2FSNA

Crystal structure of ta0583, an archaeal actin homolog, complex with adp
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
325
structure length
310
Chain Sequence
MVVVGLDVGYGDTKVIGVDGKRIIFPSRWAVTIPVLSTDGGQTKFIYGKYASGNNIRVPQGDGRLASKEAFPLIAAALWESGIHVDLVIGSGTPLGTFDLEVKAAKEALENKVLTVTGPEGEVRQFNITRLIMRPQGVGAALYLLNQGIIEQQPGYGVVIDVGSRTTDVLTINLMDMEPVVELSFSLQIGVGDAISALSRKIAKETGFVVPFDLAQEALSHPVMFRQKQVGGPEVSGPILEDLANRIIENIRLNLRGEVDRVTSLIPVGGGSNLIGDRFEEIAPGTLVKIKPEDLQFANALGYRDAAERS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an archaeal actin homolog
pubmed doi rcsb
molecule keywords hypothetical protein Ta0583
molecule tags Structural protein
source organism Thermoplasma acidophilum
total genus 71
structure length 310
sequence length 325
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF17989 ALP_N Actin like proteins N terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fsnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fsnA01
4BGBA 3ENOA 1ESVA 1X3MA 5BN9A 4WYBA 4BRFA 4F9OA 1H1VA 3LDLA 4IJAA 3HZ6A 5AQUA 4CZEA 1IJJA 1ATSA 2A6AA 4EAHD 1BUPA 3R9PA 2VCPA 3QBXA 4M63C 2YHXA 1NGGA 1DKGD 4H0TB 3A8YA 2FSNA 5BRHA 1P8ZA 3B8AX 3ZX3A 3QFUA 4BRHA 3ZETA 5KPZA 2UYTA 4BRQA 4BC4A 2ZGYA 2QWMA 4BR0A 1U2VB 2P9SB 3DXMB 5KQDA 4JHDB 4PL8A 5AQLA 5AZJB 1U6ZA 3WQTA 3FE1A 2Q31A 1BO5O 2GEMA 4H5NA 4XEIA 3BF3A 2I7NA 3I8BA 4FWNA 1NWKA 4DCHA 3QMLA 2E8AA 3CQXA 1K8KA 3UE5A 1GLCG 1NGHA 3EN9A 3DXKB 2ZF5O 3ZX0A 3WQUA 2WUSA 3FGUA 2GELA 1NBWA 1SAZA 2FLOA 4YDUC 5AFUH 4IXCA 5JICA 1X9JA 2GWJA 2A5XA 3HSCA 2D4WA 4CZFA 5JLFA 4EIAA 1KAZA 4O8KA 1QQNA 5AQSA 1MWMA 2F9TA 3MMVA 3VGKA 2ASOA 3VENA 4H0XB 3J8AA 4C23A 4CZKA 3SK3A 2DPNA 4DHYA 2E2OA 3D2FA 4AM6A 5FPDA 5E26A 4BR4A 4NB4A 5E84A 3H45C 4BRNA 4L3QA 4BVOA 4B9QA 1BWFO 3VESA 4ISFA 5AQFA 4BRCA 1EQYA 1YVNA 3IMXA 4QS7A 4BGAA 3MK6A 1GLDG 4H5VA 3VF6A 3WXIA 3AAQA 2E88A 3G25A 4HWIA 4BC5A 2FF6A 1HKCA 1T6CA 3H1QA 3H3OB 1GLEG 1T44A 4BRIA 5F0XA 3ID8A 2YJEA 3CJ9A 4KBOA 5F1XA 1TYQB 2V52B 5AQTA 2IIRA 3UKRA 4BG9A 1HX1A 1MWKA 2A3ZA 4CBXA 1NGJA 2HF3A 2V51B 2QWNA 1GLAG 5AQIA 3VGMA 3SLCA 3DAWA 1U2VA 1ATRA 5BREA 