2E2PA

Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in complex with adp
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
MMIIVGVDAGGTKTKAVAYDCEGNFIGEGSSGPGNYHNVGLTRAIENIKEAVKIAAKGEADVVGMGVAGLDSKFDWENFTPLASLIAPKVIIQHDGVIALFAETLGEPGVVVIAGTGSVVEGYNGKEFLRVGGRGWLLSDDGSAYWVGRKALRKVLKMMDGLENKTILYNKVLKTINVKDLDELVMWSYTSSCQIDLVASIAKAVDEAANEGDTVAMDILKQGAELLASQAVYLARKIGTNKVYLKGGMFRSNIYHKFFTLYLEKEGIISDLGKRSPEIGAVILAYKEVGCDIKKLIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEXOKINASE
molecule tags Transferase
source organism Sulfolobus tokodaii
total genus 104
structure length 298
sequence length 298
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2pA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2pA01
2FSNA 4WQ5C 5BR9A 4BR0A 4BRPA 1V4SA 3I8BA 4MO5A 3MN6A 2Q97A 1ESVA 4CZFA 3VGKA 5LJVA 4FWNA 4CD1A 2V7YA 4BGBA 4CBXA 3EO3A 2P9IB 3R6MA 4JN4A 4FWPA 1ZC6A 3FZKA 1HKGA 5BREA 1XUPO 3LDPA 2YJFA 3CJCA 3ZEUB 2V7ZA 5AQIA 3KZBA 3WT0A 5AQXA 1HJOA 4QS9A 3H1QA 2ASMA 5ADXA 2W41A 4ISEA 1QQOA 4BR4A 4FWSA 4EAHD 1V4TA 1NGIA 4B1YB 4CBWA 1QQMA 1NGBA 3BEXA 3UE5A 4BC4A 4JHDA 3CJBA 3OHRA 4FOIA 4RTFD 3IMXA 4WQ4C 2P9IA 1DGKN 3HZ6A 2H3GX 4A62A 1TUYA 2D1KA 2QWNA 2ZGYA 3ZEUA 2D0PA 4PKHA 4L3QA 3R9PA 2CH5A 5AQKA 3SMSA 4H0YB 4Y0WA 5AR0A 5F2RA 1E4FT 1TUUA 3H3OB 2V52B 4BRGA 4FWOA 5TKYA 5AQOA 2F9WA 2PBDA 3VF4A 1YAGA 2ZGZA 3BF1A 3ENHA 4CZMA 3EL2A 2HF3A 5JLFA 1U6ZA 3MMVA 3SLCA 5FPNA 5BPLA 3CQXA 5AQVA 3LDNA 3IDHA 2UYTA 3AARA 3LDLA 4FOEA 2Q36A 3VEWA 4H0XB 3GG4A 2QWRA 1E4GT 3U8XA 1BA0A 4EHUA 4NB4A 2AP1A 3VEXA 3HBTA 3CI5A 2A41A 2W40A 4K43A 4K41A 3A5MC 4E1JA 4PL8A 3MCPA 5AQMA 1LOTB 1DKGD 3DWLA 5F0XA 5EXWA 4CZEA 4C23A 4BRDA 2HF4A 4IO8A 2NZTA 4EFHA 3EZWA 4K42A 3LDOA 4M7XA 3U9ZA 4BRKA 4B1ZA 1NM1A 4MLEA 3WXIA 1RFQA 5KQ8A 3SJHA 5BRFA 4I6MB 3L4IA 2E2PA 5AQNA 1BU6O 3CQYA 4FWKA 5AQSA 1NWKA 3D2EB 2FF6A 4XEIA 2CH6A 1EQYA 2Q0RA 1MWKA 1NGJA 4H0TB 4BVPA 3CJ9A 1X3MA 2A5XA 1NGDA 3O1BA 3EN9A 4YDUC 5BPNA 2E2NA 3S41A 3G25A 2HMPA 4H03B 1YVNA 3M1FA 3O8MA 4BR2A 1NGFA 3O1WA 1ATRA 4CD3A 4I6MA 1GLDG 3BF3A 