2CGJA

Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in complex with l-fructose and adp.
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
479
structure length
479
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure and Reaction Mechanism of L-Rhamnulose Kinase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords L-RHAMNULOSE KINASE
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
total genus 167
structure length 479
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2006-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cgjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cgjA02
4FWRA 4B9QA 1ATRA 2QWPA 3WQUA 1GLLO 4FPAA 3HTVA 4BRPA 3MN6A 3R6MA 2V7YA 3ENHA 4LC9B 4FL9A 4CZLA 1NGGA 5BRFA 4AM7A 2DPNA 3HSCA 3RSEB 4BC4A 4Z94A 3L6QA 2FF3B 4CZHA 1S22A 4CZKA 1JCEA 1XUPO 3QB0A 3AAQA 4FSVA 1J6ZA 1BOTO 5ADXH 4BROA 4FOIA 3B8AX 2D0OA 3QFPA 5F2RA 4FWOA 1NWKA 2P9IA 1QHAA 3BP8A 2YJFA 2I7PA 3R8EA 1X3MA 2HF4A 1U2VB 5AQWA 2P9LA 3U9DA 1HPMA 2E8AA 3GG4A 3HBTA 1DGKN 4BRQA 3VEZA 3D2EA 1Q18A 3VF2A 3CHWA 1NGEA 4HTLA 4PKGA 2FLOA 3G25A 2YCHA 4BRKA 5JLHA 4B1ZA 3BF1A 4CBXA 1U6ZA 5AQRA 2ZGYA 1YUWA 4MLHA 2IVPA 2QM1A 2P9NA 5AQJA 4CZIA 3CIPA 4Y0WA 4FWSA 2E1ZA 3IFRA 4JN4A 2A42A 4QS7A 5AQHA 4BQLA 1IJJA 1X9JA 3VEWA 4H0PA 4JHDB 1BA0A 1C0GA 2E2OA 4BGBA 4BRHA 1Z6RA 3AARA 4IWVA 2A5XA 4XH5A 5AQZA 3WXJA 4O8KA 4H5VA 4IJAA 1HUXA 4H0OA 3MN7A 4A62A 2YHXA 5AQTA 2OANA 4A2BA 4PL8A 4QS8A 4EHUA 4DCHA 1KAXA 4H5TA 3GOIA 2QW9A 1JCGA 3KHYA 4DQ8A 1NGAA 3MN5A 4BRCA 5AZIB 3EO3A 2W41A 3H45C 3QDKA 4H0YB 2E1YA 1CZAN 1QQNA 2AP1A 3FZMA 3VERA 1WOQA 2Q97A 4BR7A 3H46O 3CETA 4MO4A 1HKCA 1C0FA 4C23A 3FFKB 3QMLA 4CZGA 2PBDA 3UKRA 3DWLA 5EX5A 1ESVA 3WXLA 1T6DA 1XQSC 2NZTA 2J4RA 3JXUA 2BUPA 3VESA 3U8XA 3UE5A 1Z05A 2BTFA 5BRDA 1IG8A 1HKGA 2A3ZA 4K42A 3CERA 4I6MB 5LJWA 4M7XA 3DXMB 2HOEA 3TU5A 4K25A 3C0BA 5FPEA 4FO0A 2ZWHA 4FWKA 4BRMA 3BF3A 3QFUA 5AQVA 4RCHA 3H3NO 1YAGA 5KQDA 1NGBA 2YHWA 5AQOA 3ULEB 5AQXA 1DEJA 3ZX0A 2QXLA 3VEXA 2F9TA 1E4FT 2WUSA 3VGLA 4JNEA 1BG3A 2GWJA 