2CH5A

Crystal structure of human n-acetylglucosamine kinase in complex with n-acetylglucosamine
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
347
structure length
344
Chain Sequence
PQFMAAIYGGVEGGGTRSEVLLVSEDGKILAEADGLSTNHWLIGTDKCVERINEMVNRAKRKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGDQEDAGRILIEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGVVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFHYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHIVAVLPEIDPVLFQGKIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFLLALTQGRAQNFFSSFTLMKLRHSSALGGASLGARHIGHLLPMDYSANAIAFYSYTFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of Human N-Acetylglucosamine Kinase in Two Complexes with N-Acetylglucosamine and with Adp/Glucose: Insights Into Substrate Specificity and Regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NAGK PROTEIN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 113
structure length 344
sequence length 347
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.59: N-acetylglucosamine kinase.
pdb deposition date 2006-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ch5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ch5A02
4BRLA 4ISFA 3VEOA 5CE3A 2HMPA 2QWLA 3O08A 2IIRA 4BRGA 1YVNA 1DGKN 3FLCO 1NGEA 2V52B 2F9TA 2A6AA 4DQ8A 4Y0WA 2YHWA 4A2AA 4PKHA 1TYQB 2QWPA 4FWQA 5AQOA 5AQPA 4JNEA 5AQFA 4PL8A 2GUPA 2YJFA 1SAZA 4ISGA 2P9NA 3MK6A 3ZX2A 2QWNA 3UKUB 4A61A 4EHTA 1MDUB 2FF6A 1NGBA 4BR9A 5F2RA 2Q97A 2FSKA 3VF4A 1BDGA 3ATUA 4DCHA 2FSNA 1V4TA 4BRPA 1BG3A 5AQKA 2D0PA 3ID8A 2E2PA 1V4SA 5AQVA 3I33A 5EXWA 4H5TA 4CBUA 5ADXA 3BEXA 4DHYA 2ZWHA 3H1QA 5AQSA 1HLUA 3RSEB 1K8KA 4QS8A 2CH6A 1QHAA 3GL1A 4CZEA 5E26A 1U6ZA 4B1WB 3W3DA 4BQZA 2P9UB 3IFRA 3MN9A 3L0QA 4BR2A 2HF4A 2QXLA 2YJEA 4H5NA 3VENA 3FZFA 4HWIA 2I7NA 4WQ4A 3SJHA 3GOIA 3U9ZA 1XUPO 1NGDA 1LOTB 3H3NO 2KHOA 4IZ9A 2YHXA 1GLCG 5KQ8A 5BPLA 4CZMA 1KXPA 1NBWA 4QS7A 1BU6O 3B8AX 3DXMA 4QS9A 3ZETA 4WQ5C 4BRCA 5EX5A 4FL9A 4K41A 3HTVA 3J8AA 3R8EA 4BR4A 4FWSA 1RDWX 2YCHA 4DB3A 4PL7A 4B1UB 4JHDB 3S41A 1GLEG 2V7YA 4BGAA 4XH4A 3A5OC 4BR5A 4FWMA 3O80A 5AQLA 1C0FA 4BG9A 4XH5A 4BRDA 4YDUA 