2F9WA

Structure of the type iii coaa from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 70

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
SMILELDCGNSLIKWRVIEGAARSVAGGLAESDDALVEQLTSQQALPVRACRLVSVRSEQETSQLVARLEQLFPVSALVASSGKQLAGVRNGYLDYQRLGLDRWLALVAAHHLAKKACLVIDLGTAVTSDLVAADGVHLGGYICPGMTLMRSQLRTHTRRIRYDDAEARRALASLQPGQATAEAVERGCLLMLRGFVREQYAMACELLGPDCEIFLTGGDAELVRDELAGARIMPDLVFVGLALACPIE

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
TI1 (8-11)S2 (12-18)TI10 (227-230)AH1 (32-42)S3 (22-29)O1 (45-47)TI2 (42-45)AH7 (235-244)S4 (50-54)AH2 (58-71)O2 (72-74)S6 (84-85)S7 (88-89)TI5 (132-135)S10 (136-144)AH3 (100-113)TVIII1 (92-95)S9 (125-132)EMPTYS8 (117-122)TIV5 (122-125)TIV6 (144-148)AH6 (180-207)AH4 (150-156)TI6 (157-160)AH5 (164-170)TI7 (170-173)TI9 (217-220)3H1 (220-222)S11 (212-216)3H2 (224-226)S1 (2-7)TIV2 (29-32)S5 (77-78)TIV3 (82-85)TI3 (94-97)TI8 (208-211)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title Prokaryotic Type II and Type III Pantothenate Kinases: The Same Monomer Fold Creates Dimers with Distinct Catalytic Properties.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pantothenate Kinase
total genus 70
structure length 249
sequence length 249
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2005-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2f9wA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2f9wA02
3M6GA 3O80A 4BRAA 3D2EA 1BA1A 3QMLA 2HF3A 2P9UA 4BQZA 2YCHA 4FL9A 2YHYA 2YJFA 1NGJA 1C0FA 4H5VA 1JCFA 5E84A 1V4TA 2GWJA 3C7NA 4ISGA 2Q2RA 3SMSA 3GBTA 1NWKA 4FWSA 3VEOA 4BROA 5AQMA 3S41A 1GLJO 2OANA 2P9LB 4BC2A 2ASMA 1KAXA 2ASOA 4H5NA 2E20A 3ULEB 3ZEUA 1NGFA 1ZBSA 4YDUA 5AQFA 2CGKA 1K8KB 3VGKA 4FWRA 4B1ZA 4MLEA 1X3NA 2YI1A 3BEXA 5AQVA 