2E6LA

Structure of mouse wrn exonuclease domain
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
molecule tags Hydrolase
source organism Mus musculus
total genus 60
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6lA00
4ICLA 3L2QA 3V6DA 4CK2A 3HSTB 4BDYA 1KTQA 1VSDA 1LV5A 1TVRA 3V9ZA 4OLBA 1SV5A 1VSLA 3I0SA 4DSFA 4AHTA 1U45A 1UA1A 2BGGA 3SI6A 2HMIA 1I39A 4FK2A 1RDCA 3SQ1A 3TWHA 4DTRA 4JRQA 4Z4EA 3THVA 4NYNA 2HHSA 4HUGA 4W5RA 3L2RA 3DRRA 4CEDA 3OYFA 3SYZA 1TK0A 1U49A 3KLGA 4FLUA 4KKOA 3LWLA 3LWMA 3L8BA 4BE0A 5KGWA 1T03A 4KPYA 4KHNA 4FJ5A 4IG3A 4MFBA 3PV8A 4FZXC 3AVAA 4KHQA 4Q5VA 3NF8A 2LSNA 2RF2A 1WSGA 1JLEA 3TABA 4JS4A 4CJUA 1U48A 2FBYA 2XY8A 1JLBA 3HP9A 2QK9A 3HJFA 3DRPA 4KO0A 2G8UA 3M8SA 4Z4FA 4XIUA 4H4OA 3QIOA 2X6SA 3MXJA 4NCBA 5HRNA 4KTQA 4FJ8A 1LW0A 3AA5X 5CYMA 4O5BA 3M8QA 4N47A 3HXMA 1W0HA 4AH9A 4FLVA 1T7PA 1RBRA 2IDOA 3VQ4A 1KSPA 1TL1A 2G8VA 4N76A 4W5NA 3KIOA 3HO1A 3AVHA 1Q8IA 1WLJA 2Z1JA 3H08A 4FM1A 2IS3A 4FJNA 1UOCA 1QTMA 4M45A 3K5MA 4HCCA 4Z4GA 4LY7A 2HNZA 1EXQA 2VG5A 3B6OA 2Z1GA 4I2QA 4C8NA 5JS2A 4CEBA 2P51A 3QNNA 4W5QA 3S3OA 3QLHA 1FK9A 2E4LA 3V9XA 1RTHA 3SJJA 4DSLA 1D8YA 5HRSA 4FLYA 4KFBA 4CJQA 4CJVA 3QETA 1NK9A 4CHPA 3V9UA 1L3SA 3P83D 1RT5A 4F3OA 4E7JA 4N41A 3AO1A 3V4IA 2YHAA 4F2SA 3G10A 1XHXA 3OYDA 2KFNA 3FFIA 2F8SA 2HHVA 4E89A 5C25A 3ASMA 2VWKA 4KB1A 2A1SA 3LANA 2B6AA 4I9LA 4M41A 1KVCA 2DY4A 1BQMA 1KLMA 3AVIA 3AO2A 2BDPA 3V1RA 4B9NA 4FK0A 4DF4A 2JLEA 4EP5A 3HPGA 1JKHA 4CF0A 4FZZA 4M3XA 5K14A 4IDKA 1JXEA 3CG7A 4CEZA 3K57A 2OYQA 4KHYA 3L2UA 3NDKA 2P5GA 1QE1A 1ASVA 2RN2A 4B08A 2OZMA 1ZBHA 4CGFA 2BE2A 4MQ3A 4DTOA 1WAFA 2HB5A 5CZ1A 5FDLA 1XI1A 4DSJA 