1WSEA

Co-crystal structure of e.coli rnase hi active site mutant (e48a*) with mn2+
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMALMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKARGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Identification of Single Mn(2+) Binding Sites Required for Activation of the Mutant Proteins of E.coli RNase HI at Glu48 and/or Asp134 by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Escherichia coli
molecule keywords Ribonuclease HI
total genus 44
structure length 155
sequence length 155
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2004-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1wseA00
4FJJA 3AVGA 3V1OA 4FW1A 3SCXA 4FJLA 3CG7A 4GW6A 3UIQA 4CF1A 3AO3A 1LV5A 2Z1IA 4BWJA 4F2SA 4CJTA 1RDCA 4M42A 1BQNA 4F2RA 4CJKA 4CEDA 1RBVA 1WSGA 3CFPA 3SJJA 1HQUA 2KFZA 3C95A 1WSFA 3VQEA 4CFAA 3NE6A 3ZCMA 1UAXA 3KD5E 4OKJA 2OPPA 3NF8A 1TVRA 2BGGA 3QNNA 2G8FA 1SKSA 3M8RA 4ID1A 2XO7A 2YHBA 2E4LA 3IRXA 2FBYA 5HRPA 3OYGA 3SUQA 4FLYA 4C8LA 1VSMA 3NBPA 5CYQA 1JLBA 1GOAA 3ZT1A 3SPYA 3TAQA 3NH1A 4BACA 2KW4A 2KTQA 1YTUA 3LP3A 1VSIA 4CJ5A 1SL2A 4FLUA 4DSJA 1VSFA 4FK2A 4AHUA 4RW9A 2VWJA 3TWHA 2X78A 3TR8A 3OVNA 1CLQA 5SWMA 1ZBFA 4OPKA 1D5AA 3ZT0A 3K5MA 4AHSA 1L5UA 3JSMA 5CY4A 3TABA 3LWMA 4CJLA 4BWMA 4GMJB 1LW2A 1RT6A 1N5YA 1RTHA 5DMRA 4LD0A 4CEBA 1NK8A 4Z4IA 1WSEA 3AA5X 4CF2A 1RT7A 3AA3A 3C94A 3O3FA 2IGIA 2XRIA 3TAGA 1IO2A 1NJZA 5I42A 4FXDA 1JLEA 2ATQA 3WNEA 3OYAA 5CZ2A 4N41A 3AA4A 3DOKA 3G0ZA 4KFBA 4B8AB 3K58A 4DFPA 1UA0A 2HHSA 5FROA 3QINA 1TL1A 2VG7A 3PV8A 3OYCA 3RMBA 3L3UA 2P5OA 1ZBUA 1TGOA 3K59A 3KKSA 4B8CA 3SQ0A 4DFKA 3OY9A 3RRHA 4I2PA 3ZSRA 4C8NA 1WAJA 2BDPA 2O4IA 5JS1A 3B6OA 4DSKA 1C6VA 1S6QA 4E3SA 1VSJA 4HUFA 