2AA4A

Crystal structure of escherichia coli putative n-acetylmannosamine kinase, new york structural genomics consortium
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
289
structure length
289
Chain Sequence
MTTLAIDIGGTKLAAALIGADGQIRDRRELPTPASQTPEALRDALSALVSPLQAHAQRVAIASTGIIRDGSLLALNPHNLGGLLHFPLVKTLEQLTNLPTIAINDAQAAAWAEFQALDGDITDMVFITVSTGVGGGVVSGCKLLTGPGGLAGHIGHTLADPHGPVCGCGRTGCVEAIASGRGIAAAAQGELAGADAKTIFTRAGQGDEQAQQLIHRSARTLARLIADIKATTDCQCVVVGGSVGLAEGYLALVETYLAQEPAAFHVDLLAAHYRHDAGLLGAALLAQGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Escherichia Coli Putative N-Acetylmannosamine Kinase
rcsb
molecule keywords Putative N-acetylmannosamine kinase
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
total genus 85
structure length 289
sequence length 289
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2005-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aa4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aa4A01
1H1VA 4H0XB 2E2NA 3U9DA 4FWPA 5B8HA 5CE3A 3D2EA 1BG3A 3O5BA 4EIAA 3MN5A 2P9IB 3D7EO 1NGGA 4JN4A 4K43A 5TKYA 1SAZA 1YVNA 2FF6A 2E1ZA 1GLCG 3SMSA 3UKRB 4ISGA 2YI1A 1MWKA 2QM1A 1BA0A 1E4GT 3MCPA 3JXUA 3FLCO 4QS9A 3P4IA 3VERA 1ATSA 2ZGYA 2UYTA 3CJAA 1GLEG 4H5VA 1X9JA 4JHDB 4AM7A 1YAGA 5AQUA 1NMDA 4A2BA 3G25A 1D4XA 3CJ1A 1QZ5A 4H03B 3J8AA 5AFUA 3MN7A 2QWQA 3QFPA 1RDWX 1V4TA 4BC2A 4B1WB 4KBOA 4LC9B 2GELA 3UKUB 4BRAA 1MA9B 3VESA 1G99A 4BR7A 4NB4A 2NRHA 2P9NB 3VEZA 3AARA 3BF1A 1E4FT 3WXLA 4PKIA 3QB0A 3M3ZA 2IVOA 3CJ7A 3DXMA 3IDHA 2CH6A 3CJ9A 3IUCA 2PAVA 3VEOA 3SLCA 4CZJA 4BQZA 4CJ7A 2P9PA 4EHUA 4FO0A 4FPAA 4CZGA 3CJCA 1K8KA 1C0FA 3O80A 4H0OA 5AQVA 4B1VA 3C7NA 3KVGA 2VYPA 3WEEA 3ULEB 1ESVA 2ZWHA 3D2FA 1HKGA 3VOVA 3MMVA 4FWSA 1GLDG 3IFRA 1CZAN 1QHAA 1KAXA 4H5TA 2Q1NA 4XH1A 5AFUH 1BDGA 1NGAA 4DCHA 2ITMA 3GBTA 4K41A 3ZETA 3VEYA 3TU5A 3MDQA 1QQOA 1NGIA 5KPRA 4CBWA 1GLFO 3VEVA 3CQYA 4BRMA 1Z05A 3U9ZA 2YHWA 3W3DA 1QQMA 3B8AX 2P9IA 2P9UB 4BC4A 2J4RA 4Y0WA 2HF3A 5F1XA 1BUPA 3IMXA 4BRHA 5BPMA 2OANA 3M1FA 5BRDA 3CI5A 1WOQA 4F9OA 4H0TB 3KZBA 3I33A 4B1ZA 2Q0RA 3A5NC 3WUHA 4JHDA 3VGMA 3A5LC 4K42A 