2E6LA

Structure of mouse wrn exonuclease domain
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
molecule tags Hydrolase
source organism Mus musculus
total genus 60
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6lA00
4CHQA 2ZQBA 4FJNA 2IDOA 4Z4GA 2KW4A 3LPTA 3K57A 2VG6A 1EKEA 4W5RA 3RMBA 3K5MA 4FJ9A 4M3UA 5DMRA 2QK9A 4MQ3A 4O0IA 4FVMA 1LAVA 1HRHA 3OS2A 3QEVA 2FBYA 3QNNA 2ZE2A 3NGIA 4OPKA 1CLQA 3MEDA 4PY5A 1C1AA 4W5TA 3PX6A 5HROA 3OYDA 2OZSA 1RTDA 1SKRA 4RG8A 3P1GA 3UIQA 4O55A 1U49A 4FW1A 2IAJA 2Z1JA 3NGYA 3HVRA 4DTMA 1NJWA 3OYFA 1QS4A 3CFRA 4AHTA 3U6FA 1Q8IA 3I0SA 4AHVA 3CFPA 4CFBA 1L5UA 1BCMA 4FJKA 1JLCA 3AVIA 1VSEA 3VQQA 3DRPA 3TAPA 2NUBA 4KHUA 4BDPA 3CG7A 4CFCA 4OLBA 2HHTA 2YNFA 3KLEA 3QINA 4DTXA 2RF2A 3DLGA 1HMVA 2QXFA 3DLBA 1S9GA 1WAFA 4OVLA 4EP4A 2WONA 4CE9A 1BIZA 4CEAA 1A5VA 4CGJA 1GOCA 3AO2A 4CHZA 4CHNA 4GVMA 2Y1JA 1VK0A 2F8TA 4K8XA 3ZCMA 1QTMA 3PO5A 4FM1A 1NOZA 3SZ2A 1YTUA 3ZSVA 1JKHA 4CJFA 4LSNA 1S6PA 2HNYA 1J9AA 3NH2A 2HW3A 3HPOA 4B9TA 4M3XA 3OYEA 2D0BA 3V9WA 2OPQA 1S1TA 4KTZA 3HM9A 4DFJA 4ZTJA 1NOYA 1HNVA 3I8DA 2Z1HA 3TAFA 4B9MA 4BACA 1RT1A 4JS4A 4CEQA 4EZ9A 3LANA 4CFAA 5J2PA 1L3TA 5KI6A 3KD5E 4HCBA 3O3GA 3PUFA 3AO4A 3OYKA 3SQ2A 4CK2A 1L3VA 4DSKA 4KHQA 2E6LA 1Q9YA 1KRPA 1JL2A 4O5BA 1RT4A 3LAKA 4CJQA 3KK3A 3ZSYA 4M3RA 4HVJA 4FLYA 2HHWA 1VSLA 4MFBA 4FZXC 1JLBA 5T7BA 1U45A 1IG9A 4E7KA 3T1AA 1KFSA 2LSNA 4CF8A 1BGXT 3NDKA 4WE1A 4G1QA 4FLXA 1S5JA 1NK6A 2BANA 5HRRA 1N6QA 3L2RA 1HQEA 4B9LA 1S1VA 2AJQA 3CFOA 2OYQA 2X6NA 4OKJA 3O4NA 3PO4A 1HPZA 2OPPA 2G8KA 3I0RA 4CF2A 4NCBA 3AV9A 1IKVA 3CM5A 4BWJA 3ZT0A 3U3YA 3KLHA 3PV8A 3MAQA 2KFZA 3L3VA 3NBPA 1O1WA 3NH1A 2G8UA 