4IFYA 3U6FA 4Q0BA 3K5OA 5C42A 3L2VA 2P5GA 4EZ9A 4CGFA 1GOBA 3NDKA 3KIOA 3AVNA 1ITGA 3SYZA 3HPHA 1TK0A 1HYVA 3K2PA 1SL0A 4KHYA 4B9UA 4DSEA 4DSLA 4CJEA 3WNGA 4NYFA 4CGJA 5KGXA 3DYAA 2G8IA 2HHUA 1I3AA 1ZYQA 4OLBA 4IDKA 4CJWA 4CHYA 3LWLA 3V9UA 3QO9A 4N76A 1C1CA 4CHQA 4QAGA 1J54A 3ISNC 1S5JA 4FJNA 4FZZA 3ZT3A 3OYNA 3RMDA 2OPRA 1RT2A 3DRSA 4E19A 3MEEA 1TKDA 4Q5VA 2DFHA 3V1RA 5J2QA 3P83D 4ELTA 3DM2A 2Z1JA 4HUEA 4PWDA 3HPGA 4FM1A 2IS3A 3ULDA 1NKEA 4HCCA 1NKBA 1DLOA 3LP0A 4CJFA 2Y1IA 2G8HA 4CJUA 1ZBHA 4RG8A 1Y97A 1QE1A 1SUQA 2OPQA 3M8QA 3KTQA 3KKRA 5KRSA 4FLTA 3WNHA 2O4GA 1X9SA 1XHZA 4OVLA 4FW2A 1RCHA 1JLFA 2G8WA 3CFRA 2IAJA 4CGGA 3SQ4A 1XI1A 3DLHA 4J2DA 2F8TA 4AHTA 4ICLA 3RR8A 3DLGA 1C1BA 2OPSA 1RT1A 2P51A 3SPZA 4OGCA 3WNFA 4FM2A 3HP9A 4KHWA 1QSLA 4M3RA 1X9MA 4LSNA 3O3GA 3QEVA 3OYHA 1VSEA 1HRHA 1REVA 1EETA 3VQ5A 4CK1A 4JRPA 2HNDA 1S1UA 1EXQA 3AV9A 3AVJA 1Z26A 3LAMA 2VG6A 1TK8A 3U3GA 1KFDA 4W5TA 1WSIA 3QESA 3G10A 2IC3A 1HQEA 1KCFA 4B9VA 1VSHA 3VQBA 4DLEA 4FJ7A 4OGEA 2B5JA 1KVBA 4E7LA 1JLQA 3P1GA 2AJQA 3F9KA 4CGDA 5J1EA 4CEEA 2D0AA 4YFUA 4JRQA 3TANA 5D3GA 3HJFA 4CEAA 3L3VA 4Z4HA 3SUOA 3O3HA 3HP6A 4CFCA 4DU4A 1UA1A 3NGZA 1Q8IA 2B4JA 2DFFA 2ETJA 2QXFA 2YHAA 4CJPA 3I8DA 1Q9YA 1EKEA 1NJYA 4AILC 3I0RA 1S6PA 3TAMA 1W0HA 1VSLA 4UQGA 4DTNA 5CYMA 2ZQBA 4FJGA 4I9QA 5KI6A 3DRPA 3NFAA 3KLIA 3PX0A 4DWIA 3VQPA 1J53A 1BIZA 5E41A 1MU2A 3DLEA 3VQAA 4BDYA 3SI6A 1CZBA 4K8XA 2HHTA 3VQ6A 1WSHA 4EP4A 1QHTA 1J9AA 1KTQA 2YNGA 3RRGA 3D45A 3DRRA 3CM6A 4O55A 4CECA 1JLGA 3NH0A 1C1AA 3OYFA 2FBVA 2HNZA 2Q3SA 3MXIA 1JXEA 1IKWA 4XIUA 1U47A 1L3SA 4B9TA 4B3OA 3HPOA 4E7KA 3HM9A 4DMNA 3LALA 4FZXC 1KVAA 3QIPA 3MAQA 3SV4A 4C8KA 3VQQA 4QCLA 1RBTA 2Z1GA 2R7YA 1YTAA 4LH4A 5C25A 1S9EA 4DTMA 1SL1A 5T7BA 4ELVA 2GBZA 