2E6MA

Structure of mouse werner exonuclease domain
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Mus musculus
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
total genus 61
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6mA00
1TAQA 4LD0A 3AA5X 3C94A 4B8CA 1QS4A 1NKEA 3DLHA 4KTZA 5CZ2A 5HRSA 4DSLA 3AVAA 2G8IA 1C0TA 5HBMA 4CGIA 1KRPA 1L3VA 1T05A 4O0JA 1LWCA 4DFJA 3LWLA 3TABA 4DLGA 1CZ9A 1S1XA 3F9KA 3NF9A 1VK0A 4DTUA 5J2QA 4KKOA 1O1WA 3VQ7A 1JL2A 1T03A 2QKKA 3AVHA 4IFVA 1VSMA 4LY7A 4QCLA 4E7HA 4CHZA 1BQNA 3HT3A 3L3UA 1S1VA 3O4NA 3K58A 1JLEA 1U4BA 1W9HA 4C8OA 1S5JA 1RDBA 1RBVA 2YKMA 2YHAA 4E1MA 1WLJA 2I5JA 3ZSQA 3CFRA 1RILA 2VG6A 3P5JA 3C6TA 3U3GA 4CJWA 3BDPA 1L3UA 4GMJB 1KFDA 4C8LA 3V9UA 2Q3SA 1TL3A 4AHCA 1WAJA 1QQCA 1WSEA 4M3RA 3VQ6A 2ZE2A 4NYNA 4CJLA 1BGXT 3TR8A 4PWDA 4CFDA 3I0SA 4OGEA 4CEZA 1C1CA 1RT7A 3E01A 1BL3A 4ELTA 1Z25A 3F73A 2OYQA 3VQAA 1LAWA 4F8RA 2KFNA 3CG7A 4HTUA 4DSEA 4BDYA 3NAEA 3OY9A 3RTVA 1HYVA 4F2RA 4FW1A 4CFCA 4F3OA 3K2PA 4K8ZA 3MEEA 4DSIA 2PYLA 3VN5A 1UAXA 2BANA 1JLCA 1YVUA 1B9FA 3QEIA 1HQEA 5SZTA 1NJXA 2DTUA 3OYKA 1X1PA 3ZT1A 4CEBA 2XY6A 2OA8A 3RWUA 3MXMA 4B9MA 1KSPA 1R0AA 3K57A 1WSGA 4KO0A 4NCBA 3KK3A 1YT3A 3VQDA 4CJKA 1JLAA 4I2PA 3RMDA 3THVA 4PQUA 5CYQA 2A1SA 2F8SA 3ZT4A 1VSHA 4HUGA 4AHRA 4CF1A 3LANA 1VRUA 3KD5E 3BGRA 3OYJA 3WNGA 4CESA 2OPPA 3LAKA 3QEPA 1HPZA 1NK6A 3MAQA 1RTIA 2KW4A 2A1RA 1BCOA 3HVRA 4OPJA 4AHSA 4M3XA 2F96A 1ZBHA 4FVMA 4M3TA 3S9HA 1EETA 1LAVA 1A5WA 1W0HA 3TANA 1XHZA 1S1TA 1GOBA 1B9DA 2Z1HA 4BDZA 4FM1A 4KREA 3K59A 4K8XA 1HNVA 2B5JA 2P51A 2D0CA 3CM5A 4M42A 1Z26A 4C8NA 3VA0A 3V9ZA 5DMRA 4E0DA 3H08A 3QIPA 2YKNA 1ASUA 4KB1A 1XC9A 3HM9A 1VSEA 4KFBA 3CQ8A 4W5TA 1NJWA 3O3HA 4M45A 4KI6A 4N41A 1S1WA 2QXFA 4CFBA 3JYTA 1NOYA 3OYFA 1NK8A 2G8WA 5D3GA 1S9GA 2IAJA 4BWJA 3ZSWA 3ZSXA 4E7LA 4BWMA 3TAGA 3HPGA 1RBRA 4IDKA 4FW2A 3ZT3A 4CJPA 3OYAA 4NYFA 3KLGA 1RBUA 3RMBA 4Z4HA 1J9AA 1KLMA 2HW3A 4CJVA 3VQ8A 4IBNA 1RCHA 3S3NA 3L2RA 4OLAA 4FJIA 4FXDA 5C24A 4CJ3A 4F2SA 4LSNA 4W5OA 4N76A 4E1NA 1EP4A 3AVJA 4AHVA 3OJSA 4DS4A 3AA2A 4BE2A 3WNEA 