2FSNA

Crystal structure of ta0583, an archaeal actin homolog, complex with adp
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
325
structure length
310
Chain Sequence
MVVVGLDVGYGDTKVIGVDGKRIIFPSRWAVTIPVLSTDGGQTKFIYGKYASGNNIRVPQGDGRLASKEAFPLIAAALWESGIHVDLVIGSGTPLGTFDLEVKAAKEALENKVLTVTGPEGEVRQFNITRLIMRPQGVGAALYLLNQGIIEQQPGYGVVIDVGSRTTDVLTINLMDMEPVVELSFSLQIGVGDAISALSRKIAKETGFVVPFDLAQEALSHPVMFRQKQVGGPEVSGPILEDLANRIIENIRLNLRGEVDRVTSLIPVGGGSNLIGDRFEEIAPGTLVKIKPEDLQFANALGYRDAAERS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an archaeal actin homolog
pubmed doi rcsb
molecule keywords hypothetical protein Ta0583
molecule tags Structural protein
source organism Thermoplasma acidophilum
total genus 71
structure length 310
sequence length 325
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF17989 ALP_N Actin like proteins N terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fsnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fsnA01
4YDUA 4BRDA 1HKBA 1BU6O 3CERA 3QB0A 1NWKA 4JN4A 4CBWA 4IJNA 1BUPA 2DPNA 1ATRA 1RGIA 4FSVA 4AM7A 1JCGA 3VEVA 4BC2A 3DWLA 4JHDA 1QZ6A 2OANA 2HF4A 2P9PB 3I33A 4MO4A 4CZGA 4ISFA 2FSKA 4H5WA 2GWJA 5BREA 2BUPA 3LL3A 3SMSA 2E2NA 3HSCA 4ISEA 4LC9B 3AY9A 2E8AA 3DXKB 3O1BA 4BROA 3QBXA 1KAZA 2GUPA 4A2BA 1GLCG 4BC4A 1YVNA 2YHYA 4H5RA 3ZEUB 4FPBA 5F1XA 3LDPA 1BWFO 2P9SB 4F9OA 3CQXA 1HUXA 4BRLA 3U9ZA 3CJBA 2A6AA 4B1UB 5BRDA 2HMPA 4BRAA 3GBTA 2PBDA 2QW9A 2ZGYA 3ZX2A 3VETA 5LY3A 5AZJA 5ADXH 4BG9A 1Z6RA 2ITMA 3FGUA 4BVOA 4K42A 4BGAA 4BR9A 4CBXA 3LDLA 3W0LA 1GLJO 3MMVA 2Q0UA 5BPMA 1KXPA 5EY4A 4QS8A 2E1YA 5AQRA 4A62A 4JHDB 4BRQA 1X3NA 4DQ8A 5EOYA 4EIAA 3U4LA 3QMLA 1QQMA 3A0IX 3UKRB 5AFUA 4BRKA 5E26A 3FZMA 3O08A 4FWKA 5BN8A 3M3ZA 1U2VA 3WEEA 3MN5A 3R9PA 4XH4A 1TYQA 1BA1A 3VESA 2CGLA 5KPTA 2E2OA 3H46O 2QWLA 4J8FA 3WXIA 2VCPA 2P9NB 1P8ZA 5BN9A 4IWVA 1YXQA 3CHWA 3H6EA 3QFUA 5JICA 3FLCO 3ZETA 4AM6A 1Z05A 3CJ7A 4RWTA 1EQYA 4WQ4C 5AQJA 3EKUA 2ZGZA 4FWQA 1BDGA 3VPZA 1WUAA 4M63C 4EHUA 3EL2A 3CETA 2QWOA 5AQVA 3ATVA 5AZJB 1QQNA 2D1KA 1E4FT 1HJOA 1MWMA 5AQXA 1NGHA 1NM1A 1ZC6A 3VF2A 4IZ9A 3GG4A 1C0GA 