2EWSA

Crystal structure of s.aureus pantothenate kinase
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
267
structure length
260
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Prokaryotic Type II and Type III Pantothenate Kinases: The Same Monomer Fold Creates Dimers with Distinct Catalytic Properties.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pantothenate kinase
molecule tags Transferase
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
total genus 95
structure length 260
sequence length 267
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2005-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ewsA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ewsA01
1TYQB 2YJFA 1ZXOA 3VETA 2BTFA 4QS7A 3CJCA 1IJJA 4EFHA 1GLCG 3VF6A 4Z94A 3ZX0A 3VF2A 2NLXA 1OKJA 2IVNA 2A42A 4BRGA 2FLOA 2W40A 2QWRA 2P9NB 1HX1A 5KQ8A 2CH6A 2HMPA 3CHWA 3MN9A 3CJ1A 2QWPA 3FR0A 5I9EB 1RGIA 4A2AA 5E84A 2P9PA 5AQWA 1T44A 2DPNA 4ISGA 2VCPA 3BEXA 4BVOA 3WQTA 3OHRA 1G99A 1C0GA 4K25A 5BPMA 4PL7A 1CZAN 1EQYA 4IJNA 5EX5A 3O1WA 1BUPA 1U2VA 4M7YA 4PL8A 4CZHA 1Q18A 5AQSA 3JS6A 3WT0A 3ZEUB 3VGLA 3C0BA 1IG8A 1S3XA 2GUPA 1BOTO 4IO8A 3H46O 4BQZA 3DXMB 2QM1A 4BRNA 3ENOA 2E1ZA 5AFUH 5ELZA 5BRFA 4BR4A 2P9LB 2Q0RA 1H1VA 4FO0A 2W41A 2E20A 5AQYA 4AM7A 5BPNA 4MLEA 5EOYA 5AQIA 2YHWA 1KAZA 1Z6RA 3R9PA 1ZC6A 5BN8A 3HI0A 2V52B 4IJAA 3EKSA 5E26A 5AQUA 2J4RA 3JXUA 4B9QA 5ADXH 4J8FA 5JLHA 1NGEA 2VWBA 4B1YB 3DJCA 3H6EA 1GLDG 4FWSA 2P9UB 4PKGA 1KAXA 4A2BA 4YDUC 3GE1A 2V7ZA 5AQKA 3GBTA 2YHXA 2E88A 3A5OC 3J8AA 4GNIA 1V4SA 3WXIA 1NGGA 3O1BA 5B8HA 2ZGYA 2E2QA 1RDWX 1MWKA 3AAPA 4HWIA 1NWKA 3ZETB 4CJ7A 2VYPA 1X3NA 4H0TB 4FOEA 3FZKA 1XC3A 4WQ5A 1SAZA 2HOEA 3IMXA 1ESVA 3D2EB 3M3ZA 4BR7A 1HJOA 4CD1A 2CGLA 1ZBSA 2A41A 1HUXA 2P9NA 4ISFA 3ID8A 5AQOA 5AQHA 4XEIA 5AQXA 1XUPO 1NGIA 4H0VB 3L0QA 2Q0UA 3FGUA 2QWNA 4MO5A 4A61A 1JCFA 1MDUB 2ZF5O 5EY4A 3WUHA 2CGJA 1GLEG 1LCUA 2CH5A 3CQYA 3VESA 2FXUA 3ULEB 3A5MC 1BU6O 1SQKA 2ASMA 3CQXA 3AAQA 3KHYA 4K42A 5AZJB 4H5NA 1NMDA 2PBDA 3U9DA 2QWLA 3RSEB 2YJEA 