2FBXA

Wrn exonuclease, mg complex
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
HSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Werner syndrome helicase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 63
structure length 195
sequence length 195
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbxA00
4IG3A 3U3YA 2YKNA 4CJUA 3KTQA 2HHXA 1XC9A 4CEOA 4AHSA 5HRRA 4F2SA 4E7HA 3HXMA 3TANA 3SQ4A 3K5OA 1NKBA 1BIUA 1S6PA 4E19A 1KCFA 1UOCA 2XHBA 3P1GA 1U04A 3HP9A 4KFBA 1WN7A 4TSXA 5KGWA 2YKMA 4C8OA 3HK2A 1QSYA 5D3GA 3MAQA 5KRTA 3QETA 3FFIA 4G1QA 2OPRA 4CF0A 5HLFA 2B5JA 2G8HA 3S9HA 4OGCA 3OYFA 3NGIA 1BCOA 3QO9A 3QEIA 4FJXA 1CZ9A 2VWJA 1RBVA 2XRIA 1YVUA 2D0AA 1B9FA 4NCGA 5KRSA 2A1RA 2HVIA 2DFFA 2ITGA 2XY8A 1D9DA 3TAFA 2EX3A 3B6PA 3NH1A 1RBTA 3LP0A 2RN2A 1JLFA 4KB1A 3KD1E 4E1MA 1XHXA 3V9SA 2ZD1A 4E89A 3OYGA 3EY1A 3SI6A 4KI4A 1YT3A 3K57A 4CF9A 1DLOA 1WSEA 4ID5A 3SQ1A 4DQRA 4DSLA 1WSGA 4O55A 1D5AA 1RDBA 4CECA 2OPQA 4CGGA 2B6AA 1U4BA 2F96A 4Q5VA 1SKSA 3L2RA 3THVA 1NKCA 4CIEA 1NK5A 2VWKA 1JLQA 4QCLA 2AJQA 3MEEA 1RILA 4M41A 5E41A 3I8DA 4Z0UA 3U6FA 3ZCMA 2ETJA 1K6YA 2YNFA 1TGOA 4CFAA 4W5OA 3EYZA 1QE1A 1GOCA 3RTVA 4HUGA 3P83D 3PX6A 4BWMA 4AHVA 5I3UA 5C42A 2FBYA 1QSLA 2HNZA 3OYJA 4KHYA 1Y97A 1VSEA 4Z4GA 1WLJA 4DFPA 4FW2A 3DI6A 2G8WA 3ZSOA 2QXFA 4E7JA 1L3VA 4K8ZA 2KW4A 1HYSA 4CHPA 3OYAA 4FK4A 1NKEA 4KHWA 4KRFA 4KI6A 3OJUA 1S1TA 3SUPA 4M3XA 3ULDA 1EXQA 4BWJA 2IC3A 3G0ZA 3L2WA 3ALYA 4F8RA 3PV8A 3SUNA 2HHWA 3DLKA 3VQ4A 1SKRA 1IKXA 1C1CA 2IOCA 4RW9A 3AVMA 5J2PA 4Z4CA 3SNNA 1U47A 1NK6A 2X6SA 4O5BA 1JL2A 4N5SA 1UA0A 4KREA 2BE2A 4E7KA 1IKWA 3L3UA 4KTWA 5HP1A 1Z26A 1B92A 4M45A 3ZSXA 4CFDA 5SWMA 4CIGA 3O3GA 3M8SA 4FM0A 2FBTA 1Q9YA 1TVRA 1WAJA 4B9VA 4DTMA 4BE1A 4B8AB 4DU1A 1CXQA 4DSEA 3AVBA 5HRNA 1X1PA 1IH7A 3K5MA 2Q3SA 3AVNA 1NOYA 3QNNA 1HMVA 3NF6A 4UQGA 1B9DA 1ITGA 2ATQA 3QNOA 5FDLA 2F8SA 4QOZB 4M42A 1REVA 