2FSKA

Crystal structure of ta0583, an archaeal actin homolog, semet data
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
326
structure length
321
Chain Sequence
MVVVGLDVGYGDTKVIGVDGKRIIFPSRWAVTETESWGIGGKIPVLSTDGGQTKFIYGKYASGNNIRVPQGDGRLASKEAFPLIAAALWESGIPVDLVIGSGTPLGTFDLEVKAAKEALENKVLTVTGPEGEVRQFNITRLIMRPQGVGAALYLLNQGIIEQQPGYGVVIDVGSRTTDVLTINLMDMEPVVELSFSLQIGVGDAISALSRKIAKETGFVVPFDLAQEALSHPVMFRQKQVGGPEVSGPILEDLANRIIENIRLNLRGEVDRVTSLIPVGGGSNLIGDRFEEIAPGTLVKIKPEDLQFANALGYRDAAERSM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an archaeal actin homolog
pubmed doi rcsb
molecule keywords hypothetical protein Ta0583
molecule tags Structural protein
source organism Thermoplasma acidophilum
total genus 90
structure length 321
sequence length 326
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF17989 ALP_N Actin like proteins N terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fskA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fskA01
3EO3A 1BO5O 3JXUA 3MK6A 4I6MA 3GG4A 2FSNA 2UYTA 1BUPA 1ATNA 5AQIA 1JCEA 1YAGA 3IMXA 1HJOA 3U4LA 5E26A 3M1FA 3CQXA 4PL7A 5AZIA 4K43A 4XH1A 3CJ7A 3D2EB 3G25A 3QICA 4CBUA 1BOTO 3FZHA 1ZC6A 2IVPA 1RFQA 3JS6A 3UB5A 2A41A 1HX1A 5AR0A 3SLCA 3QFUA 1BWFO 2CH5A 5E84A 5AQZA 2AP1A 3W3DA 5AFUA 4WQ5C 2W41A 5AQSA 2WUSA 1X3MA 1NGDA 3WXKA 1NGHA 2A6AA 2QWOA 2P9NB 2NRHA 3FR0A 1MWMA 1BU6O 1TUYA 4BRHA 5B8HA 4MO5A 2YJEA 5KPTA 2ZWHA 1X9JA 1NBWA 3AARA 3WEEB 3VF2A 3WXJA 3CIPA 3ZEUA 2Q1NA 2W40A 4JHDA 2FXUA 3IUCA 2E1YA 3O1WA 2PAVA 1GLJO 1RGIA 2GUPA 2P9IB 3MMVA 4FPBA 3DXKA 5KPZA 5FPNA 4CZKA 3VF4A 1ESVA 4FWPA 3I8BA 2D1KA 2E8AA 2ASMA 2PBDA 3BP8A 3O80A 4BR5A 3DXMA 2GELA 1GLEG 4DHYA 3VEXA 1Q18A 1V4TA 5AQJA 2F9TA 3EKUA 2Q36A 2ITMA 4K42A 4B1ZA 4FWMA 4MO4A 5AQMA 1NGGA 5BPNA 3M6GA 3LDNA 4IJNA 2P9UB 3VOVA 4ISGA 4QS9A 1HLUA 3ULEA 1NGJA 3D2FA 3UE5A 3H46O 4XH5A 3ZETB 5EXWA 5FPDA 2YJFA 1NLVA 3VGMA 1XC3A 1NM1A 