5AQPA 5BPLA 3DXMA 3HBTA 4WQ4A 2IVNA 3O1WA 3VETA 2ZWHA 1XQSC 3U9ZA 2BTFA 5JLHA 4J8FA 2GWKA 4FWSA 4XH5A 5AZJA 3VEXA 1G99A 3QBWA 1HKGA 3QFPA 4BROA 5AQNA 3HTVA 3R6MA 1ZBSA 4PKHA 1E4FT 3WT0A 4M7YA 4Z94A 4M7XA 2E2PA 2YI1A 4BRKA 3DXKA 1NMDA 3GL1A 1NGCA 1WUAA 5EVZA 3VOVA 4FWOA 2P9LB 1D4XA 1HLUA 3EZWA 3VEVA 4GY2B 4BRAA 4AM7A 2CGLA 3UKRB 3P4IA 3W3DA 4IZ9A 1GLLO 3FZFA 4H0PA 2QWRA 3D7EO 3VPZA 2A40A 2YHWA 3SMPA 3FZMA 4DQ8A 4ISEA 1QZ6A 4FOIA 2P9IB 2CGJA 2Q36A 2IVOA 3L6QA 1S22A 5ADXA 2Q0UA 2E2QA 2YJFA 3H3NO 4B1ZA 2E2NA 1DEJA 4BRMA 1Z05A 2Q2RA 3BF1A 1BA1A 4Y0WA 1SQKA 1Y64A 5AQHA 4BR9A 1RDWX 3MN7A 3O4WA 3VEWA 4CBWA 3MN5A 3IDHA 4H0YB 1TYQA 3D2EA 1YAGA 1NGDA 3VEOA 2D1KA 4WQ4C 1WOQA 1BU6O 2CH6A 3LDQA 2PAVA 4BRLA 2HF4A 4MLEA 4O5FA 2F9WA 2A42A 2HMPA 3AARA 5ELZA 1QQMA 2GTDA 2CH5A 3MDQA 4E1JA 3VGLA 1KAXA 4FWMA 5AQGA 2I7PA 5BPMA 5AQJA 5LJVA 1XUPO 4JN4A 5FPNA 4FL9A 1BA0A 3S41A 4JNEA 1BG3A 4MO5A 3O8MA 5KQ8A 3H1VX 2ASMA 1GLFO 3VERA 3L4IA 4A2AA 4PKGA 3KHYA 4DB3A 1MA9B 1BOTO 1HUXA 2E1ZA 3O1BA 4BVPA 2P9LA 2VYPA 4A62A 1HPMA 4H0VB 2P9UB 3C0BA 1KAYA 3QDKA 4RCHA 5AQQA 3D2EB 5BR9A 3JXUA 3WXLA 4CZGA 5AQXA 4XH1A 5EX5A 3FFKB 4CZLA 1TUYA 5F2RA 3UB5A 3LDNA 2P9IA 2YCHA 4QS8A 3M6GA 1NGEA 2GUPA 3H6EA 2FXUA 3QICA 3A5OC 4FSVA 1QQOA 3CHWA 3ATVA 1NLVA 2W41A 4RWTA 2VWBA 3ZEUB 3LL3A 3GDQA 3AY9A 3FZLA 1ZC6A 3O08A 3ZX2A 5KPRA 4B1VA 3A5LC 3EKUA 4FWLA 4I6MB 4BC3A 4CJ7A 3FZKA 4YDUA 1CZAN 4IO8A 1LCUA 4LC9B 5JMVA 4EFHA 5EY4A 4IWVA 5BN8A 1V4SA 2Q0RA 3MN6A 4JD2A 1JCFA 4H0OA 2QW9A 4K42A 4K43A 5AZIB 3U4LA 5KPTA 4BG8A 3F9MA 3CJBA 2AP1A 1T6DA 4HTLA 3I33A 4BRPA 4MO4A 2D0PA 3VF2A 1NGFA 3CIPA 4GNIA 5BRDA 2H3GX 3WUHA 3C7NA 1R59O 3MN9A 2J4RA 1DGKN 1TUUA 2OANA 5AR0A 3WXKA 4H5RA 2QWQA 1XC3A 1BDGA 4B1WB 1ATNA 3HI0A 2HOEA 3GG4A 4BQLA 5EXWA 2P9NA 2NZTA 2CGKA 3A5NC 3EKSA 4A2BA 5CE3A 4B1UB 3RSEA 5AQMA 3UKUA 1J6ZA 5BRFA 4FOEA 1X3NA 3KVGA 3FZHA 5FPMA 2AA4A 4PL7A 4CZJA 4H5TA 2FF3B 4MLHA 4BRDA 3CQYA 4B1XB 5LJWA 2P9KB 3ULEB 3KZBA 3L0QA 4ISGA 5ADXH 3CI5A 1HKBA 4JD2B 3GOIA 3CJCA 2YHYA 3TU5A 3EL2A 2P9PB 3GE1A 4CI6A 4JAXA 1KXPA 4H03B 2Q1NA 3LDPA 3FLCO 2P9UA 4FO0A 1RFQA 1Z6RA 1YUWA 3EO3A 4CD3A 