4JS4A 4C8LA 1NJXA 3RR8A 3S3OA 4E1NA 3SQ0A 3V4IA 4CJRA 4EZ6A 1G15A 1TV6A 2XO7A 4CHYA 3F9KA 4M3ZA 3EZ5A 5C25A 1RT5A 3OYEA 4RW6A 4HUEA 5I42A 3IS9A 2FBVA 2PY5A 4FJJA 3V9WA 1TK0A 2IGIA 5J2MA 1RT3A 1EETA 4B9UA 1HQEA 4DQSA 1SV5A 3V81A 1J53A 4CJPA 5FRNA 2YV0X 5J2NA 2HHQA 4Q0BA 4LY7A 2X74A 5HBMA 1KSPA 1VSMA 3AVAA 3VQDA 3RMDA 4FLXA 3IRXA 1NK8A 3NF7A 4AILC 1ZBHA 4RG8A 3ASMA 2HW3A 1NOZA 1RTIA 4CFBA 3LALA 2OZMA 4C8NA 4E7LA 3U3GA 1BQNA 4CHQA 3PX4A 1SUQA 4FJ7A 1RDCA 4CJVA 3L3VA 4M3YA 3QIPA 1U48A 2XY5A 1ASVA 3M8RA 5FRMA 2ZE2A 1F21A 1VSLA 4FXDA 2GBZA 4DTJA 3SJJA 4FJHA 3DM2A 4B08A 3JYTA 4DS4A 2WOMA 1L5UA 1T05A 2RPIA 4H4OA 2RKIA 5J1EA 4GVMA 2D0BA 3KJVA 4CJ4A 1X9WA 3KLGA 1TAUA 3VQEA 3AVGA 1JXBA 4Z4HA 3L2UA 2Y1IA 3HSTB 1RCHA 4B9SA 1WSFA 3VN5A 4FJIA 4FJ8A 1S9GA 3KK2A 4O4GA 1C1AA 1A5WA 2DFEA 3CYMA 3HPHA 4L8RB 4IDKA 3LAMA 3MXJA 3KK1A 2YHAA 4M3RA 4B9LA 4B9TA 5SZTA 1WAFA 4CHZA 3NCIA 4GW6A 3PX0A 2FBXA 3ZSVA 3BDPA 2DFHA 2O4GA 3QIOA 1RT1A 3OYBA 3QEVA 3TAEA 4FM2A 3OYCA 3PO4A 4K8XA 3OYIA 4CE9A 1S1VA 3E01A 5DK5A 3L2QA 1MU2A 3CM6A 1LW0A 3DOLA 4CIFA 4HCBA 3TAGA 4M3UA 5KI6A 4H8KA 4CEZA 3IG1A 3QINA 4BE0A 3AA3A 2P5OA 4B9MA 4HHTA 4LSNA 3CFPA 1TL1A 3HPGA 3VQQA 3AO5A 2R7YA 2QKBA 2E6MA 1ZBUA 4CEFA 3DLBA 4CJFA 3ZT4A 1BI4A 1C6VA 1NK4A 4YNQA 2QKKA 3O4NA 3AO4A 1WNSA 4NCBA 1S9EA 4FJGA 2Z1GA 4IKFA 4IFYA 2KFNA 1FK9A 3AVJA 4CERA 1VRUA 4CHOA 2HHTA 2G8VA 1QHTA 1ZBFA 4B8CA 3F73A 4KKOA 3SV3A 3WNEA 1T8EA 1EX4A 1RT2A 2YNHA 1VSJA 3DLRA 4CJ5A 3RMBA 1SL0A 3AVFA 4Z4IA 4PY5A 1CLQA 1JLEA 3OYHA 1J54A 1FKPA 1LV5A 1JL1A 1SL2A 1NJZA 2IAJA 3RWUA 1HNIA 2G8KA 4Z4FA 1IKVA 3A2FA 3LZJA 1A5XA 4CF1A 3ZT3A 4CJWA 4CJLA 3VQ9A 4FLWA 4DTSA 3IAYA 4PWDA 1HPZA 1HYVA 2PZSA 4H4MA 3VA0A 4DTNA 3LPUA 4ZHRA 1O1WA 3VQCA 1W0HA 3AO1A 3TAPA 1TK5A 3NE6A 2OPPA 2QK9A 5HROA 3NHGA 3QESA 5CYMA 4F3OA 4DS5A 1KRPA 3OYMA 3MXIA 4FJLA 1NK0A 3VQAA 1N6QA 3OS2A 5CYQA 3RRHA 4ELTA 1S1XA 2KFZA 4HUFA 5JS1A 