2F9TA

Structure of the type iii coaa from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
250
structure length
241
Chain Sequence
ASMILELDCGNSLIKWRVIEGAARSVAGGLAESDDALVEQLTSQQALPVRACRLVSVRSEQETSQLVARLEQLFPVSALVASSGKQLAGVRNGYLDYQRLGLDRWLALVAAHHLAKKACLVIDLGTAVTSDLVAADGVHLGGYICPGMTLMRSQLRDAEARRALASLQPGQATAEAVERGCLLMLRGFVREQYAMACELLGPDCEIFLTGGDAELVRDELAGARIMPDLVFVGLALACPIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Prokaryotic Type II and Type III Pantothenate Kinases: The Same Monomer Fold Creates Dimers with Distinct Catalytic Properties.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pantothenate Kinase
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 66
structure length 241
sequence length 250
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2005-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2f9tA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2f9tA02
1QZ6A 4XH4A 2E20A 2YCHA 2E2NA 3ZETA 4BR9A 1C0GA 1NBWA 3DJCA 1KAXA 3QICA 3QMLA 4YDUC 3L6QA 1KXPA 1GLFO 2D0PA 4Y0WA 1NGGA 4BRDA 4CD3A 1SQKA 5ADXA 3VOVA 4RTFD 1Z6RA 3DXKA 4WQ5C 3AARA 3O08A 3VEXA 3A5NC 3RSEB 4IXCA 1BA1A 1GLJO 3CJBA 2E1YA 3ID8A 2DPNA 1BWFO 1T6CA 3ZX2A 1KAYA 3WEEA 4ISFA 5AQIA 2ZF5O 4FWMA 1P8ZA 4BR4A 2J4RA 2P9KA 2FF6A 5F2RA 3WXLA 3B8AX 1NGIA 1SAZA 5F1XA 1Z05A 3ENOA 2E2PA 4M63C 1TUUA 3ENHA 2E88A 3A0IX 3FZLA 2V51B 4BRFA 3QFPA 3G25A 4DB3A 4H5RA 2V7YA 1GLCG 2YJEA 3D2FA 3WQUA 3DXMA 3A5MC 5ELZA 4BRLA 1ZBSA 3BP8A 3FZMA 5AQLA 2UYTA 2GEMA 1JCFA 1K8KB 3W0LA 4KBOA 4BQZA 5AQFA 3QBWA 4EHUA 2HOEA 4WQ4A 2YHYA 3MMVA 4O5FA 3UE5A 3AAPA 3CJ7A 3HBTA 3J8AA 2FSJA 2CGLA 1GLEG 4A2AA 4BRIA 5BREA 4XH5A 1EQYA 3HM8A 3C7NA 4IJAA 5EVZA 3KHYA 4RWTA 5FPMA 2IVNA 4GNIA 3P4IA 4J8FA 4CI6A 4WYBA 2P9UA 1HJOA 4H0YB 1ATRA 5EY4A 4K42A 3EKUA 1G99A 2BTFA 3U9DA 5LY3A 2Q31A 3UKUB 4BR2A 1TYQA 3GDQA 4FWQA 5FPNA 3A5OC 3QDKA 4JNEA 1T44A 4FWSA 3VENA 3VGKA 2GWJA 3LM2A 3O1WA 1E4FT 3BF3A 3MK6A 3C0BA 2KHOA 4MO4A 1Y64A 4JHDA 2QXLA 1YAGA 4XH1A 3HZ6A 4HWIA 1BA0A 3MCPA 1X9JA 5AQZA 3U4LA 5KPRA 4B9QA 2A3ZA 2FSKA 1YXQA 2BUPA 1R59O 4GY2B 4PL7A 5AZJB 4A62A 3MN9A 