2GUPA 4IZ9A 1KAYA 4H5NA 4E1JA 3ENOA 4FWMA 1NLVA 4H0VB 4A61A 4BQZA 4JAXA 3EKSA 1P8ZA 4ISFA 1HKBA 4CI6A 5JMVA 1BU6O 4GY2B 3IMXA 1MWKA 5B8HA 3ZEUB 1KAZA 5AQUA 2VYPA 2YHYA 5AFUH 4EHTA 2GWKA 1NM1A 2P9UB 4H03B 3W3DA 5AQGA 2AA4A 3A5LC 3TPQA 3JS6A 4ISGA 4EFHA 5BPLA 4JHDA 3C7NB 1MWMA 5AZJA 2IIRA 3SLCA 1NGDA 3LDOA 1K8KB 3D2FB 2E2NA 3IDHA 4BVPA 5BPMA 2V7ZA 5FPDA 2D1KA 1MA9B 3IUCA 5I9EB 3O4WA 1T44A 1OKJA 4ISEA 5EXWA 2V51B 3J8AA 4WQ5A 2FF6A 1HJOA 3SK3A 2P9KA 3MMVA 1V4SA 1GLDG 1RGIA 1YXQA 2FSKA 3ID8A 4WYBA 4B1YB 2ASMA 3ZETB 4JD2B 2ITMA 4YDUA 4BRLA 4CD1A 1BWFO 2CH5A 1WUAA 2I7NA 5AZIA 2P9PB 2UYTA 3O6WA 4XH1A 4QS9A 1HX1A 5ELZA 2VCPA 3BUZB 4BRGA 4WQ4C 3DAWA 3MCPA 5AQKA 2E2PA 4M7YA 3LM9A 1BO5O 3H3OB 1SAZA 3FZLA 5AFUA 2Q0RA 3HM8A 1QQOA 3EN9A 4DB3A 5ADXA 2ZGZA 2ZF5O 3FLCO 2W40A 3O1WA 3EL2A 3GE1A 5LY3A 1EQYA 4NB4A 2H3GX 3OHRA 4BR4A 2GTDA 2Q0UA 2P9IB 5BN8A 2NLXA 4PL7A 4FPBA 2P9LB 2QWQA 3CJAA 3UKUA 4BGAA 1ATSA 3DXMA 2D4WA 5KPZA 4B1WB 3VEOA 5FPMA 1LCUA 3D2EB 3ZX3A 3QBXA 4BRDA 4IXCA 4MLEA 2PAVA 2KHOA 3ULEA 3VGKA 3A5MC 3VGMA 1ZBSA 1QZ5A 1YVNA 3U9ZA 3DXKB 1QQMA 1ATNA 1MDUB 3CQXA 3LDLA 4BR9A 3FE1A 2FXUA 1G99A 2P9NB 4AM6A 4B1XB 5AQSA 4RWTA 1TUUA 3A5OC 1H1VA 3MK6A 1RFQA 4WQ5C 3VENA 3A8YA 3FZHA 3RSEA 2A41A 2HMPA 2ASOA 5LJVA 3ZEUA 5AQQA 5KPTA 1RDWX 1S3XA 4BRNA 4YDUC 1V4TA 1GLFO 4H5WA 3L0QA 4WQ4A 4XH4A 3H1QA 3R9PA 1T6CA 3LL3A 1TYQB 5AR0A 3HZ6A 2EWSA 3D7EO 3KZBA 4PKHA 3M1FA 3VEYA 5EY4A 1GLJO 3WT0A 2Q1NA 4H5RA 5E26A 1U2VA 3L4IA 3LDPA 4A2AA 2QWRA 1K8KA 2CGLA 3D2FA 2IVOA 3LDQA 3WEEB 4BG8A 3AAPA 3ATUA 4IJNA 3O5BA 4CZMA 3CJ7A 4F9OA 2A40A 2P9SB 3UKRB 5EVZA 3KVGA 3U4LA 3O1BA 4CZFA 2NRHA 4JD2A 4K43A 4BC5A 5BN9A 3O8MA 3H1VX 1XC3A 2P9PA 1NGFA 4CBUA 4DHYA 4BRIA 3I8BA 5AQMA 4FOEA 3P4IA 3W0LA 4CZJA 5JLFA 5AQLA 2V52B 5AQIA 4B1UB 3A5NC 4NO7A 3FZKA 1BUPA 3VEVA 3A0IX 2E20A 4CJ7A 3EKUA 1BDGA 3I33A 3S41A 3F9MA 2F9WA 5KPRA 4FWLA 3VF4A 3CJCA 4CZEA 2QWMA 3DJCA 3GBTA 5FPNA 2GEMA 1BA1A 3AY9A 1TUYA 5BREA 1X3NA 4RTFD 4FWPA 2Q31A 1GLCG 1JCFA 3FZFA 2IVNA 1DKGD 4BR0A 3H6EA 2ASPA 2CGJA 3GDQA 