2EWSA

Crystal structure of s.aureus pantothenate kinase
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
267
structure length
260
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Prokaryotic Type II and Type III Pantothenate Kinases: The Same Monomer Fold Creates Dimers with Distinct Catalytic Properties.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pantothenate kinase
molecule tags Transferase
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
total genus 95
structure length 260
sequence length 267
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2005-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ewsA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ewsA01
4QS7A 3H3OB 3UKRA 2A6AA 5AQVA 3DAWA 3ZX0A 4XH4A 3RSEB 2ASPA 1R59O 2NZTA 4M7YA 4F9OA 1Z05A 2I7NA 4M7XA 2GELA 4CZGA 1BOTO 1JCEA 4PL7A 3D2FA 1DKGD 4BRCA 4H0YB 2AP1A 2GTDA 3GDQA 2E2PA 3VEWA 3FZFA 1NLVA 2A41A 2E1YA 3AAQA 2ASMA 1QQMA 1HLUA 4B1ZA 3LDLA 1BU6O 3WEEB 4CZMA 5AQHA 5AQMA 5FPNA 4H0PA 5AZIB 4EAHD 4FPAA 4RWTA 1NGDA 5KQ8A 4EHUA 3L4IA 5F2RA 2D4WA 3SMSA 1HJOA 2F9WA 4IZ9A 1NWKA 2QXLA 5E84A 5EOYA 4C23A 1RDWX 3S41A 3VF6A 4CBUA 2V7ZA 3CQXA 5BPNA 4CJ7A 1NGEA 1YAGA 4I6MB 3B8AX 3A0IX 3FZHA 3CJCA 3R6MA 2FSNA 3VF2A 3W3DA 1SQKA 4FOIA 1MWKA 2AA4A 4HWIA 5ADXA 1WUAA 2P9NB 5KPTA 1TUYA 1QQNA 3U8XA 3A5OC 4CZJA 4CZLA 4H0TB 2ZGZA 1GLLO 2EWSA 3CQYA 3LDQA 4ISFA 3QFUA 4O5FA 2BTFA 2P9UA 4B1UB 5LJWA 1BG3A 4BRLA 3IMXA 3W0LA 4FSVA 5AQSA 1ZBSA 3FZMA 2QWNA 3EZWA 4BR7A 1HPMA 2ITMA 1RFQA 3SMPA 1ATNA 3ID8A 4IJAA 3ZX2A 1MA9B 3CJ7A 4H03B 4B1YB 1XUPO 2UYTA 1QZ6A 4AM6A 3GOIA 4BVPA 2P9PB 1BA0A 4FWPA 1IJJA 2P9IB 5JICA 1H1VA 1Q18A 3VGLA 4CZIA 2PBDA 1RGIA 2Q97A 3DWLA 4FWLA 1NMDA 4B9QA 5AFUA 3HI0A 1X3NA 2E8AA 5EXWA 3LDPA 2Q0UA 4NB4A 3BF3A 3VPZA 2Q36A 3QBWA 4PKGA 3CHWA 1ATRA 3LM2A 2YHWA 3TU5A 3BUZB 4L3QA 2D0PA 3G25A 3CI5A 3WXIA 5BRHA 1U2VA 4CZKA 4B1XB 1C0GA 3FGUA 1J6ZA 4MO4A 5BRDA 1WOQA 2IIRA 4H5NA 3VENA 3HSCA 3UE5A 2BUPA 2IVOA 2P9LA 3L6QA 1TYQB 3WQUA 1QQOA 2CGLA 3O6WA 1MDUB 3MK6A 1KXPA 5FPDA 2VWBA 2W41A 