2FC0A

Wrn exonuclease, mn dgmp complex
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
HHSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Werner syndrome helicase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 63
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fc0A00
2F8TA 3AVNA 3TAQA 2HHQA 3HXMA 4EP4A 1XI1A 2YHAA 3B6PA 3U3YA 4CFAA 3TABA 4IKFA 1GOBA 3KTQA 2G8VA 4FLVA 1KVCA 3S3NA 2OYQA 4CJLA 4CJ5A 1CZ9A 2WONA 3RTVA 4CE9A 4DU1A 3V81A 3D45A 3QIPA 5CZ2A 4FM1A 4CGJA 3VQDA 3MEEA 4M3ZA 5FRMA 3VN5A 1WSEA 1U04A 1S6QA 3ZT4A 3OS1A 3AO5A 1EXQA 1EKEA 4DSIA 1NKEA 1VSIA 1BI4B 4LSNA 4PWDA 1EP4A 4B9SA 1SL1A 2KW4A 5HRPA 2X6NA 2XY5A 1QSYA 2QXFA 1L3UA 2FBVA 2P5GA 3OYGA 1XC9A 3DRSA 3LAKA 2YKNA 4CHZA 1VSFA 1O1WA 2BGGA 1NK7A 3AO2A 3VQQA 4NCBA 1BCMA 1QHTA 1ASWA 3KLIA 5HP1A 3OYKA 1SKRA 5T7BA 5J2PA 3DOLA 3PUFA 1D5AA 1S1WA 4DSJA 5HRNA 1K6YA 3U3GA 4CHOA 4E7JA 3LZIA 1U45A 4KTWA 1RBRA 3HM9A 4DQRA 4DS5A 3PO5A 1ZYQA 3NAEA 4KHWA 3SYZA 5HROA 1GOCA 4OGEA 4CJ4A 4AHSA 4QCLA 2Y1IA 3OYMA 5J1EA 4DTNA 2Z1HA 2HHTA 1TKXA 2OZMA 4BDZA 2VG5A 5SZTA 3LWLA 3BDPA 3RRGA 4DTXA 1RTJA 1REVA 1BI4A 3SNNA 4B9NA 1RT6A 4LD0A 4G1QA 4F8RA 1Y97A 1JL2A 1B9FA 1UA1A 1YTUA 1RTDA 2EX3A 2YV0X 3G10A 4PA1A 4E19A 4CF0A 3V1RA 1UA0A 4ID1A 2LSNA 4B9LA 1NJXA 2O4GA 3IG1A 4NCGA 1FK9A 1RILA 5JS1A 1ASUA 1QSLA 4TSXA 2ETJA 1WSIA 4OKJA 4E7KA 4UQGA 4DQQA 1VSEA 1LAWA 2B6AA 1X9SA 4LY7A 3C6UA 3HL8A 1S5JA 1C1BA 3C94A 2B4JA 3AVKA 2IS3A 1RT5A 2E4LA 3NGYA 1RNHA 3HYFA 4FVMA 4I2PA 5K14A 2FBYA 3NHGA 3NGIA 3DOKA 3DRRA 4IFYA 4DLEA 3PX6A 4IDKA 1JLCA 3V1OA 4FYDA 2Z1JA 5J2QA 4M3UA 1S1XA 1TK5A 4FJJA 3K5NA 3SUOA 1A5WA 3I0SA 5DMRA 3S3OA 1XWLA 2QKBA 4IG3A 1ITGA 3KLEA 4RW4A 3CM6A 1JLBA 3ZT3A 4Z4GA 4KREA 2KFNA 1JLGA 3ZSQA 5KRSA 4ELTA 4ZTFA 4FLWA 4B8AB 3TR8A 3ZSXA 1HYVA 1GOAA 3HVRA 3PO4A 2F8SA 3AA3A 4Q0BA 4FLYA 4CEAA 1Z26A 3CFPA 1U48A 2JGUA 4BE2A 2G8WA 3DLHA 4FJXA 3PX0A 2IAJA 2AJQA 4H4OA 4Z0UA 4M45A 1BL3A 3RWUA 3IAYA 3MXJA 4CGDA 4YNQA 1UAXA 3TAEA 3THVA 2IGIA 1NJWA 1Q9YA 4FK4A 2HVHA 1Q8IA 4OLAA 1TAQA 3DM2A 2X74A 1W0HA 3NFAA 4CECA 4CK1A 3KK2A 3TAFA 2G8UA 5C25A 3ZSWA 