1NM1A 3QMLA 3LDNA 1C0FA 2P9SB 4JHDB 4EAHD 1YUWA 3WXJA 2GWKA 5AQLA 5AQMA 4EHTA 2FSKA 2H3GX 4H0YB 4XH1A 4WYBA 3SLCA 1E4FT 4CZMA 4BR0A 4BG9A 1QZ5A 3MN5A 3QDKA 4BVPA 4CZLA 5AQRA 3ZX3A 4FWOA 2Q36A 4RCHA 1NGCA 3MN7A 3CERA 4FPBA 2ZGZA 3D2FA 3A8YA 1HKCA 1GLJO 4BGAA 4JAXA 4WQ4C 4HTLA 3HZ6A 3VEOA 2A3ZA 4BC3A 1KAYA 1X9JA 3H45C 4LC9B 4CZKA 3O8MA 2OANA 4H5WA 3BF1A 3CJAA 3LDQA 1K8KB 2I7PA 3ATVA 3P4IA 4JD2B 5TKYA 3VF4A 3W0LA 4EHUA 1QQMA 4B1ZA 2P9UA 4BRDA 4GY2B 3MK6A 3O4WA 3VGMA 1D4XA 4FOIA 2D4WA 3BP8A 3IUCA 3UKUB 2P9IB 3LM9A 3M6GA 5AQGA 5AZIA 4DHYA 1R59O 1NBWA 4AM6A 3FZLA 5AQFA 3FFKB 3VEXA 1GLFO 2Q31A 4YDUA 1NLVA 3ZETA 1NGHA 2QWOA 3C7NB 3WQUA 4NB4A 3DXKA 5KPZA 5FPDA 5AQQA 4BRAA 3QFPA 3R8EA 5LJVA 2A40A 4H5VA 4BGBA 3QFUA 2F9TA 4I6MA 3FZMA 1JCEA 2HF3A 5AQVA 5JICA 4BR2A 3WXLA 3EN9A 4CZFA 1X3MA 3ZX2A 2E2PA 4MLHA 2HF4A 3UKRB 3BUZB 2GTDA 4FWKA 1NGJA 4K41A 5BR9A 1Z05A 4BR9A 4BR5A 3I33A 4F9OA 1GLLO 1GLAG 3FE1A 1ATSA 1DEJA 1QZ6A 2ITMA 4XH4A 2A5XA 2IVOA 5F0XA 3HBTA 3FZHA 1BWFO 2E1YA 2WUSA 3SJHA 5FPMA 4CZEA 3GL1A 1GLBG 3I8BA 4FPAA 4H0OA 1QQOA 4PKIA 1TYQA 1HLUA 2Q97A 2FSJA 5AZJA 2QWQA 3WEEB 1MWMA 3CI5A 1HKGA 4DCHA 4CD3A 3HM8A 2P9SA 3LL3A 3BF3A 3CJ9A 3LM2A 3SMSA 4K43A 5FPNA 3H1VX 4BC2A 4BREA 2QW9A 3TU5A 4B1XB 4JNEA 1NGAA 1QHAA 4CZIA 5FPEA 1DGKN 1T6CA 3D7EO 3LDOA 1YVNA 3CJ7A 3S41A 5LJWA 2NZTA 4RTFD 3QICA 3ENHA 1QQNA 4B1WB 5AFUA 5EXWA 2V51B 1HPMA 4FWNA 2E2OA 5AQJA 4O5FA 3ZEUA 3LDLA 2A6AA 4QS9A 3LDPA 4BC4A 2IIRA 2ASOA 5BRDA 2Q1NA 2V7YA 3DXMA 1K8KA 1BG3A 4WQ4A 2CGKA 2Q2RA 5KPTA 4BRFA 4FWMA 3IFRA 2P9LA 3CETA 4QS8A 3DWLA 4BRQA 5ADXA 3CIPA 3O08A 3H3OB 5F1XA 3VEZA 4H03B 3W3DA 2YCHA 2YHYA 3EO3A 1V4TA 2E2NA 3MN6A 3EL2A 3VPZA 4M7XA 3H3NO 4BROA 3L6QA 1E4GT 3C7NA 3R6MA 3O5BA 3VERA 1P8ZA 3QBXA 3EZWA 2FF3B 2ASPA 2FF6A 2P9KB 4NO7A 4BRPA 3VOVA 5AQZA 4BRIA 4CBWA 2AP1A 2I7NA 3B8AX 4FSVA 4A62A 2GEMA 2BUPA 2UYTA 3ATUA 3UKRA 4H0XB 1TUYA 4RWTA 1J6ZA 3UB5A 3FLCO 1DKGD 3KVGA 2IVPA 3MMVA 2NRHA 1NGBA 3QBWA 4L3QA 5BRHA 5BN9A 5AR0A 1SZ2A 2QWMA 4M63C 3U8XA 3H1QA 3U9ZA 4BG8A 2AA4A 3UE5A 3F9MA 2D1KA 3G25A 