2E2QA

Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in complex with xylose, mg2+, and adp
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
297
structure length
297
Chain Sequence
MMIIVGVDAGGTKTKAVAYDCEGNFIGEGSSGPGNYHNVGLTRAIENIKEAVKIAAKGEADVVGMGVAGLDSKFDWENFTPLASLIAPKVIIQHDGVIALFAETLGEPGVVVIAGTGSVVEGYNGKEFLRVGGRGWLLSDDGSAYWVGRKALRKVLKMMDGLENKTILYNKVLKTINVKDLDELVMWSYTSSCQIDLVASIAKAVDEAANEGDTVAMDILKQGAELLASQAVYLARKIGTNKVYLKGGMFRSNIYHKFFTLYLEKEGIISDLGKRSPEIGAVILAYKEVGCDIKKLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEXOKINASE
molecule tags Transferase
source organism Sulfolobus tokodaii
total genus 110
structure length 297
sequence length 297
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2qA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2qA01
4CZKA 1GLBG 2A40A 4WQ5C 4BR2A 2BUPA 5BR9A 3CJ9A 3SJHA 2GUPA 3DXKB 4PKIA 4FWSA 2E2QA 2P9KB 2P9IB 4BR0A 4PL8A 4B1ZA 4BRFA 3MDQA 3TU5A 4EHUA 2CH5A 3GL1A 3QBXA 4BQLA 2FSKA 3MN7A 3CJ7A 4DCHA 1DGKN 5AQSA 4Z94A 5AQHA 1YUWA 1BA0A 2Q31A 2E1YA 3M1FA 1NWKA 2P9UA 1E4GT 1NGGA 4JHDA 2YHXA 2CGJA 3MK6A 5AFUA 4FWNA 4CD1A 3CJAA 4CZJA 3JXUA 3QBWA 3HZ6A 1LCUA 4DHYA 3IFRA 3VOVA 3HTVA 5AR0A 2J4RA 1CZAN 1MA9B 4FWPA 1QZ5A 4H0PA 3VGMA 3BEXA 2Q1NA 2A5XA 3O1WA 4ISGA 1NGFA 2VCPA 4BC5A 3GG4A 2QWQA 2QWNA 3BUZB 4CBUA 1Z05A 2E1ZA 2D4WA 3QFUA 2Q36A 3GE1A 3AAQA 2QWMA 4IJAA 1RFQA 3J8AA 2BTFA 3ATVA 1GLEG 3EN9A 1E4FT 1XQSC 3FFKB 2D0PA 2DPNA 3CHWA 3HI0A 4PKHA 1ATSA 4ISFA 4WQ4A 2FLOA 1JCEA 1BOTO 4BRPA 1K8KB 5AQQA 4BRIA 4JAXA 4A61A 2QW9A 1GLDG 3I33A 1NGBA 3IUCA 3LDPA 1T44A 3RSEA 4XH4A 3C7NA 1U2VB 4ISEA 3MN9A 3H1QA 3LM2A 3WEEB 1R59O 2GWKA 2QWRA 4BRLA 1NLVA 3GDQA 5JLFA 4QS7A 2P9PA 4K42A 4BREA 3AY9A 3W3DA 4O8KA 1G99A 1BWFO 3VERA 2ASMA 4FOEA 1YVNA 1HJOA 1ESVA 1KXPA 3L0QA 1NGDA 1NGHA 3H45C 5ELZA 1YAGA 3VF6A 4BROA 1S3XA 5ADXH 2QWPA 4CZMA 3FLCO 4IXCA 4CZEA 3FZFA 3FR0A 2P9SA 1S22A 3D7EO 3LDLA 2HOEA 4FWKA 3O08A 5AZIA 3VEWA 2E2OA 3MN6A 3D2FA 3VENA 3CQYA 4RCHA 2E88A 4B1WB 2IVOA 4BRKA 3WUHA 3UKUA 3H46O 5CE3A 4IZ9A 1NGCA 1YXQA 4KBOA 5AZJA 4H5NA 4B1YB 