2E2NA

Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in the apo form
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
MMIIVGVDAGGTKTKAVAYDCEGNFIGEGSSGPGNYHNVGLTRAIENIKEAVKIAAKGEADVVGMGVAGLDSKFDWENFTPLASLIAPKVIIQHDGVIALFAETLGEPGVVVIAGTGSVVEGYNGKEFLRVGGRGWLLSDDGSAYWVGRKALRKVLKMMDGLENKTILYNKVLKTINVKDLDELVMWSYTSSCQIDLVASIAKAVDEAANEGDTVAMDILKQGAELLASQAVYLARKIGTNKVYLKGGMFRSNIYHKFFTLYLEKEGIISDLGKRSPEIGAVILAYKEVGCDIKKLIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEXOKINASE
molecule tags Transferase
source organism Sulfolobus tokodaii
total genus 109
structure length 298
sequence length 298
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2nA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2nA01
3GOIA 4BRIA 4FWKA 3HSCA 3JS6A 3A5OC 5ELZA 4BR9A 4CI6A 4NO7A 1E4FT 4H5RA 1GLLO 1TUYA 3VGKA 3EKSA 1BO5O 2VCPA 3CJAA 3L0QA 5F0XA 4CZHA 4WQ4C 5B8HA 5AQMA 2GEMA 3H45C 4H5TA 2Q0UA 2FSJA 3SMSA 3FR0A 3WXJA 4FWOA 5JLFA 1U6ZA 4CZJA 2E88A 3ZEUB 4KBOA 4BRGA 5AQLA 3LM9A 2P9KB 3H46O 4JD2A 1T44A 2QWOA 3KHYA 3FZFA 2F9WA 4FWNA 1CZAN 3BUZB 4I6MA 5AQNA 5E26A 4JN4A 2D4WA 1XQSC 5AZJB 4EIAA 2P9NA 1BA0A 2CGKA 3M6GA 2CGJA 3GE1A 3QFPA 2V52B 1HLUA 4BREA 4CBWA 4BRKA 3F9MA 1OKJA 2FF3B 4FWRA 3ZX0A 1JCGA 3O80A 1NGIA 4HWIA 1DKGD 4MLEA 4FPBA 3UB5A 2HMPA 1LCUA 1HX1A 3IDHA 4IJNA 3CIPA 4H0YB 1GLEG 2GUPA 2UYTA 3L4IA 3TU5A 1RGIA 1QQMA 3QFUA 4B1VA 1NGFA 3CJ1A 2I7NA 4BC5A 4CBXA 5BN8A 2QWMA 4JAXA 2YI1A 5EXWA 4H0OA 2A42A 2GWJA 1XC3A 3FZMA 3D2EA 4FO0A 4H5NA 4JD2B 3KVGA 1DEJA 4FOEA 4O8KA 4CJ7A 1J6ZA 2NRHA 4IXCA 4BRMA 4I6MB 1NGEA 4BR0A 2ASMA 5AQSA 3OHRA 5JMVA 4CZEA 3VEXA 3HTVA 1HKBA 4PKHA 4Z94A 4M7YA 2BUPA 5AQJA 2ZGZA 2ZWHA 1G99A 3CJ7A 3VETA 4IO8A 3U8XA 1TYQA 1NGDA 3A0IX 1GLAG 1U2VB 4BGBA 2QM1A 5AFUA 4WQ4A 2V7YA 5BPMA 3BF1A 2ZF5O 4E1JA 2ASPA 4B1XB 4DB3A 2FF6A 5BPNA 3WXLA 4ISEA 3D2EB 1E4GT 3QMLA 2A5XA 5AQOA 1H1VA 3UKRA 4H0XB 4IWVA 3L6QA 4BC4A 5BRFA 2VWBA 3WQUA 3LDQA 4QS7A 4BRQA 4EFHA 4BR2A 3TPQA 3H6EA 2V7ZA 2ZGYA 3I8BA 2Q31A 1ESVA 2P9UB 5AQHA 3A5LC 3ZEUA 2Q36A 1S22A 1YVNA 1V4TA 5FPNA 5KPRA 