2E88A 4L3QA 2GELA 2QWLA 2VWBA 4H0TB 3MN9A 3DXKA 4PKIA 1SZ2A 5AQYA 3SMPA 4HWIA 4M63C 3CJ9A 3M6GA 1LOTB 1QZ6A 3LM2A 1NGIA 1R59O 1KXPA 5EOYA 3VETA 5BR9A 4I6MA 3CQYA 1GLEG 1NMDA 3WUHA 4XEIA 5BRHA 3SJHA 5AZJB 4BC3A 3VPZA 3GL1A 5AQNA 4GNIA 5F0XA 4MO5A 5CE3A 3M3ZA 1D4XA 4H0XB 3FR0A 4BREA 1TYQA 3WQTA 3SMSA 5AQPA 1Y64A 1NBWA 2P9KB 1NGJA 5E84A 4CBWA 3WXKA 3ZX2A 1NGCA 2D0PA 3EZWA 1ZC6A 4BC2A 4BVOA 5KQ8A 4BRFA 1ZXOA 4BR5A 3WEEA 3CJ1A 3VF6A 2QWOA 4J8FA 3WXIA 4B1VA 3O08A 1NGHA 2FSJA 3O80A 5JICA 2P9SA 3LDNA 4BG9A 5F1XA 4K41A 2P9UA 2CH6A 4O5FA 5AQFA 4BRAA 4IO8A 3BEXA 2A6AA 3VOVA 2Q36A 4FWQA 4BR2A 1GLAG 1HLUA 1GLBG 4EIAA 3C7NA 1SQKA 2YJEA 3UKUB 4KBOA 4EAHD 3HI0A 3CJBA 3QICA 2FSNA 3MDQA 3CI5A 2QWNA 4FWNA 5BPNA 5TKYA 2YI1A 3UB5A 2Q2RA 4CD3A 3ATVA 2CGKA 3QBWA 3ZETA 3FGUA 2HF3A 2E2QA 1E4GT
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FWRA 1BQMA 4FPAA 4Z4HA 3TTFA 4CJEA 1REVA 4CCHA 5M1FA 4B9SA 2DPNA 3OYFA 3L6QA 3O3HA 2G8VA 4CJPA 1ZBLA 1JCEA 1XUPO 3P5JA 3OTOK 3RR8A 1BOTO 4BROA 4YOXA 2B4JA 5F2RA 4FWOA 3C94A 2QTDA 3BP8A 2I7PA 3MXMA 4FM0A 5AQWA 4O55A 3L3UA 3V9XA 3D2EA 3C6TA 1YVUA 1OH7A 3VF2A 3V81A 3AVGA 5M1QA 4JI0K 2HHVA 3AVNA 3G25A 2YCHA 4BRKA 2VWJA 4RW6A 4NLBA 4B1ZA 2ITGA 4CBXA 4CJWA 1WB9A 2G8FA 1U6ZA 5AQRA 2ZGYA 2DFFA 2IVPA 2P9NA 5GADP 5AQJA 3CIPA 3IFRA 4CF8A 4AHUA 3QEWA 2A42A 4QS7A 3VN5A 4BQLA 1QE1A 1IJJA 1BA0A 2E2OA 4BGBA 2QK9A 4AHVA 4BDYA 4DR7K 4KREA 5AQZA 3HM9A 4KHQA 4KO0A 1JXBA 4H5VA 4IJAA 2O8BA 3AO5A 4AHCA 3V1OA 1T03A 2OANA 4PHTX 2X78A 1VSDA 4CFDA 2RF2A 3CCLN 4LF5K 3KHYA 4DQ8A 4W5NA 1R0AA 3EO3A 3QDKA 2P1JA 4IEEA 1VQ9N 1WOQA 2YNIA 1I39A 4BR7A 1QSSA 4DSJA 2GX9A 1NK8A 4C23A 5HOOA 3FFKB 4A5BA 3CCMN 4X62K 3J7ZO 1FKOA 4LY7A 4CEDA 4F2RA 2YKMA 3CCUN 3HL8A 4CFAA 2NNWA 3ID6A 4DG1A 2PY5A 4J2DA 2OZMA 3U8XA 3L2WA 3P31A 3H08A 1ILYA 1Z05A 1D8YA 2HNDA 5BRDA 4N5SA 4K42A 5LJWA 3PLAA 4M7XA 3AVIA 4DQRA 2WFBA 2HOEA 3DXMB 3SBGA 4K25A 1G15A 4ILJA 3EE9A 1C6VA 3THXA 5H1SQ 2F4VK 1EXQA 1NGBA 5AQXA 4FLZA 2QXLA 2DY4A 4M3RA 3VQQA 4G1QA 4B08A 4JNEA 1IKXA 1WN7A 2UXDK 