3QB0A 2GWKA 4E1JA 3DXMA 3U4LA 4YDUC 1EQYA 1K8KA 3IFRA 5AQYA 1GLJO 4GNIA 1BDGA 4B1WB 3WXLA 5JMVA 3TPQA 3WXJA 3QFPA 2QWRA 3FZKA 3VGMA 2P9SA 4FO0A 5BN9A 2FF3B 4GY2B 5AQNA 1NGIA 2CGJA 1BWFO 4Y0WA 3KZBA 3M3ZA 2QM1A 3DXKB 1YUWA 4IO8A 1IG8A 4BR2A 4WYBA 1T6CA 1V4SA 4FWMA 5AQPA 5AQQA 3RSEA 3FLCO 3MN6A 5AQIA 5AQKA 4B1VA 3ZETB 2E1ZA 3LL3A 3H6EA 3QMLA 4WQ5A 5AQXA 3F9MA 5KPRA 4K25A 4FWKA 2E2NA 1NGGA 2F9TA 4H5RA 1NGFA 2QW9A 3A8YA 3VEYA 1YXQA 3O1WA 2HMPA 4MLEA 2I7PA 4BR4A 1GLCG 3R8EA 2NRHA 1BA1A 3BEXA 4FWRA 4XH1A 2DPNA 5AQGA 1GLAG 4K43A 1HUXA 5AQZA 5BN8A 3CIPA 3H1QA 4J8FA 3WEEA 3ZX3A 2A5XA 1T44A 5AZIA 4IXCA 3ZEUB 2FXUA 2QWLA 5BREA 4O8KA 3A5MC 1S3XA 2Q2RA 1Y64A 1XC3A 3O8MA 2FSKA 2E2OA 3HBTA 4ISEA 2HF3A 3D2EB 1YVNA 1TUUA 3GL1A 2E88A 4CBWA 4Z94A 3VF4A 4I6MA 2YJFA 4WQ4A 2CH5A 1NGCA 1P8ZA 3QICA 3CERA 2P9NA 2YJEA 1KAXA 4XEIA 5AQLA 4RCHA 4CI6A 2GWJA 4HTLA 3JS6A 2GEMA 5EVZA 3EKSA 1T6DA 4QS9A 3VEZA 1NGBA 5ADXH 1HKCA 1GLEG 4EIAA 3M1FA 4CZFA 2ASOA 3CJ9A 4BRMA 3VEXA 1NBWA 3C7NB 3A5NC 3WQTA 3VERA 4BR0A 4QS8A 5BRFA 3IUCA 3M6GA 4CZEA 3HZ6A 4FWOA 3QBXA 2P9PA 5KPZA 3MDQA 2QWQA 1NGAA 2P9IA 3VESA 2CGKA 3MN5A 4JD2B 3A5LC 3EN9A 3CJAA 3OHRA 1U6ZA 3O5BA 3UKUB 3SLCA 3VGKA 2FF6A 4H5TA 5EY4A 3ENOA 3UB5A 5E26A 4A61A 1DGKN 4PKIA 4DHYA 1ATSA 3FR0A 4BGAA 2IVNA 3AARA 4JN4A 4NO7A 3WUHA 2PAVA 5LJVA 3O08A 2VCPA 5AFUH 2A40A 4BQLA 5BR9A 4CZHA 4RTFD 3BP8A 2V52B 4H5WA 5AZJB 2ZWHA 3MMVA 3FE1A 4MLHA 4BGBA 4JNEA 5BPMA 4JHDB 2A42A 4FWNA 2P9KB 1E4FT 3ULEB 1XQSC 4MO5A 3P4IA 2YHXA 2HOEA 2D1KA 4H0XB 3VETA 3EO3A 3UKRB 1TYQA 3H3NO 1HKGA 2YI1A 3GBTA 3R9PA 1E4GT 5FPEA 4BREA 1QZ5A 4BC5A 5I9EB 5AQOA 4EHTA 4BRFA 4FL9A 1MWMA 2FLOA 3L0QA 3AAPA 1JCFA 1SZ2A 4EFHA 3EKUA 1OKJA 2IVPA 3AY9A 3LDNA 3D2FB 1NM1A 5CE3A 4CBXA 3DXKA 1LCUA 1CZAN 4PKHA 1X9JA 3LDOA 1Z6RA 4BR9A 1S22A 3I33A 3I8BA 3O80A 4M63C 4BRDA 3HM8A 4BRKA 3ZETA 4CD3A 4KBOA 4BRIA 2V7YA 2ZGYA 4BRAA 5FPMA 3CJ1A 5AQRA 2Q0RA 1LOTB 5AQJA 3O4WA 1KAYA 4FOEA 5AQUA 1NGJA 2W40A 2WUSA 1ESVA 4BC2A 3H1VX 3H45C 4A2AA 4FPBA 3FZLA 3ATVA 3LM9A 5F0XA 2YCHA 5AR0A 1SAZA 1GLFO 3ZEUA 