4NCAA 3AA2A 3QEXA 4FZYA 4IBNA 3V6DA 4N76A 3QEWA 4FJKA 3ZT1A 4F3TA 1JLBA 4DQIA 3NGZA 3HPOA 3LWLA 1RTDA 3AVHA 1JLGA 1T03A 3VQ6A 2VG5A 4OKJA 4KHNA 3C95A 1ZBLA 4J2DA 3DMJA 2DY4A 1I3AA 3KK3A 1LAVA 4MFBA 1TKZA 4FLTA 2PYLA 3B6OA 3T1AA 1KFSA 3HJFA 4FW1A 4W5RA 3TAMA 1JKHA 2EHGA 4I2PA 4AHCA 2O4IA 2XY6A 2HHSA 1RTHA 3VQBA 2HNYA 2P1JA 5DMRA 1CXUA 1EP4A 3UIQA 4OKEA 1LAWA 1BHLA 3AO2A 4DSIA 4RW4A 3DLEA 3DRSA 3K59A 2VG6A 1KFDA 2A1SA 5HRSA 3OYLA 4OPJA 3AVIA 1RTJA 4FLUA 1L3UA 3TR8A 4DMNA 1RBSA 4M3TA 4CEQA 1CZBA 1UAXA 2HMIA 1QSSA 3V9XA 2YNGA 5HRPA 2NUBA 3KLEA 2IDOA 4KHQA 1X9SA 3CFRA 2D0CA 3WNFA 4BDYA 1S6QA 1XHZA 1QTMA 3AVLA 4GMJB 4FK0A 1WSHA 3MECA 4M3WA 4CGFA 1X9MA 2GUIA 3VA3A 1U45A 4XIUA 3OYDA 3ZSZA 2ZQBA 3D45A 3KD5E 3SUOA 4DTXA 1S1WA 3HL8A 3NH0A 1RT4A 4Y1CA 1IKYA 3OVNA 1VSHA 4FJ9A 4W5QA 5FROA 4PA1A 3ZT2A 4CJEA 2BDPA 4F4KA 4CESA 3HVRA 3C6UA 1IO2A 2F8TA 3PUFA 4HCCA 4Z4EA 2Y1JA 4DF8A 4BDZA 1VSKA 4F2RA 1R0AA 2OZSA 4I9QA 3VQ8A 4Y1DA 4C8KA 1W9HA 2FC0A 3VQ7A 4CJSA 3HP6A 4LH4A 4N47A 1TKTA 4DFKA 1VK0A 3SPZA 2RF2A 4OPKA 3OYKA 3TI0A 1HRHA 4DSFA 4QAGA 4FLVA 2WONA 3LANA 3ZSRA 1EKEA 1GOAA 3QLHA 1NJWA 1WSJA 4MQ3A 4CGJA 1HQUA 2LSNA 4AH9A 3O3FA 3LPTA 1A5VA 3CM5A 4KHSA 4FM1A 1TK8A 4B3OA 4NYNA 2JLEA 3TAQA 1QQCA 2X6NA 3MXMA 2OYQA 3HO1A 3LP1A 3SCXA 1T7PA 2DTUA 4C8MA 3AA4A 3NDKA 4OLAA 4FZXC 4DQQA 4O44A 3DLGA 3H08A 2HHUA 1WSIA 3MEDA 4JLHA 4CEEA 1LW2A 3OY9A 1NK7A 3NFAA 3LZIA 3CG7A 2X78A 3OS1A 3G10A 4I9LA 1S1UA 4FVMA 4DU3A 3QERA 1RDDA 1TL3A 2HB5A 5K14A 4KHUA 4EP4A 2OA8A 4CGHA 4CJQA 4FZZA 4KTQA 1VSIA 3P5JA 1I39A 5CY4A 1C0UA 4RW8A 3RR7A 3V9UA 4CGIA 4FYDA 4OVLA 4AHRA 3PO5A 1LWEA 2P51A 3KLHA 3TARA 1U49A 1D9FA 1JLAA 4YFUA 4CEDA 4DQPA 4FJMA 1UWBA 1FXXA 2P5GA 1C0TA 1BISA 1C0MA 5CZ1A 4CEAA 4HVJA 4KPYA 4PUOA 3AVCA 3ZSQA 3KKSA 3SUQA 4N41A 1KLNA 1LWCA 3AO3A 4N56A 1JLCA 4AHUA 1NJYA 4CK3A 4IFVA 4O0IA 1TKXA 3MEGA 3V9ZA 4JS5A 2KTQA 2KZMA 5KGXA 1RT7A 3JSMA 3BGRA 