2FBYA

Wrn exonuclease, eu complex
Total Genus 66
204060801001201401601800102030405060
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
HHSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
2040608010012014016018015010050
0102030405060Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS2 (78-84)S1 (52-56)3H2 (114-116)AH1 (59-72)AH5 (177-185)TII1 (74-77)TI'1 (90-93)TIV1 (89-92)S3 (99-105)TVIII1 (117-120)TI1 (105-108)S4 (108-112)O1 (112-114)TI2 (130-133)TIV2 (137-140)AH4 (161-169)3H1 (39-41)S5 (134-137)AH6 (193-197)S6 (158-160)AH2 (122-129)AH3 (140-151)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Werner syndrome helicase
total genus 66
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbyA00
1TL3A 3AO1A 2FBTA 4IBNA 4DFPA 1JL2A 3DOLA 3HVRA 1UOCA 4FYDA 3O3GA 1KFSA 1EETA 1I39A 4O55A 3I8DA 4DU3A 5J2MA 1VSFA 3KLFA 4FLVA 4E7IA 2HHQA 4OKJA 3VA0A 3DLEA 1BIUA 1HMVA 2KW4A 1KSPA 4EZ6A 4C8LA 4F3OA 3QIPA 4CF8A 3AV9A 2RF2A 1RTIA 3M8QA 3DRRA 4CIFA 3SUOA 3LAMA 2ATQA 1NOZA 2YNIA 5J2NA 4IG3A 5FROA 5CYQA 4FZZA 4F3TA 4FM0A 3O3FA 4FLWA 3V9XA 4DS5A 4CJ4A 4CK2A 4B9TA 2YNGA 3NAEA 1RT3A 2Z1GA 1MU2A 1RDBA 4R5PA 5EU7A 3RRHA 2QK9A 2X6SA 3SV3A 1N5YA 4FJNA 4FW2A 4HUGA 4M3TA 3V9SA 4B3OA 1KLMA 3TR8A 5KRSA 4C8KA 4J2AA 1R0AA 2IGIA 2FBXA 3OYGA 4KTWA 3U3GA 3L2RA 3EYZA 4H4MA 1LWFA 2FC0A 4DG1A 4M3YA 1CLQA 4FJ5A 4B9SA 5I42A 1ZBUA 3T19A 3NHGA 2P1JA 5JS1A 4FM1A 3SPZA 4CJWA 4FJ8A 4KI6A 1TKZA 2W42A 3VQ6A 3ZSRA 2HHTA 1IH7A 2G8IA 2ITGA 3AO2A 3KKRA 4CFBA 1L3SA 3AVAA 2HNYA 4PUOA 4O5BA 2DTUA 1JKHA 2KZMA 4Q5VA 3V9WA 4CEDA 1JLCA 3VQ4A 4OPJA 3NH2A 4AHVA 4DLEA 3OYLA 1T8EA 4Y1DA 2ZE2A 3CFRA 3V6DA 4Z4FA 3WNEA 2Z1JA 4CJ5A 2YKMA 2Y1IA 3KKSA 3HJFA 1RT1A 3AO5A 3KK2A 1S1VA 2QKKA 1U4BA 2Z1HA 1TVRA 3QLHA 2IDOA 4OLAA 3RR7A 4DU4A 2AJQA 4CFCA 4ELTA 4CEZA 4E7JA 3NE6A 4BWJA 4CFDA 1GOBA 3TARA 1HNVA 1REVA 4CIEA 3KK3A 3SPYA 4Q0BA 1B9DA 3AVMA 4M3RA 1RBUA 5E41A 3U3YA 3NFAA 2NUBA 5CYMA 3DM2A 1YT3A 4CJFA 4HUEA 4ID1A 