2CH6A

Crystal structure of human n-acetylglucosamine kinase in complex with adp and glucose
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
343
structure length
343
Chain Sequence
AAIYGGVEGGGTRSEVLLVSEDGKILAEADGLSTNHWLIGTDKCVERINEMVNRAKRKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGDQEDAGRILIEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGVVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFHYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHIVAVLPEIDPVLFQGKIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFLLALTQGREIQAQNFFSSFTLMKLRHSSALGGASLGARHIGHLLPMDYSANAIAFYSYTFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structures of Human N-Acetylglucosamine Kinase in Two Complexes with N-Acetylglucosamine and with Adp/Glucose: Insights Into Substrate Specificity and Regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE KINASE
total genus 98
structure length 343
sequence length 343
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.59: N-acetylglucosamine kinase.
pdb deposition date 2006-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ch6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ch6A02
3L4IA 3O4WA 4B1UB 5BRFA 3QB0A 4CZJA 4ISEA 5AQLA 3EKUA 3MN9A 2P9PA 5AQPA 4FWKA 3GDQA 2H3GX 3L6QA 3LDNA 1H1VA 2P9UB 2P9SB 3HI0A 4PL7A 1DGKN 2P9KA 2VCPA 4IWVA 4BRGA 1X3NA 1OKJA 4RCHA 3GG4A 4BRDA 3FZFA 5AZIB 1NGFA 4BREA 1U2VA 2F9TA 4FWMA 5JLFA 1HKGA 2QM1A 5F1XA 2PBDA 2WUSA 3A5LC 3TU5A 4MLEA 5FPNA 5BR9A 5ADXH 4CD3A 1NLVA 3VEWA 1NWKA 2BTFA 4CBWA 4DCHA 1NM1A 1NGJA 2E2OA 4DQ8A 3ZETB 1HKBA 5KPZA 2E88A 3D2FA 4BC5A 2W41A 4FWRA 3FZHA 4CBXA 4XH4A 1ZXOA 4BRNA 3ULEB 4CZEA 4K41A 4O8KA 5AQMA 1TYQA 2Q31A 1GLEG 3ENOA 2CGJA 1V4SA 2Q97A 3ID8A 3VOVA 1DEJA 3ZEUB 4BG8A 1D4XA 2QWMA 3VEXA 3BP8A 5FPDA 4NB4A 4H5WA 4CZGA 1QZ6A 3DXKB 2HF4A 3VGLA 5AFUH 3H45C 1NGBA 4CJ7A 3DXMB 3FLCO 4A61A 3I8BA 2YJEA 2V51B 2P9UA 2P9SA 1XQSC 2PAVA 4BGBA 1ZC6A 4A2BA 4H5VA 3MK6A 4BR9A 3LM2A 1Q18A 3TPQA 4FWPA 4FOEA 3VEYA 4FOIA 3FE1A 5AQNA 5AZIA 4JNEA 3ZX2A 2FF6A 3O1BA 4EIAA 5BRDA 2FXUA 1HLUA 3CETA 4MO4A 2GWJA 4B9QA 3ZETA 3AAPA 4A2AA 5AQYA 5BPNA 1MWMA 3QBWA 4B1ZA 3F9MA 4FO0A 