2E2NA

Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in the apo form
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
MMIIVGVDAGGTKTKAVAYDCEGNFIGEGSSGPGNYHNVGLTRAIENIKEAVKIAAKGEADVVGMGVAGLDSKFDWENFTPLASLIAPKVIIQHDGVIALFAETLGEPGVVVIAGTGSVVEGYNGKEFLRVGGRGWLLSDDGSAYWVGRKALRKVLKMMDGLENKTILYNKVLKTINVKDLDELVMWSYTSSCQIDLVASIAKAVDEAANEGDTVAMDILKQGAELLASQAVYLARKIGTNKVYLKGGMFRSNIYHKFFTLYLEKEGIISDLGKRSPEIGAVILAYKEVGCDIKKLIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEXOKINASE
molecule tags Transferase
source organism Sulfolobus tokodaii
total genus 109
structure length 298
sequence length 298
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2nA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2nA01
5AQGA 1SAZA 1TYQA 2VWBA 3WXLA 4CZMA 5LJWA 2NLXA 2QWOA 1NWKA 4CBWA 4MO5A 2QW9A 3DXMA 3KHYA 3FFKB 3LL3A 1RGIA 4WQ5A 4K25A 3DJCA 4JN4A 4B1YB 4GNIA 3D2EB 3G25A 3ZEUB 2IVOA 3CQXA 5AZIB 2EWSA 5BPNA 4EHUA 4O8KA 1NGHA 5ADXH 2J4RA 1JCEA 2D0OA 3GOIA 3DXMB 1YAGA 1GLDG 4IWVA 4WQ4A 2F9WA 2YCHA 1S3XA 3IFRA 4H0XB 1BA1A 1NGBA 2V7YA 4JHDA 4FWNA 3L4IA 3QBWA 3R6MA 2E2OA 2D1KA 3D7EO 4WQ5C 1KAYA 4H5TA 4A61A 1H1VA 2OANA 3IUCA 4FOIA 1V4SA 4BC5A 1D4XA 1ATNA 4J8FA 4IXCA 3CJBA 3R8EA 2VYPA 2GWKA 5FPDA 4FWSA 5AQNA 4BRKA 2FSJA 1TUUA 4IZ9A 3BP8A 1BG3A 3GBTA 3O1BA 3AY9A 5AQMA 4FWOA 2P9NB 5AQQA 5AQVA 4H5NA 2UYTA 3DXKB 1ZC6A 4A2BA 1E4FT 3C0BA 4JNEA 4WQ4C 3CJAA 3AAQA 5AFUA 5LY3A 4FWLA 4M7XA 3A8YA 4PL8A 2V51B 5KPZA 1DKGD 5AQJA 5AR0A 3QFPA 4B1UB 2D0PA 2E8AA 5BN8A 4CJ7A 5AZJA 2A40A 4B1WB 3SK3A 3FGUA 3S41A 3GG4A 4H5RA 4NO7A 3U9ZA 3CERA 3FE1A 5AQZA 4PL7A 1BUPA 3LDOA 5I9EB 1BU6O 1BWFO 4Y0WA 4AM6A 4BRLA 1IJJA 2A6AA 2PBDA 2YHWA 2QM1A 5TKYA 3SMSA 2A5XA 1QQOA 4FSVA 4NB4A 4BG9A 4BR7A 4H0OA 4I6MB 1NGGA 3H1QA 4L3QA 2V52B 1BA0A 4B1XB 5LJVA 1DGKN 1JCGA 4CD1A 2QWMA 4FWQA 1P8ZA 2GTDA 2Q36A 2QWQA 1MDUB 1NGEA 3KZBA 4ISGA 2YHXA 3SLCA 3LDPA 1V4TA 3UKUA 4K42A 2WUSA 2HF4A 2DPNA 3I8BA 5KPRA 3TU5A 5AQXA 4BR5A 1NGJA 5AQHA 1HLUA 3JS6A 3ZX2A 4BRFA 3WQTA 3O80A 2FXUA 3WXKA 4F9OA 1LOTB 1EQYA 1ZBSA 3ZX3A 2BUPA 