1G15A

Co-crystal of e. coli rnase hi with two mn2+ ions bound in the the active site
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
150
structure length
141
Chain Sequence
KQVEIFTDGSALGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHAEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKARGWKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVGHPENERADELARAAAMNPTLEDTGYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Co-crystal of Escherichia coli RNase HI with Mn2+ ions reveals two divalent metals bound in the active site.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Escherichia coli
molecule keywords RIBONUCLEASE HI
total genus 47
structure length 141
sequence length 150
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2000-10-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1g15A00
4DS5A 1U48A 4CGJA 1WAJA 3O3GA 4HUEA 4NYNA 3OS1A 4FJJA 1S1WA 4F2SA 1WN7A 3IS9A 4O0JA 4CHYA 1ZBIA 4H4OA 5J1EA 3RWUA 4LSNA 1DTTA 4AHVA 1KVAA 4OGCA 1RDBA 4W5TA 1GOCA 4FLZA 3V81A 3TAQA 1TK8A 3CG7A 1LWEA 4DSJA 1RBTA 4MQ3A 4H8KA 4CGFA 2VWJA 1LAVA 5CZ1A 4OPKA 1RT7A 4DTJA 3RMAA 4CJUA 1X9MA 3TABA 3HYFA 3MXMA 3PO5A 3D45A 4PA1A 3ZSXA 3DYAA 1TGOA 4CK3A 3TR8A 3P5JA 2IOCA 3QIOA 4B9NA 4DQPA 3SCXA 4IBNA 4DSKA 3HPHA 3NBPA 1NKEA 2HHTA 3MEEA 4FW1A 2OA8A 4CFDA 4TSXA 1GOBA 4XIUA 1JLAA 4BWJA 3OJUA 3SQ0A 3ZSWA 3L2UA 2E6MA 1SUQA 2W42A 1LW2A 1Z25A 2XY8A 3SJJA 1NKCA 2WONA 5FRNA 3AVKA 3CM6A 4LD0A 3LZIA 1XI1A 2QXFA 1QSLA 3AVJA 3IRXA 4CFBA 3TAEA 3HT3A 3NF9A 4C8MA 3KK1A 3HVRA 2X74A 4F3OA 4KPYA 4IDKA 1G15A 2P1JA 2FBYA 3LPUA 4FLWA 4FM1A 3PO4A 4EZ9A 3CFOA 3ZCMA 3KLGA 3C94A 1BL3A 5KRTA 5FROA 5HRNA 3D0PA 4B9TA 1VSDA 2KTQA 4ELVA 4CE9A 3QLHA 4CIEA 4DSFA 4DFMA 2B5JA 1LWFA 1S9GA 4DMNA 3VQ5A 1HYVA 4R5PA 1JLFA 1TV6A 