1SQKA 1YXQA 4YDUA 4BRGA 3GL1A 3IDHA 3P4IA 4IJAA 3C0BA 3CETA 2V7YA 1Y64A 4O5FA 3SMPA 4IWVA 2FSKA 3R9PA 1WUAA 1S22A 3C7NA 3M3ZA 3H1QA 2F9WA 5AQLA 3O6WA 5KQDA 1DGKN 4JN4A 1ATSA 2CGKA 4BC3A 1QZ6A 5KPRA 1TYQB 3L0QA 3BUZB 4E1JA 2QW9A 4XEIA 5AQKA 4KBOA 5FPEA 4BR0A 1J6ZA 2CH6A 2D0PA 5AFUH 4EIAA 3HZ6A 3DWLA 3AY9A 5ELZA 5EX5A 3QBXA 4BR9A 5AQWA 5AQYA 3FZFA 3U8XA 2P9PA 1MDUB 3ENHA 4HTLA 5JLFA 3B8AX 2QWNA 3CJ1A 3FGUA 4IZ9A 3WUHA 1MWKA 5F2RA 2GWJA 2FSJA 2FLOA 5AQHA 4A61A 2I7PA 4BRAA 2IIRA 3ID8A 2YCHA 1QHAA 4F9OA 4FWNA 5AQUA 3LDQA 4ISFA 3AAPA 5AQVA 1K8KA 4BRIA 2P9SA 3ZEUB 5EY4A 3R8EA 5CE3A 5BRFA 2ZF5O 3L4IA 4H5NA 1KXPA 2E2OA 5BRDA 2A42A 4MLEA 3KHYA 4DCHA 3CJCA 5AQOA 3DXKB 2Q0UA 3O4WA 5ADXH 4A2AA 5I9EB 4CZMA 3SMSA 3UKUA 3A5NC 2VWBA 4J8FA 3QB0A 3FZMA 4WQ4A 2GWKA 1KAXA 3UKRA 1XUPO 3MN5A 3OHRA 3VF6A 1BDGA 2HF4A 3DXMB 3TU5A 3LL3A 4B1WB 1XQSC 5KQ8A 4EAHD 4JD2B 1BA1A 2CGLA 4PL8A 4YDUC 3RSEA 1HKGA 4JNEA 4QS7A 4CZIA 2YHWA 3ZX3A 1E4GT 1ATRA 2IVOA 4FWQA 3I33A 2D0OA 3ULEB 3A5LC 3CERA 4K41A 4BREA 4O8KA 2QWLA 2P9KA 2FF3B 2V51B 4DB3A 2YHYA 3SK3A 4FWSA 5ADXA 3CJAA 4H0VB 2BUPA 2E2NA 2HF3A 4A62A 2QWRA 2QWMA 1S3XA 1KAYA 3D2EA 4CZEA 3C7NB 2AA4A 1HKCA 2J4RA 3WQUA 2IVNA 3BF3A 1NGBA 2DPNA 1NGCA 3VEWA 3CJ9A 4AM6A 3DJCA 4BRNA 2A3ZA 3VEOA 2E20A 4CZJA 4WYBA 4BG8A 4H0XB 4C23A 4CI6A 3H3NO 3W0LA 3GDQA 1P8ZA 3ZX2A 1GLDG 4IO8A 4JAXA 4FWOA 3WQTA 4BR2A 4RCHA 1OKJA 4FWLA 1T6DA 4H0YB 2YI1A 4CJ7A 4BC4A 3LDPA 3QBWA 4CD3A 5BREA 1HPMA 4BGAA 4I6MB 3FE1A 4BQZA 1NGIA 4FOIA 1YVNA 1C0GA 3ATVA 1LCUA 4M63C 4BRPA 3FZLA 3GE1A 4BR7A 4Z94A 4B1VA 4H5WA 5LJVA 3BEXA 3HSCA 5AZIB 1C0FA 4WQ4C 1EQYA 2P9SB 4B9QA 4CZLA 3S41A 3LDLA 3VESA 4BRCA 5BN8A 3EN9A 2QWPA 4H0OA 4PKGA 3VPZA 1U2VA 4ISEA 1QZ5A 3WT0A 1BG3A 3R6MA 3A0IX 3MDQA 1GLFO 3ENOA 4FWKA 2QXLA 3VERA 3QMLA 5AQXA 2E88A 4CZFA 3QFPA 3WXIA 5JICA 4HWIA 4CD1A 1ZXOA 4FWRA 2I7NA 3EL2A 3MN9A 2YHXA 1QQMA 2NLXA 4EHTA 4B1UB 2FF6A 3U9DA 2Q2RA 1RDWX 