1TKZA 3O4NA 4J2EA 4JS5A 1BQMA 3V4IA 4OJRA 4B9SA 2WONA 3OS0A 1Q9XA 3ZSZA 1JKHA 3AVAA 4W5OA 4J2AA 3RR7A 4OKKA 4CFDA 3LPUA 2QKKA 1T7PA 3LPTA 4YNQA 3RMAA 4DU3A 4O44A 2WOMA 3DLKA 3AVFA 4AHCA 5HROA 1U45A 1RT5A 1ZBLA 2XY5A 4DTUA 1KSPA 4W5QA 2YNIA 3OS2A 3PX6A 4GVMA 1T8EA 4KRFA 4BE0A 1S9GA 4CIEA 4NYNA 1B92A 3SV3A 2Y1JA 3CM5A 4M3YA 1IH7A 2RKIA 4HUGA 1X9WA 4CK3A 4WE1A 4CF9A 1EX4A 4DQQA 1U49A 3AVBA 1B9DA 1L3TA 2X74A 3T3FA 2F8SA 1O1WA 1S1TA 2YKNA 2PZSA 4E7JA 4CHOA 4AH9A 2E6MA 4IG3A 1N6QA 2PY5A 1WSJA 3AVMA 1QQCA 4I9LA 3EY1A 2YNFA 4AHVA 4RW6A 3QETA 3SQ2A 3KLHA 2KZZA 2ZD1A 2P1JA 1IKXA 4RW8A 4DTJA 1NK5A 1BCOA 3QEPA 4DTSA 1R0AA 4KI6A 3AO1A 1BI4A 1LWCA 1RBSA 2FC0A 1KLNA 4C8OA 3AVIA 2G8UA 1TAQA 4DTRA 2DFEA 3V1QA 1NKCA 3ZSOA 4KHSA 3LAKA 1HNIA 3VQ8A 5SZTA 3VA0A 5KRTA 3MXJA 3QEWA 4HVJA 3NHGA 4Y1DA 5FDLA 3VQ9A 4O0IA 3M8SA 3V6DA 2HVIA 4LY7A 4B9MA 5HBMA 1J5OA 4PA1A 3VQ7A 1TL3A 3ALYA 4MQ3A 3KK1A 4O5BA 1NK7A 2NUBA 3LZIA 5HLFA 1KRPA 3AVHA 1I39A 1FKOA 2RN2A 1ASUA 4CEOA 3TAEA 4KHQA 1BISA 2JLEA 4DG1A 1LWEA 3P5JA 4M3UA 4DSFA 3KJVA 1YVUA 4I7FA 3SZ2A 3HK2A 3VQDA 4DTPA 4DQSA 2RF2A 1HPZA 3IS9A 1RDBA 1CXUA 3OYEA 5J2PA 1ASWA 3AO2A 1T03A 5FRMA 1RT3A 1D9FA 3S3MA 4FJMA 3CYMA 4PY5A 4CGIA 3L8BA 3ZSQA 4E7HA 4CEQA 1RTDA 4Z4CA 3RTVA 1XWLA 3NGIA 3A2FA 3S3NA 4FLVA 3K57A 1S1XA 3HYFA 4CERA 4CJRA 3TAPA 4DFJA 2HB5A 2QKBA 1D8YA 3OJUA 4CK2A 1BCMA 3PUFA 2X6NA 2KZMA 1BI4B 1HNVA 3H08A 4NCGA 3OYKA 4ZTJA 5K14A 2EX3A 4DQIA 2VWKA 3VA3A 4PUOA 3TAFA 3NAEA 1ASVA 5HRSA 2D5RA 3LP1A 2FBTA 2Z1HA 2HHVA 3QLHA 4J2BA 1S1WA 4M3XA 3K5NA 4M3TA 5EU7A 2X6SA 3ZSWA 1U4BA 2DY4A 4DLGA 1QSYA 1WLJA 3OYDA 5HP1A 4FJ8A 1RBRA 2PYLA 1T05A 5HRNA 5CZ1A 1A5VA 4E1NA 1G15A 2G8KA 2B6AA 5KTQA 4B08A 4TSXA 4DF4A 3PO5A 4JS4A 4DFMA 4FJIA 3AO4A 4KHUA 1RTJA 