2E6LA

Structure of mouse wrn exonuclease domain
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
molecule tags Hydrolase
source organism Mus musculus
total genus 60
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6lA00
3A2FA 1EP4A 3AVKA 4FM0A 4Z4FA 3VQ8A 1K6YA 4FJJA 5J2PA 2HMIA 3ZSQA 2OYQA 4W5TA 2YNIA 4O0IA 4N5SA 3TR8A 5C24A 3RR7A 3ZSOA 4CEDA 4EZ6A 1VSHA 1C0UA 4E7IA 1SL1A 2HHTA 5KGWA 3LZJA 3CQ8A 4DSIA 3V1OA 3DOLA 1S1TA 4CGFA 2X78A 4KRFA 1XWLA 2HNZA 4DTPA 1WSGA 4DTJA 4KI6A 1Q8IA 3D45A 1HQUA 4BWMA 3VQEA 1IKYA 1JL1A 1KFDA 1UA0A 1NKBA 4L8RB 5HLFA 1EX4A 2F8TA 3KLHA 4CJ5A 4FJKA 1WSIA 4LY7A 1EKEA 1ZBUA 4CJUA 2XY7A 3K5LA 2D0AA 4OKKA 1X9MA 4KTWA 1RNHA 3ZSRA 2B6AA 3NGIA 1RCHA 2X6SA 4AHCA 2P1JA 3IS9A 2A1RA 4CFDA 3V9SA 2PYJA 4ELUA 4E0DA 1B9DA 1UAXA 1TVRA 4OGEA 3LP2A 4CGGA 3TAGA 3THVA 4B9TA 4N41A 3NH2A 4DQSA 4DSLA 4IFVA 1NOZA 2Z1HA 3VQ9A 3NHGA 1NK6A 3V9WA 4J2BA 3KK2A 5SWMA 3S3MA 3QEXA 4E7HA 3S3OA 4MFBA 3OS1A 1NK5A 1L3VA 3VQQA 1JLEA 4B9SA 1LWCA 3DLHA 4B9MA 2KW4A 1LAWA 3M8QA 4I9QA 2XHBA 1YTUA 3AVHA 3T1AA 4DFKA 3OYGA 4CFBA 5FDLA 3DLRA 2GV9A 3LPTA 4DLEA 2JLEA 2QXFA 1R0AA 1IG9A 3K58A 1JXEA 1TKTA 4C8MA 3VQDA 3SUQA 3TAEA 4F8RA 4FLYA 3AVJA 1ZBLA 1Q9XA 1NK8A 1QQCA 3TWHA 3E01A 1HNVA 4BDYA 3SYZA 1SL0A 2FBXA 1YT3A 5C42A 4TSXA 4DF4A 1D9FA 1XC9A 2P5GA 1A5XA 4JRPA 1D5AA 3KLFA 4CJVA 3CM6A 3L8BA 4DS5A 3U6FA 5HP1A 3AVCA 4K8XA 3OYCA 1QS4A 4N76A 1L3TA 3L3VA 3K57A 4DTMA 3SCXA 4EZ9A 4B9UA 4FK2A 2BE2A 1FK9A 1JL2A 4DFPA 3WNHA 1U49A 1S1XA 3HK2A 1VSJA 4HVJA 2HNDA 4PUOA 4YNQA 4DU4A 2IC3A 4I2QA 4AHVA 4DTNA 4F4KA 1JLFA 4RW8A 1TAQA 1SUQA 4M3TA 3OYBA 3EY1A 2D5RA 4CJ4A 3H08A 4DS4A 4MQ3A 2O4GA 3LP1A 3DRSA 