2E6MA

Structure of mouse werner exonuclease domain
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
molecule tags Hydrolase
source organism Mus musculus
total genus 61
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6mA00
1RNHA 4CK1A 1WN7A 3NGIA 1J5OA 4PUOA 3QLHA 1QTMA 1QS4A 2PY5A 4B9MA 4CJWA 4E7HA 2X74A 2G8HA 1SKSA 3SZ2A 4KKOA 1RT1A 4CEZA 4CIFA 4DU3A 4M3WA 1B92A 2ATQA 5EU7A 4CHZA 4OPJA 1Z25A 1VSKA 4CGGA 1VSFA 4TSXA 3QO9A 3PY8A 4PY5A 3DLGA 4BDZA 4NYNA 1KTQA 2HHVA 4AHSA 5DMRA 4I2QA 3VQ9A 4W5QA 2XY5A 2KZZA 1NOYA 2WONA 2YKNA 3OS0A 4FJJA 2D0AA 4DMNA 1DLOA 4AHRA 2Z1HA 4DU1A 4DU4A 4MFBA 1W0HA 4FW2A 4HTUA 1ZBLA 3OYJA 4F2SA 1X1PA 2E6MA 3AA3A 4LH5A 2QKBA 1TAQA 2B4JA 2HVIA 2B5JA 3G0ZA 4W5OA 3AVIA 1LAWA 1IKYA 3S3NA 5SZTA 4DG1A 3K59A 3LDSA 1U49A 1NKCA 4OVLA 3SI6A 3TAGA 1RBSA 3TAEA 1BIZA 1TL1A 1JLEA 1EETA 3B6OA 3LP0A 2YKMA 4NCGA 3NH0A 4DTXA 1IKWA 3DYAA 3ZSVA 2HB5A 4LH4A 2GBZA 2E4LA 3THVA 4KTZA 3K57A 4K8XA 4DFJA 1NOZA 4IG3A 1F21A 1LWEA 3HT3A 3IS9A 4B08A 4DS4A 3C95A 4B9SA 1HQUA 1O1WA 1QHTA 1TKXA 4FVMA 1HJRA 3DRRA 3KK2A 3NAEA 3F9KA 4DSKA 4JRPA 4N56A 2HHXA 4C8NA 5E41A 5FROA 4F3TA 2XO7A 1WAFA 4F2RA 3WNEA 1NK8A 1NJXA 4CEEA 1WLJA 4DQIA 2G8IA 1KFDA 4J2DA 3ZT3A 3PUFA 4W5NA 4C8KA 2D5RA 2FBVA 3AVJA 3VA0A 1TKTA 4CJRA 4FM0A 3TANA 2DY4A 3LAKA 3SUOA 3OYAA 3KKSA 4OLAA 5I42A 2P1JA 4Z4IA 1TVRA 1BCMA 4KTWA 1RTHA 2A1RA 1NKEA 1S1WA 4I7FA 4AHCA 4FK2A 5KRSA 1FXXA 4DFKA 3NE6A 4FJXA 3OY9A 3B6PA 4I2PA 4RW4A 3RMAA 4FJKA 4WE1A 4NCAA 4AHVA 5HLFA 1A5WA 1GOBA 2XY7A 2IOCA 2ZQBA 4B9NA 3ZSYA 1U48A 1RT6A 2BDPA 4IDKA 3PV8A 5J2MA 3DLEA 3VQ7A 3V9ZA 4FLTA 3AO3A 4KV8A 4DTUA 2B6AA 2PYJA 1KVBA 1XC9A 3V81A 2IGIA 1C6VA 1IKXA 4KFBA 4F4KA 4CFCA 3SNNA 3SYZA 4KB0A 2FC0A 2HHWA 3DM2A 4E7JA 4BDPA 4OGEA 4ELVA 4B9LA 3F73A 2QKKA 3OS1A 4DTPA 1I39A 4N41A 3ZSXA 3AO1A 1TKZA 2Z1GA 1Q8IA 1XHZA 4CF1A 1YTAA 2R7YA 4CF2A 1FKPA 3DRSA 4FJ8A 3U3YA 1NK0A 3HPGA 3E01A 3QEIA 2RF2A 3OYEA 2EHGA 4AHTA 3LWLA 3KLEA 3M8QA 4DSFA 3QESA 3S9HA 1R0AA 3LP1A 1Q9YA 4CJVA 2IAJA 4OKJA 1J9AA 1SUQA 1W9HA 1HRHA 3MECA 3MXJA 3CFPA 1U47A 1TKDA 2IC3A 3O4NA 1REVA 