2AP1A

Crystal structure of the putative regulatory protein
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
305
structure length
305
Chain Sequence
NAMYYGFDIGGTKIALGVFDSTRRLQWEKRVPTPHTSYSAFLDAVCELVEEADQRFGVKGSVGIGIPGMPETEDGTLYAANVPAASGKPLRADLSARLDRDVRLDNDANCFALSEAWDDEFTQYPLVMGLILGTGVGGGLVLNGKPITGQSYITGEFGHMRLPVDALTLMGFDFPLRRCGCGQMGCIENYLSGRGFAWLYQHYYDQSLQAPEIIALWEQGDEQAHAHVERYLDLLAVCLGNILTIVDPDLLVIGGGLSNFTAITTQLAERLPRHLLPVARAPRIERARHGDAGGMRGAAFLHLTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the putative regulatory protein
rcsb
molecule keywords putative regulator protein
molecule tags Transferase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 102
structure length 305
sequence length 305
ec nomenclature ec 2.7.1.59: N-acetylglucosamine kinase.
pdb deposition date 2005-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ap1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ap1A02
3DXMA 3MN6A 4PL7A 4IXCA 3D2FA 3CERA 3MK6A 4FWSA 3VGMA 4B1WB 1KAYA 1HKCA 2FSJA 4BRQA 1HUXA 1NLVA 1BG3A 1TYQB 3WEEA 1KAXA 1NMDA 4BG9A 5AQZA 3O1WA 2P9LB 4PKGA 4ISGA 3CIPA 4BC5A 3EKSA 2ASPA 5AQFA 1GLLO 3LM9A 3FLCO 3LDNA 5LY3A 5BN9A 4BRKA 2WUSA 4C23A 1XC3A 4JHDA 4HTLA 3IUCA 2NZTA 2UYTA 2FXUA 3C7NB 5AQTA 3BF1A 3DAWA 3VERA 5AQIA 1NGJA 3HI0A 3MN7A 3EO3A 4BRIA 3O6WA 2QM1A 3QBXA 3S41A 3SMPA 2DPNA 4FWLA 1ZC6A 1NGBA 3QMLA 1EQYA 4HWIA 5AQUA 3R6MA 3GL1A 3ZETA 2PAVA 3WQTA 4FWQA 3CI5A 4B1XB 1ZBSA 2E20A 2KHOA 3GDQA 5JLHA 4ISFA 5AQPA 3KZBA 1YUWA 3A5MC 4GNIA 4BR0A 3SK3A 2P9IB 4DQ8A 1X3MA 1ATSA 2YI1A 4CZFA 3BEXA 5BPLA 3MN9A 3CJCA 3DWLA 3O1BA 1E4GT 2QXLA 5AFUA 3W3DA 5KQDA 1NGHA 3LL3A 4DHYA 3QFPA 4O8KA 2E1ZA 4K25A 5E26A 3VEOA 2Q97A 2V7ZA 3LDPA 5AQJA 3UKUA 2BUPA 5BR9A 3M6GA 1GLDG 3HTVA 3DXKA 4WYBA 5AZIA 1MDUB 1NGFA 1RDWX 4H5RA 4JD2B 2YHXA 2ZGYA 3TPQA 3CJ1A 3EN9A 3LM2A 3H6EA 4FL9A 3EZWA 1BA0A 3HBTA 2Q0UA 3IDHA 4XEIA 4BR4A 2QWLA 4CZGA 1T44A 5BRHA 4CZMA 4BRLA 1C0FA 5KPTA 2P9SB 1WUAA 1V4SA 1T6CA 4M7XA 1ATRA 2GEMA 3SJHA 4EIAA 1JCFA 2A40A 1U6ZA 1RFQA 2AA4A 1E4FT 3BF3A 1H1VA 3HZ6A 4H03B 2D1KA 3VEZA 5AQQA 4A2AA 3QICA 2F9TA 2QW9A 5JICA 