1SL2A 4QOZB 2YNGA 1T8EA 2DY4A 3L3UA 2Q3SA 1HQEA 4FJLA 4FK4A 1RBRA 5HRSA 4PQUA 4FW2A 3TAMA 4CIGA 2KQ2A 4N47A 4ZHRA 4ZTJA 1JLQA 4CIEA 4O4GA 3ULDA 3MXMA 2OZSA 1YTAA 4DQIA 2OPRA 2FBTA 2WONA 3AVAA 1B9FA 2XY6A 4DQQA 3NF8A 4OKJA 4CJWA 4KB0A 4IKFA 4CERA 1I3AA 4BACA 2E6LA 2EX3A 1IKVA 2Z1GA 3LWLA 3LANA 1NK0A 4Z0UA 3ZSYA 5CY4A 4AHRA 3EZ5A 4AH9A 2HVIA 2IOCA 5J2QA 1C1BA 1S1UA 3OYNA 3SQ2A 1XHZA 2RPIA 3CYMA 1GOBA 4KO0A 4CF0A 3VQCA 1IKXA 1VSEA 3HVRA 5KGXA 4M3XA 1RDCA 1QHTA 3DRRA 4CF1A 4FJ9A 4HUEA 4GMJB 1UWBA 1L5UA 4KHQA 4OLBA 1J54A 3KKSA 1A5VA 4Q5VA 3LAKA 3K5MA 4QAGA 4KV8A 3VQBA 4FLVA 2FBVA 3HPHA 4JLHA 5J1EA 3OYEA 1NJYA 4OJRA 4ZTFA 1KLNA 4KI4A 1ZBHA 4H4OA 1TKXA 3V9UA 4E7JA 3PX0A 5KRTA 1TK8A 3NF9A 2EHGA 4DTRA 1X9WA 3KLIA 3SJJA 1JLGA 4CHYA 3NE6A 4DTSA 2IAJA 2DFHA 2ZQBA 3UIQA 4BE1A 1U45A 1WNSA 3KKRA 1RTIA 1S1VA 1C6VA 4RW4A 1YVUA 4FW1A 4RW6A 4CEZA 2XY5A 1U4BA 1RT1A 2KTQA 5K14A 2WOMA 3RMAA 3HO1A 3L2UA 5HROA 3OYIA 3G10A 3MXJA 3QIOA 1I39A 4EP4A 5KTQA 4KTZA 4B8AB 4W5RA 1IKWA 3AVLA 4CFCA 4Y1CA 1RDBA 4FJ5A 5JS1A 3M8RA 4B9NA 1FXXA 1UA1A 4QCLA 4KAZA 4CGDA 1EXQA 1TKZA 3LP0A 4CFAA 1VSIA 4CJRA 3KK1A 4FLTA 2QKBA 1C0TA 3ASMA 1N5YA 1ZBIA 1HMVA 1HYVA 3AVIA 4GW6A 3V6DA 3TAFA 4LH5A 3IAYA 4J2DA 3ZT1A 3PY8A 2VG6A 4OKEA 3OYKA 3PX4A 2D0BA 4CEEA 3HT3A 3KK3A 4KFBA 3P5JA 5CZ2A 3LP3A 1TK0A 4BE0A 4CHZA 4KREA 3OVNA 3O3GA 3SV4A 2P5OA 2BGGA 3MXIA 4FJGA 3OYLA 4FLZA 2QKKA 4B9LA 4PY5A 3ALYA 1RBTA 4E3SA 2HHXA 1BIZA 4M3UA 3QO9A 3RRHA 4O0JA 4CJLA 5I3UA 3SPZA 1BHLA 1KVCA 4DU1A 3AA5X 1LW0A 1LWFA 4LD0A 3MECA 4M3RA 3JSMA 2KFZA 2RF2A 1RT5A 4C8NA 4B8CA 3AO2A 3CFPA 1Z26A 4PA1A 3SUOA 2E4LA 5I42A 1NJZA 1SKSA 1T03A 4I7FA 3QEVA 1NKCA 3SUNA 