3FGUA 4B1UB 1Y64A 3D7EO 2P9PB 3D2EA 4BG8A 4BRMA 4FPAA 5ADXH 5JMVA 4CBUA 3TPQA 3CERA 3M6GA 4O5FA 4YDUA 1RGIA 5AQFA 2OANA 4FSVA 4LC9B 4A2AA 2QWQA 4DB3A 5I9EB 5AQQA 3QBXA 3C0BA 3VPZA 4H5RA 2D4WA 1ATNA 3VETA 4CZJA 2A40A 2P9PA 1GLBG 3ID8A 4H5NA 3VF6A 2VYPA 2CGKA 5EX5A 1X9JA 1X3NA 4BR5A 3QFUA 1RDWX 2PAVA 4JD2B 2GWKA 3AY9A 5AQGA 5E26A 3WEEB 3ZX2A 2A42A 3W0LA 3H45C 2E88A 3O5BA 3WUHA 1JCFA 1SZ2A 2YHYA 1BA1A 3WXLA 4JNEA 4B9QA 4CJ7A 3L0QA 4FWQA 4IWVA 3QICA 3H1VX 4BRHA 1D4XA 2YCHA 4CZHA 3RSEB 4BGAA 4ISGA 4BRNA 2E8AA 2ZF5O 4IJAA 4IXCA 5ELZA 4JD2A 2WUSA 3H46O 3WEEA 2I7PA 3B8AX 3W3DA 3J8AA 3FZFA 2BUPA 1ATSA 4CI6A 3A5LC 2ZWHA 1NGGA 4H5VA 2QM1A 4FWMA 4H5TA 2KHOA 2QW9A 5AQRA 3RSEA 3I33A 2FF3B 4O8KA 3U4LA 2GELA 4IJNA 2ASOA 5KPRA 1HLUA 3UKUB 3ENOA 4BC3A 1IJJA 3A5OC 4BVOA 1P8ZA 4H0PA 4WYBA 3VGLA 4PL7A 3QB0A 1NMDA 3O80A 3WQTA 2E1YA 4Z94A 3A5NC 4RWTA 2BTFA 1MA9B 3MDQA 1WUAA 4M7YA 5AQUA 4M63C 3WXJA 1KAZA 5FPMA 1GLLO 3ATUA 4DHYA 2Q0UA 3UKUA 2E2QA 1R59O 3QDKA 3QMLA 2Q1NA 3QBWA 4JAXA 2YI1A 4BRQA 3CJ1A 4BQLA 1BWFO 4BC2A 3UB5A 1HX1A 4RCHA 5KPTA 1ZXOA 5AFUA 2ITMA 3VEZA 1K8KB 2HOEA 4HWIA 1T6DA 5CE3A 4BC5A 2YHWA 4PKGA 3VEYA 3FLCO 2YJEA 3JXUA 4BR9A 3U9DA 1QZ6A 4FL9A 3FZMA 5BRHA 3CHWA 2ASPA 2DPNA 3VF2A 4ISFA 1KXPA 3DAWA 1MWMA 5KPZA 4BRFA 3LM2A 3O08A 2P9LB 3O6WA 3VEOA 1IG8A 1K8KA 3DXKB 1S22A 2GUPA 3H6EA 1HPMA 5AQTA 5EY4A 4H0VB 4EIAA 1BDGA 4BG9A 1OKJA 5LJWA 4B1XB 4BRAA 3VGMA 3HSCA 2P9KB 3VERA 3H3NO 2VWBA 2A3ZA 2P9LA 2P9UB 3DXKA 5FPEA 1HUXA 3AAPA 2NRHA 4XH4A 5BN8A 5AQJA 4JHDB 1H1VA 3HI0A 2FSKA 3QFPA 3ZETB 3ULEB 4GNIA 5AZIB 4CZGA 1XQSC 2GEMA 2NLXA 3BUZB 5AQZA 4BRLA 3KHYA 4CZIA 1WOQA 3M3ZA 3IFRA 2P9KA 4QS7A 4WQ5A 3GL1A 3MN9A 1T44A 5LY3A 4MLHA 2QWPA 3AAQA 2P9UA 1JCGA 1BUPA 3FZHA 1C0FA 4NO7A 3HM8A 3CIPA 3GE1A 5F1XA 2P9SB 3A0IX 3ZX3A 1GLCG 5JICA 4H0OA 3O4WA 2E20A 1GLAG 3C7NB 4FWLA 2Q31A 2QWMA 3R8EA 3ZETA 3ULEA 5AZIA 1Q18A 2IVPA 3BP8A 3LM9A 1HKCA 4FWRA 4BRIA 3ATVA 3GDQA 4DCHA 1Z6RA 1BOTO 5AQHA 3LDQA 3VEVA 4BREA 2VCPA 1SQKA 3CJAA 3VENA 2A6AA 1NGCA 5EOYA 4AM6A 5E84A 2FXUA 3EKSA 3F9MA 3FFKB 2IIRA 2P9SA 