2FSNA

Crystal structure of ta0583, an archaeal actin homolog, complex with adp
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
325
structure length
310
Chain Sequence
MVVVGLDVGYGDTKVIGVDGKRIIFPSRWAVTIPVLSTDGGQTKFIYGKYASGNNIRVPQGDGRLASKEAFPLIAAALWESGIHVDLVIGSGTPLGTFDLEVKAAKEALENKVLTVTGPEGEVRQFNITRLIMRPQGVGAALYLLNQGIIEQQPGYGVVIDVGSRTTDVLTINLMDMEPVVELSFSLQIGVGDAISALSRKIAKETGFVVPFDLAQEALSHPVMFRQKQVGGPEVSGPILEDLANRIIENIRLNLRGEVDRVTSLIPVGGGSNLIGDRFEEIAPGTLVKIKPEDLQFANALGYRDAAERS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an archaeal actin homolog
pubmed doi rcsb
molecule keywords hypothetical protein Ta0583
molecule tags Structural protein
source organism Thermoplasma acidophilum
total genus 71
structure length 310
sequence length 325
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF17989 ALP_N Actin like proteins N terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fsnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fsnA01
4QS8A 3DXKB 4FOEA 4BRFA 4BRPA 3MN5A 2P9PA 1QQMA 1S3XA 1Y64A 4ISEA 4CZMA 3B8AX 2YCHA 5JICA 2FF6A 3SJHA 3WXKA 5AQTA 1LOTB 1IJJA 2FF3B 1RFQA 2D0OA 4C23A 5LJWA 3CJBA 2D4WA 2V51B 3VGLA 2A41A 3DXMA 2J4RA 1NGIA 1QHAA 4B1YB 1NGGA 5EOYA 1BU6O 1NGBA 1QQOA 3J8AA 3SMPA 3VF6A 3WT0A 2QWOA 4BRQA 2FSKA 1T6DA 2AA4A 3U4LA 4M7XA 1E4GT 4ISGA 3VGMA 5F1XA 2GELA 3LDLA 1ZBSA 1U2VB 3DWLA 5AZIA 5ADXA 2VCPA 5BRHA 1H1VA 4FWRA 4CZEA 4GY2B 5AQWA 3UKUA 4WQ4C 4BREA 1ATNA 3VEVA 1C0FA 4BR0A 1ATRA 5EXWA 4L3QA 4K42A 4YDUC 2GTDA 4JN4A 1J6ZA 4LC9B 3L4IA 1TUYA 3M1FA 5I9EB 3H45C 4WYBA 1ATSA 1KXPA 1BOTO 2E1YA 4KBOA 4I6MB 1OKJA 1GLBG 2ZGYA 3IUCA 4FL9A 4K43A 3WUHA 2YJFA 3AARA 1KAYA 1BO5O 1MDUB 1GLCG 3DAWA 1XQSC 4H0TB 3WQTA 3FE1A 3CJ7A 2I7NA 2QM1A 4BRGA 4IJNA 2CGKA 2OANA 5AFUH 3MDQA 1T44A 3D2FA 1GLFO 1HPMA 2D0PA 1NGFA 4PL8A 3CETA 4CZJA 5AQVA 5JLHA 2HF4A 5AQNA 4BRAA 1X9JA 4PKHA 5AQXA 4BGAA 1QQNA 4BC5A 2YI1A 2D1KA 2CH6A 3KHYA 4Y0WA 3FZMA 2QWRA 3WQUA 1SQKA 3WXJA 1K8KB 4IWVA 1HX1A 1NBWA 4JHDA 1HJOA 2E2NA 2P9KA 1NLVA 3GOIA 3JS6A 4YDUA 4B1VA 5BPNA 1HUXA 5B8HA 2A42A 1GLJO 4H0PA 4JD2A 2A5XA 3P4IA 3ZX2A 4RWTA 5FPNA 1SAZA 