1JXEA 3IRXA 3PO5A 3BGRA 3HXMA 5DK5A 3ZT2A 3NGZA 2BANA 3OJUA 3LZJA 4DSIA 3KD5E 5FRNA 1KLNA 4FZYA 1HYSA 1SL2A 4PY5A 1ZBLA 5FRMA 4CEEA 4CEQA 1ZYQA 2IC3A 3SI6A 2HHXA 4FK4A 3VQ9A 1LW0A 2RN2A 1SUQA 3O4QA 3OS1A 4CJKA 2JGUA 3FFIA 1A5XA 4CJUA 3HP6A 4DQSA 3QEWA 4IG0A 2OA8A 1VK0A 4O0JA 4LSLA 1J9AA 4AH9A 3HP9A 4AHUA 3AVLA 1XI1A 3V1QA 3VQPA 1YVUA 3OS0A 2A1RA 3ZSOA 4CK3A 4JS5A 3SQ4A 5HLFA 4FJLA 2P51A 1JLAA 1FKOA 4E3SA 1WSFA 1U47A 1QSSA 1RDDA 3HPGA 3DLBA 3K57A 4DFMA 4CJRA 5HP1A 4B9NA 1C0UA 4IFVA 1UA0A 3AA3A 2DY4A 3C6UA 1JL1A 4I9LA 2X6NA 4RG8A 3PY8A 1LAWA 3VQQA 4BE0A 3QEVA 2OPPA 3HL8A 5KTQA 1VSKA 4DMNA 3OYIA 3QEPA 1D9DA 2F8SA 1RBVA 3VQEA 2KFNA 4L8RB 4OGEA 1BI4B 3ASMA 4B9VA 4J2EA 4Z4GA 3OS2A 3TAQA 4ZTFA 2HB5A 3VQAA 1JLQA 4FZXC 1FK9A 1TKTA 4DSJA 4FK2A 1S1TA 3AA2A 3KD1E 3HM9A 3CFOA 4B08A 1SKWA 4FW1A 1HYVA 3L2WA 3ZSXA 3MEDA 2DFHA 3VQDA 4W5QA 2VG7A 3ZT1A 1X1PA 3TWHA 1NK8A 4E1MA 1UAXA 3OY9A 3CQ8A 5I3UA 3MXMA 1D9FA 1CZBA 4OGCA 4KHWA 4QCLA 2HVIA 3KK1A 3NH1A 4K8XA 1TKXA 4AILC 3S9HA 4CGHA 4FLXA 3V9UA 4FLUA 5KI6A 4DWIA 3QO9A 2OZSA 4CGDA 1QHTA 3A2FA 4E89A 1QE1A 4CHOA 3PX0A 2VG6A 2EHGA 3OYNA 3RTVA 4O0IA 3V1OA 4FJKA 4DQRA 1NK9A 4BDYA 4FJIA 4CJTA 1QQCA 4O44A 4Z0UA 4DSFA 5J1EA 2D5RA 4DTMA 1NJYA 3L3VA 4DLGA 4EZ9A 1JLFA 3HT3A 2KZZA 1D8YA 4K8ZA 1RCHA 1YTAA 3PUFA 4F2RA 2XRIA 4H8KA 3NGYA 4DTNA 3RMAA 1IG9A 3LWLA 4E0DA 4FJGA 3LP3A 1DTQA 1HNIA 4GMJB 2XY8A 2OPRA 3OYFA 1WSEA 4OJRA 2Q3SA 3M8PA 3SQ0A 4FXDA 4DQPA 3DLRA 4RW9A 4B9LA 2E4LA 5FDLA 3VQ5A 3RMCA 1SV5A 4LD0A 2XO7A 3PX6A 3THVA 1L3UA 1KTQA 4DF8A 2YNFA 1BISA 4ID5A 4AHTA 3AVFA 1NK4A 2VWJA 4MQ3A 5D3GA 4LH4A 1BHLA 1ASWA 2GV9A 5JS2A 1L5UA 4DQIA 3KLHA 1WSJA 1JLBA 3KLGA 4C8OA 2HHUA 4CFAA 1K6YA 1T05A 2YKNA 1Y97A 4DU1A 5T7BA 4KO0A 1CXQA 4KHQA 3P83D 1ZBHA 3CG7A 4DFJA 3DYAA 3EY1A 3TABA 3MEEA 5C25A 1Q9XA 4EP5A 3SCXA 4CEOA 3S3MA 2G8HA 2HMIA 4H4OA 4KTZA 4CGIA 4KHYA 4OPKA 4Y1CA 1X9MA 1ITGA 2HHSA 3CYMA 3WNHA 3U6FA 4F4KA 1TK5A 1U45A 2OYQA 4W5OA 2X78A 5J2QA 2ZQBA 4KTQA 2D0AA 