2E6MA

Structure of mouse werner exonuclease domain
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
molecule tags Hydrolase
source organism Mus musculus
total genus 61
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6mA00
2P51A 4Z0UA 4DTJA 3IS9A 2OPPA 4N47A 1SL0A 4F3TA 1SL1A 4AHTA 1VK0A 2Y1JA 1CXQA 3T1AA 1HQEA 3O3GA 3TAPA 3SQ2A 1WSFA 2YHAA 4OPJA 1C6VA 1RDDA 4CJVA 3QEXA 1NK8A 1VSFA 4DU1A 4K8ZA 4M3WA 2DFHA 2HHUA 4M3UA 1TL3A 4LY7A 1TKDA 3K57A 1KRPA 4CGGA 4O44A 4DF4A 2KFZA 1JKHA 4CJ3A 4DTXA 1SKSA 2HVHA 3WNEA 4Q0BA 3KLHA 3ZSRA 3AA5X 4CE9A 1LAVA 2G8KA 2HMIA 4KHNA 4Z4GA 1ASVA 4E1NA 3I0SA 4M3XA 1VSDA 4CGDA 3D45A 2DY4A 3TR8A 3EZ5A 3CG7A 1REVA 4FLVA 4ZTJA 4FZYA 3DMJA 1RT1A 3KD5E 2KZZA 4CHOA 5SZTA 3AVJA 3OYMA 3SUOA 1XI1A 1EETA 4CF1A 4CJFA 4FM0A 4J2AA 1N6QA 4N76A 1O1WA 1TK0A 3L2WA 4KI4A 3DYAA 3O4NA 4FJMA 1HPZA 3VQPA 1TAQA 3PO4A 2YNIA 4PUOA 1A5XA 1NK6A 3TI0A 4LD0A 3OYEA 4FJNA 3HK2A 4J2BA 1LAWA 3M8QA 3ZSYA 2FBVA 4CEDA 2ZE2A 1RT2A 1RDBA 2YNHA 4DS5A 4IFYA 2YKNA 1XHXA 2VG6A 4RW6A 4KHWA 4EP5A 1BCMA 3V1QA 1U49A 3MEGA 5HBMA 2X78A 3P83D 4B9SA 1FKOA 3B6OA 2R7YA 4FJ5A 3AO1A 3AVNA 1IKYA 1IG9A 1KFDA 3DLRA 4E0DA 2F8SA 4FJGA 2HHXA 3LP1A 5FRMA 1EXQA 3DRPA 4LH4A 4JLHA 5K14A 5FROA 4CHPA 4CIEA 3M8RA 4DFJA 2QKKA 2OYQA 4HHTA 3TABA 4ICLA 2Z1IA 2G8UA 1KLNA 4KAZA 3QEVA 3NFAA 4FLZA 4KRFA 4O0IA 2QXFA 4CGHA 4B9TA 2X6SA 2FBYA 3SZ2A 1XWLA 1VSMA 1WSJA 1QE1A 3NH2A 1IKWA 1GOAA 2E6MA 1X9MA 1WAFA 3QINA 4M42A 1BQNA 4FK2A 3PX4A 4FLYA 3JYTA 3NF8A 1BL3A 4Z4HA 3KK1A 1DTTA 3NF9A 5J2MA 1LWFA 2WONA 1RBTA 1RBRA 1TV6A 4GW6A 3DLBA 4FJLA 4ID1A 3ASMA 3SUQA 2PYLA 2BDPA 4Z4IA 4CFDA 3TAMA 3TAQA 3TARA 5J1EA 3L2QA 3AVKA 1N5YA 1U04A 3IG1A 2OPQA 3ZT0A 4NCGA 2OA8A 1D9FA 1TL1A 3ITHA 3V1RA 3ZSOA 3NH0A 1RTDA 5C42A 4EP4A 4FJXA 4CEFA 1T7PA 1I3AA 4CJRA 1EX4A 4E7LA 5I42A 3LPUA 1NK0A 4F3OA 2RN2A 3V81A 1WN7A 2HW3A 1YVUA 2BGGA 2HHTA 4CF2A 1B92A 1ZYQA 4IKFA 4KKOA 1ZBHA 1B9DA 1BIUA 3NF6A 3ZSZA 1NOYA 3HJFA 3NH1A 2B4JA 2X74A 2KFNA 1FXXA 3ZSQA 4CJKA 3PV8A 4F8RA 1JLAA 3AVHA 3VN5A 3S3OA 1IH7A 1ASWA 2HNZA 4F2RA 4OKJA 3U6FA 1RDAA 1S5JA 3VQEA 