3LM9A 3LDNA 4NO7A 5KPTA 2E2PA 2GWKA 2P9PB 3M6GA 5AQYA 1YUWA 1HKGA 3FFKB 4BVOA 4FSVA 2VYPA 5KQDA 2HOEA 4FWLA 4H0VB 3CIPA 3KZBA 5BRFA 2QWNA 3DXMB 4BQZA 4CZHA 4CZGA 3CJAA 1YAGA 3H46O 3ATUA 3O8MA 3S41A 3QFUA 4FWQA 2W40A 1YXQA 3GDQA 4AM7A 5JMVA 4FWOA 3WXLA 5AQQA 4DB3A 2QWQA 2UYTA 3F9MA 4H0XB 5TKYA 4EHUA 4HWIA 2ASMA 2Q2RA 3VENA 1QZ6A 1NGHA 2IVPA 3A8YA 5FPEA 1DKGD 3UKUB 4MLEA 3QDKA 4J8FA 4BR9A 2CGJA 5KPRA 2PBDA 2IIRA 1MWMA 4GNIA 2P9UA 3VERA 2A40A 1Q18A 3QB0A 1EQYA 3CQYA 3BP8A 4XEIA 2P9SA 1RGIA 1S22A 5AQKA 4BRHA 4BRIA 4FPBA 3UE5A 4K25A 4BC3A 2YHWA 3O1BA 1D4XA 3MN6A 2HF3A 5LY3A 3MMVA 4NB4A 1SZ2A 2GWJA 4B9QA 5JLFA 2QW9A 2NZTA 2ZF5O 3GG4A 4BR4A 4FWNA 2HMPA 3RSEA 5KPZA 4QS7A 4CBXA 3VEYA 4CI6A 3EKUA 5F0XA 3H3NO 3ZX3A 1HKBA 3U8XA 3W0LA 5ADXH 1NGCA 1GLLO 4JHDB 3VF4A 5BR9A 2P9KB 1BUPA 3EKSA 3FLCO 1DGKN 3HBTA 3VPZA 1JCEA 2A6AA 4JD2B 5AQJA 4H5TA 1Z05A 4H5NA 4XH1A 5CE3A 4M63C 3VETA 2PAVA 4BG8A 2E88A 3IMXA 3OHRA 3DXKA 4FWMA 3R9PA 1BA1A 2WUSA 2ZGZA 5AQGA 2ITMA 2ZWHA 2E8AA 2V7YA 3QBXA 2FSJA 5EVZA 5BPLA 1NGAA 2P9LB 3KVGA 3G25A 3VEXA 2BTFA 3L0QA 4H5WA 4CZIA 3MN9A 4IJAA 1X3MA 4B1WB 2FSNA 3TU5A 1ZC6A 5FPMA 4B1XB 1XC3A 1V4TA 4H0YB 2VWBA 1U2VA 1TUUA 3CJ9A 3FZFA 2NLXA 4M7YA 4B1ZA 3LDQA 3A5OC 3R8EA 3ATVA 3W3DA 3R6MA 1DEJA 3ULEA 4PKIA 1NGJA 5AQIA 2YJEA 1GLDG 3H1VX 4IZ9A 3FZLA 2Q0RA 3UKRA 4BR5A 3FZKA 5AQPA 4RCHA 4WQ5A 4BRMA 4BROA 2P9SB 3VF2A 2H3GX 4I6MA 2CGLA 2P9NA 2DPNA 5BREA 2Q97A 1RDWX 4CZLA 4EHTA 4Z94A 2V52B 3BF3A 4DCHA 1X3NA 2IVOA 1WUAA 3GE1A 5AQHA 1TYQA 5AZIB 5FPDA 2Q36A 1NGDA 1JCFA 3LDPA 5LJVA 2EWSA 3RSEB 3QMLA 5E26A 2FXUA 3FGUA 3A5MC 1KAXA 3D2EA 4BRNA 3H3OB 4K41A 1XUPO 4FWKA 4CD1A 2P9IA 3MCPA 2YHYA 2V7ZA 2QXLA 1QZ5A 5AQMA 2E2QA 5AQOA 1MA9B 3LDOA 3U9ZA 4EAHD 4FPAA 1KAZA 4A2AA 2QWLA 3AY9A 5BRDA 2E1ZA 3LL3A 4IO8A 3ZETA 4CJ7A 1NMDA 2GEMA 2Q1NA 5E84A 4DQ8A 3D2FB 4QS9A 5F2RA 1HKCA 3C7NA 3ZEUA 2KHOA 2AP1A 3H6EA 3IDHA 3EN9A 4BRCA 4E1JA 4A2BA 4BRKA 2CH5A 1BG3A 3EO3A 3D7EO 4O8KA 3A0IX 3O1WA 3AAPA 4FOIA 3M3ZA 3WEEA 4BQLA 3BF1A 3C0BA 5AQSA 3O4WA 4H5RA 4FO0A 1T6CA 1ZXOA 4FWPA 3SLCA 4BR2A 5AZJA 1Z6RA 4PKGA 1CZAN 3WXIA 5ELZA 3MK6A 4BG9A 1BA0A 1NM1A 