2CH5A

Crystal structure of human n-acetylglucosamine kinase in complex with n-acetylglucosamine
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
347
structure length
344
Chain Sequence
PQFMAAIYGGVEGGGTRSEVLLVSEDGKILAEADGLSTNHWLIGTDKCVERINEMVNRAKRKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGDQEDAGRILIEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGVVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFHYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHIVAVLPEIDPVLFQGKIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFLLALTQGRAQNFFSSFTLMKLRHSSALGGASLGARHIGHLLPMDYSANAIAFYSYTFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of Human N-Acetylglucosamine Kinase in Two Complexes with N-Acetylglucosamine and with Adp/Glucose: Insights Into Substrate Specificity and Regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NAGK PROTEIN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 113
structure length 344
sequence length 347
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.59: N-acetylglucosamine kinase.
pdb deposition date 2006-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ch5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ch5A02
3R8EA 3HBTA 3MMVA 4CBUA 3GE1A 3EKSA 1BG3A 3LDLA 2QM1A 4M63C 1ZC6A 5AZIB 5FPNA 5BPMA 3VGKA 1TYQB 1U2VA 4CZMA 4JNEA 3JS6A 3LM9A 4JD2A 4BR4A 2ZGYA 3MN6A 2CGJA 5AQKA 3CJAA 3OHRA 3M1FA 5EX5A 2GWKA 2A5XA 3LM2A 3GBTA 3J8AA 2Q97A 2P9UB 4BG8A 4WQ4A 4BGBA 4IJAA 1WOQA 1V4TA 4FSVA 4IO8A 3ULEB 2GELA 2Q31A 3WXJA 1T6CA 2E1ZA 4H0YB 3O6WA 1HKGA 1BUPA 2QWLA 2W40A 4BG9A 1V4SA 3D2EA 2NLXA 4DQ8A 3VF6A 1GLFO 3UE5A 3WEEA 4IXCA 3ZX2A 3FE1A 4BRGA 4CZIA 3HZ6A 3O1WA 1T6DA 3SMPA 5AQYA 1BDGA 4EHTA 3VEWA 4WQ5A 3VF2A 3WXKA 5BRHA 1KAXA 3UKRB 5AQWA 4CZFA 5BPLA 3F9MA 3ZEUA 4FWPA 2QW9A 3ZX3A 1HX1A 1YVNA 5BN8A 1JCEA 2QWRA 5KPZA 2F9WA 5BRFA 2P9SB 2Q0UA 4BQZA 4FWQA 1NBWA 3VEVA 2D1KA 1ATSA 1OKJA 1G99A 2NRHA 3VPZA 2E2PA 2GEMA 4JHDB 4CZGA 5F0XA 1QQNA 3U8XA 3WXIA 4DB3A 1GLCG 1MA9B 5AQQA 1HPMA 4PL7A 1WUAA 1LCUA 3VGLA 4IWVA 4O8KA 3CETA 1QQMA 1T44A 3DXKB 1GLJO 4LC9B 1Z6RA 3KZBA 3IFRA 2V52B 2QWQA 4BC4A 2A3ZA 1NWKA 2V7ZA 3QBWA 4BRFA 1NGJA 