1ZC6A

Crystal structure of putative n-acetylglucosamine kinase from chromobacterium violaceum. northeast structural genomics target cvr23.
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
285
structure length
285
Chain Sequence
PSIRYLIGVDGGGTGTRIRLHASDGTPLAMAEGGASALSQGIAKSWQAVLSTLEAAFQQAGLPAAPASACAIGLGLSGVHNRQWAGEFESQAPGFARLSLATDGYTTLLGAHGGQPGIIVALGTGSIGEALYPDGSHREAGGWGYPSGDEASGAWLGQRAAQLTQMALDGRHSHSPLTRAVLDFVGGDWQAMMAWNGRATPAQFARLAPLVLSAARVDPEADALLRQAGEDAWAIARALDPQDELPVALCGGLGQALRDWLPPGFRQRLVAPQGDSAQGALLLLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Putative N-acetylglucosamine Kinase from Chromobacterium violaceum
rcsb
molecule keywords probable N-acetylglucosamine kinase
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Chromobacterium violaceum
total genus 86
structure length 285
sequence length 285
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1zc6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1zc6A01
5AFUH 4WQ5A 3VF4A 2P9UB 5AQWA 3DXMB 4CZLA 3UKRA 4CZJA 3C0BA 5AQVA 1GLFO 5JICA 3WQTA 3VOVA 1G99A 2BUPA 1NLVA 4HWIA 3FGUA 3GBTA 2YI1A 2BTFA 4BRFA 3CJ1A 3FLCO 3ID8A 1EQYA 2ZGZA 3U4LA 3U9DA 1KAZA 3GOIA 3H3NO 3QMLA 3I33A 4PL7A 4EHTA 3D2FA 1GLEG 2E2QA 5ELZA 2FF3B 5AQUA 5F2RA 3MK6A 2W41A 2E2PA 3MN7A 1U2VA 3A0IX 3O1WA 3SK3A 4AM6A 4BRLA 5BPMA 3CQYA 4H5RA 4CZFA 3C7NB 2ZWHA 3O4WA 4RTFD 1IG8A 2HF4A 5E84A 1LOTB 1Y64A 3QB0A 4CD3A 4MO4A 2QWQA 2P9UA 1HX1A 4H5WA 3DXMA 3KHYA 5E26A 2YHXA 3A8YA 4CJ7A 3HZ6A 3MMVA 2FXUA 1NGJA 4BROA 5ADXH 2P9KB 4BRCA 2VWBA 4H0TB 1R59O 3EKSA 1JCEA 4Y0WA 1HJOA 4JHDB 4BC4A 3LDOA 4BRQA 3O08A 1ATSA 4BRNA 3H1VX 1NGHA 4BGBA 2I7NA 3C7NA 3M1FA 4H03B 4H0YB 1Z05A 4BQZA 2QXLA 4DB3A 2V7YA 2Q0RA 3WEEB 1V4TA 3MN5A 4B1XB 4K43A 4EHUA 1BU6O 1ATNA 1NWKA 4BR2A 5I9EB 4ISFA 1ESVA 2P9KA 1QQMA 4H0XB 2Q36A 1X9JA 1HKBA 2CGLA 3J8AA 2I7PA 3WXKA 4PL8A 5F1XA 3VF2A 3LDNA 2EWSA 4JHDA 1SQKA 3IUCA 1KAXA 3D2EB 3VEZA 3ZX3A 4EIAA 3O80A 4H0OA 5JLFA 5KPZA 3FZKA 2Q1NA 4CZGA 4E1JA 5LJWA 5AQIA 3H45C 3EL2A 1NGFA 1K8KB 2Q0UA 3ZX2A 3QBWA 1NGDA 3O1BA 4L3QA 4CI6A 3WEEA 2P9PB 3BF1A 5AQGA 3ATUA 4K25A 3VENA 1T6DA 