2ZGYA 3GDQA 4H0YB 1TUUA 3O6WA 3EN9A 3MK6A 3VEWA 2P9IA 3A5OC 5EVZA 1GLLO 4EFHA 3CJ1A 2QWLA 5EOYA 4BC4A 4WQ4C 2NLXA 3BP8A 3SLCA 2Q0UA 4ISEA 3RSEB 1NGGA 2AA4A 3TU5A 2HMPA 1GLDG 4XH5A 3ATVA 1BU6O 1HKCA 3VF2A 1IG8A 4MO5A 5KQ8A 4KBOA 3DXKB 4F9OA 2V7ZA 3L0QA 3DXMA 2YHWA 3ZX2A 5BRDA 1XC3A 2IIRA 1YAGA 2V52B 3CI5A 3O1WA 4BR2A 1NGEA 3VPZA 1ZC6A 4RCHA 4FSVA 4O5FA 5CE3A 4DQ8A 5AQTA 1NGIA 3CERA 4XEIA 2V7YA 3VERA 2AP1A 4BRQA 2HOEA 1EQYA 2FSJA 4BG9A 3TPQA 3FZMA 4DB3A 1OKJA 1JCEA 3AAPA 3WXJA 4BG8A 4BRLA 4Y0WA 3VOVA 1KAYA 4K42A 5BR9A 2A41A 4BR4A 3IMXA 4XH4A 3R6MA 5EY4A 3WXKA 2P9KB 4WQ5C 3O08A 2FLOA 3HSCA 1LCUA 3UE5A 5BPNA 4DCHA 2Q1NA 1QQMA 3M3ZA 1YVNA 2A5XA 3U9ZA 3EKUA 4BRCA 4H0OA 5AQUA 5LY3A 2PBDA 2E1YA 4K43A 2BTFA 5BN9A 4C23A 2BUPA 3HTVA 4A2AA 1NLVA 5AQXA 3BF1A 3WXLA 2E2QA 3OHRA 3FFKB 3MN9A 5F1XA 3LDLA 3W0LA 1HPMA 4H5RA 4J8FA 5BPLA 3O5BA 4HWIA 3CETA 5JLHA 4FWNA 1BWFO 5F0XA 4CBXA 3FLCO 3ZETA 4BR5A 4NO7A 4JHDB 5BPMA 2FF3B 4BRDA 5BRFA 1G99A 1BDGA 3WQUA 2VYPA 1RGIA 3IFRA 4A2BA 4A62A 3EKSA 4K25A 4JNEA 4IO8A 2GUPA 4L3QA 3W3DA 3WEEA 4IXCA 2YJEA 4K41A 3C0BA 4E1JA 5AQLA 1MA9B 1MDUB 3R9PA 2P9NA 1TUYA 5AQSA 5FPNA 4JD2B 1SAZA 3UKUB 4CD3A 1DKGD 4I6MA 5EX5A 5FPDA 5JLFA 2FSKA 4BRIA 4H0VB 1MWMA 2E8AA 4M63C 1XQSC 4B1YB 2QW9A 4CZEA 2E2NA 4WQ4A 4BRKA 4PL7A 2QM1A 2QXLA 3JXUA 2P9SA 1TYQA 1XUPO 5ADXH 4BRFA 2NRHA 4EAHD 5AQGA 5TKYA 5AZJA 3A5LC 5AQHA 1Z6RA 3O8MA 3CJCA 4M7XA 1NMDA 1KXPA 5AQPA 3LM2A 4WYBA 5AZIA 1E4GT 4BQLA 5JICA 4CJ7A 3EL2A 3H3NO 4H03B 3D2EB 2F9WA 3IDHA 3UKRA 1GLAG 2PAVA 3VF4A 1U6ZA 2P9UB 2P9PA 1NGHA 3GE1A 2I7PA 3L6QA 1GLBG 5F2RA 3VEYA 3EZWA 2W41A 3SMPA 1GLEG 3F9MA 4MO4A 3C7NB 1D4XA 4MLHA 4CZMA 1NGDA 3ATUA 4FWLA 5AQQA 2GTDA 2QWNA 3LM9A 1JCGA 1NGAA 1R59O 5B8HA 3LDNA 4JAXA 1QHAA 3VETA 3ZEUB 3H45C 1Y64A 2GEMA 4WQ5A 5AFUH 