3VF4A 3FZHA 5B8HA 5LY3A 4H0OA 3KZBA 2D0OA 2HF4A 3L6QA 1NM1A 3DXMB 2P9NB 3WXLA 4IWVA 2FSJA 4QS9A 3WXKA 2F9TA 4BG8A 1QQOA 4A2AA 3LL3A 3DJCA 5AQLA 2CGLA 4M7YA 4C23A 5AQZA 2Q0UA 2HF3A 4CD3A 3ENOA 2ZWHA 4CZHA 4CI6A 4M63C 3D2EB 4B1XB 4EFHA 4DB3A 3QICA 1QZ6A 4I6MB 3TPQA 3A8YA 5EX5A 1HX1A 3R6MA 5AQIA 1WOQA 4M7XA 5AQKA 4BVOA 4Y0WA 5I9EB 1LOTB 3CJBA 4BR9A 4BC3A 3DWLA 3GBTA 3H3NO 2EWSA 4DQ8A 2V7YA 2V52B 1C0GA 1MDUB 1MWKA 5F1XA 2E2PA 5AQMA 2WUSA 1RDWX 1GLCG 5BPNA 2KHOA 5AQJA 4B1VA 1EQYA 3EL2A 1TUYA 3UB5A 1WUAA 2V51B 3VESA 3ZX0A 1Y64A 3FZKA 2FF6A 3SK3A 3VEOA 4RWTA 2A41A 2P9LA 4H5RA 5TKYA 3SLCA 4FOIA 2OANA 4O5FA 5AQRA 1X9JA 3ID8A 3M3ZA 3DAWA 5BREA 1TYQB 3F9MA 5AQTA 3VEXA 4NB4A 5FPEA 4K25A 3BF1A 4E1JA 1QQMA 4WQ5A 4GNIA 3CETA 1SQKA 2NZTA 4BR4A 5AQOA 4FO0A 4BR7A 3FZMA 3VGKA 3IMXA 4YDUC 2I7PA 2PAVA 1OKJA 4H5VA 3VEYA 5F2RA 5BN9A 3U8XA 2F9WA 3CERA 4FWMA 1NGIA 4H0TB 4QS8A 2IVNA 3RSEB 1U6ZA 1BDGA 4FPAA 4CJ7A 4GY2B 2CH6A 3P4IA 3O4WA 3UE5A 3LDOA 3U4LA 4CZIA 2ZGYA 3ZEUB 4CBXA 3ULEB 1U2VA 2ZGZA 5EVZA 2P9PB 3WEEA 4JD2B 3WXJA 1X3NA 4XEIA 5FPMA 5BPMA 5AQXA 4H5TA 5BPLA 4LC9B 5AFUH 3VGLA 4K41A 1SAZA 5LJWA 2YHWA 3MN5A 5E84A 5KQ8A 3UKRA 1HKGA 4BRCA 1GLJO 2FF3B 3B8AX 3ZX3A 5KPTA 2VWBA 2CGKA 2GELA 4B9QA 2PBDA 2A3ZA 4MO4A 2YJFA 2GEMA 2A6AA 1KAYA 3O80A 3VEZA 4CZFA 2E2NA 3G25A 3UKUB 1GLLO 3HBTA 1T6CA 5BN8A 1DKGD 3ZETB 1ATRA 4BGBA 4J8FA 4FWRA 3R9PA 1XC3A 5AQUA 3JS6A 4F9OA 4FWLA 1NMDA 1TUUA 4HWIA 2GTDA 4XH1A 3H1VX 2YCHA 2H3GX 1ZBSA 2P9NA 1NGAA 3ZX2A 4H0YB 3EKUA 4BGAA 2Q0RA 5AQYA 3SMSA 4BRQA 5FPNA 2GWJA 3DXKA 5AQPA 4MLHA 1RGIA 4WQ4C 2P9KA 3QFPA 5BRDA 1QQNA 2AA4A 2P9IA 3U9DA 4BRGA 2QXLA 1JCFA 3KHYA 2W41A 3D2EA 3EO3A 2ITMA 2P9UB 2Q2RA 2VYPA 3H6EA 2A42A 4I6MA 3VF2A 2ZF5O 3AARA 4H0VB 4JHDB 2QWOA 4FWOA 1P8ZA 4EIAA 3O6WA 3SMPA 5BRFA 4EHTA 3A5MC 3HSCA 1ZXOA 1IJJA 4JN4A 3A0IX 3QB0A 1HLUA 1JCGA 3C0BA 4BG9A 5ADXA 5KQDA 1KAZA 3VEVA 1BG3A 4FWQA 5LJVA 3KVGA 5AQNA 3WQTA 3VPZA 5AQWA 4EAHD 2W40A 1BUPA 3CI5A 5EXWA 3EKSA 3A5NC 5BRHA 1HKBA 2E8AA 3IDHA 3L4IA 2P9LB 4MO5A 3O8MA 4A2BA 2Q97A 3O5BA 4JNEA 5JICA 3WT0A 2QWLA 2NLXA 4BRAA 