1QSYA 2OA8A 4J2EA 2QKBA 5J1EA 4LSLA 1GOBA 3AVCA 3VQPA 3G0ZA 2ETJA 3I8DA 4JLHA 2HVHA 1FXXA 1GOAA 3SNNA 4HUFA 2OZSA 4CFBA 5SWMA 4OGEA 3ZT4A 4DG1A 4DLGA 1BISA 1TAQA 2ZD1A 3O3GA 1NK8A 3OS0A 4F8RA 2X78A 3VN5A 4FLXA 3DLHA 2HHWA 2RKIA 1Q9XA 3VQ5A 3K5NA 1B92A 1DTTA 1S6QA 3LP2A 3KK3A 1HNIA 4LH5A 4UQGA 1WAJA 4JRPA 4DTXA 3TAFA 3LZIA 3TARA 1NJXA 4E3SA 3TAQA 1N6QA 4I2PA 3LP0A 3AO4A 1K6YA 5J2PA 4CEQA 4FJIA 2B4JA 3HL8A 1C1CA 3QEWA 1QSLA 2XRIA 1HRHA 3F9KA 4ZHRA 3OYGA 3SUQA 3SPZA 4KAZA 4KB0A 1WN7A 4B3OA 4CEOA 4Z4CA 3MXIA 3HK2A 1RTDA 1VSKA 3NH2A 4CJ4A 4FK4A 4OKJA 1BIUA 3SQ4A 4J2BA 3AVNA 1Y97A 3WNFA 1U47A 3RR7A 4FJJA 4ZTFA 4Z0UA 5SZTA 3CM5A 3SUOA 1CZBA 1GOCA 1VSFA 1UWBA 1TKZA 3DI6A 2DTUA 3HYFA 1X9MA 2HHQA 3C6TA 4CHNA 4CEEA 4CJSA 4CHQA 3RRHA 4PY5A 1S5JA 2ATQA 1TAUA 1BQNA 3SQ2A 4CFCA 3NH1A 1LWEA 3QESA 5JS1A 1CXUA 3P1GA 2A1RA 4O0JA 4AHCA 3HVRA 4H4MA 4NCAA 4FW1A 1HMVA 1KFDA 1HJRA 4DU3A 3EY1A 5KRTA 4HCBA 3L3UA 2E6LA 3AVMA 5KI6A 4IKFA 3U3GA 3SV3A 3DOLA 1U04A 1VSJA 3IRXA 3QO9A 1BHLA 2XHBA 4HHTA 3OYBA 3AA2A 3LALA 3HVTA 4CJKA 5J2NA 1HYVA 1RBUA 4CE9A 3NGZA 3TAGA 3OYEA 5HROA 4YFUA 1S1WA 1C0TA 3C95A 3HP6A 1BI4A 3VQ8A 2R7YA 1L5UA 4KI6A 3L3VA 4CIFA 3RMCA 4ELUA 3NCIA 2KFZA 3E01A 1RT3A 2HNDA 5EU7A 1L3UA 2PZSA 3RR8A 1KLNA 3QEPA 5KGXA 3KTQA 1KFSA 3DYAA 3DLGA 4RW6A 4CESA 4DSEA 4IFVA 4J2DA 5HRPA 1VK0A 4IG0A 1FKOA 4AHUA 3NHGA 4CK1A 5I42A 1WSHA 1J53A 4NYFA 3K5OA 3ZT2A 1RBSA 4AHSA 4DWIA 4OKKA 2VG7A 4H8KA 3NF9A 2EX3A 3CFOA 1MU2A 4DS4A 3AA3A 4RW7A 4CIEA 3RMDA 4CJFA 4DTPA 4M3TA 1N5YA 5C24A 2YKNA 3OYHA 2QKKA 2EHGA 3EZ5A 1C6VA 1NKBA 4F3TA 3T1AA 2HNYA 4IBNA 1RDDA 1ZBLA 5HRRA 4CJ3A 4ID1A 3S3MA 1Q9YA 3O4QA 3CYMA 4YNQA 4KTWA 