2RF2A 3NDKA 1VRUA 3AVBA 1EX4A 1JLQA 1SV5A 2FBVA 1RT4A 4CF8A 4E7HA 5HP1A 4KHSA 4K8ZA 4CF1A 3TAFA 4N56A 1U4BA 3B6PA 1T8EA 2ITGA 2G8KA 2KFNA 4I9LA 4M3XA 1VRTA 3RRHA 4FVMA 3RMBA 4OVLA 3HL8A 1YTAA 5HRSA 1T7PA 3RRGA 2HHUA 2X6SA 3DLEA 1TKTA 4JLHA 2FBXA 1JLEA 2D0AA 4Z0UA 3QO9A 4CGDA 4RW6A 3LWMA 4DWIA 2F96A 3VQPA 2HHSA 3VQEA 1UA0A 1KVBA 4GVMA 1BGXT 2QKBA 1RDAA 1KTQA 4Z4EA 3AO1A 3V4IA 1IG9A 4EZ6A 1QE1A 3O4NA 3QERA 3QEXA 5J2PA 4M45A 1RT6A 2NUBA 4M42A 4CGGA 1EETA 4Z4CA 4B9MA 2IAJA 1NOYA 3LAKA 2B6AA 2F8TA 1RBVA 1J9AA 1NJZA 2HHQA 3L2QA 2G8VA 1D9DA 1HMVA 4DTMA 2O4GA 1NK0A 4B9LA 2WOMA 2F8SA 3F73A 1GOAA 1BHLA 3V9WA 1KSPA 1JLBA 1KFSA 3TARA 1TKXA 2Z1JA 3AA4A 3THVA 3KLEA 5CYQA 4CK1A 3SUPA 1WSEA 3HK2A 3KK2A 4BDZA 4W5NA 1C0UA 1HNVA 3MEDA 4E3SA 3L3VA 3U3YA 3NE6A 2GV9A 2Y1JA 1TK0A 3TWHA 4FJ5A 1ASVA 4LH4A 5C25A 2QK9A 1CXQA 4AHRA 3EY1A 2YKMA 1QS4A 3L3UA 3PX6A 4AH9A 3NAEA 1ZBLA 4WE1A 4Z4HA 3OYKA 2VG6A 1S1UA 1K6YA 1RBRA 4CHOA 3AVIA 1RT2A 4CJQA 1XWLA 3RMCA 3SQ4A 2QKKA 1JLCA 1WAFA 2ZD1A 2I5JA 3AO2A 3VQ7A 1EKEA 3I0RA 1NK8A 3SI6A 4O5BA 2YNFA 1B9DA 3DRPA 3ZSQA 3OYAA 4BDPA 3QEWA 4DU1A 3HP6A 2X78A 2OZMA 5JS1A 4FK2A 3LDSA 1CLQA 4FM2A 4KB0A 4IG0A 5CY4A 2YV0X 4RG8A 4CJ4A 3OYLA 3VQ4A 3ULDA 4B9SA 4HHTA 4DSEA 1W9HA 3T1AA 2P5OA 3OYGA 1X1PA 3QNOA 3CYMA 2P5GA 3ZSVA 3VQ8A 2OPRA 1IKYA 5HRPA 5SZTA 5KGWA 3S3NA 1SKWA 4PWDA 4ZTJA 2DY4A 1Y97A 3LP3A 3HXMA 5E41A 3ZSOA 1X9WA 3KD5E 4FJIA 1UOCA 1RBUA 4CCHA 3AA2A 2GUIA 3TI0A 4IKFA 2XRIA 1YTUA 3K2PA 3DLBA 4BDYA 4RW7A 4LY7A 2YNGA 3SNNA 1KLNA 1DLOA 1BCMA 4KB1A 1QHTA 1NJXA 1TL3A 2B4JA 3LPTA 4GMJB 3CFPA 3AA3A 4DQQA 4DQRA 3AV9A 1U49A 3L8BA 3QIPA 4C8KA 4ID5A 1O1WA 3SV3A 3V9UA 3TAPA 3AVLA 3MECA 4CJPA 4CECA 1RTIA 4CEAA 1WSGA 1ITGA 3KJVA 4ZHRA 2YHBA 3AVHA 2X6NA 2XY6A 3E01A 4JS5A 3ALYA 3VQDA 3VQ6A 5FDLA 3ZT1A 