2ZF5O 1ATRA 1XC3A 1KAYA 3WXIA 2PBDA 2P9PA 5AQQA 3VPZA 3FR0A 3VOVA 1BA1A 4H5WA 1JCFA 1HJOA 2P9IB 4ISEA 1Z05A 4GNIA 4IXCA 3ATVA 4EFHA 2J4RA 4BREA 5AQMA 4IJNA 2Q0UA 3WXKA 3FE1A 2V51B 2E1ZA 2OANA 3CJ1A 3GBTA 3VGKA 4FPBA 3C7NB 5AQUA 4B1VA 5AQXA 4BG8A 4CI6A 3MMVA 4NB4A 2YI1A 1BUPA 3LDNA 1ZC6A 3CQYA 1X3MA 4FO0A 1CZAN 1U2VB 1ZBSA 2E2QA 2NLXA 2P9SA 3UKRB 1IG8A 5BRDA 3CIPA 1WUAA 2BUPA 2W41A 5KPRA 4MLHA 3DWLA 3A5MC 5AQZA 4FWRA 4JAXA 3QFPA 5KPTA 2P9LB 3KZBA 3D7EO 4CZIA 2VCPA 5TKYA 1NM1A 1S22A 3D2FA 2H3GX 5AQRA 5AQGA 5AZJA 2VYPA 1X3NA 4B1ZA 5FPDA 5F1XA 3FZHA 3CHWA 3R9PA 4CBXA 3JS6A 3ZX0A 3CERA 1MWMA 3HZ6A 3DJCA 1ZXOA 1G99A 1LCUA 1T6CA 2GELA 3LM9A 3M3ZA 2IVOA 3O8MA 2P9NB 3DAWA 1ESVA 3ZEUA 3H45C 3QICA 3VF6A 1T44A 3EKUA 1KAXA 4H0TB 3H1VX 5BR9A 2FLOA 3EKSA 1NGIA 3W0LA 5JICA 1D4XA 4JN4A 5AQJA 3MN7A 1Q18A 2BTFA 3MCPA 5AR0A 3LDPA 4A62A 4B9QA 4BRQA 4CZKA 1QZ6A 3WXLA 3O5BA 2E20A 1X9JA 1HX1A 4K43A 1T6DA 1MA9B 4HTLA 4BRFA 1K8KB 4BQLA 3EO3A 3LM2A 3MN5A 3D2EA 3A8YA 3UB5A 5AFUH 3UKUA 4FOEA 2AA4A 1Y64A 4WQ5A 4FWLA 2VWBA 3GG4A 1NGAA 4IO8A 3TU5A 3CJAA 4BC4A 3BF1A 5JLHA 5BPNA 4IWVA 3QFUA 2WUSA 3H6EA 3VEXA 2QM1A 3U8XA 3WT0A 2A40A 2CGJA 3VEWA 1E4FT 3A5LC 5F0XA 2UYTA 3DXMB 2ASPA 4BVPA 3KVGA 4BGBA 1QQNA 1Z6RA 3LDLA 3GE1A 1SQKA 2NRHA 3AAPA 1H1VA 1P8ZA 4H0YB 2EWSA 1TUUA 2D1KA 3M1FA 2Q1NA 3QBWA 3EL2A 3WUHA 2I7PA 3CJCA 3O6WA 2ASMA 3KHYA 4H0PA 2P9PB 3GDQA 1KAZA 2DPNA 3HI0A 5FPMA 5AQIA 4BC5A 3JXUA 3SLCA 1IJJA 3QBXA 4FSVA 5AFUA 3FGUA 4BC2A 3AAQA 1BA0A 3G25A 4H5VA 4RCHA 4BRKA 1TUYA 1RFQA 2FF3B 5BREA 5BN8A 3O4WA 5LJVA 3FFKB 3FZKA 1HKBA 2QWOA 1BO5O 3SMPA 4EAHD 5ELZA 1OKJA 3MN6A 2P9KA 3WXJA 1HUXA 4BR7A 3WQUA 4H0VB 1QQOA 3DXKB 3LDOA 4FWPA 2NZTA 5AQYA 3VETA 3WEEA 2CH5A 4FPAA 3ZX3A 5I9EB 2QW9A 2PAVA 2Q36A 2P9IA 3EN9A 4MLEA 3L6QA 4C23A 3QDKA 5AQHA 5B8HA 5AZIA 4XH1A 5KQDA 4CZHA 5BRFA 3U4LA 5LY3A 3ENHA 5AZJB 3P4IA 3ULEA 2E2NA 3CI5A 3VGLA 4CBWA 4A2BA 4BROA 3MDQA 1GLLO 3CETA 4H0XB 4BRIA 5ADXH 1U2VA 1R59O 3TPQA 2CGKA 3UKRA 3QB0A 4I6MA 4CZFA 2E8AA 3ZEUB 4JD2A 5LJWA 1ATNA 2QWRA 1YAGA 3F9MA 2E2OA 2HF3A 4M7XA 3R6MA 2Q0RA 4B1XB 5BN9A 4BVOA 5BPMA 4CZGA 1EQYA 1DKGD 2CGLA 3UE5A 4CZJA 4AM6A 1GLDG 4O5FA 4LC9B 1XQSC 3LDQA 1MWKA 2QWMA 