1KRPA 1CZ9A 3TR8A 4CCHA 3VA3A 3MAQA 3IS9A 4OLAA 4DFMA 3TAMA 3VQ6A 2Y1IA 1SUQA 4E19A 1S6PA 1Z26A 2JGUA 3VQDA 1RDBA 4CJWA 4E0DA 1S1XA 2IC3A 5KTQA 4DFKA 1NOYA 1C1BA 5DMRA 1JLCA 4LSNA 1LWCA 4G1QA 2D0AA 4CHYA 5D3GA 3ZCMA 1RBVA 4EP4A 1TK8A 2D5RA 3QERA 3WNHA 3K2PA 2XO7A 1RBTA 1KCFA 4K8ZA 3PX4A 3OYIA 1QQCA 3OYCA 3RTVA 1VSHA 1NK7A 3OVNA 1L3TA 4B9VA 3O4NA 2VG6A 2YHBA 4DFPA 2OPPA 3S9HA 3LP1A 4N5SA 1SKRA 3PY8A 2P5OA 1C1AA 2P1JA 4B8AB 1X9SA 1NK0A 4C8LA 3RWUA 4FJLA 1EETA 5J2MA 3MXMA 3C6UA 3QIPA 1X9WA 2QXFA 4OKEA 4CJPA 1T8EA 3SUNA 2YNFA 4KRFA 1C0UA 1S9EA 1A5XA 3LAKA 1Z25A 1D9DA 1EP4A 3OY9A 3L2VA 1EKEA 1JLGA 1O1WA 4FW2A 2KZMA 1YVUA 1IG9A 1VRTA 4BDPA 1LAVA 3UIQA 3BGRA 4W5OA 1T05A 4KREA 1TKXA 3NF6A 1X1PA 2G8KA 3TAEA 1D9FA 4RG8A 4CGHA 3ZSOA 3TI0A 4C8OA 3ZSQA 3KLEA 1RCHA 2X6NA 5C42A 4CGGA 1NK5A 1IKXA 2O4GA 1NJYA 3KD1E 4LD0A 5DK5A 2WOMA 1SKWA 1WSEA 2I5JA 2ZQBA 1ZYQA 4CJLA 4W5TA 2YNIA 3VQAA 5I3UA 3V1OA 3PO5A 4E7KA 1SKSA 1TK5A 1ZBIA 1RT1A 3AV9A 3ISNC 4DSKA 4AILC 2F8TA 3JSMA 3OYJA 3IG1A 5CZ2A 1TKDA 4M3WA 4M3ZA 4O44A 4KI4A 3DLEA 3WNEA 1RT6A 2G8IA 1CLQA 2BANA 3V9SA 2F96A 1J5OA 2YNHA 1HYZA 3KLHA 2G8FA 3KD5E 4FJHA 3AVFA 5HLFA 2PYLA 2PYJA 4E7LA 3TAPA 3DOKA 1QHTA 2Z1IA 4FLTA 3T3FA 1W9HA 3U6FA 4OGCA 4CJTA 3TANA 3SZ2A 4FJ7A 4FJXA 4M3UA 4CGIA 4GMJB 4EZ9A 4R5PA 3KLIA 4PA1A 1TGOA 3MEEA 2YNGA 3AVBA 3K5LA 1NOZA 4DS5A 4DQQA 4BWJA 2E6MA 3MEDA 3PX6A 3SQ0A 2HW3A 1VSMA 4KHUA 4CJEA 4BE1A 1NJWA 3LP3A 4C8MA 4Z4HA 1EX4A 3KKRA 3O3HA 4CIGA 4OPKA 3AVKA 3ZSRA 1NK4A 3PUFA 1BGXT 3AO3A 2HVIA 3VQQA 4DLEA 4WE1A 4DSIA 1JL1A 2HHTA 3NF7A 4CF8A 1B9FA 4K8XA 2YV0X 2FBTA 1SL0A 2XY5A 1BCOA 3OYLA 4DTNA 2IOCA 2Z1HA 1JLFA 1DTQA 5KRSA 3SPYA 