2FC0A

Wrn exonuclease, mn dgmp complex
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
HHSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Werner syndrome helicase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 63
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fc0A00
3TAFA 3QINA 1HQEA 2P1JA 1A5VA 4ID5A 4KKOA 4W5RA 4WE1A 1XHZA 5HBMA 3AVCA 1JXBA 4DF4A 1BIUA 4IDKA 3LPUA 3SPYA 2FBYA 1TL3A 1I39A 3OYAA 1LW0A 1RT5A 1VSKA 2ATQA 1LWFA 1RT2A 1S1XA 4CJ4A 4RW7A 2YKMA 4GW6A 4DU1A 3C6TA 4CFDA 1U48A 4NCGA 2RKIA 3MEEA 3MAQA 1TV6A 1WSFA 3I8DA 3TARA 1JL1A 2HNZA 5HLFA 1RDDA 4LSNA 3DLBA 4H8KA 3HVTA 5CYMA 1Q8IA 1YTAA 3ZSVA 1S9EA 2HNDA 3AA4A 3I0SA 4FLVA 1U4BA 4MQ3A 4IG0A 1BI4A 3QEVA 3HP6A 3L2QA 2GBZA 4HUEA 1S1VA 2KTQA 2KFNA 3CQ8A 3AVNA 3K5MA 5CZ1A 3KJVA 3WNFA 1BI4B 2IAJA 3ZSXA 3VQ7A 2E6MA 3LAKA 3P5JA 3ZT4A 4CF0A 3CM6A 3SUOA 1NK0A 2P5OA 3AVAA 3VQ4A 4CHOA 3K5NA 3SI6A 3ZT0A 3PY8A 2G8KA 4E0DA 3NF7A 4CEAA 1B9DA 3MXJA 3DI6A 3G0ZA 1GOCA 3L2UA 2Y1JA 2OPRA 1XC9A 4HCBA 1ZBFA 1HYVA 3AVGA 3PX6A 1NJZA 4OLBA 1CZBA 2B6AA 1TKZA 3NF8A 4G1QA 4LH4A 1T05A 4B9UA 2X78A 1YT3A 3OYIA 4DSEA 3ZSRA 4E7HA 3VQ5A 3NF6A 4W5QA 3C94A 3V9XA 1L3TA 1LV5A 2DTUA 4ICLA 3OVNA 3K58A 1SKWA 3LZJA 2HHTA 3VQ8A 1TL1A 3ZT2A 3QETA 5HRPA 4DTJA 1X9WA 1NJWA 2B4JA 3ZSZA 3O3GA 4AH9A 3V9UA 3K2PA 4ZTFA 4E1MA 4B9TA 4CF2A 3THVA 1CXQA 1T7PA 4CESA 3LAMA 4DTNA 3BDPA 3OYHA 4CJ5A 1C1BA 3DLEA 4FLZA 1RBVA 3VA3A 3EZ5A 2BGGA 3U6FA 2GV9A 2A1SA 3WNHA 1J5OA 4JRQA 4FLYA 4I9LA 3V1QA 1JKHA 1NOYA 4KV8A 3M8RA 4CHNA 1T8EA 4ELTA 1ZBUA 1DTTA 3SV4A 1NJXA 3DLHA 2GUIA 2DFEA 3VA0A 4KB1A 3WNGA 3L2RA 2DFFA 1TK8A 2HVIA 1WLJA 2JGUA 2PY5A 3C95A 3CM5A 1SKSA 4KHWA 1HYZA 1VSFA 4RW8A 3LWMA 4Z4IA 3QERA 4BDPA 1Q9XA 3QIOA 3AVKA 1NK8A 2QKBA 3M8PA 4OGEA 3OYLA 4B8CA 4KHYA 3TAMA 2HW3A 4KHUA 3QLHA 4CJUA 1JLBA 4E7JA 4W5OA 4DQRA 1QSSA 2BDPA 1RTIA 1TGOA 5FRMA 4FLUA 1CXUA 3IRXA 2OZSA 1JLGA 4CEOA 4FK0A 3K5LA 3VQDA 4Z4EA 2D0CA 3WNEA 4RG8A 1ASVA 4M3YA 4RW9A 4E89A 4CGJA 5SWMA 4ID1A 3TWHA 3AVIA 4CFCA 4EP5A 4QOZB 4BE0A 3ZSYA 4OKJA 2EHGA 1BGXT 2ZE2A 4KAZA 3CYMA 4B08A 4Q5VA 4F3OA 1SL2A 3AO3A 