3QB0A 2Q31A 1ATSA 4DHYA 4BC3A 2P9KA 2D0OA 1KAZA 2CGJA 4EHTA 3ZX3A 4IZ9A 3LDOA 4FWOA 3SK3A 5LJWA 2ZF5O 2WUSA 1U2VA 4FPBA 1QZ5A 2Q97A 3D2FB 2P9IB 4QS7A 1NGCA 3H3OB 3BF3A 4FWMA 3A5MC 1Z05A 1ATRA 1BOTO 1ZXOA 4IJNA 5BN8A 2ZWHA 3DWLA 3VEZA 3FZHA 1QQOA 5FPMA 1DEJA 4IJAA 3I8BA 4ISFA 2W40A 3H1VX 2YHXA 3DAWA 1T44A 5ELZA 5AQJA 2ASPA 3CJ9A 4FPAA 2Q36A 2FXUA 4IWVA 3FR0A 3DJCA 2KHOA 5AQWA 5EXWA 3SJHA 1HKGA 2F9TA 3H46O 3LDQA 3FE1A 4CZGA 3M1FA 2CH6A 2E1ZA 2E2PA 3KZBA 3L4IA 2A40A 2EWSA 4H0PA 3CJAA 5KPRA 5KQDA 3LL3A 2D0PA 2QWMA 1CZAN 4HTLA 3H1QA 2CGLA 3WT0A 4FOIA 4PL8A 4EIAA 1T6CA 1WUAA 2IVPA 1P8ZA 2FF6A 2P9LA 4GNIA 3VESA 3HI0A 5AQIA 3ULEA 2GWKA 3JS6A 4PKHA 1ESVA 1K8KA 4CD1A 4FWPA 1GLFO 5E26A 4AM7A 3MN7A 4XH1A 3I33A 3WUHA 3IUCA 3FGUA 3FZLA 3HBTA 3FZFA 4AM6A 1C0GA 4Z94A 1BUPA 3U9DA 4H0TB 4BGBA 3J8AA 2ITMA 2QWQA 4A61A 5ADXA 2VWBA 1H1VA 4M7YA 3RSEA 3AY9A 4RTFD 4QS8A 4FOEA 3U8XA 3ZETB 5LJVA 3CQYA 1HUXA 2D1KA 2HF4A 3DXKA 4PKIA 4CI6A 4EHUA 3UB5A 4FO0A 5JMVA 2ZGZA 3P4IA 1E4FT 3ID8A 3WEEB 4PKGA 3CIPA 4LC9B 3EO3A 1BA0A 3GOIA 3HZ6A 1MWKA 5AQNA 4QS9A 2P9NB 1GLCG 4BC5A 3MCPA 4I6MB 1BO5O 1S22A 2DPNA 1NM1A 3QDKA 1Q18A 3AAQA 2A3ZA 1QQNA 2E2OA 2E88A 3D2FA 4CBUA 2P9SB 3A5NC 1TYQB 4BRPA 3MMVA 4BVOA 4H5TA 3VF6A 1NGBA 5AZJB 4BVPA 1J6ZA 3CJBA 4B1WB 2FSNA 5AR0A 5BREA 3ENOA 4YDUC 3KHYA 5AFUA 3CHWA 1X3MA 3U4LA 2IVOA 4BRGA 2Q0RA 3GL1A 3HM8A 5AZIB 3VGLA 3VEXA 4CZLA 3O4WA 1S3XA 2IVNA 3BUZB 4NB4A 1RFQA 1WOQA 3GG4A 4BRMA 4BR9A 2VCPA 4FWKA 1BG3A 5I9EB 5FPEA 1HJOA 3CJ7A 3CQXA 3UKRB 2A6AA 4H0XB 4CBWA 2P9PB 1V4SA 5AQKA 4B1XB 1ATNA 1HKBA 3MN6A 3ZX0A 4RWTA 3R8EA 3A0IX 2CH5A 3WQTA 4H5WA 3QBWA 2GELA 1DGKN 2V51B 3FZKA 4B1UB 4CZKA 4BRHA 3LDPA 3QFPA 3B8AX 3DXMB 1RDWX 3H6EA 5AQYA 2QWRA 3VGMA 3QBXA 4CZFA 3AARA 4JHDA 2QWOA 2A42A 1SZ2A 3KVGA 4BRNA 3WXIA 4CZIA 