4ELVA 4LH4A 1NKCA 1C0MA 1HNVA 3JYTA 4DU4A 3U3YA 3V81A 4FJMA 4KHSA 4PQUA 3AA4A 3DM2A 3M8PA 3HM9A 3QEXA 4F2RA 2IAJA 3B6PA 3T19A 4AHVA 3NE6A 4E7HA 2PY5A 1RDAA 4M42A 3RMAA 1ZBFA 3D0PA 3OYKA 3ZT3A 4FCYA 3LDSA 3DLRA 4FXDA 4CJRA 3NH0A 2KZZA 4E7IA 1ASWA 4PUOA 4E1NA 4O55A 4BDZA 3KJVA 4HTUA 3DLKA 1YTUA 3CM6A 1HYSA 3O3FA 4IFYA 4ID5A 5T7BA 3ULDA 2GV9A 2OPQA 4KTZA 3OYNA 5HP1A 1S1UA 1WSFA 2XY7A 2GUIA 5CYQA 1S1TA 3QINA 3VA0A 2O4IA 3LPUA 5J2QA 4J2AA 3VQEA 4DTUA 4CJ5A 4B9MA 4FM0A 4OPJA 3HPHA 4N56A 2IGIA 4CEAA 3AVJA 2D0CA 3K59A 3CFRA 4FLZA 4DF8A 2YKMA 4CHZA 3SV4A 4O4GA 4DTJA 4B9UA 3AVGA 2KQ2A 5E41A 2Y1JA 1TL3A 3S3NA 1RILA 1IO2A 3OS2A 2FBVA 1IKWA 4NCGA 1BL3A 1D5AA 1ZBUA 3ZSXA 3ZSYA 3EYZA 4CGDA 3QEVA 4FYDA 2DFEA 1A5VA 3MEGA 3ZT0A 3F73A 4BE2A 4RW8A 3NAEA 5CY4A 1TV6A 3KK2A 4DQRA 4CF1A 4C8KA 1JLAA 3VQBA 2W42A 3K58A 1RT2A 3OS1A 1FKPA 3NGYA 2OPRA 4RW4A 4B8CA 3QNOA 1J54A 2NUBA 2X74A 3LPTA 1HQUA 4FJGA 1YT3A 4GVMA 4M3YA 4Q0BA 2OPSA 4BWMA 4Y1CA 3SUPA 1NK6A 1JLQA 1VRUA 3QEIA 1HPZA 3LZJA 4DTSA 4Z4IA 4OVLA 3PX0A 4B9TA 4L8RB 3DLBA 1A5WA 4QOZB 2DFHA 3ALYA 4FLWA 1U4BA 2GBZA 1YTAA 1ASUA 3RRGA 1J9AA 4HUEA 1LW2A 4DQIA 1IKYA 1RTIA 1QS4A 2B5JA 2AJQA 2DFFA 3ZSVA 1F21A 4CHOA 4TSXA 1TKTA 2XY6A 1QSSA 1LAWA 3AVLA 3VQ7A 1S9GA 4DTMA 3SCXA 1WNSA 3CQ8A 4FJKA 1VSEA 1HQEA 4CECA 3ITHA 3CFPA 1XHZA 2G8HA 4DQPA 1VSIA 3OYAA 4QAGA 4E1MA 1R0AA 2FBXA 4DQSA 3D45A 3P5JA 1CXQA 1I3AA 5FRNA 4PWDA 5HBMA 1JXBA 2KTQA 1XC9A 4GW6A 3DRSA 1NKEA 1KVAA 4HVJA 1XWLA 3ZSZA 1UAXA 1WSJA 4CFDA 1WSIA 3KKSA 4I7FA 3WNGA 3IAYA 1IH7A 4CF2A 3AO5A 3NBPA 5FROA 1LWFA 2ZE2A 1SL2A 4CFAA 1L3VA 1ITGA 1SL1A 4QCLA 3C94A 3HT3A 3OYMA 4ELTA 2G8WA 4AHRA 1BCMA 4KHWA 1DLOA 