EYZA 4FLTA 1RT1A 4CE9A 1HYVA 2X6SA 5C42A 4FM1A 2YKNA 2E6MA 3CFOA 3PO5A 4EZ6A 2P1JA 3K5OA 4KHQA 3I0RA 1TK0A 4HCCA 4B9SA 1A5XA 4CF1A 3OYCA 1IKVA 2G8KA 2HB5A 2OZSA 4ZHRA 4CCHA 4O5BA 3A2FA 1NK5A 1C6VA 4MQ3A 1YTAA 3VA0A 4R5PA 3NE6A 1UWBA 5J2QA 4J2BA 1RT4A 3I0SA 3V4IA 3D45A 3DRPA 2X74A 2DFHA 1EP4A 4PA1A 1WAJA 4CGJA 3OYLA 2BE2A 4BWJA 3P5JA 3NGIA 4CEZA 1XWLA 3M8RA 4E7HA 4BDZA 1L5UA 4IKFA 4I9QA 2P51A 1JXBA 3ISNC 1EETA 2VG5A 3ZT0A 4CJKA 3HVRA 3NCIA 4HTUA 1VSMA 1F21A 3QETA 3SJJA 1TGOA 4ID1A 1DLOA 4LD0A 1LAWA 5JS2A 1NK7A 2IS3A 2HHXA 2XY5A 1I39A 3V9ZA 3SV3A 3AVIA 3EZ5A 3C95A 4J2EA 5I42A 2XRIA 4O0JA 4CFAA 4ZTJA 4FLVA 2OYQA 3C94A 1JLBA 2D0BA 3NAEA 3VQ7A 3LP2A 1LAVA 3CFRA 2D0CA 3ULDA 5C25A 5J2PA 2Y1JA 3AVFA 1L3TA 3SYZA 1HQEA 4CF2A 2LSNA 4C8NA 1KCFA 3L2QA 4W5TA 1A5WA 4AHTA 3LZJA 4CGDA 1IKXA 3ZSZA 2VWJA 3VQ5A 3OYGA 3CYMA 4FJHA 4DTRA 1L3UA 5I3UA 1NK8A 1FKOA 4CIEA 1TL1A 2X78A 4KO0A 3HYFA 3OY9A 4RW9A 4FCYA 1NJXA 2QKKA 1WSEA 4E0DA 4N41A 3CG7A 2KTQA 5JS1A 1JL2A 1W9HA 5KTQA 2YNGA 3AO1A 3CM5A 3VQAA 3OS1A 3QNOA 1HNVA 4RW4A 4DS5A 4B08A 1HQUA 2QKBA 1U4BA 2NUBA 4E7JA 4FM0A 1SKRA 1Q9XA 4IFYA 4FXDA 3WNHA 4CJWA 1ZBLA 2PZSA 4CJ3A 4FLZA 1X9SA 1TAUA 4PWDA 4OLAA 1JKHA 1QS4A 2QK9A 5EU7A 3PY8A 3TWHA 3SUPA 3OYHA 4B9TA 3PX0A 4FJLA 1B92A 2P5GA 4DLEA 4FW1A 3T1AA 3L2VA 4EZ9A 4IDKA 1LW0A 3AVCA 4KI4A 2XY6A 4CJSA 4CFDA 2HMIA 4I2QA 3PUFA 3NBPA 1KVAA 5K14A 3MAQA 4BDPA 1LWEA 1VSFA 3CQ8A 4B9UA 3LAMA 2P5OA 3VQQA 4Z4HA 1QE1A 5CZ1A 2DFEA 1LW2A 3PV8A 1RNHA 1WSGA 2HNZA 4DF8A 3U3GA 4CF0A 4MFBA 1RBTA 1RDAA 1UOCA 3VQCA 2OA8A 4QOZB 1BIZA 1FKPA 4Z4IA 3MEGA 2GBZA 3F9KA 3DMJA 3OYJA 3V6DA 3SUQA 3M8PA 1S6PA 3VQ6A 4B3OA 3TARA 4N5SA 4QAGA 2RN2A 3S3NA 1Q9YA 1VRUA 