5CZ2A 3L3VA 3L2VA 4CJ5A 4DQQA 1T03A 1TAUA 2D0BA 4DSEA 2IS3A 1RILA 1RT3A 3TAMA 5HROA 3AO5A 3LZJA 4E7LA 2JGUA 3TR8A 1D9FA 4FJ9A 3OYFA 3MXIA 4DQSA 1C1AA 5KI6A 3KIOA 1S1XA 2VG7A 5K14A 1U4BA 3O3GA 4FJLA 1RDBA 2XHBA 1NK5A 5J2QA 3A2FA 4ID1A 4YFUA 3AA2A 1L3UA 4FXDA 2E6LA 4CJTA 4DTRA 3I8DA 3RMCA 3S3MA 2JLEA 3P1GA 4CF8A 3RTVA 1T7PA 3KTQA 4OKEA 4KHUA 4O44A 2YNIA 1JLGA 1C1BA 4Z4CA 2XRIA 4FLXA 1UAXA 3IRXA 1KLNA 1UA0A 3AVFA 4YNQA 4M3YA 3K58A 1YTUA 4DWIA 1KVAA 3G10A 3OYMA 3DI6A 1C0MA 2HNZA 4CFBA 3P5JA 1RTDA 4CK2A 1D5AA 1SL2A 1RBUA 3RRGA 4HCCA 4HUGA 1VSDA 2HVHA 4O5BA 5HBMA 3OYLA 1S6PA 4OPKA 3ZT0A 4CFDA 4GW6A 2RKIA 3SUNA 4KREA 1IO2A 3RRHA 1EKEA 5DK5A 5J2PA 4R5PA 3OVNA 1RBTA 3AVGA 3TI0A 4Z4EA 1BIUA 1FKOA 4RW8A 3VQDA 2OZMA 4FJGA 4CJ3A 4LY7A 2BGGA 4AH9A 2QK9A 2P5OA 3CYMA 4CESA 3CFOA 1LAVA 1MU2A 2VWJA 4FYDA 1ASWA 3AA5X 1C0UA 1WSEA 3CG7A 4H4OA 4IG0A 5CYQA 3ZT4A 4DTMA 4DTJA 3VQ4A 1J53A 3HPOA 1X9SA 1L3VA 2OYQA 4FLYA 5KGXA 4CECA 1BL3A 4ZTFA 2X6NA 3FFIA 1XWLA 2VG6A 2OPSA 4M45A 3CFRA 1NK4A 1RDCA 4F8RA 2YHBA 2G8KA 1YVUA 2HNDA 3VQ6A 4DS5A 2HNYA 1BQNA 4OKKA 5J2NA 3L2QA 4C8MA 3OYKA 1QSSA 4CJQA 3EZ5A 1K6YA 4DSIA 3DOLA 3V9WA 2X6SA 1RTJA 5HRRA 1WSIA 1CXQA 4HHTA 1L3SA 2KFZA 3ITHA 4PA1A 3AO2A 3NF6A 3HSTB 3WNHA 1N6QA 1EP4A 4Y1CA 2VWKA 4O0JA 4BACA 1BHLA 4FJ7A 3KLHA 2Y1IA 4K8ZA 3SCXA 4N47A 1NK7A 4L8RB 4W5RA 1NK9A 3LP3A 4HUEA 1GOAA 4CJUA 3QEWA 2G8UA 3HPHA 4Y1DA 4CGIA 1Q9XA 3HVTA 4CEOA 3KJVA 5I3UA 4CF0A 4DFMA 4KO0A 3QINA 2HMIA 4FJHA 4CE9A 1WSFA 3OYGA 4CHPA 1UWBA 3ZSZA 3ISNC 4CHOA 3SV4A 1N5YA 2DTUA 3QEVA 4M3ZA 1JKHA 4E1NA 4KHQA 4CGHA 4BDYA 3C6UA 5C42A 3RMDA 3ZSWA 2LSNA 2HHQA 1LW2A 4Q0BA 5HRPA 3EY1A 1BI4B 4J2BA 4OJRA 3RWUA 4QAGA 5CY4A 3PX6A 5KTQA 3SUPA 4FCYA 5FRMA 3OYNA 1VSEA 1SKRA 1KLMA 3NF9A 4BE2A 1L3TA 2QXFA 4O4GA 1BCOA 4KPYA 4IBNA 1LV5A 4IFYA 4DTOA 4Q5VA 2Y1JA 4EP4A 4AILC 4M3UA 4CGFA 2Z1IA 4FJ5A 4CF9A 1S9EA 1VK0A 3AO4A 2HHSA 3NCIA 2OA8A 4F3OA 5HP1A 1T8EA 3L2RA 1WNSA 4O0IA 3I0RA 3S3OA 4FJNA 1WSJA 3VQEA 3HM9A 1FK9A 1HNIA 4CJKA 4KI6A 4ELTA 5KRTA 4FJIA 3QIPA 4UQGA 4HCBA 4ICLA 2X78A 1U45A 3I0SA 4Z0UA 3NH2A 