4YDUC 5AQNA 1WOQA 1Z6RA 5KPRA 5EXWA 3QFPA 2QWOA 5AQTA 3TPQA 2F9TA 2D1KA 3A5NC 5FPNA 2CGJA 3HI0A 4BRAA 2D0OA 2PBDA 3CI5A 4BREA 2OANA 1NGCA 3D2EA 4RWTA 1JCGA 2NLXA 2P9IB 4CD1A 2UYTA 2HOEA 2GWKA 3D7EO 4FWLA 3FZFA 3GG4A 4FWSA 1K8KA 3A5MC 3VESA 1YVNA 4XH5A 1NBWA 2ASOA 3VGKA 2P9PA 3O8MA 4QS9A 5AQYA 2Q2RA 4A61A 1JCFA 3CIPA 1GLCG 1ZXOA 3CJ9A 3DXKB 5FPDA 5LY3A 1BWFO 1T44A 1ZC6A 4FWRA 1Q18A 1BUPA 2QWRA 3LM9A 5AQJA 3LM2A 2VCPA 5EY4A 4B9QA 3AAQA 3WT0A 4XEIA 3BP8A 5AQXA 1P8ZA 2QM1A 3MCPA 1BOTO 5B8HA 2E20A 2P9IA 3WXLA 4BVOA 3FR0A 4BRPA 1HLUA 4B1ZA 3MDQA 3VEXA 1XQSC 4QS7A 3VEYA 3QBXA 5KQDA 2IVNA 2YHWA 3CQXA 1QHAA 3CJAA 4IJNA 4BRDA 4YDUA 1IJJA 3MN9A 3CJCA 1SAZA 2FF6A 3DXKA 3UE5A 2F9WA 1XC3A 1TYQB 5EOYA 4CBXA 3AAPA 3G25A 4FPAA 3BEXA 2P9LB 4BC3A 2QWLA 3O6WA 3H1QA 1QQNA 3HSCA 1H1VA 5FPEA 4ISGA 4PKGA 3CJBA 4F9OA 3DWLA 3U8XA 5KPTA 4JN4A 1BO5O 2D4WA 3SJHA 4H5TA 1GLJO 4MLEA 4CZMA 3OHRA 2A40A 5BREA 2A41A 1ATRA 2P9NB 4DQ8A 1X3NA 3WUHA 3VGLA 3BUZB 3B8AX 4FO0A 3SMPA 1QQOA 3ULEB 3FFKB 4FWPA 5JLHA 5F0XA 3BF3A 2AP1A 1GLLO 3A5OC 3R8EA 3ZEUB 3MN6A 4BR9A 1GLBG 2HMPA 4JD2B 5AQOA 2FSNA 3EKUA 1TYQA 3HBTA 3KVGA 3JXUA 4XH4A 1SZ2A 2NRHA 3VEVA 2AA4A 2P9LA 4H5NA 4BR7A 4O8KA 2ASMA 3R9PA 2QWPA 2GWJA 4I6MB 3U9ZA 1YUWA 3W0LA 4FWNA 2V52B 5BN8A 2E1YA 3FZLA 4B1YB 2FLOA 2A5XA 2Q31A 1HUXA 3VETA 1S22A 2IIRA 5BPNA 2P9NA 4FOIA 4BC2A 3F9MA 2DPNA 1RFQA 2V51B 1DGKN 1HPMA 3ULEA 4BVPA 5AZIB 2FSKA 4GNIA 3CHWA 2YJEA 5AQKA 3ZEUA 4LC9B 4JD2A 1GLAG 2QW9A 3AY9A 3H6EA 4BRKA 1GLDG 2FSJA 3DAWA 5TKYA 1QZ6A 1DEJA 4BRMA 5AQHA 1BDGA 2WUSA 4IXCA 3SLCA 4XH1A 4DHYA 1NGEA 4BR5A 1E4FT 4FWMA 4FL9A 1HKGA 4I6MA 3LL3A 4J8FA 4EAHD 3HTVA 5AZJB 3WXJA 1MWMA 4EFHA 5AQMA 4PKIA 1D4XA 4ISEA 1V4SA 3VGMA 3GE1A 4B1WB 3ENOA 3VERA 2D0PA 3ZETB 3FE1A 4WQ4C 5AZIA 2J4RA 1MA9B 1MWKA 1NM1A 3FZMA 3O5BA 1MDUB 3LDLA 5AQSA 4IJAA 4CBWA 2IVOA 5KQ8A 4FSVA 1TUYA 4PKHA 2KHOA 3CETA 5JMVA 4Z94A 1NMDA 5AQQA 4B1VA 2W40A 1KXPA 2YHYA 1X3MA 5BPLA 1NGGA 3FZHA 2E2NA 4BG8A 5EVZA 1OKJA 2E8AA 4H5VA 3WXIA 4JNEA 5BR9A 4JAXA 4A2BA 3KZBA 4BG9A 5AZJA 3SMSA 3IMXA 3DJCA 5AFUA 3EO3A 4MLHA 3VPZA 4K42A 3QDKA 1T6CA 4H0VB 2IVPA 4KBOA 2ZF5O 