4DCHA 3AY9A 5AZIB 2IVPA 3A5LC 5BN8A 3VETA 4QS9A 4I6MB 3IMXA 1X3MA 3EKSA 2YI1A 3A8YA 3VEWA 1GLAG 1H1VA 4BRMA 4EIAA 1X3NA 2YHXA 1NGJA 3SK3A 2P9LA 1XQSC 3OHRA 5BPMA 5LJWA 3ULEA 5AFUH 5KPTA 2NRHA 3M6GA 5F0XA 4H0VB 1U6ZA 1NGAA 1T6DA 2D4WA 3CHWA 3GOIA 3R6MA 1QZ5A 2I7PA 4H5VA 4C23A 3WT0A 3UB5A 3RSEA 2FXUA 3M1FA 3MN7A 5AQQA 3R9PA 4DHYA 4IWVA 4IZ9A 4BC4A 3L0QA 5JMVA 5BR9A 2A6AA 2E2QA 1U2VB 4BVPA 1TUYA 3GL1A 3CJ9A 1ATNA 1HX1A 2Q36A 3F9MA 3D2EB 3LL3A 1NGHA 2ZGZA 4JN4A 3ZEUA 4FOEA 4EHTA 3O80A 3LDPA 4M7XA 3R8EA 3CETA 2CH6A 3GE1A 4CBXA 4CZMA 2P9PB 1HKBA 2OANA 5EOYA 3QB0A 3FE1A 3VPZA 5AQJA 3UKRB 3BUZB 1GLLO 2D1KA 3I33A 4K41A 4BGAA 2FSNA 2GWKA 2A42A 4FWPA 4BR5A 1HKCA 4H0OA 3CQYA 1LCUA 3CI5A 2ASOA 3H1QA 5AQXA 2IIRA 3DXKB 1YUWA 3H3NO 4FO0A 4H0XB 1NGEA 5FPDA 1CZAN 4JD2A 1ZXOA 3CQXA 3LM9A 1XUPO 4M7YA 4PKIA 4B1XB 2Q1NA 2P9NB 1BDGA 4BROA 3FFKB 1NGBA 4FPBA 4PKGA 5ADXH 2P9KB 2QWOA 4K43A 1WOQA 4CZLA 3FLCO 4XEIA 5AQOA 4K25A 3L4IA 4DQ8A 2P9SB 5BN9A 1IJJA 4BRNA 3ATVA 1YVNA 4CD1A 4CZGA 3FZFA 3O1BA 1HUXA 5AQVA 2YJFA 2CGKA 5LJVA 3O8MA 3D2FB 2Q0UA 2V52B 1S3XA 4CZEA 3LDOA 3SJHA 4WQ4C 3HSCA 1E4GT 2IVOA 2P9IA 5AZIA 2EWSA 1C0FA 5AQPA 2QWRA 4I6MA 3FGUA 3VGMA 2NZTA 3CIPA 4EAHD 4MLHA 4FWOA 4IJNA 2Q97A 3WXIA 1IG8A 2HMPA 4BREA 1HPMA 3C7NB 3WQTA 4NB4A 4E1JA 3VEOA 2P9UB 3S41A 4O8KA 4BG8A 2PAVA 4CJ7A 3BF1A 4BRQA 1MDUB 2FF3B 5JLFA 3LDQA 1RFQA 1BU6O 1HKGA 2QWMA 5JLHA 1GLBG 4HTLA 2AA4A 3CJCA 4FWKA 3WUHA 3CJ1A 2GTDA 1KAZA 2W41A 4H5NA 1BOTO 1MA9B 3H46O 4ISEA 1J6ZA 4JHDB 5KPZA 1DKGD 1WUAA 3O4WA 5EXWA 4YDUA 2AP1A 4FSVA 3FZHA 5CE3A 2A41A 4CZHA 2ASPA 1OKJA 2ZGYA 4IO8A 3JS6A 4AM6A 4BC3A 4CZJA 4EFHA 3D2EA 5BPLA 4WQ5A 2ASMA 3FZKA 2QWLA 5E26A 4FPAA 3IUCA 3GG4A 1XC3A 2P9PA 4H0TB 1ATSA 3IDHA 3VF6A 4A61A 1S22A 3LDLA 4FWNA 4BRPA 3AAQA 1D4XA 2QWPA 3MN6A 4PL8A 4AM7A 2P9LB 2H3GX 4BC5A 2WUSA 3WXJA 2GUPA 3ULEB 4BRGA 4MO5A 5BRHA 3VEYA 1QQMA 3FR0A 1HLUA 2CGJA 3DAWA 5BRFA 1QHAA 2HF3A 3ZETB 4H5TA 3D7EO 2D0OA 3H3OB 1QQOA 4QS8A 5AQHA 3ZX0A 4RCHA 1K8KA 1DGKN 2GELA 3JXUA 3EZWA 2NLXA 2QW9A 2E1ZA 4FWLA 3VGLA 2P9NA 1SZ2A 3VEVA 2V7ZA 3VERA 5KQ8A 1RDWX 2ZWHA 2ITMA 3QFUA 3SLCA 