2EWSA 3L6QA 2YI1A 2E2QA 4H0TB 3P4IA 1XC3A 4FWPA 3IFRA 3VENA 2IVOA 3JXUA 4Y0WA 4B1ZA 3A5MC 1KAXA 3FFKB 5ELZA 2FXUA 1CZAN 3HI0A 3CJ1A 5EXWA 4EAHD 1IG8A 4CZLA 3RSEA 3WEEB 4YDUC 4CD1A 3HBTA 3SJHA 2E2PA 5EX5A 1TYQB 4FWNA 3LM9A 1BOTO 4FOEA 3D2EA 1J6ZA 1DGKN 1RDWX 2NZTA 4K43A 4K41A 3AARA 2YJEA 3SK3A 4BQLA 2AP1A 1D4XA 2V7YA 3FZFA 3HTVA 4IXCA 1NGAA 3VEXA 3BF1A 3ZETB 5AZIA 1NGCA 3LDOA 5KPZA 1QHAA 3FE1A 3BEXA 3LDNA 2AA4A 2QWNA 1S22A 2CGKA 4BRNA 4WYBA 4RTFD 2A3ZA 1Y64A 3BP8A 5KPRA 2A40A 2I7NA 4XH5A 1MWKA 4H0YB 3A5OC 5FPNA 4CZEA 1GLLO 2V51B 1V4SA 1ZBSA 4H0OA 3ZX3A 3VEOA 1NGGA 2YJFA 3EN9A 5CE3A 3CJ9A 4BRIA 2Q36A 3QBWA 3H3NO 4RCHA 4K25A 4QS7A 4BR0A 3O8MA 3CJCA 3MN6A 4FWRA 1YUWA 3WQUA 4E1JA 2HOEA 3F9MA 2P9KA 4I6MA 2P9UA 3TU5A 3RSEB 4BR2A 1X3MA 4B1YB 1G99A 2Q31A 2WUSA 5AQNA 5AQYA 3D2EB 1C0FA 3WQTA 2KHOA 4KBOA 4H0VB 2GELA 4EHTA 1BG3A 4PKIA 5AQGA 4BGBA 2Q2RA 3UB5A 3ZX0A 5AZIB 2YHXA 2ZWHA 3R8EA 1XUPO 5BRFA 2FF3B 2P9IA 2QXLA 2CH6A 2Q1NA 4FWSA 3VF6A 3QICA 3SLCA 2P9LA 3C7NA 3IMXA 3L4IA 4MO5A 3U8XA 4CJ7A 4DB3A 3A5LC 2QWQA 5KQDA 3UKUA 1OKJA 4M7XA 5JLHA 3QFPA 4H5VA 3FZLA 2E88A 3O1WA 5JLFA 4CBUA 3VERA 4H03B 2I7PA 5ADXA 1HX1A 1V4TA 3VEZA 1SZ2A 3CIPA 3QDKA 4ISGA 5AQHA 2V52B 4B1WB 1U6ZA 5AQMA 2J4RA 1GLEG 4XEIA 3SMPA 3GL1A 2FLOA 5AQTA 5F0XA 5BPLA 1GLAG 3M1FA 4H0PA 2P9KB 5AQWA 4I6MB 2P9UB 3O80A 1KAYA 5FPDA 5AQPA 2HF3A 3H1QA 1LCUA 4QS9A 4CZIA 3H1VX 3FZHA 4A2AA 3TPQA 4NO7A 4WQ4A 3DXMA 4B1XB 1ATSA 3VGMA 1NLVA 1HPMA 2A5XA 2GTDA 1MA9B 1X9JA 1LOTB 4H5NA 4JD2A 5I9EB 5JMVA 1NBWA 5LJVA 3JS6A 3EKSA 4BREA 2P9IB 4BRGA 2IVPA 2P9LB 3C7NB 3O4WA 1JCFA 3L0QA 1GLBG 1U2VB 4WQ5A 4DCHA 2ASOA 3ENHA 5BRHA 2PAVA 3VF4A 1SAZA 1H1VA 2CH5A 4MLHA 3AAQA 3ULEA 3BF3A 4BRHA 1HLUA 5B8HA 2V7ZA 3G25A 5LJWA 4BQZA 4CI6A 1E4GT 5AQZA 1DKGD 3M6GA 4C23A 2FSNA 3D2FA 4O8KA 4L3QA 3J8AA 4BRFA 4FO0A 3U9DA 4DHYA 4H0XB 4BR4A 2W41A 4H5TA 4CZFA 1Q18A 1MDUB 3IUCA 2BTFA 2VYPA 3I8BA 4PL7A 3OHRA 4PL8A 3C0BA 3DXMB 5AQIA 1NGDA 2IVNA 3VEWA 4HWIA 4JD2B 1ESVA 1YAGA 5FPEA 3H3OB 1T6CA 1TUUA 2GWKA 3DJCA 3EO3A 2D0OA 4PKHA 3FR0A 1QQOA 1JCEA 2QWRA 3BUZB 3UKRA 4FWLA 3AAPA 4O5FA 2NRHA 5AQOA 2IIRA 2Q0RA 3WXKA 