2EHGA

Crystal structure of hyperthermophilic archaeal rnase hi
Total Genus 49

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
149
structure length
149
Chain Sequence
MIIGYFDGLCEPKNPGGIATFGFVIYLDNRKIEGYGLAEKPFSINSTNNVAEYSGLICLMETMLRLGISSPIIKGDSQLVIKQMNGEYKVKAKRIIPLYEKAIELKKKLNATLIWVPREENKEADRLSRVAYELVRRGKLRDIGCIILT

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Sulfolobus tokodaii
publication title Crystal Structure of Type 1 RNase H from a Hyperthermophilic Archaeon with Double-stranded RNA-dependent RNase Activity
rcsb
molecule keywords ribonuclease HI
total genus 49
structure length 149
sequence length 149
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2007-03-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13456 RVT_3 Reverse transcriptase-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2ehgA00
1I39A 3AA4A 4G1QA 3LAKA 3OJUA 2KW4A 4E19A 5C25A 2HNYA 2ZD1A 1SKSA 3SYZA 4PA1A 4KHYA 4FZZA 3QERA 3SCXA 3KK1A 1YVUA 4DSIA 1Q8IA 1A5VA 1KFSA 1ITGA 4WE1A 1HYZA 4M41A 3VQAA 3SNNA 4DLEA 3DI6A 1S1WA 1NJZA 4DWIA 4DSKA 5HLFA 1RBSA 3V9XA 3SJJA 5KGWA 5SZTA 1NK8A 4W5NA 1TK0A 3MECA 2KZMA 3NDKA 4CHOA 4IFVA 4FJ5A 5EU7A 1QSLA 4BE2A 3WNFA 4F3OA 1D5AA 4CJVA 1JKHA 3DRPA 4CEZA 3QNOA 5I42A 1VSMA 3QLHA 3HM9A 4BDPA 2XY6A 4PWDA 2G8HA 2X74A 2OPPA 3AVCA 2Q3SA 4CIEA 4QOZB 4OPJA 4RW6A 4F4KA 3AVBA 3DOKA 3I0SA 4DG1A 2P51A 3PO4A 3C95A 1O1WA 1HMVA 4OJRA 1CZBA 4E7HA 1UA1A 3AV9A 1LAWA 3OS2A 4CJWA 3VQBA 4B8AB 1L5UA 3ASMA 4AHVA 3QIPA 3D0PA 3ITHA 3DLGA 3ZT3A 1QTMA 2EHGA 3O3HA 1S5JA 4OGCA 3TAQA 2OYQA 3LWLA 1KVAA 2IS3A 3HXMA 3THVA 4KAZA 3MEGA 3G10A 3L3VA 3K57A 1Y97A 1CZ9A 4AHTA 1D8YA 3RMAA 3UIQA 4J2DA 4GVMA 3M8RA 3K5LA 3S3NA 3RRHA 4O4GA 3NH1A 3ZT2A 4FLUA 2G8WA 3K5NA 4FJNA 3FFIA 3L2RA 4ZHRA 1BQMA 4C8MA 1KRPA 