2FSKA

Crystal structure of ta0583, an archaeal actin homolog, semet data
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
326
structure length
321
Chain Sequence
MVVVGLDVGYGDTKVIGVDGKRIIFPSRWAVTETESWGIGGKIPVLSTDGGQTKFIYGKYASGNNIRVPQGDGRLASKEAFPLIAAALWESGIPVDLVIGSGTPLGTFDLEVKAAKEALENKVLTVTGPEGEVRQFNITRLIMRPQGVGAALYLLNQGIIEQQPGYGVVIDVGSRTTDVLTINLMDMEPVVELSFSLQIGVGDAISALSRKIAKETGFVVPFDLAQEALSHPVMFRQKQVGGPEVSGPILEDLANRIIENIRLNLRGEVDRVTSLIPVGGGSNLIGDRFEEIAPGTLVKIKPEDLQFANALGYRDAAERSM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an archaeal actin homolog
pubmed doi rcsb
molecule keywords hypothetical protein Ta0583
molecule tags Structural protein
source organism Thermoplasma acidophilum
total genus 90
structure length 321
sequence length 326
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF17989 ALP_N Actin like proteins N terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fskA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fskA01
2CGLA 2P9KA 4IZ9A 2BUPA 2Q1NA 5E26A 3GBTA 1U2VB 2J4RA 2IIRA 4B1VA 3CJBA 3I33A 1HUXA 4BR9A 3UKUB 2YHXA 2OANA 3EN9A 1MWKA 1GLFO 3CJ7A 4BGAA 5AZIA 4CD3A 4BG9A 3B8AX 4YDUC 2E2NA 3HM8A 1LCUA 5BRHA 4EIAA 4BRGA 2A3ZA 3KVGA 1NBWA 3H1VX 3DXKB 3MN5A 4WQ4C 2VWBA 3LDQA 5AQYA 3C7NB 2QXLA 5F1XA 1HLUA 3D2EA 1MWMA 4XEIA 3FZFA 4BRQA 3RSEB 3VEYA 3QDKA 3SLCA 4L3QA 1QQNA 5AQUA 4A61A 3M3ZA 4H0YB 2A42A 5BRFA 4CBXA 4A62A 5AQPA 3H45C 2CH6A 2QWQA 4NO7A 1NGEA 2FF6A 3FZMA 1RDWX 2P9IB 3WXLA 3HZ6A 3HBTA 4M63C 3WT0A 3VENA 2CH5A 1OKJA 3I8BA 3IMXA 2NRHA 4FL9A 1WUAA 1X3MA 4O5FA 3WEEB 2P9UB 1NGAA 2F9WA 4XH4A 3R8EA 4H03B 2ZWHA 5LY3A 4RTFD 5B8HA 3DXMB 4BREA 3A0IX 3JXUA 4H0XB 3WQTA 1K8KB 3IFRA 4BC4A 1NGGA 2FXUA 3EL2A 5AQVA 5JMVA 5KQDA 1SAZA 2VYPA 2QWLA 5AQZA 2NZTA 3CI5A 2D4WA 5AZJB 1NGHA 3ZEUA 3U8XA 3M6GA 4FWQA 5AFUH 3AAQA 2IVPA 3HI0A 1DGKN 3R9PA 4DB3A 3CQXA 4CBWA 4JAXA 3L0QA 2GWJA 5FPNA 1WOQA 3U4LA 3H1QA 3QFPA 4JHDA 3TPQA 3VF4A 2AP1A 1BA1A 4CJ7A 5AQGA 5AQOA 4I6MA 4GY2B 3MDQA 2QWMA 1S22A 1YXQA 1H1VA 2ASPA 4M7XA 3VEVA 1GLCG 3CJAA 3S41A 3QBWA 5I9EB 1QZ6A 2Q2RA 2E1ZA 2DPNA 1BOTO 4FWKA 2PAVA 2E2OA 3CHWA 