2E2QA

Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in complex with xylose, mg2+, and adp
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
297
structure length
297
Chain Sequence
MMIIVGVDAGGTKTKAVAYDCEGNFIGEGSSGPGNYHNVGLTRAIENIKEAVKIAAKGEADVVGMGVAGLDSKFDWENFTPLASLIAPKVIIQHDGVIALFAETLGEPGVVVIAGTGSVVEGYNGKEFLRVGGRGWLLSDDGSAYWVGRKALRKVLKMMDGLENKTILYNKVLKTINVKDLDELVMWSYTSSCQIDLVASIAKAVDEAANEGDTVAMDILKQGAELLASQAVYLARKIGTNKVYLKGGMFRSNIYHKFFTLYLEKEGIISDLGKRSPEIGAVILAYKEVGCDIKKLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Sulfolobus tokodaii
publication title Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEXOKINASE
total genus 110
structure length 297
sequence length 297
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2qA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2qA01
1HKBA 1NGGA 2PAVA 1HPMA 2A6AA 1J6ZA 2ITMA 1NGHA 2PBDA 3ZEUB 4IJAA 2I7PA 3I8BA 3TU5A 3CJ1A 3VEYA 4BRHA 3CERA 2YJEA 1GLBG 3ULEA 3VEOA 3H3NO 3UKUB 4BRIA 3MN9A 5AQOA 2ZF5O 5AQQA 2FXUA 4ISFA 4M7XA 3UB5A 1HJOA 2QM1A 3FGUA 5AQTA 4IWVA 5AFUA 5CE3A 4WQ4C 4BRFA 1ZBSA 3UKRB 4I6MA 3IMXA 5AZIA 5ADXH 5AZJA 1K8KB 4PL7A 4O5FA 5AQSA 1TYQB 5EY4A 4JD2B 2HMPA 2FF3B 3AAPA 3LM2A 1Y64A 3OHRA 3J8AA 4CJ7A 4HTLA 3VEXA 3DXMA 3VETA 2IIRA 4J8FA 1JCFA 4BC5A 4QS9A 4WQ4A 1E4GT 4BRPA 2GWJA 2P9PA 3VGKA 1BG3A 5JICA 2VCPA 1NGFA 2V51B 4FSVA 4MLHA 2D1KA 5JMVA 3EO3A 2J4RA 2FLOA 2V7YA 1HX1A 5KPZA 3HSCA 1MWKA 3H3OB 3LDOA 2NZTA 3ZX3A 3VF4A 4DQ8A 3WXIA 4A61A 4BVPA 2P9LA 3VESA 4JHDB 2Q1NA 3QFUA 4MO4A 2EWSA 2NRHA 3RSEB 1JCGA 4FWRA 4XEIA 4AM6A 5AZJB 2A5XA 1GLCG 2QWQA 3CJBA 3VEVA 4Y0WA 4BRLA 2KHOA 4BQZA 1MA9B 4Z94A 5EVZA 1SQKA 4F9OA 2ZGZA 3EKUA 3MDQA 1U6ZA 3VGMA 2IVOA 4FWQA 4BQLA 2VWBA 3QFPA 3ZEUA 1OKJA 3O08A 4BRMA 3CJAA 3QB0A 1RGIA 5AQYA 2QWPA 4XH5A 5BRHA 3O1WA 1H1VA 2CGKA 3CIPA 2AA4A 2E1YA 3UKUA 1P8ZA 1ESVA 3ATVA 4DB3A 3D7EO 4GY2B 1LOTB 4JN4A 2YCHA 5AQKA 1GLDG 1KXPA 4BRNA 3VPZA 3JS6A 4BR5A 1NWKA 3A0IX 2YJFA 3VF6A 1K8KA 4FWNA 1TYQA 4JD2A 3R8EA 1X9JA 3H6EA 5BPNA 4M7YA 4H03B 4BR2A 2QW9A 2FF6A 4H5VA 3VEZA 4CZMA 5KPTA 3MN5A 1QQNA 