2FBTA

Wrn exonuclease
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
HHSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Werner syndrome helicase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 61
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbtA00
4Z0UA 2PYLA 1IKVA 4E7LA 2D0BA 4CCHA 4IG0A 1TK5A 1LWEA 2KW4A 1BQMA 5J2QA 4E0DA 2DFEA 4M45A 2PZSA 4M3UA 4CIEA 3E01A 1RBVA 2EHGA 4CGFA 4N56A 3A2FA 1KSPA 3AVGA 4F3TA 2HVIA 3RRHA 3DYAA 3V1QA 3ZSXA 1N5YA 4DU3A 4CHNA 1Q9YA 3OYKA 3OYCA 3G0ZA 4CJTA 1KFSA 3B6OA 2RF2A 4CJUA 3AVKA 1HYVA 4YFUA 4DFMA 1UA0A 5D3GA 4E7JA 2JGUA 4KFBA 4CJWA 4I7FA 1NK5A 4KHSA 4I2PA 3O3FA 4E7IA 3SQ1A 4CEBA 3OS1A 1WSGA 4CIFA 2OYQA 4DS5A 1ZBLA 5C24A 4DTOA 4F3OA 4FK4A 4FJMA 4CEZA 4ID5A 3SV3A 2Z1HA 3SQ4A 2KQ2A 1KFDA 4H8KA 3ZSYA 1RTJA 3LAMA 3CQ8A 1YTAA 2KZMA 2AJQA 3NF8A 3RMDA 1BIUA 4OLAA 1UAXA 1YVUA 5I42A 3H08A 4FJHA 4FJ9A 3MEDA 4CF0A 3FFIA 3OYDA 1Z26A 3C94A 2DY4A 1HQUA 2YHBA 3CM5A 2G8UA 4ZTJA 4N76A 3DOKA 3HSTB 5CZ1A 4FM1A 4MFBA 3PO4A 2IGIA 4OGEA 4CK2A 4KRFA 2OPRA 3OYBA 1CZ9A 1LAWA 1RDDA 4OKJA 1HMVA 2XO7A 4CE9A 3NE6A 2P5OA 2X6SA 4BDYA 3OJSA 3AO2A 2FBVA 1RBSA 4W5TA 4FLWA 1N6QA 4B9VA 4L8RB 3HM9A 3MXJA 3HVRA 3D45A 3KK1A 3KD5E 3LALA 4CEQA 1NJYA 4ELUA 3DLHA 2Q3SA 3VQPA 4M3XA 3ZT0A 4CGJA 4CGDA 4OKEA 2G8WA 2NUBA 1NKCA 1QQCA 1NK0A 3HK2A 4DLEA 4FLYA 1DTTA 3IS9A 3DLEA 3NCIA 4DTUA 2HHTA 4XIUA 2E4LA 1JL1A 1WSFA 3AVCA 3O3GA 1JLQA 3SYZA 4B9TA 3NF6A 3SCXA 5FRMA 1VRTA 1U04A 4FW1A 4CEOA 2XY6A 5CYMA 4KB1A 1D9FA 4CJSA 3L2VA 3MXIA 4ZTFA 1C0UA 1IKYA 3TAFA 3SPYA 1HNVA 3ZT2A 1NOYA 4FJKA 4LY7A 2LSNA 3LPUA 3CM6A 1VSMA 2ZQBA 4B9LA 3ZSWA 3QEWA 1ASUA 3C6UA 4CGIA 4FK0A 4DF4A 3ZSVA 2VWKA 4KTZA 3ASMA 2E6LA 1JLEA 4DFPA 1KVBA 4NYNA 1SL2A 2GV9A 1B9FA 3NGZA 4FLZA 4DTSA 1TAQA 5HRSA 3MEGA 4EP5A 1TKDA 2VG6A 4OKKA 3PX4A 1WSHA 4B9MA 4FJ8A 4M3TA 4IG3A 4KHNA 1C1CA 4DU4A 1SKSA 