2FSJA

Crystal structure of ta0583, an archaeal actin homolog, native data
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
325
structure length
318
Chain Sequence
MVVVGLDVGYGDTKVIGVDGKRIIFPSRWAVTETESWKIPVLSTDGGQTKFIYGKYASGNNIRVPQGDGRLASKEAFPLIAAALWESGIHNPVDLVIGSGTPLGTFDLEVKAAKEALENKVLTVTGPEGEVRQFNITRLIMRPQGVGAALYLLNQGIIEQQPGYGVVIDVGSRTTDVLTINLMDMEPVVELSFSLQIGVGDAISALSRKIAKETGFVVPFDLAQEALSHPVMFRQKQVGGPEVSGPILEDLANRIIENIRLNLRGEVDRVTSLIPVGGGSNLIGDRFEEIAPGTLVKIKPEDLQFANALGYRDAAERS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an archaeal actin homolog
pubmed doi rcsb
molecule keywords hypothetical protein Ta0583
molecule tags Structural protein
source organism Thermoplasma acidophilum
total genus 88
structure length 318
sequence length 325
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF17989 ALP_N Actin like proteins N terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fsjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fsjA01
4FL9A 3VEYA 4BQZA 4A62A 3ENHA 1LOTB 2FF3B 5JLHA 5AQYA 4CZJA 1NBWA 2P9PB 3FE1A 2F9WA 4BC4A 5FPDA 2F9TA 1GLJO 4BRCA 3LDLA 5EXWA 4FO0A 1TYQB 5AZIA 4FWMA 3ULEB 4CZKA 1X9JA 4A2AA 3VPZA 1GLAG 5FPMA 4B1XB 1QQMA 5BPNA 4FSVA 1BWFO 4RTFD 4FWQA 4AM6A 2GEMA 4O5FA 2D4WA 1BA0A 3HBTA 2W40A 1HKBA 1Z05A 1T44A 2QWQA 4IJAA 4CJ7A 2P9KA 1H1VA 4H0VB 2ZF5O 3RSEA 2Q0UA 3D7EO 5AR0A 3O8MA 3L6QA 5AQPA 1GLEG 1TUUA 3GE1A 3I33A 2QWRA 4BG9A 3M3ZA 3MMVA 2VCPA 4FWKA 2P9PA 1X3NA 3VEZA 5AQHA 2HOEA 3KHYA 3WEEB 1TYQA 2A42A 2P9NB 1ATNA 4YDUA 3VERA 3ULEA 1WUAA 3MN5A 2P9SA 3WXJA 1NGBA 3IUCA 2QWNA 4YDUC 5BN9A 1QZ5A 2IIRA 4RCHA 3H46O 3FGUA 4JAXA 2I7NA 2I7PA 3TU5A 3IMXA 3ZX2A 3BUZB 3QB0A 3O5BA 4H03B 1NGIA 1EQYA 2V7ZA 3O1BA 4A61A 5AQMA 4CZFA 3SK3A 3GL1A 4JD2A 5JICA 3A5LC 3D2EA 1NM1A 2VWBA 3GDQA 3B8AX 4BR5A 4FOIA 1DGKN 4EAHD 1BA1A 2QW9A 1HLUA 3GBTA 4H0PA 5ELZA 4DCHA 2ZGZA 3H1VX 5F1XA 1E4GT 2FSJA 3VOVA 1XQSC 3VEOA 2Q2RA 3VGMA 3WT0A 1C0FA 4CZEA 1BOTO 1DKGD 2ASOA 2GWJA 4A2BA 1Y64A 5E26A 3MN6A 3FZLA 1BU6O 3CQXA 3DXMA 4BC5A 1YVNA 4BVOA 1NGFA 5AQIA 3CQYA 3VGKA 5AZIB 4PL7A 3FR0A 4BRIA 3VETA 3GG4A 2A40A 4BRLA 5LY3A 4BG8A 