4WYBA 3FZLA 2P9SB 3GBTA 3S41A 4BC3A 5AZJA 3EO3A 1TYQB 5AQUA 5FPMA 4BRAA 1BG3A 5EOYA 4A2AA 4JNEA 4FOIA 4CBUA 4EHTA 2QXLA 1ZXOA 2FSNA 2A41A 3M3ZA 3HM8A 4PKIA 1HJOA 3UKRB 1P8ZA 3VGMA 1XUPO 5BRDA 5AQIA 5EVZA 2NZTA 2YHYA 3DAWA 3DXMB 4K25A 3MDQA 3CJ9A 3DJCA 4FWSA 3VF6A 2GELA 2QW9A 4NB4A 2QWPA 3WUHA 4CD3A 3LDOA 1Z6RA 4BRDA 3CQXA 2P9IB 2VYPA 4CZLA 3MMVA 5AQQA 5AQRA 4PL7A 5KQDA 5AFUH 1GLDG 2CH6A 2W40A 3MCPA 2KHOA 4ISFA 3BP8A 4BR7A 5KPTA 4HTLA 3MK6A 1BUPA 1Y64A 2E8AA 3AY9A 2PAVA 5BREA 5E84A 1Z05A 5AR0A 4BROA 1QQOA 2A40A 4RCHA 3MN5A 5AZIA 1U2VA 4B1YB 4CZIA 3QDKA 4Y0WA 3RSEB 5BR9A 1GLBG 1JCEA 4L3QA 1NGCA 4WQ5C 3VOVA 2YHXA 4H5VA 5EX5A 1NMDA 4XH1A 4AM6A 4BRPA 4CZKA 1YUWA 1MDUB 3HZ6A 4DCHA 4CZGA 1GLJO 1RDWX 3O6WA 3QB0A 5AQXA 1YAGA 1KAYA 3H1QA 4MLHA 3U9DA 2P9UA 3FLCO 4GNIA 4JHDA 5TKYA 4DQ8A 1BWFO 2IVOA 2P9SA 4XH5A 4XEIA 3B8AX 1QZ6A 4FWLA 1HPMA 4CZMA 1RFQA 2GTDA 2QWQA 5AZIB 3ENHA 3QBWA 4BQLA 4H0TB 3VPZA 2P9PB 4CZFA 3DWLA 1HKCA 4C23A 4IJAA 5EY4A 3KZBA 3O1BA 3D2FB 3P4IA 3LDNA 5JICA 5AQFA 5LJVA 4FWQA 2OANA 1KAXA 3D7EO 2F9TA 3DXMA 3SLCA 4B1ZA 5LJWA 1ZBSA 3O08A 3QICA 4BR4A 5AQPA 1NBWA 3VEZA 1DGKN 3MN9A 1KAZA 3FZKA 3GL1A 4M63C 3SK3A 4JHDB 3VGLA 3VERA 3U9ZA 5LY3A 2ASOA 2P9IA 4EHUA 3A8YA 3AARA 3AAQA 1X3NA 2EWSA 3EL2A 3MN6A 4O5FA 3A5NC 1GLFO 3CJCA 1T6CA 4PKGA 2CGLA 2DPNA 3DXKA 4A2BA 4H0PA 3ZX3A 1NWKA 2D1KA 4WQ5A 3J8AA 3FZHA 1HKGA 2YHWA 2E1YA 3VEVA 3M1FA 4B1UB 3VF4A 3WQTA 4J8FA 1TUUA 2J4RA 1QZ5A 4BVOA 1WOQA 2IIRA 3RSEA 5AQTA 3CETA 2CH5A 2HF4A 3CERA 2E2OA 2AA4A 3I33A 1NGBA 4QS8A 2Q97A 3ENOA 3O8MA 3FGUA 2E2NA 4RWTA 3EZWA 1NGHA 1EQYA 2GWKA 2E20A 4LC9B 3UKUB 2P9LB 1R59O 3VF2A 3H1VX 1T6DA 4H03B 5AQWA 1ATSA 2AP1A 3O5BA 3DXKB 3ULEB 1K8KA 5FPDA 3HI0A 4BG9A 5AQYA 1X3MA 3VENA 3HBTA 3CI5A 2ITMA 4H5WA 5AQVA 3IFRA 2IVPA 4BRNA 2YCHA 3LM2A 3CQYA 1Q18A 1QQNA 3CJBA 2FSKA 1MWKA 1KXPA 4FWMA 4B9QA 4BC2A 4K41A 4BG8A 3ZX2A 4MO4A 3R9PA 4YDUC 4BVPA 5JLHA 4CD1A 5FPEA 4K43A 2FXUA 3WEEA 3ATVA 4BQZA 2NLXA 2P9PA 2QWRA 5ADXA 4BRHA 3W3DA 3IUCA 1X9JA 2BTFA 1BU6O 3D2FA 5F2RA 4DHYA 3EN9A 4B1WB 1LOTB 1S3XA 1NGAA 