4CHZA 4ZHRA 3OYLA 4KV8A 4GMJB 1ZBIA 3TAEA 2GBZA 4EZ9A 1D8YA 5C25A 2B5JA 3HP9A 3K5OA 1JKHA 4OJRA 1RT7A 1RTIA 4NYFA 5KI6A 3I8DA 3AO4A 3VQEA 2Z1GA 5J2PA 3S9HA 4Z4IA 1Z25A 3ZSQA 3SUOA 4FJIA 3NH2A 2QK9A 3HO1A 1LV5A 1EX4A 3V1RA 2IS3A 1W0HA 4Z4HA 3NAEA 4JS4A 2FC0A 4F8RA 3P5JA 4E7KA 3VA0A 1I39A 1RT5A 4DS4A 3NF7A 3AV9A 1EKEA 1QHTA 4FW2A 3L2UA 1SV5A 3RMCA 4FJNA 2DFHA 2W42A 2IOCA 2VWJA 1CZBA 4AHUA 1JXBA 2HB5A 3U3GA 3KJVA 3VQAA 4MQ3A 4JRQA 3S3NA 4F2RA 4IDKA 3K2PA 1EETA 4W5QA 3SZ2A 3S3MA 3VQBA 2RN2A 4CFDA 4RW6A 1WLJA 5HBMA 4BE1A 3DLGA 3RRGA 4DQRA 5KRSA 1JL2A 3TAPA 4DSLA 4CJKA 2G8VA 3T3FA 5KGXA 2ITGA 4AHTA 4R5PA 1S1VA 2HHXA 4O5BA 3LZJA 4BACA 4FJXA 4O0JA 4CHYA 3ZSRA 3HPHA 1EP4A 4B08A 4RW4A 1SKRA 3MECA 1L3VA 2GUIA 3DI6A 4CHPA 1HPZA 3QEXA 1ZBHA 3VQ5A 3VQ8A 3K5NA 4DSFA 3V9SA 3NFAA 3M8RA 1S9GA 3PX0A 4O44A 3ALYA 5HRNA 3RR8A 4B8CA 3KLIA 4CFAA 4CFBA 1RILA 4B9UA 5KGWA 2XY5A 3TWHA 3WNGA 3K58A 4J2BA 2P51A 4E3SA 1VSIA 4IFYA 4BDZA 1U47A 4AHRA 3NH1A 2DTUA 4E19A 3JSMA 4OPKA 4DSIA 4TSXA 4C8OA 1D5AA 2X78A 3AA2A 3M8QA 5CY4A 5HP1A 4KTQA 2G8KA 3S3OA 3V81A 2KFZA 2B6AA 1UWBA 4DFKA 2XY7A 1KTQA 1VSEA 1WSEA 4KPYA 4B9SA 1KVCA 1WSIA 3B6PA 4LH5A 3VQ7A 2RKIA 1VSDA 4CJQA 1NK4A 4OGCA 1IKWA 1NJZA 1SL0A 3AA5X 5J2NA 1L5UA 2HNYA 2X6NA 1HQEA 1LWFA 2FBTA 4QAGA 2FBYA 1J54A 4FZZA 4CESA 1LWCA 2A1SA 1NJXA 3K59A 1TKXA 4CGGA 4DLGA 3OJUA 4DF8A 1RT1A 3KLHA 4ELVA 3LDSA 4EZ6A 4KHWA 1GOCA 4FJ5A 1JXEA 3G10A 3V9UA 3DLKA 4CJFA 4PUOA 3ZCMA 4DTPA 1O1WA 4H4OA 1NJWA 4GVMA 4M3ZA 3O3HA 3DOLA 2QXFA 4AH9A 3VQQA 3KK3A 1XC9A 5J1EA 3SNNA 1ITGA 1RT3A 2BANA 3MAQA 4FCYA 1HYZA 3TARA 4M3YA 4I9QA 4KHQA 3LP1A 3MEEA 2F96A 1Q8IA 1RTHA 5JS2A 1MU2A 1TKZA 3VQ4A 3VN5A 1SKWA 2Y1IA 1TK0A 3NGIA 4B9NA 1BGXT 2P5GA 4AHVA 2OPPA 4CJ5A 1TAUA 3SV4A 4KO0A 3LP2A 1YT3A 2PY5A 3O4NA 4B3OA 3QINA 4Y1DA 1J9AA 4CEAA 3NHGA 3TAQA 3AO1A 1CXUA 3DRPA 3PX6A 3KTQA 1WN7A 3AVMA 