4BR7A 3O5BA 5KQDA 3W3DA 4BRCA 1BUPA 5AQNA 4BQLA 2P9SA 3UKUA 3ZEUB 4CZFA 3WEEB 1Q18A 3DWLA 5AQGA 2W40A 4BRAA 3H6EA 3O6WA 1NLVA 1QQNA 2Q0RA 3EO3A 3BEXA 1NMDA 5TKYA 3QBXA 3KVGA 2YHWA 4A2BA 4BVOA 5BRDA 1MWKA 3CERA 5JICA 4BGBA 1BG3A 1GLDG 3HI0A 2FLOA 4BC2A 4CZKA 1V4SA 4BRKA 4H5WA 4CBUA 5AQTA 1BO5O 3SMSA 4FL9A 4PKHA 2A40A 5B8HA 3DXMB 3KZBA 5AQYA 4B1YB 3CJAA 1RGIA 5AZJA 5AFUA 4QS7A 4CBWA 4Z94A 3TU5A 4JD2B 2F9WA 3H1VX 3IFRA 2Q2RA 5AQSA 1JCEA 5FPEA 1DEJA 4BR0A 5AQMA 3MN5A 2A5XA 3U8XA 5AQWA 1NM1A 5AQRA 3H45C 4ISGA 4F9OA 2QWQA 4MLEA 3U9ZA 2E2OA 2VWBA 4B1VA 4BG9A 1NGFA 4NO7A 4JAXA 1TYQB 4FWRA 4FOIA 3TPQA 1NGCA 5BPNA 3ATUA 1ZC6A 2E8AA 3VF4A 3GBTA 4CZIA 4B1ZA 1LOTB 4H0PA 3I8BA 2QWNA 3SMPA 3WXKA 3VEZA 1NWKA 2HF4A 2P9IB 5EX5A 2I7NA 4LC9B 1JCGA 1ESVA 1U2VA 3HTVA 1NGDA 5I9EB 5AR0A 4B1UB 5E84A 2VYPA 3M3ZA 3MDQA 3VESA 3VF2A 4L3QA 4BRHA 2PBDA 2QM1A 5AQUA 2VCPA 3ZX3A 2F9TA 4B1WB 3LDNA 1V4TA 2CH5A 3EN9A 4H03B 5AQKA 1MWMA 3EL2A 3UKRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XH4A 4L8RB 3B6OA 3OBWA 2E2NA 1OVYA 3ZETA 5A2QO 3MXIA 1KAXA 2FBXA 3QICA 2HMIA 4DF4A 4YDUC 5C25A 3BZKA 1NGGA 1KLMA 3VN5A 2WONA 5E41A 4RTFD 3KK3A 4WQ5C 5HLFA 1L3SA 3VEXA 3RR7A 1VQPN 3TARA 3J7ZO 3ID8A 4JKFA 4CJSA 5HROA 4RW4A 4ISFA 3SQ4A 3RRGA 3QIOA 2YKMA 5F2RA 4B9SA 1JXBA 4F3OA 4CK1A 4PWDA 2OZSA 3OYEA 1XMQK 2HW3A 4JKCA 4DQPA 3KWIA 3LWMA 3SPYA 1G15A 4CFAA 1NG9A 4BRFA 1LW0A 4PA1A 4H5RA 1KVBA 4KH5A 3DLLL 2OPPA 1ZYQA 4E89A 5CYMA 2FBYA 1HYSA 3A5MC 4BRLA 1ZBSA 1D9FA 4R79A 3DRSA 2QTDA 2UYTA 3V1OA 2VQFK 1KRPA 4FJHA 3QIPA 4KBOA 5AQFA 3T69A 4WQ4A 3MMVA 2VG5A 4DS4A 3HBTA 1Z25A 2UXDK 2HHQA 4WFBL 3O4NA 3P1GA 4WYBA 2P9UA 2KTQA 1HJOA 3BDPA 4K42A 1LWFA 3U9DA 3E9OA 3UKUB 1TYQA 4BR2A 1HR0K 1YITN 4GVEA 1EXQA 4JNEA 4NCBA 4KPYA 4YORA 3VENA 1NKEA 3VQ4A 3O1WA 3CFOA 2O4IA 1SS6A 1XNRK 2KHOA 4MO4A 1GOBA 2O8FB 1Y64A 1VK0A 4DR4K 3ZSZA 4HWIA 2HBLA 3BZCA 5KPRA 1Z26A 2FSKA 1D8YA 1U48A 4XIUA 4F4KA 4WFAL 4DLGA 3TAPA 2KFZA 4N76A 1FKPA 5AZIB 1BIUA 3KK2A 4V19S 1W2BM 3IMXA 4CJ5A 3EKSA 2YI1A 4JS4A 3RMBA 3I56N 1H1VA 1NGJA 4CGIA 4JI7K 2DFEA 3NGYA 4FXDA 5AFUH 5KPTA 4H0VB 1T6DA 4LFAK 