3HM8A 3ULEB 1NGEA 3HI0A 4F9OA 4WQ5C 3VEWA 3JXUA 2W41A 5AQUA 3UKRB 2QWPA 4A61A 3FZHA 3MN7A 3CQXA 3HSCA 3CJCA 2A3ZA 1IG8A 2P9NB 4IXCA 5AFUA 3ZX0A 5KQ8A 2E20A 3LM2A 1E4FT 2F9WA 1WOQA 4B1UB 4MO4A 3VOVA 4H5VA 2YHXA 4BRDA 3L6QA 4AM6A 4BC4A 2I7PA 1TYQB 4HTLA 3A5LC 3VEZA 4XH5A 3IFRA 3I8BA 3H1QA 1R59O 5BPMA 3CERA 3ENOA 3VEOA 1V4SA 3HTVA 4BR7A 4CBWA 5EY4A 2ASOA 3A5NC 4DHYA 3D2EB 2P9UB 2QWMA 1G99A 5AQLA 3VESA 2P9IB 4XH4A 3EL2A 4EFHA 5AQFA 3O6WA 4WQ4A 4H03B 4CBUA 3CHWA 1BWFO 1JCGA 4BC2A 3CI5A 3QICA 3CJ1A 3ZETB 4FWSA 4MO5A 4BVPA 3O08A 2ASPA 3GBTA 4JAXA 2E2OA 4CZKA 2FLOA 1C0GA 4CD3A 4JNEA 3C7NB 3I33A 3O80A 3ZEUB 5AR0A 3UB5A 3TPQA 3FR0A 3SK3A 4A62A 1GLAG 2F9TA 1P8ZA 3WEEB 1MWKA 5AQRA 3BUZB 1HLUA 4CZFA 4H0OA 2P9LA 5AQZA 1NWKA 2NRHA 5AZJB 3QBWA 4PL7A 3ID8A 3SMSA 1YVNA 3EZWA 2BUPA 3U9DA 3AAQA 1K8KA 4EIAA 2IVNA 4ISFA 4BGBA 3GL1A 3DJCA 1GLEG 1BDGA 5BN9A 1LCUA 3O5BA 3VGKA 4BRLA 3HZ6A 2GUPA 3QFPA 5EX5A 2Q0UA 1U6ZA 5BN8A 4RTFD 4O5FA 3ENHA 1ESVA 3BEXA 4MLHA 2Q31A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C1NI 3RRGA 1BCMA 2Z1HA 1NK7A 1NJYA 3ENBA 1QQMA 4CZMA 1QSLA 3B8AX 4KHNA 4KREA 3SJHA 2F8TA 3KIOA 1XI1A 3CJBA 3DXMA 2KW4A 2J4RA 4JI3K 3LWMA 1BQNA 3C6AA 1QQOA 4YOYA 2WOMA 2QWOA 4BRQA 2HHHK 5HOOA 4FVUA 1HMVA 3J81O 1E4GT 3G10A 5FLXO 5F1XA 2GELA 3LDLA 3ZCMA 1W97L 2VCPA 1C6VA 1HPZA 2VWJA 5HRNA 1XMOK 5AQWA 4JV5K 4PUOA 3VEVA 3JSMA 1C0FA 1B9FA 5EXWA 4GKKK 3DRRA 4YDUC 3C6HA 1U4BA 4JN4A 3CYMA 4LC9B 3T1AA 3THWA 3E01A 3L4IA 2YNHA 4WYBA 1QS4A 2E1YA 4KBOA 2LSNA 5SWMA 4I6MB 1OKJA 1GLBG 1C0MA 3IUCA 4FL9A 2F96A 4IG3A 4K43A 4FJMA 3WUHA 2KZZA 4BDYA 2YJFA 4OO1J 3FE1A 3CJ7A 2I7NA 2HNDA 3HPGA 4YOVA 4FYDA 4JI7K 3DOKA 1TKDA 1CXUA 3D2FA 3I8DA 2D0PA 4PL8A 4CZJA 1C0TA 1JLGA 5AQVA 3QESA 2XY7A 2O8FB 3SCXA 5AQXA 1QQNA 3AVCA 2D1KA 3KHYA 3TR8A 2A1RA 3THYA 3LPUA 1ASUA 2HHWA 3HVTA 1HX1A 4KHPK 1LV5A 4EP5A 4H4MA 5BPNA 4NCBA 1HUXA 5IWAK 4LH4A 3QERA 1GLJO 4H0PA 1C1CA 1VQNN 1IBMK 5FPNA 3LM9A 4O55A 1XC9A 4Q5VA 4Z4EA 3NH0A 5CYQA 4F3OA 5J1EA 4X64K 3E9OA 4FSVA 2VGNA 2VYPA 3V6DA 3LP2A 1NJWA 4FZYA 4KTZA 4CIEA 3DXMB 2W6KA 4CZHA 1YI2N 4UY8O 1RDAA 3LP3A 3MXJA 1BHLA 1NU0A 1W9HA 