2GWJA 4QOZB 3THWB 3CPWM 4Z4IA 2QKKA 2HSTA 2VG6A 2FBXA 4BQZA 4ISFA 1BU6O 1WAJA 3IMXA 1JJ2M 2YHYA 5AFUH 3K5NA 1NM1A 3QIPA 2BDPA 3W3DA 3DLRA 5AQGA 4DTXA 2HNYA 3A5LC 3NE6A 3TPQA 3JS6A 1A5WA 4O4GA 4IG0A 3LP3A 4FM1A 1N33K 2UUAK 1K8KB 4Q5VA 1NKCA 1X1PA 1RDCA 1S9GA 2D1KA 1MA9B 3IUCA 3SJJA 1XMOK 5I9EB 2QEXN 3AO4A 1RCHA 2FF6A 1HJOA 1VQLN 5JS1A 1GLDG 1RGIA 4JD2B 5M1OA 2CH5A 1WUAA 1HR0K 4JKCA 3CYMA 4DSEA 3DAWA 3MCPA 3ZLJA 2E2PA 3K2PA 4CHOA 4M7YA 1BO5O 3OYAA 4WCEL 3V9UA 2GUIA 2F8TA 5AFUA 2Q0RA 1JL2A 3RR7A 4N41A 2WOMA 4DB3A 5ADXA 4PQUA 2IS3A 3FLCO 4AHSA 3G10A 5LY3A 2H3GX 3AA2A 3OHRA 1J9AA 3OVNA 4PL7A 4EP4A 3PY8A 4I7FA 3KKRA 4DU3A 3ZX3A 5I3UA 4OLAA 2HHHK 4MLEA 3ULEA 3A5MC 1RT5A 1C1CA 1ZBSA 2O8EA 1JLGA 1QZ5A 2WBNA 1YVNA 5HL7L 3V4IA 4CVNE 1MDUB 4BR9A 4BDPA 1Z25A 4RW8A 3RRGA 4KHPK 3O9TA 4WFNL 1H1VA 3VENA 4KFBA 3VQBA 3A8YA 3TAQA 3FZHA 3L8BA 2HMPA 3K57A 1ASUA 4KTZA 2O8CB 1S3XA 4YDUC 1V4TA 4H5WA 3L0QA 1JLFA 4M3XA 1NK6A 2P5GA 5SWMA 3KJVA 1NJYA 3D7EO 3VEYA 3IAYA 4DF8A 3LDPA 4IDHA 4CF2A 4CECA 4YORA 4KTWA 1BCMA 3OYBA 3TTDA 3PX6A 3THVA 3LDQA 4CHZA 4B9LA 4J2BA 5FDLA 3F5TA 1W7AA 4B8AB 4CZMA 2WC9A 4C1NK 3UKRB 1EKEA 2VGNA 2NRHA 3AA3A 5HROA 3TABA 1XC3A 4PA1A 4CF0A 1NK0A 4OO1J 4OPAA 4DHYA 1SUQA 4BRIA 3HPHA 5C2DA 4MDBA 3W0LA 3AA5X 5JLFA 5AQIA 1T8EA 3MECA 4FJIA 4B1UB 4LD0A 5HBMA 3NCIA 1TAUA 3VEVA 3DI6A 3RVCA 3THYA 4OX9K 2BGGA 3QINA 4GMJB 5KPRA 3PX0A 3L4QA 5FPNA 4CEBA 1JCFA 4AF1A 1VSEA 3NVKA 1XMQK 3T7ZA 1FJGK 3VTHA 2GELA 4EZ6A 3SUQA 4CGDA 3DXKA 5C24A 4PKIA 1SZ2A 4IKFA 1QTMA 1JL1A 4FJLA 3SMPA 3MEGA 2HHSA 2NRZA 4CERA 3K9JA 3HK2A 4FZXC 1RDAA 4CJFA 3JAMO 3WUHA 5BRHA 4X65K 3SJHA 3TAMA 1IKVA 5SZTA 1K6YA 1TKTA 1KVBA 5LL6Z 4CIEA 2HBLA 5AQPA 4E1NA 1Y64A 1NBWA 3KD5E 2OTJN 2OPPA 4OPKA 3M5RA 4OLBA 3THWA 3HRGA 4L8RB 1VK0A 3MAQA 4BRFA 1ZXOA 3AVKA 4JI5K 3CJ1A 1O1WA 3MXJA 3OYGA 3CCJN 4B1VA 3DRPA 4Q0BA 3G71N 5JICA 4B3TK 3NF7A 4BG9A 4MFBA 3C95A 1SL2A 1BIZA 2O8BB 1RDBA 3RWUA 3V9WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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