1U2VB 3WXKA 2J4RA 2QWOA 4DQ8A 1MDUB 5AQWA 3C7NA 1BO5O 2IVOA 1LCUA 1QHAA 1TYQB 3FZLA 4WQ4A 3VESA 2IVNA 5BN9A 4CZLA 1YUWA 1Z05A 4MO4A 4BRCA 2QWLA 1GLEG 3ZX0A 3MK6A 4XH5A 5AQLA 5KQDA 4XH1A 3VOVA 3CJ7A 5BPMA 5FPDA 2E1ZA 3TU5A 4A61A 4B1WB 2D0OA 5AFUH 1NGEA 1U2VA 4KBOA 5AZJB 1GLJO 4BQZA 1TYQA 3GBTA 1CZAN 1QZ5A 2P9NB 4B1VA 4BROA 1NGHA 2GWJA 1YXQA 4IZ9A 2FSJA 1DEJA 3A8YA 3FE1A 1JCEA 4PKIA 3D2FB 4F9OA 1SAZA 3L6QA 4HTLA 2CGJA 1G99A 3UKRB 3GOIA 5EVZA 3DXMB 2F9TA 3IUCA 1KAXA 1T6CA 1ZBSA 5AZJA 2FLOA 2V51B 3HTVA 1HKBA 2EWSA 3MN7A 1NLVA 1C0GA 1XC3A 3SMPA 4EHTA 1NGAA 2P9NA 4QS8A 2GTDA 2QXLA 2E2OA 3LL3A 2CGLA 3CETA 3D2FA 4GY2B 2I7NA 4BR7A 4K25A 4J8FA 3UKRA 3MN5A 3DXMA 4H5WA 1S3XA 3KVGA 5AQYA 4AM7A 1NBWA 5B8HA 4CZKA 4FO0A 4FPBA 3DJCA 2YHXA 1J6ZA 3FR0A 5AQPA 3EKUA 5JLHA 1QQNA 3SK3A 1BG3A 5BRDA 3WQUA 1KAYA 4A2BA 1GLFO 3JS6A 2AA4A 3P4IA 2Q2RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4Z4EA 1C6VA 1HJRA 3TAPA 2IS3A 4IKFA 3DRRA 2PY5A 4U7BA 3LAKA 3NGYA 3OBWA 3A2FA 3DOKA 4DS5A 4FWNA 4CD1A 5KRSA 4YOUA 4N47A 2V7YA 4BGBA 1RTJA 4CBXA 3VQ5A 4JN4A 3OJUA 2O8FA 3THXB 3FZKA 1Q9YA 2Z1JA 3LDPA 2YNGA 3ZEUB 3HOTA 3M8RA 2G8FA 1X9SA 1VQ4N 4FJLA 3VN5A 3QEWA 4CJPA 3H1QA 3NF6A 2ASMA 1OH8A 4C8KA 1D9FA 3TARA 4RW7A 1V4TA 4CBWA 1QQMA 1YITN 3BEXA 4WQ4C 3V9UA 3THXA 2H3GX 4A62A 1S1VA 3ZEUA 3LWLA 3OYLA 4L3QA 4CGHA 2CH5A 2V52B 3AO1A 3HT3A 4FWOA 3M8QA 4NLCA 2PBDA 2QK9A 1VSHA 2HF3A 3AO4A 3MMVA 2OPPA 2YNHA 4CJ4A 5BPLA 1N6QA 3CQXA 3O9TA 3AO2A 4FM2A 3AARA 3LP0A 1BIUA 1IV0A 1BA0A 4M3ZA 4FM0A 3HBTA 3CI5A 4LFAK 3OYIA 1NMNA 3TR8A 4E89A 5C10A 3SAGA 3T7ZA 3MCPA 3RRGA 5AQMA 1REVA 4GKKK 4PWDA 1VSMA 3KWIA 1DKGD 4WCEL 3V1QA 4DTUA 5C2FA 3OJSA 2D0BA 3Q7BA 3DYAA 1QS4A 3CM6A 4CHPA 4K42A 1IO2A 4KH4A 3SUPA 4M7XA 3U9ZA 2NRTA 4BRKA 1NM1A 5KQ8A 4CIEA 5KGXA 3LZJA 1TAQA 3MEGA 5AQNA 2E2PA 3WXMB 5M1FA 3HM9A 1U48A 1NWKA 2YHAA 4GMJB 2FF6A 2D0AA 1MWKA 3O9UA 4B3SK 3L2VA 1ZYQA 3CJ9A 4OO1J 3O1BA 3O9QA 1K9MO 3NBPA 4CJRA 3S41A 1YVNA 4CK1A 2VG7A 4BR2A 4CD3A 1SUQA 1DTQA 3BF3A 2VGMA 4I7FA 3K5NA 4BDPA 2F96A 1RBTA 1JLAA 2XY8A 3QIOA 4FPAA 