4YDUC 4BG9A 1P8ZA 4BRKA 1K8KB 4F9OA 3KHYA 5BREA 5LJWA 3SK3A 4PKIA 1Z05A 3CERA 3P4IA 2DPNA 3ZEUA 3WEEA 1GLFO 4FWLA 2ZGYA 4CZIA 5F2RA 3J8AA 2W40A 2VWBA 3KVGA 1X3MA 2F9WA 3O1WA 2P9LB 3CIPA 2FLOA 4H5NA 5LJVA 3H3OB 4JD2B 1E4FT 3ENHA 4IO8A 1GLBG 4H0PA 3DXMA 4L3QA 3R8EA 4H0XB 3IDHA 5I9EB 3RSEB 5KQ8A 2QW9A 3BF1A 3D7EO 4B1YB 4WYBA 2ASPA 4BRQA 3CHWA 4BR2A 4CI6A 2ZGZA 2Q2RA 2NRHA 2HF3A 2Q36A 1QQNA 3C7NA 1TUUA 4MO5A 4Y0WA 1XC3A 3BUZB 1ATSA 3WUHA 3KZBA 2E1YA 3DJCA 5TKYA 4M7YA 4EHUA 2E8AA 4H0VB 4CZKA 3EO3A 3LDOA 4BVPA 1XUPO 2J4RA 2GWKA 4DB3A 3IMXA 4FL9A 4PKGA 4QS9A 5FPEA 2V52B 2YHXA 3HBTA 1JCFA 1K8KA 2YJFA 3FZLA 3AY9A 2KHOA 4JAXA 3VENA 4BQZA 4FWOA 3CJBA 1IJJA 2A42A 1NBWA 4EFHA 4LC9B 5AQHA 3IFRA 2P9LA 3CJCA 3O08A 5AQRA 2D4WA 5B8HA 3FR0A 3C0BA 2QWRA 5FPMA 3WT0A 3UKUB 4CZLA 4CZFA 4MLHA 2IIRA 4PKHA 4M63C 3VEZA 2E2QA 2CH5A 5AQKA 3M6GA 2V7ZA 1BWFO 4XEIA 3EKSA 3VETA 4KBOA 2EWSA 3W0LA 2YCHA 5EXWA 3FFKB 3UKRA 1NGGA 1E4GT 3MDQA 3O8MA 5BN9A 3CQXA 1NGCA 3H3NO 5ADXA 4H0YB 3EL2A 3ATUA 3AARA 4XH1A 2E2PA 2QXLA 5JLHA 3VF2A 4H5TA 2A40A 5AR0A 1BUPA 3SMSA 1R59O 3M1FA 3QFPA 3BEXA 5AQSA 5BPLA 2FSJA 3BF3A 3JXUA 4M7XA 4JHDB 3MN7A 2E2NA 4FSVA 3WQTA 5BPMA 2ASOA 4H03B 3D2EB 3H46O 3UB5A 1HKCA 3HSCA 3CJ7A 4K42A 4BRCA 4EHTA 5AFUA 1BA1A 2CGLA 2D1KA 3ULEA 4IZ9A 1SQKA 4DHYA 4AM6A 3LL3A 4BRMA 1HX1A 1KAZA 3GOIA 2ZF5O 4Z94A 2P9IB 3H1QA 3SLCA 5JICA 5EVZA 1MA9B 4BGAA 4IXCA 3CJ1A 1NGAA 2A41A 2A3ZA 3DXKA 2GUPA 3M3ZA 2P9PB 3HM8A 1WUAA 2P9NB 1U6ZA 2AA4A 3DAWA 3H6EA 3VEVA 2P9KB 1RGIA 1LCUA 2D0PA 2ZWHA 2NLXA 2YI1A 4J8FA 3HZ6A 4FWNA 2I7PA 5AQWA 1U2VB 3IUCA 2QWNA 3U9ZA 1KAXA 2A6AA 1GLJO 2UYTA 3GBTA 4BC4A 3R6MA 2D0OA 1BOTO 3L0QA 4A62A 5KQDA 1DKGD 1ESVA 3D2EA 4IJAA 3ZX3A 1HJOA 1MWKA 1BO5O 3D2FB 4BC3A 1BG3A 1QQOA 3EN9A 4K25A 4BRAA 4BRPA 3VF4A 4BRFA 5E26A 3JS6A 5AQTA 1TYQB 5AQJA 4HWIA 1LOTB 4BC2A 1GLCG 2NZTA 4FPAA 1T6DA 3LDLA 5AQIA 3U4LA 3O80A 3CJAA 3WQUA 3LDQA 2V7YA 1RDWX 3QDKA 4FPBA 4AM7A 4E1JA 4CD1A 4B1VA 5F0XA 4BR0A 2CH6A 4JD2A 3SMPA 2P9NA 4BR4A 1J6ZA 3RSEA 1YUWA 3DWLA 4QS7A 1KXPA 4BRLA 5CE3A 4RTFD 5AZJB 3O5BA 3LM9A 4FWQA 2QWLA 1EQYA 4NO7A 3CI5A 1V4TA 2QWPA 1S3XA 3GE1A 4QS8A 3WXIA 3A8YA 1T44A 1YAGA 1QZ5A 3FZMA 4JN4A 3R9PA 