3OYHA 1ZBHA 3BDPA 1VSIA 3LAMA 3MEDA 3ZSOA 4DF8A 3SQ1A 4HUFA 3O4QA 1UOCA 5JS2A 3AVNA 3KKRA 4I9LA 1NJZA 3QEPA 4CGDA 2KW4A 4E7IA 4CEBA 2P51A 3NGYA 2ITGA 4M3XA 2OPQA 1IKVA 3TAFA 3P83D 3TARA 4ZTJA 2DFHA 1HYVA 4KAZA 3D45A 4I9QA 4PWDA 1QE1A 1KCFA 3SPYA 1XHXA 1J54A 2YNFA 5D3GA 2I5JA 2IDOA 4QOZB 4E7KA 1VSMA 3T19A 3NF7A 1IH7A 3TWHA 4FM1A 1ZBUA 1S9GA 3AVKA 4FLWA 3ALYA 3HYFA 4CFAA 3AVHA 4HVJA 1SL1A 4J2AA 1B9DA 3HVRA 1GOCA 1ASVA 1C1CA 4DFPA 1G15A 1YT3A 3LZIA 3V9XA 1L5UA 4ZHRA 3EYZA 2OPRA 2Q3SA 3TAQA 3QNOA 4FLUA 2AJQA 3VQPA 2EX3A 3AA4A 5FRNA 3NBPA 4J2EA 3ASMA 3AVCA 3SUQA 2BANA 4FLZA 1ZYQA 3SJJA 2BE2A 4NYFA 4KHSA 4OGCA 2D0CA 1VRTA 4DSLA 3NH1A 3RR8A 3VQQA 3ZT2A 2YHAA 1WAJA 1KSPA 4DLEA 3ULDA 4CIEA 1TK5A 1EXQA 3MEGA 4Z4FA 3AVLA 3LPUA 2KQ2A 1JLAA 4BWJA 4B9UA 1IG9A 1Z26A 1QQCA 1VSJA 2G8VA 4CJLA 3L8BA 4DF4A 1TL3A 1NJYA 3KLFA 2O4GA 1BQMA 1DTQA 1S5JA 3K5NA 3LP2A 1RCHA 3KK1A 3UIQA 4Z4GA 4E19A 3K5MA 3TABA 1JL1A 4JRQA 1S6QA 3LANA 4AHUA 1T05A 4IKFA 3VA3A 5JS1A 1X9WA 2FBTA 4GVMA 4CJFA 2PZSA 4OLBA 3K5LA 5J1EA 3M8PA 3SQ4A 3VQ8A 4Z4HA 4M41A 1TV6A 5CZ1A 4B8AB 1HYSA 3DLRA 4JLHA 3BGRA 3SV3A 1QSLA 3WNGA 4M3TA 4B8CA 1BI4A 2XY8A 1ZBIA 4RW6A 4FLVA 4C8LA 1JLFA 2DFEA 3K2PA 2ETJA 4CIGA 4E1MA 3WNFA 4DSJA 1X9MA 3L2UA 1TK8A 3V1OA 4CHQA 2GV9A 2RN2A 1VSLA 3QERA 1TK0A 1S1VA 4IFVA 3RR7A 1S1TA 3DOKA 4B3OA 3SQ0A 3LALA 3VQAA 1XI1A 1HQEA 1U04A 2F8SA 2HHUA 2Z1JA 4FK4A 1JL2A 3ZCMA 4G1QA 4RG8A 3V9UA 4BE0A 4KB1A 4FW1A 4LSNA 3C6TA 5T7BA 1S1UA 3AVBA 3L3UA 2KFNA 4FK0A 4KHYA 1LW0A 3HL8A 4C8OA 5FDLA 1RT4A 3O3HA 3JYTA 3RMBA 4B9VA 4B9TA 2KZMA 1CLQA 1RT5A 4RW9A 3HJFA 3O3FA 4CJEA 1BISA 1VRUA 4XIUA 2F8TA 5HRSA 2NUBA 2OPPA 2P5GA 1TGOA 1ZBFA 1HYZA 1SV5A 2G8WA 1BGXT 4GMJB 4CK3A 3V6DA 3DRPA 3VQ5A 5CYMA 4FM2A 4MQ3A 1ASUA 3NDKA 1CZBA 3PX4A 2O4IA 4O55A 4M3RA 2FBYA 3OYDA 1WSHA 3NF8A 2WOMA 4QCLA 3AV9A 3AVMA 3OYIA 1ITGA 3KK3A 3V9SA 3OJUA 3PO4A 4E89A 3CM5A 4CEFA 1B9FA 4JS5A 4DTSA 4JS4A 3QEXA 3PO5A 3U6FA 2YNHA 3MEEA 2GUIA 3HP9A 5HRNA 2YV0X 4KRFA 3CQ8A 1WSGA 1EX4A 1JXEA 1D8YA 1KFSA 4CEDA 4DQPA 1LWCA 3SPZA 3DLBA 4FJMA 1RT7A 4N76A 3QNNA 4NCBA 1RBVA 