1TK5A 1VSJA 3UIQA 4CJQA 1C1CA 4CFCA 4CJ4A 1C0TA 4CHZA 1G15A 1TL3A 4F2SA 3MEEA 1T03A 3S3MA 2JLEA 3RMCA 3SNNA 3L3VA 3V1QA 1SKSA 4FJ5A 1I3AA 5KRSA 1JL1A 1IO2A 4CEAA 2GV9A 4KB0A 4PY5A 3DLHA 4B9LA 1HYSA 3MXIA 1KLMA 3DLGA 3QIPA 4FZZA 4AH9A 3OYIA 3LPTA 4NYFA 3L2RA 2DFFA 4CFBA 4DTJA 3ZT2A 4ELTA 3K57A 4M45A 3MEDA 5DK5A 4FK2A 4AHUA 3LALA 4CERA 4RW8A 1HNIA 3K5MA 3V9WA 3SPYA 2OZMA 4KHWA 2HW3A 5CY4A 1MU2A 4I9LA 1S1TA 3V1OA 5FDLA 1X1PA 4BE1A 4CEBA 3NH0A 4FLWA 1BCOA 3AO5A 2IOCA 5E41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NCGA 1LV5A 4C1NI 4M63C 4FJNA 3RRGA 4YDUC 2E4LA 3AVHA 4LH5A 3U9ZA 1RTJA 1T3VA 3DJCA 5SZTA 5AQRA 1I94K 2VG6A 3O1BA 3D0PA 2UUCK 4C8LA 3CI5A 4MDBA 3O9RA 1N36K 4JRPA 4FWQA 5D3GA 3GBTA 1UA1A 3F9MA 4H0VB 1LCUA 3THYB 4FOIA 4PUOA 2O8FA 2I7NA 3ZT1A 4K8ZA 4DFJA 1ZXOA 1BHLA 3HPHA 4ELVA 1XNQK 1EKEA 2IGIA 1X9JA 4BQLA 1M1KO 5AZJA 4Z0UA 1Q8IA 3MWTA 1YHQN 2QEXN 3DYAA 1DKGD 3S41A 3SZ2A 3JSMA 3P38A 1SZ2A 4WQ4A 2KW4A 3ZSQA 1GLLO 1JLQA 4BRDA 3AARA 4DSJA 4AHSA 3O4WA 4CZFA 1Y64A 3MECA 4IFVA 3M8QA 4UQGA 1NOYA 5GAHP 4F9OA 2IVOA 2HBJA 2ZM6K 3THXB 1Z6RA 1VSKA 1NLVA 3M8SA 5BREA 3RR7A 3J8AA 4DFMA 3TAEA 3LP1A 4F8RA 4M42A 3JAMO 5FRMA 3OYMA 2O8CB 4FJKA 3LP3A 4Z94A 1HNZK 3U4LA 1HR0K 5FRNA 3NFAA 4M3TA 2PY5A 1SL0A 1HNWK 1IBKK 3CM6A 3T19A 3JYTA 5EX5A 1QZ6A 4OGEA 4JS4A 1VQ7N 3ZSVA 5BN8A 4GY2B 4MLHA 5DM6L 1M90O 4X64K 3D2EA 4DQPA 4FVUA 2D4WA 2P9PA 4Y1DA 1KLNA 2O8EB 1RCHA 1ATSA 2P9UB 3TAQA 5AFUA 3VQ8A 3KIOA 3T3FA 2NRZA 3PSIA 3MN9A 4DFKA 3CXCM 3HXMA 3RRHA 5M1FA 4JLHA 1YVUA 3OYEA 1VQMN 3V1RA 5HROA 4JI7K 2FBTA 4K8XA 5AZIA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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