3BDPA 2HNZA 3HSTB 1BIZA 2OZSA 4KTQA 4KI6A 1JL2A 3AVCA 3F9KA 4RW8A 4DTPA 2BDPA 3UIQA 4I9QA 5DK5A 2DFFA 2RPIA 4GW6A 4YNQA 2Q3SA 4E1MA 2HW3A 2ATQA 4CIFA 2JLEA 4FYDA 4F8RA 3ZSYA 5KRSA 3TAGA 1WSHA 3DLRA 3KLIA 2R7YA 4E89A 1HYSA 1QSSA 1ZBHA 4Z4FA 3JYTA 2OYQA 4DSLA 2G8IA 1RT3A 3O4QA 3K5OA 3VQCA 1CZBA 1KRPA 4HCBA 5HROA 2A1RA 4LH5A 1RTJA 1RCHA 4MFBA 4O44A 2ETJA 4E7LA 1A5XA 4DU4A 2HHXA 4E0DA 4N76A 2FBTA 4I2PA 1N5YA 2HB5A 4BWMA 1NJYA 3OYFA 4KO0A 2YNIA 2XHBA 3NGYA 4KTZA 3V9XA 3DI6A 2Y1IA 1REVA 4KKOA 4AHCA 1HQUA 3KTQA 1J53A 2OPSA 4E7JA 1WLJA 4Z4GA 3DM2A 1TAQA 4FJHA 1RDCA 3ITHA 3JSMA 3NF6A 2KQ2A 1ZBUA 2HMIA 1NOZA 3OYMA 3EYZA 1C1CA 3PUFA 4DU3A 1L5UA 4OLBA 5FRMA 4DF8A 1HNIA 3PX0A 1SL2A 2G8UA 4ZTFA 5C24A 4W5RA 5K14A 3KLFA 3RR7A 1VSEA 4KHNA 4FJ9A 4AHUA 3LP2A 4J2AA 3NH1A 4CJ3A 3LP1A 3OYHA 4NCAA 4DTOA 4M3WA 2KW4A 4YFUA 5CZ2A 3NHGA 4PQUA 1BISA 3CM5A 5C42A 4FM0A 3A2FA 2GBZA 1NK5A 3SUOA 4CJWA 1VSKA 2IC3A 1JXEA 3ZSZA 1C0MA 1EXQA 2VG5A 3OVNA 3P83D 3HVTA 5J2MA 4DLGA 4CJKA 3QEPA 4KHQA 4BE2A 3TANA 5KGXA 2HHVA 3M8SA 3HP9A 3QINA 4KTWA 1RT5A 4O0IA 4FK4A 1S1VA 1SL0A 1W0HA 4FLVA 2XO7A 4CIGA 3C6UA 4Y1DA 5CYMA 2ZQBA 1HQEA 4DTNA 3IAYA 3C95A 1I39A 3LALA 4HUGA 2XY7A 3IG1A 3K59A 3OYDA 4PY5A 1B92A 5EU7A 4M41A 4W5OA 4E1NA 1Q9XA 4C8OA 2D5RA 2HHWA 2DFEA 1C1AA 5J2QA 3NGIA 3EZ5A 3LZJA 3K57A 4I2QA 4E19A 3AO4A 3KKRA 2OPPA 1Z26A 4CJRA 4FLTA 1L3SA 1VSLA 5DMRA 1KFDA 3V1QA 1WNSA 3H08A 1S1XA 1SKSA 1XHXA 3OYBA 4UQGA 1BIUA 2PY5A 1RT1A 3U3GA 4IG3A 4EP5A 5J2NA 1Q8IA 2G8WA 3RR8A 4M3ZA 4J2BA 3PY8A 5HRRA 4HCCA 4CEQA 4BE0A 3DOLA 1A5WA 3VQAA 3QETA 4KAZA 2YKNA 4CK2A 4EP4A 1FKOA 4CGHA 3LWLA 1NK7A 3U6FA 4NCBA 1C0TA 4FJ8A 1VSIA 3M8RA 3I8DA 4N41A 2KZZA 4IFYA 3V1OA 4BACA 4CHZA 4L8RB 3HPGA 1QSYA 1UA1A 1FK9A 3QESA 4DQSA 1DTQA 4O55A 4FJKA 3AO5A 2HVHA 3K58A 1C6VA 