2E88A 1KAYA 4AM7A 3IDHA 3I8BA 3ZETA 2PAVA 3VF6A 2VYPA 5AQZA 4CBUA 4BRGA 4NO7A 4C23A 4FWKA 1HKCA 3GDQA 5AQPA 3GL1A 1WUAA 3VEWA 4B1UB 3M6GA 3M3ZA 3CJ7A 1E4GT 2QWMA 5CE3A 3H3OB 3L0QA 3TU5A 2CGKA 4A2AA 4BRIA 2CH6A 3UB5A 4BGAA 1RGIA 5AQFA 2H3GX 4QS8A 5BN9A 1BG3A 1DKGD 4BR4A 3ENHA 3RSEB 4WQ4A 4NB4A 1NGAA 1QZ5A 4FWQA 3R6MA 4M7YA 3L6QA 4CZIA 3ATVA 3H46O 5AQRA 2ITMA 3EN9A 4WQ5C 3W3DA 5ADXA 4CZHA 4BRHA 4BQLA 5AQLA 1J6ZA 2GELA 2E1ZA 4FPBA 4CZEA 5BRFA 3CERA 3UKUB 3HM8A 3LDPA 1NGIA 1BA1A 2A42A 3QFUA 4K41A 5LJVA 4O5FA 4MO5A 3L4IA 3A5LC 4HTLA 4IZ9A 2GTDA 4FOEA 2ZGYA 3VEOA 1ZBSA 2P9SB 3S41A 1YXQA 2NZTA 4M63C 2ASPA 5AR0A 2E2OA 1TUUA 3RSEA 1S3XA 3LDQA 4IWVA 3UKRB 1YAGA 4GY2B 1RDWX 5EX5A 3IFRA 1XUPO 3P4IA 1C0GA 4DCHA 5FPMA 1LCUA 2V7ZA 2HF3A 2CH5A 4WYBA 2A6AA 1U6ZA 3AARA 2Q97A 2YCHA 4BC5A 4FWOA 3UKUA 3D2FB 2YJFA 4M7XA 3ZX0A 4RCHA 5BRDA 4H0PA 4IO8A 1U2VB 1CZAN 4CZKA 1C0FA 1BA0A 2A3ZA 2QWNA 3WQUA 2P9SA 2GUPA 4A62A 5BRHA 2GEMA 3QICA 1NGBA 4BR0A 3EZWA 3JS6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZSZA 2O8BA 4WQ5A 5C42A 5AQWA 3UKRA 3C0BA 5JICA 1UWBA 3WQTA 4O44A 3S3NA 1NLVA 1O13A 3NDKA 4E1MA 3CJ1A 1VSMA 1BIZA 4AHSA 3AA2A 2R7YA 3HOTA 4YNQA 2DY4A 3D2FA 2P51A 3EE8A 3A0IX 3KLIA 5BPMA 3NF6A 3V9ZA 3KKRA 4AHTA 3KKSA 1J5EK 4JK7A 3LANA 4CZFA 2G8FA 3O4WA 3HO1A 1IG8A 2HF4A 4MDAA 5DK5A 1JLCA 4MO4A 3RMBA 1EP4A 4QAGA 4XIUA 1J53A 4O5BA 1HNXK 4N76A 2YHXA 2GUIA 2IAJA 2FXUA 3CCEN 5C2FA 1REVA 4CEOA 5J1EA 4CJKA 1DLOA 4Y0WA 3E9OA 2OPPA 3NGZA 4BC4A 3S9HA 4BRNA 1KC8O 4DFPA 3EEQA 1YTUA 2Z1HA 3LPTA 4H0YB 1L5UA 1BCOA 2QXLA 1FKPA 3E1YA 4LF6K 4YY3K 1KFDA 4B1XB 2HBLA 1N34K 1S1UA 1NWKA 1HPZA 3HPHA 1B9DA 3O9SA 5EU7A 1HKBA 4CCHA 2I7PA 2O8DA 4JKFA 4CF1A 1I39A 3K9JA 3O4QA 3M8SA 2UXBK 5E41A 4EIAA 2VG6A 3ZX3A 3LZIA 1YIJN 3O80A 4H0OA 3T1HK 4DR3K 5C10A 3JYTA 1HJRA 4ILHA 3FFIA 3EL2A 1K8KB 1RBUA 2FBYA 2P9PB 4M3WA 4AF1A 1EWQA 4FJGA 4KTQA 1T6DA 4FW1A 1IG9A 4YDUC 3TSQA 5IT9O 5KPRA 1WSGA 1X1PA 4CF2A 4DV6K 3AO5A 5LMUK 4OLAA 2W42A 2FBTA 4CJUA 3ZCMA 4DTRA 3A5NC 4DV5K 3HI0A 5HL7L 4B3RK 3CI5A 4E7HA 1NU0A 5C2DA 2NLXA 2P9IB 2UYTA 1VQON 2HHHK 3I8DA 1KSPA 4WF9L 4CHZA 4FWSA 4OPHA 