2FBXA

Wrn exonuclease, mg complex
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
HSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Werner syndrome helicase
total genus 63
structure length 195
sequence length 195
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbxA00
2G8FA 4K8XA 4FZZA 1WLJA 1A5WA 4FK0A 3HL8A 3TAMA 4XIUA 3M8SA 3O4NA 3MAQA 3TAGA 1UA1A 3VQ6A 3KJVA 3L2UA 3QNOA 3V6DA 1SKSA 1IKXA 4CEZA 4CK3A 3SV3A 2Y1IA 2PYLA 4FM0A 1T05A 4DMNA 2G8WA 4HCBA 1TAQA 2HNZA 1RDDA 1HQUA 1QQCA 2HNYA 3H08A 3ZSOA 4ELVA 1W9HA 2YV0X 2IOCA 2D0BA 5CZ2A 1S6QA 1RDBA 1SL1A 3OS1A 3HP9A 3KLHA 3TAFA 1KRPA 3OYBA 3EYZA 2OZSA 3SUNA 1C1CA 3DLHA 3THVA 1T8EA 1FK9A 1GOCA 4I2PA 4JLHA 4CF2A 3CFPA 2DFFA 3PY8A 1BCOA 2NUBA 4B9MA 1TL3A 4B9VA 4FLWA 3ISNC 1BCMA 3AVLA 3QERA 1U04A 2QKKA 4E3SA 4E19A 2Q3SA 4OPKA 2OPPA 4CECA 4CEQA 2KZMA 4M45A 1HYZA 1HNIA 4Q5VA 1NKEA 1KLNA 4FJGA 4BDYA 5FRNA 1WN7A 2OA8A 4QCLA 1IKVA 4J2AA 3PX0A 3WNEA 3AA4A 1EETA 2GBZA 3AVKA 3AVCA 3LPTA 1B9DA 3ZSVA 2RKIA 3AA3A 3VQ5A 3SUOA 3CM5A 4PQUA 5HBMA 3TABA 1QE1A 1JL2A 4OKEA 3ZT4A 1Q9YA 3RMBA 2X74A 3QLHA 4DSJA 4BE0A 4E1MA 4BDPA 3P83D 1WSFA 3LWMA 4KHWA 4M3UA 4OGEA 3ZT3A 1NKCA 3ZSZA 2HHTA 5CYMA 1KTQA 3V4IA 3AA5X 3VQ8A 4IG3A 3K5OA 4MQ3A 1S1VA 4KB0A 1FKPA 4KI6A 4DQIA 3ITHA 3SZ2A 3QEIA 4QAGA 4CIGA 1B92A 1EX4A 3LP3A 1D9DA 3DLEA 2B5JA 4RG8A 1SKWA 4Z4CA 4LH4A 3QEVA 4E7LA 4RW6A 3KKRA 4E89A 3OJUA 1WAJA 3V9ZA 3K58A 1J5OA 2HHSA 1JLEA 3AO3A 4DU3A 3PX6A 2KQ2A 4FVMA 5E41A 3O3FA 4NCAA 3DLBA 4CF1A 2X6SA 1JXBA 2EHGA 3L2QA 1YT3A 3L2RA 1SL2A 2EX3A 1ASVA 4E7IA 3DOLA 1K6YA 5FRMA 3OJSA 4Q0BA 1NK7A 3LALA 4Z0UA 3NGYA 4CJKA 3B6OA 1RT5A 4M3WA 4GMJB 1WSGA 2YNFA 1FKOA 4B8AB 1BIZA 1Z26A 2VWJA 3OYEA 3SQ4A 1NK4A 1NK8A 4CJFA 1UAXA 4W5TA 4HHTA 1KFSA 4PWDA 1ZBHA 3AO4A 3PO4A 1D9FA 3WNFA 4DSLA 2KFNA 4B08A 4CJRA 2Y1JA 1RT1A 4N47A 3RMCA 1LWCA 3HPOA 3NH1A 1KSPA 4KFBA 2BE2A 1GOBA 4FJNA 1RBRA 4M3YA 1RT6A 4LY7A 2IDOA 4CF9A 3NGIA 1RCHA 2IAJA 4CEBA 4AHRA 2ZD1A 3RTVA 4FJMA 5DK5A 3D0PA 4KHUA 3OYHA 4AH9A 3K5MA 4WE1A 4O0JA 4CJTA 3LANA 3F73A 3AVJA 4ID5A 4NYFA 2XHBA 5D3GA 4J2EA 2GV9A 1DLOA 