2HNDA 4ELTA 1ASWA 1SL1A 1IKWA 2LSNA 1KCFA 2E6LA 4G1QA 4F2RA 3L2RA 4KI4A 2BE2A 3SQ2A 2O4IA 3CQ8A 4HTUA 1IO2A 3NCIA 1JL1A 4DTSA 1UAXA 3KD1E 3FFIA 3AVAA 1CXUA 4JRPA 1TKZA 1VK0A 1TKDA 4FJLA 2KZMA 3M8QA 4CERA 3OY9A 4CJFA 3QEIA 4FZZA 2D0CA 2IDOA 3KLHA 3K5NA 4B9UA 3T3FA 4B9VA 4DQIA 1ZBFA 3ZT2A 1HJRA 4B08A 4B8AB 3K5LA 1D5AA 1QQCA 3VN5A 3QNNA 3DLHA 3KKSA 3SQ1A 5KTQA 4AILC 5D3GA 1VSHA 1D9FA 3CFRA 1NK9A 3V9SA 4Y1CA 4FLYA 4FLXA 1NJWA 4M3UA 3SZ2A 1U47A 1IH7A 3SPZA 3SPYA 1FKPA 3DLKA 1BQNA 1HPZA 2A1SA 5HBMA 4QCLA 1F21A 1S9EA 1RTHA 4AHTA 3RMDA 1XC9A 4JRQA 1ZYQA 1SKRA 4K8XA 2IGIA 4OLAA 3NH0A 1YVUA 2BANA 5I3UA 1S6PA 3VQBA 4ICLA 4N5SA 5T7BA 2Z1HA 3VQ9A 3O3HA 2PYJA 2HVIA 2VWKA 4CFCA 1S5JA 1HYZA 4I7FA 4DF4A 1S6QA 1QTMA 1WSFA 2G8HA 4DTUA 1JXBA 3AVFA 1RTDA 3NGZA 4KFBA 1R0AA 3LP0A 4CEZA 1TK5A 4KHYA 1TAUA 4CESA 1WSJA 1J5OA 4J2EA 3RTVA 4CGIA 3PV8A 1N6QA 4CJ5A 3K5MA 4DFKA 3ZSRA 1NKBA 1T03A 3ZT4A 4C8LA 4M3TA 3MAQA 4CJSA 1EP4A 4CF2A 4HUFA 1TL1A 3C6TA 4LSLA 4FJ7A 1HRHA 3OS2A 2Z1GA 4KHUA 4CJLA 3AO3A 4KV8A 3AVNA 1CZ9A 3SYZA 2PYLA 2KFZA 4B3OA 4CJEA 3P1GA 4BE1A 4FJGA 3MXIA 2EHGA 4DLEA 1JKHA 1IKXA 3HO1A 1T05A 3BGRA 4KHWA 1BI4A 5I42A 3ISNC 2RN2A 3VA3A 3OYNA 4M3RA 4OGEA 3WNGA 4NYFA 4DS4A 2DFHA 4Z4IA 2D0BA 3NFAA 1Q9YA 4RW9A 4W5QA 3VQQA 3WNFA 3ZT3A 3MEGA 1VSMA 3NF8A 1U04A 1LWCA 3SUQA 1BCOA 3KIOA 1B9FA 4N47A 3OYEA 1NK4A 1L3UA 4FJNA 5HLFA 2Z1IA 3DRSA 4AHSA 4CJTA 1WSIA 3V1RA 2IS3A 2JGUA 4OJRA 1IKVA 4CF9A 3DMJA 3L2WA 4IFVA 3WNEA 4CHQA 3O3FA 1L3TA 5SWMA 2PZSA 2YHAA 4F3TA 3ZT0A 3OYJA 3HPOA 3OYCA 4DFJA 5KI6A 3SV4A 3I0SA 1RNHA 4M3YA 3G10A 1XHZA 3WNHA 1U45A 2OPQA 2E4LA 3B6OA 4OKKA 4H4MA 3OYIA 1X9SA 1A5VA 3ASMA 2P51A 4OKEA 1J54A 4RW4A 3T19A 2XY5A 3PX4A 1BQMA 4FJXA 2YNHA 4HVJA 1UWBA 3DOKA 4CF0A 4DG1A 4FLUA 2G8FA 3SUNA 4FZYA 4C8NA 4FZXC 1VSFA 