2EWSA

Crystal structure of s.aureus pantothenate kinase
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
267
structure length
260
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Prokaryotic Type II and Type III Pantothenate Kinases: The Same Monomer Fold Creates Dimers with Distinct Catalytic Properties.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pantothenate kinase
molecule tags Transferase
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
total genus 95
structure length 260
sequence length 267
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2005-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ewsA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ewsA01
4BVPA 1RFQA 3JXUA 4CZKA 3FZFA 4H0XB 4I6MB 2E2QA 5BPMA 1GLCG 4CI6A 3WUHA 3FZLA 4J8FA 4FOEA 1HX1A 1X3NA 4DHYA 5BREA 3GDQA 2YCHA 3U4LA 5BPLA 2EWSA 4FPAA 4A62A 1NGFA 4BC5A 5BR9A 3SMSA 5EX5A 5AR0A 1V4TA 4M7YA 4EIAA 5AFUH 3VOVA 4A61A 2QWQA 3TU5A 4FWNA 1HLUA 2ITMA 1BDGA 1KAXA 2YJEA 4H0TB 1E4FT 3RSEB 2GTDA 4DB3A 4B1ZA 4IO8A 1NGDA 3EO3A 2QWLA 1LCUA 1GLLO 2E2PA 3WEEA 2P9UA 4NB4A 2VCPA 5BN9A 1NBWA 4BG8A 2P9SA 3DWLA 5I9EB 5KPZA 2FF3B 5AQMA 4RWTA 3LL3A 1RDWX 1S22A 3VF4A 5JLFA 3O80A 3LM9A 4PL7A 3BF1A 2Q36A 3KZBA 3F9MA 3CERA 3L4IA 2P9IB 3VETA 4KBOA 2IVNA 3O4WA 2FSJA 4BREA 1U2VA 4ISFA 1BOTO 3IMXA 4CZEA 1IJJA 4XH4A 1D4XA 1DKGD 3H6EA 3ULEB 4MO4A 2PAVA 5AZJA 2GWJA 1J6ZA 2E20A 2VYPA 3QB0A 4JHDA 3VGLA 3VEOA 1NGIA 4BRDA 3O08A 5F1XA 2P9PB 3SMPA 3FZKA 3ZX3A 2P9PA 1KXPA 1GLBG 5AQGA 1Q18A 2F9TA 1SAZA 1BA1A 3ENHA 2NRHA 3MDQA 1QZ6A 2Q31A 1HUXA 2A3ZA 4FOIA 4PKHA 1KAZA 2ASPA 2H3GX 4CZLA 5ADXA 1SQKA 3WQUA 4C23A 2UYTA 2Q1NA 2D4WA 2OANA 4Z94A 4B1VA 5AQQA 5EOYA 4BRMA 4H0VB 1K8KA 3H1QA 3L6QA 2V7ZA 3HI0A 2FF6A 4JN4A 5KQDA 2QM1A 4IJAA 5AQXA 5AQFA 2D0OA 3ATUA 3LDLA 5AQTA 3ZEUB 4CZJA 3ZEUA 5CE3A 4LC9B 3VGKA 3AARA 3DXMB 3ZX0A 4H5WA 3EKSA 2W40A 5AQVA 2YJFA 4BR0A 2YHWA 3C7NB 4YDUA 3VEWA 3UKRB 2IVOA 3ZETA 3B8AX 2ASMA 2I7NA 4FSVA 3AAPA 5ELZA 1U6ZA 3CI5A 5BRDA 3H46O 4BRQA 2PBDA 3LDNA 3M6GA 5FPNA 2NLXA 3BP8A 