3QMLA 3W0LA 5FPDA 1MWMA 4FL9A 5F0XA 4BQZA 4BRDA 1TYQA 1SZ2A 2V7ZA 4HTLA 1HUXA 4WYBA 3H3OB 3M6GA 3OHRA 2IIRA 1Q18A 5E26A 1H1VA 1K8KA 3ENHA 3MMVA 3R8EA 1Z6RA 3C7NB 4H03B 2UYTA 4L3QA 1BA1A 5AQVA 1BO5O 4A62A 5AQFA 3HM8A 3FZLA 2QM1A 4CBWA 3EZWA 3CJ1A 3S41A 1GLFO 3WXIA 1QHAA 4IO8A 3LM9A 2YHYA 4AM6A 3LDQA 4XH5A 1C0FA 1IG8A 3WQUA 3ZEUA 3MCPA 3BF3A 3ULEA 3A5OC 4K43A 3A5LC 5JLHA 4CZGA 4JD2A 2P9SB 4BR5A 4BRHA 4B1UB 5KPRA 3ATUA 1ZC6A 5AZIB 2ASOA 1T6DA 2YI1A 2D1KA 3BP8A 4AM7A 2IVPA 5JMVA 3UKRB 3GOIA 3D2FB 4PKGA 3LDNA 1D4XA 2E20A 5EOYA 1DEJA 5AZJB 5AQGA 4PL7A 1J6ZA 4FPBA 1V4SA 2I7NA 4NO7A 2ASPA 4CZLA 1HKCA 4H5WA 1BU6O 1XUPO 4FSVA 3QDKA 3U9ZA 3AAPA 2YJEA 4BRNA 4BVPA 1KAXA 1V4TA 1GLAG 1NGJA 2HMPA 3CIPA 3CQXA 1ATNA 3CJCA 3DXMA 4IJNA 3O1BA 4H0XB 4YDUA 3FE1A 5EY4A 3ZETA 1NGEA 1NBWA 1X3MA 4BC2A 4MLEA 2NRHA 2FSNA 1HPMA 2FXUA 4BRMA 4BC4A 3VETA 3I8BA 3FGUA 4RTFD 2AP1A 5KPZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JS2A 4CZKA 1GLBG 4WQ5C 4JKEA 3NH1A 3CJ9A 4MDBA 4PKIA 3DXKB 2Z1IA 4FWSA 2IS3A 1WSHA 4PUOA 4IG3A 4O5BA 1IKWA 4EHUA 1KVCA 1HQEA 3GL1A 4BQLA 1VRTA 2FSKA 4DTRA 4NYNA 5AQSA 3PX0A 3U3GA 1BA0A 1O13A 3OTOK 4EZ6A 1C1AA 4E89A 3M8QA 4FWNA 4CD1A 4CZJA 3U6FA 4IEEA 3JXUA 2UXCK 1T8EA 3F9KA 2J4RA 3OYMA 2X6NA 1MA9B 3J7AP 3G71N 3KWIA 3BEXA 1BI4B 2Q1NA 3HRGA 4F4KA 2QWQA 4AF1A 1LAVA 4CBUA 4YOWA 4X65K 1SL1A 2Q36A 2RPIA 2QWMA 3KLIA 2GX9A 1RFQA 3HVTA 1OVYA 4K0KK 2BTFA 1E4FT 1GOAA 2XY5A 3WNEA 2DPNA 4HUGA 3D6RA 4HTUA 3QNNA 1VSFA 1DTTA 5DM7L 5DMRA 2FLOA 3RMAA 3S3MA 3T1YK 4G9ZA 3HPGA 1WSJA 5AQQA 4FLZA 1GLDG 1NGBA 1TKXA 1KC8O 1VRUA 4BDYA 3RSEA 3CYMA 1U2VB 3MN9A 3H1QA 3WEEB 3L2QA 1ITGA 2QWRA 2EHGA 4CJWA 3O9UA 1R0AA 5HRPA 2ZE2A 1KQSM 3W3DA 4O8KA 1EKEA 2E6MA 4JKHA 4H8KA 4FOEA 4BE2A 1HJOA 1ESVA 3QEVA 1RBUA 4DU1A 4F2SA 4O4GA 3H45C 5GADP 3T1AA 3FZFA 3FR0A 2P9SA 1S22A 2QTDA 2HOEA 5KRTA 3VQ6A 3CQYA 2HVHA 3WUHA 4JKAA 4BE0A 3ZSYA 1YXQA 4KBOA 5M1QA 4H5NA 3CXCM 3FZHA 1RT6A 3HJFA 3AVJA 4B3TK 2WOMA 3SQ0A 4B3SK 3WXKA 3BGRA 1QQOA 4A2AA 4CJUA 2VGNA 4CFDA 1ZBFA 4KB1A 3D2EB 3SQ2A 4B1XB 4ZTFA 3AO1A 5EX5A 1HX1A 3ENBA 