1TUYA 4XH1A 1S3XA 4NB4A 1HKGA 3GE1A 1GLFO 2P9NA 2VWBA 4CZHA 5AQUA 1WOQA 2A42A 2QM1A 3B8AX 3CJAA 5AFUH 3GDQA 5AQKA 3KVGA 3ULEB 5TKYA 3HZ6A 1ZXOA 2E1ZA 3MN7A 3LDQA 4JNEA 1RFQA 4M7YA 3D2FB 5AR0A 4BG8A 4PKGA 5AQSA 1K8KA 4CD3A 1R59O 5AQLA 1IJJA 4GY2B 4IO8A 3CI5A 4FWMA 3H45C 4B1VA 1NGBA 5AQFA 4EFHA 2QWMA 2FF6A 2W40A 1DEJA 3IDHA 2ZF5O 3D7EO 4A61A 1T44A 2F9WA 4IJAA 2A41A 3VOVA 2GEMA 1T6DA 3ENOA 2YCHA 3O5BA 3LM2A 1BO5O 3MN9A 5BR9A 5EVZA 4FWOA 4BC3A 3WT0A 2H3GX 3EZWA 3R6MA 3WXLA 3ATUA 3VGLA 2FSJA 4BR5A 1ATNA 2D4WA 5FPMA 3MDQA 3KHYA 3MK6A 1SQKA 2Q97A 2YHWA 1XQSC 4FL9A 3ID8A 1NGIA 2CGJA 3VEYA 4GNIA 1QZ5A 5KQ8A 4FOIA 1NGFA 5E84A 4CZKA 2P9PA 1GLDG 3A8YA 4BR7A 1NMDA 1K8KB 3MCPA 4B9QA 2E20A 3WUHA 3DXKA 2UYTA 3FZKA 1HKCA 3WXJA 2D0PA 3UKUB 3W3DA 4BRCA 4FPAA 3DAWA 3GOIA 4BC5A 4HTLA 3O6WA 4Z94A 4WQ5C 3ZEUA 2QWPA 2F9TA 3KZBA 3S41A 3CQYA 3VGKA 2P9SA 3HM8A 5AQQA 1NGJA 4MLEA 5F2RA 2ASMA 2ASPA 4BRPA 4CZJA 3UE5A 1NGEA 1BA0A 4JAXA 4CZMA 4BVPA 3A5NC 2NLXA 4BRMA 5BPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BRDA 4M3WA 3RMDA 2OTJN 3OYGA 1SS6A 4IJNA 5SWMA 4Z4FA 3TAQA 1ATRA 1RTDA 3OYHA 1JCGA 3VEVA 4O55A 4BDYA 3BGRA 1RCHA 4IBNA 2HF4A 5JVGL 3V9UA 4KPYA 4CZGA 5SZTA 4H5WA 4IKFA 4IO9L 3CCSN 4C1NI 2W6KA 3ZCMA 2E2NA 2E8AA 3QBXA 2FBVA 2BGGA 2XY5A 1KSPA 3V9ZA 1JLGA 2G8KA 1LW0A 4IDKA 4H5RA 4TSXA 4KHNA 4FPBA 2E5LK 3SV3A 5M1QA 5BR8K 3DLGA 1BWFO 2P9SB 5M1FA 1M90O 3PIOL 3JYTA 2YNGA 2YKNA 4NCAA 4U67L 2HMPA 1ZBIA 2PBDA 3ZX2A 2KFZA 1N6QA 4BG9A 2KFNA 1WSJA 4E7KA 2ITMA 4GKKK 3HXMA 4BR9A 4DSLA 1CXQA 4CJWA 5EY4A 4JI3K 3DM2A 4GW6A 2E1YA 5AQRA 4HUGA 1M1KO 4JHDB 4Q5VA 3T3FA 2A1SA 4DF8A 5C25A 1C1AA 2QA4N 3QMLA 4OGEA 1T03A 4LH4A 3O08A 5M1KA 1U2VA 3WEEA 3MX2A 2O4IA 1A5WA 4CK2A 2CGLA 5J2MA 1VRTA 2QWLA 3WXIA 4ZHRA 2P9NB 3AA3A 1LW2A 5I42A 3ZETA 2XO7A 3CJ7A 1EQYA 4WQ4C 5AJ3K 4DTJA 4W5TA 4FWQA 5DM6L 4FLVA 3NH2A 3O9RA 4DQIA 3P83D 1QVFM 3CETA 4DFMA 4KRFA 3LALA 4CGIA 4E7IA 1TKDA 2D1KA 1JJ2M 2E4LA 1Q86O 3VF2A 3GG4A 1C0GA 3L6QA 3CC7N 3AGKA 2E2QA 3ZT4A 3P4IA 4K0KK 3AVHA 1J9AA 3AVNA 4Y0WA 3L2UA 2UUAK 3A5MC 4Q0BA 3AVMA 3HI0A 3U3GA 4AQYK 5EXWA 4EAHD 1YTAA 3NF8A 4CZLA 1HNZK 