4E7HA 4AHSA 3V9ZA 1J54A 3C94A 3AVBA 4ZTJA 4CCHA 4FJ7A 1EX4A 1TAUA 3KIOA 2ETJA 4HCBA 1GOAA 2G8WA 4BDPA 4DSLA 3OYCA 1SL0A 2VG5A 1BCMA 2FBVA 2A1SA 3AVCA 4CF1A 4Z4HA 3MAQA 4ELUA 1B92A 3PX4A 1VSHA 4QOZB 4QAGA 3F9KA 3OVNA 4W5RA 2PY5A 1NJWA 4CJLA 1RT4A 4RW4A 2VWKA 2JLEA 3DLKA 4HVJA 1BCOA 1JLGA 2YV0X 3P5JA 1S9GA 1WAFA 4E7KA 2BE2A 4CECA 1Z25A 3K5MA 2PYLA 4IFYA 3OYEA 1HYZA 3LP0A 1DLOA 3IG1A 2GUIA 5CZ1A 1KVBA 3V4IA 4CESA 2HVHA 5SZTA 2HNZA 3K5LA 4J2BA 3G10A 3I0SA 3NH0A 3LPUA 1QTMA 3MXIA 1LWCA 3QNNA 4FJMA 1BQMA 3RMBA 4CGJA 2OPQA 1S6QA 4B9MA 3K5OA 2KFZA 2DFEA 2GBZA 2HHWA 2E6MA 3LALA 3WNGA 1IKVA 3CM5A 1SL1A 1L3VA 4E1NA 3VQCA 5CY4A 3LDSA 4KB0A 3AO4A 1NKCA 1TGOA 1RT6A 1LV5A 1JXBA 4CHNA 3KTQA 2LSNA 4LSNA 1JLEA 1NKBA 3UIQA 1O1WA 1EP4A 3H08A 5HRSA 1IKXA 3LZIA 5HROA 1RTHA 1RTDA 4Z4EA 1A5WA 4N5SA 3TAFA 4FVMA 2EX3A 4CF2A 4FJXA 3NF8A 4DQQA 3F73A 1GOCA 3JYTA 3NDKA 3LANA 4CJSA 4M3XA 4FLYA 1QS4A 3B6OA 3KLIA 2XY7A 5HRNA 4Z4CA 4OLBA 3DMJA 1C1CA 5HRPA 1BL3A 3LPTA 1HQEA 1LWEA 3T3FA 5DMRA 2FBYA 3HPOA 3ZT0A 3E01A 1Z26A 3AA4A 4J2DA 4N41A 4CF9A 3LWMA 4DTOA 3P1GA 4ICLA 1RILA 1IO2A 2G8UA 1W9HA 4KHUA 3O3HA 4JRPA 4BE2A 4C8MA 4HCCA 3RRGA 1U04A 1I3AA 3NF6A 3NBPA 4CJ3A 2XHBA 4CIGA 2OPSA 4E19A 3ALYA 4FLTA 2PZSA 1RBRA 2I5JA 4BDZA 1XHXA 5C42A 4UQGA 4HUFA 1DTTA 3NF7A 2HW3A 1LAVA 3T1AA 4YNQA 3SNNA 4DSKA 4IKFA 5C24A 4DFKA 3LP1A 1RDCA 5HRRA 1U49A 2YHAA 3ZSYA 3QESA 4KRFA 1HJRA 1VSJA 1RDAA 3DRSA 3NCIA 3ZSZA 1ZBIA 3AVJA 2IOCA 1KRPA 4N47A 3ZSVA 4O4GA 3SUPA 3ZT4A 4CE9A 4DTPA 1UA1A 4NCAA 3ZSWA 3DI6A 2IAJA 3QEIA 2D0CA 3SQ2A 1QSYA 4CHYA 1EKEA 2IS3A 3VQ8A 5KRTA 4JS4A 1KCFA 1RT7A 4IDKA 4DSEA 1NK7A 2P5OA 4KPYA 5KGWA 1FKPA 4DTJA 1NK0A 1N6QA 1BI4A 4FK0A 2O4GA 1BQNA 1SKSA 4KHNA 2Z1IA 3AVIA 4M42A 3QETA 4CJQA 1ASVA 3NGIA 4I2PA 3SQ1A 3OYJA 3M8RA 4HHTA 4FM2A 3IAYA 1T03A 4OVLA 1X9SA 2RKIA 3KLEA 1BIZA 3TI0A 3SZ2A 4OKKA 1F21A 2G8VA 3PO4A 2XY5A 1IKYA 4PWDA 2YNHA 3HVTA 2KTQA 1VSDA 3B6PA 2RPIA 3O4NA 3L8BA 4W5NA 3SYZA 3RR8A 4KAZA 3VN5A 