2FSKA

Crystal structure of ta0583, an archaeal actin homolog, semet data
Total Genus 90

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
326
structure length
321
Chain Sequence
MVVVGLDVGYGDTKVIGVDGKRIIFPSRWAVTETESWGIGGKIPVLSTDGGQTKFIYGKYASGNNIRVPQGDGRLASKEAFPLIAAALWESGIPVDLVIGSGTPLGTFDLEVKAAKEALENKVLTVTGPEGEVRQFNITRLIMRPQGVGAALYLLNQGIIEQQPGYGVVIDVGSRTTDVLTINLMDMEPVVELSFSLQIGVGDAISALSRKIAKETGFVVPFDLAQEALSHPVMFRQKQVGGPEVSGPILEDLANRIIENIRLNLRGEVDRVTSLIPVGGGSNLIGDRFEEIAPGTLVKIKPEDLQFANALGYRDAAERSM

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
S1 (3-8)S8 (100-108)TII2 (71-74)TIV1 (9-12)S3 (22-26)S2 (12-16)TI1 (17-20)O1 (26-28)S7 (54-57)TIV5 (63-66)EMPTYS4 (29-32)TVIII1 (51-54)S6 (43-46)TI'1 (49-52)TIV6 (124-127)AH1 (79-91)TII'1 (57-60)S10 (138-150)TI3 (74-77)AH2 (113-124)3H2 (134-136)S9 (127-132)TII3 (150-153)TII4 (298-301)AH3 (153-162)S12 (182-188)TIV7 (163-166)TI4 (178-181)3H3 (271-276)S11 (171-177)AH4 (206-221)S13 (194-202)AH5 (227-234)S14 (238-240)TI'2 (240-243)S15 (243-245)AH6 (248-270)S16 (277-283)AH7 (286-290)3H4 (291-297)TI7 (309-312)AH8 (312-324)S5 (38-39)TII1 (39-42)TIV4 (47-50)TIV8 (188-193)3H5 (307-309)3H1 (110-112)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural protein
source organism Thermoplasma acidophilum
publication title Crystal structure of an archaeal actin homolog
pubmed doi rcsb
molecule keywords hypothetical protein Ta0583
total genus 90
structure length 321
sequence length 326
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF17989 ALP_N Actin like proteins N terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fskA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fskA01
1X3NA 3MDQA 3R8EA 2P9SA 4F9OA 3H3NO 5JICA 1NGHA 1GLDG 1YUWA 5EOYA 3ZX2A 3CHWA 4CBWA 2NZTA 3HTVA 5F1XA 5FPEA 2OANA 3O6WA 2CGKA 1BA1A 4BVOA 4BRQA 4DCHA 1YVNA 2PAVA 1TUYA 3VF2A 3VEXA 4BRDA 4HTLA 1MA9B 4M63C 4KBOA 1GLJO 4C23A 3ZETB 1LCUA 3ZEUB 3VEOA 5AQWA 2YHXA 2E1YA 4NO7A 3H1VX 2AA4A 3A5OC 4AM7A 4BR2A 2CGLA 3WXLA 2QM1A 4K43A 1XUPO 