3WEEB 5BPNA 3O6WA 4CZIA 3LM2A 5AFUA 1C0FA 5AQYA 4BR2A 4BR7A 1JCEA 3C7NB 4K25A 4BREA 1QHAA 2D0OA 5AQRA 3TPQA 3LDOA 2QWOA 4QS9A 4WQ5A 1ZXOA 1C0GA 1Q18A 4FWRA 3DWLA 4FWPA 3BUZB 3R8EA 3MCPA 2NLXA 1IG8A 2BUPA 2P9NB 1RGIA 3CJ1A 2QXLA 3DJCA 4H5WA 4IJNA 3ZEUA 3O80A 1MDUB 3RSEB 4CZMA 3UKUB 4XH4A 4I6MA 3CETA 3ZETB 3BEXA 3O5BA 1NGIA 3ATUA 2ZGZA 4BRGA 5I9EB 1YXQA 1LOTB 2IVPA 1QZ5A 2A41A 3CJ7A 3A5MC 5AZIA 2V7YA 5EOYA 3A0IX 3M1FA 1NGAA 3SMSA 3ENHA 5AQOA 4CZHA 4BQZA 4CBUA 1GLJO 3WXJA 1E4GT 3HM8A 3W0LA 2QWLA 4CD1A 3CJAA 3M3ZA 3SJHA 4B1YB 4FWKA 5AQZA 5TKYA 4BR5A 2EWSA 3LM9A 1NGBA 1NM1A 1K8KB 3AAPA 3VF4A 3CERA 3BP8A 4K41A 4FPAA 4BC2A 3U9DA 2ASPA 2E1YA 2PBDA 4FWQA 1OKJA 3VEZA 3OHRA 3H46O 3VEYA 2P9KA 3ULEA 2P9SA 1GLBG 2ITMA 2Q97A 5B8HA 3D2FB 4FPBA 2E20A 5FPEA 4EHUA 4JHDA 2P9PA 2V7ZA 1V4TA 5LY3A 3JS6A 4PKIA 5AQVA 4A61A 4EHTA 1SZ2A 2KHOA 1HJOA 3QB0A 2QM1A 3IUCA 1S3XA 3GBTA 3WEEA 2NRHA 2FSKA 4NO7A 3FR0A 2W40A 4WQ5C 2FSJA 2QWPA 5AQKA 5AQWA 3U8XA 4RTFD 3IFRA 1JCGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NK4A 4FK0A 2PYLA 3LDLA 1RILA 3HZ6A 4DFKA 4DS5A 2Z1GA 4CZEA 2O8CA 2B6AA 1BUPA 3R9PA 2VCPA 3NF8A 1VSMA 1X1PA 1RT2A 1NGGA 2XY8A 3KLEA 1T8EA 3ZX3A 3QFUA 2QA4N 2FBTA 4BRHA 4DSEA 4JI0K 4BRQA 1VQ8N 1U2VB 4OLAA 1U47A 3DXMB 1GOAA 5KQDA 4PL8A 4DMNA 5AQLA 2ZJPL 1U6ZA 4LFAK 2OYQA 3KK1A 4F4KA 4H5NA 3BZCA 2Z1IA 2OPPA 4CW7B 4FWNA 1EWRA 4DCHA 3QMLA 3CQXA 3SNNA 3UE5A 1GLCG 1NGHA 1XHXA 1IKWA 3WQUA 4MFBA 4YDUC 4F2SA 4DR7K 3QEVA 3WXMB 4AQYK 3E01A 3EYZA 1A5VA 4B9TA 4FW2A 3C6TA 3LPTA 1TGOA 1RBTA 2YV0X 4O8KA 3CC2N 4LF6K 1RTHA 3VGKA 4H0XB 4CZKA 1S6QA 5DMRA 5GAEP 3AO2A 2WC9A 5E26A 4BR4A 5C2DA 3SQ2A 4ISFA 2GX9A 4HUEA 3CPWM 3AVLA 3IG1A 1GLDG 5A2QO 3WXIA 1IBLK 1RT5A 4E89A 2FF6A 1HKCA 1T6CA 4CJEA 4AHCA 4N47A 1HR0K 1W9HA 4DV3K 5CY4A 1NK8A 1KLNA 5JS2A 4BDYA 2IDOA 2UUCK 2OA8A 1IG9A 4PWDA 4KBOA 4U67L 5GIPA 1RDAA 4YOWA 4A5AA 2IIRA 2OTLN 3LP1A 1HX1A 4FZYA 2A3ZA 4FLUA 4RW7A 4LF7K 4Z0UA 4ICLA 5MLCQ 5FLXO 4B08A 1GLAG 2YKNA 3CQ8A 3M8SA 3SLCA 1U45A 4EZ6A 1YJWN 3CCUN 4FJMA 2BTFA 4LF5K 2GWKA 5J2NA 1HKGA 3QFPA 5FDLA 2O8EA 3F5TA 5AQNA 3KD5E 1ZYQA 1WSIA 3HTVA 4JI2K 3Q7BA 