3J8AA 4I6MB 4B1VA 5ADXH 4BRAA 4FWRA 1BDGA 3LM9A 4H5WA 3O08A 5EX5A 3EKUA 1HJOA 4L3QA 3QFUA 4BRKA 3CJCA 1MDUB 2YHXA 3RSEB 2GUPA 3L0QA 4IJNA 2A6AA 3HSCA 1E4FT 3KVGA 2IVPA 2CGKA 5CE3A 4FWOA 1G99A 1GLBG 5ADXA 5JLFA 3C0BA 2AA4A 3QBXA 3S41A 3H45C 3VEWA 1V4TA 1BUPA 4BRMA 2V7YA 2E88A 4FWNA 2CGJA 4IXCA 2A41A 4K25A 5BPMA 4HWIA 3A8YA 1R59O 3CETA 2QWMA 3WXIA 5AQZA 4BR2A 1X3MA 2P9SB 1XC3A 1QQNA 2WUSA 1SAZA 1NWKA 4I6MA 3LL3A 2W41A 4H0YB 3EL2A 4GY2B 4CZLA 4DQ8A 5BR9A 3CJAA 1JCFA 2D1KA 2V51B 4EHTA 1BO5O 2E8AA 3EN9A 2QXLA 3U8XA 3I8BA 4XH1A 1XUPO 5BN8A 5AQTA 4O8KA 4JD2B 3IDHA 1NGCA 1OKJA 2HMPA 3D2EB 2FSKA 4BRFA 4CZHA 2HF4A 1CZAN 1KAXA 2QM1A 5EOYA 4BGBA 1GLCG 3LDPA 3WXLA 2CGLA 4PL8A 1KXPA 3U4LA 5B8HA 2UYTA 3VESA 2A5XA 3WXKA 4BC2A 3BF3A 3DWLA 5AQWA 5KPRA 3AY9A 1DEJA 3VF4A 3VF6A 1NGJA 3ATUA 2BUPA 3CJ1A 3H3NO 3QDKA 3DXMB 3QBWA 4B1YB 1HKGA 4Z94A 4KBOA 3VEXA 4WYBA 2FSNA 3SMPA 3CERA 2FLOA 3A5NC 2KHOA 2PAVA 5F2RA 4H5VA 3HTVA 5EVZA 2J4RA 4FOEA 1S22A 4H5NA 3QICA 2QWLA 2E1ZA 4PKGA 4BRQA 4M63C 1ESVA 4CD1A 4IZ9A 4JN4A 1QHAA 1JCGA 2YHWA 5AZJA 3VENA 2CH6A 2V52B 1TUYA 4MLHA 3G25A 1BG3A 2Q36A 4BRNA 4GNIA 4JHDA 5AQKA 1ZXOA 4M7XA 1KAYA 2PBDA 3R9PA 2GELA 2FXUA 5KQ8A 1ATRA 4RWTA 5AQJA 3HM8A 3H1QA 4ISFA 3M1FA 3HZ6A 2E20A 3VF2A 3EO3A 2E2PA 3ATVA 3D2FA 1NGAA 3MN7A 5AQRA 3FZHA 3WQTA 3DXKA 2CH5A 4DHYA 4BRDA 3MDQA 4QS7A 4BQLA 3HI0A 5LJWA 5BPLA 4BR7A 3UKUB 3ENOA 1WOQA 5FPNA 4EIAA 1T6CA 2YCHA 3SMSA 4BR9A 2AP1A 2Q97A 5AQQA 4BC3A 1C0GA 4JNEA 2BTFA 1Q18A 3MN9A 4AM7A 3BF1A 3WUHA 4BVPA 4NB4A 2QWOA 3U9DA 1MWKA 3CJ7A 1HUXA 3ZEUA 3LDOA 1P8ZA 3ZETB 2NLXA 3L4IA 4ISEA 3LM2A 4XH5A 4Y0WA 3MK6A 4K42A 1J6ZA 2IVNA 2DPNA 4B1WB 1D4XA 2GWKA 4QS8A 4H5TA 1QZ6A 4B1ZA 2D0OA 4BRGA 1U2VB 2YI1A 1ZC6A 1LCUA 3CJ9A 3UKUA 3H6EA 2IVOA 2P9UB 5AQGA 3A5MC 1HKCA 2ASPA 3A5OC 2A3ZA 4BRHA 2QWPA 1GLFO 3UB5A 4FWLA 1RGIA 1T6DA 4EFHA 1NGGA 5EY4A 1YUWA 2Q0RA 2YJFA 2P9LA 5AFUH 3P4IA 1K8KB 1YXQA 3ZX3A 3EKSA 3ZETA 2NZTA 1GLLO 3FZMA 5AZJB 2NRHA 3OHRA 4H0OA 5AQUA 2ASMA 3LDNA 4BR4A 3C7NB 5AQVA 3H3OB 5I9EB 1MA9B 4JHDB 2P9IA 4HTLA 4IWVA 3JS6A 3CJBA 3QMLA 4DB3A 1NMDA 1V4SA 3GOIA 2H3GX 4ISGA 5AQOA 4BREA 3VGLA 