1C1CA 3HL8A 1VSJA 1ASUA 3M8RA 3S3NA 3VQEA 3KLIA 2XY7A 2P5OA 3NCIA 3M8SA 1TV6A 1UOCA 1WAJA 3VN5A 4H4MA 1QSSA 3HK2A 1QE1A 1WSJA 3SCXA 1FK9A 3ZSOA 1SV5A 2RPIA 3WNEA 3VQ4A 5HRNA 4CJVA 4JS5A 1SL2A 3L2WA 4KB1A 1TGOA 4CJTA 3DM2A 3B6OA 1ASVA 3VQDA 1JLFA 3AA5X 1RTIA 1C1BA 2GUIA 5C24A 4OKEA 5HRPA 2G8VA 3V9SA 1UA1A 4FJGA 1QQCA 1VSHA 4HUFA 1KFDA 1Z26A 4M45A 2OPSA 2XO7A 4CESA 3C94A 4OPJA 1ASWA 3RMCA 2EX3A 3RR8A 3NF8A 4CJWA 3ZT1A 1J54A 4HUEA 4J2AA 1ZBFA 2IS3A 4IG3A 4DTNA 1XI1A 3OJSA 3SQ0A 2A1RA 4Y1DA 1WNSA 4DSIA 2FBTA 3AA3A 5KRSA 3MECA 4CCHA 1NJYA 3KJVA 4DLGA 4PA1A 4DWIA 3LZIA 1DLOA 3DOLA 4DQSA 4KAZA 2F96A 4CJUA 2JLEA 4Q5VA 4BWMA 4DSJA 3V81A 4KI4A 3AVCA 3HPHA 3OYAA 4C8MA 1WSGA 3V1QA 3QESA 4PUOA 3DI6A 3T3FA 1T05A 3ZSRA 3CYMA 4CJ3A 4E3SA 4W5QA 5HLFA 1RTJA 4ID5A 1UA0A 4RW4A 4CGGA 3TAMA 3OYGA 2XY5A 1YTAA 4CF0A 4DQPA 1ITGA 3OVNA 1LV5A 1TL1A 1IKYA 3NF6A 3ITHA 3HT3A 2VWKA 4CIFA 1RT3A 4B8CA 3TR8A 4FLTA 3AVKA 1RT6A 4FLZA 5KTQA 1HYSA 1Q9XA 4JRQA 3JYTA 4CK3A 1T03A 1U4BA 4N5SA 4LY7A 3ZT4A 1JLAA 1BQMA 2I5JA 3HPGA 4CEBA 3K58A 3SUNA 2G8FA 3QEPA 3NAEA 2BGGA 2HHQA 1R0AA 5CZ1A 5FROA 3V6DA 4RW7A 1XHZA 2B6AA 3HJFA 2QKBA 5EU7A 3VQ6A 4CJPA 4M41A 4M42A 3AVBA 3AVFA 4F2SA 4FJXA 1WSIA 4C8OA 4CGDA 4DTRA 4NCAA 1HYVA 1N5YA 3M8QA 4FCYA 1IO2A 2HHXA 2KFNA 2YNHA 3DLKA 4KI6A 1U48A 1RDCA 4Q0BA 1BHLA 3OYHA 4ICLA 3AVLA 4QAGA 3ZSXA 3OYNA 4ELVA 1BI4A 2YV0X 2PYLA 1VRUA 1EETA 4O4GA 4DTUA 1EX4A 4CJRA 1XWLA 3DMJA 3NH0A 1LW0A 1NK5A 4FJ8A 4E1NA 4CJ4A 4CJLA 1XHXA 3L8BA 4FJ7A 4CEDA 2D0AA 2OZMA 3AVHA 4BDZA 1RNHA 1NK4A 3ISNC 1SL0A 4KREA 1RT2A 1Y97A 4J2EA 3VQ8A 3KD1E 1KLMA 3CM6A 4B9SA 3IS9A 3E01A 4FK0A 2JGUA 4OGEA 3QEWA 2O4IA 5SZTA 