4DTPA 1J54A 1WSGA 2F96A 1GOAA 4CF1A 1Z26A 4M3ZA 3HXMA 4FZYA 4KHNA 3A2FA 3KLGA 1LAVA 2YNHA 2RPIA 4KTZA 3RMDA 3DYAA 1FKOA 4CJFA 2PZSA 3LZIA 4O44A 4DSKA 1N6QA 4PA1A 3NFAA 3SCXA 3NDKA 4F3TA 1S9GA 1FK9A 1SUQA 1D9FA 1S1WA 3TABA 4Y1CA 3HJFA 4DS5A 4LH5A 1HMVA 1KVBA 3MXMA 3KD5E 1QTMA 4F8RA 2ZD1A 5C25A 3L2WA 4EZ6A 4OVLA 3ASMA 5CY4A 3NE6A 4FZXC 4FM2A 3DM2A 3T1AA 4KTWA 4O0JA 3OJUA 1HPZA 2ITGA 3HO1A 4PWDA 1RILA 3QIPA 1XHXA 1IH7A 2Z1IA 4KI6A 3QEPA 4DQSA 4IG3A 2YHAA 5DMRA 1IG9A 3QESA 1ASUA 3AVJA 4CEQA 4LY7A 4M3RA 3VN5A 5KI6A 1REVA 3L8BA 4DSIA 1J9AA 1NOZA 4FM1A 2I5JA 4Z4CA 4HHTA 4FJKA 4BE1A 3CFPA 3SUNA 1VRUA 3VQPA 3LDSA 4B9VA 4CECA 4DFMA 3L3VA 1TAQA 3LP1A 4CFAA 1SKRA 4FJLA 1G15A 4Z4HA 4ELUA 3G10A 1CZ9A 2G8FA 2W42A 1C0MA 4CEEA 3HPOA 2NUBA 3CG7A 3O4QA 4FJNA 2QK9A 4GMJB 4FW1A 1NKEA 3NH1A 4CJEA 2EX3A 4BE2A 3TI0A 4J2BA 4YNQA 2G8HA 1J53A 4C8KA 1S6PA 3OYEA 1NK4A 2FBTA 2HHUA 3QO9A 5CYQA 4O4GA 2G8WA 4CJRA 4N41A 4CFBA 1WNSA 4FK2A 4M45A 2IOCA 3B6PA 4N47A 4CGIA 4E1NA 2IS3A 4KO0A 1EP4A 4BWJA 1U49A 4J2DA 4JS5A 1VRTA 1BIZA 5D3GA 2DFHA 1WN7A 3HYFA 1TAUA 2YKNA 4DTMA 1RTDA 1RBTA 1ASWA 3D45A 4CJPA 1K6YA 3LP2A 4FCYA 1GOBA 1L5UA 4FK4A 2HHVA 3MECA 1NJYA 4W5TA 3TAGA 3AVLA 3KKRA 3TAQA 2YNIA 1TVRA 1YVUA 3PUFA 1UOCA 4FVMA 4OKEA 4CJ3A 1JLAA 4DTRA 1JXEA 1KVCA 3KLHA 3SQ4A 4FLWA 3TANA 5JS1A 1JLQA 3AVFA 2Z1HA 1UWBA 4M41A 2G8IA 1BL3A 4DSLA 4OPKA 3B6OA 2G8UA 3UIQA 1RT1A 1RT6A 5KRTA 4N56A 2E6LA 4I2QA 4PY5A 3V81A 1F21A 3H08A 4YFUA 2FBXA 3T3FA 1JLCA 4DMNA 3CFOA 3OJSA 4L8RB 3AVHA 1HNVA 4CGDA 4I9QA 1B9FA 1QE1A 1C1CA 4UQGA 2XY8A 3AO1A 3I0RA 1JL2A 1S6QA 4J2AA 2P51A 4EP4A 5I3UA 4FXDA 4R5PA 2PYJA 1QSLA 4RW4A 1BCMA 1C0TA 3U3GA 4DG1A 3HSTB 3OYKA 1KFSA 3OYNA 1VSLA 3DLKA 4GVMA 3LWLA 1I3AA 2VG5A 4KB0A 2HB5A 3NH0A 3TAEA 2OZMA 2E4LA 4CEZA 3BGRA 4E3SA 3V1RA 4F2RA 3LPTA 3LP3A 1SL1A 1KCFA 3QNOA 4EZ9A 1HJRA 3NAEA 5HRNA 3QEWA 1BISA 2BE2A 1C1AA 1TKTA 5J2NA 4RW6A 1KFDA 1RT7A 2QXFA 2X74A 2D0BA 4CK1A 1U45A 3HL8A 1IKVA 3P83D 5C24A 3DOKA 3AVBA 2B5JA 4N5SA 4CK2A 4BDYA 3ISNC 4FLTA 1Y97A 3K57A 2HVHA 3KK2A 4O0IA 2FC0A 2O4IA 4E19A 3KKSA 1WAJA 4CJSA 4K8ZA 1LWEA 