2ASOA 4BVPA 1E4FT 3HM8A 4DQ8A 2VYPA 2E2PA 4NO7A 4JHDB 1NGEA 2P9LA 3J8AA 3HTVA 5BRHA 4CZHA 5AQTA 2P9KB 5BR9A 5BPMA 5LJWA 3DAWA 2E1ZA 3CJBA 4PKHA 4RWTA 3VEZA 4BR4A 4FO0A 4BQLA 4H5VA 4EFHA 3VGLA 3FLCO 1TYQA 3O5BA 4AM7A 1MA9B 2GTDA 2Q31A 1Z6RA 4BRDA 1GLBG 4M7YA 3EZWA 2CGJA 3KZBA 3WXLA 4QS8A 2ASPA 1DKGD 4CZGA 5AZJA 1JCGA 3QDKA 1QQOA 5JMVA 4BRQA 5AQRA 3H3OB 3U9ZA 2ZGZA 4FPAA 5FPMA 4BC5A 3D2FB 2HOEA 2D4WA 1G99A 2Q97A 3AAQA 4BC2A 3O1BA 3CI5A 4NB4A 4FL9A 2V7ZA 3VEYA 4Y0WA 3LM2A 3VEVA 1GLAG 3EKSA 3ZX0A 3GBTA 1T6CA 4BRFA 1CZAN 4B1XB 1H1VA 4GY2B 3GOIA 1T44A 3L6QA 4BROA 3BF1A 5AQQA 1SZ2A 2E2QA 2VCPA 3FFKB 4FOEA 2V52B 4H0PA 4K25A 3H6EA 3O08A 3ATUA 3D7EO 4A2BA 3VENA 2GEMA 5AQNA 5LY3A 1IG8A 1GLCG 2A5XA 4M7XA 2Q0RA 4B1YB 3TPQA 3A8YA 4CBXA 1DEJA 3H45C 3KVGA 2NZTA 4BGBA 1IJJA 4CBWA 5BPLA 4IXCA 4H0TB 4RTFD 2P9NA 1NGFA 1U2VB 1WOQA 1X3NA 2QM1A 2ZGYA 1NWKA 1V4SA 2A40A 4JD2A 4BRMA 4H03B 3MN6A 4FSVA 4WQ5A 4LC9B 3WEEA 2P9PB 4BVOA 1ZBSA 3SJHA 1SAZA 2H3GX 4PKIA 1JCFA 3LDOA 1YUWA 2OANA 2P9IA 3HBTA 3F9MA 5AQGA 4GNIA 1NGAA 1HUXA 1TUUA 2KHOA 3CQYA 3MCPA 2HMPA 1QQNA 1K8KB 3MN7A 5BN9A 1U6ZA 2P9LB 5AQFA 1Z05A 5TKYA 4BG9A 4BRKA 3HI0A 4XH4A 3UKUB 4H5TA 2BTFA 3FZKA 1LOTB 2QWQA 1D4XA 3A5OC 3UKRB 2P9UA 3H1VX 1KAZA 2EWSA 5F1XA 3CHWA 4BRLA 5JLHA 5F0XA 3ZETA 4EHUA 3IFRA 3VGKA 3LM9A 5EOYA 4MLHA 1R59O 5AQPA 5AZJB 3RSEB 3A5MC 3O8MA 1BA0A 5EVZA 1HKBA 1NMDA 1GLLO 4H5RA 3VETA 4L3QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IKFA 2G8FA 1BO5O 3NE6A 2HNDA 4F3TA 4DUZK 4CJLA 1HJOA 5C25A 3U4LA 4B9SA 3ZLJA 1UA1A 2Z1GA 3PUFA 1EETA 3D2EB 3QICA 4AHCA 2VG7A 3FZHA 4U7BA 4FJ9A 3ZCMA 1TGOA 1JLFA 1HX1A 4CGFA 2HBJA 4JI4K 1R0AA 2WFBA 1NK0A 1BWFO 3AA5X 5E84A 4CE9A 3BZKA 1W7AA 4KFBA 2W41A 3OYAA 3CXCM 1D5AA 4C1NK 3KK3A 3CCUN 3WXKA 2A6AA 5LMUK 3OBWA 4ICLA 4LF9K 1UAXA 2O8BB 4BDYA 1TUYA 4MO5A 1X9JA 3AARA 5M1PA 3WEEB 1VK0A 3G71N 3B6PA 5JS1A 1NK5A 2XY8A 2WTUA 2OYQA 1BQNA 4LSNA 2PAVA 