3C6TA 3VA3A 4RW7A 1VRUA 3L2QA 1YTUA 1W0HA 4TSXA 5KGXA 3SV4A 3OJSA 1WNSA 1LW2A 4I7FA 3LP2A 3OYAA 4FJHA 4M41A 4YFUA 4CHZA 3C95A 3DOKA 1NKEA 3DLHA 4G1QA 2G8FA 3DRPA 3NF9A 1QSLA 3L2UA 4HTUA 4LH5A 3VQBA 4CJPA 4AHRA 1RT2A 2HNDA 1UWBA 3ZCMA 1WSHA 3OYDA 4DTRA 2PYJA 4RW8A 3L3UA 3OYMA 4ELVA 4CEBA 2O4IA 4NYNA 2P5GA 1WSIA 2R7YA 1RT5A 1NOYA 1ASUA 1T7PA 3ITHA 1VRTA 1TAQA 1C0MA 3MEGA 4KB1A 3JSMA 4WE1A 4W5TA 4E7LA 4PQUA 4GW6A 4M3WA 4JLHA 4KHSA 1S6PA 1KVAA 3AVNA 4CJEA 3MXJA 4CHPA 3BDPA 4PA1A 4BWMA 4CK1A 1A5VA 3D0PA 1FXXA 4CGFA 4DF4A 3SUQA 1XHZA 4GVMA 4Z4IA 1TL1A 3OYKA 1IKWA 1C0TA 3QEXA 4M45A 3S3NA 1NK6A 4CHQA 3DLGA 2YHBA 4KI4A 1S1WA 3TAEA 2ZD1A 1S1XA 1KFDA 1D5AA 3G0ZA 4FCYA 1TKDA 4I9QA 3ULDA 5J2PA 4KFBA 3HO1A 2D0BA 3OYBA 2QKBA 3HPHA 4DTXA 1RBTA 4F2SA 4BE1A 5SWMA 4KREA 4CJVA 1G15A 1TK8A 1RBSA 1BGXT 1U48A 1WN7A 4DTUA 3RMDA 1J53A 3OYHA 4C8NA 3RWUA 4F8RA 3HYFA 1VSIA 2E6LA 4KKOA 4FLZA 4I2QA 3SJJA 3I0RA 3HSTB 1RNHA 2WONA 1L3TA 2X74A 3CFPA 1CXUA 2DFFA 4CEAA 1J5OA 1XWLA 3HK2A 3AVGA 5K14A 4AHCA 3V81A 4M3ZA 3AVHA 3ISNC 4KV8A 3AO3A 2BGGA 3TAPA 4N56A 1Q8IA 1X9WA 3TAMA 2QXFA 3WNFA 4M3UA 4CGGA 1TK0A 2OZMA 1NJZA 3D45A 3TAGA 1C1AA 4ZHRA 4NCBA 4N76A 1S9EA 3AVKA 1VSEA 2B6AA 3LAKA 3SUNA 1NJXA 3MECA 1HRHA 3QINA 4CEFA 4NCGA 3KJVA 4CERA 4JRQA 2XY6A 3S3OA 4FJ9A 3K59A 2HHVA 4BACA 2Y1JA 2B5JA 1HQUA 1VSLA 3ZT3A 1WSGA 3K2PA 4B8CA 1B9FA 2F8TA 3TANA 3QNOA 1TV6A 3AA5X 3QIOA 3V1RA 1XC9A 4B8AB 2B4JA 1S1UA 3VQ7A 4OKEA 2G8KA 4CF0A 3M8SA 1WLJA 1KVCA 3EZ5A 2BDPA 1CZ9A 1RTJA 1S5JA 4LY7A 2KQ2A 3PV8A 5CZ2A 4NYFA 5HBMA 3ZSQA 3K5NA 1NK5A 4FJJA 1VSMA 3K58A 3IS9A 4EP4A 1HPZA 4DS4A 3QERA 1WAJA 1C6VA 4XIUA 2WOMA 4RW6A 4B9UA 1Q9YA 4DTSA 2F96A 4MFBA 1SKRA 1ZBFA 3L2VA 3CM6A 1C1BA 1EXQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TL3A 4JHDA 1JL2A 3DOLA 4KH5A 1I39A 4O55A 3QMLA 4JI2K 4BRIA 2F9TA 5M1OA 3KZBA 4OKJA 3VA0A 2GUPA 3DLEA 4JI1K 1ZBSA 3DAWA 4EZ6A 4GV3A 4H5RA 4BROA 4BREA 4L3QA 1T6DA 4FWKA 4FZZA 4LF9K 1XNRK 4FLWA 4DS5A 