1TGOA 3IAYA 1BI4B 1L3TA 3WNFA 4CK1A 3OS0A 4FLVA 4Z4EA 1B9DA 4W5OA 4YNQA 4CECA 3CFOA 3RR7A 5HRRA 4N5SA 3SQ2A 1HYSA 2OPQA 3AA4A 3LWLA 1BQNA 4LSLA 4F4KA 3TANA 3C6TA 1IKXA 3NDKA 4BE0A 1NK6A 4AILC 3QNNA 2P1JA 4LD0A 3PY8A 3CYMA 3HL8A 3NGYA 1LW2A 1S5JA 4G1QA 4BWJA 3EY1A 4DSJA 4PWDA 3UIQA 4CFCA 1C6VA 2KTQA 4N41A 4NCGA 1NK8A 1BHLA 3KIOA 3F73A 5CYQA 1BI4A 1F21A 4CF2A 3P83D 4FYDA 4RG8A 4KB0A 3C95A 1S1XA 4BE2A 2ZE2A 4OPJA 3VQ6A 3QEPA 2XY8A 2HHWA 3KKSA 3RWUA 4J2DA 1LW0A 1TV6A 3LAKA 3L2WA 1X9WA 4ICLA 5HLFA 2HVHA 2RPIA 3F9KA 3OYJA 3AVAA 2ZD1A 3HT3A 1I3AA 4Q0BA 3M8SA 4Z4CA 4KKOA 4HUFA 1FKOA 4AHSA 4B8AB 1C1BA 1TL3A 4CF1A 4UQGA 3DM2A 3OYHA 1S1WA 3LWMA 1T7PA 5J2MA 2IDOA 1TKTA 4CJPA 2BGGA 3HJFA 2YNIA 3IRXA 3OS2A 2Y1JA 4KTWA 1L3SA 1QS4A 2FBXA 3AO3A 4CJ3A 2HNDA 1L3UA 4I2QA 4CERA 4OVLA 3SUQA 4J2EA 1A5WA 5C42A 3QERA 1HNIA 3ITHA 4DFJA 3ZT1A 1VSHA 1KLMA 1KCFA 1RTDA 2YNHA 3V4IA 1S9EA 3IG1A 4HTUA 1Y97A 4DSEA 5K14A 1DTQA 1XI1A 2G8IA 1KVAA 3K5LA 3HXMA 1UOCA 2Z1JA 4I9LA 2F8SA 1XWLA 3I0RA 4C8MA 3OYNA 3NBPA 4DU1A 2ETJA 4W5NA 1X1PA 4C8LA 3L8BA 3V1OA 4LH4A 1R0AA 1QSSA 3M8PA 4CEDA 4M3RA 4FM2A 2YV0X 1BCMA 4HUEA 3L3VA 4GW6A 3L2RA 4DQQA 4BDPA 1RT2A 1FXXA 3K57A 1T05A 3V9WA 4F2SA 3KKRA 2EX3A 4PQUA 4KAZA 5KRTA 1RDBA 4HCBA 2HHQA 4FZYA 3CFPA 4J2AA 2I5JA 3U6FA 5EU7A 1BL3A 3PUFA 3SUNA 1D9DA 1BISA 1X9MA 3KLGA 2HHVA 1BIZA 3VQCA 1QTMA 4CK3A 3DRRA 5CZ2A 1JLGA 3LZIA 3RMBA 3WNEA 3BDPA 1HRHA 2YKNA 5DK5A 1TVRA 4JRPA 4CHOA 5HRPA 4FJJA 1ZBFA 4KI6A 3KLFA 2JLEA 4KHUA 3OY9A 1IO2A 3ISNC 4FLUA 1JLBA 4H4MA 3V9XA 3SPZA 3TI0A 5JS1A 3AVBA 4C8KA 4QCLA 3VA3A 3DLBA 1G15A 1U45A 4FM0A 3OYAA 1SL1A 2YKMA 1A5VA 1ASVA 4O55A 2KZZA 4E1MA 1RCHA 3OYFA 3ZSOA 1JLFA 4FLXA 3PV8A 4DQIA 4HCCA 3TAGA 5KTQA 1VRUA 4W5RA 5DMRA 1U49A 2HHSA 4ELTA 2X74A 1VSFA 3AVIA 5FROA 1C0TA 1TL1A 3AO5A 1T8EA 4M42A 1ZYQA 2A1RA 3QEVA 4DQPA 1T03A 2D5RA 2ATQA 1ASWA 3I0SA 