3VEXA 3UKUB 3ATVA 2ZWHA 3WXLA 4F9OA 1KAZA 4FWRA 4BR2A 1NLVA 3MDQA 1BA0A 2J4RA 2HOEA 2FSNA 1KXPA 3O08A 2H3GX 3U4LA 4GNIA 4BRHA 2P9PA 2FSKA 3ATUA 3D7EO 4EIAA 3H3OB 3DXMA 4A2AA 2DPNA 3CERA 4BC5A 1X3NA 1HKCA 3ENHA 1RFQA 5BRDA 3SJHA 4KBOA 3R9PA 3P4IA 2FLOA 1QQOA 5KPTA 3MN5A 4QS9A 4MLHA 3C7NA 3O1BA 4RTFD 4L3QA 3ZEUB 5AQRA 5AQVA 3H6EA 2A42A 2E2OA 4E1JA 2P9NA 3QFUA 3CQYA 4C23A 4FO0A 3FZLA 3GL1A 3QDKA 4M7YA 3G25A 4YDUC 2CGLA 4BRAA 3CHWA 1YUWA 4FWSA 2A6AA 4FPAA 4BRMA 3GOIA 3SMSA 4FWKA 1JCFA 4NO7A 5AQHA 4MLEA 4BRDA 4J8FA 3WQTA 4H5VA 1RDWX 3KVGA 1U6ZA 3RSEA 3R6MA 3JXUA 4AM6A 5AQXA 3A8YA 4H0VB 5ELZA 3O5BA 5EY4A 1IJJA 5I9EB 4FWLA 1IG8A 2ASPA 3I8BA 2PBDA 5AQUA 2Q0RA 3A5LC 2P9KA 4XEIA 4H0OA 2QWNA 5F2RA 3O80A 1DEJA 2YCHA 2VWBA 3VEZA 5AQMA 5JLFA 4QS7A 3BF3A 1BOTO 3D2FA 3FZHA 3O4WA 4Z94A 2P9PB 1J6ZA 3QICA 2QWMA 4BRQA 3U9DA 2P9LB 4B1VA 5AR0A 3UB5A 3EO3A 2I7NA 3A0IX 2AA4A 3WT0A 1K8KA 4BROA 4WQ4C 4AM7A 2P9IA 2FSJA 4BRNA 5CE3A 2HF3A 3AAQA 4K25A 2GWJA 4CJ7A 5FPMA 2CGKA 5AQLA 1XQSC 1S3XA 3ID8A 4B1UB 2E2QA 2P9NB 4ISFA 3BUZB 3W0LA 4XH4A 5AZJA 4H0PA 2A41A 3ZETB 2HF4A 4PL8A 2FF6A 4ISGA 4B1WB 2D4WA 4BRIA 3CJBA 1QHAA 1E4FT 4WQ5C 1ATNA 3MN9A 4I6MA 5JICA 1JCGA 4B1ZA 4ISEA 3H1VX 4CBXA 1RGIA 1U2VB 4M7XA 4NB4A 3ZX0A 3H45C 3M6GA 4JD2B 3M3ZA 1DKGD 1BU6O 4CZKA 4A61A 5AQGA 5LJWA 2OANA 2D0PA 4EHUA 5LY3A 2IVOA 3CJCA 1HKBA 4RWTA 3U9ZA 2NZTA 5AZIA 3HM8A 3TPQA 5KQDA 4FL9A 1C0GA 1TYQA 3FLCO 4GY2B 4HTLA 4CZHA 1Q18A 2E1YA 3VF4A 2ASOA 5AQZA 4BRCA 2YHWA 1BWFO 3EKUA 1C0FA 5ADXH 5E26A 5F1XA 2BTFA 1HUXA 4IZ9A 1ATRA 1GLAG 3D2EB 3VETA 4A62A 3WEEB 3GDQA 3W3DA 2Q1NA 4H0XB 5TKYA 1NMDA 4FPBA 5AQJA 3LDPA 2P9UA 1K8KB 2GUPA 5AQSA 1MDUB 4XH1A 5AQTA 5BR9A 1NGCA 1QZ5A 5AQNA 2IVPA 1XC3A 2A40A 2QXLA 3GG4A 2E20A 1QZ6A 1EQYA 5FPDA 4BR0A 5B8HA 5AFUH 2V51B 3H1QA 1DGKN 4BREA 3MK6A 4JN4A 3LL3A 4BR9A 2CH6A 2QWPA 3FR0A 4BR7A 1P8ZA 4O5FA 2VYPA 2GTDA 3VEOA 3BP8A 4A2BA 4H03B 4XH5A 3L6QA 3BF1A 5JLHA 1NGFA 2UYTA 2CH5A 2D0OA 2YHYA 5EXWA 3VOVA 1SAZA 1NGBA 4FWMA 5E84A 1BO5O 3BEXA 2P9SA 3FZFA 4FWNA 3MN7A 4MO5A 4PKIA 5AQIA 4BVPA 1TUUA 5BPNA 2YJEA 1CZAN 2ZF5O 3VERA 3CI5A 2BUPA 4JHDA 4CZJA 3MCPA 3QBXA 3O8MA 1ZXOA 4BC2A 1HJOA 1HLUA 3LDNA 3DAWA 2VCPA 3IUCA 4H5NA 