2Z1GA 3CQ8A 3KD1E 1TV6A 3U6FA 1QSLA 2HHWA 1BI4A 4H8KA 4H4OA 5HRPA 3CFRA 3CYMA 5KGWA 1QTMA 3BDPA 4ELTA 1Q8IA 4F2RA 1KVAA 1VSLA 4YFUA 4CHYA 4BDZA 4KRFA 3V1OA 1U49A 3EZ5A 1XI1A 2E6LA 1J53A 3RR8A 4F2SA 3VA0A 2P5OA 3KD5E 2VG7A 4RW9A 3CM6A 3DLRA 4C8NA 4DFMA 1LW2A 1SUQA 4E0DA 3RMAA 3SQ0A 2E6MA 1VSDA 4CJ5A 4CK2A 4CIEA 4KTWA 3MXIA 1L3TA 4KAZA 1C0UA 3QNNA 2D0CA 4IFYA 3DM2A 1KFDA 3QO9A 2B6AA 4EP5A 4CGGA 4CEAA 4PUOA 3TR8A 4B9TA 4CEOA 4AHTA 3E01A 1WSHA 4AHCA 3OS0A 4KPYA 3V9XA 4TSXA 3QEWA 2IS3A 1MU2A 1JLCA 2RN2A 3B6PA 3VQBA 4Z4HA 1ASWA 4FJIA 4C8LA 4FK2A 2JLEA 4F3OA 4O4GA 3SJJA 1WSEA 1RTIA 1VSHA 2FBXA 1XHXA 3DOKA 2YKMA 1TVRA 4CGFA 1HJRA 4LH5A 5I42A 3AVGA 1IKWA 1GOAA 3M8PA 1RTJA 4RW4A 4CK1A 4HVJA 4CHZA 4CHNA 2XO7A 3OYNA 3ULDA 1QSYA 1F21A 1KVCA 3ASMA 1JLAA 4KTZA 4CGDA 3O3GA 4B9NA 4I9LA 2P5GA 1RDAA 4E1NA 4DSKA 1HPZA 3HSTB 4KHQA 2DTUA 3NBPA 3SI6A 4G1QA 2I5JA 4FM1A 1LWFA 4IG0A 1ITGA 3WNHA 5CY4A 3K57A 5C42A 4J2DA 2XY6A 5HRSA 3L3VA 3LZJA 2B4JA 4ZTJA 4FJ5A 4N41A 2X6NA 3L8BA 4IFVA 5KRTA 3TANA 1NK6A 4FXDA 3OYJA 4AHVA 4BE1A 4DU1A 1X9MA 1VRUA 4FK4A 3OYAA 1BI4B 1YTUA 3FFIA 3KIOA 1B9FA 3NF8A 4DSFA 2P51A 3QEXA 3AA2A 4K8ZA 1JLQA 3LP2A 3RWUA 1XHZA 4OGCA 2XY7A 4JS5A 3C6TA 4FJKA 4W5RA 3DI6A 3T3FA 3NE6A 1TKDA 2F96A 3C95A 3ZT1A 3S3OA 4M3XA 1IKYA 1X9WA 2LSNA 3OYDA 3KK2A 4CEFA 5KI6A 4GW6A 4DTXA 3HP6A 4DTMA 3KKSA 4FCYA 4HUFA 5HROA 4OKJA 5HLFA 4M3ZA 2DY4A 3IRXA 4I7FA 3MECA 5K14A 1TAUA 2OPQA 4I2QA 4DU4A 1LV5A 1RTDA 4CJQA 2IC3A 3LZIA 1RNHA 3G10A 1VK0A 4O5BA 4OPJA 4FJ8A 2F8SA 2HMIA 2E4LA 5J2QA 4FZXC 4DTJA 4I9QA 4N76A 3PV8A 3S3MA 3AVNA 3ZSWA 1S1WA 4RW7A 1N5YA 3EY1A 3V81A 4DFKA 2BGGA 3TAEA 1WSJA 1QHTA 4DTUA 2HHVA 1U4BA 1EXQA 1NJYA 4CJSA 4NYNA 3JYTA 3K5NA 3TWHA 4CE9A 2O4IA 4DSEA 1BHLA 1RDCA 3SPYA 3D45A 3OYCA 3S3NA 2O4GA 1JKHA 3V9SA 2KZZA 3P5JA 4C8MA 4CEDA 1NJZA 1JLFA 3AO1A 3VQDA 3K2PA 4CGJA 1SV5A 1HRHA 4CFDA 3ZCMA 3I8DA 2W42A 4C8KA 2XY8A 4FW1A 4CCHA 4FM2A 4F4KA 1HQEA 1RT2A 3NFAA 5SZTA 4M3RA 1LWEA 1QS4A 1TKXA 3AVAA 4RW8A 3VQAA 1BIUA 2YHBA 4FLVA 4DTRA 1S9GA 4FJLA 3HM9A 1J9AA 4AHSA 1VSIA 1TK8A 1ASUA 1JLBA 3HVRA 3ZT2A 3LP1A 1A5VA 