2E20A

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with diadenosine tetraphosphate (ap4a)
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIAHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of Salmonella typhimurium propionate kinase and its complex with Ap4A: evidence for a novel Ap4A synthetic activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Propionate Kinase
molecule tags Transferase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 136
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2006-11-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e20A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e20A02
4MLHA 1CZAN 1NGDA 1HJOA 4BRHA 4MO5A 3ZX0A 3CERA 2YHXA 1S22A 2P9SB 3MN9A 3FLCO 1GLAG 2DPNA 3UB5A 5AQJA 2ASPA 3QICA 3EO3A 4L3QA 4HTLA 3DXMB 2BUPA 5AQYA 1Z6RA 1NGFA 4K25A 5AZIA 3VEYA 4F9OA 1T6CA 1TYQB 5AQTA 4CZHA 4M7YA 4K41A 2Q0RA 2IIRA 3O08A 2HMPA 2QWMA 4B1ZA 4BGBA 1C0FA 5JLHA 4ISFA 4CZGA 4JN4A 3LM9A 3ULEA 5FPDA 4BGAA 3LDOA 1V4SA 4PKGA 2YJFA 3HM8A 2GTDA 1WUAA 3RSEB 3VF6A 4B1WB 1QQNA 3M1FA 4FOIA 1HKGA 5ADXA 4LC9B 3D2EB 4CBWA 3O80A 2YJEA 3EN9A 4BRNA 1QZ5A 4J8FA 4WQ4C 3SJHA 4BQLA 2CH6A 5KPTA 3LDNA 4CJ7A 2NRHA 3VEWA 1ATSA 2P9UB 1NM1A 5AQKA 3KVGA 3O8MA 4WQ5A 5ADXH 3WT0A 3WXJA 4FO0A 3QDKA 4FPAA 2W40A 4FWPA 4NB4A 3UKRB 1YUWA 2NLXA 3W3DA 4DB3A 5BRHA 5AQLA 4BC4A 5KQDA 2OANA 4A2BA 2QWQA 5JICA 1KAYA 3BUZB 4I6MB 1GLJO 1IJJA 3EKUA 2V7ZA 2QWLA 4QS9A 1U2VB 3MN7A 3FGUA 3MCPA 2IVNA 3H3NO 2E2OA 3WXIA 1NGAA 3DXKA 1XQSC 2FLOA 3MMVA 2BTFA 1Y64A 2E2NA 3O6WA 3IDHA 1BOTO 2E88A 4H5TA 1SZ2A 4RWTA 3FFKB 4A2AA 2P9IA 2CH5A 4H5RA 2ZGYA 3G25A 4IXCA 2FXUA 5EY4A 3VESA 3VETA 3H1VX 3HBTA 3WXKA 3GG4A 2D4WA 5EXWA 5BPMA 4BRGA 3MN5A 1IG8A 3LDLA 4JNEA 3OHRA 3S41A 4PL7A 1YXQA 4H0OA 1SQKA 2YHWA 1NGCA 4FWQA 5KPRA 3R6MA 4BR9A 3CETA 1R59O 4B1YB 4CZEA 3O1WA 1ATNA 3ENOA 4IWVA 5E84A 2VCPA 2YI1A 4JD2B 1NGHA 1SAZA 5F0XA 1XC3A 3R9PA 3GDQA 1HLUA 4BQZA 1YVNA 1HUXA 4FL9A 2F9WA 3FZFA 4FWLA 4FPBA 3CHWA 4BREA 3J8AA 4DQ8A 4FSVA 1NWKA 4C23A 5AQNA 1MWMA 2YCHA 