3AA4A 1WOQA 4BVOA 4DU4A 1YI2N 1UA0A 4Y0WA 4DTNA 5I9EB 1LOTB 3VQ8A 1JKHA 2E5LK 4Q5VA 5LL6Z 2Q3SA 1WLJA 1NG9A 2V52B 3SCXA 1D8YA 1U48A 3M5RA 2OA8A 5AQMA 5C10A 4KI6A 1VQKN 5BPNA 2KHOA 5AQJA 4JK8A 5M1PA 4FZZA 1L3TA 2KFZA 2A1SA 5C2FA 1L5UA 4JKDA 2V51B 4A5BA 4E1NA 3KKRA 4LF8K 4A57A 4M3YA 3CCEN 4RWTA 2A41A 2NRTA 2O8FB 2P51A 1N5YA 4DQQA 1U04A 2P9LA 4B9NA 3OYBA 4O5FA 1X9JA 4O8UA 1RDUA 4LF9K 1TYQB 1QE1A 4CFAA 3NE6A 3VEXA 2FBVA 3J81O 5FPEA 1OH8A 1QHTA 4GNIA 2NZTA 3NBPA 5AQOA 2F8TA 4BR7A 3VGKA 1XNRK 3IMXA 4YDUC 3TR8A 1SL2A 4GMJB 1LWCA 4W5OA 4H0TB 3MXMA 2G8HA 1LAWA 3PO5A 3LDOA 3JSMA 1IH7A 3SUQA 2ZGYA 1BCOA 4DLGA 3QEWA 4FJMA 4OPJA 3Q7BA 4AHUA 1B9FA 2NNWA 1T05A 2X6SA 3VGLA 3TTDA 3V1QA 1SAZA 3D45A 2EX3A 3MN5A 3VQ7A 1CXUA 5E84A 3T19A 1FXXA 2FF3B 2YNGA 1RDDA 2VWBA 3TAQA 2CGKA 3QEXA 3QERA 3TSUA 2PBDA 3AVIA 2YJFA 1NK4A 3O80A 3E9LA 3VEZA 1BHLA 3G25A 3THYA 3HBTA 3ZETB 1X9WA 1NOZA 2BGGA 5AQUA 1XI1A 3ZT2A 4KREA 5HRRA 5J2MA 3QIOA 4I9QA 4F3OA 1D9FA 4H0YB 3EKUA 3TWHA 5FPNA 3MAQA 2GWJA 3LPTA 3DXKA 3CCUN 4RW7A 5AQPA 1KVBA 1QVGM 1RGIA 4YOTA 3CG7A 2ITGA 2ETJA 3EO3A 2ITMA 2VYPA 3SBTA 4IFEA 4DTSA 2JWKA 2A42A 3AARA 2QWOA 4FWOA 4N5SA 1LV5A 4EIAA 3CCSN 3P39A 3O6WA 3SMPA 3O3FA 5J2QA 3AVAA 4RW4A 1NJZA 3QEIA 3A0IX 1YJWN 2Z1HA 4KHPK 1YVUA 4KH6A 3OYAA 1BG3A 4PQUA 4QCLA 1RDAA 3VPZA 3DLEA 2W40A 1BUPA 3AA5X 5CZ2A 3CF5L 2HHXA 5M1KA 5BRHA 3L4IA 1BI4A 1YJNN 1TK0A 3I55N 4CJLA 4JNEA 1LWFA 3O3HA 3O4NA 2NRZA 1NK0A 3A2FA 4AHVA 4DSIA 4CESA 3OYLA 4BRDA 4HTLA 3E9PA 2VG5A 4FLVA 4U67L 4OJRA 1XHZA 3L2UA 5HRSA 4Z0UA 4GVMA 4CEQA 1S6PA 2VWJA 1Q18A 1P90A 3R8EA 3KKSA 2UYTA 4KHSA 2F8SA 5FROA 4DR4K 4KFBA 5AQFA 5FRMA 3ZSXA 2XY8A 2OZMA 2UUAK 3KK2A 2XHBA 1J53A 3WXIA 3U3YA 3LM9A 3EY1A 1QS4A 4AM6A 1NKBA 1DLOA 3LDQA 5HP1A 4X66K 4CJ4A 1YIJN 3BF3A 3A5LC 3SAFA 2F7TA 1KFSA 1Q7YO 4B9SA 2P9SB 4DV5K 4YOXA 2YI1A 2LSNA 4I2QA 2YKNA 2VGMA 4CF8A 4PKGA 1DT9A 3LDNA 2E20A 5EOYA 1ZBUA 2D5RA 2W42A 2G8IA 4C8LA 4AQYK 1T3VA 4CZLA 4Z4CA 4JRPA 4DR5K 3AO4A 3LDSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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