1QQNA 3SJHA 4H5RA 5ADXA 4BQLA 2A6AA 3VF4A 2GUPA 2YHYA 3VGKA 3QBXA 3LM2A 2GTDA 4BC3A 4CZKA 3ZX2A 3GOIA 3HSCA 3H3OB 4GY2B 4IXCA 1KAYA 1BA1A 1S22A 1T6DA 3ZX3A 4IWVA 4DQ8A 2D0PA 2FSKA 1X3MA 3A8YA 3ZEUA 3H6EA 3VF2A 4FPBA 4B1XB 5E26A 4O8KA 3RSEB 2ASMA 4CBXA 3FZLA 5JMVA 3A0IX 3DXKB 3FZMA 4M7XA 5AQHA 3QFUA 4H0VB 1X3NA 4YDUA 4EFHA 2A3ZA 2PBDA 5KQDA 3AAPA 3WXKA 2P9SB 5AZIA 1T44A 4A2AA 2D4WA 4BVOA 2V52B 4FOEA 3QMLA 1GLLO 4JD2A 1ZC6A 3DWLA 4QS8A 4BR4A 2GWKA 5AQSA 1GLAG 3TPQA 2P9KA 2IVPA 2H3GX 1WUAA 3MK6A 3SMPA 1HKBA 2CGJA 3VENA 2YJFA 3O1BA 4BRKA 1C0GA 2ZF5O 1TYQB 3CERA 5AZJB 3VF6A 5ADXH 5KQ8A 3JS6A 1NLVA 2CH5A 4BVPA 4WQ5C 1ATRA 5F2RA 3FR0A 5AQKA 4BRGA 4H5WA 5FPNA 2HF4A 2QWPA 1GLJO 3S41A 2D1KA 5FPMA 3FZHA 4DHYA 5LJWA 1ZBSA 2P9UA 5EY4A 5EXWA 3MN9A 2E20A 1RFQA 3WQUA 1MDUB 4I6MB 4BG8A 5BREA 3H45C 5AQXA 1NGFA 1SQKA 4CZEA 2FSNA 2BUPA 1IJJA 1MWMA 4B1YB 3VGLA 3D2EB 2P9LA 4ISEA 3QICA 3EZWA 2HMPA 3HI0A 4NO7A 4PL8A 2CGLA 2YJEA 4CZHA 4J8FA 4XH4A 3ATUA 5AQWA 3O4WA 5JICA 4FWMA 5AQZA 3LDLA 5AQYA 2FF3B 3LDNA 4B1UB 3AY9A 5KPZA 2CGKA 2IVNA 4HTLA 5AQIA 4AM6A 1XUPO 1NGBA 5AQLA 4FOIA 3CQXA 3CJBA 2W40A 3A5MC 1DGKN 4WQ4C 3QDKA 3UKRA 4IZ9A 4IO8A 3R8EA 1P8ZA 4CZLA 1Q18A 4BR0A 4PL7A 1NBWA 2A5XA 4A62A 3ENOA 3CIPA 4BREA 3DXMB 4RTFD 2ASOA 3BEXA 1R59O 2YCHA 4FWNA 1NGDA 2VCPA 5AR0A 2KHOA 3F9MA 2P9PB 3SK3A 3UKUA 2I7NA 3VETA 5BPLA 3O1WA 3WXIA 4CZMA 5AQQA 1NM1A 5AQOA 2GEMA 2P9NA 1XQSC 4RCHA 1HUXA 1NGEA 3C7NB 4PKHA 4H0PA 4JAXA 2Q97A 1BWFO 3WQTA 3D2FB 3GDQA 1U2VB 1JCEA 3L4IA 4BRDA 5AQPA 5FPEA 4MLHA 1TUUA 4FWQA 4C23A 3HBTA 2E8AA 3LL3A 2E2OA 1SZ2A 3R6MA 5EX5A 5JLFA 5F0XA 1HPMA 5JLHA 3ZETB 4BG9A 3LDPA 2QWMA 1YUWA 4EHTA 3ULEA 5LJVA 3WXJA 3HZ6A 1HJOA 1OKJA 3FZKA 2E2QA 3H3NO 3R9PA 4CBUA 3EO3A 4IJNA 4MO5A 3U8XA 5I9EB 3FZFA 4CZFA 2E88A 2FXUA 1NWKA 1HLUA 1BO5O 5EOYA 1EQYA 3FFKB 1JCFA 2V7YA 2DPNA 4EAHD 1HX1A 2QWOA 3CETA 5E84A 3HTVA 4WQ5A 3DJCA 2FSJA 4BRPA 5LY3A 3H1QA 3LDQA 4HWIA 1U6ZA 3LM9A 3FE1A 4FWRA 1BU6O 4Z94A 4GNIA 3DAWA 5AQMA 4FWLA 2ZGZA 2VWBA 1NGCA 2W41A 1RGIA 2QWRA 2WUSA 2AA4A 2V51B 5AQNA 3H46O 4L3QA 1ATNA 2YHXA 3ZEUB 2EWSA 4BGAA 1LCUA 2NZTA 2FLOA 1KXPA 3LDOA 