3SQ2A 2X6NA 3QEXA 4DQIA 1R0AA 4CHZA 4JS4A 4W5NA 3S9HA 2RN2A 4NCAA 2VG7A 4MFBA 3AA2A 4CHYA 2IDOA 4B9NA 3S3NA 2Y1IA 4FJ7A 3OY9A 3SUPA 4CHQA 3K5OA 2VWKA 4ZHRA 3AO4A 4FJ8A 1S5JA 2ZQBA 1HNIA 4KHSA 3NGYA 3ZSQA 1WAFA 5KGXA 1B92A 1JLFA 3AA5X 1Q9YA 4M3UA 4PQUA 4OLAA 4DFJA 5HRRA 4E7LA 1RNHA 2XY5A 2OYQA 1CLQA 2WOMA 4PUOA 1BQMA 2QKKA 3S3MA 1KLMA 3IAYA 3SYZA 4NYNA 4CJWA 4KPYA 2KZMA 4OGCA 2XRIA 2KZZA 3KLIA 2O4GA 1IKYA 3JYTA 4Z4FA 3RMBA 4TSXA 2RF2A 3HVRA 4JRPA 4IFVA 3ZSOA 3HM9A 2OPSA 1NK5A 2FBVA 1QSYA 3RR8A 3T19A 5HP1A 2XO7A 2VWJA 1TKDA 3OS1A 2YHBA 3PX4A 1A5XA 1D5AA 3VQEA 1FXXA 1EXQA 4AHVA 4OPJA 1VSHA 1MU2A 2HMIA 3KLEA 4C8LA 1HYSA 4DU4A 5KTQA 4JLHA 3OYGA 4DTSA 5J1EA 2Z1GA 1ZBLA 1U47A 4DTOA 3V9ZA 4CIEA 3DRSA 4Q0BA 3OS0A 3EYZA 3NGIA 2OA8A 4KRFA 4HVJA 1XWLA 4OJRA 4AILC 3VQAA 1KRPA 3RRGA 1L3UA 4CERA 3KD1E 3O3HA 3ALYA 4BACA 3OYCA 4FJ9A 3V9WA 3NF9A 5HRSA 1SV5A 1RDCA 2F8SA 2R7YA 1QS4A 5SZTA 3VQQA 4C8OA 4FM0A 2AJQA 2P5GA 5EU7A 1HQUA 1RBRA 2D0AA 2VG6A 4NYFA 1VSIA 1RT4A 4FLXA 3DLGA 4H4MA 1KSPA 4CF8A 5KRSA 3HPHA 2IC3A 1NKBA 4H4OA 3P1GA 1NK7A 3AV9A 1RTHA 3PX0A 3HK2A 4FYDA 3HPGA 3E01A 4CEFA 4C8MA 2KQ2A 3MEGA 3NH2A 3F9KA 3V1OA 4HTUA 3V6DA 3IG1A 5FDLA 5J2PA 1BQNA 4FJXA 4DQQA 1ZYQA 3KLFA 1TK0A 5K14A 4M3WA 3DMJA 1Z25A 4CK3A 3OYJA 4QCLA 3FFIA 4OKKA 3VQ6A 4CJTA 4B3OA 1WSEA 1BCOA 4I2PA 1VSEA 2XY6A 5HROA 3ITHA 3PO4A 3IS9A 3RR7A 1UA1A 4KHQA 1ITGA 3AO2A 4IFYA 4HUGA 3OYBA 2G8VA 4B9SA 3MXIA 2ETJA 4Z4GA 1C6VA 4BWMA 3RMCA 3OYMA 3K59A 1WSIA 4LD0A 1ZBHA 1RBSA 2BANA 2D5RA 4FZZA 1DLOA 3LANA 1BHLA 3F73A 4CJVA 1TKXA 1DTQA 3LALA 3VQ9A 1S1UA 5I42A 4ZTJA 2LSNA 4HCCA 3AO5A 2YNGA 4Y1DA 4DU3A 4DLEA 4CJQA 3SPZA 4HUFA 1EX4A 4M42A 1X9SA 3OYFA 5J2QA 2A1RA 2IGIA 3NGZA 3DLRA 4M3XA 3O4NA 4DFPA 3LP0A 1IO2A 3RWUA 4B9MA 1EETA 4CIFA 3M8SA 3DRRA 1W9HA 4AHRA 1KTQA 1UAXA 4CE9A 3SUQA 1W0HA 3TAPA 4FJGA 1EKEA 2Z1JA 5JS2A 2OPQA 4CGHA 4CF9A 4DQPA 4FJJA 3QNNA 4I7FA 3PV8A 4BDZA 4E7IA 1WSHA 4FW2A 4B8AB 4CCHA 5FROA 5T7BA 4K8XA 4DTXA 4Z0UA 3SJJA 2HHWA 1QHTA 1O1WA 1U04A 3ZCMA 3ZT1A 1L3SA 3PO5A 3HT3A 4E7KA 4DTUA 3HP9A 4O5BA 4FJHA 3NBPA 4CGGA 4DF8A 1VSJA 1T03A 