3BF1A 5BRFA 3LDLA 4IXCA 2D0OA 5FPDA 1HLUA 2AP1A 2CH6A 1BUPA 1XQSC 1MDUB 3H45C 2FSJA 3SK3A 4FOEA 3GOIA 1BOTO 4FPAA 5AQMA 4CZJA 2I7NA 4B1ZA 4RTFD 2QWLA 4PKHA 1QZ5A 1XC3A 2A42A 3R6MA 3HTVA 1ZXOA 5BPLA 3C7NA 3ID8A 5KQDA 4CBWA 2P9IB 4M63C 2FSKA 2A40A 2Q97A 2W41A 5AQIA 1C0FA 2Q2RA 3KHYA 1QQMA 4H0TB 4JHDA 4H5TA 3RSEA 5AQNA 3HM8A 4BREA 5B8HA 5TKYA 3ZX2A 5AQWA 1HUXA 5KQ8A 1NGIA 4BRAA 4BC3A 3QBWA 1V4SA 4L3QA 1SAZA 1GLJO 3O1BA 2FSNA 2E2OA 3A5NC 1GLEG 1GLFO 4BGAA 2ASMA 4QS8A 4BR7A 4B1UB 5BN9A 2E88A 1QHAA 3ZX0A 2OANA 4FO0A 5AQUA 1X3MA 4WQ5C 5AQXA 5JLFA 2E1ZA 2YHWA 3DXKB 3L4IA 3GDQA 2D0PA 2GTDA 3IDHA 3I33A 4BRQA 2UYTA 1HKGA 1YUWA 5AQHA 4CZLA 3FFKB 4B1YB 2E2NA 3C7NB 4B1WB 4BRKA 3M3ZA 4CBUA 2CH5A 3CI5A 3A5MC 4NB4A 4PKGA 3O6WA 1IG8A 4CZIA 3MN7A 3M1FA 4A2BA 2YHXA 4WQ5A 2E2PA 1DKGD 5LY3A 3SLCA 4BR0A 2E8AA 3WEEB 1RDWX 4H5WA 3HI0A 1T6DA 1QQOA 3WQUA 4B1VA 1BWFO 3VF2A 3EN9A 4BROA 2IVNA 3M6GA 1DEJA 2P9SA 4MO5A 3CJCA 5AFUH 4CI6A 3WQTA 2P9NB 1ATRA 4EHTA 5F0XA 4CZEA 5AQFA 3GBTA 4HWIA 3WXKA 1BU6O 3FZMA 3WT0A 2F9TA 3C0BA 3FR0A 3A8YA 4PKIA 3KVGA 1TUYA 3O8MA 3BF3A 1V4TA 5AR0A 3U8XA 3VENA 1YVNA 4MLEA 4BG8A 4K25A 5FPNA 4XH1A 2P9KB 4BVOA 1U2VB 5BPMA 4FWLA 3D2FB 1BA0A 1ATNA 3W0LA 2P9IA 2HF3A 1HKCA 1T44A 5ELZA 2DPNA 3FZLA 3QICA 3F9MA 2Q31A 1NGDA 4BRGA 2Q36A 3AARA 4A2AA 4FWPA 3WUHA 1YAGA 3LDQA 1X3NA 4RWTA 1BO5O 3DAWA 4WYBA 5E26A 3A5OC 1GLAG 5ADXA 2GEMA 4YDUA 1NGEA 4B1XB 1TUUA 5F1XA 1KAXA 3VOVA 2A41A 2P9SB 4XH4A 2Q0UA 5JLHA 1NLVA 3ENHA 3FZFA 3L0QA 4BRDA 4DCHA 1ATSA 2V7ZA 3SJHA 1GLLO 4JAXA 4AM7A 4CBXA 3DXKA 3W3DA 3CHWA 5EOYA 4ISEA 3CQXA 1DGKN 2HOEA 3CJ9A 1NGCA 3CJ7A 4BR4A 3IFRA 2GWKA 4H0XB 5BN8A 4H0YB 4CZHA 3CETA 2Q0RA 2NLXA 4CD3A 2BUPA 3A5LC 1YXQA 3WEEA 3H46O 1WUAA 4H0PA 2YI1A 3GG4A 3D2EB 3LL3A 4IJNA 4QS7A 3H1QA 3GE1A 3DWLA 1NMDA 5F2RA 4BR9A 5EXWA 1G99A 3O4WA 5KPRA 3S41A 1Z05A 2P9NA 4BRCA 4EFHA 3VEWA 3R9PA 1E4FT 4H0VB 5I9EB 2WUSA 3ATUA 4O8KA 4FWOA 4JNEA 1S3XA 4FOIA 5FPEA 2ZWHA 3AY9A 3QMLA 3U9DA 4KBOA 3MMVA 4FPBA 2P9KA 3WXLA 1NBWA 3CQYA 5E84A 1U2VA 3FE1A 3MN6A 4H0OA 3D2FA 3DJCA 1BA1A 2P9UB 4GNIA 4FWMA 4B9QA 2QWMA 