3LP3A 4O0JA 4M3WA 4N56A 4F2RA 1HJRA 3OYCA 1W0HA 3OJUA 1Z25A 3AO1A 1J53A 4Z4CA 3KK1A 5C42A 1YT3A 4B8AB 3HXMA 3SV4A 4CJ5A 5KGXA 4DTSA 3PY8A 3PX0A 3O3HA 4Z4FA 2ATQA 1JLQA 2P5GA 3VQBA 1JLGA 3OYBA 3SJJA 2HNDA 4CFDA 3AVAA 5JS1A 1DTTA 4F8RA 4F3OA 2KZMA 4KPYA 1FKOA 1LWFA 3C95A 1TAQA 3AVMA 3QEIA 1BI4B 4KO0A 3V9XA 1BIUA 4RW9A 3NFAA 4CJSA 4YFUA 3RTVA 1TKDA 4HCCA 4AHUA 5DK5A 3P83D 1LWCA 4BE2A 3KLGA 1F21A 2BE2A 1L3UA 2X74A 3RRGA 3AO3A 2PY5A 4Y1CA 4KTQA 2DFEA 4B9VA 4B9UA 5SWMA 4M3TA 4CHYA 2GBZA 3NF9A 1NKCA 4C8LA 2X6SA 1NK8A 3K5NA 1SL1A 2G8WA 1WLJA 1GOAA 1BQNA 1VRTA 4CGFA 3OYLA 2YNGA 3DLEA 3LWLA 3LZJA 3SQ4A 1KVBA 3SUOA 4ELTA 2Q3SA 2A1SA 4ID1A 1D9FA 4KRFA 3OS0A 3HVTA 4IDKA 4F4KA 4KHWA 3AA2A 3A2FA 5FRNA 3KTQA 2HHSA 4H8KA 4DLEA 1RBRA 1X1PA 4UQGA 4H4OA 1NJZA 2W42A 4Z4HA 1X9WA 2BDPA 5KGWA 5KRTA 3F9KA 2YKNA 5HP1A 4DF4A 1ZBLA 2P1JA 1RILA 3VQ9A 1X9MA 2Z1GA 3DLRA 5CYQA 2XY8A 4KKOA 4N41A 4AHCA 3VQ5A 4CGHA 4CEFA 4FJIA 3KKRA 1GOBA 4EP5A 1KTQA 2P51A 1S6QA 3B6PA 2Z1IA 4CF9A 3TI0A 1HNIA 1TK0A 1HQUA 4E19A 3PX4A 4C8NA 3C6UA 4FJMA 3D0PA 3QLHA 5J2MA 2Y1IA 4PWDA 3L2UA 4DFPA 1NK0A 2D0CA 3V4IA 3ULDA 3OY9A 4DTOA 4KB0A 2O4GA 4XIUA 1TVRA 3H08A 1JXEA 1C0UA 1LWEA 3DRSA 2KQ2A 2DFHA 4DU4A 3VQCA 3WNHA 3VA3A 4IFVA 1CZBA 4AHSA 3LDSA 3BDPA 2ITGA 5K14A 1C0MA 1TK8A 2VWJA 4DU1A 1SKSA 4KHNA 4E89A 1W9HA 4LSLA 4DQRA 4LH4A 1TKZA 3TABA 4FJHA 2R7YA 4O44A 4TSXA 4ZTFA 3K2PA 1TKXA 2YNIA 3HO1A 2WOMA 3IRXA 4F3TA 1U04A 3RWUA 4EZ6A 1S1WA 4K8ZA 4AILC 1EXQA 4BE1A 1UAXA 3NHGA 1ZYQA 1L3SA 5HBMA 4HUGA 3HP9A 2HB5A 2RKIA 4OJRA 3K59A 1X9SA 4Z4IA 4N76A 2FC0A 4E7IA 3MEGA 1DTQA 3WNGA 3RMAA 1RDBA 4DS5A 2HVIA 2QKKA 1SUQA 4CIGA 2OPRA 1TL3A 3G10A 4OGCA 