1ATRA 1YUWA 1WOQA 3CIPA 3VEZA 1IG8A 3UE5A 4BC4A 2YJFA 2KHOA 3H3NO 2QWNA 4M7YA 2Q0UA 4EIAA 3EL2A 3VEWA 3MMVA 2IVPA 4ISEA 3VGKA 3ZETB 2AP1A 3O8MA 4PKGA 5ADXA 2P9PB 1DEJA 4K43A 4A2AA 5JICA 3HBTA 2I7PA 2PAVA 2H3GX 2E2PA 4FWKA 1Z05A 4FPBA 1T6DA 2A41A 4A62A 2QXLA 1ESVA 3VEVA 3FZMA 4DCHA 3CJCA 2IVNA 1TYQB 4Z94A 2FF6A 2HF3A 2P9LA 1NGAA 3MCPA 4YDUA 2E1YA 2HOEA 3I33A 3FR0A 3A0IX 3O1WA 2FSKA 2P9IA 4BGBA 1BDGA 3M1FA 5BREA 3CJ7A 2A42A 3WT0A 3ATVA 5ELZA 3RSEA 2W41A 4BRGA 3BEXA 3M6GA 4H5WA 3DAWA 2Q1NA 3ULEA 3H3OB 5AQOA 3L6QA 5EVZA 1KXPA 3QICA 4H5VA 1J6ZA 3BF3A 2E2QA 1G99A 4FWMA 4BVOA 4WYBA 2CH6A 1JCFA 4CD3A 4PKHA 4BRQA 5AQPA 4CZJA 1NGIA 1U2VA 1HPMA 3P4IA 5AQIA 5FPNA 1GLEG 4JHDB 1HX1A 4AM7A 3MN9A 4JD2A 5AQFA 4LC9B 5AQTA 4EAHD 4BQLA 2QWRA 1HUXA 4CI6A 3CJ9A 1QZ6A 4MO4A 5KQDA 3FZFA 2HMPA 3VGLA 3VEOA 2ASPA 2F9TA 1QHAA 3IDHA 3LM2A 1LCUA 1KAZA 1QZ5A 4IJNA 4BR0A 3BUZB 1X3MA 3FLCO 3LDNA 1WUAA 4FOEA 2AA4A 4IJAA 3LDQA 5EXWA 2ZGYA 3SMPA 5KQ8A 4JAXA 1HKCA 2V7ZA 2NZTA 1TUYA 3UKRA 3WUHA 4RCHA 4BGAA 2ASOA 5AZJB 3U9DA 3W0LA 3H46O 3VF4A 4BG8A 4CZGA 1X9JA 4CZIA 3GL1A 3LM9A 4BRPA 4RWTA 3VETA 1C0FA 1GLFO 4CZEA 5KPTA 3QDKA 2YI1A 3W3DA 3IMXA 5AFUH 2P9KA 3EKSA 3H1VX 5AQYA 1K8KA 4CZLA 2I7NA 1Z6RA 3U4LA 4XEIA 4FO0A 5F2RA 4MLHA 3GE1A 3MDQA 1NGCA 3H6EA 4C23A 4BQZA 5AQKA 3WQUA 2GWJA 3ENOA 2D4WA 3O4WA 3HTVA 3UKUB 2P9UA 4H03B 2NRHA 5BPLA 3H45C 3F9MA 4BRHA 3AARA 5BRHA 3SJHA 3D2FA 4CZKA 1SQKA 1HKGA 4BRDA 2QWLA 5EY4A 4GY2B 3MK6A 1E4GT 1GLBG 3OHRA 4KBOA 2GEMA 3VF2A 3J8AA 3AAPA 4H0TB 5FPMA 2FSNA 4QS9A 4H0VB 4BRCA 1RFQA 3D2EA 3UB5A 5BRFA 2P9UB 4E1JA 4BRNA 3ENHA 3DWLA 4PKIA 4XH1A 3ZEUA 5AZIA 4H0YB 4BREA 3LDLA 1C0GA 3D2FB 3FZLA 5BR9A 1Y64A 3HI0A 1ZXOA 3VERA 5BPMA 2Q97A 1MWKA 5EOYA 2A3ZA 4BRIA 2E2NA 2Q31A 4CZHA 2P9LB 3EN9A 3VPZA 4DQ8A 3MN7A 2CGLA 4CZFA 4DHYA 3VOVA 3VESA 5AQLA 4FL9A 2P9IB 2CGJA 4FPAA 5BN9A 4HWIA 3WXIA 1CZAN 3ZX0A 4O5FA 5E26A 5AQUA 4YDUC 3QB0A 3MN5A 3RSEB 1NGDA 1R59O 3EZWA 3CJ1A 5EX5A 4QS7A 1BO5O 2E1ZA 3JXUA 3ULEB 2P9NA 3FZHA 4BROA 3VENA 5JLFA 3A5MC 4FWPA 3DXKA 2FF3B 5E84A 1XC3A 1S22A 4BVPA 