4LFAK 5A2QO 4DTSA 4MFBA 3DXKA 4KH4A 4NXMK 5HRPA 3SUOA 4CZKA 5GIOA 1BIZA 1ASVA 4FWPA 3I8BA 2D1KA 1P90A 1VSJA 4DV0K 4DTOA 2GELA 1UA0A 4BDZA 4CF0A 3MAQA 5AQJA 1WSFA 4DQSA 2F9TA 2ITMA 4K42A 4Y1CA 1RBRA 3AVGA 3OVNA 4PWDA 1WN7A 1ZYQA 3M6GA 4DTUA 2G8VA 3ULEA 4XH5A 3CFRA 4GVEA 2W6KA 2YNGA 1Z25A 3NF9A 1XC3A 1SQKA 2KW4A 1L3TA 2ETJA 3C0BA 3CETA 3SMPA 1S1WA 3CCQN 3B6OA 4IWVA 3HPGA 3SBGA 4BWJA 4B08A 5AQLA 1ZBUA 3VQ4A 3V9SA 3O3FA 3J7YP 2AJQA 1LAWA 4JKEA 1QZ6A 3PX0A 1IKYA 3BUZB 2HBMA 5HOOA 2E6LA 4CGHA 3THYA 4XEIA 4E1MA 1WNSA 4EIAA 3HZ6A 3CC4N 4RW4A 2VWKA 4KKOA 3QEXA 2XRIA 1OH5A 3TAFA 5JLFA 3S3OA 3KK2A 3CJ1A 4IZ9A 3WUHA 4E3SA 2VGNA 3CCRN 4A61A 4LY7A 4DU3A 4FJJA 5I42A 3ID8A 3NCIA 1Q82O 2O8EB 4Z4CA 3TAMA 4JI5K 1K8KA 4DF8A 4CEOA 3KWIA 2ZF5O 4BE2A 2D5RA 4H5NA 1RTIA 4JS5A 3CYMA 3KWGA 4MLEA 2HHTA 3KHYA 5I9EB 3DXKB 3O9UA 4O4GA 4NLCA 4CZMA 1S6QA 3SMSA 4AHVA 1ASWA 4OPAA 1TAUA 1XUPO 3VF6A 4DV6K 1BDGA 1TVRA 1RT2A 1L3SA 1HQEA 1BA1A 4FJGA 2QEXN 3RSEA 3NGZA 4M3UA 2HBLA 4FZYA 4YOUA 3KKSA 4JI8K 3ZX3A 1ATRA 3VQAA 3VQ9A 2GBZA 3ULEB 4BREA 2E5LK 1KLMA 2V51B 1N32K 2DFFA 4E7KA 2Z1HA 3DLHA 1Z26A 4KHYA 2O8DA 5ADXA 1XMOK 4ELTA 3HOSA 2OPPA 1VRTA 1KAYA 2HVHA 2ZJPL 4K8XA 2I5JA 4CEEA 2AA4A 4GKKK 1RT6A 4OJRA 3VQEA 2J4RA 2PZSA 4W5NA 3L3VA 4KHQA 3DI6A 1VQ6N 3BF3A 3VEWA 4CEAA 4CGIA 5J2NA 3VEOA 4OLBA 4CZJA 4CHOA 4B9MA 1FW6A 4AF1A 4H0XB 2WOMA 4CERA 4CI6A 2BANA 1GLDG 4IO8A 3WQTA 3KIOA 3O4NA 4RCHA 3VQ8A 2O4GA 2YX6A 4CJ3A 2YI1A 3S9HA 1XHZA 4TSXA 1C0UA 4CD3A 4I6MB 3V9UA 4FOIA 4CEZA 1C0GA 4M3RA 3FZLA 3GE1A 3E9OA 4BR7A 4Z94A 3DRRA 2YKMA 4WE1A 3V6DA 4WQ4C 1O1WA 1C0TA 4AHSA 1VQON 4X64K 3G4SN 2D0AA 1XMQK 1HYVA 5HLFA 1IKVA 1K6YA 3EEQA 3VPZA 4PKGA 1QZ5A 1UOCA 3R6MA 3A0IX 1GLFO 4CJVA 4H4OA 4HUEA 4FZXC 4Z4HA 4DLEA 4CEBA 4CZFA 4ID5A 3WXIA 3VQQA 1L5UA 4FWRA 2I7NA 3LZIA 3NH1A 3MN9A 4PHTX 3SJJA 3CCLN 1QQMA 2KZMA 1VSIA 5JS2A 4B1UB 1A5VA 1JLQA 3U9DA 4CJWA 4RW6A 1W97L 3DLRA 2ASOA 3TTFA 