1K9MO 3HPOA 3VQQA 1QZ5A 5C12A 3ZSRA 4OLBA 4FM2A 3E66A 4DQQA 1EP4A 3EY1A 3RSEA 2FXUA 3MN7A 5AQQA 3OY9A 4IWVA 3MEEA 4LF9K 3R3LA 3L2WA 1WBBA 3F9MA 3K5MA 1VSDA 1UWBA 4JN4A 3SNNA 3ZEUA 3M8PA 3O80A 3AA3A 4M7XA 3R8EA 3SQ1A 2BGGA 4CZMA 1S1WA 1HKBA 2P9PB 3M8QA 5EOYA 2X74A 4FK4A 3AVKA 3IKMA 1NKCA 5DK5A 4C1NK 4YOWA 4N47A 4FJJA 3HO1A 4K41A 4BGAA 1KFDA 2FSNA 2GWKA 2Z1GA 4YOUA 1FJGK 4H0OA 4W5TA 4KFBA 3THWA 3RVCA 3THXB 2ASOA 2IIRA 3DRRA 4O55A 3IS9A 3V6DA 4FJKA 1ZXOA 3F9KA 3CQXA 4QOZB 2P9NB 3AVIA 5CZ1A 4BWMA 4BROA 1S6PA 3SZ2A 2HBMA 4FJGA 3SQ0A 1EWQA 1VRTA 3MXMA 3FLCO 4KREA 3CC2N 5AQOA 3L4IA 2R7YA 3KIOA 1N33K 3AO3A 3C6HA 4FLUA 3NFAA 4EP5A 2KLAA 2O8EB 1XI1A 2OZMA 4EZ6A 4KHYA 2Q0UA 3RMAA 3TAFA 1RT4A 2HHSA 3D45A 2IVOA 4CGDA 5AQPA 4B3RK 2O8CA 3NE6A 4MQ3A 1OH8A 5KGXA 1NNEA 2NZTA 1VQ5N 3KTQA 3MEGA 1QS4A 4AHUA 3AO2A 2G8VA 3WXIA 1HNWK 4O4GA 3DLBA 1ZBUA 2HMPA 3OS2A 2IC3A 1RBTA 2ZJRL 2P9UB 1FKOA 1X9MA 4O8KA 2PAVA 3OBYA 3TTCA 4DFPA 3WNGA 4BACA 1SUQA 4BRQA 3Q7BA 4DTOA 3DLRA 1Q82O 1NK8A 4RW6A 1BU6O 1C1AA 5JLHA 4HTLA 2IDOA 3CJCA 3HM9A 5DM6L 1KAZA 2HBKA 2W41A 4OX9K 1TKZA 4ISEA 5FDLA 1XWLA 3CPEA 4ILHA 4YDUA 2AP1A 1TL3A 3ITHA 4TSXA 5CE3A 2OPRA 4CZHA 3SCXA 5EU7A 1N8RO 2ZGYA 1NJZA 4IO8A 1VQ4N 3MXJA 4KHUA 3D2EA 3LZIA 4OPAA 4JK7A 4WQ5A 1GOCA 4E7LA 1RTDA 2QXFA 4KHWA 2NRTA 2OCEA 3TAQA 4FWNA 4BRPA 4YNQA 1D4XA 2Z1HA 4AM7A 4WCEL 3LP2A 4BC5A 4CJFA 2WUSA 3OS0A 3LAKA 3MWPA 4MO5A 1T7PA 3AA5X 2O4GA 3DLKA 2D0OA 1WSFA 4QS8A 3TTDA 1SKSA 2F8TA 4DF8A 2QW9A 2E1ZA 4Z4FA 3VGLA 2GUIA 3SYZA 3VEVA 2VQEK 3SUQA 1BGXT 4YHHK 3ZYYX 5KQDA 4M41A 3ZEUB 1Q18A 3DWLA 1DLOA 3RR8A 4FJ5A 3O6WA 3LALA 1QQNA 3T1AA 3QBXA 3KVGA 4DFMA 4A2BA 3HL8A 5J2QA 3DOKA 5JICA 4DLEA 1GLDG 4I9LA 3SMSA 4FL9A 2E5LK 2WOMA 4DTXA 4BDPA 4DTMA 4B1YB 3CXCM 1WAFA 4LF6K 2E6MA 4M3XA 3TU5A 4CJTA 3O3FA 2BANA 3L2QA 3H1VX 3IFRA 3G0ZA 1JCEA 4CF0A 5FPEA 3J81O 4JK8A 5AQMA 1JLQA 1S1VA 2VGMA 3CCUN 4PQUA 3QEIA 4O0JA 4CEDA 5SZTA 2ZQBA 4JEPA 3NVKA 3KD1E 4GKKK 2F4VK 2PYJA 1LWCA 1NGCA 1S9EA 1YHQN 1NMNA 4HUFA 2XY6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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