4CEOA 3OYBA 2DFEA 2HHVA 5DMRA 4BACA 4E7KA 4KHQA 1LWEA 3G10A 1JLFA 2Y1IA 3BDPA 3C95A 4DFPA 4HUGA 4MFBA 1LW0A 4KV8A 3HO1A 4FW1A 4PY5A 1HJRA 2P1JA 3E01A 1LV5A 3NAEA 4YNQA 4DU3A 4KTZA 5JS2A 3KK3A 2DFFA 1SUQA 4BE0A 3DLHA 2O4IA 2OPRA 1S1UA 4OJRA 4BDZA 4NCAA 4DSEA 1EKEA 5C25A 4I2QA 4J2EA 3SNNA 1C0MA 1VSEA 1FK9A 3I8DA 2B5JA 3K5LA 5KRTA 1IKVA 1VRTA 1D5AA 3QLHA 4E7HA 3KTQA 4DTUA 1TKXA 2VWKA 1TK5A 3L3VA 4FJIA 1CZBA 4CJLA 4CK3A 1RT6A 3AO2A 3V6DA 3PX6A 3KJVA 3KLEA 1UOCA 3V9XA 3AO4A 5DK5A 1T03A 1JLCA 1S1XA 3OYKA 3RMCA 1D8YA 1C0UA 4PQUA 4E89A 3CFPA 1KTQA 3OYCA 4HCBA 1L5UA 2P5GA 1BCOA 4DTNA 1HQUA 1RNHA 3QEWA 4K8XA 3KKSA 2E6LA 4CF9A 3VQ7A 3RMDA 3CFOA 1J53A 4QAGA 5FDLA 2OPSA 4WE1A 4CJ4A 1QQCA 3CYMA 5HRSA 3OYDA 1NK5A 4KI6A 3OYHA 3VQ5A 4XIUA 1RT3A 3HVRA 1HYSA 3AVBA 5FRNA 3SPYA 3KD1E 4LH5A 4JS5A 3HXMA 1XHZA 1L3SA 3JSMA 4FK4A 2KZMA 1JL2A 1W0HA 4CGJA 3MEEA 3NGYA 1A5VA 1U47A 2VG5A 3OYNA 1JLBA 1IKXA 3WNFA 1JLQA 3VQBA 3CFRA 4HUEA 4QCLA 2HHSA 4DU4A 1RTIA 1SKWA 4E7IA 4M3TA 4BWMA 4DSFA 2GV9A 2W42A 4Z4FA 1BQMA 4CJQA 2XO7A 3LWLA 4FLUA 3OS2A 5J2QA 4CJSA 2XHBA 3NDKA 3SJJA 1HNIA 3P1GA 5KGXA 4DLGA 3HM9A 3SYZA 4R5PA 4EZ9A 3KLGA 4B9VA 3QO9A 2YHBA 4ZTFA 2I5JA 3V9UA 1T05A 1YT3A 2KQ2A 3HT3A 4KHSA 1TVRA 4NYNA 4M3YA 3ZSVA 4E1MA 3O3FA 4FLXA 4DTMA 4N41A 3ULDA 4FCYA 4CK1A 4CGFA 2XY5A 4CGIA 1SKRA 4F2SA 4RW4A 1HYZA 4NYFA 1C1BA 3ISNC 4CESA 2HHQA 3HSTB 4Z4EA 3OYFA 4CHZA 1J5OA 3WNHA 1VSJA 3AVIA 1RT7A 3AO3A 3HPGA 2FBTA 1S6QA 4OLAA 1X1PA 2BANA 4W5OA 4KREA 3V9ZA 3VQAA 4BDYA 2JGUA 5HRRA 4FYDA 1TGOA 1WSGA 1UA0A 5C24A 4IDKA 3RRGA 1G15A 1HMVA 1NOZA 3M8PA 3ZT2A 1BHLA 3G0ZA 4CK2A 3HP6A 4E3SA 4FZXC 3DOKA 4FVMA 4FK0A 2ETJA 1S9GA 4C8KA 2ATQA 4KB0A 1JXEA 4IG0A 2IS3A 2ITGA 1DTQA 1WSHA 3NBPA 1S6PA 3L2RA 2RF2A 1QSSA 4DQRA 2X6NA 4CEBA 3K59A 3NCIA 1NJZA 4DQPA 2E4LA 4FM1A 3S3NA 1NK7A 3OY9A 3M8SA 3VA0A 1Q8IA 3NF7A 3K2PA 4IG3A 1C1CA 1GOBA 3PUFA 3VQ8A 3AA4A 4FJ9A 4BDPA 1BGXT 3V9SA 3T3FA 2ZQBA 1MU2A 3LAKA 3OYAA 4H8KA 4DTSA 2Q3SA 3RMBA 4DSIA 1KVBA 2D0CA 5CZ1A 3ZCMA 4N5SA 2IOCA 3C6UA 4DQSA 3AO5A 4CJPA 1WNSA 3AVAA 2D0AA 3ZT4A 3QESA 4LSNA 