4XIUA 3HM8A 4YOWA 1RT1A 4JHDB 1NGEA 3NDKA 1VSHA 3DAWA 3ZSQA 4PKHA 3R3LA 3QETA 2O4IA 2O8DB 3P83D 4H5VA 4FJKA 5FRNA 3FLCO 3O5BA 4AM7A 1MA9B 2GTDA 3TSPA 1IBKK 4BRDA 4CGGA 3OW2M 3EZWA 3AA4A 2CGJA 3SI6A 1HYSA 3CM5A 4CECA 3MWPA 1DKGD 1RDDA 3THXB 4CFAA 1JCGA 3ZSVA 2ATQA 3CD6N 3U9ZA 3NVKA 4FPAA 3LPUA 5FPMA 4KHWA 2UXCK 2RF2A 3D2FB 4DTJA 3U3GA 4DTXA 4KPYA 2ZM6K 4ELUA 2G8HA 3N4QA 4Y0WA 3LM2A 3VEVA 1GLAG 3OJUA 3GBTA 2A1RA 1T6CA 4BRFA 4PY5A 1TV6A 2IS3A 4BROA 3BF1A 3J7ZO 1KRPA 4K25A 3O08A 1VAZA 3ATUA 3D7EO 4DTRA 5LY3A 1IG8A 2A5XA 3HP6A 4M7XA 4B1YB 1DEJA 2GX9A 2NZTA 1WBDA 3I55N 1IJJA 4CBWA 4O0JA 3HXMA 5J2QA 1NGFA 1WOQA 2ZGYA 4FJMA 1V4SA 1C6VA 2A40A 4DS5A 1RBUA 4YORA 3MN6A 2G8WA 1Q8IA 3J80O 3DLGA 3JAMO 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2PY5A 1Q18A 4OO1J 2HHWA 3TAGA 3TAQA 3KLHA 1NGGA 3H08A 3LDNA 3QIPA 1S5JA 1KQSM 1KD1O 1QTMA 4Q5VA 1E3MA 3C95A 1HLUA 3KLEA 3THVA 4M3XA 5FPDA 3VGMA 5C10A 3AA3A 2KFNA 4BRGA 3P4IA 2HMIA 4DU4A 1U04A 1Y64A 3OYHA 3I8DA 3C7NA 4KTZA 3RMCA 3O6WA 5KQDA 5KRSA 1NK4A 1KFSA 5TKWA 3SQ1A 3MEDA 3VQDA 5KPRA 1TYQB 3L0QA 3ALYA 4JKFA 4CW7B 1YIJN 1QVFM 4YOVA 4I7FA 4KBOA 1J6ZA 2KTQA 4DSLA 3CCMN 4JKBA 5AFUH 3T3FA 4BR9A 2DFHA 3ZT1A 3U8XA 1VSKA 1MDUB 4HUFA 1CXQA 2QWNA 1KFDA 1MWKA 5F2RA 1OH6A 2FSJA 2FLOA 4JKDA 5AQHA 2IIRA 4JKCA 2YCHA 3QIOA 1QHAA 3PO5A 4FVUA 4O5BA 3TSUA 3ZSWA 3LDQA 4ISFA 3SZ2A 2P9SA 5EY4A 3R1XA 3CMEN 4FLUA 3VA0A 3L4IA 1KXPA 4FLWA 2E2OA 5HROA 3KLGA 1N5YA 4B3MK 1B9DA 3RMDA 3OYKA 3L2VA 4DMNA 1NG9A 5AQOA 2Q0UA 3SAHA 3AVCA 4A2AA 3HPOA 4FJ8A 3A5NC 2YHAA 4J8FA 2P51A 4WQ4A 3K58A 1C0MA 1RDUA 1IBMK 4MDAA 3NH2A 4OKEA 3MN5A 3OHRA 3MXJA 1VQPN 1I94K 2HF4A 3AVNA 4U67L 4B1WB 5JVGL 5KQ8A 3EE8A 4JD2B 4YDUC 4KB1A 4CZIA 3S3NA 3ASMA 4DG1A 4J2AA 3AA2A 2VQEK 2D0OA 1SS6A 4BWMA 3A5LC 4OPKA 3MCAB 3PLAA 1VQMN 4CF8A 2ZJRL 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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