4G1QA 3OYJA 3L2RA 1LW0A 3KLEA 1TV6A 4N56A 3ZSXA 4C8MA 3HO1A 4M45A 3DMJA 4FJKA 4HHTA 3V9WA 1FXXA 4NCAA 4F8RA 4KB0A 4OKEA 2YV0X 4CFBA 2HHXA 2D0CA 1TK5A 4L8RB 3HXMA 4DTXA 2QK9A 2IOCA 3DLBA 3EYZA 2OZSA 3SUNA 1S1VA 3AVCA 3S9HA 4O4GA 1HJRA 4B9LA 5C24A 4CJ4A 3NF7A 1RILA 3PX4A 4CIGA 3V9XA 2HW3A 3SNNA 2FBXA 4KB1A 5J2NA 4FLWA 2ITGA 3K5LA 4JLHA 1IKYA 4RW4A 3HT3A 4E1MA 3VQCA 3TARA 4OPJA 4R5PA 3QEXA 2VG5A 4M3ZA 4H4MA 2HHQA 1BIUA 2BE2A 3DOLA 3KK3A 1RNHA 3LZJA 4EZ6A 2XY7A 1A5WA 1EP4A 1JL1A 3T1AA 4I2QA 1LWFA 1C0MA 3PY8A 1JL2A 4KO0A 3OS1A 2HHWA 1F21A 4KHNA 4O0JA 3IG1A 3FFIA 4CIFA 1HYZA 3B6PA 3ITHA 4FZYA 2DTUA 4MFBA 2A1SA 3ZSVA 1NK6A 4KI4A 4B9NA 1WNSA 3HL8A 1UWBA 4HCBA 3AVKA 1NK9A 4W5RA 1DTQA 3L2WA 1GOCA 3MECA 1SV5A 1B9FA 1NJWA 3OJSA 3MEGA 1HMVA 4E89A 3AO5A 1NOYA 4E7IA 3KD1E 4CJ3A 3V9SA 3KK2A 1JXBA 3QERA 2GV9A 1HYSA 2BANA 2E6LA 3NF9A 4CGHA 1RBUA 4CF8A 4CHNA 3OYLA 3CQ8A 3EZ5A 1QS4A 4CCHA 4DS5A 2HMIA 1XHXA 3I0SA 1W9HA 4AHRA 4DSIA 1KLMA 4N5SA 1C0TA 2PYJA 1Z25A 1SKWA 4EP5A 3KLFA 1QSSA 3F73A 4BDPA 3C6UA 1IG9A 1JLAA 3KLGA 4FLXA 1SKRA 3PO4A 4FJHA 4KV8A 3HSTB 4M3WA 4QOZB 2YKMA 3ZT2A 3JYTA 4BE1A 3RMCA 2A1RA 3S3OA 1FK9A 4M41A 2XHBA 4CF0A 1D9DA 3IAYA 2YNHA 3BGRA 4KTZA 2XY6A 1ZBIA 2KQ2A 4DQPA 1L3VA 4F3TA 1TKTA 4Z4FA 1BL3A 1NK4A 1CXQA 3LP2A 4CJQA 3LANA 3V81A 1X1PA 3ZSYA 4K8ZA 2HNYA 4Y1CA 4CJVA 3O4QA 4DTOA 4KAZA 3LDSA 1WAFA 3ASMA 2XY8A 2OZMA 4CEFA 4CEZA 4CESA 4DF8A 4FLZA 1LAVA 1VRUA 3AVLA 4LSLA 4LH5A 3QEIA 1RDDA 3MEDA 1C0UA 1QTMA 4FM0A 4IBNA 4IFVA 4Z4EA 3VN5A 4FK4A 3NCIA 1NK0A 5JS2A 1BGXT 3E01A 3OYBA 1VK0A 4FVMA 4FCYA 2F96A 3NF6A 4RW7A 1RTIA 3MXMA 5FRNA 4PQUA 2HVHA 3C6TA 3ZT4A 4FK0A 3CFOA 4KTQA 3DI6A 1UOCA 1RDAA 3NGYA 1XC9A 3RWUA 3VQ4A 4H8KA 2RPIA 4ZTFA 4ZHRA 4DU1A 4H4OA 1JLCA 3T19A 4IKFA 3M8PA 