1RT4A 4DTRA 3RMAA 3PO5A 4PA1A 3JYTA 2XHBA 3TR8A 4CHQA 1WSJA 3CFRA 1C1AA 4QOZB 2OZMA 2D0AA 3AA3A 3SUPA 2D0CA 1ZBUA 1NK7A 4CF8A 4CGHA 4OLBA 3QEIA 1YTUA 1HJRA 3LPTA 4IBNA 3NH0A 3AVNA 3K5MA 4DTMA 3HPOA 4DTJA 2PYJA 1WNSA 1S6QA 3THVA 4NCBA 2KFNA 4M3WA 1S6PA 1A5XA 1SUQA 3L3UA 3KLEA 3DRSA 5HROA 1QSYA 3P1GA 1RBRA 4E1NA 4DSKA 4DWIA 3OVNA 1XHXA 4RW9A 4RW8A 2BE2A 4CJEA 1J5OA 4K8XA 3LANA 1DLOA 4CEFA 4HVJA 1KRPA 3VQ9A 4FK2A 4CJ4A 1S1TA 3MXMA 1UA1A 2O4IA 4CJVA 2YNGA 5FRNA 1B92A 3OYEA 1Q9XA 4IKFA 4BWMA 3QESA 4CJLA 4DTXA 1VK0A 1VSJA 2WOMA 2YHAA 3VQDA 1K6YA 4LSNA 1CXQA 1IH7A 3HP6A 2R7YA 4RW7A 3U3YA 3SI6A 3ZSZA 4DG1A 5SZTA 1FKPA 1WAJA 2VG7A 4KI4A 1IG9A 5FDLA 4Y1CA 2XRIA 1W9HA 1NK9A 2WONA 3TAMA 4Z4FA 1GOBA 1FK9A 1RT6A 3AVJA 2OZSA 1J53A 1LAVA 1NOZA 4AHCA 1VSLA 2DFFA 3OYMA 2HHUA 4ID1A 4KHYA 3ZT4A 3T19A 3V6DA 4FJGA 5SWMA 3BGRA 3EZ5A 2HNZA 2IAJA 4Q5VA 2OA8A 4DMNA 5T7BA 4IFVA 3ZT3A 3TABA 3CG7A 4C8NA 3QLHA 1U4BA 4DQSA 2OPSA 5I3UA 1QE1A 2HMIA 4K8ZA 1X9SA 4FZXC 3RTVA 4M41A 3EYZA 4O0IA 1CLQA 4EP4A 4HUGA 1EXQA 1VSKA 2G8HA 4PY5A 4Z4GA 1WAFA 3OYIA 1XHZA 2IC3A 2G8FA 3LP0A 1RDAA 4FXDA 2VG5A 3LP3A 4E7HA 2YNFA 3V9ZA 1TK8A 3O4QA 1KLNA 4E89A 3DLRA 3T1AA 4FJ7A 1JLCA 1RBTA 1RDCA 3NF9A 3KK2A 1GOAA 1RBUA 3QIPA 3SJJA 1NKEA 3OYGA 1QSLA 2BDPA 4CIGA 2HW3A 4JLHA 3KD1E 3QETA 2F8TA 3HVTA 1RNHA 2Z1IA 3AVFA 3HPGA 1REVA 3QO9A 4NCAA 2E6MA 3WNHA 3DMJA 1NKBA 3HYFA 4KREA 4CF9A 1C0MA 1U48A 4WE1A 1BCOA 2O4GA 4CEEA 2QKBA 4CJRA 4FLTA 3L2QA 3D0PA 3ULDA 3QNOA 3SQ0A 1JLAA 1S1UA 3QIOA 4O4GA 4JS5A 2B4JA 2QKKA 4FJLA 4FVMA 5E41A 4N47A 3AVHA 3AVLA 4HHTA 4DTNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D7EO 4E7LA 4CCHA 1TK5A 1BQMA 3L0QA 5J2QA 1MA9B 2FSJA 2PZSA 4CIEA 2HOEA 1U6ZA 4CGFA 4DV0K 1N34K 1KQSM 2UYTA 3A2FA 2HVIA 4DV2K 5HL7L 3OYKA 3ZETB 2RF2A 1UA0A 4DFMA 4E7JA 1VQKN 4I7FA 3CCSN 2KKZA 4I2PA 3SQ1A 4BR0A 1N36K 2YI1A 