4EZ9A 1DLOA 2E6LA 3LP0A 4CEQA 4W5RA 4CJFA 2HMIA 4CJTA 3NBPA 5I3UA 4DF8A 4RW6A 3RR7A 4NYFA 3T19A 1CLQA 4KB0A 4GMJB 3M8QA 3K59A 3JSMA 4E7IA 2BDPA 5HRRA 1NJZA 3SCXA 2G8KA 4CGFA 3L2RA 2HHXA 2DFFA 1JXEA 3LANA 5FROA 4BWJA 3TAMA 4L8RB 5CY4A 4Q5VA 2OZSA 1BISA 3I8DA 4K8ZA 4CGHA 3SUQA 4FJKA 4AH9A 1BQMA 4F3TA 4CEFA 3MXMA 4RW7A 3LALA 3ZSZA 3VA3A 2ITGA 3AO1A 2OPQA 5C42A 3NDKA 4FM0A 4FJMA 1X9MA 4CJVA 4E7LA 4DTJA 3U6FA 4CHQA 4DQSA 4OPJA 1KVBA 1LV5A 1I39A 2D0BA 3SQ1A 3TI0A 4I9LA 3L3VA 3C95A 3DMJA 4MFBA 4F4KA 1RBVA 3TAPA 2VWJA 1WLJA 3OYCA 3NCIA 1NOYA 4BDPA 3QETA 1RTHA 1NKBA 1KCFA 4HTUA 3OYLA 4PY5A 1TKTA 2XO7A 1W9HA 1DTQA 3ZT0A 1J54A 3LDSA 2FBTA 3OYDA 3AO3A 1HJRA 3ZCMA 4CEEA 4KTQA 3HJFA 3HT3A 1WAJA 4HCCA 4FLUA 1KRPA 3WNFA 3O3GA 2A1RA 3VQ8A 3VQEA 4CCHA 4CJ3A 4ELVA 2IOCA 2HNZA 1T7PA 4XIUA 3PV8A 4DU4A 1SL0A 4E0DA 4J2DA 4ZTJA 5HBMA 4KV8A 5KI6A 1T03A 4DTUA 4DSKA 3L3UA 3K57A 4B9TA 4F3OA 4FZXC 4CJPA 1IKYA 1TK8A 3IS9A 5HRSA 1J53A 1SUQA 3ITHA 3KIOA 2P51A 1J9AA 3QO9A 4ZHRA 4CHNA 3CM5A 2G8FA 3SUPA 4FXDA 4N41A 4DLGA 1D8YA 4B9UA 3DLKA 1KSPA 3P5JA 1RT4A 1QE1A 1S9EA 3NH1A 3MEGA 4CEZA 4KPYA 4M42A 3E01A 3IRXA 1JLEA 3ZSYA 3TANA 2O4IA 1S9GA 1VK0A 3CFRA 3DYAA 4JS5A 1BIZA 4FLTA 3QNOA 1NK0A 1HYSA 2D5RA 2HB5A 2EHGA 4DQIA 4M41A 3MXIA 3JYTA 1CXUA 2OPRA 4DWIA 1B9DA 5DK5A 3AVGA 1RDAA 1N6QA 4N5SA 3HPOA 1FKOA 3AVHA 4FJGA 4W5NA 1D9FA 4O55A 4CIEA 3G0ZA 3K58A 2W42A 3AVJA 1BIUA 4J2EA 4FW1A 4CHYA 4Z4FA 2JLEA 1LW0A 3MECA 4H4MA 1TV6A 4E1NA 4E3SA 2KFZA 4KHNA 3HK2A 1LAVA 1S1VA 5CYMA 1WSFA 4NYNA 3ZSRA 2YNHA 1TL3A 3RRHA 2BANA 4JRPA 3AO4A 3M8RA 2E6MA 4JLHA 2RPIA 4B9MA 4F2SA 4M3XA 4I7FA 2Q3SA 3O4NA 4C8MA 1X1PA 4KTZA 3AVCA 3SQ2A 4RG8A 1G15A 4KHQA 4C8KA 3AVAA 4MQ3A 3QEVA 1DTTA 1C0UA 4IG0A 3DLBA 3VQAA 4FM2A 3EYZA 4FK2A 4FZZA 3HVTA 4K8XA 3DRPA 1D9DA 4FJ8A 3DLGA 3OYBA 5J2MA 5KTQA 3MEDA 4CK2A 1NKCA 4EZ6A 4N76A 2HVIA 3T1AA 3K5LA 3RMAA 2NUBA 1NK4A 5J2NA 3BGRA 3NF9A 3P83D 4CIGA 1KVAA 4OGCA 3NGZA 3KLHA 4FJ5A 1NK9A 1HNIA 3B6OA 4LSLA 4FCYA 1C6VA 1QTMA 3HPGA 1VSMA 3UIQA 4Z4EA 1ZBFA 3ZT2A 3SQ0A 5HLFA 1WSHA 3V6DA 2KZMA 3HP6A 2PYLA 1Q9XA 3AV9A 3EZ5A 2QKKA 