4O8KA 4BC4A 1OKJA 5EXWA 3RSEA 3HSCA 4BRLA 3H1QA 4ISFA 3ID8A 2GWJA 3ATVA 3D2FB 5TKYA 4B1XB 2V52B 1U2VB 5AZJB 1DGKN 2GELA 3DXKA 4H5RA 3WUHA 5BRFA 3UKUB 3U4LA 2FF6A 4K42A 3D2EB 1ATNA 2W41A 1GLAG 2IVPA 2H3GX 4MLEA 3AAQA 2E2PA 1C0GA 5LJWA 1QZ6A 5B8HA 2P9KB 3DXMB 3ENHA 3AARA 4CBUA 4PKGA 3HI0A 4I6MA 4IXCA 2E1ZA 1CZAN 3CQXA 4H0YB 1G99A 2VCPA 3A5NC 3M3ZA 5AQVA 3ZETA 4FO0A 4CZJA 2GWKA 5EX5A 2QWPA 3FZKA 5AQTA 3O8MA 3WEEA 3D7EO 4H03B 3S41A 4ISGA 3HM8A 1GLLO 3LDNA 2FF3B 2IVOA 4CZKA 5BR9A 2QXLA 4IJAA 4Z94A 4JHDA 4QS9A 3QICA 3CJAA 2P9LA 4AM6A 5CE3A 3CJ7A 5EVZA 3CIPA 1U2VA 1WUAA 2YJFA 4BGBA 3VGLA 1BG3A 2Q1NA 4BC2A 1S3XA 3TPQA 4MO5A 3IDHA 4CZFA 5AQRA 3WT0A 1C0FA 1MDUB 4BC5A 4L3QA 3VEWA 3BP8A 1NGFA 3MN7A 3MN5A 4HWIA 4FWKA 1BU6O 3BUZB 3JS6A 5AQMA 3GG4A 3LDQA 3LDPA 3HBTA 1U6ZA 1SZ2A 2HF3A 3DJCA 4A61A 1Z6RA 2YHYA 3QBXA 4PL7A 1ESVA 1Y64A 5AQIA 3UKRA 5AQSA 4B1YB 5KPZA 4H5TA 3MCPA 3SMSA 3TU5A 2GUPA 1HKCA 1YAGA 4IJNA 2F9WA 2A6AA 4BRPA 2VWBA 3G25A 4BRMA 3FR0A 2Q0RA 3R6MA 3U9DA 5BRHA 3CJ1A 3C7NB 3JXUA 4FSVA 5AQZA 3BF1A 1NM1A 4BRHA 2IIRA 4QS8A 1NBWA 1NGDA 1Q18A 2GEMA 3WQUA 4JN4A 5EY4A 4WYBA 1ZBSA 3ULEB 3EZWA 5AQOA 2VYPA 3AY9A 2YI1A 3UB5A 2P9NA 2P9PA 1NMDA 5AQJA 3A5MC 4RTFD 3I33A 4O5FA 3EL2A 3FFKB 2ASPA 3O08A 1NGJA 3VENA 4EHUA 2ASMA 5AQQA 3O4WA 3H45C 4DHYA 1MWKA 5AR0A 4XH4A 1TYQA 3VEVA 4GNIA 2P9IA 2ASOA 3FZMA 2EWSA 3CERA 4DQ8A 1NGGA 4FL9A 1JCFA 3J8AA 5BPLA 3C0BA 1GLEG 1ZXOA 1BO5O 2P9UB 3VEZA 2ZGYA 2D1KA 3F9MA 2A5XA 1NLVA 1TUUA 3UE5A 4GY2B 4BG8A 2FLOA 4FOIA 2Q2RA 2PBDA 3GOIA 1V4SA 1LOTB 4PKIA 1D4XA 3FLCO 5F2RA 4FWNA 4FOEA 5JMVA 2Q36A 4B9QA 4WQ5A 2Q0UA 3WXJA 4B1VA 4J8FA 4BRKA 4EHTA 1IJJA 5ELZA 3MMVA 3IUCA 3M1FA 4MLHA 3ZEUA 3GL1A 1T6DA 1JCGA 3OHRA 4BRAA 4CZEA 2A42A 5AQGA 1DKGD 4M7YA 3KZBA 1K8KB 3W0LA 4WQ4A 4EIAA 3ATUA 1IG8A 2D0PA 1RGIA 4H5WA 5AFUH 1RDWX 2CH6A 3D2FA 4M7XA 1HKGA 3ZX0A 3EN9A 2ZF5O 4BR5A 3CI5A 3L4IA 4FWMA 5AZJA 4E1JA 1X3MA 2QWOA 3LL3A 2IVNA 4BRCA 4JD2B 3UKUA 3D2EA 3VF4A 2A40A 3VGMA 2AP1A 2W40A 2E20A 1HPMA 5KPRA 4FWQA 2UYTA 3A0IX 5AQPA 4H0PA 2P9KA 3DXMA 1P8ZA 1EQYA 5AQNA 