3DOLA 3CQ8A 4JRPA 4CIGA 1T8EA 1ZBLA 2FBXA 3IRXA 3DRRA 5T7BA 3TAGA 4W5RA 3VA3A 4ELVA 4PWDA 3MXJA 4PA1A 3B6PA 4IFVA 1XC9A 3ZSWA 2YV0X 4AILC 5KTQA 3FFIA 3LDSA 4DF8A 1NK9A 2P5OA 3LP3A 2VWJA 3QEIA 1S9EA 1Q9YA 1RCHA 3OYGA 2OZMA 3DLEA 3MEDA 1NKCA 5D3GA 1U48A 4AHRA 3DI6A 4CEZA 4HUFA 1CXUA 3PX0A 1RDCA 3ZT1A 2RKIA 4M45A 3MAQA 3NE6A 3TAEA 2HHWA 1NJXA 1X9SA 2HVIA 1TKTA 1RBSA 1K6YA 1S1TA 4KO0A 1VSIA 4OVLA 4Q5VA 3HPOA 4I9LA 4CECA 3SCXA 4KHYA 3AVCA 1QSYA 3PO5A 5EU7A 4CFBA 2FC0A 4I9QA 2AJQA 1RT4A 4DTRA 3LALA 5HP1A 3LAMA 1BI4A 3HP9A 3HYFA 3RR7A 4KTQA 2QKBA 1Z26A 3OJUA 1NJWA 3NGZA 3O3HA 2IDOA 1JLGA 4W5TA 2WOMA 4CJ5A 4B9LA 4RW8A 4CEEA 3SV3A 2D5RA 2G8VA 1B9FA 4CEQA 4OKEA 3AVMA 2EX3A 4B8AB 3VQ6A 2IC3A 1KLMA 1VRUA 4IBNA 1VSLA 4KFBA 1U45A 4B8CA 3TAFA 1C1AA 3QIOA 3AA2A 2XY7A 1WLJA 4CCHA 4W5NA 4O4GA 3HL8A 3QERA 1DLOA 4C8OA 4LSLA 1C0TA 1S1VA 4YFUA 4OLBA 3QEPA 3BGRA 4DSKA 4EZ6A 5J2PA 3AV9A 3DRSA 1TAUA 3UIQA 3WNGA 4F4KA 3F73A 5KRSA 1KVCA 3S3MA 1BISA 4KB1A 3AVFA 4CF0A 3V4IA 4AH9A 1U4BA 1KCFA 5CYQA 4J2DA 3U3GA 1QHTA 1I39A 1QS4A 4FLTA 2OZSA 5JS1A 1YTAA 3RTVA 1VSKA 4GMJB 4JS4A 3QIPA 4O5BA 1RBUA 4KTWA 3OJSA 4DWIA 1LWCA 3LANA 1IO2A 4H4OA 3QNNA 4B3OA 2QK9A 3F9KA 3P5JA 4O0JA 4RG8A 4DLEA 1NK4A 1NKBA 3OYLA 2LSNA 2RPIA 4CJEA 1A5WA 3RR8A 2YNGA 1R0AA 1YTUA 3S9HA 4B9MA 4QOZB 4CERA 2PY5A 2EHGA 1Z25A 3OS0A 4CEAA 3K5MA 4FJJA 4AHVA 4FW2A 3NHGA 3L2UA 1RT5A 4DSLA 1SV5A 2HB5A 3D0PA 4AHCA 3TANA 5HLFA 4W5QA 2B6AA 3MECA 5CYMA 4HTUA 1QSLA 4FJ8A 4CHNA 2YKMA 1WSIA 4CJWA 2PYJA 4RW9A 2A1SA 1KVAA 3EYZA 3K5NA 1L3TA 2O4GA 3QNOA 1BIZA 3AA3A 3L3UA 1JL1A 1J54A 4GVMA 5KI6A 1VSHA 3V1OA 2IAJA 3KLIA 3DLGA 3VQ9A 4CFAA 1F21A 3VQCA 4CF8A 3RMAA 3VQDA 3U3YA 4KPYA 1UA1A 4DQIA 1UWBA 1WAJA 3SUPA 3A2FA 3PY8A 3L8BA 4AHSA 4M3RA 2DTUA 5CY4A 3VQQA 3CM5A 4Y1DA 4N56A 4FM2A 1EP4A 2HNDA 2VG7A 2G8IA 1ASUA 2BE2A 1TKZA 3OS1A 5HRNA 4CJUA 1D9DA 4B9NA 1ZBIA 4CIFA 1TK8A 1J9AA 1JLEA 1UAXA 2HNYA 4O55A 5HRPA 2A1RA 2KTQA 3K5OA 3O4QA 3EY1A 1S1WA 1RTJA 3C94A 3SQ0A 2D0BA 1NJYA 3RRHA 1CZ9A 4MQ3A 2GBZA 4DG1A 4FLWA 3QETA 1LW2A 3SUNA 4OPKA 2G8HA 4Z4CA 3L2VA 3C6TA 4DSJA 