5AQRA 1Z6RA 3ZETA 3VERA 3SMPA 5LJVA 3O5BA 1XUPO 3BP8A 4EHUA 1Q18A 3ENOA 4EIAA 3L6QA 4FWSA 4ISGA 4K41A 1NM1A 1LCUA 2W40A 2E2QA 2CGJA 4IO8A 1IJJA 3FZHA 2VYPA 2ZGYA 3HZ6A 3QDKA 1ZC6A 2BTFA 4FWKA 3MK6A 4LC9B 4E1JA 1QZ6A 2D4WA 2ASPA 3U9ZA 3KZBA 1JCEA 3ULEB 3QBXA 4C23A 5BRDA 3EL2A 3GL1A 2HF4A 5EX5A 3P4IA 5AQZA 1C0GA 3BEXA 1KAYA 3FZKA 4I6MB 4H5NA 5AZIB 4NO7A 3WXJA 3MCPA 4K43A 2GELA 2E20A 4YDUC 3EKSA 1D4XA 5AQJA 5AQLA 4FL9A 3ZETB 1BDGA 2QXLA 4PL8A 4BG9A 2CGLA 3DXMB 4BGBA 1R59O 3IUCA 2YHYA 1CZAN 3H1VX 2QWOA 1MWMA 3B8AX 4H5RA 2P9PB 3LDPA 3D2EA 1KAZA 5FPMA 1NGJA 3JXUA 2V52B 2IVPA 5AQGA 1RFQA 3G25A 4EAHD 4CZKA 3EZWA 1EQYA 1S22A 5BREA 3LDNA 3FLCO 3U4LA 4CZFA 1T6CA 3SMSA 5BR9A 4BC4A 4DHYA 1WOQA 3TPQA 3UKRA 5AQPA 3VGLA 2A3ZA 2P9LB 5LJWA 2ASOA 4K42A 4BC2A 2GUPA 3AAQA 3UE5A 4CD1A 2H3GX 2F9WA 3BUZB 4A62A 2P9UA 4RCHA 1NGBA 1NGAA 4IZ9A 2QWNA 4CZGA 3O80A 1SZ2A 5AQVA 2QWRA 3HBTA 3LM9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HKBA 3OYIA 4JKAA 1OH8A 3U3YA 1HJRA 2A6AA 2NUBA 2PBDA 3BY5A 4I2PA 4BRHA 3EE9A 4CESA 4A5BA 3CERA 2YJEA 4E89A 4DV1K 3PY8A 3ULEA 1BQMA 4LD0A 4KKOA 1VSEA 3D6RA 5AQOA 3NH2A 4JRPA 5C24A 3KKSA 4IFYA 5DK5A 1C0UA 4BRFA 4I6MA 1KTQA 5AZIA 3ID6A 5ADXH 3C6AA 3HYFA 4PL7A 1I39A 4O5FA 5AQSA 2NRVA 3G71N 4GV3A 4O5BA 2DY4A 2FF3B 1CZBA 4Z4FA 1SKWA 4IKFA 4KI6A 1BL3A 3DXMA 1SV5A 4J8FA 3N4QA 4N56A 3K9KA 1A5WA 2P9PA 3MAQA 1EWQA 1NGFA 2V51B 4MLHA 2DTUA 1NJIO 4CVNE 3EO3A 4N76A 4JKGB 1HX1A 3OYMA 2KZZA 3H3OB 2NZTA 3VF4A 4DQ8A 3WXIA 3L2RA 4BVPA 3KLEA 4F4KA 3TTFA 1Z26A 3HVRA 4OLBA 2NRHA 3RSEB 1JCGA 3Q7CA 5AZJB 3G0ZA 2QWQA 5IWAK 4W5NA 4JK9A 1TAUA 3B6PA 1S1TA 3S3OA 1HQUA 3MDQA 1BI4A 1OVYA 4KTWA 2BH1A 3QFPA 3ZEUA 4DV2K 1KLMA 1LWEA 1OKJA 3O08A 1T05A 2OPSA 3QB0A 5K14A 3JSMA 3DOLA 4CFDA 2CGKA 1RTDA 1S1XA 4FVMA 3UKUA 3ATVA 3KK3A 4GY2B 1LOTB 1QSSA 2YCHA 2X6SA 1KXPA 4RW9A 3VQCA 4CHYA 3NVKA 4JKHA 4BR5A 1NWKA 2YJFA 4FWNA 1TYQA 4JD2A 3H6EA 5BPNA 2BANA 4M3UA 1N32K 4WFBL 4CZMA 3DOKA 4CF2A 1N8RO 3BF1A 3WXMB 2D0OA 4FLXA 3QIOA 4FJJA 4BWMA 4OPKA 3OYGA 4FK2A 2CH6A 2OZSA 2FSJA 2PZSA 1BHLA 2O8BA 4RTFD 2QK9A 5FROA 