4JNEA 1U2VA 3P4IA 3VERA 5AQRA 2ZGYA 4FWNA 5AQJA 3OHRA 1NGIA 2WUSA 2V51B 3GE1A 1NGDA 5AQNA 3FFKB 3A8YA 3VGKA 2HOEA 3ZETA 3UKUA 2YCHA 4ISFA 4CZKA 2FSJA 4M7YA 4CZIA 4YDUA 4J8FA 3CJCA 5AR0A 4BVPA 3VEWA 4GNIA 3VESA 2QM1A 2GUPA 4WQ4A 4BQLA 3FE1A 3MCPA 1ATSA 3D2FB 4K42A 1BUPA 4CZLA 3ID8A 2D0OA 3F9MA 1XC3A 2P9LA 3FR0A 1KAXA 1GLEG 1XQSC 3W3DA 4H5TA 3ATVA 5ELZA 4A2AA 2E2PA 4FSVA 2P9KB 3L6QA 4CI6A 3C7NA 3ENOA 1CZAN 3ULEB 3LDOA 3U9ZA 4H5WA 3VGMA 5TKYA 3W0LA 4ISEA 3A5LC 2E20A 2CGKA 3RSEA 3LDPA 3H46O 3ENHA 5E84A 4QS8A 1BWFO 1NGFA 3AARA 2I7PA 5LJVA 1P8ZA 1BA0A 1JCEA 3DAWA 2D0PA 4DCHA 5CE3A 3A5NC 1TYQB 1HKCA 5EVZA 2P9IA 1JCFA 3H3OB 4FWPA 3DJCA 4WQ5C 4BRDA 4F9OA 3O6WA 5BRDA 2E2QA 3CIPA 4B1WB 3HSCA 5AFUA 2YHYA 5BN9A 4FPAA 2QWPA 5EOYA 2BTFA 4ISGA 3FGUA 1XUPO 4FWRA 5AQXA 3O5BA 2P9UA 1BG3A 3H6EA 1V4SA 2V52B 1NLVA 5F0XA 1BO5O 4H5RA 3DXMA 4EFHA 1HPMA 4B9QA 5BR9A 4BR0A 1K8KA 1KAYA 2GEMA 1KXPA 3EZWA 1NM1A 1U6ZA 3ZX0A 3EKSA 1JCGA 2A40A 2FSNA 2IVOA 2YI1A 5AQLA 4K25A 1HJOA 1IG8A 2F9TA 2Q0RA 3DWLA 3L4IA 4CZHA 4BR7A 1YVNA 3MN6A 5AZJA 2P9PB 4XH1A 2Q0UA 3VGLA 4FWMA 3CETA 5AQMA 3WUHA 1HX1A 3TU5A 1MA9B 3CJ9A 1QZ5A 3QICA 2H3GX 3IDHA 5KPRA 3JS6A 4PKHA 3CQYA 3VEZA 4BR2A 3SMPA 1YUWA 2A5XA 4BQZA 4BG8A 4BRNA 3ZX3A 5AQIA 2ITMA 2GWKA 5KPTA 2QWOA 4C23A 2YJEA 4CZGA 3VETA 3O08A 4BVOA 3WXJA 4E1JA 3GG4A 4WYBA 1E4GT 3VEXA 3MN9A 4QS7A 4BRIA 2Q36A 5ADXH 2W41A 3HTVA 3LDLA 4HTLA 4NB4A 2P9NB 1NGCA 3GOIA 1QQOA 4RCHA 4BRKA 4BGBA 3C0BA 1T6CA 1KAZA 1HKBA 4CZJA 4JD2B 3FZHA 3AY9A 1GLLO 4IWVA 3J8AA 3O1BA 4IJAA 3D2FA 3SJHA 4FWSA 3SMSA 4HWIA 3R6MA 5KPZA 1QQMA 4H0TB 4JN4A 4K43A 2IVNA 2P9SB 3LM9A 4MO4A 1D4XA 1Z05A 2GELA 4FOIA 3UKRB 3A5MC 1G99A 2QW9A 4FWOA 3WXKA 3BUZB 5EY4A 3ULEA 1ZXOA 2A6AA 4FPBA 3DXKA 1ATNA 2AA4A 4MLEA 3BP8A 4CD1A 5AQHA 4CZMA 2Q97A 2W40A 4IXCA 1GLAG 3KHYA 5AQWA 4DQ8A 4EAHD 4BRCA 4BRLA 4BRFA 4MLHA 3ZETB 4WQ5A 4B1YB 1J6ZA 3GDQA 3ZX2A 4BC5A 5KQ8A 1IJJA 5AQSA 5AQQA 4CBUA 3LM2A 5JICA 3M1FA 3WQUA 1BU6O 2PBDA 5FPDA 3O80A 1TYQA 5BN8A 2NLXA 5FPMA 5AZIB 3D7EO 1X3NA 1S3XA 4BRAA 4QS9A 1YAGA 2P9LB 4FWLA 4B1XB 3AAPA 2ZF5O 3QB0A 3VF2A 4K41A 1V4TA 1GLJO 3CERA 1T44A 2HF4A 1ATRA 