3QFPA 4M63C 1ATRA 5AQXA 4IJAA 2QW9A 3HTVA 4CZLA 4BRDA 3UKUB 3WQTA 3D7EO 4BRFA 2GEMA 3CIPA 4IZ9A 1TUUA 1BU6O 5BRFA 2AP1A 5EVZA 3MK6A 5LJVA 3FZKA 3EZWA 3A5NC 1GLLO 1NLVA 3ZEUA 2VWBA 2A5XA 3ZETB 4DHYA 2ASMA 3VENA 1KXPA 3BF3A 3FR0A 3QBXA 1GLBG 3R8EA 2AA4A 2HOEA 2I7NA 4AM6A 3HSCA 1QZ6A 3KZBA 3W0LA 3A8YA 3QB0A 1WOQA 2V51B 1BA1A 3CJ7A 3UE5A 3ATVA 3DXMA 1ZXOA 5JMVA 5BN8A 3HZ6A 5AR0A 1TYQA 5AZJA 1H1VA 2E1YA 3ZX2A 4WQ4A 5AQGA 3O4WA 4IO8A 3IUCA 3MDQA 5EOYA 3VF2A 5AQHA 3DWLA 5JLFA 4AM7A 1V4TA 5AQQA 1KAXA 3AARA 1BG3A 3HI0A 5AQIA 1TUYA 1NGGA 3JS6A 4PKIA 4XH1A 2Q36A 3MN6A 2CGJA 3SMPA 4B1VA 4EIAA 1BA0A 3A5MC 1OKJA 4WQ5C 2E8AA 3O1BA 3CQXA 3D2FB 3GBTA 3VERA 5BRDA 3F9MA 2EWSA 3DXKB 4B9QA 4FWKA 3WEEA 2P9LB 3EL2A 3BP8A 2P9PB 2Q1NA 3CJAA 3LM2A 4FWRA 3WXLA 2P9KA 2W41A 3DJCA 4BRCA 2P9UA 5BN9A 1T44A 5KPZA 3VGLA 3AY9A 4A62A 1QQOA 4BG9A 4K42A 4PKHA 1NBWA 3I8BA 4MO4A 3WQUA 1RGIA 4MLEA 1RDWX 3C7NB 3U9ZA 5AQSA 2NZTA 3TPQA 1DEJA 1LOTB 3ENHA 4Z94A 4H0TB 4GNIA 4BR0A 3VF4A 4H5VA 3TU5A 3VPZA 3VEXA 4H5WA 4A61A 1GLCG 4I6MA 4CI6A 1S3XA 1Q18A 5AQUA 1Z05A 4YDUA 1K8KB 3ATUA 5AQRA 3WUHA 4BR5A 3FZHA 3FZMA 4H5NA 5FPEA 1J6ZA 1KAZA 3I33A 5B8HA 1HKBA 1ESVA 4H0YB 4PL8A 4QS8A 4BC3A 4BRPA 1NGJA 2E1ZA 4CZFA 4M7XA 5LY3A 1RFQA 3M3ZA 2Q2RA 1HX1A 3VOVA 5F1XA 1X3NA 5AFUA 2YHYA 4BR7A 2A3ZA 4H0PA 5BPNA 1BDGA 3C0BA 4FWSA 5AZIB 5BPLA 1ZC6A 4JAXA 3EKSA 5AQVA 4EAHD 3VEZA 2I7PA 4ISGA 2FF3B 2ZWHA 1YAGA 3CJ1A 2QM1A 4CD3A 2P9NA 2CGLA 3CJBA 1MDUB 1X9JA 3H45C 3SLCA 1NGIA 3ULEB 5FPMA 2E20A 2Q31A 3H46O 5AQZA 3ZX3A 3VGMA 4JHDA 4JD2A 3A5OC 4CZMA 1GLFO 1QQMA 1DKGD 2GUPA 3LDPA 1U6ZA 5I9EB 3H6EA 4HWIA 1BO5O 3B8AX 5EX5A 2Q0UA 2IVPA 4BC2A 3AAQA 3QFUA 5AZJB 2Q97A 4CBXA 2A40A 2P9SA 3AAPA 2FSNA 3SK3A 4H0VB 5TKYA 3KHYA 2FSJA 3LDQA 3U4LA 2A6AA 4O8KA 3SMSA 3UKUA 3L6QA 5AQOA 2VYPA 1DGKN 1NGEA 5BR9A 3L4IA 2D1KA 4B1XB 3H3OB 4K43A 1NMDA 3CI5A 5AQFA 4BG8A 4FWOA 4QS7A 1JCEA 1MWKA 3ZETA 2ZF5O 4EFHA 1E4FT 2D0OA 3WEEB 2A42A 2CGKA 3BEXA 4XH5A 2QWOA 2V52B 3RSEA 2FSKA 2E2QA 1BUPA 2KHOA 2P9KB 4BVOA 4BC5A 1LCUA 4BROA 3D2EA 3CQYA 