3IFRA 2FSNA 3ENHA 4CZIA 4L3QA 4QS8A 3C7NA 4WQ4A 4FWOA 3A0IX 3UB5A 2W41A 3CQYA 5FPDA 3MCPA 3JS6A 2ZF5O 4MLHA 5BN8A 1QZ5A 2GELA 2IVNA 3VEWA 4BRGA 2PBDA 2QWQA 3FZKA 1NGCA 3CETA 4CD1A 2H3GX 4BQLA 3DJCA 4QS9A 2P9IA 1BUPA 3U9DA 4EFHA 1HPMA 2Q0RA 2Q36A 4IZ9A 1XQSC 1X9JA 1MA9B 5AQYA 1QQNA 2E2NA 1HJOA 1NGIA 3H1QA 1R59O 5KPRA 4CZEA 5KPZA 2J4RA 1OKJA 4M63C 4AM6A 2ASOA 1C0GA 4XH1A 2HOEA 4DB3A 2Q31A 5JMVA 4EHUA 4BRAA 5EVZA 1Y64A 3L6QA 3L4IA 1GLBG 1YAGA 5FPNA 3SMSA 4K42A 3CQXA 1HKBA 3EL2A 3H1VX 4CZJA 2FSKA 1YVNA 2P9SA 3VGLA 4ISEA 1D4XA 1JCEA 2W40A 3FZMA 4MLEA 4H0OA 1GLAG 2P9UB 3WXKA 3UE5A 2A5XA 3ZEUA 3GOIA 1KXPA 4CBWA 1MWKA 3ATVA 3O80A 5AR0A 5I9EB 1YXQA 5AQWA 4BRHA 3VF6A 3FZFA 2VYPA 4JAXA 1P8ZA 1SZ2A 3QB0A 1RGIA 1BO5O 3JXUA 5ADXH 3A5NC 3MN5A 3D2EB 2E88A 1KAZA 3LDOA 1BA1A 3SLCA 4BRPA 3VOVA 5F0XA 2E2OA 4FPBA 3WXIA 4EHTA 3ZX3A 3ULEA 3EKUA 5AQRA 3RSEB 3VEYA 3IMXA 2QWRA 5F1XA 3A8YA 2AP1A 2CH5A 2IIRA 4K43A 4H5NA 2QWMA 4F9OA 5LJWA 3J8AA 2P9KB 4PKIA 1T6DA 4JN4A 4FWKA 4IJNA 1TYQA 2Q2RA 2BTFA 1ATNA 5AQHA 2OANA 4LC9B 3VENA 5AQKA 1IG8A 2P9LA 3CJAA 2ZGZA 3VETA 1ZXOA 1K8KB 3VF4A 4A61A 4BRNA 5BPMA 2Q1NA 3FZLA 2CGKA 5AQNA 4I6MB 2P9PB 4CZKA 1BOTO 4DCHA 4BG8A 3M1FA 2D0PA 1Q18A 3U8XA 4CZLA 4JHDB 2ZWHA 4EAHD 3QDKA 4H0TB 3UKRB 5AQLA 3H45C 5AQXA 3O5BA 1GLJO 3G25A 5AQMA 1S3XA 1BU6O 3AY9A 2A42A 4H0VB 2HMPA 5AFUH 3M3ZA 1DGKN 3MMVA 4M7YA 3F9MA 2A6AA 3H3NO 4H5VA 4B1UB 5JLFA 2IVPA 2YHYA 4FPAA 4PL8A 3R8EA 5BREA 1NGAA 3VEVA 4BGAA 5LJVA 3O4WA 2ITMA 3D7EO 2FF3B 4FOIA 3U4LA 1GLEG 4JNEA 1J6ZA 4BROA 4GY2B 1SAZA 1IJJA 5BRFA 3LDLA 2ASMA 2D0OA 4MO5A 4RWTA 1Z6RA 4BVOA 2HF3A 2I7PA 3CJBA 5EX5A 1MWMA 4H5TA 3GE1A 3ZX2A 4A62A 4BR7A 4MO4A 1NM1A 3LDQA 3WUHA 4JD2A 4BGBA 2GTDA 2NLXA 5E84A 2E8AA 4O5FA 5AZJB 4FWRA 4BR5A 1NWKA 3BP8A 4BVPA 2YCHA 2E2QA 2FF6A 1TUYA 4FO0A 1HKGA 4BRCA 4RCHA 4CD3A 3W0LA 3AAPA 4RTFD 4PKHA 2VWBA 2HF4A 4BRMA 1JCGA 1K8KA 3WXLA 3AARA 1QZ6A 4AM7A 4I6MA 2P9PA 1HX1A 2CGJA 1CZAN 3TU5A 1U2VB 4IJAA 4NO7A 2P9NB 3HM8A 4Z94A 3WQUA 3C0BA 3WT0A 1DEJA 4XH4A 5AQGA 4B1VA 4CI6A 5AQOA 3ATUA 2YHWA 3UKRA 5BPNA 1V4TA 1G99A 4A2BA 4IO8A 1LOTB 2YJFA 4BREA 1NGDA 