1Y64A 3DXKA 4BGAA 3DXMB 4BVOA 3SK3A 3AARA 3DWLA 4K42A 1NGIA 1ESVA 3EL2A 3UKUA 4BR5A 5FPEA 2WUSA 3LDQA 1NGHA 4BQLA 3C7NB 4PKGA 2KHOA 2AP1A 1NM1A 4RCHA 1X9JA 3FZMA 2HMPA 4H5WA 4CZEA 4WYBA 1GLBG 4CI6A 3A5OC 3I33A 1D4XA 4H0TB 3HTVA 4H5RA 2F9TA 4B9QA 4QS8A 4B1XB 4BRLA 3VENA 1LOTB 1GLDG 3H3NO 3TU5A 4Y0WA 4CZLA 3CQXA 3EN9A 4H5TA 4B1YB 3S41A 4JAXA 3KHYA 4EFHA 3C0BA 3RSEB 3VGMA 2IIRA 4BRPA 2V7YA 1H1VA 2E8AA 2QWOA 2IVNA 1MWKA 1MWMA 5BREA 3HI0A 2ZGZA 1YXQA 3WUHA 4EAHD 2P9KB 2E2NA 2Q36A 3B8AX 3CIPA 3VEYA 4DHYA 3HSCA 4CD3A 3QB0A 1BA1A 3CJ9A 4HWIA 4CD1A 2PAVA 3CJ7A 3D2FB 2YI1A 3CJ1A 1E4GT 1ZBSA 3FGUA 1NGAA 3A5NC 1XUPO 3A5MC 1KAYA 4FOEA 3L0QA 3QMLA 1X3MA 4K43A 5AQFA 3IDHA 5LJVA 4FWOA 3AY9A 4PKHA 5BN9A 3ULEA 2P9IB 2ASMA 1NGEA 3ENOA 4FOIA 3SLCA 3AAPA 2YJFA 1NGDA 3WQUA 3FZKA 4BRKA 2FXUA 2YHXA 1SZ2A 1YAGA 3QFPA 5EOYA 5JMVA 5ADXA 1GLLO 3LDOA 5AZJB 4BC3A 1Z05A 3EZWA 3FFKB 2EWSA 2P9LA 1TUYA 3VESA 2FF3B 2Q2RA 3L4IA 3IMXA 4IJNA 1R59O 5AQPA 5KPRA 4YDUA 4DCHA 1SQKA 3DJCA 1NGGA 3UKRA 4I6MB 2W41A 5KQ8A 4K41A 5EVZA 4CBWA 3H46O 2I7PA 2E88A 2ITMA 3ZETA 5AQOA 1S22A 4MO4A 5AFUA 1GLEG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3R8EA 3GE1A 3EKSA 3SQ1A 4NCBA 3DLEA 4O5BA 3OJUA 2RF2A 4Q5VA 1HYSA 4YORA 4OPKA 2KZZA 3LM9A 4BR4A 3EE9A 4CF1A 4JKDA 5EX5A 1TKTA 3JYTA 1QS4A 2O8CB 1IO2A 5I3UA 3DOKA 4I9QA 3RMBA 4DG1A 4FSVA 4EZ6A 4CECA 4FVUA 3WXJA 4OKJA 2E1ZA 1EO1A 2QWLA 1N6QA 4BG9A 3OYJA 3SUOA 1SL0A 3WEEA 4IXCA 2OCEA 4CJQA 3KLFA 4H8KA 3O1WA 1T6DA 1EWRA 4DS5A 1X9SA 4IKFA 4V19S 1KAXA 5GAGP 1LV5A 3KD5E 5AQWA 5BPLA 3F9MA 2O8FB 3D45A 1VSKA 4CFCA 2FBXA 1FXXA 5BN8A 4H4OA 5KPZA 2F9WA 4O0JA 5BRFA 2P9SB 1SL2A 3LP0A 3DLRA 1NBWA 2X6SA 3O9QA 4CIEA 5KGXA 3PSIA 2ZD1A 2NRHA 4JHDB 3U8XA 3AVBA 3RMCA 2RN2A 1MA9B 4HHTA 3G71N 2HHXA 2AJQA 4KTZA 3OW2M 1YHQN 4DTNA 5HL7L 4O8KA 1T44A 3DXKB 4LC9B 3TAQA 3H08A 5FROA 2V7ZA 1NGJA 3L2QA 4F9OA 1KAZA 1KXPA 1J9AA 4E0DA 3MWPA 1D9DA 4NLCA 3ATUA 4EIAA 1XMQK 3H3OB 1S1VA 1IKYA 1HKCA 1SS6A 3DRPA 4JKCA 1TAQA 1RT6A 2FLOA 1QQOA 4RW7A 5KPTA 1KCFA 3MN5A 3VQ4A 4A5BA 2X6NA 4CIGA 3TSUA 5AQRA 1UA0A 3LP2A 4CK3A 1VQPN 1N36K 3OY9A 4F2SA 3CQYA 3T1AA 2YHAA 2RHKA 4FO0A 3QDKA 4DTPA 4YDUC 3CCLN 1JL2A 4CCHA 4LF8K 