3OYAA 2ZD1A 4O4GA 4E1MA 3F73A 3PX4A 2GV9A 3ISNC 4DSLA 4CEDA 5FRNA 2KTQA 1JLFA 2YNGA 3AA2A 4FW2A 1JXBA 3QEWA 4Z4IA 3SPYA 1QQCA 3CFOA 3NE6A 4LH5A 1L3TA 1RBUA 1IG9A 4RW8A 4DFMA 4DTOA 1HQEA 3O3FA 1S6PA 3RR8A 1RBTA 4M3RA 2R7YA 4J2AA 1IKXA 1NOZA 4KFBA 2OPSA 1TK0A 1JL1A 1KLMA 3DLEA 4CF2A 4CJQA 1ZBHA 3NH2A 4CK3A 3QNNA 1T8EA 3AVLA 5EU7A 4B08A 5D3GA 3OYHA 2ATQA 3WNGA 2RKIA 3DLRA 4AHRA 2OA8A 2DFHA 1LWEA 1KTQA 1FXXA 1S1TA 3KJVA 3SV3A 3WNHA 1KFSA 4FLZA 1RT1A 2XRIA 2PZSA 4I2QA 3VQ5A 2FC0A 4C8NA 4HCBA 1X9WA 1LW2A 4ICLA 1ZBUA 4BE0A 1RBSA 4JRQA 4BACA 4CEBA 2BE2A 2RN2A 3H08A 1WNSA 3AVBA 4PUOA 3F9KA 4KHUA 2GUIA 3LZJA 1VRUA 1RDDA 2HNDA 4FLXA 4DTPA 1JLQA 4DFJA 3RMBA 1LWCA 4CGGA 2DFEA 3QINA 5FDLA 4HUEA 3ASMA 3CYMA 5C24A 1HPZA 4PQUA 3NF8A 4OKKA 4DFPA 1TKDA 5KGXA 1HYZA 4QAGA 3SUNA 3EY1A 3VQ6A 1VSDA 1EETA 1SKWA 4CF9A 4N47A 3RMDA 4HVJA 2PY5A 1WSGA 3TWHA 3KD1E 1NK5A 3HP9A 2HHSA 1A5XA 3KLFA 1NK8A 4KHYA 1TKZA 1RDBA 3M8PA 3KD5E 4OJRA 2HHVA 3SI6A 1KFDA 4WE1A 3ZT1A 4W5OA 3VQPA 3QEIA 3SQ4A 2DY4A 3DI6A 1BHLA 1VSJA 3K2PA 1IKVA 1JKHA 1WN7A 1HMVA 2IC3A 3NF6A 3O4QA 4OVLA 3MAQA 2HW3A 1L3VA 1RT2A 3OYEA 4AHTA 3V9SA 3QEPA 1R0AA 1U47A 4B3OA 1FKPA 3CG7A 1BCOA 4KKOA 3LP2A 2XY6A 3OS0A 3V4IA 2G8IA 4CJSA 4IFVA 4DU3A 2X6SA 2YHBA 4E7HA 3VQBA 4I9QA 2YNIA 1QSSA 2HHWA 1JLAA 3LAMA 2IDOA 2B5JA 4CEOA 1U4BA 4AHUA 1RTIA 3ULDA 3T3FA 3V1QA 4DMNA 1C0TA 1F21A 3AA5X 3OYIA 4DSEA 1J5OA 1SL2A 4LH4A 5CYQA 4DTMA 1EX4A 2OPPA 1BGXT 3P1GA 1VSHA 4HUFA 5KRTA 3OYJA 3QIOA 4BWMA 4OPKA 4O0JA 3K5OA 4DTSA 4N56A 3CQ8A 4FJHA 3SZ2A 2ZQBA 3TARA 4HHTA 4FJ9A 2DTUA 1UWBA 2X78A 1LWFA 4BE1A 3SPZA 1VRTA 4W5QA 2P1JA 1I3AA 3HSTB 1T05A 3PY8A 4C8LA 2Z1IA 1SKSA 1TGOA 4FJ7A 5E41A 2FBXA 3KKRA 2D0CA 2HHUA 3KK3A 4J2BA 2I5JA 4AILC 3OS2A 3VQ7A 4FJNA 4CJRA 3QESA 2QK9A 3AVIA 3LP1A 4E89A 3VQCA 4FZYA 4FK0A 2VG6A 1B92A 4CFCA 3QLHA 4KO0A 3V9ZA 3QERA 4M3YA 2KZZA 4OKEA 4O0IA 2PYJA 1YVUA 1XHZA 4CJEA 1C1CA 1L3SA 4GW6A 2ZE2A 3LWMA 3NF7A 4KRFA 5SWMA 1NK6A 4QOZB 3LP3A 3OYFA 1NJYA 1QS4A 4CFDA 1HRHA 3A2FA 3L2VA 4Y1CA 4DTRA 4IBNA 4OLBA 1Z25A 3L8BA 4KI4A 2XY8A 1L5UA 3FFIA 1RT3A 1SV5A 3OY9A 3V9UA 