3NF8A 3KK1A 4EZ6A 1BIUA 1HJRA 3KK2A 3OS2A 3K5LA 2XO7A 1U45A 1ASWA 4BDPA 4DWIA 4OKKA 3A2FA 4FK2A 3SUNA 4NCGA 2HB5A 3OYIA 3QIOA 2EX3A 2GBZA 1SKWA 2Y1IA 1TK0A 1U47A 3CFOA 4CJQA 3QEWA 4Z4EA 2W42A 1KVAA 2HNYA 1VSKA 2FC0A 4HCCA 1XHXA 3QO9A 3MXJA 4BE1A 3O3FA 1IKWA 3DLKA 5CYMA 3VA3A 3AVCA 3SQ1A 1NK7A 1J5OA 3DRPA 1KLNA 2FBVA 4UQGA 3L2VA 4O4GA 4FK4A 4Z4FA 3AVNA 3OYLA 3SI6A 4ID1A 4FJ7A 4CFAA 3ASMA 2FBYA 3OS1A 4B9TA 1IKXA 3AO4A 3S3OA 1N6QA 3HJFA 1BISA 3AVFA 3AVMA 3OVNA 4IG0A 3HP6A 1CZBA 3LALA 3SV4A 3K5NA 3V9WA 4DTPA 5K14A 1XWLA 3AO2A 3T3FA 1KCFA 5J2PA 3MEDA 2P1JA 3PUFA 5C42A 3PX6A 4CIFA 4OPKA 2E6LA 4LH5A 4CECA 4W5QA 3PY8A 4CJ5A 4Q0BA 1VSJA 4B9VA 4E3SA 1K6YA 4CF0A 4DFKA 1A5VA 1LW2A 4CJEA 4DF8A 3CFPA 4FZXC 1SV5A 3KKSA 1TL1A 5J1EA 2BGGA 3WNHA 3TAEA 3CM6A 5KTQA 3SQ4A 1BIZA 3MECA 4CJUA 3AVIA 3KLEA 4B9UA 3OYDA 3LZIA 4DLEA 1RT6A 4MFBA 1L3TA 5HRNA 1NK4A 3SQ2A 3G10A 2OPQA 4OLBA 4PY5A 2ITGA 2HHVA 2DFFA 3VQ4A 2PYJA 1TKDA 1QTMA 3LWMA 2YNGA 3HK2A 2RKIA 3PX0A 3KJVA 2RN2A 3PX4A 1SKSA 2HMIA 4KHYA 4F3TA 4JS5A 1D9FA 2YNFA 3DOKA 3AO1A 4GVMA 1RT4A 4R5PA 1HMVA 3RMAA 4CE9A 4CEEA 1Q9YA 1D8YA 1RBSA 3MXIA 1LV5A 5FROA 1CXUA 4FJ9A 1X9WA 2OPRA 3V1OA 1T7PA 5T7BA 4J2BA 4DQPA 1RT5A 3D0PA 4OKJA 4RW7A 3ZT2A 1QSLA 2PZSA 4CEAA 1JLQA 4DQSA 3QNNA 3EYZA 4DTSA 1QHTA 1ZBUA 4KTWA 4FLUA 1SL1A 3TAMA 4HCBA 1C0MA 1RDCA 4AHUA 4CK3A 4N47A 3SV3A 4DF4A 2HNDA 1BHLA 3ISNC 3DYAA 1Q9XA 1RT2A 3DMJA 1EKEA 1HQUA 1DLOA 4AILC 4FM0A 1ITGA 1MU2A 3V1RA 4H8KA 3NFAA 4QAGA 4B8AB 3O3GA 3OYMA 2GUIA 4ID5A 4DTJA 3RRGA 1U49A 4CCHA 1TAUA 5CZ1A 1WSHA 3VQPA 1NKCA 4CF8A 1NK5A 2HHWA 1FKOA 2OPSA 4Z4CA 2HHUA 3NF6A 4CHOA 2YNIA 4KHQA 5FRMA 2OZSA 3RR8A 1FKPA 1VSLA 1SL0A 2Z1IA 5CY4A 3VQ5A 2ZQBA 5I3UA 1A5XA 3LPTA 1X9SA 4W5NA 4DFPA 4HHTA 4M3WA 1S6PA 4FK0A 2IS3A 4FJXA 1VSIA 4I9LA 3NBPA 4RW8A 4J2DA 3LDSA 2HHTA 2D5RA 4FLWA 1IG9A 3SPZA 1D5AA 3SZ2A 5JS2A 2B6AA 3B6OA 4PA1A 3V1QA 2VWJA 3QERA 4KRFA 2ZD1A 4M3UA 1I39A 1X9MA 3NCIA 1WNSA 2KTQA 2KZMA 4BE0A 1JXBA 4FJ8A 1RNHA 2IOCA 3HP9A 3VQCA 4J2AA 3VQQA 5SWMA 4ZTJA 3LP3A 3DRSA 1D9DA 1TV6A 4CGHA 3NH1A 4FCYA 4DMNA 3V9XA 4M3ZA 