1ZBUA 4IKFA 2D5RA 3L2QA 1RDDA 2KZZA 4PQUA 1TAUA 4KHSA 4LD0A 3F73A 4Z4EA 4KTWA 1I39A 1QHTA 5J2QA 3ASMA 1YVUA 1WSHA 3KKSA 3HP6A 1I3AA 3TAQA 3THVA 2IC3A 2VG7A 3LP2A 1T7PA 3SQ1A 3VQ7A 4J2BA 4DU3A 3OYMA 1QSYA 1RBTA 4W5NA 3VQAA 1BL3A 2YHBA 3O3FA 4B3OA 3EZ5A 3QO9A 1VSMA 3EY1A 4AH9A 3SUPA 4IG0A 3QEXA 4FYDA 2XY6A 3V9ZA 1RBVA 5J2NA 2X78A 4GW6A 3U3GA 4DTPA 3NF7A 4AHRA 3TAGA 2HVHA 5I3UA 3QIPA 4KV8A 4CIEA 3G0ZA 3O4QA 3V1OA 4ZHRA 4DQQA 1JXBA 3TANA 3L3UA 1A5XA 1LW2A 2PYJA 3MXJA 4BDYA 4B9NA 1B9FA 2DY4A 1SKWA 4CJEA 3D45A 2IGIA 1QSLA 1D8YA 3LPUA 3T19A 2YHAA 4L8RB 2F8SA 4FJLA 1CZ9A 1KVAA 1WSEA 4FW2A 4ELUA 3SUQA 4QOZB 4R5PA 3DLHA 1NJXA 4KHYA 5D3GA 3S9HA 3C6TA 4OKKA 3SYZA 1CXUA 4KFBA 4CERA 4NCGA 1J5OA 4CEEA 5C25A 4FLUA 3RRHA 3S3MA 3RR7A 3ZSZA 4FLVA 4LH5A 2XRIA 4CHPA 1BISA 4BE0A 1RCHA 2E6MA 2DTUA 3V9UA 3QIOA 4FZZA 1NK9A 1T8EA 2ZD1A 1FXXA 4HTUA 4RW8A 3MXIA 1S1XA 4JRPA 2HNZA 4I7FA 4I9LA 4CHOA 2XHBA 4DSEA 4FM0A 3VA0A 1KSPA 1VSKA 5FRMA 4FK2A 3DOKA 1RBSA 1D5AA 2DFFA 2HMIA 3NGZA 3MEEA 1RBUA 1MU2A 4E7HA 1U47A 3HSTB 3OS1A 4DSLA 4N47A 3ZT3A 2B5JA 4QCLA 4CECA 1JLEA 4I2QA 1RDAA 1IKXA 3DYAA 4FXDA 4J2DA 1UWBA 3QNOA 3MXMA 3EYZA 3AVGA 1VSFA 1A5WA 4FJ5A 2FBXA 4CJKA 1KCFA 1VSDA 4E0DA 4YNQA 1S9EA 3ZT2A 1B9DA 2E4LA 3S3OA 4IFYA 4IBNA 4FM2A 4OLAA 2IOCA 3LALA 4NYFA 2G8HA 1REVA 4C8KA 4DQIA 4M3ZA 4FLWA 4E7LA 4E7JA 3KIOA 3TWHA 1RT5A 1IKWA 1KVCA 2GV9A 3DRRA 5JS2A 5HRSA 3K5LA 1NKEA 3IG1A 3AO5A 3ALYA 3P5JA 1JL1A 4GMJB 3L2VA 4DFMA 2KTQA 2YKMA 3QETA 2PZSA 4CEOA 3BGRA 3K5OA 1VSIA 3ZSWA 3SPZA 3FFIA 4M3YA 1ZBIA 3LP1A 1C6VA 1RTHA 5CYMA 2VG5A 4I2PA 1LAWA 4CF1A 1NKBA 3KK2A 4DF8A 4DG1A 3IAYA 5E41A 4DFKA 4B08A 4W5OA 1FKPA 1G15A 2RN2A 