3DLBA 3C7NA 4CBWA 1IH7A 2P9IB 2FSKA 2W41A 2Q2RA 2YV0X 1LV5A 3Q7BA 4H5TA 4M42A 1X9SA 1WSHA 2HHUA 4YOYA 1HUXA 4FM0A 3OYEA 4BRAA 2X78A 4BC3A 4M3RA 3K5LA 4ZHRA 1S1WA 5CYQA 1GLJO 2GX9A 1NJWA 5GINA 5J2MA 3DLEA 1GLEG 1GLFO 3MX2A 4QS8A 4M3YA 3HPGA 3TAFA 3S9HA 2OANA 4KH4A 4G1QA 4O55A 4E1MA 2E1ZA 3WNFA 3GDQA 2GTDA 1TK8A 1NJZA 3KLGA 4E7KA 2E2NA 3VQEA 2YKMA 3TWHA 4FJMA 3A5MC 1IG8A 4Z4EA 2NRXA 4GVMA 1UOCA 2E2PA 5LY3A 3SLCA 4BR0A 2E6MA 3WEEB 3HPOA 3V9WA 1VHXA 3VF2A 3EN9A 4N5SA 1DEJA 2P9SA 4U67L 3NDKA 3NAEA 1XNQK 4NLCA 3O9UA 1BGXT 2DFEA 5F0XA 1FXXA 3GBTA 3CQ8A 4OKEA 2F9TA 3FR0A 3A8YA 1TL3A 5KGXA 3U8XA 3C94A 1TL1A 4BG8A 3L8BA 2OTJN 1WSJA 5BPMA 1RBVA 3D0PA 4FWLA 1BA0A 3K2PA 2OZMA 2XY6A 4DSFA 1T44A 5ELZA 2UU9K 4QOZB 4DFPA 3F9MA 3O9SA 3V81A 1NGDA 4DG1A 4YY3K 5J2NA 4FWPA 3SV3A 3ZSOA 4PWDA 1NGEA 4NCGA 4DSJA 4FJGA 5F1XA 4IOCL 1VRUA 4FLTA 4GVEA 3CCSN 4UQGA 3FZFA 1ATSA 1GLLO 3NF8A 4AHTA 3M8RA 4AM7A 1TKXA 4FJNA 3HPHA 5FDLA 3IKMA 1HNZK 4CEFA 3SPYA 2VG6A 5SZTA 4WFNL 1NK4A 1VSJA 4I2QA 3WNGA 4KB1A 2IS3A 4ILGB 3THWA 5A2QO 4C1NK 3OBYA 4BR4A 3CETA 2Q0RA 4FJ8A 4OGCA 4F8RA 4N41A 1W7AA 3K59A 4Z4GA 1D5AA 4QS7A 4E0DA 3DWLA 4JV5K 1CZ9A 4O4GA 3S41A 4B3RK 2P9NA 1IV0A 3DRPA 3R9PA 3I0RA 1EETA 4O8KA 3KIOA 4FOIA 4A5AA 4DTNA 3AY9A 3MMVA 4FPBA 1ZBFA 2P9KA 1U2VA 2YX6A 3D2FA 1RT4A 3OJSA 4B9QA 3VQPA 5AQRA 1Z6RA 4YOUA 1Q18A 3L6QA 1RBTA 1W9HA 4E19A 4IO8A 4JS5A 4AQYK 4KAZA 1CXQA 4W5TA 3HZ6A 4CHZA 1YHQN 3LWLA 1KRPA 2D4WA 4LFAK 1E3MA 4PUOA 2WTUA 2FBVA 4CJWA 3ULEB 3NF6A 4H4OA 1QQCA 2XY8A 3SV4A 1FKPA 2FBTA 5AQZA 4CCHA 4X62K 2O4IA 4CJ3A 1C0GA 3AA5X 1KAYA 3PSFA 4I6MB 2WOMA 4H5NA 4IDHA 5AZIB 3E1YA 4NLBA 1UA0A 4K43A 3PX4A 1HQEA 1W0HA 5TKWA 2O4GA 4CIEA 3EKSA 1KVCA 1NK7A 2UUAK 1VQ4N 4BG9A 2QXLA 3V4IA 1RBUA 1RT2A 3DXMB 3HM9A 3IUCA 2WFBA 1QVFM 3B8AX 3O3GA 4H5RA 1VQ8N 2P9PB 3LDPA 2ZE2A 5FPMA 1KAZA 2IVPA 3ZCMA 1S72N 5AQGA 3SQ0A 3G25A 2UXCK 2GV9A 5GIPA 4JI5K 1S22A 3G4SN 5C2FA 4CZFA 3HK2A 1VSDA 4CFAA 4DHYA 1JLCA 5AQPA 5HRNA 3E9LA 3NGIA 4KHQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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