4EZ9A 1S9EA 3L2UA 4CIEA 4CEFA 1IKYA 4CEOA 1JKHA 1GOAA 3QEVA 3PO4A 4KTQA 4W5RA 3SPYA 4Z4GA 4CHQA 5C25A 5J2NA 2HHQA 1WSFA 1JLGA 2KFZA 1C6VA 4E89A 1L5UA 4FJ5A 4E7IA 4DU1A 4FJGA 5HP1A 4ZTFA 4FJNA 2BE2A 3K5OA 3P1GA 3EZ5A 4CJSA 4GW6A 2DY4A 3DM2A 5E41A 4DU3A 3DLRA 3K5MA 2HHSA 1S1UA 4HUEA 4HUFA 3RRHA 1TK8A 3ZSOA 2PY5A 4IKFA 3KLHA 4PUOA 3ULDA 3TI0A 3ZSYA 4FZYA 2YHBA 1XI1A 4JRPA 1BI4A 1C1AA 2WOMA 2HNZA 3OYGA 3KLFA 4Z0UA 3TAFA 4LSLA 2P5GA 4N5SA 3IAYA 3VQ9A 2O4GA 4MQ3A 3C6UA 3M8RA 3KLIA 2JLEA 3VQEA 4XIUA 2YV0X 1HYZA 4DTRA 3LAMA 4CJ4A 4FLTA 3TAQA 2G8VA 4DTMA 1HNIA 3DI6A 2XRIA 4I7FA 4KHSA 2YNHA 2XY5A 2D0BA 1QE1A 2XY8A 4DQIA 1B92A 1VSFA 1ZBLA 1EXQA 4KV8A 1TVRA 3SYZA 4B9NA 5I42A 1WN7A 1JLFA 4ICLA 1IH7A 1C0UA 1NK9A 3PO5A 3S3MA 3HPHA 4TSXA 3AA4A 1I3AA 1F21A 2IGIA 3AVKA 3CYMA 1YTUA 4CJFA 4CJTA 1BI4B 4C8MA 4KI4A 4DQQA 3VQBA 4M41A 1TKZA 3LP2A 1RDDA 4CGGA 1RTHA 3JSMA 3L2WA 4DQRA 5HLFA 3NH0A 2O4IA 1N5YA 4CEDA 4RW4A 4CGDA 3OS0A 2HHXA 1SKRA 3NHGA 2B4JA 4CF2A 1VSDA 3AO3A 4Y1DA 1BCMA 3U3YA 1KVCA 3ZSZA 3SNNA 1LWEA 4LH4A 5KGXA 4KPYA 3AO5A 4F4KA 2ATQA 2DFEA 4DTXA 2X6SA 1S6QA 3NGZA 3OJUA 2X78A 3KKRA 3OYEA 4CJRA 3KTQA 4KHUA 4FZZA 1RTJA 4RW9A 1YTAA 4OJRA 4I9QA 3RR7A 3SUPA 1KVBA 5HRRA 3SCXA 3DOLA 4JS4A 3QETA 4BACA 1NOZA 1QSYA 1JL1A 3HVTA 4O44A 4O0IA 2RPIA 4FM2A 3KIOA 3DRRA 4CIGA 3L2QA 1UA0A 3HXMA 3OYNA 1WSJA 4H4OA 4E7JA 2WONA 4Y1CA 3C95A 3HPOA 3QNOA 3AVBA 3AVLA 2X74A 5FRNA 2Z1GA 4WE1A 3TAPA 3T1AA 1RTDA 1GOCA 5DK5A 3T19A 4CHPA 4DU4A 2IC3A 3NDKA 1JXEA 3FFIA 4JLHA 4J2EA 2FBTA 3IS9A 3LPUA 4CGJA 4IFYA 3PV8A 1J54A 4OGCA 3SUQA 1NK0A 4FJHA 3AV9A 5HROA 4FLYA 3AVGA 3HL8A 4CK2A 4I2QA 1TKXA 2R7YA 2G8FA 4N56A 4E7KA 4ELUA 3HO1A 1QSSA 4KHWA 1ZBIA 1TGOA 4NCAA 1NJYA 1FXXA 4CEQA 1IKVA 4M3YA 4DS5A 3EY1A 4B3OA 3UIQA 1TK5A 4FLXA 2E6MA 1RDAA 4CGFA 2GV9A 1SL2A 3V81A 4KB0A 1Q8IA 4ELVA 2E4LA 3OYHA 3NF7A 4JRQA 1NKBA 5J2MA 3NGIA 3U6FA 1LW0A 4O55A 3QLHA 1LWFA 3NE6A 4FLVA 2KZZA 4FLZA 1RT1A 1ZYQA 1C1BA 3L3VA 4FJJA 3LP1A 1DTTA 5KRSA 3QESA 2XY7A 4H4MA 3M8QA 4AH9A 2BDPA 3ALYA 3ITHA 3WNFA 4Z4IA 3IG1A 2VG7A 5EU7A 1U04A 3TARA 1IO2A 3I0RA 4DG1A 