4Z4GA 1ITGA 2LSNA 2ASOA 5CYMA 4DS5A 4QS9A 5AQYA 2Q2RA 4DTMA 1WBBA 2NNWA 1BWFO 3QEVA 5M1OA 4RW6A 3LAMA 1B92A 1ZC6A 1Q18A 1BUPA 3OA9A 4Z4HA 3RMAA 5M1KA 5EY4A 3AAQA 4R79A 3WXMB 3L2UA 4GKKK 3KWIA 5AQXA 5FROA 1KCFA 1P8ZA 3MCPA 4CEAA 5C12A 1BOTO 3O3HA 4H8KA 2RHKA 4DWIA 4DU4A 4QS7A 2DTUA 3AO1A 3D6RA 3G10A 3KK3A 2ZJQL 3BZKA 3OJSA 2FBVA 4BE2A 5CZ1A 4FK4A 5M1QA 4BRDA 4DLGA 3AVMA 3CJCA 4DTSA 1JLEA 3UE5A 4GV9A 1LV5A 1ASVA 3BGRA 3AAPA 3DRSA 1JL1A 3CFRA 3TAFA 2O8CB 2QWLA 4CW7B 4N47A 1GOAA 5FPEA 4ISGA 3U8XA 1BO5O 4MLEA 3MECA 1ATRA 2HHTA 1NOYA 3WUHA 3VGLA 4B3SK 2HHSA 4U67L 3OYAA 1TGOA 3ULEB 2KQ2A 3VQAA 4K8XA 1VQ8N 2AP1A 1U4BA 1L3SA 3NF7A 3SV4A 1TV6A 2FSNA 3LP0A 3P38A 4JI7K 1A5VA 3KVGA 3JXUA 4H4OA 2D5RA 1SZ2A 3VEVA 1NK0A 3SAHA 1QHTA 3EY1A 4BR7A 2ASMA 3BY5A 3AO4A 3CCUN 4FWNA 2V52B 4DSLA 3FZLA 4B1YB 1HUXA 3QEPA 3OBWA 1IBLK 1S22A 3SQ1A 1HNVA 1RT2A 2NRVA 3CCQN 2WBNA 3A2FA 5AZIB 2O8BB 3OJUA 3CHWA 3S3MA 3ZEUA 1IBKK 4KI4A 3L2QA 2OPQA 3B6PA 2KFZA 4B8CA 2QW9A 3H6EA 4M3RA 3CC7N 3DAWA 4IOAL 1QZ6A 4BRMA 2O8EA 3KK2A 3NFAA 1BDGA 2WUSA 4XH1A 4JI4K 1DTTA 4G1QA 1Q7YO 5DM7L 2ZJRL 3EYZA 1UA1A 3V1RA 5KGXA 2WC9A 4EP4A 1S1VA 1W97L 3E9PA 4NLCA 2OTJN 4ISEA 1LW0A 3VQBA 3ENOA 4IDHA 2HMIA 4WQ4C 2E6LA 4WFAL 1MA9B 1NM1A 4E7JA 1SV5A 1T8EA 5AQSA 3RWUA 4CBWA 1VHXA 2FC0A 4PKHA 4W5RA 5JMVA 4Z94A 1NMDA 5AQQA 4JKCA 2YHYA 5BPLA 2JWKA 1S5JA 4FJ7A 3MX5A 3J7YP 2QXFA 5EVZA 4Q5VA 4CEFA 3WXIA 4KREA 2KFNA 4JNEA 3WNEA 3LP3A 4BG9A 3SMSA 3IMXA 4CHYA 1D8YA 3DJCA 1JLBA 4FJ5A 3VPZA 3V4IA 3CD6N 5SWMA 2E88A 1KAYA 2JWLA 4AM7A 4F8RA 4FLZA 3CFOA 4LSLA 2PAVA 1RILA 4LD0A 5A2QO 1MU2A 4CBUA 4NO7A 1VSHA 2O4IA 1HKCA 2GBZA 4E7IA 1ILYA 3GL1A 5GAEP 4NXMK 4DSKA 3O9UA 1E4GT 1SUQA 2X78A 3M8QA 4CEEA 4CJEA 4CJFA 1NK7A 4KH4A 3ZSXA 2CGKA 3ZT4A 1RGIA 5AQFA 5HRNA 2DFFA 3NVKA 3SAFA 3O9RA 2OPSA 4Z4IA 4BR4A 3P83D 2G8IA 3VQ7A 4NB4A 4FZZA 4DR4K 4FWQA 3L6QA 4CZIA 5JS1A 3L3UA 5AQRA 3EN9A 1WNSA 4B08A 2OZSA 4BRHA 4RW8A 3ZT3A 2B4JA 5AQLA 1JXBA 4CZEA 1S1TA 4FPBA 1M90O 1S1WA 3CERA 1C0MA 3HM8A 5C25A 1BA1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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