4JN4A 3QICA 5AQZA 4B9QA 1YXQA 1T6DA 2NZTA 4B1VA 1QZ6A 3ENHA 4CZHA 4BREA 4GY2B 5AQOA 1U2VB 3G25A 2J4RA 2I7NA 3A8YA 1HX1A 3D7EO 5AQRA 4JD2A 3UKUA 4BGAA 4CZJA 5BRHA 3MN5A 3QFUA 1LOTB 1IJJA 1SQKA 4O8KA 2UYTA 4BR7A 2H3GX 2D4WA 3VEVA 5KPZA 1YUWA 1NBWA 2QWPA 1HLUA 3MDQA 1X9JA 4BR0A 4FWQA 3O1BA 3VENA 5KPTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QEPA 3M6GA 1RBSA 4OPKA 3JSMA 2HBMA 3NH1A 2P9UA 4AHVA 3RR7A 4BWJA 1HJRA 1C0FA 1JCFA 1HNVA 3CFRA 5E84A 3AGKA 1V4TA 5HBMA 2IS3A 4CJTA 2WFBA 3ZT4A 2HHUA 4ISGA 1XMQK 1TGOA 1YF5L 4CEZA 4DSFA 3OVNA 4CFAA 4BROA 1WN7A 1FXXA 1GLJO 3O9SA 3J81O 3I8DA 4DS4A 1WAJA 5BR8K 1KAXA 3G71N 4CJSA 1NGFA 4CCHA 1GOBA 2CGKA 4E7HA 4JKGB 2YI1A 1KSPA 3CCLN 4IEIA 3BEXA 3IRXA 1RT6A 4GKKK 3GDQA 4NCAA 1TUUA 4DTNA 3EN9A 4JI0K 3MK6A 1I3AA 4DSIA 2Y1IA 3A5OC 5EVZA 2QWLA 1VQ7N 3HXMA 4BC4A 4CEEA 2NLXA 3BP8A 3SLCA 5C25A 4CEBA 4W5QA 2F8TA 4KHUA 3HPHA 1SV5A 1VAZA 3NE6A 2YX6A 3ATVA 4E7LA 4KBOA 1OH8A 3LALA 2YHWA 5BRDA 1XC3A 1OH5A 3VQ4A 4LY7A 5DK5A 3QLHA 2F96A 4WF9L 3RWUA 5AQTA 4KKOA 4BRQA 4C8OA 4CK3A 3HVTA 4YOYA 1EQYA 3DRRA 1WLJA 3TPQA 2E5LK 3C65A 3FZMA 3QINA 3ZSYA 2HMIA 3BDPA 4DB3A 3AAPA 4B3RK 1KAYA 2A41A 3K5NA 2FC0A 1JLFA 3OYAA 1U45A 3ITHA 1R0AA 2NNWA 3O08A 4GV9A 2FLOA 3HSCA 3C95A 3NF6A 4DCHA 1I39A 3HK2A 2JGUA 3AA2A 3U9ZA 3BY5A 1WSGA 2ZJPL 3NBPA 1NK0A 1ZBLA 4KHPK 4C23A 4A2AA 3BF1A 3WXLA 2G8KA 4MQ3A 3OHRA 3MN9A 4PWDA 4DTRA 3V1RA 3AV9A 4ILGB 4H5RA 3HT3A 4JI5K 5BPLA 1Z25A 3CETA 1VSLA 5F0XA 2ZJRL 4KTZA 3NF7A 2AJQA 4JHDB 5FROA 5BPMA 5BRFA 4DTUA 4YOUA 3WQUA 2RN2A 1O1WA 1U4BA 2UXBK 3AVBA 2VWKA 4A62A 4JNEA 2O8EB 4CHNA 1NMNA 2GUPA 2YNFA 3IKMA 3W3DA 4EP5A 3SBTA 4IXCA 4CGFA 4ILHA 4H4OA 5AQLA 3DLBA 4JV5K 3R9PA 3PSFA 1VQ6N 1LW2A 1S1TA 3CCRN 1TUYA 4I9LA 5AQSA 5FPNA 3UKUB 4CD3A 5EX5A 4BE2A 4BRIA 3VN5A 