3JXUA 1NGGA 3C0BA 3SMPA 3IMXA 2A3ZA 5BPLA 4M7XA 3ZETA 4GY2B 2YJFA 4FWPA 1K8KB 1YXQA 2Q1NA 4ISGA 4PL8A 1SZ2A 1HUXA 2E2QA 1SAZA 2QWLA 1NM1A 3GG4A 1MA9B 1GLCG 1QHAA 2Q2RA 4FSVA 3VEWA 2HOEA 3GDQA 4MO5A 5AQGA 3FE1A 3CHWA 2Q0RA 5I9EB 3EKUA 3WEEB 2QWNA 4A61A 2P9NB 3ID8A 4AM7A 3R6MA 1SQKA 2PBDA 1ZC6A 3G25A 5F1XA 2A6AA 3AAPA 5AQKA 4BR5A 3O1WA 4H0VB 2IVNA 3H3NO 4BRCA 3FFKB 2E1ZA 3SJHA 2E2PA 1BOTO 3LDPA 3C7NA 2H3GX 2V51B 2FLOA 3ZETB 3A5MC 1C0FA 5KQ8A 1IG8A 2I7PA 4F9OA 4K42A 4XH4A 3ATUA 1D4XA 3UKUA 4IZ9A 2P9LA 4QS9A 2D0PA 2HF3A 3BF3A 3VEOA 1C0GA 2W41A 3LDLA 5AQZA 3ULEA 2YJEA 4YDUA 5CE3A 5ADXH 3U4LA 5BN9A 1ATNA 4A62A 3VESA 1ATRA 1BA1A 1MWMA 4FPAA 1V4SA 3BEXA 3O4WA 3LL3A 3MN7A 1NLVA 2P9KA 3QBXA 5KPZA 4EAHD 1NGJA 4RTFD 3W0LA 5BRHA 4BGAA 1IJJA 4BRFA 1JCFA 2D0OA 3R8EA 1WUAA 3H3OB 3WXKA 3WXIA 3VEYA 4BRLA 3C7NB 2WUSA 3WT0A 1BDGA 3UE5A 4FL9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ICLA 4F8RA 1HQUA 4J2DA 4PWDA 3JS6A 4ILGB 5JVHL 1UWBA 4Q0BA 4H5RA 4B3RK 1X1PA 4CEZA 4M3UA 3QESA 3L0QA 3SI6A 4FM2A 4JI5K 4LH5A 5AQMA 4C8LA 2GEMA 2EHGA 4NXMK 3N4PA 3FR0A 3CCSN 1KFSA 2D0BA 2YV0X 2W42A 2HMIA 4JLHA 1TK5A 3H46O 4GKJK 3KHYA 2F9WA 3OJSA 3BUZB 2F96A 3KWGA 2D4WA 2UXDK 4NYNA 5M1QA 1WSFA 5A2QO 1NK0A 2CGKA 3M6GA 2CGJA 3CFOA 2V52B 1OH7A 4E19A 1O13A 4X64K 4BRKA 4JKBA 1QS4A 2D5RA 2W6LA 1WSEA 1HX1A 2P51A 3CPWM 3IDHA 3CIPA 4BE0A 3HP6A 1GLEG 3TAEA 2UYTA 1EP4A 1C1AA 2O8EB 3QFUA 4B08A 2I7NA 4M42A 1YTAA 2QWMA 3OYBA 3ASMA 2A42A 3QEXA 1WLJA 2GWJA 4CEFA 4JD2B 4JEPA 3O9UA 4FM0A 1BCMA 1J6ZA 4FZXC 2NRHA 3VQCA 3QNOA 3H08A 2UU9K 3OHRA 2JLEA 2RN2A 1HKBA 1Q9YA 5DMRA 4Z94A 2BUPA 1TKXA 3OJUA 1RCHA 3RR7A 4JI4K 4JRQA 4XIUA 4IO8A 1KCFA 4B9UA 3S3NA 4LY7A 4AF1A 1KC8O 2E6MA 1NGDA 4KTWA 3K5MA 4DKWA 4E7JA 1GLAG 1U2VB 3LDSA 2QM1A 5AFUA 1N8RO 4B3TK 2B4JA 2V7YA 4WQ4A 4DSIA 1RTHA 3DRRA 1IKVA 4B1XB 1OVQA 1C1BA 5HRRA 4WF9L 1L5UA 1VSFA 4LH4A 4KPYA 1E4GT 1H1VA 4GW6A 3UKRA 4IWVA 3TANA 3L6QA 4KTZA 4GMJB 3CCLN 2UUAK 3LDQA 3V9XA 2VG6A 3SJJA 1JKHA 4BR2A 3THXB 3HOTA 1ASWA 2V7ZA 4NCAA 3I8BA 2Q31A 2HHWA 3VMFB 1S22A 1YVNA 4F2RA 