1RT6A 3ZT0A 1S5JA 4DTUA 1N5YA 1IG9A 3WNHA 5CZ2A 4DTOA 3TWHA 3I0SA 4LH5A 1DTQA 1JXEA 4DG1A 3ITHA 4CEBA 2D5RA 1FKOA 4RW7A 4CFCA 1XI1A 3KLFA 4KB0A 1DTTA 4IG0A 3T3FA 1HNVA 4E3SA 4W5TA 4E0DA 1BI4B 3NGYA 4CJTA 4LD0A 1VSFA 4CJKA 4HTUA 4LSLA 3O4QA 3V1QA 1LWFA 3K5LA 2G8IA 4I7FA 2PYJA 1ZYQA 3LP3A 3RRGA 4J2EA 3DLHA 2KZZA 4ID1A 3NBPA 3CQ8A 3OS0A 4JRQA 1L3TA 4DTRA 3KKRA 3KIOA 3OJSA 1RBUA 4CF2A 2G8FA 3L2VA 3OYNA 1SKWA 2G8UA 4DSJA 3S3MA 4OLBA 1J5OA 4BDPA 4FJNA 3DOKA 4FK2A 3CFOA 3HVTA 2VG7A 4CF8A 4DLGA 2Z1IA 3LWMA 4DFJA 3SQ2A 5T7BA 4CK2A 4FLZA 1TAQA 5EU7A 2E4LA 5J2QA 1KVBA 3S3NA 4OJRA 3M8PA 1KVAA 3K2PA 3SV4A 3SPYA 1RBRA 3V1OA 3I0RA 3HYFA 1HYZA 4E7IA 3RMAA 4DWIA 1HJRA 1BL3A 4KTZA 2YHBA 4OGEA 4FCYA 1VRTA 1YTAA 1Z25A 3C6TA 4WE1A 4CJ3A 1Q9XA 4O0JA 4BACA 3QEPA 3VQ5A 4CGDA 3K58A 3M8QA 4ZTJA 4DU4A 4DF4A 3RMCA 3TABA 4J2AA 4CK1A 2BANA 4B9NA 4R5PA 2Z1HA 2BGGA 3LP2A 1KVCA 1VSDA 3L8BA 1BQMA 3C94A 4DTPA 1UA1A 5JS2A 4EZ9A 3T19A 4ELUA 1XWLA 3D0PA 4FJ5A 3NF9A 1SL1A 1KTQA 3K5NA 1Q8IA 3DRRA 4CHNA 3HT3A 2GV9A 1KLMA 2HHVA 4NYFA 2HNDA 3AA5X 3LDSA 4KV8A 2OPSA 1ASUA 2Z1JA 3AV9A 5C24A 1ASWA 4ICLA 1BGXT 4ELVA 2KQ2A 3DRPA 3V1RA 4FLYA 3SZ2A 2JGUA 4DSKA 1YTUA 1BIZA 3KLIA 2I5JA 4KO0A 4W5NA 1GOBA 3ZSYA 1C1BA 4EP5A 3ZSWA 1TKDA 2B4JA 3LAKA 3VQPA 4AHTA 3SYZA 4ZTFA 4DFMA 1NK9A 3ISNC 4I2QA 3NF8A 3HM9A 3NH2A 3NAEA 4DLEA 2YNIA 4OKKA 5KTQA 2E6LA 3WNGA 2W42A 4JRPA 3PY8A 1ZBIA 4J2BA 3O3HA 4CCHA 2IS3A 1L3SA 3DYAA 1QS4A 2XY7A 1J9AA 1D8YA 4KAZA 4PQUA 2HVHA 3AVKA 1RNHA 1RDAA 4BE2A 1BCMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BR4A 3FLCO 3CCQN 1XC9A 3TANA 3SQ4A 1NKBA 1QQOA 1UOCA 3HP9A 3HK2A 3VEWA 3MAQA 3H3NO 2UU9K 3FFIA 1ZC6A 4CF0A 5HLFA 3O4WA 4OGCA 1CZ9A 2VWJA 1RBVA 2XRIA 4NCGA 2D0AA 5KRSA 4ISGA 1RFQA 2NRTA 2O8DA 3NH1A 2VQEK 5GADP 3SI6A 1NBWA 3ULEA 1DLOA 2PFUA 2RE2A 4ID5A 4YORA 5M1NA 2GWKA 3SQ1A 2P9KA 2A3ZA 1RDBA 3MN5A 1U4BA 3HOTA 2FXUA 2QWRA 