2D4WA 3QBWA 2V51B 3KVGA 4H5WA 4BC4A 2I7NA 3H46O 1NBWA 5EOYA 3ZX0A 2FLOA 2A3ZA 3WXJA 3ID8A 5KQ8A 1QQOA 5FPEA 5FPMA 3U9ZA 3HSCA 4E1JA 3R9PA 4BC3A 4NB4A 2A41A 4H0YB 3CJ7A 4WQ5A 2GWJA 1Z05A 3VGKA 4FSVA 5BRDA 3DXMB 2QWOA 3D2FB 3FZHA 4WQ5C 3I33A 4K41A 4CBUA 4YDUA 5ELZA 3A5OC 1QQMA 2VCPA 4CZHA 1HLUA 4YDUC 4BRDA 2E1YA 3O08A 3WEEB 2F9WA 3QFUA 4Y0WA 3B8AX 4BRFA 5F2RA 4BR2A 3P4IA 5B8HA 3MDQA 5TKYA 3FE1A 1WOQA 1GLCG 3AAQA 5CE3A 5AZJA 3I8BA 1LCUA 2NRHA 2EWSA 4BC2A 4B9QA 2GUPA 2YJEA 4H0XB 5EY4A 2E2PA 1SQKA 3VF2A 3OHRA 4FWNA 1ESVA 2V52B 5EXWA 1NGEA 5AQVA 4J8FA 2P9UA 3ZETB 4FWMA 1DKGD 1S22A 3ZEUB 3VPZA 1U2VA 3GBTA 1TUUA 4B1ZA 4CBXA 3A5LC 2P9NA 3O8MA 4CJ7A 2QWNA 4H0PA 1BWFO 3FFKB 3FR0A 4FWPA 2CGLA 3D2EA 3CHWA 4WQ4C 5AQSA 1BDGA 4XH5A 3VESA 3BUZB 4KBOA 4IWVA 3ENOA 2IVOA 4QS7A 3FGUA 3ULEB 3KHYA 2GWKA 1NGGA 2V7YA 1QHAA 3CJ9A 3L0QA 1X3NA 3RSEA 4B1YB 3UKUB 2QWPA 3VEXA 4BQZA 5ADXA 3H3OB 1XUPO 4FOEA 2CH6A 3DXKB 4BR9A 5AZIB 1GLFO 2P9KA 3GG4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QVFM 3D2FA 2QA4N 1J5EK 3G4SN 2NRWA 4DV7K 1KAYA 2A1RA 1S6PA 3AVIA 4KB1A 3U3YA 1KAXA 4JKEA 1KRPA 5GAGP 2XY5A 1HJRA 2P9LB 4PKGA 4B9VA 2QKBA 5C12A 5AQFA 1RTJA 3F9KA 3LM9A 5JVGL 4JI0K 2WUSA 4JKGB 5IWAK 2WFBA 4HTLA 4CFDA 3IUCA 2FXUA 5FLXO 4B9LA 4LF7K 1YHQN 2F4VK 3O6WA 2QM1A 3QBXA 3SMPA 4AHTA 4DS4A 1YITN 4AILC 4HWIA 3R6MA 3ASMA 3OA9A 1WB9A 2G8WA 4K8XA 2OTLN 4JI8K 2OTJN 4OKJA 4LH4A 3ZETA 2VWJA 4B1XB 1ZBSA 2YNHA 2KHOA 3PX0A 4J2AA 4LFCK 2I5JA 5JLHA 4ISFA 1NK6A 3KZBA 1WNSA 4GNIA 4RW4A 3OYGA 1KTQA 4BR0A 2F7TA 2X78A 2OPRA 1ATSA 5BPLA 2HHTA 4C8KA 3NCIA 2FBYA 4DV6K 1JLBA 3G0ZA 4LF4K 1E4GT 3P39A 1FXXA 1KVAA 2QXLA 5AFUA 4GVEA 1YTAA 4AF1A 4FJJA 4H4OA 4CHQA 4O8UA 5E26A 1DT9A 5AQJA 2X6SA 3Q7BA 4JEPA 3M6GA 1GLDG 4YFUA 3DXKA 3OVNA 4B9MA 3HOSA 2KQ2A 2Z1GA 1A5VA 3HBTA 5BRHA 4K0KK 3T3FA 1WUAA 1V4SA 3SBGA 5KI6A 1ATRA 4MDBA 3SJHA 2ATQA 1N33K 1U6ZA 1NKBA 1VSIA 2AA4A 1W2BM 2D1KA 2P1JA 4NLCA 3IFRA 3OYNA 2JGUA 3VQ4A 1NJZA 1ITGA 2VG6A 3C7NA 3BZCA 2GUIA 4NXNK 3V4IA 3CCSN 3MCPA 4FLYA 2OYQA 1OVQA 3AO1A 1QZ5A 3MCAB 1EWRA 3VEWA 4CEFA 5HL7L 3P5JA 1VSDA 4DTMA 1WSGA 3T19A 4DTUA 