4BRAA 2PBDA 5E26A 3DAWA 1HPMA 3IMXA 1BWFO 3CJCA 4GY2B 4BR4A 1EQYA 2P9IB 3BF1A 3ID8A 4B1UB 3GE1A 2GWKA 2QWRA 5LJWA 4RTFD 4FOEA 1GLDG 4BRKA 4RCHA 1T6DA 4BVPA 5AQPA 5F2RA 4E1JA 2ASOA 3UKRA 4CZJA 2H3GX 2D0PA 1P8ZA 2QXLA 5KQ8A 3IFRA 4EHTA 1D4XA 3QBWA 3A5LC 1G99A 2ZGZA 5AQMA 4BRQA 1JCFA 3QMLA 4CZKA 3D2FA 3L0QA 4NO7A 2HF3A 4H03B 1XUPO 2P9LA 4BR2A 3U8XA 2P9PA 1U2VA 4CBUA 1HKCA 2UYTA 2WUSA 4FWNA 2ITMA 3FZLA 1MA9B 3H1QA 4BRLA 1JCGA 2A41A 2FF6A 4WYBA 3VEOA 3LL3A 1C0GA 3VGKA 2IVOA 3A0IX 4YDUC 3O5BA 3GL1A 2E2PA 3P4IA 4IJNA 2P9NB 4FWMA 5AQWA 2PAVA 3C7NA 2V7YA 4CZIA 4CD1A 4H0XB 5CE3A 2QWNA 3JXUA 3M6GA 4Y0WA 4KBOA 5BREA 1E4GT 1QHAA 4O5FA 4XEIA 5FPNA 3VEVA 4DCHA 3GOIA 4ISEA 4XH4A 5ELZA 2HF4A 5AFUH 3CJ9A 4JHDB 1K8KA 1X3MA 2GWJA 3ZEUB 4BRMA 1GLEG 2F9TA 2QWPA 3FE1A 2GELA 2J4RA 1NGBA 1ZBSA 3U9DA 4EHUA 4BRIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MLHA 3AA4A 4FK4A 4CJPA 3DRRA 3MXMA 4BDZA 1GLAG 4CIGA 3QICA 3EO3A 4CHPA 4HTLA 2BUPA 5T7BA 5AZIA 3VEYA 4FLYA 3WNFA 2QK9A 4B3RK 4K41A 1NG9A 2G8FA 4CFDA 4OLAA 3LP0A 1XWLA 2WTUA 3O08A 2F8SA 2JWLA 2QWMA 4KAZA 1RBRA 1RT3A 1C0FA 1NK8A 3S9HA 4CZGA 3VQ5A 3ULEA 5FPDA 4UQGA 4DV3K 3NF6A 1N5YA 1Q9YA 3C6TA 1VQPN 4DTSA 2YJFA 2GTDA 4DV0K 3HRGA 1D9FA 3I56N 5ADXA 4LC9B 4CBWA 3O80A 4E89A 2RPIA 4LF8K 2O8FA 1C1CA 4J8FA 3SJHA 4MDAA 4J2BA 3SUOA 4JK8A 3TTCA 2P9UB 3OW2M 4F3TA 5AQKA 2FBXA 3O8MA 4W5QA 4FLWA 2O8DB 1XMQK 1U47A 2W40A 3LP3A 1VSKA 3UKRB 2FC0A 3W3DA 5BRHA 5AQLA 1J53A 5JICA 3VQQA 4IO9L 3BUZB 1UAXA 1S1UA 4DSLA 2VG7A 2V7ZA 1WNSA 4KO0A 2ZE2A 1B9DA 2QWLA 4JK9A 5C10A 3QEWA 3DYAA 1XC9A 4KI4A 4OKEA 1JLBA 3LP1A 1BQNA 3RTVA 1QHTA 1D9DA 4DV2K 4H5TA 4OKKA 2HBMA 2DTUA 2D0AA 2P9IA 4H5RA 1VSFA 3G25A 3DI6A 3VETA 1K8AO 4O0JA 3AO1A 1R0AA 3GG4A 1LV5A 5BPMA 3CPEA 4BRGA 3PX0A 3MN5A 2VGMA 1RTJA 3CCJN 3KK7A 4ID5A 3LDLA 1YI2N 4JNEA 3O9TA 1OH8A 2YHWA 4AHUA 2X6NA 3RMAA 3V81A 5A2QO 1D8YA 4LH5A 3U3YA 3E1YA 2VCPA 3Q7BA 4Z4CA 1LWCA 3WNGA 3AA2A 3GDQA 1WAJA 1T8EA 4WFNL 3R3LA 3PV8A 1HUXA 3O9QA 3TI0A 1ZYQA 4BREA 4MQ3A 4CJUA 1A5XA 4FSVA 5AQNA 1MWMA 2YCHA 