1LOTB 3AARA 5BPLA 4H5TA 3DAWA 2D0PA 5AQPA 4FWRA 3U4LA 3EKUA 3HSCA 3WEEA 2D0OA 3GDQA 3D2EA 1BO5O 1MA9B 3IDHA 5EVZA 5JLFA 1TUUA 2EWSA 2P9PB 4BRMA 4CZGA 1BDGA 1RFQA 3M1FA 4CBUA 1WUAA 3HTVA 3O6WA 3AY9A 3MCPA 4BC5A 3D2FB 4IXCA 1U2VB 1JCGA 1XQSC 4O8KA 2GWJA 1ATNA 2F9WA 3TPQA 4H0PA 1BA1A 3ULEA 4PKHA 4CI6A 4FWLA 5CE3A 3MDQA 4EIAA 3FZFA 4BRCA 3A0IX 5F2RA 4BRKA 3QB0A 4ISEA 4E1JA 3CJBA 1T6DA 3KZBA 4KBOA 3RSEA 4FWPA 3VGKA 1YAGA 3WXKA 4C23A 4BRLA 3O80A 4JHDA 3VENA 4DB3A 1S22A 2PAVA 5AZIB 3VEVA 4BRHA 3A5NC 3DXKB 4XH5A 1KXPA 1NGFA 3A5LC 4FWQA 4JN4A 4Y0WA 4CZJA 2ZWHA 4DQ8A 2FSNA 4MO4A 4I6MB 3SK3A 5AQNA 1BA0A 4B1VA 5KQDA 1ATRA 3L4IA 1HKBA 3VEYA 5BREA 2P9KA 3VEWA 4BQLA 1Y64A 4CBXA 2KHOA 4FL9A 2E8AA 1WOQA 2QXLA 4WQ5C 1U6ZA 5KPRA 4JD2A 5LY3A 4H5RA 2GELA 2YI1A 4B1UB 3SMPA 5AQTA 3UKUA 2P9IA 1NGDA 4IWVA 3GG4A 3GOIA 5JMVA 1YXQA 4IZ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O4IA 5HRRA 3ID6A 5KI6A 3NH1A 1ZXOA 4W5RA 3JSMA 3VETA 4QS7A 3CJCA 4ID5A 2HVIA 4OKJA 1JLAA 3VF6A 3ZX0A 1ZBLA 2IVNA 3LP1A 4X64K 3AVJA 2FLOA 2QWRA 3D6RA 5KQ8A 2CH6A 1K9MO 3P5JA 1NJIO 3I0RA 4YY3K 4Z4EA 2RF2A 3DLRA 5I9EB 2AJQA 1S1UA 4A2AA 2LSNA 4BDYA 2P9PA 3QO9A 5AQWA 2JWKA 1NMNA 2KKZA 4JI4K 2DPNA 4KHNA 2NRXA 3OHRA 1G99A 1S6PA 5BPMA 4IJNA 3O4NA 3OYBA 4PL8A 1NKEA 1YF5L 4FK4A 1Q18A 4F2SA 4CIFA 2G8VA 1IG8A 1DTTA 4NXNK 2GUPA 2YNFA 1BOTO 5M1KA 5HP1A 2YNGA 2QM1A 1CZ9A 4KHYA 4BRNA 1EO1A 3ENOA 3NGYA 1Q7YO 2UUCK 2YKMA 2P9LB 3I56N 3LP0A 4CHPA 3AGRA 2E20A 2HHXA 3SUOA 3I8DA 4KTWA 2JLEA 2BGGA 4TSXA 2YHWA 1VQKN 4DG1A 2OA8A 3HI0A 3L2WA 4IJAA 3MAQA 1U45A 3BDPA 4KO0A 3RWUA 5ADXH 4UQGA 4KH5A 2OPRA 1EWQA 1JL2A 2G8FA 2ZM6K 4CESA 4A2BA 3H08A 1BIZA 2V7ZA 5AQKA 3E9PA 4DS5A 3CMAN 1IKXA 3O1BA 2ZGYA 4DU1A 4B3SK 3KLFA 3ZETB 2VYPA 4OLAA 3CC7N 4L8RB 1XC3A 2IS3A 2WC9A 4WQ5A 4ELUA 1G15A 3MXJA 3HP9A 3O9SA 2OZMA 1RT1A 1ZBSA 2A41A 1VSDA 3KK2A 5AQHA 5AQXA 1XUPO 1NGIA 2WONA 2QWNA 3OYLA 3K57A 4CGHA 5CR4A 3ENBA 1S1TA 3VESA 3ULEB 5M1FA 3A5MC 3DOKA 2HVHA 3KHYA 4AHTA 4QCLA 2PBDA 1YI2N 3CMEN 3RSEB 2YJEA 3QMLA 4JI2K 4GW6A 3EE8A 3K9JA 3J7AP 