4J2DA 1RBSA 3MXJA 4ELUA 3QEVA 3LANA 4DTXA 1C1BA 4ID1A 4B8CA 3DLGA 4FXDA 1I3AA 4CEOA 3S3OA 1LV5A 3DRRA 4FW2A 4CHPA 3S3MA 2RKIA 3AVMA 4NCGA 4F4KA 4CEFA 4CJVA 4JS4A 3HM9A 4KRFA 3OJSA 4DFPA 4OPJA 3VA0A 1S1TA 2AJQA 4FCYA 2FC0A 4PUOA 4E7KA 1LW0A 3TAMA 1YT3A 4Q5VA 3KK3A 1KVCA 1ASUA 1FXXA 4KREA 3HJFA 3AA5X 1BI4B 4CEDA 4CEBA 3AVGA 1VSJA 3NH2A 2HNYA 2BGGA 4O4GA 1L3VA 2DTUA 4DSIA 4OKJA 4DTRA 3M8PA 4CHNA 3L2VA 3NF7A 1TVRA 2EX3A 5JS2A 1D8YA 4QAGA 4FK0A 1NK6A 4CEEA 1RDDA 2VG7A 1KLMA 1JLGA 3V6DA 1MU2A 4Q0BA 2ZE2A 3LAMA 4E7IA 4FJMA 3S9HA 4CFAA 3G0ZA 3OS0A 3V9ZA 4QOZB 1RILA 1LAWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQNN 4CGJA 4NYNA 1S1WA 1IBLK 3F2KA 5GINA 1RDBA 3FFKB 2QI2A 4FLZA 3TAQA 1LWEA 4MQ3A 3MMVA 5AQZA 3EEQA 4DTJA 3RMAA 3A8YA 4BC2A 3D45A 3ZYYX 1WBBA 3DYAA 1TGOA 3P5JA 2W6KA 4MLHA 2ITMA 4DSKA 1NKEA 2F4VK 1LOTB 4AF1A 4FW1A 2OA8A 3UKRB 1YXQA 5JVGL 2E6MA 1HNZK 1Z25A 3SJJA 2I7NA 1G99A 5FRNA 4I6MA 1QSLA 1MWKA 4JN4A 3HT3A 2D0OA 4DUZK 3HVRA 4J8FA 4IDKA 2FBYA 3LPUA 3CFOA 4M7XA 2D4WA 4JK8A 4BR0A 3D0PA 4U7BA 2KTQA 1Q81O 4ELVA 2A41A 4BVOA 2YX6A 1JLFA 3MX2A 5FPMA 5LJVA 3AVBA 1JLQA 2YJFA 5E26A 3CC2N 4E7HA 5HP1A 2PBDA 4K8ZA 4CF1A 3TAFA 4N56A 3AAQA 3LL3A 2ITGA 4YOYA 4I9LA 4M3XA 1VRTA 1KAXA 3RMBA 2E1ZA 2HHUA 3CCSN 3WUHA 3BZCA 1JLEA 4KBOA 4GV3A 1Q82O 3HRGA 1OKJA 2F96A 3VQEA 2QKBA 4Z4EA 3AO1A 5A2QO 4IDHA 3O4NA 1VQ5N 4B3MK 1EETA 4Z4CA 2IAJA 3B8AX 1NOYA 1EWQA 1RBVA 1J9AA 1T6DA 3VF4A 5F1XA 3L2QA 4JK7A 2G8VA 1HMVA 4DTMA 2O4GA 4B9LA 2WOMA 3F73A 4H0VB 1BHLA 2HF4A 3VEWA 1TKXA 4YOXA 3THVA 5DM6L 1WBDA 4CK1A 4BDZA 1C0UA 1HNVA 4E3SA 3A0IX 1TK0A 3BF3A 1ASVA 4LH4A 1CXQA 2FF3B 4BROA 3EY1A 2YKMA 1NU0A 3PX6A 4AH9A 3QFPA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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