5FPDA 3BF3A 3AAPA 3H6EA 3H3OB 3GDQA 4JNEA 3SJHA 5BRDA 3DWLA 5KQDA 4RWTA 5FPNA 1YXQA 3EKUA 3GE1A 1R59O 1BA0A 2WUSA 4H0OA 3BEXA 4CZHA 4H0TB 3GBTA 2FXUA 4H5NA 3VOVA 2QWNA 3O1BA 4CI6A 3L0QA 3FE1A 1J6ZA 4PKHA 1K8KA 3KHYA 4BREA 4A2BA 3RSEB 3ENOA 5E26A 3LM2A 2HMPA 3LDLA 2D0OA 1HKBA 5JLFA 1SQKA 4A62A 1HJOA 3SLCA 2QWRA 3CJCA 4CD3A 4LC9B 5E84A 4BRNA 2I7NA 3WQTA 5AQHA 3VF6A 4ISEA 1BDGA 3DXKB 3VESA 5LY3A 2A3ZA 3DAWA 3VERA 1BWFO 1NGIA 1NGAA 4JAXA 4JD2A 2NLXA 4CZMA 1H1VA 2E8AA 4PL8A 2NRHA 3CJ9A 1HUXA 3VGKA 1X9JA 1T44A 3QMLA 4BQLA 3R9PA 4BR4A 2CH5A 2YJEA 1QZ5A 3CQYA 2YCHA 3P4IA 4IZ9A 5I9EB 3LDOA 1ATSA 2D4WA 4WQ5C 5AQKA 5LJVA 4BC3A 4I6MB 4CBXA 2QW9A 2ITMA 4BRIA 2Q31A 4H0XB 4NB4A 1HLUA 5JLHA 3KVGA 3HZ6A 3IMXA 2QWLA 5AQUA 1GLBG 2BTFA 2FSNA 4FPBA 5AQXA 3O5BA 4WQ4C 4A2AA 3QB0A 3QDKA 5AQYA 2V51B 3WEEB 1SAZA 3FGUA 3C7NA 4RCHA 4K25A 4EFHA 1KAXA 2Q97A 3EO3A 2ZGZA 4JHDB 1BUPA 4FWLA 2P9LB 3VETA 4BVPA 3ULEA 4H0VB 1QQOA 5ADXA 3MN9A 1BOTO 1NGEA 1KXPA 1NWKA 3SK3A 1ZC6A 3O80A 1GLFO 4BRGA 5KQ8A 3MN6A 5AFUA 1T6CA 1QQMA 1XQSC 3WXKA 1RFQA 4BQZA 1NGCA 5ADXH 1S22A 5AQLA 2E88A 2V7YA 4B1ZA 5KPTA 5BN8A 5BPMA 1GLCG 1KAZA 4BRFA 1Z05A 1MWMA 3MK6A 5AZIB 1JCEA 4DB3A 4FWOA 5FPMA 4CJ7A 3UKRB 1NGBA 3A5LC 5AQFA 3H46O 1DEJA 4BG9A 2P9SB 3VPZA 3U8XA 4BR9A 3L6QA 4YDUC 2DPNA 4QS7A 3QFUA 3SMPA 4EAHD 2P9UA 3FZLA 5BN9A 4BR0A 2FSJA 3CJBA 3QFPA 1XC3A 4H5VA 1V4TA 3EKSA 1ATRA 2E2OA 2I7PA 4B1WB 3FZFA 3A8YA 3O1WA 4FWRA 4CZGA 4XH5A 2E2QA 2J4RA 1QQNA 2A41A 3W3DA 1E4FT 3B8AX 4IWVA 3WXIA 4MO4A 2P9NB 2P9PB 1KAYA 4FWPA 4XEIA 1E4GT 2KHOA 2QWMA 2E2NA 3FZHA 3VEYA 5BPNA 2YHWA 5F0XA 2HOEA 3U9ZA 4K41A 3IFRA 3QBWA 1WOQA 2ZWHA 4BR7A 3M6GA 2CGJA 2BUPA 1QHAA 2V7ZA 4BROA 4CZIA 4B1UB 2HF4A 4XH1A 4YDUA 2QWQA 3ZX3A 3LM9A 5BREA 2FSKA 4FPAA 4Y0WA 4IO8A 3I8BA 5AZIA 1TYQB 4CD1A 2GTDA 2P9IB 4BGAA 2F9TA 4FWSA 4CZLA 1HX1A 3CETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HPHA 2P9SA 4F9OA 1U04A 4B3SK 1YUWA 1N8RO 3MX5A 4CBWA 5FPEA 4FLVA 3O6WA 2CGKA 4BVOA 1SL0A 4LSLA 3WNFA 2X78A 2D5RA 1RTHA 3R1XA 1REVA 2HSTA 4BRDA 4J2DA 4KBOA 1GLJO 4C23A 