3K9KA 4Z94A 3CC4N 3O4QA 4M7XA 1NK0A 3DXKA 3QESA 1NMDA 3DM2A 3GL1A 4YORA 1Q8IA 1WBBA 4C8OA 4B9VA 5M1FA 3HM9A 4KB0A 1DLOA 3VEVA 4BRAA 1M90O 1VSJA 4JKGA 2CGLA 4CJUA 3D7EO 2IGIA 4FJ9A 2X78A 2BDPA 4ISEA 1QZ6A 4IEIA 1SKRA 4CGDA 1Q7YO 3V81A 4JYAK 2IVOA 2EX3A 1HNWK 2YNHA 1QVFM 3V9WA 2WFBA 4NYNA 4E1MA 1I39A 4LH5A 1D9FA 4BRMA 1DEJA 1Z05A 2Q2RA 3O9UA 3U6FA 2G8HA 1BA1A 3KK7A 3OYKA 4Z4HA 1SQKA 4FJXA 3NMUA 1VRUA 4NXNK 5C12A 3VQBA 3RR8A 1JKHA 3QEWA 2R7YA 4K0KK 3IRXA 3MN7A 2HBMA 5GINA 4CBWA 2UXBK 1VAZA 1S9EA 3IDHA 5HL7L 3MX5A 3CC7N 1TYQA 1TAUA 2UXCK 4CECA 3LDQA 4FCYA 2F4VK 2HF4A 4MLEA 4O5FA 2F9WA 3T3FA 2HHWA 3PX4A 1VQLN 5ELZA 4G1QA 1RNHA 2CH5A 2HHUA 4X66K 3EE8A 1N5YA 3MCAB 3J81O 1XNRK 1FKOA 3S41A 3CYMA 1VSKA 4JNEA 3CFRA 1K6YA 4AILC 2ASMA 3VERA 3U3GA 4DB3A 3HP9A 3KHYA 2HB5A 4AH9A 4CIEA 2E1ZA 3TSPA 2P9LA 2O8FA 3AVHA 4A62A 3I55N 5BR9A 1RT6A 5C42A 4FJJA 3CCVN 1NOYA 4K8XA 3CM5A 4CZLA 1RTIA 2P9IA 3A2FA 3DRSA 4ILGB 4OPAA 3J80O 3LWMA 5GAHP 5LMNK 3VN5A 4DTUA 3T1HK 4IDKA 1NLVA 1I94K 3HXMA 3K59A 3AY9A 4WF9L 1ZC6A 5KPRA 3ZX2A 4B1VA 4W5RA 3EKUA 4CJ7A 1U04A 1ILYA 2O8DA 2HMIA 1WSEA 4CFCA 3HPGA 1NK9A 2FBYA 4Y1DA 4E7KA 3MN6A 2QW9A 3U4LA 4KFBA 3F9MA 3CJBA 2AP1A 1T6DA 1R0AA 1EKEA 1NKCA 3TTCA 1QSYA 3I8DA 1NGFA 3CIPA 1CXQA 5DM6L 4U7BA 2FBXA 3WUHA 1R59O 4LFBK 1DGKN 4B9NA 3TAQA 1NNEA 1XC3A 4JS5A 1BDGA 1ATNA 1ZBFA 2HOEA 4DV7K 3KLFA 3TABA 5EXWA 3ZT0A 1NK5A 3HPOA 5CE3A 4A2BA 1YI2N 1A5XA 1VQ6N 4FVMA 3OYDA 1L3VA 4PL7A 1U48A 3F2KA 1WSHA 4MLHA 2O8DB 3CQYA 1QSSA 1S1TA 3ULEB 4ISGA 3CI5A 3O9QA 4E7LA 4DFJA 3PIPL 5HLFA 1RDDA 4O55A 3TU5A 2YHYA 3GE1A 4JAXA 1HQEA 4IBNA 4PQUA 2Q1NA 2P9UA 5FROA 2A1SA 4FO0A 5E41A 1Z6RA 5BPNA 4CZIA 4GVEA 3LM2A 4DTJA 5C24A 3KLGA 4CJSA 4E7HA 1VK0A 4DSJA 4CJRA 1UWBA 4GKKK 4QS9A 2IAJA 5JS1A 2A1RA 1C0GA 1Q18A 2ETJA 3BGRA 4JI8K 2G8UA 4DTPA 2QXLA 3ZEUA 4CF2A 3C6HA 1XNQK 4CEQA 1Q86O 4CZMA 1E3MA 2KLAA 3OS0A 4NCBA 4I6MA 4H4OA 2O4GA 3ZSWA 1YXQA 3G71N 3CJ7A 4W5TA 3SPZA 4KTWA 3L2QA 3A0IX 3OYJA 4JV5K 1S1VA 4CE9A 3AO4A 4CZHA 2VG5A 1E4GT 3TANA 1WN7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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