4RW9A 4FM2A 1BIZA 1G15A 1RTJA 4OJRA 3KK1A 2KW4A 3V9WA 2WONA 4FJ9A 4FVMA 2D0BA 4CGJA 2HHXA 4CEFA 1RT4A 4DMNA 4Y1DA 4CERA 3I0RA 3M8RA 3LAMA 4M3RA 1REVA 3ZSWA 4FZYA 1NJZA 4B9SA 1KVBA 3VQCA 3NFAA 3OJUA 2VWJA 5FRMA 3VQ9A 3KLFA 4CF9A 4B9LA 3DMJA 1UA0A 4I9QA 4KV8A 3ZT1A 2Q3SA 3BDPA 3MECA 3OJSA 3HPOA 4BACA 3A2FA 3L2WA 4JS5A 3PO4A 4DU1A 4ZTJA 4CK3A 4EZ6A 1B9DA 1RNHA 4DFJA 1S1VA 1IKVA 2FC0A 3V1QA 3NGIA 4O0IA 1BI4B 2RPIA 1RT7A 2HHUA 1JL2A 4F4KA 2ITGA 3RMBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EWRA 5LJWA 1HNZK 2V7YA 3FZMA 3FZFA 4OLBA 1VSLA 1U45A 1E3MA 3SQ1A 4KHPK 3TWHA 4JRQA 4Z4EA 4BRAA 4NYNA 2WBNA 4HUGA 4W5RA 1U2VA 3SYZA 1NG9A 4KKOA 3LWLA 3L8BA 4BE0A 4FJ5A 4MFBA 2Q0UA 3PV8A 5FPEA 3AVAA 5HL7L 1JJ2M 2LSNA 3R8EA 3EZWA 3CQYA 3ID6A 2XY8A 1Y64A 1SS6A 2CGJA 4H4OA 2X6SA 1P90A 3AA5X 1T7PA 4O5BA 4AH9A 2AP1A 4FLVA 1C0FA 1RBRA 4JN4A 4DR1K 1TL1A 1KSPA 4HTLA 5FLXO 5BN8A 3H08A 2IS3A 1UOCA 3DAWA 3CC4N 4LY7A 4MDBA 2Q2RA 3B6OA 3F9MA 2P51A 3VPZA 2E4LA 3SJJA 2EWSA 4YOVA 4FLYA 4KFBA 1XC3A 5EOYA 4CJVA 1L3SA 4N41A 3AO1A 4F2SA 2QWNA 3SMPA 3OYDA 3FR0A 5KPZA 3ASMA 2VWKA 4I9LA 2DY4A 1KLMA 4FK0A 4LF6K 4YY3K 4NB4A 5AQNA 4A59A 4M3XA 4IDKA 1ZC6A 1VQ6N 3P38A 4KHYA 5AZIB 2BE2A 4B3SK 2BTFA 4Z94A 1WAFA 2FF6A 3CJ9A 1KXPA 4DSJA 4J2EA 5J1EA 3VQPA 3GL1A 4WFNL 4GV6A 4JKEA 2HVHA 1GOAA 3QFUA 4GNIA 5SWMA 4OGEA 3ZT4A 4DLGA 1BISA 3O3GA 2ZD1A 4IOAL 5C2DA 4FLXA 2HHWA 1LOTB 4H5NA 5M1QA 1HNIA 4JRPA 2QWOA 3TARA 1XMOK 3LP0A 5J2PA 1X3MA 3F9KA 2P9NB 1T3VA 3CCRN 1FJGK 1VSKA 4CJ4A 2A5XA 4J2BA 1Y97A 1U47A 4FJJA 4DV2K 3SUOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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