2HMPA 1TUYA 5AQQA 2YHYA 3VPZA 1GLAG 1G99A 1YXQA 3VEOA 4PL8A 3W3DA 4B1XB 4YDUA 3UE5A 1ATRA 3QBXA 4H0OA 1NGHA 3CJ9A 4I6MB 4RWTA 3MN6A 1Z6RA 1JCGA 4WQ4A 3WEEB 3QFUA 2OANA 2ITMA 5AQFA 2Q0UA 3GL1A 1T6CA 1QQMA 3WXJA 2GEMA 3A5NC 5ELZA 1QHAA 2VYPA 3VF6A 3I33A 4BR7A 5BN8A 3VERA 3S41A 4BROA 3SJHA 3UKUA 4BRHA 1SAZA 5AQGA 1ZBSA 4BQLA 4XH5A 3FZKA 1CZAN 3HTVA 1ATNA 4WQ5A 2QWOA 5AZJA 1BU6O 1NGDA 3LDPA 3C7NB 5KPTA 2IVOA 5KPRA 2FSNA 5E84A 1NGEA 2FF3B 3OHRA 1BDGA 5AQOA 2Q0RA 5BRHA 3MCPA 4GNIA 4BRIA 2Q1NA 3MMVA 3WXLA 5AQVA 5AQZA 2E1ZA 1X9JA 4CZHA 3A5OC 4GY2B 3FGUA 3A5MC 4H5RA 1NMDA 2GTDA 3G25A 4HTLA 4I6MA 2IVPA 4IJNA 3QICA 3AAQA 4ISFA 4O5FA 3H1VX 2AP1A 2A5XA 1BA0A 2QWQA 4WQ4C 2YHWA 5EX5A 1MDUB 4JHDA 1NGIA 4BR5A 4CBUA 3U8XA 1HPMA 4C23A 1IG8A 2CGKA 4CZMA 3WXKA 1KAYA 1GLDG 4EAHD 3U9DA 4BVOA 1C0GA 3VGMA 3VGKA 1YVNA 3QMLA 3CQYA 5AQXA 1Y64A 3B8AX 4FWSA 5LY3A 1C0FA 2I7NA 4H0TB 1HUXA 5EOYA 2GELA 2HOEA 2IVNA 5JMVA 3A0IX 1S22A 3VESA 4K43A 3ATVA 4ISGA 4WQ5C 1WOQA 2BUPA 1SZ2A 3EZWA 1GLLO 5AQUA 3ZX0A 1RFQA 2E20A 2FSKA 2ASMA 4B1WB 1JCEA 3O6WA 5EY4A 3UKRB 2P9IA 3MN5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QIOA 3L4IA 4I9LA 3P83D 3EKUA 3MN9A 3R3LA 4FXDA 4KHYA 2P9PA 3I55N 2X74A 4FWKA 5AQPA 1SKSA 3GDQA 2W6LA 4OKJA 2P9UB 4F3OA 2VCPA 4JI2K 4IWVA 1T05A 1YJ9N 1GOAA 4BRGA 2NRXA 4RCHA 5KRSA 3OY9A 3GG4A 4C1NK 3HJFA 3FZFA 1NNEA 4FWMA 1VQKN 1RDCA 3RWUA 5F1XA 3A5LC 1QQCA 5BR9A 5ADXH 4AQYK 3C6AA 2KKZA 3CM6A 5KPZA 3D2FA 1HNZK 1Q9YA 1TK5A 4OJRA 3FZHA 3ULEB 4FLTA 4K41A 4O8KA 2Q31A 3ENOA 1JLFA 1J5EK 1WSEA 2KZMA 3PX6A 3CCLN 1TVRA 4H5WA 4CZGA 1QZ6A 3OYGA 2HF4A 2HBJA 3TWHA 4CF8A 1WSJA 2V51B 1VQNN 4BGBA 1ZC6A 4H5VA 5FRMA 1Q18A 3DM2A 1ILYA 4FWPA 4DQSA 5AZIA 1QS4A 3L3VA 3QIPA 3I0SA 3MEEA 3MWPA 2ZQBA 3O1BA 4EIAA 4K0KK 2FXUA 3WNEA 1SL2A 1BQMA 1HLUA 3CETA 3PO4A 2HNDA 2GWJA 4Z4EA 4IOCL 4BWMA 4A2AA 1BCOA 3QBWA 1A5VA 2XY5A 1P8ZA 3PO5A 1VSJA 3KHYA 3OS1A 1X1PA 1JXBA 4M3ZA 3EE9A 3J7AP 4CJSA 3WEEA 3P31A 3K2PA 4B8CA 1XI1A 3NVKA 4CZIA 3NH1A 3V9XA 4IDKA 4XIUA 3KLGA 3TARA 3C6TA 1VQ9N 3O1WA 3T69A 3H3OB 4JD2B 3HVTA 4IO8A 3ENBA 3DXMA 3RVCA 4H0XB 2BH1A 3QETA 5I9EB 5KQ8A 3IG1A 1IBKK 3CHWA 4CJKA 4KB1A 3QEIA 3DI6A 3LP3A 2DTUA 