5AQMA 3CCUN 3KK1A 2FSKA 5HRPA 1E4FT 4PY5A 4J2DA 4BR0A 3DOLA 3QDKA 4BVPA 3CCJN 3ZX3A 2Q36A 1NGCA 3NDKA 4OPKA 4C8KA 3THVA 1HRHA 1GLJO 4WQ4C 3AO1A 4DSIA 1RBUA 1ZBHA 2A3ZA 5HBMA 3ZSQA 1KAYA 1X9JA 3H45C 3SAGA 3QEWA 2HNYA 3MWTA 4LC9B 3O8MA 4CJUA 1IO2A 3LDQA 1K8KB 3ATVA 4OPAA 2ZJRL 3VF4A 3P39A 3T3FA 4B1ZA 1D4XA 2E6MA 4KH6A 2D4WA 3IUCA 3QESA 3MWPA 4W5NA 2OYQA 3DLGA 1HR0K 2F4VK 3HP6A 3CG7A 3AVHA 3FFKB 4WFNL 4IOCL 3ZETA 4FLUA 3C7NB 1C1BA 3O9UA 3QFPA 3QERA 3SQ1A 1IV0A 4I6MA 1JCEA 3LP3A 2HF3A 4I7FA 1RTHA 3SV4A 2WOMA 1X3MA 2UU9K 2NUBA 3CCRN 3VQ8A 4FWKA 4K41A 1Z05A 4JI3K 4K8XA 4F9OA 3TR8A 5JVHL 1GLAG 3ASMA 4X65K 4JKGB 4HUGA 2A5XA 3SPYA 1RTDA 4CHNA 3F73A 2WUSA 5BR8K 5FPMA 4CZEA 4WCEL 4H0OA 4FJGA 4JRPA 2FSJA 1WSHA 4DCHA 2OCEA 3CCVN 4CD3A 4LH4A 3BF3A 3ULDA 4F8RA 3SMSA 4B3OA 4K43A 4Z0UA 4BC2A 2WBNA 4BREA 2YNHA 5FDLA 1XMQK 3TU5A 3DLLL 4CZIA 1DGKN 1T6CA 3AVKA 3D7EO 3LDOA 3S41A 3KJVA 4J2EA 4O8UA 3QICA 2W6KA 4CGIA 3K9KA 3ZSOA 3HM9A 1WLJA 3O3GA 2HBKA 1HNZK 4IFEA 3WXMB 3AVGA 3TAGA 4CEFA 5C2DA 4M3WA 3NH2A 5BRDA 3RR8A 1CZBA 1K8KA 1RT2A 4Z4HA 1I94K 4BRFA 2E6LA 5HOOA 2KTQA 3CETA 4E7HA 4BRQA 4Z4FA 1VQON 1S9GA 3VEZA 2HHVA 4O55A 4CERA 4YOYA 3O3HA 2E2NA 3MN6A 3FFIA 4M7XA 3H3NO 4BROA 3L6QA 1MU2A 3C7NA 3F5TA 3O5BA 4ICLA 3VERA 4EP5A 4CF9A 5M1QA 4DV3K 4NO7A 2OPQA 4BRPA 4DR3K 2AP1A 3AO2A 2IDOA 2W42A 4DR1K 3AVAA 1VQ4N 1X9WA 4A62A 2IOCA 4CECA 1Z26A 1JLQA 1WSFA 3CFPA 4B9LA 3AA5X 1TUYA 3VQ5A 1J6ZA 4MDAA 2XY6A 4FJ5A 1KTQA 5BRHA 1NGBA 4LSNA 1Q9YA 4OVLA 4PQUA 5J2NA 4M63C 1FKPA 3V9XA 1WSJA 3F9MA 2D1KA 5BPLA 3DI6A 5AQPA 4FWRA 3U4LA 3EKUA 4E7IA 1TK8A 2GUIA 1I39A 2VQEK 2D0OA 4GV6A 1LW2A 5JLFA 5EVZA 3PIPL 2EWSA 4C1NI 1Q8IA 3CPEA 4R79A 1W97L 4FM2A 4BRMA 1BI4B 2BANA 3AVFA 1BL3A 1WUAA 3HTVA 4FLTA 3HK2A 4IOXA 1U2VB 4JK9A 1JCGA 3PX6A 2FBVA 3V1OA 1W0HA 1XQSC 4C1NK 4O8KA 3SUPA 2F9WA 2EHGA 4FWLA 3PLAA 3FZFA 4BRCA 4M41A 1HMVA 3CJBA 4Q5VA 4FWPA 1QVGM 1N34K 3VQEA 2YV0X 3O80A 4YOTA 3D0PA 4KHWA 3NF8A 3TSQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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