4C8OA 3OJUA 2A1SA 4CJFA 2HHSA 4RW9A 3I0SA 2JGUA 5E41A 2YHBA 4ICLA 1NK9A 4E1MA 4CGJA 3QETA 4HUFA 4CHOA 1BCMA 1C0MA 4CF9A 3QIPA 4E89A 4FLUA 3M8SA 4FM1A 3P1GA 4IBNA 2R7YA 1F21A 3V9XA 1U48A 2PY5A 3NF6A 4KHNA 1BI4A 3RMBA 1S6QA 1QSLA 1RDAA 2PZSA 3RWUA 3AVGA 3AO3A 2DTUA 3OJSA 4M3WA 2YKNA 3LWMA 4DSEA 3U3GA 4FLWA 3MEGA 1J5OA 2OZMA 1CLQA 3C6UA 4C8LA 2G8HA 3NDKA 1RILA 3SNNA 1KLMA 3PX6A 4YFUA 1W9HA 3IG1A 4KHWA 4OGCA 1Q9YA 3NGZA 2HHQA 4IFYA 1S1WA 4CF8A 4M3ZA 1LAVA 1EETA 2YV0X 4F2RA 3SPYA 3OYHA 4OVLA 3U3YA 1ITGA 1VRUA 1WSJA 4GVMA 5CYQA 4FCYA 2LSNA 2VG7A 3MEEA 2HHVA 3AVMA 3ZT0A 4NYNA 4IDKA 2FBYA 3V1QA 1JLBA 3OYJA 2G8WA 4KPYA 4AHUA 4E7LA 4CGIA 4LSLA 2FC0A 1L3UA 1D9DA 4R5PA 1BQNA 3WNEA 1T05A 3PO5A 4CIFA 2GBZA 1BGXT 1LWEA 3L2RA 3I0RA 1WSEA 3DMJA 4FZYA 2G8KA 2PYLA 1VK0A 3L2WA 3RTVA 1S5JA 3C6TA 1NK7A 3TI0A 4CE9A 3IRXA 3KIOA 5JS2A 3B6OA 2NUBA 2B5JA 4Z4EA 4CESA 3VQ4A 5FRMA 4JS5A 3SQ0A 1XHXA 1NJXA 4CCHA 3NAEA 3ITHA 1BISA 3HYFA 4HUGA 3RR8A 4KHYA 5J2NA 4Z4GA 1RT7A 1RT6A 1BIUA 3LPUA 4W5OA 4CJ3A 4O55A 3SV3A 1L3SA 3HVTA 3S9HA 2OA8A 3DLBA 4FYDA 4Y1DA 3OYFA 2W42A 2HNYA 5SZTA 1D8YA 1QSYA 4B3OA 3HM9A 3K5NA 3TANA 2HW3A 3OYMA 1QTMA 3RMCA 4DLGA 3B6PA 1HYZA 1KSPA 3ZT2A 4DTXA 1TK5A 1MU2A 1O1WA 2VG5A 1VSKA 3OS0A 4IG0A 1RT3A 3G0ZA 3CFRA 4CHNA 1DTTA 3NGYA 1TL1A 3NH1A 3TABA 4FJ7A 1WAFA 3VA3A 4DWIA 5HRNA 4KB1A 4Q0BA 3LALA 3DOKA 1KVAA 2ATQA 1RBUA 3LZIA 3KD5E 5J2MA 4ELVA 1SKWA 4CEBA 4CK3A 3NH0A 3DM2A 4DFJA 3VQ5A 1ASUA 1NOYA 1RBVA 1TGOA 1GOCA 4CK2A 3EYZA 2Z1IA 3T19A 1CZBA 3MEDA 4FJMA 3DLGA 4NCGA 3HJFA 3HPOA 3NF7A 1UOCA 3PV8A 2DFFA 4XIUA 3V4IA 2AJQA 3HP9A 3ZSZA 3O3HA 4WE1A 2Y1JA 2G8IA 3I8DA 2HB5A 3QLHA 1U47A 5DK5A 2XRIA 