4BRHA 1LOTB 4PKIA 5EXWA 3FZLA 1ZBSA 3LL3A 3WEEA 1QHAA 5F2RA 1Q18A 5JLHA 1TUUA 2E1YA 4KBOA 3CJ1A 3BF1A 4DHYA 1TUYA 3D2EB 3KZBA 3U9DA 4FO0A 1EQYA 3EO3A 4BC3A 2ASOA 1ZC6A 3VF6A 2A41A 4BR5A 3MK6A 3ATUA 2FF3B 2P9PA 3VPZA 2VCPA 1Z6RA 1GLBG 2CGJA 2YHWA 3G25A 5ADXA 2D1KA 5BREA 4B1UB 4BR4A 4H5VA 5AQKA 1NWKA 3O4WA 2ZGZA 1BDGA 1NGJA 4EHUA 4PL7A 2YJFA 2Q31A 3IUCA 3WXIA 3H3NO 3BEXA 4EHTA 3LDNA 4BRMA 2I7NA 5BPNA 4O8KA 3QMLA 4H0OA 3VOVA 1DKGD 2GTDA 2QWRA 5EX5A 2UYTA 5AQTA 2FLOA 4BROA 5AQFA 1T6DA 4H5NA 4A2BA 4BC2A 5LJWA 2EWSA 4H0PA 2HF3A 1RGIA 1ESVA 3QFUA 1RFQA 2FSKA 2V7YA 2E8AA 5BPLA 2P9NA 4PL8A 3ZEUB 4RWTA 2V7ZA 4FOEA 5JLFA 3FZKA 1DEJA 4AM6A 1SZ2A 4JD2A 1C0GA 3A5OC 4H0VB 4BRPA 4Y0WA 1NGBA 1NMDA 4PKGA 1GLDG 3UB5A 1SQKA 4AM7A 1E4FT 4IJNA 4MO5A 2KHOA 2QWNA 4Z94A 4B1ZA 1HKGA 4CZEA 1Y64A 1R59O 3MMVA 3QBXA 3SK3A 3UE5A 4JHDB 3MN7A 2E88A 4XH5A 2P9SA 4I6MB 2ASMA 3EKUA 5FPEA 3UKRA 1X9JA 5BPMA 3FLCO 1MDUB 3VEOA 2HMPA 1C0FA 3BF3A 3O8MA 3O1WA 3GL1A 4LC9B 4IO8A 4CZFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JLHA 4GKKK 3O4NA 3THXB 4KTQA 1WBDA 4QCLA 5HRNA 5C42A 3AGRA 3O9QA 4Z4FA 3CJBA 4Z4GA 2YHXA 1T05A 5GAHP 2QA4N 4M3ZA 3DRRA 4CD3A 1IKWA 4DV4K 1DTTA 1KCFA 3B8AX 3NVKA 3MEDA 5TKWA 1X9MA 5BRHA 3RMCA 1BL3A 2A3ZA 4IG0A 3CC2N 3H1VX 3THYA 1QSSA 2VWBA 4MDAA 1YJWN 3IRXA 3DI6A 1QSLA 4W5RA 3C7NB 4CGIA 5FLXO 3AVAA 3AVHA 4XEIA 1XHZA 1M90O 4IEIA 4NCGA 1ASWA 3TSUA 3SLCA 2GBZA 2NNWA 3VA3A 2QWQA 1K73O 1JXBA 1KC8O 4DTXA 4KTWA 2P9IB 1W7AA 4HCBA 2B4JA 2P5GA 3SUPA 3WT0A 3V9ZA 4LF4K 2CH5A 3I55N 3I8BA 1LAWA 3IMXA 2NRHA 1C1BA 2KZZA 3I0SA 1HQUA 1WUAA 1NK5A 2P9UB 5C2DA 1KQSM 4F2SA 2EHGA 4YOUA 2ZWHA 1NOZA 2O8FA 2KW4A 4E0DA 1WNSA 4O4GA 3JXUA 3QEIA 4JK7A 3WQTA 3MEEA 3LZJA 4BC4A 1RBRA 1IH7A 1NGGA 5JMVA 3EL2A 3AO5A 1SAZA 3J81O 2QWLA 4K8ZA 1X9WA 3RRGA 1RCHA 1NGHA 3ZEUA 3M6GA 4FWQA 3NH2A 4M41A 3MECA 1HMVA 4PHTX 3R9PA 2UXCK 4CBWA 1ITGA 4AHTA 2GWJA 1WOQA 4O0JA 5CY4A 3H1QA 1QHTA 1L5UA 2G8VA 1YJ9N 4FCYA 1OVQA 1KSPA 5AQGA 2QWMA 1W9HA 1S22A 1H1VA 2PYJA 4IKFA 1BGXT 3CJAA 3QETA 5I9EB 4F3OA 3RWUA 1HYVA 4FWKA 3CHWA 3THXA 4JNEA 3PY8A 1SV5A 3GE1A 1TK8A 1Z26A 4ISFA 4CZKA 4CHNA 