4HVJA 1UA1A 3NH2A 4DFMA 2D0AA 1G15A 2Z1JA 3O4QA 4KHNA 1HYSA 1KFSA 3LZJA 1WAFA 3LP0A 1RBTA 5KI6A 2EHGA 3MEGA 3QINA 4IG3A 3P83D 4E19A 4YFUA 2G8KA 4DSKA 4FJMA 3M8SA 2QKBA 4AHTA 2QK9A 1FK9A 4CK1A 3TWHA 4KAZA 4CHNA 4RW6A 1TKTA 3KD1E 3M8PA 4FYDA 4O5BA 2AJQA 3SUOA 3DLBA 4Q5VA 4DSFA 4DTNA 2G8HA 3RMCA 2JGUA 4EP5A 4QOZB 3D45A 3HSTB 4CERA 1L3SA 1U48A 1JLBA 2RF2A 4L8RB 1J53A 5FDLA 1CLQA 1REVA 4CF9A 3L8BA 2NUBA 3I8DA 1ZBFA 4C8KA 3OYCA 2XHBA 2OZMA 3ZSRA 1KTQA 2F8TA 3B6PA 2FBXA 2VWKA 3AA3A 3QEXA 1CXQA 3G0ZA 3IRXA 4OVLA 4FJLA 3OYBA 4FJKA 1NJZA 2P5OA 2HVHA 1T8EA 3V9SA 1ASVA 3SQ0A 3V6DA 1WSIA 4ZHRA 4YNQA 3SJJA 1DTQA 1RT3A 2DFHA 4G1QA 4B9LA 3HYFA 5JS1A 4B08A 3NGYA 2ETJA 5KGWA 4CHYA 5KRTA 4DTOA 1SUQA 2X6NA 2Y1JA 3ZT0A 5HRPA 1EX4A 2VG5A 4DSJA 1VRTA 4EP4A 4OKEA 2KQ2A 1BQMA 3V4IA 3DLGA 4RG8A 2HVIA 3ZSVA 1HRHA 1UWBA 3DLEA 3ZCMA 1Y97A 2G8UA 4B9SA 2LSNA 2IDOA 1UOCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LD0A 3C94A 2KHOA 5CZ2A 2QWOA 4LF4K 2G8IA 3SLCA 1C0TA 3O9SA 4DFJA 2E2OA 5BREA 3F9KA 3ZX0A 5A2QO 1O1WA 2E2QA 3F9MA 4A61A 1IJJA 2QKKA 3AVHA 4LY7A 1BQNA 3L3UA 3FR0A 1S1VA 3O4NA 3K58A 1JLEA 4GVEA 3CCQN 4E1MA 3MWPA 2I5JA 3ZSQA 3QMLA 3P5JA 4FL9A 3AY9A 3BDPA 1L3UA 4C8LA 4QS8A 1TL3A 1YITN 3BEXA 4PKGA 3VQ6A 3TR8A 1H1VA 4CFDA 3I0SA 1RT7A 1QHAA 3D2EA 3F73A 3VQAA 2KFNA 4HTUA 4CZFA 4KBOA 1HYVA 5FPDA 1MWKA 4FW1A 4CFCA 3K2PA 2ZM6K 1JLCA 1NJXA 3MMVA 3U9DA 2OA8A 4CEBA 3WXIA 1R0AA 3K57A 1WSGA 4KO0A 3KK3A 4CJKA 4HTLA 4I2PA 3L6QA 5AZJA 4PQUA 2A1SA 5ADXH 1VQ9N 2RE2A 4CF1A 1Q7YO 1TYQA 1VRUA 2A5XA 3CCEN 4CESA 4JN4A 3QEPA 1HPZA 2D1KA 3MAQA 1NK6A 1RTIA 1BCOA 3HVRA 4IO9L 4NO7A 4CZMA 1ZBHA 4AHSA 1BDGA 1EETA 1A5WA 1K8KA 1GOBA 3HI0A 3K59A 3CM5A 4QS9A 3CF5L 5DM7L 5GADP 3QIPA 3N4PA 4M45A 2QXFA 3JYTA 2G8WA 3OYFA 4CZKA 4BWJA 3ZSXA 2BH1A 4BWMA 4LF8K 3HRGA 4M7YA 3S3NA 4FWMA 3L2RA 4QS7A 4FJIA 5C24A 4B1VA 4E1NA 3J7YP 2NRXA 3AA2A 1MA9B 1ASWA 4DWIA 4FK2A 3SUNA 4NCGA 3CCVN 2GBZA 1YIJN 3O5BA 1TK0A 1U47A 4ISFA 1VSKA 2FC0A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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