3KZBA 5AFUA 1U2VA 4CD3A 5AQXA 5LJVA 3M6GA 2ZWHA 5E84A 4CZMA 1RDWX 3D2FB 2P9UA 1GLDG 3AARA 3DXKB 3MCPA 1JCEA 3CHWA 4FPAA 3DAWA 3FFKB 1RFQA 1IG8A 2HF3A 3A0IX 4WQ4A 4EHUA 1NGDA 1MWMA 3LDQA 2E2NA 3JXUA 4WQ4C 1K8KA 4BR0A 3DJCA 1NGEA 3EZWA 4K43A 4MO4A 4B1UB 1ATSA 2ITMA 4CZGA 2GTDA 2Q31A 1SQKA 3ZEUB 2YJEA 4M7YA 4E1JA 3C7NA 1HX1A 4BROA 5KPZA 1S3XA 4NO7A 3O1WA 2D0PA 4XEIA 4PKHA 3BP8A 3SJHA 1Z6RA 3FLCO 4CBWA 1SZ2A 1NLVA 3IFRA 5F0XA 3AAPA 3CI5A 1U6ZA 4CBXA 3TPQA 3QFPA 3UKRB 3O6WA 3SLCA 5AQSA 5BRHA 5KQDA 5AQLA 3FZKA 3F9MA 5AQFA 4H0TB 2E2QA 3AAQA 4B9QA 4IO8A 5JMVA 3VEVA 3WQUA 4CBUA 4BGAA 1YAGA 3BEXA 3W0LA 3WEEA 4F9OA 2P9NA 1ZBSA 4MO5A 2VYPA 3W3DA 4FWPA 4K41A 1HPMA 3O80A 2P9LB 4CZIA 1IJJA 4H5RA 2E2OA 5BREA 5FPEA 4FWSA 2ZGYA 2OANA 4LC9B 2YHYA 4XH4A 5AQNA 4WQ5A 2FF6A 3ID8A 2E1YA 4FPBA 5BRDA 3UE5A 2P9IB 5TKYA 4PKIA 3CIPA 4WQ5C 3U9ZA 1NGHA 3FZFA 3O4WA 3R8EA 2P9KB 5KPTA 3UKRA 1QQOA 4J8FA 5BRFA 2Q1NA 3ZX0A 4C23A 2EWSA 4CI6A 4BRPA 1KAZA 4MLEA 4QS9A 3R6MA 4H0XB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1E3MA 3T7ZA 2HVHA 4BQZA 1JJ2M 2QEXN 1TK5A 4CGDA 4A62A 1S1WA 2P9PB 3KK3A 2UU9K 2F9WA 2F9TA 4DKWA 4BRCA 5EXWA 4FWMA 1ZBUA 5C10A 4A2AA 3EE9A 3VPZA 4B1XB 1XNRK 4AM6A 4MDBA 2QK9A 2D4WA 2YV0X 1IBMK 2HSTA 1VQMN 4N41A 4ILHA 4DTPA 4JI8K 1JLBA 3PV8A 1M1KO 4CFCA 3SQ4A 3V9ZA 1T3VA 3AVBA 3I33A 4LFCK 4DV1K 4JI4K 3SAFA 5M1OA 3SV4A 3MMVA 4CEFA 3SI6A 3VEZA 3AV9A 5AQHA 3VQ6A 4E89A 3DI6A 3HPGA 4FJHA 4OX9K 3CD6N 2X6SA 3KLEA 4LFBK 1VSDA 5HRNA 1K6YA 2P9NB 2O8FB 1ATNA 2FBVA 1VSLA 3MN5A 2P9SA 1VQLN 2F7TA 1KLMA 1QVFM 4FLXA 4O44A 3V6DA 2I7NA 4KHWA 4CF1A 4FYDA 4F2SA 3IMXA 3J80O 1Q86O 4MFBA 3BUZB 4DV2K 3DRPA 4Y1DA 3SAGA 1OH6A 3TAMA 1NJWA 1LWCA 4B3RK 4CK3A 4ZTJA 4CJVA 3NH1A 3OY9A 2HVIA 4CJSA 3HPOA 2NUBA 1DGKN 4KTQA 1BA1A 3MWTA 5ELZA 1RBUA 4W5OA 1Z26A 2ZGZA 3H1VX 5FRNA 1FJGK 1E4GT 2KZMA 4CIEA 3VOVA 1IH7A 4Z4FA 1KVBA 2Y1JA 2ZE2A 3E66A 3LP1A 4DSJA 1DKGD 2ASOA 2P5OA 4A2BA 3K9KA 1RBSA 2A1SA 4FLUA 3R3LA 4FXDA 4E7LA 1BU6O 4HTUA 4IEIA 4CIGA 4CHPA 4PL7A 2R7YA 1SUQA 5LY3A 4EP5A 3RMCA 1QTMA 1RILA 4B1VA 4FWRA 1O1WA 3OYHA 3LM9A 4H5WA 2IGIA 4QAGA 3QFUA 3MX5A 1ZBFA 4KB1A 