1K6YA 2OYQA 3BDPA 3OYIA 2ZE2A 1A5XA 4CE9A 5DK5A 2OA8A 4F3OA 1NOZA 3L2UA 3L2QA 3TI0A 4KREA 1U04A 3HVTA 4FJ9A 4FJXA 1WN7A 2D0BA 1DTTA 4KTWA 5KGWA 4CHPA 4FJ5A 4Z4GA 4E0DA 1YT3A 5I3UA 1CZ9A 1KFSA 3QIOA 1LAWA 2W42A 4CJSA 4DS4A 4ELUA 1VSKA 3HVRA 2LSNA 4BDZA 3SQ1A 1U48A 3NH2A 1FKPA 4IG0A 4Z0UA 3OYMA 3U3YA 2IDOA 1L3UA 2G8VA 1NJXA 4N47A 4DQRA 4F4KA 4ID5A 4KKOA 4FYDA 1VRTA 2JGUA 3THVA 4KPYA 4W5NA 2I5JA 3AA2A 4CHZA 3V9ZA 1TAUA 3QNOA 3SUPA 2EHGA 1KVCA 4HTUA 3D0PA 3DLRA 4OLAA 1IKVA 5HRRA 1TKXA 1VSDA 2GUIA 5J2MA 2KFNA 4NCBA 1RT4A 4BE2A 1BHLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1U2VB 4FW1A 4FJLA 4GW6A 4BG8A 1ZBSA 4CF1A 2ZM6K 4BWJA 2Q31A 4F2RA 1WSGA 4A5AA 3SJJA 3KK7A 4OKJA 3BZKA 3NF8A 3QNNA 3SUQA 2FBYA 2ZWHA 5LJVA 5CYQA 3I55N 1ZC6A 5FLXO 2KTQA 1ZXOA 1J5EK 5EVZA 4GVEA 4FLUA 4DSJA 2VWJA 4RW9A 2X78A 3HBTA 3TR8A 4OPKA 4QS8A 4AHSA 3GOIA 4CJLA 1O13A 4BWMA 5BREA 1HKCA 1LW2A 1RT6A 5DMRA 3FZLA 3ZX2A 1WSEA 2ZJRL 1DGKN 3O3FA 2UUAK 1NM1A 2IGIA 3T69A 4N41A 2P9NA 3DJCA 4DFPA 4WCEL 1TL1A 3OYCA 3L3UA 1RGIA 2P5OA 4C1NK 4X66K 4DFKA 3ZSRA 1WAJA 2CGKA 3CCJN 1S6QA 1VSJA 4HUFA 4IFYA 4YOTA 3L2VA 2P5GA 4JK9A 4CGFA 4FWNA 5E26A 3O80A 4R79A 3AVNA 1ITGA 3SYZA 1TK0A 3H3OB 4B3SK 4BR0A 1HYVA 5ADXA 1NGGA 1P8ZA 4CGJA 3DXKA 1I3AA 1ZYQA 4IDKA 3AGKA 4CHYA 2F9WA 2O8FA 3QFUA 2BUPA 3MN6A 3OYNA 4FJNA 3GE1A 4E19A 3M6GA 1TKDA 2DFHA 5AR0A 4ELTA 3CHWA 4HUEA 1NKBA 2O8CA 1MA9B 3VETA 1QE1A 4H5RA 3FR0A 3CCMN 1G99A 5BPNA 3KKRA 4DUYK 5KRSA 3FE1A 1JLFA 3CFRA 4J2DA 4IOCL 2F8TA 3UKUB 2OPSA 3ULEB 3WNFA 2I7NA 2O8DA 1QSLA 4M3RA 1X9MA 3QEVA 4AM7A 2NRRA 1HRHA 1EETA 2OANA 3AV9A 4DV5K 3G10A 1ATNA 3IKMA 3VQBA 1OH7A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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