1TGOA 1DTTA 3HSTB 1NK7A 1C6VA 1X9MA 4HUFA 3I0RA 4CEEA 3BDPA 4CF9A 3V9ZA 4DS5A 2HVHA 3DLHA 3WNEA 1B92A 4H8KA 2OPSA 2VG7A 1LV5A 3AVLA 3S3MA 3LP2A 2FBVA 5FROA 1T05A 1VSEA 3IRXA 4LD0A 3QEXA 1CXQA 3K59A 3IAYA 1SL2A 5HRNA 1FK9A 3NH2A 1FXXA 1WSEA 2JGUA 2O4GA 3HPHA 1C0UA 3O4QA 4B8CA 4PUOA 5KTQA 4CF2A 4KHUA 1N5YA 4DSFA 2D0BA 1NK6A 2HHXA 1EKEA 3U3GA 4AHCA 3ZSYA 3I8DA 3LP0A 1SUQA 4FM1A 3HP9A 3CFPA 3K2PA 3DM2A 1KLNA 4CK2A 4KRFA 4H4MA 4OLAA 1LW0A 1TKXA 1YTAA 1KFDA 4JRQA 1IKYA 4IG3A 4DTJA 2BANA 4B9MA 1B9DA 1RTJA 2Z1HA 1WNSA 3HL8A 2BDPA 4HCCA 1BI4B 4NYFA 5HRRA 4DTPA 1SKWA 1IH7A 2YNGA 4PQUA 1GOCA 4B9SA 4IKFA 3TR8A 4PY5A 4ELTA 3NAEA 5CZ2A 1XHZA 4CERA 4Z4CA 1D9FA 1IKVA 3V9UA 3SQ4A 3HJFA 3LWMA 4FJXA 3VQ5A 1QQCA 4H4OA 3HVRA 2HHUA 4KPYA 2P1JA 3RMCA 4GW6A 4JRPA 3AVHA 2BE2A 1C1AA 3QEWA 4CEAA 2XY7A 4DQIA 1B9FA 4LH4A 1C0MA 4DU4A 1T8EA 3SV4A 4KB1A 4FK2A 1NKEA 4CHZA 3LPTA 3TABA 1ZBFA 1LWFA 1TK8A 3AVGA 1X9WA 1LAVA 2PYLA 4Y1CA 3VQ9A 1BISA 1EETA 3LPUA 2YKMA 3ZT0A 4B9TA 1RT1A 1BIZA 1NJYA 1WSIA 4FCYA 4FK0A 1S6QA 2Z1IA 3SUQA 3CQ8A 2B4JA 3OJSA 4DF8A 2VWKA 2GV9A 4CHPA 1J53A 1LWEA 3RR7A 3OYGA 5CYMA 3ZCMA 3PUFA 1SL1A 3LP3A 4IBNA 3HO1A 4QCLA 1QE1A 4CE9A 4CIFA 1RT4A 4I9LA 4RW9A 1EP4A 5CY4A 4HUEA 2Z1JA 4CJRA 1HJRA 4E7KA 3RMBA 1NJWA 1WSFA 3NFAA 3TAEA 4CIGA 4DQPA 1VK0A 3AO5A 3TAMA 1VRTA 1RBTA 3KIOA 1S1TA 3AA2A 1S1XA 3VN5A 1RT2A 1I3AA 1RBUA 1SV5A 4KFBA 2IAJA 5KRTA 3KD5E 4KHQA 1G15A 4E89A 2I5JA 3KKSA 4CGFA 2OZMA 4NCGA 4DTRA 4LSLA 2ATQA 2ZQBA 4FW1A 1IKXA 1T7PA 5HBMA 4N56A 3O3FA 3EY1A 3S3OA 2OA8A 1JXBA 4F2RA 3MXMA 3PX0A 3AO1A 1TVRA 1XC9A 3ZSXA 4KV8A 4O5BA 4CEDA 3OYHA 1Q9XA 1ZYQA 2B6AA 3PV8A 4FZYA 3QIOA 4CEFA 5HRPA 3V81A 1TV6A 3C6UA 3HYFA 1TKTA 1ZBHA 2OPRA 1MU2A 4I7FA 4M3XA 3KKRA 5C24A 3PY8A 4CJ5A 1QSSA 4CGHA 4E7IA 2XY5A 3VQQA 4M3WA 5J2PA 