4O8KA 5AQWA 4EHUA 1TYQA 1YXQA 2Q2RA 3C0BA 1BWFO 3CJBA 3D2EB 4B1YB 4H03B 5AQNA 4FWNA 1WOQA 1QZ5A 2ZGYA 3IMXA 1NGGA 4J8FA 2V7ZA 1E4GT 2FXUA 2ZGZA 2ITMA 3U9DA 4AM7A 5JMVA 4Z94A 3VGMA 1GLBG 1BOTO 3FZLA 2E1YA 3I8BA 4PKIA 3HM8A 1RGIA 3M6GA 2D4WA 3A0IX 4F9OA 3FZMA 1DEJA 3O1BA 4WYBA 3VESA 1HPMA 4H0OA 2ASOA 3BP8A 2FSJA 3SMSA 3RSEA 4M63C 3ZETB 1GLAG 4M7YA 4EIAA 2E88A 4BRMA 4BRNA 3H46O 1NWKA 5AQTA 4CD1A 2P9UA 1HKGA 4RWTA 1GLFO 3WQTA 1ATSA 4K25A 3CJ9A 3H3OB 5E84A 1JCGA 4FWKA 5KPZA 3CJ7A 4L3QA 1NGFA 1YUWA 2A3ZA 4RTFD 3VEVA 1JCEA 4CZLA 3EZWA 3AY9A 1J6ZA 2A42A 1S3XA 3OHRA 3IUCA 4NO7A 1QQMA 3BUZB 1SZ2A 1C0GA 4IJAA 2GEMA 3SK3A 2GWKA 4GY2B 4K42A 4MO5A 4WQ4C 2GTDA 3O1WA 5BRHA 2HOEA 4JHDA 4MO4A 1HKCA 3HSCA 2P9KB 4BC3A 4CJ7A 2F9WA 3QMLA 2QWQA 1NLVA 2GWJA 5EOYA 4H5RA 2P9SB 3WEEB 4BRAA 2YHYA 4KBOA 1NGHA 5EY4A 3CQXA 4XEIA 5AZIB 3A5NC 2IVNA 3BF3A 5FPNA 2Q31A 5FPEA 5EVZA 3D2FB 4CD3A 3HBTA 3LL3A 3ULEB 5JLFA 1NGJA 4FOIA 4BR0A 3C7NA 4YDUC 1NGCA 2W40A 1GLJO 2AP1A 4FWOA 2A41A 3VERA 3L4IA 3DXKA 4PKGA 4I6MB 3VEZA 1NMDA 4JD2B 3VEYA 2A5XA 4E1JA 3IDHA 4BRHA 3VF2A 2IVPA 3AARA 2P9LA 3ENOA 2D0OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KTQA 4BRLA 4LSLA 4BRGA 2IIRA 3HT3A 1DGKN 4JKCA 1UA1A 1LW2A 3THXB 3OY9A 4DQ8A 1TYQB 4FWQA 5AQOA 4DFJA 4JNEA 3TAGA 1RDDA 1RTHA 2R7YA 2GUPA 2YJFA 1Z26A 1SAZA 1TVRA 1KD1O 1EX4A 4FJGA 4KH4A 1RDAA 4K0KK 1YHQN 3ZX2A 2QWNA 4ELTA 4A61A 2WC9A 1MDUB 4KV8A 3VTIA 1IKYA 2O8DB 5F2RA 1BDGA 4JI5K 5HOOA 4DCHA 2FSNA 1YI2N 1BG3A 2NRVA 2D0PA 2OPPA 2X78A 1K8AO 1V4SA 4CEEA 4JI3K 1NK0A 3ZSYA 1D5AA 1N5YA 4HCBA 3PIPL 3H1QA 4GKJK 1ASWA 2CH6A 3NVKA 4HHTA 2HHHK 3DLGA 1VQ6N 3W3DA 2X74A 2P9UB 3MN9A 5C2FA 1T3VA 2VGNA 1L3SA 2F8SA 3SAHA 1LAWA 3K5MA 4KB0A 4H5NA 5FRMA 3VENA 4JLHA 5HP1A 4CHPA 3SJHA 3GOIA 5LL6Z 3B6OA 1LOTB 1L5UA 1GLCG 3UIQA 5KQ8A 1KXPA 3O3FA 1NBWA 4B9MA 3WNHA 3VQQA 4WQ5C 1REVA 1FKOA 1LV5A 4BRCA 1GOBA 4FWSA 1RDWX 4DB3A 5LMNK 4JHDB 4DQSA 5HRNA 3T69A 5KGWA 3O80A 5AQLA 3EYZA 4YDUA 3TSUA 1Q9YA 2P9PA 5AQQA 1Q7YO 4KH6A 1G15A 2OPRA 3P38A 1JCFA 2P9IB 4X62K 4DLGA 4GNIA 4BREA 2A1SA 4R5PA 4IJNA 2V51B 2E1ZA 4I7FA 3QINA 4B8CA 3C7NB 5AQUA 3CFPA 4B1VA 3CQ8A 5AQXA 2XHBA 1M1KO 1VQLN 3LZJA 2YI1A 4IEIA 4CJWA 