4BRAA 2P9SA 3QFUA 3R9PA 3CHWA 3EKUA 3FZKA 1U2VB 2E20A 2Q0RA 3HZ6A 5B8HA 1QQNA 4DB3A 1KAXA 1Q18A 1NBWA 3A5OC 5F0XA 5AQSA 4QS8A 3QMLA 4CBUA 2ITMA 3ID8A 4BR2A 2BTFA 4JD2B 5AQRA 2YHYA 1YVNA 2ZGZA 5FPEA 5F1XA 4IO8A 2QWPA 5JMVA 4M63C 3GDQA 4EFHA 1HJOA 2P9SB 3CI5A 4HTLA 4B1VA 1GLLO 3L0QA 3VF6A 3CETA 4RTFD 4BC2A 1NMDA 3KVGA 4CBXA 2GUPA 4I6MA 3C7NA 3U8XA 2E88A 1T6CA 2VCPA 5CE3A 2CGKA 1GLJO 4BRMA 5BRDA 1ATSA 3B8AX 3VEYA 1RDWX 4BR9A 3WXJA 3QBXA 4B9QA 4H0PA 1NM1A 3WEEA 3VEXA 3A5NC 2YJEA 5AQWA 3M3ZA 2ZWHA 1NLVA 1OKJA 3C7NB 3UKRB 4B1ZA 3O6WA 5JLHA 3MN6A 1GLCG 3O5BA 4FWRA 1YXQA 4EHTA 2ASMA 1X3NA 4MLEA 3O08A 3HM8A 4XH5A 1MA9B 3WEEB 1NGFA 4XH4A 2P9KB 1HKBA 4ISFA 2FLOA 1U6ZA 2W40A 3A5LC 1GLAG 4K41A 1K8KB 2ZF5O 3HSCA 1XUPO 1MWMA 3ZETA 1QQMA 1XQSC 2P9PA 2CH5A 1BOTO 3ATUA 1T44A 3BF1A 4BC3A 2Q2RA 2IIRA 3CQYA 3TPQA 1SZ2A 2GELA 3VGMA 3EO3A 4BR4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5J2MA 1IBKK 2Z1HA 3HO1A 4CF8A 3CCRN 4B3TK 4M3XA 5HOOA 3MWPA 5LJWA 2NLXA 4PA1A 2QWOA 5FLXO 1HMVA 4CBWA 4MO5A 3DRPA 2QW9A 4JKHA 3EZ5A 3F5TA 3HPOA 2QXFA 4FJ7A 4GNIA 3AA4A 3HXMA 3ZEUB 2IVOA 4FJ5A 5BPNA 3O3FA 3VTIA 3J7ZO 2J4RA 1RDAA 3QLHA 5FROA 1RBRA 4LH5A 1EWQA 2YCHA 3WNHA 4DMNA 4H0XB 4JKBA 3KWGA 2V7YA 4JHDA 4F3TA 3D7EO 1KAYA 4A61A 1H1VA 3HVRA 3D6RA 4J8FA 3CJBA 4JI3K 3R8EA 3BZKA 3CC7N 4F4KA 4KH4A 1C0UA 4Y1CA 1TUUA 4IZ9A 1HQEA 4N5SA 2UXBK 4JRQA 3L2UA 5AQVA 3MXJA 3G6EN 1TK0A 1ZC6A 2O8DB 1E4FT 4B9TA 3DLEA 4B9VA 4FJKA 1E3MA 3AAQA 5LY3A 3QEPA 3SAHA 4M7XA 3A8YA 4PL8A 4B9UA 4Z4HA 2Q3SA 5KPZA 1CZ9A 3QFPA 3DLKA 2E8AA 4CJUA 3L2WA 4OX9K 1O1WA 3F2KA 2A40A 3CC4N 4B1WB 3SK3A 4K0KK 3S41A 1EO1A 2OTLN 2NRWA 2HHXA 2X6SA 3ENBA 2PBDA 4RW9A 1J5EK 2YHWA 3SMSA 3AV9A 1BL3A 1QQOA 4FSVA 3CMEN 3K59A 4O8UA 4A5AA 5EU7A 4DSFA 4KH5A 2YNGA 4FCYA 1KLNA 1JCGA 1A5XA 2G8VA 2QWMA 4NXMK 2GTDA 4KHPK 2KZZA 2VQFK 3BDPA 3UKUA 1ZBHA 4LF7K 3ZSRA 3OYKA 2HF4A 2BANA 2DPNA 4YFUA 2O4GA 1NGJA 5AQHA 3K9JA 4BRFA 4CJLA 4IOXA 4F9OA 1LOTB 1EQYA 1ZBSA 4IOAL 1YUWA 1VQ8N 4DV1K 1BI4A 1RTIA 3VEZA 3AVNA 3LP0A 4CF1A 3UE5A 2KHOA 3H3NO 4B9SA 2R7YA 1KD1O 