1EX4A 4M63C 1ATRA 4OGCA 1S1WA 4KHWA 3P31A 4ILJA 1RBUA 3UKUB 4CJKA 4C8LA 3ITHA 4CEBA 3PY8A 2F96A 5EVZA 2G8UA 3TAMA 1C0UA 2GUIA 1QSYA 3EZWA 1NLVA 4DHYA 5CY4A 3ZETB 1HR0K 1VRTA 4JS4A 3AA5X 3VQDA 3M8SA 3R8EA 4FJKA 4YY3K 1HYVA 1JL2A 4AM6A 1BCOA 4OPJA 3A8YA 4F3OA 1ZBFA 4LF9K 3CJ7A 4IBNA 3OS1A 5BN8A 5E41A 2QXFA 3ZX2A 3O4WA 1NKEA 2HB5A 2RF2A 4IO8A 4RW6A 4E7IA 3AGRA 1N8RO 3DWLA 1N6QA 1HQEA 4FJMA 2D0BA 1BG3A 5AQIA 1NGGA 3JS6A 2Q36A 3L8BA 2CGJA 3RVCA 3OJUA 1TK5A 1T3VA 4HVJA 3GBTA 3F9MA 4Z4GA 2EWSA 4JI8K 3EL2A 2QI2A 2KFZA 3CJAA 3CCVN 1NKCA 1QSSA 3NF9A 3S3OA 1SS6A 2W41A 4CK1A 3AVIA 2P9UA 5BN9A 4L8RB 3VQ7A 4A62A 5HBMA 1YHQN 1QQOA 1VQ9N 4IDKA 3AVMA 3LPTA 4PKHA 1NBWA 2O8DA 3JYTA 2B5JA 1LW0A 4DFMA 2O4GA 1RDWX 1XHZA 4EP4A 4JI1K 3KLGA 1DEJA 3NVKA 4H0TB 4JV5K 3VF4A 4FK0A 3TU5A 4GVMA 3VMFB 4A61A 1GLCG 4CI6A 4CEDA 1U49A 4DS4A 1K8KB 1FKPA 1E3MA 2P1JA 4H5NA 5FPEA 3RWUA 4B08A 2VQEK 4DSJA 4CJTA 3S3MA 5B8HA 3AVFA 2B6AA 4BC3A 4EZ6A 1DLOA 4BRPA 4M7XA 5LY3A 1HX1A 3CCSN 4CGHA 5F1XA 1FKOA 2A3ZA 2P51A 4H0PA 1NK9A 3EKSA 5AQVA 3VEZA 3OYDA 2QA4N 4ISGA 2FF3B 1YAGA 2E5LK 4CD3A 1VQ5N 3PIPL 1X9JA 1WSJA 3SLCA 3IG1A 1NGIA 4KH6A 3O3HA 3ULDA 5KGWA 2KZMA 3M8PA 3FFIA 2HVIA 1WBBA 3CC4N 3C6UA 1JXBA 4CVNE 3E01A 2Y1IA 4HCBA 2NRXA 4DU1A 1ASVA 3DLHA 3QLHA 1UOCA 1DKGD 3UIQA 5KRTA 3H6EA 2OPPA 3ALYA 4PHTX 1SKRA 1L3VA 1BO5O 3B8AX 3SPYA 2Q0UA 1CZBA 3SAFA 2G8WA 3QFUA 1ILYA 2UXDK 1CZ9A 4GV9A 3QINA 2FSNA 1I94K 2HHHK 5MLCQ 3BDPA 4ELUA 5TKYA 3LDQA 2FSJA 2A6AA 2OPSA 3UKUA 3NH2A 4GV3A 1DGKN 3TAQA 2G8VA 3G10A 5J2QA 1HNIA 1NMDA 4HUEA 4JI7K 4M41A 4DV1K 5JS1A 5AQFA 4E7HA 2A1SA 3P39A 1U45A 1HRHA 2WFBA 3ZETA 3EE8A 5CR4A 3M8RA 3SI6A 4B9UA 5CZ1A 1N36K 1L3UA 4JS5A 2FSKA 4ICLA 3WNHA 2P9KB 3ZSQA 4ELTA 3ZSXA 1IKXA 1TK8A 1Q9XA 5SZTA 3D2EA 5KGXA 4DWIA 4CCHA 3NGIA 3DAWA 4E1NA 4W5TA 3V9ZA 3IMXA 1BWFO 3CM6A 4GY2B 1EQYA 2XY5A 4B1UB 2BDPA 2FBTA 4CFAA 4CGJA 5H1SQ 4IOXA 4FOEA 4GKKK 1TKDA 4IOAL 4BVPA 1C0TA 5GINA 4HTUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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