1ZC6A 1X3MA 1C0MA 1CZAN 3E1YA 3UKRB 3QESA 4KHWA 1WUAA 4FJJA 3AVIA 5CY4A 3DWLA 3VQEA 2PYLA 3KZBA 3D7EO 5K14A 1YJ9N 3VQAA 1MU2A 2VYPA 1X3NA 4B1ZA 4DSFA 1KLNA 3KTQA 5HLFA 2W6KA 4CBXA 3WNFA 1MWMA 3DJCA 1EP4A 3QICA 4C8MA 3K9JA 3VF6A 3EZ5A 3ITHA 2FLOA 3DLEA 4CEOA 5C0YA 3EKSA 4CF8A 3CPEA 4R79A 4DR2K 5JICA 1L3UA 3MN7A 3CFOA 4CHNA 3QIOA 5AR0A 1W9HA 4A62A 2GX9A 4CZKA 1I3AA 2YNGA 4E89A 3ZSVA 3QNNA 3KLGA 4Z4IA 1HX1A 4F2RA 4A5AA 1C0UA 1QS4A 3CMEN 2O8CB 1C1CA 1K8KB 4CEZA 2O4GA 4G1QA 3EY1A 4HUEA 4DR1K 4WFAL 3WNEA 4EP4A 4FOEA 2AA4A 1Y64A 4WQ5A 4FWLA 4BY9C 4J2EA 4FJ7A 3OYAA 1D8YA 1RTDA 3CJAA 4DTUA 2FBYA 2KKZA 3M5RA 3QFUA 3NGZA 1VRTA 1OH5A 1XNRK 3H6EA 4FZXC 2QM1A 4CGHA 1BGXT 1E4FT 3A5LC 5F0XA 3IAYA 4V19S 2UYTA 2IS3A 4ZTFA 3DXMB 4BVPA 3TAFA 3CCQN 4WCEL 3DOLA 1QQNA 1O13A 1SQKA 2DFHA 2QKKA 1VHXA 3IG1A 1ZBLA 1T03A 4O0JA 1EO1A 3AO5A 3M1FA 4FJ8A 3WUHA 3G71N 3EL2A 3K5LA 2HVIA 2ASMA 1D9DA 1YIJN 5JS1A 3M8SA 4JKAA 2DPNA 3U3GA 4FLXA 5AQIA 2PYJA 4O0IA 3SLCA 3F73A 1IJJA 3QBXA 1RT2A 2D0CA 4Y1CA 3AAQA 3AGRA 3DLHA 2XY8A 1BA0A 3KLEA 4H5VA 1DLOA 4DWIA 5BN8A 4CEBA 1VSJA 2NRTA 2QWOA 1RT7A 4EAHD 5ELZA 2UXCK 1DTQA 3MN6A 3IS9A 1WLJA 2E6LA 3ZT2A 1TL3A 4DU4A 4MDBA 3WQUA 3DXKB 4PWDA 3NH0A 4KHQA 4FWPA 2G8IA 4FCYA 5I9EB 4DR7K 2QW9A 3EN9A 4MLEA 3L6QA 5HRSA 2VG6A 4XH1A 4B08A 4F4KA 1NKBA 1TK5A 3THYA 1YJNN 5M1OA 1KVBA 2DFEA 1CZ9A 2E2NA 3CI5A 3ZT1A 2QEXN 1GLLO 2I5JA 4CGIA 2HHQA 5H1SQ 4BE1A 5HBMA 2F4VK 4EZ9A 2CGKA 3PUFA 4C1NI 1LWCA 3TABA 1ASVA 3RR8A 2Q0RA 4FLZA 2RE2A 4CZGA 3LPUA 1DKGD 2CGLA 4CZJA 3LZIA 4AM6A 1BCMA 4O5FA 1CXUA 3SBTA 4A5BA 2QWMA 4CHYA 4YOWA 4O8KA 4KTZA 3OJUA 1YXQA 4CJ4A 3JSMA 2D0BA 3WXMB 3D2EB 1JXBA 5AQNA 2KFNA 4JKGB 1QVFM 3M8RA 4U7BA 2W42A 4J8FA 2OCEA 1WSGA 3DMJA 3LP1A 2BE2A 5JVGL 1HNVA 3FZLA 3P31A 3SCXA 4KB1A 1LW0A 3FZMA 1BISA 3U3YA 3VESA 1HPMA 1HNIA 3V1OA 4DLEA 2ASOA 5CR4A 2FSJA 3RSEA 4M63C 1Q8IA 2Z1IA 3ZETB 1GLAG 4BRMA 1XI1A 1FJGK 1NWKA 1QHTA 4CGFA 2HNDA 4FW2A 3J7YP 4ILGB 1B92A 1GLFO 3J7AP 1OH8A 1ATSA 4K25A 2NNWA 3VMFB 5E84A 3VQ9A 2B4JA 1VQ5N 4YFUA 1JCGA 1NGFA 3OYIA 4DTMA 3G10A 3VEVA 4CZLA 3EZWA 1NJYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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