3CHWA 4Z4GA 3AVJA 4FPAA 4BRMA 4R5PA 3SMSA 1JCFA 4CJ5A 4BRDA 1RDWX 5C10A 5M1FA 3RSEA 3JXUA 3CFRA 3CCRN 3NE6A 5ELZA 1TKXA 3O5BA 1IJJA 4DSEA 3NH0A 1XNRK 3A5LC 3CPWM 4NYNA 3HPOA 1RTIA 4M3YA 1BOTO 3FZHA 4CF2A 5IT9O 3EZ5A 1J6ZA 1Y97A 1W2BM 4BDPA 1N33K 5CZ2A 4B1VA 3EEQA 3VTHA 1FK9A 2AA4A 3WT0A 1J5OA 4WQ4C 1GOBA 3QERA 2HHWA 2HF3A 5J2NA 5AQLA 1YJNN 1VQ8N 4B1UB 2P51A 1DTQA 2HHQA 3BUZB 4XH4A 4GVMA 1VQMN 1Q9XA 3CC4N 3BZCA 3CM5A 1BCMA 1QHAA 4CJWA 1ATNA 5I42A 3MN9A 4B8AB 3QESA 3L2WA 4UQGA 1JCGA 1U4BA 4M7XA 4NB4A 3AO3A 3DOLA 3CCMN 4JD2B 3M3ZA 3HVRA 1HMVA 3M8PA 4I2PA 4M3ZA 4A61A 3HP9A 3C94A 3OYIA 1NOZA 2ZQBA 2D0PA 1I39A 4DKWA 2IVOA 3U9ZA 2NZTA 5AZIA 4DU4A 2P1JA 4ILHA 3FLCO 1Q18A 4NLBA 4ZTFA 2PYLA 4DR2K 3NFAA 1BWFO 1NJXA 1HUXA 2Z1IA 4KB1A 3AVGA 4CHZA 4A62A 1RCHA 4FJ8A 4LD0A 3W3DA 5TKYA 3TR8A 5J1EA 3THXB 1QQCA 5FRNA 4KFBA 5AQSA 3AVNA 5AQTA 4CJ3A 4DWIA 3B6OA 5BR9A 1VQNN 2Y1JA 1WNSA 1C1BA 3GG4A 2E20A 4IG3A 1QZ6A 4W5TA 5CR4A 3VQPA 1T03A 3HYFA 3WNFA 2O8DB 3AA5X 3VQ9A 1P8ZA 4DFMA 2GTDA 3NAEA 3ZSVA 4B9UA 2HBMA 4H03B 4ZHRA 3VOVA 3AVCA 1JL1A 4O4GA 4GV9A 5CYQA 3ZSOA 1TUUA 1T05A 4JKHA 2QEXN 4H4MA 3TANA 3CI5A 5GINA 2BUPA 3MCPA 1LAVA 1TL1A 3D6RA 4BC2A 5KRSA 2HBKA 3ZT1A 4L8RB 1RT2A 3KLEA 4O55A 3NH1A 5C2FA 3KWIA 4NCGA 3AARA 1R0AA 1EX4A 1MU2A 2YKNA 2O8EB 1IH7A 4M3WA 5LMNK 4DSKA 2FC0A 2A1SA 3C7NB 1NMNA 1NJYA 2KHOA 2AP1A 1NOYA 1O13A 2ZM6K 1KVBA 4PUOA 4Q0BA 4H5WA 1BQMA 4Z4EA 4KHYA 2F9TA 4B9QA 3TI0A 4QS8A 1ITGA 4AILC 3VENA 1XWLA 4CESA 3LZIA 3HO1A 4FVMA 1QVFM 4H5TA 3D0PA 4N47A 3C0BA 1FKOA 2NUBA 2IIRA 1EKEA 1H1VA 2E8AA 1MWKA 1XI1A 4HUEA 3SPYA 1KFDA 1YITN 3VQAA 1IBKK 1YXQA 3Q7BA 4OGEA 2E2NA 1BGXT 3VEYA 4M41A 2VG6A 3QB0A 1BA1A 3CJ9A 2FBTA 4CD1A 2PAVA 3CJ7A 4KV8A 3O3FA 1NK5A 4YOYA 4FOEA 4LFAK 1HR0K 3MEGA 3S3NA 1UAXA 3T19A 5CY4A 3ENBA 4KI4A 1B9DA 2E6LA 4JK9A 1NGEA 3ENOA 3SLCA 3WQUA 1WSHA 4YY3K 3NHGA 5JMVA 1GLLO 2W42A 5AZJB 4BC3A 1HYZA 1Z05A 5J2PA 4CJPA 4DV5K 3VESA 3E9PA 3PLAA 4N56A 5EU7A 2XHBA 3SI6A 3AO5A 3DJCA 3VMFB 4M3UA 3DYAA 3UKRA 1X9MA 4DTXA 5KQ8A 3QEIA 4KHUA 1NJZA 3NVKA 3ZT2A 3H46O 2E88A 1U48A 1S22A 5AFUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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