1SL2A 1CLQA 1L3UA 2F96A 3LP0A 5J2NA 1Y97A 4FJKA 1RBVA 1ZBUA 2ZD1A 1X9WA 2JLEA 3SQ1A 2NUBA 4FXDA 4ID5A 3AVLA 1L3VA 5I3UA 4CHQA 1ITGA 3HPHA 4DFMA 3VQ4A 3OYIA 4M3ZA 3CM6A 1GOCA 3I0RA 4C8LA 1RILA 3ZSXA 2GUIA 1KSPA 3SPZA 3MXMA 3SI6A 3THVA 4FJ7A 3KK2A 4C8MA 2PZSA 4CJTA 3RWUA 4DQQA 3ALYA 2Z1HA 4OKKA 4ELUA 3ZT3A 4H4MA 1FKPA 4G1QA 3K58A 1JXBA 3LP2A 4DMNA 4HVJA 3DLKA 3SV4A 3KKRA 4DTOA 4KHUA 3V9WA 1HRHA 2G8WA 2F8TA 4B08A 5E41A 1WSEA 4E7JA 5SWMA 4NCBA 3SQ4A 3T19A 4ZHRA 4E19A 3KLFA 4I2PA 4BE1A 4DS4A 5HROA 4OGEA 1NKEA 4FZZA 5KGWA 4DTPA 3OVNA 4BE2A 4HCCA 3LWMA 3LZJA 1QTMA 3DM2A 3NGIA 1HYVA 4CFCA 3TWHA 4C8NA 2G8FA 2XY8A 4L8RB 1BI4B 1HNVA 2Z1GA 3IAYA 3AVGA 3MXIA 3OYJA 2XRIA 2IGIA 3H08A 4AHUA 3LPTA 4DFKA 4CHYA 4RW7A 4BWJA 4ELTA 4Y1CA 4UQGA 1Q9XA 4M41A 4TSXA 3KIOA 3LZIA 2YNFA 1ZBFA 4JRQA 4FJHA 4OGCA 2KW4A 5CZ2A 1W9HA 1KFSA 4I7FA 1RTHA 4B9UA 2XY6A 2Z1JA 3HVTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IS9A 3MN7A 4WQ4C 3SBGA 5EX5A 4WFBL 3CCRN 4OPJA 2HHUA 3GDQA 4M3UA 4LY7A 1TKDA 4DB3A 3K57A 1KRPA 3CF5L 4O44A 4DF4A 2KFZA 1JKHA 4CJ3A 4ISEA 3KLHA 2G8KA 2HMIA 4KHNA 4E1NA 3CPWM 4CGDA 1YJ9N 3EZ5A 3CG7A 1REVA 4FZYA 4DQ8A 3KD5E 3MN5A 1WBDA 4BG9A 2P9UB 4JKHA 1EETA 4N76A 2UYTA 5E84A 1YF5L 4RTFD 3O1WA 1HPZA 4K41A 4LD0A 2E2PA 4FJNA 1Q82O 4M7YA 2VG6A 4KHWA 4BRQA 4B3SK 4PKGA 4XH1A 2E88A 1IG9A 1KFDA 1VQ4N 3I33A 5F0XA 4JLHA 1N8RO 3TABA 4WQ5A 1NGGA 1ATNA 3DXKB 4O0IA 1T3VA 4JI0K 4B9TA 4DR4K 5AQRA 1XWLA 1WSJA 1QE1A 1GOAA 1X9MA 1K8KA 3QINA 4A62A 4FK2A 1BL3A 3ZETA 4BRMA 3NF9A 5J2MA 1LWFA 4AM6A 1RBRA 3UKUA 4LF7K 3PLAA 1W7AA 2PYLA 3WUHA 4CFDA 3TAQA 1TUUA 4H0PA 3ZT0A 2OA8A 4NCGA 1TL1A 2FSKA 3ZYYX 3NH0A 1RTDA 1QQMA 4FJXA 4YOTA 1HKCA 3EKUA 1RDWX 1ESVA 2BGGA 2HHTA 1B92A 2F4VK 4BR7A 1B9DA 3ZSZA 4O5FA 2IIRA 2V7YA 4O8KA 2X74A 1WB9A 2KFNA 5AFUH 4CJKA 4IFEA 1BA0A 5KPZA 3U9ZA 2A41A 4B1XB 4MLEA 4DR7K 4CBUA 2HBMA 3LL3A 4IDHA 3Q7BA 3BDPA 3EEQA 4DFPA 4HUGA 2GTDA 1LW0A 3CQXA 4KV8A 3M5RA 4FW1A 1HJRA 1ILYA 4KTZA 3AGKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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