3DI6A 4E19A 2F96A 3V1RA 4CHPA 4E7KA 4NCAA 4NYFA 4HHTA 3SZ2A 3AA4A 1J53A 3TAQA 3KLGA 5HRRA 3AO1A 3HL8A 4M45A 4OPKA 1RT2A 4CGHA 1RTHA 3AV9A 1TV6A 1JXBA 1S6PA 3OYAA 4CECA 4FJ8A 3VQAA 1ASVA 3PO4A 4HCBA 4CJQA 3VA0A 1RT4A 5CZ1A 1HRHA 4M42A 1CXQA 1REVA 3ZCMA 4DQRA 1BL3A 4CF2A 4C8KA 1VSFA 1IH7A 1JLCA 2X6NA 4Z4CA 4G1QA 3ZSXA 2B4JA 2O4IA 3NCIA 3DLKA 1WLJA 4DFMA 1BQMA 1RBSA 1RTJA 4K8ZA 1A5WA 3CFOA 3AA3A 5EU7A 3ZSWA 5C25A 2HHUA 1X1PA 3V81A 3KD1E 4F2SA 1GOAA 3QNOA 4DF8A 3PUFA 4DG1A 4FJXA 3OY9A 2XO7A 2KZZA 2X74A 3QINA 3NFAA 3SUPA 3TARA 4FJIA 1S9EA 3TAPA 3KJVA 4ID1A 3LDSA 1N6QA 4M3YA 4DSFA 3D0PA 2DFEA 3BGRA 1WAJA 2I5JA 1JKHA 4HCCA 2RKIA 3AO4A 3QERA 4OLAA 3OYDA 4FZXC 3HP6A 2XY8A 4EP5A 4AILC 3CG7A 3S3NA 1LW2A 1FKPA 3AVNA 3FFIA 2Y1IA 2G8FA 1S9GA 1U04A 5FRNA 1HPZA 4CJTA 2RN2A 4H4MA 3QESA 1WSFA 4I2PA 2G8VA 3DLEA 2YNFA 4B9VA 1CZ9A 4CJSA 4NCBA 1HNIA 1IO2A 4B08A 1KTQA 1KRPA 1TL3A 3QNNA 3VQPA 4FJHA 1SV5A 1J9AA 1ZBFA 3ZT4A 1C1AA 4DQPA 4DSKA 5KRSA 2VWKA 4DTUA 1NJWA 2BDPA 3K5OA 1BCOA 1QE1A 5KI6A 3AO5A 3SQ1A 3O3FA 1X9SA 4DSJA 4W5QA 1B92A 3WNGA 3T3FA 2HVHA 1W0HA 1TKDA 3HSTB 5DMRA 3RMDA 4BDZA 3MAQA 1FKOA 3HPGA 4DU3A 1DTQA 3JYTA 5D3GA 3KLEA 2VWJA 4IG3A 1SKRA 3C95A 4FXDA 3OS2A 3RRGA 4CJPA 4OPJA 4FLXA 4ELTA 3QEIA 4CEOA 1XI1A 3CM5A 1WN7A 2QK9A 3L2QA 2IDOA 4KTQA 4DMNA 4M41A 3O4NA 4E1NA 3AVFA 2IGIA 2GUIA 4CJEA 2ITGA 1NKEA 4FJNA 1KVBA 4I9LA 3F9KA 4Z4IA 1C1CA 4FZZA 5T7BA 4AHTA 4PWDA 4FM2A 4BDPA 1RTDA 4HTUA 1KCFA 4BE2A 4BWJA 2YNHA 3AA2A 1QSSA 5HBMA 1WSHA 3KTQA 1VSMA 3L2VA 3VQ6A 4CEQA 1ASWA 3LAMA 4LH4A 4KHSA 2P51A 1ZYQA 3K59A 2OPSA 2ETJA 4O44A 1HYSA 3M8PA 3P83D 2YHAA 2F8SA 4CHQA 4RW7A 5FROA 3WNFA 4UQGA 3DRPA 4Z4HA 