4WCEL 2O8DB 1YJ9N 4FJ9A 4FM2A 1Q9YA 5AQWA 1YF5L 3ZSWA 5M1KA 3QEPA 4PUOA 3H1VX 4CERA 4AM7A 3WXLA 4BC4A 4K43A 4O8KA 4CESA 4FM1A 1OKJA 3HSCA 4BRLA 3H1QA 3P1GA 2DTUA 3HPGA 4W5TA 4JI1K 4B3OA 3AVGA 2PY5A 3NMUA 4J2BA 4Q0BA 1HYSA 1RDAA 3DXKA 4H5RA 4CFCA 1DLOA 4W5NA 2HBKA 1N32K 2RHKA 4O55A 3D2EB 2W41A 1GLAG 2IVPA 2H3GX 2QI2A 3R3LA 2KKZA 1BQMA 3IRXA 1C0GA 5LJWA 2G8FA 3NDKA 1B9DA 1LW2A 4CBUA 4DV2K 2HVIA 4PKGA 3TTCA 4GKJK 4OVLA 4IXCA 5CHIA 4X62K 1G99A 3ZETA 2PYJA 4DQQA 2QWPA 2GBZA 1DT9A 5AQTA 1SKSA 2BDPA 4W5RA 3WEEA 2F7TA 3D7EO 2ZD1A 5BR9A 5IT9O 2QXLA 4L8RB 5C10A 2G8KA 3L4QA 2ZJRL 3TTFA 3S9HA 3QLHA 1U2VA 3LZIA 3TAGA 1QSYA 4JEPA 1S3XA 3TPQA 4EZ9A 3IDHA 2JWKA 4CHQA 5AQRA 3WT0A 3VQCA 4JK8A 1T7PA 4L3QA 3VEWA 3PY8A 3D0PA 3D6RA 4HWIA 1RT2A 4FWKA 1BU6O 4FZXC 3F9KA 1N6QA 1XHXA 3K5OA 3CPWM 3LDQA 1KLNA 4JS5A 3HBTA 3OVNA 4CEZA 5J2QA 3V81A 3TU5A 1YAGA 4LF8K 4CCHA 3PV8A 2VWBA 1HNVA 3DLRA 3FR0A 3HP9A 5BRHA 1NK6A 4RG8A 3MAQA 4ILGB 3V4IA 5HLFA 3BF1A 4QS8A 1NBWA 3WQUA 3T7ZA 4CF2A 1IG9A 2DFHA 4JN4A 4WYBA 1ZBSA 4H8KA 3EZWA 2VYPA 3SV3A 4F4KA 2E6LA 3BGRA 2HBJA 1S5JA 1OVYA 4RTFD 3A2FA 3RWUA 2X6NA 3RRGA 3I33A 4CFAA 4PQUA 3EL2A 4I9LA 3DLKA 3FFKB 2ASPA 1KQSM 1NGJA 4KFBA 4BDYA 4FVUA 2YHAA 2FBTA 4EHUA 4YOWA 1TKTA 3I0RA 3BZKA 2ASMA 5AQQA 4KHSA 3H45C 3OA9A 3RR7A 3HP6A 2UXCK 4CHPA 4DF4A 3KWGA 3OS0A 1YVUA 1Q82O 3C0BA 1GLEG 4JLHA 1BO5O 2I5JA 2P9UB 4FW2A 3MEEA 3F9MA 2A5XA 1O1WA 3EYZA 1RILA 4KH6A 1S1UA 2PBDA 1UOCA 4PKIA 4E89A 4O4GA 4B08A 1XC9A 1D4XA 4BDZA 1LWEA 4B9QA 4JKBA 4B9VA 3WXJA 2D0AA 4DQPA 3OYJA 5M1PA 4DLEA 3M1FA 4MLHA 3OYKA 3RMCA 1JCGA 1ASWA 3T1AA 4A57A 4DSIA 2A42A 5AQGA 4M7YA 2NRTA 3C6HA 3KZBA 4WQ4A 1FJGK 4JRPA 3ZSZA 5LMNK 4OKEA 1C0TA 1Q81O 4H5WA 5AFUH 1RDWX 2CH6A 3D2FA 4FJ7A 1R0AA 1S1TA 2ZF5O 3L4IA 4WFBL 1T3VA 5AZJA 4LF6K 1D5AA 1SV5A 3OBWA 2IVNA 1ZYQA 4E7JA 4DTXA 3UKUA 3VQ7A 1NK8A 4CJFA 2A40A 1UA1A 3LP3A 3KLFA 4AHTA 1HPMA 3KLHA 4FWQA 2UYTA 2NRVA 5AQPA 1YIJN 4E0DA 5HRSA 1A5VA 4KTWA 3AAPA 3H6EA 4F8RA 3VQQA 4IFYA 1HYVA 5HP1A 2VGNA 1VSLA 3J7YP 3RMBA 3QINA 4CJUA 5FPNA 3EKUA 3GE1A 4JI3K 3E9OA 