4KHNA 3LPTA 3NHGA 1SL0A 1QSYA 3MXMA 5C25A 3H08A 2PYLA 1JLQA 4BWMA 4N5SA 4CJPA 1LWFA 3OS2A 1HPZA 4RW7A 4DTNA 3IAYA 3OYBA 3IG1A 2DFFA 3DLKA 1UA1A 2OZSA 4EZ6A 4LSLA 1HNVA 4FZZA 2A1SA 4KHWA 1A5VA 4CGJA 4CERA 5SWMA 3OYCA 1RT2A 3OJSA 3PX0A 3VQCA 4E0DA 4W5TA 1KVCA 4H4MA 4H8KA 3ZSRA 5KGWA 3AVAA 3KLGA 4CHNA 1NJWA 4ID5A 3HK2A 4FZYA 3DMJA 4E3SA 3MAQA 4CJSA 4FZXC 2KTQA 3KD1E 2ZD1A 3M8SA 3HXMA 3ZT1A 2F96A 4LD0A 3LWMA 3JSMA 1RDDA 4EP5A 3DLHA 1CZ9A 4M42A 3KD5E 3SQ2A 1DTTA 1VSHA 1JLBA 3ZSQA 1NK6A 3QETA 4BE1A 1SKWA 4CCHA 4CJ4A 3L2WA 2FBXA 1KRPA 1RTIA 2RPIA 3KLIA 1RBRA 3V1RA 1D9DA 4CHYA 1NKBA 3T3FA 4DQRA 1CXUA 2ZE2A 1JXBA 1JLCA 3HP6A 3HO1A 3K5OA 1C0TA 3V4IA 2HHTA 3D0PA 3VN5A 4EZ9A 4KI4A 3C94A 1A5XA 2HW3A 3QIOA 4PQUA 3NGZA 1RDAA 2YNGA 3VQBA 3CM6A 2G8FA 4DLGA 3T1AA 4CEQA 1HMVA 1I3AA 3NFAA 5C24A 4CEAA 4KTQA 2W42A 4ELUA 1Y97A 3V1QA 2VG5A 3U3GA 3M8RA 2XY6A 3TAPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NGIA 3CCVN 1J5OA 1QS4A 2G8HA 3SZ2A 4KKOA 4CEZA 5EU7A 4DR4K 1Z25A 5AQNA 4CGGA 4H5NA 4NYNA 5DMRA 3VQ9A 4GV3A 1P8ZA 1C0FA 4AM6A 2Z1HA 4DU1A 4MDBA 4MFBA 1ZBLA 4ISGA 4F2SA 3VETA 4CZJA 2ZGYA 2HVIA 2B4JA 3G0ZA 5JVGL 5AFUH 3S41A 1LAWA 1NMDA 4JN4A 3S3NA 5SZTA 3AAQA 1S22A 4OVLA 5KQ8A 1KAZA 3SI6A 2HBJA 3NH0A 1EETA 4DTXA 4LH4A 3THVA 2E4LA 3K57A 4BR7A 4K8XA 4DFJA 1X3NA 4IG3A 1F21A 3HT3A 4B08A 4DS4A 3C95A 4B9SA 3J7AP 4N56A 4DUYK 1WAFA 4F2RA 1OVQA 1WLJA 5BPNA 1KFDA 1T3VA 4C8KA 2D5RA 3VA0A 3TANA 1TKTA 2P9LB 4GVEA 4CW7B 3KKSA 5KPTA 3WXMB 4OLAA 5I42A 4A59A 1TVRA 2ZGZA 4KTWA 1NKEA 4OO1J 1S1WA 3CCUN 2O8BA 5KRSA 4DFKA 1QQMA 3B6PA 4FJKA 1GOBA 2IVPA 2XY7A 2P9IB 2E2PA 1NGAA 1RT6A 3EE9A 3V9ZA 2NRHA 1NNEA 3AO3A 4XH5A 4F4KA 2IGIA 3A5LC 4KFBA 4I6MA 5ELZA 3SNNA 4DB3A 2FC0A 4E7JA 4IJNA 4B9LA 4YOTA 4DTPA 3M1FA 2ZJPL 1DEJA 1TKZA 1YTAA 3DRSA 1NK0A 2RF2A 4AHTA 1D9FA 3M8QA 3QESA 2IAJA 1J9AA 1SUQA 3PIPL 5CZ2A 1REVA 4DHYA 2D0BA 3J7YP 1RT3A 3TAMA 5HROA 4E7LA 3EO3A 4PKHA 3MXIA 3KHYA 5K14A 1S1XA 3O3GA 4YFUA 1GLDG 3MDQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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