5J2MA 3RTVA 1N5YA 3SZ2A 4CEDA 1S1TA 5C42A 4CEBA 4DLGA 1KLNA 4J2EA 2F8TA 3VQBA 1LAWA 3KK3A 3RRHA 2HHSA 3SQ1A 4CHPA 2DY4A 1JLEA 3NCIA 1A5WA 2HHXA 4XIUA 2WONA 1QQCA 3L3UA 4KTQA 4CIGA 1D9DA 4KI4A 3AA3A 3KIOA 1ZBIA 4F4KA 1FKPA 1RTJA 1NKCA 4KREA 1UA0A 3O3FA 4AHSA 1YTUA 4IBNA 1VSMA 2PYLA 4QAGA 3V4IA 2JLEA 3ZT3A 4IKFA 3S3OA 2OPPA 1X9MA 4CJLA 4N76A 2KW4A 1IKXA 4B9LA 3ZSWA 4NCBA 5CZ2A 3MEDA 2XHBA 3RMAA 1XI1A 1KVAA 3NHGA 5FRNA 3VQCA 2X6SA 4AHCA 1RT3A 3OYDA 3EY1A 1D8YA 3L2VA 4DSJA 4DFKA 3AVMA 3DRPA 4CGFA 3QEIA 2XY7A 4ELVA 1C0UA 2HNYA 4DSFA 3SV3A 1NK6A 4CJKA 1VK0A 3ULDA 4AHTA 4M3TA 1WSJA 3OS2A 4O55A 1IKWA 1L3VA 4C8NA 3V9SA 3DOLA 3JSMA 3M8QA 1RDAA 3U3YA 1RCHA 2YNFA 1HRHA 3SQ0A 4FJIA 4FJMA 3SNNA 3CFRA 2KFZA 1LWCA 1SL0A 5DK5A 4KFBA 1VSDA 3TR8A 1LW2A 4DS4A 1NK9A 5KGWA 1TK5A 1RBUA 4AHUA 4FJ5A 4LSLA 3D0PA 4F2SA 3C6UA 4DWIA 5E41A 3KK1A 2YV0X 1RDBA 3KTQA 2HHQA 1X1PA 2Q3SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TAFA 3QINA 2P1JA 1XHZA 5HBMA 3AVCA 1JXBA 4NXMK 4GV6A 3P4IA 3CCJN 1I39A 3OYAA 1RT5A 4E1JA 4PHTX 4DU1A 4GW6A 1GLDG 1GLCG 1HX1A 5AQRA 4DQ8A 3ATUA 1TV6A 1WSFA 2HNZA 3VEWA 5AQKA 1RDDA 4LSNA 1S22A 1YTAA 5C2DA 4MQ3A 2KTQA 2VCPA 3CC2N 3AVNA 2Q2RA 2BTFA 4J8FA 3WNFA 3MDQA 5AZJA 2A40A 3VQ7A 1SZ2A 3LAKA 4G9ZA 3CM6A 3VEVA 3K5NA 3PY8A 5AZJB 3E9PA 3L2UA 4HCBA 4FWOA 1GLFO 2E20A 4OLBA 2B6AA 3NF8A 4LH4A 1T05A 4JKBA 2FXUA 3VQ5A 4WQ5A 3NF6A 3C94A 4Z94A 1L3TA 1OVQA 4ICLA 3K58A 1SKWA 3LZJA 3VQ8A 1X9WA 2YHWA 2QM1A 3V9UA 4ZTFA 1OVYA 5DM6L 5HOOA 4CF2A 2HOEA 3DLEA 1RBVA 4BRGA 1VQ4N 4ISFA 3A0IX 3UKUA 2BGGA 3U6FA 4BRKA 1J5OA 4I9LA 3V1QA 3UKUB 1NOYA 1ZBUA 3SV4A 1NJXA 3D6RA 3BF3A 3WT0A 3GDQA 2HVIA 4JI6K 1HYZA 3LWMA 3JS6A 2GX9A 1Q9XA 5AQWA 2YHYA 3EEQA 3OYLA 4CJUA 4YDUA 5AQUA 5BPNA 1RTIA 3QBXA 2OZSA 4YOVA 2D0CA 3SAFA 2P9IA 4EP5A 4JHDB 4OKJA 3I56N 3CYMA 4B08A 3KK7A 2P9IB 1ESVA 4DTPA 1EO1A 4GVEA 4FZYA 1LAVA 3OTOK 3NVKA 3VEOA 2AA4A 4GV3A 2VQFK 4O44A 1N6QA 4PA1A 1VQKN 1S9GA 1D9FA 3CERA 2QI2A 4LH5A 1HMVA 3KD5E 1H1VA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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