5LMUK 2ZJQL 4Z4FA 5KPRA 3WXMB 4DR7K 2P9SB 3I0RA 1TKDA 3AO1A 5AZJA 3EO3A 3CC4N 5AQUA 3NGIA 3VQBA 4FJIA 4E7LA 3AVMA 4HCCA 4BE1A 1Q81O 2O8FB 3TTCA 4LF6K 1ZXOA 4Q5VA 2A41A 3IS9A 3HM8A 3K59A 4BDPA 1HJOA 3AA5X 4CEQA 4RW8A 4N76A 3K2PA 3K9KA 4QAGA 4M3ZA 1BI4A 2PYJA 3AVAA 4K25A 4DQQA 2QK9A 4CF2A 2QWPA 3LDOA 2KTQA 4B9TA 3KLEA 4JK9A 2P9IB 2HSTA 2IOCA 3AVJA 5AFUH 3T1AA 4KFBA 3LZIA 4KHWA 3MCPA 4ISFA 3BP8A 3AO3A 4HTLA 2QA4N 3TSPA 1J54A 3NF6A 3HXMA 5E84A 1TGOA 5AR0A 4BROA 2DY4A 4YY3K 5IT9O 5GADP 3V9WA 4RW7A 2PZSA 4Y0WA 3HT3A 5BR9A 3OS1A 1BIZA 4DR2K 4XH1A 4JRPA 4AM6A 3J7ZO 3HP9A 1GLJO 3QB0A 3O6WA 3QNNA 1HNZK 1KSPA 1K73O 3U9DA 4RW4A 2HNZA 1RDUA 3E9PA 5TKYA 2WC9A 1ASVA 4DTXA 3WNFA 3CCMN 3ZT4A 2IVOA 1SL2A 4CGFA 4KH6A 3B8AX 4KI6A 3V81A 3D6RA 2GTDA 4DTUA 3ENHA 3QBWA 1XNQK 1VHXA 2ATQA 3SV3A 4BQLA 3RMDA 3AVLA 1NK9A 2Z1HA 4OX9K 2OTJN 1CXUA 3O4QA 4CK2A 3ITHA 2P9PB 2QTDA 5T7BA 2PFUA 3SAGA 4DV7K 4HUEA 4X65K 4CJQA 3LDNA 5JICA 5LJVA 5D3GA 1EO1A 2OANA 2G8FA 3DXMA 4DF8A 1Q8IA 1ZBSA 1WN7A 3QICA 1KQSM 3VEZA 1W0HA 5HRNA 3G10A 1KAZA 3SK3A 3VERA 4HTUA 2QXFA 4CEBA 3AAQA 4DU4A 1RTJA 4O5FA 3A5NC 3LALA 1C0UA 1GLFO 5CZ1A 2HVIA 1T6CA 2YNHA 5GAEP 3DXKA 3CD6N 1RILA 4CJKA 1ZYQA 4LF7K 4KHYA 4WQ5A 3FZHA 2YHWA 3VEVA 3PSIA 4YNQA 2UXCK 3QIPA 1WSIA 1TUUA 4KHNA 1QZ5A 1NJYA 1JJ2M 2B5JA 3WNGA 1K6YA 2IIRA 4I9LA 3CERA 4DSEA 3J80O 3NAEA 3OYMA 1BIUA 4G9ZA 1RT7A 3O8MA 3EZWA 1RT4A 1EQYA 3C94A 1NKEA 4LC9B 2E20A 4EZ9A 3UKUB 1T7PA 3KWIA 1X9MA 1NG9A 1ATSA 4JS4A 1VQMN 1S1UA 3MXMA 1K8KA 1S1WA 5FPDA 1D9DA 4CK1A 3L8BA 1RTIA 2UXBK 3QIOA 4AHUA 2ITMA 3IFRA 2OTLN 2YCHA 5HL7L 3CQYA 2FSKA 1KXPA 1MWKA 5HLFA 1ZBHA 3VQ6A 4HVJA 4MO4A 3R9PA 2ZQBA 4JKEA 4BVPA 1VQPN 3DOKA 4IEIA 4CD1A 5EU7A 2Z1IA 3ATVA 4YORA 2NLXA 3ZT0A 1KVAA 3VQ8A 5ADXA 4DR5K 2AJQA 2Y1JA 3W3DA 1S1VA 4JKHA 5J2PA 1VQKN 1LAWA 4DR6K 3D2FA 4HUFA 5F2RA 4DHYA 1LOTB 3LPTA 4NCBA 1S3XA 3C0BA 1YI2N 3NF9A 4CESA 5IWAK 5AJ3K 1VSEA 3NF8A 3SAHA 3LWLA 4DS5A 1HUXA 1TKTA 5SWMA 3NDKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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