2HF3A 2IOCA 5HL7L 4JKGB 2F8SA 4B3RK 2E8AA 4CZKA 1XUPO 3ZSRA 4FK2A 4A5AA 4FL9A 4N41A 4HCCA 2GV9A 1JCFA 1K8KA 3AY9A 2PYLA 4Y1CA 4CGJA 4BQZA 1TKZA 3CC7N 4LC9B 3PX4A 4MQ3A 4WF9L 1BCMA 4RW7A 3O08A 3TTCA 1D5AA 1UA0A 2OA8A 4E19A 3FR0A 3AVCA 4DSJA 3QEXA 1EKEA 3F2KA 4FW2A 2KFNA 3WT0A 4GW6A 2W42A 4JS5A 2HNZA 4E7HA 4RW6A 5AQKA 5C0YA 4DSEA 3CD6N 4DTSA 1EWQA 4XEIA 5C2DA 1NK4A 3IAYA 3UKRA 2OTLN 4HUFA 1L3SA 1E4GT 3MDQA 1YVUA 3NMUA 1FK9A 4FVMA 4DU3A 1NGCA 4M42A 4H0YB 3PLAA 3VQ6A 5HOOA 3VN5A 2E4LA 1VQON 4AHTA 2QXLA 4OPJA 4H5TA 4FJ9A 5AR0A 4CJTA 2VGMA 3LP2A 2OPPA 3U3YA 4DSFA 3BF3A 3JXUA 1YJWN 3MN7A 4O4GA 3WNFA 4CIFA 4N56A 5I42A 1JLQA 3TANA 3HT3A 3HSCA 3ZT3A 3CJ7A 4K42A 4CF2A 1KVCA 3HPOA 1NJIO 1SQKA 4DHYA 4FLYA 4YOVA 1RTHA 2BANA 1VSFA 3GOIA 4BRMA 1XWLA 3TR8A 4X64K 3O4NA 5EVZA 4BGAA 2QKBA 4LH5A 4CEEA 4CK3A 2YKNA 2A3ZA 3M3ZA 2P9PB 4M3RA 5FROA 3KK1A 5CYQA 4AHSA 1U6ZA 4FYDA 1RDBA 1RBUA 4FJHA 3DAWA 3H6EA 1XHXA 3AA4A 2ZWHA 2HNYA 2HHQA 4GV9A 1NJWA 3HZ6A 1X9WA 2EHGA 2QWNA 4F2SA 2UYTA 2G8UA 1WN7A 2D0OA 3TTFA 3L0QA 1DKGD 1ESVA 2X6SA 4YORA 3KLEA 4FJJA 4LF5K 3QNNA 4BDZA 4ELVA 1MWKA 3D2FB 1RCHA 4LF9K 2YNHA 3VF4A 4R79A 5E26A 5C10A 4OGCA 4DR4K 4JS4A 3C6UA 3EZ5A 2WONA 3LDLA 5AQIA 3O80A 5CR4A 4CJWA 4AM7A 5J1EA 3I8DA 4JRPA 4BR0A 2CH6A 3SZ2A 4DU1A 1S1VA 2HHSA 4W5OA 1O1WA 3K5LA 2YX6A 4O8UA 5CE3A 4NYNA 4CFAA 2P51A 4RTFD 5AZJB 4A59A 4FWQA 3LM9A 2QWLA 4GV6A 3VTIA 1V4TA 3K5NA 4JKDA 1RBTA 3OYEA 3A8YA 1QZ5A 2UUBK 3O3HA 3IS9A 4DV7K 2JWKA 2HMPA 4C1NI 4DUYK 4CFDA 2A1RA 3RRHA 1ATRA 1NGHA 2YHAA 2QXFA 3CJ9A 4FJLA 1KFSA 4J2DA 3MN6A 2ZD1A 3NH0A 2ETJA 3WEEB 3THXA 2RKIA 1T03A 1IKXA 2Q0UA 3GL1A 5LMNK 1D9DA 2GEMA 3A5NC 3BY5A 3VERA 2KLAA 4B3SK 4EZ9A 3SJHA 2QEXN 5H1SQ 3AVAA 3T7ZA 2HBLA 3QLHA 3LDPA 3VQ5A 4JI7K 1HPZA 2RF2A 5AQOA 1BIUA 1IV0A 3TSUA 2HVHA 4BRIA 4Y1DA 4B9MA 3WXLA 1FJGK 5AQZA 4CEBA 1BISA 4FZZA 3V1QA 4UY8O 3VQEA 2DFHA 4CJPA 3OYBA 3CCQN 2GTDA 4RW8A 2G8WA 3QICA 4JKHA 4BDYA 4BE1A 1BA0A 4WQ4C 3T3FA 5HP1A 1L3UA 1MDUB 4JI1K 3ZYYX 4JHDA 3U8XA 3AVIA 4C23A 2CGKA 3G6EN 5GADP 2ATQA 4E1MA 1GLDG 1ITGA 4DTXA 4JYAK 4RG8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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