1TUYA 3O6WA 1GLBG 4H5NA 2A41A 2V7ZA 4RWTA 3O8MA 2F9TA 3H1VX 3CHWA 1V4SA 3MN6A 5BN9A 1NGJA 4FWOA 2A40A 2HOEA 4E1JA 4FL9A 5AZIB 2BTFA 5ELZA 5AQFA 5BPNA 4O5FA 4XEIA 1DKGD 1Y64A 2AP1A 1XC3A 4QS7A 3BUZB 4JD2B 3UE5A 4CD3A 3VEWA 1YXQA 4M7YA 1BOTO 1QZ6A 3RSEA 4BRCA 3U4LA 3W0LA 2P9KB 3BF3A 3KHYA 3O08A 4CI6A 4FWKA 2Q31A 3DXKA 3EKSA 4H0YB 1U2VA 5AQTA 3ENHA 3M6GA 4BR9A 1J6ZA 2Q0UA 4CD1A 5BN8A 3L0QA 5EVZA 1T6CA 3I8BA 1KAZA 4BRQA 4WYBA 2P9SA 4FSVA 3AAQA 2D0OA 4BGBA 2QXLA 1NGHA 3FGUA 1IG8A 4WQ4A 5KPTA 4A61A 4DB3A 4BR2A 3EKUA 3GL1A 2I7PA 3ATVA 2GWJA 3UB5A 3VEXA 4BRLA 5BRHA 4CZIA 2IIRA 4JNEA 1LOTB 1JCGA 1TYQA 5AZJA 4BRFA 5BRFA 5BR9A 3A5OC 2F9WA 4IJAA 4MO4A 4M63C 3EL2A 4BRIA 1K8KB 3GE1A 2QWLA 3BP8A 4B9QA 5AQJA 4BRNA 4PKGA 3WEEB 3VPZA 5AQGA 5FPDA 3HM8A 2QW9A 3L6QA 3QBWA 2P9LB 2A42A 3C0BA 3ZX0A 3EN9A 1ZXOA 4ISFA 2NLXA 5AQRA 3GG4A 2QWNA 1DEJA 2E2PA 4BC5A 4BROA 2E1YA 4MLEA 3OHRA 2Q36A 4K25A 4XH5A 2ASPA 2Q2RA 1S3XA 4YDUC 4I6MA 3ID8A 4BR5A 3WT0A 1Z6RA 1HKCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H0XB 4E19A 3U9DA 3DLHA 1RDAA 1SV5A 2VWJA 4EIAA 1R0AA 4JN4A 3D7EO 4K43A 1TGOA 1XC9A 3L2QA 1TKXA 1YVNA 3TSUA 4LF5K 2OCEA 4ISGA 2YI1A 1MWKA 4QS9A 3MCPA 3MXMA 1RBSA 1GLEG 3OYBA 2PYJA 3HO1A 4AM7A 1HNWK 4XIUA 3G25A 4A57A 3LDSA 4AHTA 1QZ5A 3CMEN 4H03B 1LWCA 3J8AA 5AFUA 1V4TA 3T1YK 4BC2A 4OPJA 4B1WB 4KBOA 3UKUB 4OLBA 1G99A 3IRXA 3LWMA 3DLGA 1VQ5N 4BR7A 2HBKA 4NB4A 3EE9A 3M8QA 5I3UA 5JVGL 3IS9A 1N5YA 4CF8A 5CZ1A 2VG5A 3CJ7A 3DXMA 3IDHA 4ICLA 1BIUA 4DSIA 4CHQA 4EHUA 1TL3A 4DV7K 2OZMA 3HP9A 4X66K 3TAGA 1K8KA 5AQVA 1ZBIA 4DKWA 4B1VA 3C7NA 4HUEA 3MCAB 4NCGA 3WEEA 1L3UA 1ESVA 1VSFA 1HKGA 1D9FA 3OYNA 4DUYK 1S1XA 1VSIA 2QI2A 2KKZA 3VA0A 1KAXA 2OA8A 4YOWA 2Q1NA 4KH5A 5AFUH 1WBBA 1BISA 1GOAA 3O9TA 3GBTA 4DTXA 3TU5A 2XO7A 3OBWA 1VQ4N 5KPRA 4CBWA 4CJRA 3CCEN 1XNRK 1GLFO 3CQYA 3RWUA 5M1QA 4BRMA 3ZSWA 4JK8A 5MLCQ 3LAKA 3NGZA 4DV1K 5M1OA 3TI0A 2J4RA 4ILGB 4KHUA 5F1XA 3SNNA 3TSQA 4PY5A 2KLAA 5BRDA 3CI5A 1WOQA 3CXCM 3JAMO 1NJYA 2BDPA 3KZBA 2DTUA 4IEIA 5ADXA 1S1VA 3VF4A 4HUFA 2HHSA 2YHYA 4CK1A 5HRRA 4BC3A 4UY8O 4AHUA 3GOIA 4CEOA 1IKXA 1NOZA 3EZ5A 1ASUA 4IWVA 