3NF6A 5H1SQ 4CD1A 4BWJA 2H3GX 2IC3A 5SWMA 4J2DA 1BI4B 3HM9A 3PSFA 2P9IA 3TTFA 3VQCA 2Q36A 2QEXN 4IZ9A 1XQSC 4ID5A 1EKEA 3ALYA 3VQ8A 5AQYA 1ILYA 1QQNA 5HP1A 4OPHA 3LP2A 3PIOL 5KPZA 5CYMA 3QEXA 2ASOA 4CEOA 3NGZA 3VQPA 4CHYA 4DV4K 4DB3A 2Q31A 1VQ9N 3V1OA 5EVZA 3CYMA 3DLEA 1NOYA 3K59A 4IEIA 5FPNA 4Q5VA 4K42A 3CQXA 3EL2A 4B8CA 1ZBIA 1HNVA 1YJNN 3TAFA 3AVNA 3DI6A 4RW7A 3TTDA 2E6MA 3LP0A 3IAYA 3HPOA 4Q0BA 2F8SA 3LAKA 4JK8A 2P9UB 5CHIA 1NJIO 3GOIA 1KXPA 1W97L 1BHLA 3NGYA 3ATVA 4C1NK 5AR0A 3V9ZA 2UXBK 2VYPA 3CCQN 4B9SA 2X6NA 2QK9A 3OY9A 1SZ2A 1VSMA 3QB0A 4KTWA 4DV0K 4DR1K 3A5NC 3PY8A 5JS1A 4BRPA 4LSNA 4FPBA 1W7AA 3O9RA 3WXIA 3OYLA 4DU3A 4PY5A 3SUQA 3QEIA 1SS6A 3RMBA 4FJ5A 4CJ4A 3RSEB 3IRXA 3SBTA 5HRNA 2OPSA 3A8YA 2AP1A 4Y1CA 2JWKA 4CHOA 5LJWA 3J8AA 3G10A 3ITHA 1BQNA 1BL3A 4M3ZA 3EY1A 4J2BA 4DQQA 5C25A 4KFBA 3THYA 4F8RA 1TYQA 4DR4K 2BTFA 1ATNA 2O8CA 2OANA 4LC9B 2IGIA 1NMNA 1RDUA 3CJAA 4LD0A 3VETA 3VF4A 1VQ7N 4OKEA 2B4JA 2CGKA 5AQNA 2P9PB 4YNQA 4DCHA 4BG8A 3D0PA 4NCGA 4CZLA 4EP5A 4JHDB 1UWBA 1OVYA 3MXJA 3UKRB 4DSEA 2PYLA 2KZMA 3VQ7A 1S3XA 1ZBUA 1BU6O 3NFAA 4KI6A 4H0VB 5GAHP 4B3OA 1TAUA 3HK2A 1UA1A 4CJ3A 4FPAA 3R8EA 5LJVA 3PO5A 4BGAA 3TAPA 4M45A 1JLGA 1J6ZA 1SAZA 4CHNA 3U6FA 4DS5A 1QQCA 3L2WA 3HP9A 1J5OA 4QOZB 4H5TA 3K0SA 3ZX2A 2UU9K 3J7YP 4BR7A 5BR8K 1JLCA 4F2RA 2O4IA 1QE1A 3LWLA 4ELTA 2W6LA 2DFEA 1O13A 4JD2A 2FC0A 2GV9A 1VSJA 2E8AA 5AZJB 4FWRA 3O4NA 3L2RA 1WSEA 4GV3A 4LH5A 4ELUA 1ZBHA 3KK2A 2FF6A 3WNEA 1TUYA 3AVKA 1HKGA 4H8KA 4BRCA 2WONA 3G71N 4FJIA 3W0LA 2NRZA 3OJUA 4BRMA 1JCGA 4LF6K 4JRPA 4FJHA 1N6QA 3B6OA 1HX1A 1CZAN 3NVKA 4F3TA 1ZBFA 3AV9A 3KLIA 4Z94A 1Q86O 3WT0A 5AQGA 4B1VA 4CI6A 2X74A 4NLBA 4CJFA 4W5QA 2YJFA 4BREA 2D4WA 3O3FA 3QBWA 1VQ4N 3IKMA 1NBWA 3DMJA 1C6VA 1QQOA 5FPMA 1S9EA 3HSCA 4E1JA 3SQ0A 3R9PA 2VQEK 3SV3A 3KD1E 4CEQA 4YOWA 4H0YB 3CJ7A 2RN2A 4JYAK 3TSPA 4B8AB 4FSVA 4JKBA 3DXMB 4J2EA 3FZHA 4WQ5C 4CEBA 2Z1HA 3A5OC 2UUBK 1QQMA 4Z4EA 1TAQA 1KFSA 1X9SA 1N34K 3O08A 4JKHA 4R79A 4Y0WA 4L8RB 2HVHA 3N4QA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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