4LF8K 3THYB 1W7AA 4CJQA 2G8WA 2P9SA 1XUPO 3G4SN 3M8QA 3QNNA 5AZJA 1VRUA 1NJWA 4W5NA 1NK5A 1TKXA 4TSXA 3O9QA 4DV4K 4CHOA 3LM2A 2Y1JA 2X74A 4B3MK 4KAZA 4DV3K 3AVHA 4JKFA 3H3NO 4KI4A 2F9WA 3VF4A 1K6YA 3SPZA 2Z1GA 2OPQA 1NGHA 3VEYA 3EZWA 3L2RA 4YY3K 4E7JA 3NVMA 1RDUA 3EE8A 3F9MA 4JKAA 1RNHA 1VSEA 3C7NB 3L3UA 2BE2A 3RMDA 2P5OA 1NGDA 2Z1IA 4IEEA 2GUIA 3OYCA 3ZT0A 3LM9A 4LSNA 1EWRA 3LDNA 1HQEA 3VMFB 1QHAA 4Y1CA 2GEMA 4WQ5A 3QB0A 1VQLN 1ATSA 2WTUA 4N5SA 3ZX3A 4DKWA 3I55N 4HUEA 2DY4A 1G15A 2WUSA 4HUGA 1U2VA 4KRFA 2Q97A 3P31A 3RTVA 3AVAA 4BDPA 3BF3A 3A5MC 3MXJA 1ZXOA 5BN8A 4Z4GA 3T1HK 1DEJA 5CR4A 3K5OA 1KD1O 4ISFA 1EO1A 3H1VX 3NGYA 1EXQA 3DAWA 5ELZA 5AQJA 3V9UA 3L2QA 3CJ9A 4GVMA 1N33K 5GAHP 1SKRA 4IWVA 1J53A 3CFPA 1HR0K 4CGJA 3H46O 3LDQA 4CZGA 2HBKA 5KRSA 4FJ5A 4CK2A 2E2PA 4RW8A 1KLMA 3L4IA 3TTDA 3CJAA 1K8AO 3LL3A 2D0PA 4HTLA 4I7FA 2EX3A 3THYA 2O8CA 1RT7A 4PL8A 2BANA 1WUAA 2IVPA 2P9LA 4GNIA 2GWKA 4A5BA 1K8KA 1GLFO 4RG8A 3V81A 3WUHA 3KJVA 5E41A 1XHZA 4IFEA 3T1YK 3THXB 5HOOA 4DSEA 2X6NA 3JYTA 3ZLJA 3HVRA 4BGBA 3SQ0A 4O0IA 3C6HA 4A61A 5ADXA 1H1VA 4M7YA 1YTUA 2KZMA 2QXFA 1VRTA 4LSLA 4FOEA 1S9GA 5HRSA 4IO9L 3VQBA 4DU3A 4QOZB 2YHAA 2P1JA 4FZXC 2D1KA 4EHUA 1B9DA 5J2QA 2PFUA 1C0TA 3ZCMA 1T8EA 2HW3A 3P4IA 1E4FT 2EHGA 3ZSXA 3OW2M 3O3FA 2KW4A 3KD1E 4LC9B 4C1NK 3EO3A 1BA0A 3VTHA 2HNDA 3GOIA 4B08A 5CHIA 2ATQA 4IOCL 4QS9A 3EE9A 4I6MB 1TAQA 2WBNA 1NK6A 2DPNA 1Q8IA 3O9UA 1BQMA 2XO7A 1NG9A 2E2OA 5SZTA 3MMVA 3VF6A 4Z4IA 5FDLA 4KHQA 3HOSA 2FSNA 4ICLA 2JWKA 1X3MA 3KWIA 3LAMA 4BRGA 4DV1K 3HM8A 4CZLA 3O4WA 3TARA 1WOQA 2VCPA 1TAUA 1BG3A 3DOKA 3CQXA 2XHBA 1N32K 5LMNK 1VQ8N 4YHHK 1V4SA 3NF8A 3LP1A 2HHQA 3A0IX 5CY4A 4CGHA 4H5WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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