5J1EA 3RMDA 4AILC 1NK9A 2HHQA 2HHUA 3U3GA 4CFCA 3HJFA 1KVBA 1A5XA 2DFEA 2HB5A 4DTSA 1NKBA 3IAYA 4LSNA 4DTNA 3SUPA 4OKKA 4R5PA 1VSEA 1CXUA 4KREA 4CJLA 3HK2A 1TL1A 2WOMA 1ZBIA 4CGIA 4JRPA 1UWBA 4FJJA 1I3AA 3SUQA 4FYDA 4FW2A 2HVHA 5KTQA 4W5QA 4B9SA 3TI0A 4Z4IA 1XC9A 1ZBFA 3VQQA 3HVTA 3CFOA 3HT3A 4FZYA 4L8RB 1C0TA 1L3SA 4KI4A 4CJWA 5HRRA 4OLAA 2YNIA 4CJ4A 3LAKA 1L3UA 2FBYA 3ZSRA 1TK0A 1RT7A 1VSKA 3L3UA 4KHYA 4E7JA 3OYMA 3KTQA 3ZSQA 5FROA 3ZT0A 1S6PA 3QIPA 3C94A 4OJRA 1TK5A 1TGOA 4DWIA 2P1JA 3O4QA 1NJXA 3OS2A 4BE2A 1ZYQA 1U48A 4M41A 1KLMA 4DLGA 1UOCA 3HYFA 2XRIA 3OYIA 1U45A 3LWLA 3SQ2A 4KTQA 2YNGA 1WNSA 1RT4A 1BL3A 1S9EA 5T7BA 4QOZB 4HUGA 5KGXA 3M8RA 1Q9XA 4CFAA 3DLKA 2ZE2A 4HCCA 4DS5A 4IKFA 4Z4FA 4B8CA 1YTAA 3DRSA 1TKZA 5KRSA 3HPHA 4ICLA 3DRPA 3ZSXA 3O3HA 5J2PA 3SV4A 1NK0A 1S5JA 2X78A 3AO2A 4LD0A 4FJXA 2OYQA 1TKTA 1CLQA 4IBNA 3DYAA 1NOZA 2OPRA 1VSMA 3MXMA 4CERA 1RT3A 3M8QA 2WONA 3NHGA 1CZBA 3UIQA 1W0HA 3NAEA 4CJVA 3QEPA 3TAPA 5HP1A 2RPIA 4W5NA 1NJWA 3SNNA 4BACA 2OZMA 4LSLA 1LW0A 4DQRA 3CG7A 4C8OA 1Y97A 3V1QA 4J2BA 1JXEA 1RBSA 4GVMA 2Z1HA 4CJ3A 3KK3A 3VA3A 3SYZA 2IGIA 3NF6A 2F8TA 5CYQA 2KW4A 2G8IA 3K5LA 1BGXT 3JSMA 5CZ1A 2PZSA 4O44A 3MEGA 2OPSA 1LAVA 4PA1A 4CGHA 4DTOA 1L5UA 4O55A 3AVBA 3IG1A 4KO0A 3QIOA 3OYFA 4Y1CA 4CEEA 3NDKA 4FLTA 4DQPA 4B9LA 3OYKA 4EZ6A 1RBUA 2YNHA 3VN5A 4W5OA 3HXMA 2FC0A 4ELUA 4KHNA 1IO2A 2DFHA 3AV9A 1U47A 2KFZA 2Z1JA 3VQPA 3OY9A 2G8UA 5DMRA 4DLEA 3L2VA 3NCIA 2AJQA 1X1PA 4ZHRA 1VSJA 2VWKA 3AVIA 3I0SA 5J2MA 2HVIA 2QXFA 2HW3A 4DFPA 4KB1A 4BWMA 4FLYA 1Z25A 1ZBUA 3RRHA 4CJEA 4N56A 3VQ7A 3KLGA 2BDPA 1DTQA 3P1GA 1HYSA 5JS2A 4F8RA 3VQ4A 5JS1A 3VQEA 2D5RA 3K59A 1ZBLA 4CESA 4HUEA 2YHAA 4ZTFA 3LP0A 3T1AA 1G15A 4CF8A 3DLGA 4CFBA 4DS4A 2G8VA 1JL1A 2RF2A 4CHPA 1O1WA 1S1TA 1S1XA 3WNGA 3S9HA 1D8YA 3F9KA 4DG1A 3LPUA 3SQ1A 3HO1A 4OVLA 1S1UA 2R7YA 3T19A 4MFBA 3G0ZA 4NCBA 1RBTA 3I0RA 4M3TA 1D5AA 1RTHA 1DTTA 4IDKA 1C6VA 5HRNA 2FBTA 2VG6A 2YKNA 4H4MA 3QETA 1EKEA 3VQCA 4JS4A 4KHSA 4Z4GA 4DF8A 1KCFA 1QSSA 3ZSYA 4OLBA 3A2FA 3NH2A 3PX4A 1RILA 2XY5A 1BQNA 3MEDA 4B9UA 3TARA 4CHOA 1C1BA 4N5SA 