5JMVA 4YFUA 3WXLA 1QVGM 4H0XB 4EHUA 4O5BA 1RT2A 3S3OA 4HVJA 2IVPA 3A8YA 4DV0K 2HMIA 4L8RB 4M3YA 4GKJK 3QDKA 4JKHA 5CZ1A 2NUBA 4BR9A 2OTLN 4Z4IA 3HO1A 5KPRA 5HL7L 4ID1A 1CLQA 1Q18A 4FM0A 3OYEA 2G8WA 3CPEA 4I2PA 2P9SA 1BI4A 3PIOL 4N47A 4Z4FA 4M3UA 3CC4N 1VSDA 4FLTA 1B9DA 2BANA 3CMEN 1SKSA 3O9UA 1WSEA 3TAEA 3K5LA 3O1BA 4EZ9A 4FJ7A 3CPWM 4R5PA 1Z26A 2R7YA 4DFPA 3AA5X 3OYMA 4AHCA 2HBLA 2GWJA 4B9QA 4I9LA 4OKJA 3VTIA 1HYSA 2ZF5O 3J80O 1WSHA 3RSEA 5KPZA 4DV6K 4QS7A 3MCAB 3VEYA 4PWDA 2KZMA 3QETA 4LF6K 3DLGA 3U8XA 4CJTA 1GLLO 1L3SA 2DTUA 3FLCO 3NFAA 1DGKN 2HHTA 1JCEA 2EX3A 4DTUA 1RDUA 3QLHA 3SAGA 4FK4A 1SUQA 3IMXA 3O3FA 2WC9A 4DLGA 4DF4A 4FWMA 3R9PA 1IKVA 3VQQA 4E7LA 3D6RA 1N6QA 2D0BA 2WUSA 3KLGA 1S1WA 4IOAL 3KD1E 4K8ZA 3KLFA 5FRNA 5E41A 5BPLA 2P9LB 2RE2A 1Q9XA 2E6MA 2JGUA 1SL0A 4CGGA 4WCEL 1WSFA 2IS3A 4C8OA 3SQ1A 5BR8K 2O8DA 1XC3A 1S1TA 2Z1IA 1T03A 4DQQA 4KI4A 4KO0A 4W5QA 3CJ9A 1OH7A 3LDQA 4E19A 3R8EA 2UUBK 3ATVA 5M1NA 4PQUA 3W3DA 3R6MA 4DQPA 4B9LA 4M3ZA 4CJQA 3CFOA 3SJJA 3FZLA 2P9SB 1BI4B 4NLBA 3LWLA 1M90O 3NAEA 3NVKA 1JLFA 5BREA 3E9LA 1SL2A 2D5RA 2X6NA 3RRHA 5D3GA 3OW2M 4DU4A 1TK0A 3CQ8A 4FJGA 4FJJA 4DMNA 2IVOA 5C42A 3GE1A 3ZSOA 1JCFA 3LDPA 4M3TA 3C6UA 3RSEB 1GOAA 1RBVA 3KTQA 3FGUA 4PHTX 1GOCA 1XUPO 4FWKA 1WAFA 2P9IA 1KLNA 2E6LA 4LFBK 4WE1A 1L3TA 3OYKA 2HHVA 5FDLA 2RF2A 5DM6L 3LDOA 1ZBIA 3SNNA 3F9KA 4FPAA 2ZD1A 1JLBA 1JJ2M 2E1ZA 3LL3A 1OVYA 2GEMA 3TTDA 3CD6N 1SKRA 4AHRA 4QS9A 4TSXA 4E7IA 4BREA 1BG3A 4FOIA 3V9ZA 1Z6RA 1CZAN 3WXIA 5ELZA 1TAQA 3C6TA 2DFFA 1J53A 4CERA 4BG9A 1UOCA 3OYDA 2O8EA 4CGDA 1A5WA 3EY1A 3A2FA 3WNFA 3EEQA 4FJ8A 4HUGA 3V1QA 4Y1CA 3CG7A 3MN7A 5M1FA 4BY9C 3CQXA 4IDKA 3C94A 1BCOA 3HSCA 3CJCA 3MXMA 5AFUA 5KQ8A 2E20A 4KHYA 2QI2A 3QIOA 1WOQA 2YNGA 3PV8A 2I7PA 4FCYA 4BE2A 3THXA 1FXXA 3VEZA 2OZSA 3IFRA 2KQ2A 3O9QA 4RG8A 3OS2A 5BPMA 3LP1A 3V81A 3CERA 5J2MA 3HTVA 4CBWA 4CJFA 1JXEA 3NH1A 3LZJA 4FJIA 5AQLA 2P9IB 1IO2A 4CEBA 4XH4A 3EL2A 5AQFA 3O6WA 4WQ4A 3RTVA 4WFBL 4AH9A 4E0DA 3SV4A 4BC2A 4FZZA 1WB9A 4E7JA 2G8HA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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