3HM8A 4AM6A 2V52B 1XUPO 3CIPA 2Q2RA 4FWLA 3UKUB 1ESVA 1NGHA 4CJ7A 4H03B 3A5LC 3MN7A 4GNIA 5LJWA 4I6MA 2BTFA 1MDUB 3VEZA 4AM7A 3KVGA 1H1VA 3VF2A 4BGAA 3ATVA 1NGCA 3J8AA 2QXLA 3GL1A 4QS8A 2P9LB 1DGKN 5AQPA 4CZHA 1JCFA 3LDQA 5LJVA 1ZBSA 4MLHA 1HJOA 3HZ6A 4BGBA 4IZ9A 4FO0A 3MN9A 3BEXA 2HF4A 3GBTA 1TUUA 2A41A 1ATRA 1C0GA 5AQOA 1BA0A 3P4IA 3UB5A 1MWKA 3O8MA 1NGAA 3D2FB 3EN9A 3RSEA 5FPMA 2NZTA 1GLDG 2QWMA 3O1WA 4CBXA 2YHYA 1S3XA 2A5XA 1G99A 2Q0UA 1R59O 5AZIB 3QBXA 4M7XA 3QFPA 4IWVA 3LDOA 3W3DA 3AY9A 3C0BA 1NM1A 2Q97A 3H3OB 4IJNA 5AQRA 1X9JA 3CETA 3VEVA 3VPZA 3IDHA 5LY3A 1TUYA 3A0IX 3CJCA 4O5FA 4BR5A 4BRHA 1RGIA 2V7YA 3MK6A 3CJAA 2P9IA 2FXUA 4PL8A 1C0FA 4H5NA 3FR0A 5ADXH 4CD1A 2P9KB 4RTFD 1HPMA 3BUZB 3G25A 3MN5A 3VENA 3DAWA 3VGMA 4CBUA 4B9QA 4NO7A 3FZMA 1XC3A 5AQNA 3UE5A 2I7PA 3ULEA 4BRKA 3ID8A 4FWQA 3WXJA 1NWKA 4PKGA 4BR2A 5KQ8A 1GLJO 3H3NO 4M63C 4WQ4A 3AAQA 3FFKB 1GLAG 1IG8A 1HKCA 1ZXOA 2P9NB 4H5TA 2GUPA 3R9PA 2CH5A 3CQYA 5BPNA 1E4GT 3WT0A 4BRLA 3D7EO 1ZC6A 4WYBA 5AQSA 1XQSC 4BQLA 3A5OC 5JLHA 4WQ5A 3DXKB 3BF3A 4L3QA 4ISGA 1TYQB 2ZWHA 3R6MA 4GY2B 3CQXA 2ZGZA 1P8ZA 3U9DA 4HTLA 4XEIA 2E1YA 3A5MC 5FPEA 2IVPA 2GELA 1YAGA 4CD3A 3GG4A 2CH6A 3WXLA 1BUPA 2A40A 3DXMA 4A2AA 2YHXA 3MN6A 4F9OA 2V51B 3M3ZA 3CJ9A 3C7NA 4B1YB 1QHAA 3M1FA 3HTVA 3UKRA 2QWNA 1KAYA 3O1BA 4JD2B 5BRHA 3IUCA 1DEJA 5F2RA 4BG9A 4FL9A 4EHUA 1NGGA 5EY4A 1BU6O 1ATNA 4PKIA 1NGJA 1HKGA 4JNEA 3DJCA 4CZGA 5AQWA 5AQIA 2YI1A 2QWOA 3ENOA 3A5NC 3UKUA 4CZFA 3U9ZA 3EKUA 3SK3A 1WOQA 4QS9A 3D2EB 4FWMA 2P9LA 4H0PA 3GE1A 3GOIA 4O8KA 3MMVA 2DPNA 3VERA 4BR7A 4BRFA 3QMLA 4BRNA 2E88A 4YDUC 3W0LA 1Y64A 4K42A 1HKBA 2CGLA 2D1KA 2BUPA 3CJ7A 3QBWA 2GWKA 3CHWA 4JAXA 3CJBA 4FWPA 3FZHA 3HSCA 3D2FA 1NLVA 1YUWA 2FLOA 4Y0WA 2KHOA 5TKYA 3VEXA 5BN8A 3LDPA 1YXQA 3QICA 3ZX2A 4K41A 1QQOA 5AZIA 1JCGA 4BVOA 2HMPA 2D0PA 4BROA 3WQTA 3I8BA 3S41A 4B1UB 4EFHA 3IFRA 4DCHA 3A8YA 2ZF5O 1MA9B 1NMDA 3TPQA 2QWPA 3HBTA 4CZIA 5AQJA 3WEEB 5FPDA 3WXIA 1X3MA 2P9UB 4H5RA 3CJ1A 4CZMA 4IXCA 4MLEA 4FPBA 4BRCA 2FSNA 2P9SB 4XH1A 2P9KA 4DQ8A 1T6CA 2A42A 