3EE8A 4BRCA 3NAEA 1MU2A 2YCHA 4FW2A 4HUGA 2O8FA 1KLMA 3TR8A 5KRSA 2QXLA 4Z94A 2IGIA 3OYGA 4KTWA 3U3GA 3L2RA 1HNWK 1N32K 1KC8O 2G8IA 4LFAK 1ATRA 1SS6A 1TYQB 4PUOA 4O5BA 5DM6L 2DTUA 1JKHA 2KZMA 4Q5VA 2Q1NA 4U7BA 4CEDA 1JLCA 3VQ4A 4OPJA 4DLEA 1T8EA 2ZJPL 5M1QA 3WNEA 2O8DB 1RT1A 2QKKA 4OLAA 4DU4A 5AQUA 4Q0BA 3KK3A 4CIEA 1B9DA 3U3YA 1RBUA 4CZLA 5CYMA 5AR0A 4AF1A 3EKUA 3S41A 3ZT2A 3OJUA 3ID8A 3FZHA 1J6ZA 4CZFA 3VQ9A 3OS1A 4CJUA 4DQSA 2OA8A 1VK0A 4O0JA 4CVNE 3I56N 3E1YA 4AH9A 3V1QA 3SK3A 2A1RA 1JLAA 2ZJQL 1WSFA 2PBDA 2BUPA 2VQEK 3HPGA 4DFMA 4CJRA 4IJNA 3MN5A 1YITN 1NU0A 2OPPA 2D4WA 3K9KA 4YOXA 3QEPA 1D9DA 1RBVA 4L8RB 4J2EA 3ASMA 3D2FB 2HB5A 1JLQA 4B3TK 4DSJA 2QA4N 3HM9A 3Q7BA 4B08A 4FW1A 1HYVA 3ZSXA 4W5QA 3D7EO 4E1MA 3CQ8A 3MXMA 4XH4A 1Q86O 3LM9A 3BZKA 4JKEA 2HVIA 5BR8K 3VPZA 3LDNA 2VQFK 1Q7YO 2VWBA 2ZGZA 4DWIA 4JEPA 3CIPA 5M1FA 3QO9A 4CGDA 1T44A 3RVCA 3PX0A 2VG6A 4O0IA 4FJKA 4ISGA 1QQCA 4DUZK 1QVFM 4O8KA 3SJHA 3HT3A 1N34K 4H8KA 3NGYA 5HL7L 1IG9A 5TKYA 1WSEA 3VEWA 3SQ0A 2ZGYA 5F0XA 4QS9A 3CMAN 3EL2A 5FDLA 3RMCA 2GEMA 3WEEB 2XO7A 2NRVA 2P9SA 3VOVA 2YNFA 4AHTA 1NK4A 5BN9A 3M5RA 1BHLA 3P31A 3JXUA 3CJ9A 1L5UA 3KLHA 3CERA 3F5TA 4KO0A 1ZBHA 3DYAA 3WT0A 1Q9XA 4CEOA 3S3MA 4H4OA 3CI5A 3M6GA 3WNHA 1U45A 5J2QA 4KTQA 2V52B 2D0AA 1NMNA 4LF5K 1J54A 4CCHA 3KIOA 3LDLA 2G8WA 1XMQK 2HBJA 4ELUA 4CF1A 3O1WA 1VSHA 4QOZB 4CZMA 2VWKA 3CC7N 1BCOA 2YV0X 3CCLN 1WAFA 1Z25A 5ADXA 3K5MA 3FLCO 2J4RA 3CJAA 3M3ZA 3OYEA 4I6MB 3J7YP 3LP0A 1DLOA 3IG1A 2GUIA 3C6HA 3V4IA 4J2BA 1FW6A 3NH0A 4A59A 5E84A 3F2KA 3QNNA 1MDUB 4B1UB 2OPQA 4B9MA 1TYQA 2P9IB 2E6MA 3LALA 5IT9O 1IKVA 5AQGA 1L3VA 3VQCA 5CY4A 4EAHD 5DM7L 4DV7K 2QWOA 4CHNA 2LSNA 3HOSA 1WOQA 2O8DA 1IKXA 3LZIA 4FVMA 4X65K 3F73A 2P9PB 1QQMA 1VQLN 2QI2A 1QS4A 4BY9C 1BL3A 3T3FA 2FBYA 3ZT0A 3E01A 1KD1O 3TPQA 4CF9A 1T6CA 1O13A 3A5MC 4IEEA 1IO2A 2QM1A 1Z05A 1C0GA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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