1D9DA 3NF6A 5CZ1A 3T1AA 3NGIA 2IDOA 1RT6A 4CGDA 4CGIA 4AHSA 1WAFA 3AVIA 3WNGA 5J2QA 1ASVA 1BIUA 1VRUA 2PYJA 3L2UA 1XI1A 3V6DA 1RDCA 2HHTA 2O4IA 3L2WA 2E6MA 4IG0A 3VQCA 3P5JA 2XO7A 4W5TA 1LWCA 3SUOA 3RRGA 5JS2A 4FJ9A 1J5OA 1JLQA 4E1NA 3ZT1A 3EYZA 4CFAA 3RR8A 3SQ2A 1NK5A 1A5WA 2RKIA 1QHTA 1RBRA 3TANA 3AVAA 3HPGA 5FRNA 3AVMA 4YFUA 3SPZA 2DFHA 3DLRA 1Q9YA 4DFKA 3RTVA 1L3TA 1VSKA 3V1RA 2R7YA 1UOCA 3OYAA 4N76A 2QK9A 4M3YA 3VQ8A 4FW2A 3WNHA 2OZSA 2F8SA 4AHUA 4CF1A 4KTZA 4BE0A 2QXFA 4DF4A 4K8ZA 1VSJA 3VQ7A 4MFBA 3VA0A 1WLJA 2YKNA 4OVLA 1NOZA 4FJKA 1K6YA 2B5JA 3OYIA 4DTUA 3MXJA 2VG5A 1ASUA 1TKDA 1VSFA 3T19A 3SZ2A 2RN2A 3F9KA 3LAMA 1RTIA 2HHSA 4Z4GA 4CJFA 1REVA 1YTUA 4BDYA 4BWMA 3SQ1A 4FZXC 4Z4FA 2XRIA 4FLVA 1TL3A 3NBPA 1SKRA 1S9EA 3NCIA 3PX4A 3PO5A 3MXIA 2XY8A 2IOCA 2YNFA 3A2FA 2KZZA 3MEEA 1BL3A 3KD1E 2PZSA 4LSNA 4RW4A 5J2NA 4CJUA 3P83D 4DSJA 1ASWA 3SUNA 5DMRA 1HPZA 4CF0A 1GOAA 2WONA 1FKPA 3DOLA 4FVMA 2XHBA 4KTQA 1Z25A 3CFOA 4B9VA 2OPQA 4FXDA 3CM5A 3P1GA 1XHXA 4LH5A 2KFNA 4R5PA 3OYMA 4I2QA 4F3TA 4OGEA 4YNQA 3U3YA 3QETA 4CESA 1T03A 1IKWA 2VWJA 3KLGA 4DTXA 3DRRA 2PY5A 1JXEA 4C8OA 4F8RA 2KQ2A 4CFBA 4CEQA 1RILA 2G8KA 3QO9A 4RG8A 4DTSA 2D0AA 3LDSA 4CGGA 4M45A 3OYCA 4Q5VA 1A5XA 3SPYA 3NF9A 3C94A 2QKBA 1CLQA 4E0DA 1JLGA 3SUPA 1L3UA 4Z4IA 2D0CA 2VG6A 3LALA 4CJTA 1RDDA 4BDZA 4I2PA 4FJMA 4CHQA 1TAQA 4M3UA 3HP6A 3ZSVA 5HRSA 5K14A 3EZ5A 4DFJA 4J2AA 1BCMA 4FLWA 3AVKA 1VSHA 3K5MA 3V9WA 3U6FA 5HP1A 2ITGA 1DLOA 4CHYA 2P5GA 3H08A 1KVCA 3DLKA 2Y1JA 4DTNA 4UQGA 3KLHA 3KJVA 2HHVA 2HMIA 4IDKA 4IFYA 1R0AA 4FJGA 1C1BA 4CGJA 4B08A 2G8IA 2X6SA 4JS5A 3CFRA 5E41A 1JL1A 4KI6A 1JLCA 1HNIA 2QKKA 3OY9A 3SI6A 1UA0A 3QINA 4XIUA 4DMNA 4OKJA 2E4LA 3LZIA 4FLZA 3HT3A 3V1QA 1IO2A 3B6OA 3ZSOA 4O44A 4CCHA 3VQEA 4HCBA 4CK3A 2KTQA 4AILC 2DTUA 