2E8AA 5AQUA 1LOTB 2ASOA 3EZWA 4BQZA 5KPTA 5AQYA 2W41A 2VWBA 3O5BA 4BRGA 2QWRA 3KHYA 1GLEG 4H0YB 5JICA 2AA4A 5AFUA 5AQLA 4HWIA 4FWRA 1CZAN 4BRIA 3EL2A 3MCPA 1U2VB 2Q0RA 3U8XA 2HF3A 1NGEA 3FGUA 3L0QA 3I33A 1OKJA 4FWKA 4H0OA 4EAHD 1V4SA 2F9WA 2P9NA 5AQZA 5JMVA 1ATSA 5AZJB 1BG3A 1QZ5A 4JHDB 1T44A 3DXKA 4BRPA 1MWMA 2ZGYA 4FWSA 1TYQA 2QW9A 4A2BA 3H1VX 4BC2A 1JCEA 1QQMA 2A6AA 4EHTA 5F0XA 2E2OA 5E26A 3WXKA 5KPRA 4H5VA 3FLCO 3QFUA 4FWOA 4K25A 3VF6A 1YVNA 4K43A 5B8HA 2AP1A 3VESA 5EXWA 4BC4A 2E1ZA 4BC3A 1GLFO 2IIRA 3QDKA 4WQ4C 1BO5O 1K8KB 3SLCA 4QS7A 4ISEA 3R8EA 5EVZA 2CGJA 1T6DA 4JD2A 2CGKA 4BR4A 4B1WB 2HOEA 4XH5A 5E84A 2E2NA 2J4RA 4RCHA 5BRFA 4BR9A 2FSKA 3OHRA 4WQ5C 1BWFO 3H45C 3O6WA 4B1XB 4BRAA 2WUSA 3SJHA 3ZETB 5AQKA 1EQYA 1WUAA 1QQNA 4CBWA 3D2EA 4MO5A 3JS6A 1SZ2A 5AQHA 2GEMA 1Z6RA 3FE1A 4E1JA 1NGBA 3LM2A 1Z05A 3VEYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LF4K 3O9TA 3FZFA 3V4IA 2E2QA 3WUHA 3FZLA 3EY1A 2PFUA 4JI0K 4JS4A 4E7LA 4IOAL 3CCRN 2YCHA 5GADP 5BPLA 3KLGA 5BR9A 3SMSA 4KI6A 5AR0A 1RTJA 3WNHA 1WSHA 4M7YA 4B3TK 3SUNA 4FWNA 3KK7A 3BDPA 4FJJA 4JKGA 4H0TB 4TSXA 1JLQA 4B1ZA 4IO8A 3KWIA 3O9SA 3EO3A 1Q82O 4IKFA 3WEEA 3AVMA 1DT9A 4BG8A 1XC9A 3NH2A 1VSFA 4CERA 1RDWX 1XHXA 1WSFA 3BF1A 5HOOA 3OYJA 3KZBA 3NFAA 3F9MA 3CERA 3L4IA 2P9IB 3VETA 3G71N 4KBOA 3DLBA 3NVMA 4J2EA 2FSJA 1U2VA 4CJQA 4ISFA 1BOTO 4YOTA 3NVKA 3FFIA 1IJJA 4F2SA 4DR4K 4GV9A 1DKGD 3NF7A 4DTMA 2NRVA 1YI2N 2RPIA 4KB0A 4BRDA 1ASVA 3O08A 3ZSVA 5F1XA 3SMPA 3NE6A 2P9PA 1KXPA 1Q18A 5GIOA 3VQ6A 3RR8A 4FOIA 2ASPA 3KKSA 2UYTA 2OANA 3SQ4A 1M90O 3CCMN 4BDZA 4KTWA 2UXCK 4I2PA 3VA0A 4JYAK 3AVLA 4KO0A 4CZJA 3LDLA 5AQTA 1RCHA 3AARA 1RNHA 3DXMB 4H5WA 4ICLA 2W40A 2YJFA 1FKOA 3SNNA 3LZJA 3SPZA 1J9AA 2KLAA 3UKRB 3ZETA 2YKNA 2ASMA 4FSVA 1VSKA 4CJUA 4JV5K 4LSLA 4OVLA 3O3GA 3QNOA 3OS0A 1KD1O 2PBDA 1W2BM 2E4LA 2UXDK 5CZ1A 3HM8A 5C15A 4HUEA 3CIPA 4Z4IA 3G0ZA 1KC8O 4RW7A 4X62K 1W9HA 1MDUB 4AM7A 5I3UA 1L3SA 1IKWA 4CFBA 1NGCA 1NJWA 1LW0A 3DOLA 5AQPA 1JCFA 5LJVA 1T7PA 4CF8A 4JRQA 3PX6A 4RW9A 1HJOA 3AGRA 5KGWA 2Z1GA 