4DFKA 2YNFA 3VQ4A 3S3MA 1UOCA 2VG7A 4KB1A 4CJUA 1YTAA 1RCHA 3C6TA 3HO1A 1CZBA 4EP5A 4CF1A 3ZSVA 1MU2A 3AVMA 3OVNA 3OJSA 1KLNA 4FJIA 1IO2A 1TAUA 1WSJA 3V9XA 1CXQA 2HNYA 2RF2A 4O5BA 1S1UA 2F96A 3KK1A 1TVRA 4CJKA 1BQNA 1IH7A 4DG1A 4B9VA 4CHPA 3LPTA 3SJJA 2Y1JA 4CIFA 4FJLA 1A5VA 4ID5A 3I0RA 1WAFA 2D0AA 4AHCA 4B8CA 4YFUA 2GBZA 3WNEA 1IKWA 3LPUA 1YT3A 3OYNA 3S9HA 2A1SA 2XY7A 3AVFA 2P5OA 5JS2A 3AA4A 3SV4A 4RW9A 4R5PA 4F2RA 1HNVA 4DQPA 4O44A 4Z4CA 3O3HA 4DSFA 4KI6A 3NH0A 4M3WA 4M3TA 4AHVA 4CERA 3V9WA 4DF4A 4CGIA 3ALYA 2WOMA 4H8KA 3L2WA 4HUGA 1ZBLA 4CFBA 2YKMA 4BDYA 3QEXA 4CJWA 5I42A 3TAGA 4Y1DA 1HQUA 1U49A 1VSKA 3L2QA 3K5MA 1C0MA 3L2UA 3D0PA 4ELUA 4NCAA 4CF8A 3OJUA 4KHSA 4JS4A 2G8HA 1RDCA 1TL1A 1C1AA 5CZ1A 4Z4HA 5KGWA 3ZSOA 2XHBA 1XHXA 3KKSA 3HPHA 3VA0A 4W5TA 4KAZA 1ASVA 1N5YA 3KLGA 2Z1GA 1RT7A 1ZBIA 3RMCA 1VSLA 2VWKA 3M8SA 4CESA 2KQ2A 3VQ9A 4GVMA 4C8OA 4DS4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BR7A 4LF9K 3U3YA 2G8VA 1KVCA 2CH6A 3RTVA 4DU1A 2ASPA 3G25A 4FM1A 4CBXA 4JHDB 3MEEA 4CGJA 1WSEA 3I55N 3ZT4A 2KHOA 1EXQA 2QEXN 4DSIA 1VSIA 4IOXA 4B9SA 4FWOA 2VWBA 3DRSA 3LAKA 1VQMN 1O1WA 3VQQA 3KLIA 3D6RA 3EE8A 1SKRA 3DOLA 1D5AA 4CD3A 4IOCL 3O9QA 4DS5A 2CGLA 3NAEA 5HROA 2Y1IA 3JAMO 4JHDA 2ZWHA 4BDZA 3LWLA 3UE5A 3RRGA 3TSPA 3IKMA 3EN9A 4LD0A 4CZIA 1JL2A 1UA1A 4PA1A 4E19A 1NBWA 4ID1A 4QS9A 2O4GA 1ASUA 1GLCG 4BGBA 5CR4A 2KLAA 2VGNA 4XH4A 1TYQB 5AFUA 1S5JA 1C1BA 5AQJA 4FJNA 1RT5A 4E1JA 4I2PA 3NHGA 4FVMA 3PX6A 4DLEA 3KWIA 4V19S 3CD6N 4IDKA 1JLCA 1W97L 4FYDA 4M3UA 4A2BA 4IO8A 1A5WA 5DMRA 4B1YB 5AQOA 4IO9L 2QKBA 3H6EA 1JLBA 4JKFA 4DR5K 4FLWA 1P8ZA 1GOAA 1NGBA 3HVRA 4Q0BA 4FLYA 4CEAA 3O9RA 1KQSM 3PX0A 1TYQA 1OVQA 1NJWA 4FL9A 1Q8IA 4OLAA 2YCHA 1JCEA 1W0HA 3TAFA 3KK2A 4CK1A 3K9JA 1DLOA 2HBMA 4W5RA 3WT0A 1NGHA 1J6ZA 4WFBL 3T19A 4GMJB 3GDQA 1NJZA 1RDUA 3OHRA 3L2RA 2HHXA 3LANA 3T69A 5CY4A 4Q5VA 3SUQA 4FJKA 4AH9A 3SBGA 4CEFA 3MXMA 4ILGB 2UUBK 3ZSZA 2ITGA 3AARA 4DTJA 4DQSA 3SQ1A 3TI0A 2VWJA 5F1XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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