4DQ8A 3HP6A 1X9SA 4O4GA 2A1RA 3ZEUA 4B1XB 3FZLA 4ILJA 3DXKB 4KI4A 5AQHA 1EETA 1X3NA 4K8XA 2WFBA 3PUFA 1Q9XA 1JKHA 2HMIA 4M45A 4OPAA 5J2PA 2A3ZA 3OYJA 4ELVA 1T44A 1KFDA 2D4WA 5GAGP 1N32K 3NVKA 1GLLO 4JD2A 3DWLA 4QS8A 4I2QA 5AQSA 3RMCA 4Q5VA 1GLAG 3TPQA 2ATQA 5GADP 2H3GX 1Q86O 1KRPA 3VENA 4CJSA 1D9DA 4BRKA 5ADXH 2ZQBA 2HHWA 4LF7K 1DLOA 3JS6A 2CH5A 1WSHA 2O8EA 1KC8O 3TTDA 4WQ5C 4B3SK 3FR0A 5AQKA 3AVJA 5SZTA 3I56N 5KRTA 3S41A 1NK8A 2P5GA 4DHYA 5LJWA 4B9NA 5EXWA 3UIQA 4YY3K 5E41A 4H8KA 1FJGK 3V1OA 2D0AA 1MDUB 2KQ2A 3SPYA 5BREA 2RHKA 3H45C 4O0IA 4CZEA 1T8EA 1DTTA 4DTMA 4B9UA 2FBYA 4DTUA 3MXIA 2RF2A 5KTQA 1C1AA 5GIOA 3EZWA 3HI0A 4CJLA 2CGLA 2RE2A 2YJEA 2DY4A 4J8FA 3TSPA 4XH4A 5AQWA 3QESA 3O4WA 5KGXA 2O8FA 5JICA 4FWMA 3HVTA 2FF3B 4B1UB 3SAHA 4M3RA 2IVNA 1XUPO 4KHYA 3I55N 3QEXA 3J80O 1S72N 4FOIA 3K9JA 2VGMA 2Z1JA 2B6AA 2VG7A 3HOTA 5C25A 1C1CA 3UKRA 3R8EA 4GW6A 3E9PA 3N4PA 4BR0A 4PL7A 1NBWA 1KLMA 1VHXA 2UUAK 1KVBA 1B9FA 4LSLA 3ENOA 3KWIA 3DXMB 4FJJA 1JJ2M 4F8RA 4C8OA 3HYFA 4H4OA 4FM0A 2KFNA 3L3UA 5BPLA 2QTDA 3O1WA 3WXIA 4BE1A 3I0SA 5AQQA 1NM1A 5AQOA 4RCHA 4I2PA 3ZT0A 2HBMA 3V4IA 3MX5A 3C7NB 4YNQA 3FFIA 4JI8K 5FPEA 4BRDA 4JYAK 4MLHA 3SQ1A 1RILA 1VRUA 1WB9A 4AHSA 4A59A 3HVRA 3QEIA 1NOYA 3OBYA 1SZ2A 1RNHA 4FLWA 4BG9A 3LDPA 4LH5A 4HVJA 4YOTA 1OVQA 4DFPA 2KZMA 4KPYA 1YUWA 4X64K 4J2BA 5LJVA 3HZ6A 1HJOA 5JVHL 2Y1IA 1RTIA 5M1FA 3EO3A 3SUOA 3P39A 1VSDA 5I9EB 2E88A 3P31A 2FXUA 1BO5O 3QETA 2DPNA 1HX1A 3QLHA 4BE2A 3SYZA 4WQ5A 3DJCA 2G8FA 3H1QA 3Q7CA 4HWIA 3CCQN 3WNGA 3LM9A 2FC0A 2XY6A 4FWRA 2PYLA 3DAWA 4NCBA 3C95A 2ZGZA 4E89A 2W41A 2HVHA 4HCBA 1ATNA 3QIPA 3ZEUB 3SZ2A 4LF6K 1SS6A 2YNGA 1P90A 3O3FA 4DR2K 2FLOA 4CJKA 3O6WA 3P5JA 4H5NA 4YORA 3OYDA 3AVFA 4ZTJA 1V4SA 1MU2A 4DQSA 2FBVA 4DF8A 3E1YA 4RG8A 2HOEA 3O9QA 5J2MA 3ALYA 4FL9A 3T3FA 2BTFA 2W6KA 5HROA 2WBNA 4C8NA 3RRGA 1DKGD 2Z1GA 4QS7A 3BUZB 4JD2B 3V9SA 4DFKA 4Z4IA 3OYEA 3VEWA 4CHNA 1BOTO 1QZ6A 3CPEA 4CEQA 4WF9L 4DV0K 1DT9A 3KHYA 4CE9A 1TKDA 4CI6A 1NKBA 4H0YB 3AO2A 4B3RK 3K9KA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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