4IZ9A 3TSUA 1YF5L 3MN9A 4E7JA 3BEXA 2HF4A 1U47A 2UU9K 1NGAA 3BY5A 4PHTX 5FPMA 2NZTA 5GAGP 5KTQA 4CGJA 3PO5A 1S3XA 2IDOA 5FROA 1W0HA 1T8EA 4M7XA 4IWVA 2BH1A 1NNEA 5AJ3K 4H4MA 4IJNA 3VQ5A 2KFZA 2P5GA 4CFDA 3CCSN 1TKZA 1TUYA 3E9LA 3KK3A 1C0TA 3WNFA 4BRHA 4A59A 1BI4B 3O9RA 4WFBL 4DSFA 4BWJA 4CEOA 4FVMA 3FR0A 3K58A 2BE2A 4CD1A 4JK8A 3VQEA 2Z1JA 3G25A 3K0SA 3AA3A 3QESA 1KCFA 5AQNA 3UE5A 3OYMA 3OS2A 2KQ2A 4DQIA 3SQ2A 2D5RA 3P1GA 3OYAA 4J2BA 3PLAA 3IRXA 2LSNA 3TAQA 5KQ8A 4LY7A 3KLEA 4LSNA 4WQ4A 5E41A 3HYFA 2UUCK 4DKWA 1IG8A 3T1HK 2P9NB 3R9PA 3CYMA 5J2PA 1ZC6A 5AQSA 1RT6A 2O8DA 4CF1A 3OTOK 4L3QA 4DQRA 3T3FA 1NU0A 5IT9O 3U9DA 3DYAA 1QSSA 1WSGA 1S1VA 4XEIA 5J2NA 1NKBA 3WXMB 5FPEA 2IVPA 1KFSA 3HVTA 3LP0A 4OGEA 4IG0A 3WXLA 2WFBA 4A2AA 1JKHA 1YHQN 3VN5A 2P1JA 4F9OA 3CJ9A 1NJIO 4M3UA 2GBZA 2QWNA 3CFOA 1KAYA 5BRHA 1VQMN 5C25A 5F2RA 4BG9A 4FL9A 3O3HA 1BU6O 1JLBA 3DJCA 5AQWA 4C1NK 4N41A 1BL3A 4C8LA 2QWOA 1Q81O 3U9ZA 3EYZA 3EKUA 3L2WA 4PQUA 3RRHA 3J80O 1SKWA 4J2DA 2P9LA 4CEEA 4H0PA 3MCAB 3GE1A 3MMVA 3SJJA 2OTLN 1ITGA 3NF6A 4BRNA 4RW6A 3DLEA 3QERA 1KVAA 5HROA 3CJ7A 3CHWA 3I8DA 4JK7A 3O3FA 3CJBA 4GW6A 4FWPA 2YHBA 3AVNA 3D2FA 3J7AP 1NLVA 3TARA 4DS4A 2W6LA 3E01A 3K9JA 1TL3A 4CIGA 4K41A 1QQOA 3QLHA 2VG6A 4DUYK 2HMPA 5KRSA 2D0PA 3WQTA 3S41A 4AQYK 1ZBHA 4JKGB 1P90A 4OLAA 1IBMK 2FBXA 3NF9A 4CHYA 1XI1A 1MA9B 4JKEA 4GKJK 1NK9A 4X64K 3QNNA 4CZIA 3WEEB 5FPDA 4IFEA 3WXIA 1VSMA 1KRPA 4H5RA 3LP1A 4CEAA 4UQGA 1UWBA 2NRRA 1WAFA 4CHOA 4OGCA 4DQ8A 4AHVA 3V1QA 4DV4K 3HPHA 1RTIA 3EZWA 3AVJA 4BQZA 5FRNA 2G8HA 1E3MA 3AVGA 3QO9A 2QWRA 3KHYA 5JICA 1A5XA 3B6OA 4LFCK 1O13A 3CMEN 5HLFA 3EL2A 3MCPA 1SL0A 1U2VB 4HCCA 2YV0X 2HF3A 4CK1A 3DRPA 4YOUA 5K14A 2HHTA 1R0AA 2JLEA 1V4SA 2JWLA 4FJ9A 3HP6A 3HRGA 4MFBA 1BG3A 4KKOA 3DXKA 4BRPA 1ZBLA 4FWSA 4LF8K 1RDAA 3G4SN 4BC2A 1C6VA 3SAFA 3CG7A 3ZSWA 4DTPA 3SZ2A 4JKDA 4GV3A 1YVNA 1LWFA 1SV5A 3VESA 5EXWA 2ZD1A 4BC4A 2ZJRL 1ZBUA 4CHNA 1HNZK 1Q8IA 3QDKA 3VQ4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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