5SWMA 3GBTA 1VQ4N 3VQBA 3VOVA 3CC2N 2QWNA 4DSEA 4EP4A 5I42A 4CI6A 3ZSQA 2VG5A 2AJQA 4NCAA 1RBUA 3KHYA 1VSMA 4FLXA 2HHXA 4F3TA 2D0OA 4UY8O 1HKBA 5JLFA 2IS3A 3OYEA 3T3FA 2HHHK 4JKGA 3SLCA 1NKCA 4E3SA 1N36K 4BRNA 2I7NA 3T19A 3DXKB 5KRSA 5KGWA 4OPKA 3OS2A 2WTUA 1VHXA 5GAEP 4E7HA 5T7BA 1H1VA 1HUXA 4CJ5A 4O0IA 2CH5A 1HNWK 4ZTFA 2YJEA 1QZ5A 2IOCA 4F3OA 4O5BA 3I0SA 2D4WA 1VRUA 2FBXA 1IH7A 5AJ3K 3MEDA 3HXMA 5HBMA 4H0XB 1NKBA 3V9WA 3KVGA 4CJ3A 1S1XA 4LF4K 5AQUA 3N4QA 3LDSA 4WQ4C 3ZSXA 4R79A 5GAGP 4YFUA 2F96A 3WEEB 3FGUA 3C7NA 5KTQA 4AHCA 1NK9A 1YTUA 2YX6A 3OY9A 3SCXA 2F8TA 2ZGZA 1BUPA 4KI6A 4M3UA 1XHZA 3O9RA 2HB5A 3CYMA 3O4QA 3C6AA 2HBLA 3CC4N 1X1PA 4HVJA 1GLFO 4BRGA 4DR3K 3WXKA 1IKVA 1G15A 3KK3A 1ILYA 3AVMA 1JLGA 4CJWA 5C25A 2O8CB 3EE9A 5KPTA 1RDCA 4IFEA 3AVAA 1KAZA 4BRFA 1FKOA 2OPQA 3MEGA 4DB3A 2XRIA 2OA8A 1NGBA 1UA0A 2OPPA 3A5LC 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3A5NC 2WFBA 4HUEA 1RT4A 2FBYA 3LANA 4OPHA 3IG1A 3SBTA 3O8MA 3MWPA 1YJNN 4ISGA 3K0SA 1GLLO 3LDNA 2IVOA 4PA1A 1BIUA 4JKGB 3AVHA 3LP1A 4AM6A 5CE3A 3Q7BA 1VSKA 2Q1NA 3O9UA 1TL3A 4OJRA 4YORA 3AVNA 4MQ3A 4MDAA 4E1NA 1MDUB 4JKHA 4CK1A 5KGXA 1NG9A 1RBSA 1NGFA 4ID1A 3MN7A 4CFDA 4FLYA 3EE8A 4IFVA 1RNHA 1ZBIA 1OH6A 3JS6A 3N4PA 2HW3A 3LDPA 2NNWA 2ZQBA 4A61A 1XMOK 2YHYA 4PL7A 1VSJA 1ESVA 5AQIA 3UKRA 1Q8IA 4B1YB 4H5TA 3AA2A 4WFNL 1L5UA 2A6AA 3ZSRA 3G25A 4BRMA 5GADP 2HMIA 3R6MA 1XWLA 3U9DA 1S1VA 3P83D 1W2BM 4FK2A 1IKYA 2QXFA 3C7NB 1U4BA 1IBLK 3CCEN 5AQZA 3D45A 1S6PA 4GV3A 4BRHA 4FZYA 1N33K 2IIRA 3ZT3A 1NGDA 2HHQA 4DLGA 3MWTA 3VQ6A 1LAWA 1LAVA 2E5LK 3SBGA 1U47A 3UB5A 4FK4A 2P9NA 1L3UA 3HVRA 1CXUA 1TGOA 1C0UA 3A5MC 2OCEA 2EX3A 4Z4HA 3NF7A 3O08A 4LFBK 4BY9C 1BI4A 3O4NA 1X9SA 3PX4A 1JXBA 1QS4A 4DHYA 3SPYA 1MWKA 1TYQA 2ASOA 2KLAA 1NGGA 4V19S 1ZXOA 5CZ2A 1NNEA 1HQEA 2D1KA 1TUUA 3UE5A 4BG8A 4FOIA 3V6DA 3TTDA 1JLBA 4KHUA 3HJFA 3NH1A 3P31A 4GW6A 4DTPA 2W42A 3FLCO 4CJVA 3MXJA 2IGIA 3MECA 4EHTA 3KKSA 1RBVA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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