2E20A 1NGHA 4BG9A 3GG4A 5LY3A 1QHAA 5ELZA 2P9UB 2CH6A 1BUPA 2ZF5O 4WQ5C 2QWPA 3D2EA 3WT0A 3H46O 2FSJA 2J4RA 4BC4A 2VYPA 5BPLA 3J8AA 4H5VA 1V4TA 2NLXA 1ZXOA 2GUPA 2Q31A 4AM7A 4BRPA 2D0OA 2V51B 3QDKA 4K41A 4BVOA 3MN9A 1JCGA 5JLFA 4BRGA 2A3ZA 4BR5A 3DJCA 4ISGA 4H0OA 3GE1A 5TKYA 5JLHA 5EX5A 3FFKB 1DEJA 3D7EO 3C7NA 5AQWA 4YDUA 2QWMA 3KVGA 1KAZA 5F1XA 3MCPA 4FWQA 4DB3A 5KQDA 4BRNA 4XH5A 5B8HA 3VEOA 2H3GX 4PL8A 3CJBA 1G99A 4BC3A 1D4XA 4WQ4C 4JD2A 3SJHA 4DQ8A 3HTVA 2E2QA 3KHYA 4BQZA 3IDHA 4BRQA 2HF4A 4IJNA 2OANA 3U9DA 1U2VB 3UKUA 3WXKA 2Q1NA 2KHOA 4A62A 3EL2A 4BROA 3ENHA 3BF1A 2P9LB 5AQTA 1C0FA 2QWOA 3ATUA 2YHYA 3JXUA 1X3MA 4H0VB 4FWSA 4BG8A 1HKBA 5AQFA 4A2BA 4JAXA 4K42A 3VEVA 5AZJA 3CETA 3DXMB 4BRHA 4JHDA 1K8KB 1HX1A 1ZC6A 4LC9B 2P9KA 3C0BA 3MN7A 3O1BA 4CD1A 3ULEA 1BO5O 4DCHA 4IWVA 2P9SB 3VOVA 1GLDG 3SK3A 1GLBG 3U9ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XO7A 4GV3A 1VSMA 3H3OB 3AO3A 4CJWA 3DAWA 3HRGA 3ZX0A 3K5NA 4QOZB 4DFKA 2ASPA 4I7FA 1Z05A 1HNIA 4M7XA 1N34K 1VAZA 1KFSA 5FDLA 4OPAA 3RR7A 2VQEK 3D2FA 1DKGD 4KI6A 2YHAA 3THYA 3AO1A 1LWEA 4H0YB 1QTMA 1NLVA 1HYSA 4JS4A 3AAQA 1RBSA 1IG9A 3HPGA 4FLZA 1XWLA 5LL6Z 3DLLL 3WEEB 4CZMA 5AQHA 3PV8A 4EAHD 3OVNA 3AVFA 3ZSZA 4YOYA 4YOWA 3ZSOA 4BACA 4BDZA 1NWKA 5E84A 4CERA 2IAJA 3VF6A 4LFCK 3OYAA 4CJ7A 1VRTA 1J5OA 3P39A 2NRTA 1SQKA 1MWKA 2AA4A 4DR3K 3OYHA 1NKCA 3PUFA 3OYNA 1QQNA 4H4MA 3A5OC 4GW6A 4CEBA 4JI7K 3B6PA 4ICLA 3TTCA 4KREA 4O5FA 3PX6A 2ZJRL 4LH5A 1IBKK 4LY7A 3W0LA 1YT3A 3FZMA 4JS5A 3J81O 4BR7A 3KD5E 2ITMA 1RFQA 3NGYA 1ATNA 4DTUA 4IJAA 3NH0A 3ZYYX 3CJ7A 4B1YB 2KFZA 2UYTA 1QZ6A 2EX3A 4FWPA 3KWGA 3CYMA 2P9IB 2BANA 5JICA 1CXQA 3VGLA 4CZIA 4PUOA 2Q3SA 1RGIA 2Q97A 2HHTA 1K6YA 4CHYA 3HI0A 4FJGA 3SI6A 3FFIA 3K5MA 5EXWA 1RT7A 3SNNA 2D0AA 3LZIA 2HNDA 4NB4A 3CG7A 4F2RA 1EETA 1REVA 2D5RA 3EE9A 3VPZA 4PKGA 4F2SA 3HM9A 3CHWA 3QIPA 4LFAK 4IDKA 3BUZB 4N47A 4CZKA 4MO4A 5CR4A 3HSCA 1N36K 4BDPA 3WQUA 3L3VA 2ZD1A 1FKPA 1JLAA 3MK6A 4KTQA 4G9ZA 3L2QA 4CHQA 1KQSM 3DXMA 4YDUC 4KI4A 1OH5A 3IFRA 1GLJO 3VQ6A 4DR1K 2XY5A 2P9SA 