4W5QA 3M8QA 4ZTJA 2YV0X 3LP1A 1GOBA 1NK0A 1RTDA 1W0HA 1BQNA 1WSHA 4B3OA 3D45A 1HNVA 2HNDA 3NGYA 5FDLA 4CJEA 1N6QA 3OS1A 5I3UA 1S1UA 4JS4A 2HHQA 2AJQA 4C8KA 4NCAA 3IS9A 3OYLA 3VA3A 4DQRA 4KTWA 1KLMA 3HVTA 4QAGA 2HHWA 4C8NA 4I9QA 2HW3A 3RMDA 2GBZA 1KSPA 3PX6A 3ULDA 4FLTA 2YHBA 5FRMA 4DFPA 1BGXT 4N47A 4DSEA 4ZTFA 3MEDA 1NKBA 4J2EA 3AO3A 4KB0A 1U48A 1X1PA 1NK4A 3QNNA 2KFZA 2RPIA 3LZJA 3V1OA 2DFEA 3G0ZA 4FJIA 5J1EA 1VSLA 3L2QA 4E3SA 3NF8A 3OYEA 1KVBA 1JLEA 2F96A 1RTHA 4FJ8A 4BWJA 4HTUA 3VQ4A 3T3FA 3LANA 1U49A 3NGZA 3TAFA 1EX4A 3CG7A 4CJLA 4DQQA 4TSXA 4FLYA 4L8RB 1YT3A 1W9HA 4B9UA 5KGXA 4FJHA 3VQPA 1JLFA 4CJPA 5DK5A 1QSYA 1J54A 4ICLA 4OKKA 1EXQA 1S9GA 4BACA 3SV3A 5JS1A 4EP4A 3KLIA 4FM0A 5C42A 1S6PA 1VSDA 3OYBA 1WN7A 3E01A 4CJ4A 1Z26A 2FC0A 1J9AA 4J2BA 3TAPA 3ZSWA 2G8VA 3NE6A 4M3TA 3AO4A 3KK3A 3M8SA 3TI0A 3OYKA 1TK5A 3F73A 2A1RA 2X6NA 4AH9A 1HRHA 4CF8A 1UAXA 4CEBA 3KLEA 2FBTA 3TAGA 4ID1A 4Y1DA 4CEOA 4B9NA 1ZBIA 2BGGA 3ISNC 2YHAA 4ELUA 1SL0A 3M8PA 4FYDA 3AVFA 1KCFA 1WSGA 3OYNA 4KO0A 4CECA 3AVJA 3DRSA 3V4IA 5HROA 2HNZA 1RDBA 2E6LA 2IC3A 3AVNA 1RNHA 4Z4HA 1X9SA 1L3VA 4K8XA 4KHSA 3S9HA 4CFDA 4KREA 3DLBA 3L2VA 4BE1A 3ZSRA 1WAJA 3QEVA 4Q0BA 1VSIA 1HQUA 4EP5A 1HQEA 4DU3A 1U45A 3KLFA 1TAUA 1DTQA 1ZBLA 3SQ0A 4FJLA 2X78A 2YNIA 4O55A 4Z0UA 3VQDA 4GMJB 4W5OA 4HHTA 2G8FA 3ZSQA 4M42A 1JL2A 1C1CA 3TWHA 4CHNA 4CJSA 3OVNA 4DFMA 3QEPA 1UWBA 3OYFA 4FJ7A 2NUBA 3OYJA 2DY4A 4C8LA 4OPKA 4CJKA 3B6PA 1U47A 4ELVA 4NCBA 4EZ6A 4O0IA 4DTOA 5CYQA 3AO2A 4ID5A 3V9SA 4HUGA 2ZE2A 4DLGA 3CYMA 3L8BA 4E1MA 3K5OA 2IGIA 4CJQA 3KK2A 1NJXA 1ZBUA 4LY7A 1BI4A 2P5OA 4OLBA 3AA3A 2HB5A 1QS4A 3DYAA 4EZ9A 2ETJA 1S1VA 2JLEA 2D5RA 1FKOA 1TL1A 3OYDA 4NYNA 3ZT4A 4W5RA 5KRSA 1NOYA 3NH0A 5J2MA 3BGRA 5SWMA 2FBXA 5D3GA 2Y1IA 3HPOA 1NKCA 1RT5A 4DS4A 2F8TA 3C6TA 