4FLVA 3HK2A 3O8MA 4K8XA 1VSDA 5ADXA 1U04A 1S1WA 3QINA 4KHWA 5JICA 4YY3K 4LF6K 1TKXA 3ZT1A 3SQ4A 2H3GX 1Z05A 1TYQB 5GAGP 1NGAA 3P38A 1NJYA 1VQ7N 1K6YA 1ZYQA 3PIPL 4BGBA 3OYNA 3OYJA 1YTAA 3WT0A 1YJNN 3MEDA 5C0YA 4BRGA 3BEXA 1XHZA 4CHOA 3RR7A 3QICA 3HL8A 4ILGB 4FWMA 1G99A 3THWB 4I2PA 4WYBA 3RWUA 3ZT4A 4CEEA 4CD3A 4PKHA 5HBMA 1RT6A 4CZJA 3KWIA 1D9FA 4CHQA 3CM6A 1HPMA 2BDPA 4CFCA 5SWMA 5AQIA 3JYTA 3THXA 4PQUA 3ZSXA 3MN9A 5M1QA 3QIPA 2Z1GA 3ZYYX 5J2PA 3ITHA 4BQLA 5GAHP 1HUXA 4CI6A 4EP4A 1W2BM 2X6NA 1QZ6A 3C65A 4CE9A 4MO4A 4PUOA 3AA5X 5MLCQ 2QA4N 3VEOA 3THXB 1QHAA 1DT9A 2HBJA 5LL6Z 1Q86O 3NFAA 1QZ5A 4AF1A 4L8RB 3FLCO 2D0AA 3AO3A 1KQSM 1XNQK 3CCQN 1WUAA 3G71N 2O8CA 3NAEA 3KK2A 1HKCA 2YKNA 4CESA 2IGIA 2E6LA 3BY5A 3J7YP 1QSLA 2ASOA 3U9DA 1RDUA 4HCBA 1JLFA 4CJ3A 4CZGA 1X9JA 1EP4A 5AJ3K 4F2SA 4CZIA 1KC8O 3SV3A 4YORA 1VQNN 3VQ8A 1HNWK 5KPTA 3AVHA 3W3DA 3IMXA 4DV2K 2HSTA 3OJSA 2G8WA 5GAEP 1VSFA 3DOKA 1K8KA 4CZLA 1Z6RA 4B3OA 3L4QA 4XEIA 1QTMA 3JAMO 4MLHA 4KPYA 1NGCA 3HP6A 1T05A 3RRHA 1C1CA 3T7ZA 4N76A 4QCLA 4HVJA 4OPKA 1TK8A 2NRHA 4B8AB 4YOTA 3VQPA 1SKSA 1JXEA 3AARA 5BRHA 1FXXA 4CZKA 1SQKA 1RILA 4E89A 5EY4A 3D0PA 4GY2B 3VQ6A 5FRMA 2Y1IA 3O4QA 4JEPA 3KK7A 1TV6A 1D5AA 4CIEA 2YX6A 5BRFA 1XNRK 4YNQA 3KD1E 3DWLA 4PKIA 1L3VA 1N5YA 5AZIA 4CF2A 3QNNA 4CJWA 4BE2A 1C6VA 3OYGA 4KB0A 2UUAK 1WLJA 3ZSOA 4OKEA 1ZBLA 2Q97A 3K9KA 1L5UA 1GOCA 4R79A 3NVKA 4DWIA 1HJRA 1WAFA 2CGLA 2LSNA 1TL1A 3VOVA 3OS1A 1HQUA 1QE1A 5AQLA 2P9IB 3MAQA 4JI4K 1CZAN 4CEFA 2PYJA 4CGDA 1VK0A 1NGDA 4F2RA 4YOVA 3CJ1A 5H1SQ 4BDYA 3ULEB 4DR7K 3FZHA 4C1NK 3CMAN 4NCBA 5JLFA 3F9KA 4C8NA 3DXKA 1HRHA 4CHPA 5E84A 1XC3A 2I5JA 1S22A 1IG9A 3CHWA 5HL7L 1UWBA 3DM2A 3FZKA 4JKGA 4CK3A 1N8RO 2Q0RA 2PZSA 5B8HA 1QQNA 4E3SA 4CGFA 4FJJA 2KFZA 1Q18A 1NBWA 5HRSA 1U4BA 5F0XA 4QS8A 3SZ2A 4B9MA 4CBUA 2ITMA 4BR2A 3DLBA 5AQRA 4DTNA 2YNIA 4I9LA 5KGWA 4AHUA 1HJOA 3P31A 1GLLO 5CYMA 4JKGB 4CBXA 2ZJRL 2IS3A 1YJ9N 4JKCA 4CHYA 1JLCA 1HR0K 2F8SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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