5FRNA 3RSEA 4YDUC 4YFUA 3I0RA 4KHQA 4FJ7A 1J6ZA 1DGKN 1RDWX 4K43A 4DG1A 2YJEA 3CYMA 2AP1A 4NXMK 3MEGA 2V7YA 4JKAA 3PX6A 1NGAA 3VEXA 3BF1A 1WSEA 1YJWN 4JKGB 4KTWA 2OA8A 3BEXA 4B9LA 3LDNA 2AA4A 3QETA 4DUYK 2YX6A 4WYBA 4B9SA 3TI0A 2VGNA 4FXDA 1VQ5N 3A5OC 1GLLO 2V51B 5KI6A 4AILC 4RW9A 2O8FB 4KTQA 1U47A 4E7LA 3VEOA 4FJXA 1NGGA 2YJFA 3EN9A 4F2SA 3QBWA 2AJQA 3VQ6A 1GOCA 3V1RA 2PFUA 3L2WA 3NDKA 3MN6A 1NK9A 3TWHA 3AVCA 4FYDA 3O9SA 4W5RA 2HOEA 3HYFA 1Z25A 2F4VK 1D9DA 2P9KA 3TU5A 3NF6A 2Q31A 5AQNA 5AQYA 3D2EB 4FLXA 2JLEA 3WNFA 4EHTA 1BG3A 1U4BA 5AQGA 4BGBA 3HOTA 2Q2RA 3UB5A 5AZIB 1VSIA 2D0AA 4OKJA 2O8EB 2ZWHA 4E89A 5BRFA 2IDOA 3PO4A 2E6LA 2FF3B 3AO4A 5HP1A 2G8WA 3IMXA 1FW6A 3U8XA 2QK9A 1N34K 1T05A 3TR8A 3K5LA 3OYMA 1S6QA 1RDCA 3SPZA 4HCCA 2O8BB 3LWLA 4J2EA 3K2PA 3M8PA 4W5OA 4CBUA 1VQ4N 4YOVA 3BDPA 1U45A 4BDPA 2I7PA 2HHWA 1V4TA 3CCRN 1SZ2A 3QDKA 4ISGA 1KVBA 1GLEG 4YOUA 3V9XA 4CIEA 5BPLA 4ZTJA 3VN5A 4BDZA 1EX4A 2KKZA 3O80A 3IAYA 3H1VX 2HHXA 3LP1A 4IFEA 4IOXA 4JK9A 4B1XB 2QKBA 2A5XA 4H5NA 1BGXT 1X9JA 1MA9B 5JMVA 3OS1A 2WFBA 5LJVA 3NGYA 5C2FA 2P9IB 3C7NB 1ASUA 1TKTA 2VQFK 1IV0A 2FC0A 4DCHA 4WQ5A 2P1JA 4LSLA 1SAZA 1H1VA 3PY8A 2ATQA 4DR5K 3AAQA 3ULEA 4BRHA 4BQZA 3F73A 3MX5A 3B6OA 3N4QA 5AQZA 3M6GA 4DQQA 2B5JA 3CC2N 3O4NA 3CFPA 4L8RB 1A5VA 3AVIA 4NCBA 4FO0A 4DHYA 1JXEA 2W41A 4CZFA 1SUQA 2VYPA 1DTQA 3I8BA 4PL7A 3V1OA 3ZSOA 1D9FA 4DTXA 2XRIA 4JD2B 1TKZA 3CCVN 4CJRA 1TUUA 3OS0A 3EO3A 1L3VA 3BUZB 4OGCA 4DSKA 3AAPA 4WFNL 3C95A 3SPYA 2Q0RA 3WXKA 1OH6A 1HKGA 1HPZA 2A42A 2HHHK 3CJAA 1FKOA 2XY8A 3KVGA 4KH4A 2DFEA 4AF1A 3KIOA 4DSEA 3RMAA 1NG9A 3G4SN 1XI1A 1ZXOA 3MN7A 1OH5A 1RFQA 5HROA 2HBLA 4R79A 3NF7A 1XMOK 3NGIA 3ZSVA 1UOCA 3OJSA 2FF6A 4B8CA 4CGGA 1CZBA 4B9VA 3WXMB 1T44A 4KHPK 2A41A 3TAPA 1HNVA 3MECA 3RTVA 2HHUA 2YNIA 3SNNA 3PX4A 4BC3A 2H3GX 4BR5A 1ATNA 2D4WA 4A5BA 3MDQA 3MK6A 3J7ZO 1QSYA 1BQNA 2YHWA 3VEYA 4GNIA 4MDAA 4RG8A 2WONA 2YNHA 5C15A 5TKWA 4YOWA 3K59A 4FJLA 3LWMA 4JI5K 3AV9A 4B3MK 3KLEA 3LZIA 2D0PA 3UKUB 4BRCA 4FPAA 4EP5A 1S6PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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