1S1UA 1WSHA 1JLQA 3L0QA 4IJNA 2A6AA 1WSGA 3VQ4A 3KVGA 4FWOA 5GAGP 4CGJA 1GLBG 4CEBA 4FJ7A 3L8BA 4OLAA 1QSYA 4H8KA 2AA4A 2G8UA 5C24A 4E1MA 3S41A 2P51A 2D0BA 3VEWA 1V4TA 2V7YA 4AHVA 4DU4A 4X62K 3F5TA 4KFBA 3CETA 1C6VA 1RT7A 2QWMA 3SUQA 4IG3A 4BR2A 1HJRA 1X3MA 2P9SB 3RMAA 2JGUA 2WUSA 3LZJA 1NWKA 1JLFA 3HXMA 3LL3A 3V1OA 4FJMA 4H0YB 4GY2B 4CZLA 4CHOA 2V51B 4KTWA 1LW0A 5CR4A 4JI1K 4RG8A 4GVMA 1LAWA 3AO1A 1SKRA 1I3AA 3NGIA 2KZZA 1OKJA 3OYFA 2BH1A 2FSKA 4BRFA 3AVIA 4RW9A 1KAXA 2QM1A 1KVAA 5EOYA 2CGLA 3ZT4A 3AGKA 4W5TA 4ELTA 4IG0A 5AQWA 5CYMA 1RDDA 3PX0A 1XHZA 4CEAA 3CMEN 1RDUA 3H3NO 2BUPA 5FLXO 3QDKA 2NRWA 2QXFA 5KRSA 3QBWA 4B1YB 3V9SA 4J2BA 3KLGA 4KBOA 3VEXA 3T1AA 5HOOA 3SMPA 1Q8IA 3CERA 1S1TA 2LSNA 4AHTA 4DUYK 4DR5K 3NFAA 3G4SN 2J4RA 4FVUA 4LF9K 3E1YA 4H5NA 2KLAA 4CERA 4MQ3A 3QICA 2E1ZA 4ICLA 1C1AA 4CD1A 4DSIA 5HRPA 4M3WA 2CH6A 4DTXA 1TUYA 4BRNA 4GNIA 2P5GA 3ZLJA 1S6QA 1KAYA 3CPWM 2GELA 5TKWA 5KQ8A 1BGXT 1D5AA 2IC3A 3HM8A 5GAEP 1KCFA 1DTTA 3H1QA 3HZ6A 2HNZA 2E20A 4CGFA 4LF7K 3K2PA 3ATVA 3D2FA 4Z4HA 3HK2A 3NF8A 4DHYA 4BRDA 4BQLA 3LAKA 2B5JA 4BR7A 1VSFA 2W6LA 3ENOA 5C2FA 4EIAA 1HYSA 2YCHA 4DV5K 4BR9A 4BY9C 3P38A 1RTHA 3S3MA 1ILYA 1C0GA 4JNEA 4CFDA 3S3NA 2XY6A 4GMJB 3CCEN 4BVPA 1HYVA 4DQQA 4B8CA 2QWOA 4FZXC 4O0IA 4JLHA 3AA3A 3LDOA 1P8ZA 3KWGA 2X78A 3I8DA 1W9HA 1JLAA 4NCBA 1ZBIA 4A59A 3AVJA 1VSMA 1D4XA 4HUGA 4QS8A 4DG1A 4H5TA 3SUNA 4K8ZA 4B1ZA 4JI6K 3SAHA 1QS4A 1XWLA 1LAVA 2W42A 4BRGA 4CF0A 3CJ9A 4LH4A 5J2PA 3UKUA 4CGIA 2IVOA 2QKBA 2ASPA 3A5OC 4BRHA 1REVA 4I2QA 4FWLA 4N76A 1L3UA 3OS2A 4BDZA 4FJ5A 1NGGA 4IFYA 3KLFA 1A5VA 2WTUA 2D0CA 3HOTA 3RRGA 2D5RA 4FK0A 1VQKN 4FJ9A 5KGWA 1RT1A 3CFOA 3ZX3A 1NU0A 3ZETA 1VHXA 4E7JA 3FZMA 4CJRA 2NRHA 3OHRA 3LDNA 4AHCA 3C7NB 2Z1GA 3DOLA 3H3OB 5I9EB 4DTRA 4HTLA 1TKTA 3ZSOA 1NMDA 2H3GX 4FM2A 3DLRA 4CD3A 5E84A 1BCOA 3D2FB 4DTSA 1OH7A 4I9QA 2X74A 4FPAA 4DR4K 3SQ1A 3FFKB 3THXB 3PX4A 2HF3A 2UUBK 3O9SA 3LWMA 4B9SA 4CJUA 3LDQA 3QINA 3M8SA 3ZT2A 3G0ZA 5JS1A 3EYZA 4K43A 2ITMA 5C25A 4CZGA 4DTUA 2GTDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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