3AVHA 5EU7A 4JRQA 3HPGA 3VQ9A 2GUIA 2D0AA 4BWJA 1REVA 3QINA 1IH7A 4O0IA 3L2WA 4FLXA 2PY5A 3TAQA 1BISA 3U3YA 1IG9A 1VRTA 2Z1IA 3MXJA 3C6UA 4DSIA 3PUFA 5SWMA 2BANA 5C25A 2G8KA 3V1RA 3NGZA 4FJHA 4M42A 1WSIA 4CJUA 4DFJA 4PY5A 4DQQA 1FXXA 3NH0A 2PYJA 1CZ9A 5FDLA 1JLGA 1LAWA 4DTPA 2ITGA 5I3UA 4CJPA 4YNQA 3ALYA 4FJ9A 4B3OA 4CHQA 1CXQA 2ZQBA 1BQMA 1I39A 4CIFA 5C24A 1T03A 1C1AA 2HHXA 4Z4EA 3OYLA 1UA0A 1XWLA 4E7HA 3IS9A 4NCGA 1NOYA 3AO5A 4EZ9A 3OYGA 3NF7A 4EP4A 5J2NA 3LAMA 4HTUA 1NK5A 2ATQA 3KLEA 3SPZA 3RR7A 4KKOA 4KV8A 3AVMA 3V9WA 1N6QA 3QESA 4F3TA 1HMVA 3V9UA 1C0MA 3BGRA 3LDSA 1YVUA 4E7KA 3MEEA 1SL0A 3DRRA 4DQSA 2FBVA 1SKRA 3AVFA 1HYVA 2JGUA 4Y1DA 3KK1A 4FLZA 1VSFA 2HNDA 2A1SA 2G8HA 3RRGA 1J54A 3KLIA 2QK9A 4CF0A 4FLUA 4DF4A 1EP4A 1HNVA 3SCXA 4FJ7A 3NF9A 2ETJA 1T7PA 1X9SA 1WAFA 2A1RA 2QKBA 3OVNA 4ID1A 2KTQA 4UQGA 1RBVA 4AHUA 3DMJA 1R0AA 1L3VA 3KLFA 2VG5A 3PO5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5GIOA 5M1PA 3LL3A 4FZZA 3FZLA 4B1VA 2P9PA 3TAMA 4C1NK 3M8SA 3O4NA 3P39A 4DV5K 1HNWK 1UA1A 3VQ6A 4X66K 3V6DA 2Y1IA 2DTUA 1T05A 1RDDA 3J81O 3H08A 1W9HA 2IOCA 1S6QA 4B1ZA 4CZHA 2QM1A 3HP9A 1KRPA 3EYZA 3BF1A 5KPTA 3THVA 5DM7L 4DR6K 4B9MA 3M1FA 1TL3A 3H1VX 1U04A 5FPEA 2QA4N 2OPPA 5AZIB 3ZETB 4CECA 4CEQA 4M45A 3MCAB 3WUHA 1KLNA 4FJGA 2OA8A 4BREA 3WNEA 3NVMA 1B9DA 4H0OA 2UXBK 4RTFD 3O4WA 1T3VA 2W40A 3ZT4A 4GNIA 1CZAN 4YHHK 3CC7N 4BDPA 4KHWA 3LWMA 3A0IX 4M3UA 3ZT3A 1NKCA 3V4IA 5C2DA 4KB0A 3QEIA 4CIGA 2ASOA 3LP3A 1D9DA 3AY9A 4RG8A 5AJ3K 4NLCA 1SS6A 2QW9A 2I7PA 1J5OA 3K58A 1HX1A 1JLEA 3AO3A 3PX6A 4B1YB 2KQ2A 4FVMA 5E41A 5TKYA 1SL2A 3OJSA 4CZKA 3MX5A 4CJKA 3B6OA 4GMJB 3IUCA 4GKKK 1BIZA 1Z26A 1NK8A 3OYEA 1NGCA 4HHTA 4W5TA 3PO4A 4GV6A 4CJRA 3RMCA 3HPOA 2RHKA 3FGUA 4AHRA 5DK5A 4WE1A 4O0JA 2O8EA 3LANA 1Q86O 4ID5A 2XHBA 3VTHA 4J2EA 4AF1A 3KD1E 1TV6A 3QB0A 5AQHA 4YOWA 5HRPA 3CFRA 1QTMA 4FOEA 1Q8IA 1NGGA 4F2RA 3MN9A 4KRFA 1XI1A 2D4WA 2E6LA 3RR8A 4JI8K 3VA0A 3CQXA 3KD5E 2VG7A 1FW6A 2YHXA 5AR0A 4DFMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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