1NGIA 2CGJA 3OBYA 3KZBA 2HNZA 2Z1HA 4ELVA 2JWKA 1RT4A 1BISA 4UY8O 3P83D 1V4SA 2B6AA 3RSEA 3MEDA 5FRMA 2E1ZA 3QMLA 1NG9A 4WQ5A 3F9MA 3NH2A 2E2NA 4JKAA 3J80O 1NGGA 2E6LA 3AA3A 3C6AA 4ID5A 4H5RA 3A8YA 2QW9A 4B9TA 3CFPA 3THVA 3O1WA 1ITGA 2NRZA 1TL3A 4BR4A 1JLQA 3NF6A 3SYZA 1WB9A 3SAFA 1BA1A 3RRGA 4X66K 5AQGA 5BN8A 1G15A 4BWJA 1NJIO 3QLHA 3CIPA 4J8FA 1XHXA 5CY4A 3QEPA 1A5XA 3TSPA 4CK3A 3ZEUB 5H1SQ 1BI4B 3K5LA 2JGUA 1S3XA 3JAMO 3O8MA 2KQ2A 3CPEA 1D9FA 4GMJB 3D2EB 5AJ3K 4CE9A 1TUUA 2E88A 4CBWA 1RBUA 4KKOA 2VGMA 3QIOA 2P9NA 4I2PA 3KWIA 1KAXA 1LW0A 1U45A 3HYFA 2OTJN 2G8WA 2HBKA 4M45A 5ADXH 1NU0A 2ETJA 2I5JA 5JS2A 5GADP 4FLXA 4IKFA 1NK6A 4KHYA 1S1XA 3OYGA 3WQTA 4PQUA 4WCEL 3S3NA 2HHXA 5BRFA 3M6GA 2Y1JA 2P9PA 3VN5A 3NDKA 1TKZA 1ZBFA 5HRPA 4B9SA 1KVBA 3CJAA 3VA0A 3G71N 3UKUB 4H5TA 5E26A 4DLGA 2X78A 4OO1J 3LDSA 1ATSA 3FR0A 2ZM6K 2IVNA 3WUHA 4CJKA 3O08A 5AFUH 4RTFD 3AVNA 3JSMA 3ZT3A 3TANA 4MLHA 5BPMA 4JHDB 1NOZA 2A42A 4FWNA 2GUIA 5HP1A 3E1YA 3THWB 1VQ7N 1NK9A 4DFJA 4ILGB 3VETA 3EO3A 4CEDA 5I42A 4IDHA 5HBMA 1BGXT 1HKGA 2YI1A 3S3MA 1VSEA 1VQLN 1FKOA 5AQOA 4EHTA 2P5GA 3EE8A 4FL9A 3AAPA 1JCFA 1C6VA 4KH4A 2P51A 1WAFA 4C8NA 1OKJA 2IVPA 3H08A 3AY9A 3LDNA 5CE3A 3DXKA 4B3RK 1RBTA 1U04A 1LCUA 4C8OA 1X9JA 1WNSA 4YOVA 1YITN 3U6FA 3I8BA 3HM8A 4K8XA 3OYEA 5J2QA 4BRIA 4CEAA 4YOUA 2OZMA 3DRRA 3K59A 3CJ1A 2O8BA 1HYVA 4FK2A 4I2QA 3I55N 4B3SK 4RW6A 3MX5A 1K8AO 1ZBUA 5AQUA 1NGJA 1WSHA 5A2QO 2WUSA 2VQFK 3H1VX 3H45C 4FPBA 4ZTJA 2KTQA 3VQ8A 3LM9A 3A2FA 5AR0A 4DU3A 1C0UA 3KTQA 1XHZA 1T3VA 2GV9A 1NGHA 4J2AA 3RMBA 1QHAA 1RT1A 5ELZA 2P9UB 2CH6A 5KRSA 4JI5K 2HMIA 2AJQA 1VSHA 4AH9A 5M1KA 3TTFA 1U47A 5C10A 1Q9XA 1DTQA 2FSJA 2J4RA 4GVEA 1B9DA 1I3AA 2HNYA 2ZE2A 4FLTA 2NLXA 5SZTA 3SAHA 1ZXOA 4JK7A 1SL0A 1BQMA 2V51B 4CHPA 1JCGA 4C1NI 3OYDA 1VQ9N 3P5JA 3OA9A 2PYJA 1A5WA 5TKYA 5JLHA 3CPWM 4DR4K 1JLFA 3FFKB 4W5QA 5SWMA 2O4GA 4CF1A 4FJKA 1DEJA 3ZCMA 3DRPA 2QWMA 4JRQA 1Q81O 3SBTA 1JL2A 2JLEA 4FVMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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