3V1RA 3KLFA 4I9QA 1K6YA 3OYIA 3JSMA 1C0TA 4RW6A 3SI6A 4Z0UA 2FBVA 4JLHA 3LWMA 1KLNA 3AVNA 3WNFA 5CZ2A 1NK7A 4FJJA 3RMDA 1HYZA 3SV3A 1TKTA 4DS4A 4FZYA 4FK4A 2HHVA 3M8PA 3NE6A 2ETJA 3SNNA 2G8IA 1IH7A 3VQPA 3SPYA 3TARA 1ZBHA 5CY4A 3AA4A 1WN7A 3HYFA 1D9DA 3LAMA 4CEZA 1B92A 3AVJA 1BCOA 4E1MA 2B4JA 3LP0A 1RT7A 1TK5A 2HHUA 1S1UA 1CXQA 3CQ8A 2EHGA 4DTJA 3ZSQA 4DMNA 4DSFA 5J1EA 5I42A 1XC9A 4CK1A 4NYNA 3OYJA 5FDLA 1EP4A 4HHTA 4CGIA 3TAEA 3QERA 2OA8A 1WSFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5F1XA 1QVGM 3K57A 3RMBA 3CJ9A 5DMRA 2FSJA 3H1VX 3CQYA 4OPKA 1YJWN 1C1AA 3PX6A 3UIQA 4EFHA 5JMVA 3HVRA 2Z1JA 4DTMA 1NJWA 3FZHA 3QFUA 3CFRA 4AHTA 3CFPA 3AARA 4CFBA 1BCMA 1BDGA 3VQQA 1VSEA 4IXCA 2NUBA 3CG7A 2QWMA 3KLEA 3VPZA 3AAPA 5AR0A 1GLFO 4OVLA 2WONA 3ZETB 4CEAA 4CHZA 1XQSC 4JYAK 3ULEB 5CR4A 4K8XA 4B1UB 3G6EN 4FM1A 3GDQA 4GVEA 1JKHA 1S6PA 3CC4N 4BRHA 4M3XA 3HM9A 4BR7A 3E66A 4JS4A 4CFAA 4A57A 3KD5E 5KI6A 3O3GA 4KHQA 1L3VA 1KRPA 4JEPA 4FLYA 1RT4A 3KK3A 4HVJA 4M3RA 2V52B 3CI5A 3F9MA 1VSLA 4MFBA 4FZXC 2WUSA 1U45A 2LSNA 4WE1A 4GNIA 4MO4A 1N6QA 3RSEA 1HQEA 2AJQA 3CFOA 2OYQA 3ZEUA 2OPPA 2G8KA 4CF2A 3AV9A 4BWJA 2VQEK 4WCEL 3U3YA 3KLHA 3PV8A 2KFZA 4JAXA 2H3GX 3C6AA 4JD2B 3T69A 2QEXN 3NCIA 3M8SA 1TV6A 3O9RA 3UKRA 4X62K 1QSSA 3SCXA 4E1JA 3WNEA 3VQ4A 5HRNA 5KQDA 4H0PA 4H5NA 4CJTA 5I9EB 3DM2A 4RTFD 4WFNL 2G8VA 4FJGA 4OKEA 3Q7CA 3FFKB 3VERA 3RR8A 3ZT1A 4J2AA 1ZBFA 4IG3A 1NM1A 2NRZA 2FBTA 5KRSA 1NJYA 4CZLA 4DWIA 4CZKA 4CJUA 4Q5VA 4BWMA 3R3LA 1NBWA 2HF4A 1MWKA 3HPHA 3V1QA 4PUOA 3DI6A 1M1KO 3C7NA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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