3ID6A 1HQUA 3CPWM 1QE1A 2E6MA 3TPQA 1NK7A 3M6GA 1KD1O 5AQFA 4FSVA 2QWQA 3DOLA 3P31A 2IAJA 4WFNL 5AQQA 2GV9A 2WOMA 3NH0A 1EXQA 3AVIA 1QQCA 1NG9A 4FLYA 4H5RA 2D4WA 3ZSRA 3G4SN 1GLBG 1OH7A 1W97L 3VQ7A 4DF8A 1RTDA 3WNFA 3ZT1A 3MX2A 4DLEA 3L4QA 4G1QA 4KHNA 3CQ8A 1B9DA 4JD2B 3SUOA 1LV5A 3ZLJA 2F7TA 4M41A 5AQGA 3EZ5A 1VQLN 3K5OA 3CPEA 5MLCQ 4CHOA 2QI2A 4CHYA 1OH5A 3O5BA 1JLEA 1RDUA 2KKZA 3AVLA 1SZ2A 1BA1A 3QICA 3H1VX 1EWRA 4BRHA 2VG6A 4BGAA 4FVUA 4WF9L 3TTCA 1D5AA 4IXCA 4JD2A 4DTNA 4DV2K 2OZMA 3W3DA 2NRRA 2HHXA 4FJNA 1EKEA 1VQNN 3NVKA 2BUPA 4JKCA 4CHNA 4YY3K 2ZWHA 3SUNA 3KK1A 1S9EA 2QM1A 2NRZA 3G6EN 2B5JA 3I33A 1U47A 4DR4K 4JKAA 4UQGA 1RT7A 4GV9A 4AHCA 1HYSA 4IJNA 3ZSZA 2O8EB 4NXNK 1IJJA 4BVOA 3CC7N 4WYBA 3VGLA 3VQPA 1N8RO 2E1YA 2XO7A 4Z94A 4Z4CA 1RT2A 1K6YA 5J2NA 2QKBA 2BTFA 3MDQA 1VSFA 4M7YA 4RW6A 4LSLA 5FPMA 4CGFA 3UIQA 4DHYA 2VWKA 2O8EA 3QDKA 3SQ2A 5HROA 4B9NA 2P5GA 3VTHA 2WTUA 1YI2N 4FJKA 5K14A 3UB5A 5KPTA 3HJFA 2ITMA 4ICLA 4WFBL 2G8HA 4HWIA 3THVA 3QNNA 4HUFA 4PKGA 2FBXA 1WB9A 1YTAA 4RW4A 1DT9A 2XY5A 4BE0A 1KXPA 4A5BA 1ILYA 1IKVA 3O6WA 2ETJA 1S22A 3HPGA 4DMNA 3T3FA 2YHBA 4IOCL 1L3SA 2G8KA 4B8CA 4U67L 3QETA 3NMUA 3E01A 1U49A 3L8BA 1TK8A 1D8YA 4DR2K 1WSIA 2P9KB 3H3NO 1HMVA 3SCXA 2P9UB 3VQBA 3QINA 1EO1A 1U4BA 4DV6K 5JVGL 4B08A 2NRHA 4XH4A 2VQFK 4NLBA 1OVQA 3LDSA 2WBNA 4O5BA 5E41A 3KKSA 3QFPA 4E1NA 3ULEB 2D0CA 5AZIB 4CZGA 2PYJA 3P83D 3VQEA 4CGDA 1JLGA 1UOCA 3KHYA 3BZKA 1NKCA 1WSJA 2P9KA 4F8RA 3LZIA 4PA1A 2P9UA 2QWPA 3ZCMA 1JCGA 1BUPA 2LSNA 4NO7A 1VQPN 3CIPA 4WFAL 4CW7B 3VQ6A 1K8AO 4JKEA 3ZX3A 4ZTFA 3O9RA 5JICA 4H0OA 4KI6A 2QWMA 3R8EA 3ULEA 5AZIA 3LM9A 3BP8A 1HKCA 4M3XA 1Z6RA 4QAGA 1X9WA 5AQHA 3NGZA 4DSEA 2VCPA 1T7PA 5DMRA 1NGCA 3FFKB 2J4RA 1XMQK 2O8DB 3CCMN 4M45A 1BO5O 5GIPA 4WQ4A 3VESA 2IVNA 4IFEA 1KCFA 3V81A 4CZLA 1A5WA 3CJ7A 4DR3K 1L3TA 5FPDA 1VQ5N 3PY8A 2QA4N 3RMDA 4HCCA 5SZTA 2B6AA 1KTQA 2D0OA 1NGEA 4KBOA 4JI7K 5AZJB 2O8DA 4BQZA 3M8PA 3NCIA 1VRUA 2GWJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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