3VQ6A 4CFCA 1BCOA 4AHRA 3MAQA 4FK4A 4Z4EA 4CJ3A 4DQSA 3IG1A 4RW7A 1U4BA 3KTQA 4DSLA 1IG9A 2YNHA 4M3ZA 4DTMA 3L3UA 4JLHA 3NHGA 1C0TA 1CXUA 4FM2A 3DMJA 3AA5X 4KHNA 4N41A 1LW2A 3NF7A 1HYSA 2Z1GA 2GUIA 3OS0A 2G8UA 2EX3A 4KI4A 3QESA 4RW8A 1RDAA 3O3GA 3DLEA 3TARA 3RWUA 4KKOA 4N5SA 3JSMA 4FLXA 2A1SA 4KHWA 1U04A 3ZSZA 4B9LA 3ALYA 4CK1A 2RF2A 1L3SA 3HK2A 1JLAA 5T7BA 2LSNA 1F21A 3CM6A 4FJJA 4E7JA 1BHLA 4HVJA 1XWLA 1RCHA 2W42A 1HYVA 5KI6A 3JYTA 3K58A 1RBVA 1RT7A 4DU1A 4MQ3A 3O4NA 1RT3A 4O0JA 4F2SA 2DFFA 4OKEA 3QEIA 2WOMA 2HVIA 2FBYA 1JLBA 4E7LA 1NK9A 1KTQA 1TKZA 4M3RA 1WSJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LAKA 3OJUA 2KW4A 3H3NO 3TTDA 4AM6A 1Q8IA 3VQAA 4NXMK 3DI6A 4DWIA 2UXBK 4DSKA 4W5NA 5KGWA 5SZTA 5CE3A 5KPTA 2KZMA 3NDKA 4CHOA 4IFVA 4FJ5A 4H0XB 3DRPA 1YUWA 1ATRA 4DR5K 3QLHA 4B3RK 4BRAA 2F9TA 2X74A 4IXCA 3LDNA 4OO1J 4JHDA 5AZJA 2CH6A 3I0SA 3PO4A 3SMSA 3AV9A 3OS2A 4CJWA 3ASMA 4FWKA 3D0PA 4KAZA 4IOCL 3LWLA 2IS3A 3K57A 4AHTA 4WQ5C 3HZ6A 3M8RA 2A5XA 3K5LA 3S3NA 1BWFO 4O4GA 3ZT2A 4FLUA 3P39A 3VEYA 1BQMA 2E8AA 2E20A 4C8MA 1NK7A 3HSTB 5AQMA 1C6VA 4BVPA 3A5NC 1WB9A 3DLHA 2GELA 5MLCQ 2OPSA 2Q2RA 3CJ9A 3RVCA 3S3MA 1LV5A 5FROA 3QEXA 3K59A 1SL2A 1VQ7N 3J81O 4FPAA 2O4GA 1N5YA 3ZSYA 4FM1A 3HP9A 4JI0K 1KLNA 4OLAA 3ZYYX 1IV0A 3GG4A 3HL8A 4GVEA 1IH7A 5BR9A 3TR8A 5CZ2A 5JICA 1HLUA 4Z4CA 1D9FA 3V9UA 3SQ4A 3HJFA 3LWMA 3HVRA 2HHUA 3EL2A 2HF3A 4GW6A 4MDBA 3AVHA 2BE2A 3QEWA 2O8DA 3THWB 4DQIA 1C0MA 3DXMA 4A59A 3KVGA 2P9PB 3CHWA 1NKEA 3LPTA 3TABA 3AVGA 4G9ZA 3EN9A 3L4QA 2GWJA 2YKMA 5FPNA 3SUQA 3CQ8A 2B4JA 2QTDA 2GV9A 4CHPA 1LWEA 3OYGA 4JKGA 2HBMA 3GOIA 3ZCMA 1SL1A 4CJ7A 1RT4A 5CY4A 4NO7A 5AQYA 2QXLA 4DCHA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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