2OPQA 2Z1JA 3ISNC 4ID5A 2YKMA 1LV5A 2G8UA 4CJKA 3VN5A 2ZE2A 4FK0A 4CK1A 1Y97A 1CXUA 3HXMA 5CYMA 3NBPA 4LSNA 2KFNA 4F3OA 3DYAA 3K2PA 4J2EA 4DTOA 3ZT3A 2HHWA 1Z25A 1TAUA 3ZSVA 1HJRA 2IS3A 2OPPA 3AVBA 3O4QA 4O5BA 2BANA 1JLAA 1RDDA 4RG8A 2ZD1A 3QEWA 3QEPA 1T7PA 3SQ4A 3C94A 1VRTA 4JRQA 1BI4B 1KFSA 3V9ZA 1DLOA 2E6MA 3VQ7A 1NK4A 3BDPA 5HRPA 4F3TA 4KHUA 4J2AA 2KZMA 2D0CA 4CEFA 4KKOA 4N56A 1G15A 1VSLA 4CEAA 4JS4A 4W5NA 4AHSA 3F73A 4H8KA 4FVMA 3SI6A 1VSDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MMVA 1K6YA 3ZSQA 4A2BA 1WUAA 1NU0A 1HNXK 3AAPA 3RR7A 4CEDA 4E7IA 3LZJA 3CQ8A 3SMPA 3ATVA 3FZKA 2UYTA 3DOLA 1KD1O 2QXLA 4DTPA 4DTJA 1P8ZA 4BRGA 4L8RB 3VF2A 4WF9L 5HLFA 5LJVA 4FJKA 1WSIA 3G6EN 3THXB 4MO4A 1ZBUA 4CJUA 5DM6L 2D0AA 1RNHA 3NGIA 4K25A 4CFDA 4ELUA 1B9DA 4B9TA 4CGGA 2P9PB 2ASMA 4Y0WA 4JI4K 2VGNA 4IFVA 3VQ9A 2Z1HA 3NHGA 2W6LA 3V9WA 5SWMA 3QEXA 4MFBA 3OS1A 1NK5A 4B3TK 1JLEA 2O8EB 1QZ5A 3M8QA 4I9QA 3T1AA 3K0SA 3LDNA 1IG9A 1O13A 3THWA 2E5LK 4F8RA 4OX9K 4FLYA 1ZBLA 1QQCA 3E01A 4BDYA 1Q81O 1YT3A 2P9NB 2YJEA 4DF4A 4IDHA 1D9FA 2A41A 1D5AA 1OH7A 4CJVA 4YY3K 3TU5A 2HF3A 4K8XA 1GLJO 2FSNA 3AVCA 1QS4A 5H1SQ 3VPZA 3K57A 4CW7B 3WXLA 1FK9A 5LMUK 3WNHA 4A57A 1S1XA 4HVJA 4PUOA 2GWKA 3MN5A 4RW8A 1SUQA 3JXUA 1QVGM 3EY1A 2D5RA 3O8MA 3H08A 5BRFA 4BVOA 5AQFA 1NJIO 3MK6A 4QOZB 2IVNA 5GIPA 4GY2B 5AQTA 4GNIA 4GKKK 4MLEA 3I55N 5JICA 2OPRA 4K0KK 3AVAA 1B9FA 4A61A 3NF8A 3THYB 2I7NA 1SAZA 2EX3A 4MDBA 3LANA 1NK0A 3LM2A 4AH9A 4EHUA 1S1UA 3CJ9A 3OYNA 3SQ2A 2RPIA 1MWMA 3VQCA 2GX9A 1IKXA 2UXCK 4M3XA 1QHTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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