4XH4A 3VOVA 4B1VA 4CIFA 2OYQA 5ADXH 4DS5A 1ZBLA 1D4XA 3J80O 4FK4A 4CEZA 3SQ4A 3A5OC 1KFDA 1RTJA 3LAMA 3NF8A 5M1OA 3IUCA 1UAXA 4FJHA 5AR0A 5DM6L 2DY4A 2YHBA 5GIPA 4N76A 3THYB 1BDGA 2QEXN 2IGIA 2OPRA 3OYBA 1YIJN 3VEOA 4CE9A 3P38A 4BDYA 4W5TA 1GLLO 4B9VA 4JNEA 4FLWA 1N6QA 4KH6A 3HM9A 4DR5K 3KK1A 3ZLJA 3LALA 3THWB 3CJ9A 3VQPA 4M3XA 1YVNA 4DLEA 4FLYA 3DLEA 3NCIA 4XIUA 4DR1K 3O3GA 3SCXA 1GLBG 5CYMA 2UXCK 3MXIA 4ZTFA 4NO7A 4FJKA 5BN9A 2ZQBA 4B9LA 1OVYA 3C6UA 4O8KA 4YOWA 3ASMA 1Q81O 1X9JA 3PSIA 1KVBA 1H1VA 3H3OB 1YJNN 3U4LA 4B9MA 3MEGA 1TKDA 1WSHA 3DXKA 2WTUA 3OYLA 5JVGL 2E1YA 5LMNK 2GBZA 5C25A 3HP9A 3K5OA 1JKHA 4OJRA 2YCHA 1RTIA 5KI6A 4Z4IA 3AO4A 3ZSQA 4O5FA 4EHUA 3CCVN 2QK9A 1EX4A 3V1RA 1W0HA 2ITMA 4LFCK 3P5JA 4DB3A 5KPZA 4M7XA 4LC9B 1R59O 3N4QA 3AV9A 1JCEA 1SV5A 4FJNA 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 3O5B A;  5E84 A;  3O1B A;  3OVN A;  1DLO A;  2A5X A;  1GLF O;  3DJC A;  1GLJ O;  1IG8 A;  3LDP A;  2O4I A;  4CJV A;  2YNG A;  5FRN A;  1Q9X A;  4BWM A;  4DTX A;  4BY9 C;  3KWI A;  3CPE A;  5KQ8 A;  4LSN A;  1IH7 A;  1OKJ A;  3SI6 A;  3ID6 A;  5AZI A;  4DG1 A;  4KI4 A;  2VG7 A;  5FDL A;  3C6H A;  1NGF A;  1NK9 A;  3TAM A;  3AVJ A;  3T19 A;  1YAG A;  1FW6 A;  2QM1 A;  5T7B A;  3TAB A;  2A41 A;  3I56 N;  2F9W A;  4K8Z A;  3VF2 A;  5M1P A;  2KHO A;  3HBT A;  1XMQ K;  3PLA A;  4EAH D;  2IC3 A;  2ZJR L;  3LP0 A;  1RDA A;  2VG5 A;  4A62 A;  1JLC A;  2O8F B;  2FXU A;  3QFP A;  4CW7 B;  1GOA A;  1P90 A;  1NKE A;  4H0T B;  4JEP A;  3I8B A;  3KD1 E;  2YHY A;  3QET A;  2QTD A;  2Z1I A;  3HPG A;  1REV A;  1NKB A;  3HYF A;  4CF9 A;  1C0M A;  1U48 A;  1HKG A;  4CEE A;  4CJR A;  4BC2 A;  3E1Y A;  4BRA A;  4O4G A;  4LF8 K;  4FVM A;  3EKU A;  3AVH A;  4HHT A;  4DTN A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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