1NKCA 4CIEA 1NK5A 2UXDK 2YHWA 2I7PA 2YNFA 1TGOA 4DV1K 3RTVA 1GOCA 4HUGA 3SMSA 3J8AA 2P9PA 1KAYA 4LF5K 1N34K 3THXA 1VSEA 5KPTA 1WB9A 1WLJA 2NRXA 2YHXA 3LDNA 4FW2A 4E7JA 4A2AA 3OJUA 4M3XA 4BG9A 4B1ZA 1EXQA 3IFRA 1OH8A 1SAZA 2IC3A 3G0ZA 3L2WA 4F8RA 3SUNA 1SKRA 1IKXA 1Q18A 2IOCA 4RW9A 1U47A 3U8XA 1IV0A 4KREA 2BE2A 5HP1A 3PSIA 4M3UA 2FBTA 4A2BA 4B9VA 1QVGM 2BTFA 1E4FT 3A5MC 4GNIA 3AVBA 1X1PA 3K5MA 4DV4K 1NOYA 4UQGA 2P9LA 2ATQA 3M3ZA 1HX1A 1U2VA 1LCUA 3RR8A 4B1VA 3D2EA 3V4IA 1G15A 1T44A 1N36K 2HF3A 4CHYA 3F9KA 4M3ZA 4WQ4A 1RT5A 3H6EA 3CCVN 4FJJA 2V7ZA 4B9UA 4HWIA 1K9MO 2YV0X 2HHQA 1KSPA 3IRXA 1NK8A 4RG8A 3ASMA 4IXCA 5AQWA 2OZMA 3TSPA 1NGAA 3U3GA 5CHIA 1SUQA 4FJ7A 2V7YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4BR4 A;  3FLC O;  3CCQ N;  1XC9 A;  3TAN A;  3SQ4 A;  1NKB A;  1QQO A;  1UOC A;  3HP9 A;  3HK2 A;  3VEW A;  3MAQ A;  3H3N O;  2UU9 K;  3FFI A;  1ZC6 A;  4CF0 A;  5HLF A;  3O4W A;  4OGC A;  1CZ9 A;  2VWJ A;  1RBV A;  2XRI A;  4NCG A;  2D0A A;  5KRS A;  4ISG A;  1RFQ A;  2NRT A;  2O8D A;  3NH1 A;  2VQE K;  5GAD P;  3SI6 A;  1NBW A;  3ULE A;  1DLO A;  2PFU A;  2RE2 A;  4ID5 A;  4YOR A;  5M1N A;  2GWK A;  3SQ1 A;  2P9K A;  2A3Z A;  1RDB A;  3MN5 A;  1U4B A;  3HOT A;  2FXU A;  2QWR A;  1NKC A;  4CIE A;  1NK5 A;  2UXD K;  2YHW A;  2I7P A;  2YNF A;  1TGO A;  4DV1 K;  3RTV A;  1GOC A;  4HUG A;  3SMS A;  3J8A A;  2P9P A;  1KAY A;  4LF5 K;  1N34 K;  3THX A;  1VSE A;  5KPT A;  1WB9 A;  1WLJ A;  2NRX A;  2YHX A;  3LDN A;  4FW2 A;  4E7J A;  4A2A A;  3OJU A;  4M3X A;  4BG9 A;  4B1Z A;  1EXQ A;  3IFR A;  1OH8 A;  1SAZ A;  2IC3 A;  3G0Z A;  3L2W A;  4F8R A;  3SUN A;  1SKR A;  1IKX A;  1Q18 A;  2IOC A;  4RW9 A;  1U47 A;  3U8X A;  1IV0 A;  4KRE A;  2BE2 A;  5HP1 A;  3PSI A;  4M3U A;  2FBT A;  4A2B A;  4B9V A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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