2FSJA 4CZIA 4YDUA 5LMUK 3CJCA 3KK7A 4EZ9A 3CCMN 4PQUA 4BVPA 3L2QA 1RBVA 2GUPA 4LH5A 1Q86O 1L3VA 3ZSVA 5HROA 1LW0A 4A5BA 4FJ9A 1XC3A 3FR0A 1XQSC 4H5TA 4FLZA 3K59A 1NK7A 3TAEA 1ZBLA 1C0TA 1VQNN 3SQ2A 3C7NA 3M8SA 4AHVA 3NH0A 4KV8A 5DM7L 3A5LC 5IWAK 1NKCA 4KHWA 3NCIA 2YNFA 3ENHA 4ZTFA 3S9HA 4Z4EA 1NGFA 3AARA 2I7PA 3HVRA 1JCEA 1LAVA 3MXIA 4DCHA 4JI3K 3AA5X 1L3UA 2XHBA 3SPYA 2P9IA 4FWPA 1Y97A 4WQ5C 3AA3A 4E19A 4FJGA 5GAEP 4B1WB 3CC7N 1A5WA 4X64K 3AVIA 2QWPA 4IG3A 4LF7K 1XUPO 3HL8A 4JK9A 4RW7A 1EXQA 3O5BA 4O0IA 2P9UA 1YJNN 3V1OA 4L8RB 2DFFA 1V4SA 4JV5K 1YTUA 2V52B 1NLVA 3N4PA 5F0XA 1SL2A 4ELTA 2HW3A 4B9UA 3EYZA 1NK8A 3LALA 1K9MO 3C95A 1N32K 4F3TA 2IVOA 3CCEN 1NOYA 3V1RA 4XH1A 4ID1A 3SI6A 1VAZA 1D9DA 1ZBHA 4DR1K 5GINA 4FWMA 4MFBA 1VSHA 2BE2A 4M42A 1P90A 1TKXA 3TU5A 1QZ5A 2IOCA 2QKKA 4FJ8A 2YX6A 1YVUA 4PKHA 2XY8A 3VEZA 4DWIA 2W42A 3Q7CA 1RNHA 4BQZA 5KRSA 4BG8A 3ZX3A 3OYGA 4YOTA 2BH1A 4KB0A 4CZGA 1ZBUA 3O08A 1J5EK 1VQ5N 5KI6A 1SL1A 4BVOA 3G6EN 2UXDK 2RPIA 4CHYA 4BWJA 4YOXA 1HQEA 4DV0K 3SUQA 2WONA 4RW9A 4QS7A 3NMUA 2Q36A 2W41A 1FW6A 4Z4HA 4BGBA 3C0BA 4LY7A 4JI6K 1T6CA 2BGGA 3VTHA 4JI4K 4JD2B 3OS1A 3AY9A 1JLEA 4FJ5A 4DV7K 3F9KA 4Y1CA 4DFJA 1RBSA 4IOCL 2HNYA 3L2RA 4ZTJA 3R6MA 3PIOL 1S9GA 3CXCM 4LF5K 3S3OA 4Z0UA 4FJ7A 1EWQA 3LM9A 4KH5A 1JKHA 2GELA 4IDHA 2G8IA 3BUZB 3QO9A 2A6AA 4OGEA 1G15A 3DXKA 4HVJA 3OYCA 3BP8A 4B8CA 5AQHA 3CM5A 4TSXA 4EAHD 3ISNC 4KO0A 1N8RO 4BRLA 4IO9L 1N5YA 3AO1A 1NK6A 1JL2A 4CHQA 2ZQBA 5AQSA 5AQQA 1RT2A 5JICA 3QEPA 3O80A 3T7ZA 4LF6K 3CD6N 2NLXA 3P38A 3ZCMA 1S3XA 2HSTA 1Q7YO 3E01A 5SZTA 4JI0K 3T3FA 4B9SA 3CQ8A 4K41A 3AO4A 3SCXA 2G8WA 4O5BA 3MWTA 4HCCA 4BRHA 2XY7A 3DLHA 4WE1A 3MWPA 3WNFA 5EXWA 4CJWA 3O9TA 1Q18A 4M3TA 4F4KA 3CJ1A 3D2EB 3KZBA 3F2KA 3EO3A 3KK3A 1VQ8N 3VF6A 5MLCQ 2A41A 4BR5A 4E7HA 1WSJA 5HRRA 3MK6A 3HXMA 3RR7A 5EU7A 4N56A 1Z6RA 4B08A 1RT7A 3M8RA 1BIZA 2BDPA 4B1UB 4RG8A 3PUFA 3LPTA 1J54A 2BANA 4CEZA 1NJIO 4FLVA 4WFNL 3K0SA 3OBYA 4KHSA 3O3HA 1RT6A 3UIQA 4CEFA 4B3TK 5EX5A 2UYTA 3AVFA 5AQFA 4B9MA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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