2IIRA

Acetate kinase from a hypothermophile thermotoga maritima
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
400
structure length
400
Chain Sequence
MRVLVINSGSSSIKYQLIEMEGEKVLCKGIAERIGIEGSRLVHRVGDEKHVIERELPDHEEALKLILNTLVDEKLGVIKDLKEIDAVGHRVVHGGERFKESVLVDEEVLKAIEEVSPLAPLHNPANLMGIKAAMKLLPGVPNVAVFDTAFHQTIPQKAYLYAIPYEYYEKYKIRRYGFHGTSHRYVSKRAAEILGKKLEELKIITCHIGNGASVAAVKYGKCVDTSMGFTPLEGLVMGTRSGDLDPAIPFFIMEKEGISPQEMYDILNKKSGVYGLSKGFSSDMRDIEEAALKGDEWCKLVLEIYDYRIAKYIGAYAAAMNGVDAIVFTAGVGENSPITREDVCSYLEFLGVKLDKQKNEETIRGKEGIISTPDSRVKVLVVPTNEELMIARDTKEIVEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Acetate kinase from a hypothermophile Thermotoga maritima
rcsb
molecule keywords Acetate kinase
molecule tags Transferase
source organism Thermotoga maritima
total genus 132
structure length 400
sequence length 400
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2006-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2iirA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2iirA02
3R9PA 5BPLA 3ATUA 2CGJA 1V4SA 2ZWHA 3H45C 4CZEA 3D2EA 3GL1A 4BRGA 2A40A 3D2EB 1QZ5A 4BC4A 4BR5A 4EIAA 1P8ZA 2IIRA 3GE1A 5AQKA 3H6EA 2P9PA 2P9LA 1NGDA 4BRPA 1QQNA 3S41A 2P9LB 2P9PB 3DAWA 3P4IA 4L3QA 1JCEA 4XH1A 1DGKN 3FZKA 1R59O 3UKRA 1GLLO 2Q0UA 4IJAA 2Q36A 3WQTA 3RSEA 2EWSA 3ULEA 3UKRB 3O1BA 1TUYA 2QWLA 3CJCA 1TUUA 3RSEB 2DPNA 3ULEB 2VYPA 4H0PA 2A41A 2E2QA 4FWMA 2PBDA 1C0FA 2E2PA 4CBWA 3OHRA 2WUSA 3IMXA 4FWQA 4IO8A 3MN5A 5AQFA 5AQXA 3H3OB 3L0QA 3VGLA 4FOEA 3MDQA 3FE1A 4JHDA 1E4GT 3M3ZA 2YHWA 4JHDB 1ATSA 5EXWA 1NGAA 2UYTA 1LOTB 3R8EA 3MN6A 3FZHA 1V4TA 2VWBA 4BROA 4Z94A 3VEYA 2AA4A 4IWVA 2QWNA 1KAXA 2KHOA 3AARA 2QWMA 3I33A 3VOVA 1X3MA 5BREA 3FR0A 2A42A 4BC2A 4BRHA 1G99A 4FWNA 1T6CA 4IJNA 4IXCA 1NGGA 3A8YA 3CJAA 2GWKA 3W3DA 3I8BA 1X3NA 4H0OA 5AQGA 1XUPO 2E2NA 2ASMA 2P9UA 3ENOA 5JLHA 4O5FA 2FF3B 4B1ZA 2P9UB 1NBWA 2P9KA 2VCPA 5AQJA 4QS9A 2P9KB 2F9WA 3O1WA 1XQSC 3CQYA 5CE3A 3A5OC 3JXUA 3QICA 2FXUA 2E88A 3H1QA 3C0BA 3DXKA 2D4WA 1S3XA 3VGKA 4A62A 3DXKB 1NGBA 1ZBSA 3HSCA 5AQSA 1MA9B 1QQOA 3MN9A 4H03B 4B1VA 5KQ8A 2IVPA 1U6ZA 3VEXA 4CJ7A 3ZX3A 1NM1A 4K25A 2ASOA 2FSNA 4C23A 4EHTA 3LL3A 4BG8A 2PAVA 2QWPA 3EO3A 3G25A 5AQMA 3QDKA 4MLEA 3VF4A 5AQPA 4MLHA 3EZWA 3EL2A 3AAPA 5F1XA 5AFUA 5I9EB 4A61A 4CZIA 4BRMA 3D7EO 2HMPA 4JN4A 4BREA 1YVNA 3VGMA 4BVOA 3LM9A 1H1VA 5EX5A 5AR0A 3H46O 3O4WA 4A2BA 5AFUH 4K43A 3ZX0A 4PL7A 3O08A 3AAQA 2AP1A 4QS7A 1MWMA 3H1VX 4PKGA 2V52B 3EKUA 2D0OA 4B9QA 5AQOA 5FPNA 4BC5A 1MDUB 4K41A 4FWSA 1ESVA 4A2AA 4BRAA 3VETA 1GLFO 2YI1A 4AM6A 1U2VA 4B1WB 4BRIA 1EQYA 1U2VB 1S22A 3A5NC 2CH6A 4FWOA 3WT0A 2I7NA 3L4IA 3W0LA 5BPNA 3WEEA 1NGEA 1GLAG 1GLCG 3JS6A 3MK6A 1TYQA 2A6AA 3WXIA 4FWKA 3WEEB 4H5WA 4BQLA 1TYQB 3DJCA 3WXLA 2J4RA 4CZGA 3HI0A 4BRCA 5BRHA 1GLEG 3U9ZA 4B1UB 4BR9A 1DEJA 2Q2RA 2ITMA 1NGFA 2GELA 4E1JA 3UB5A 5BR9A 1HKCA 2CGKA 2P9IA 4H0YB 2P9IB 3IFRA 5FPEA 1CZAN 4H0XB 5AQQA 1KAYA 1NMDA 4FO0A 3A5MC 1KAZA 2CGLA 2F9TA 4K42A 4EFHA 2ZGYA 2H3GX 1J6ZA 5AQNA 1Z6RA 4WQ5A 5FPMA 2D0PA 1T6DA 4XH4A 4FSVA 3D2FA 4DB3A 4DCHA 4ISGA 4CZKA 1ATRA 5AQZA 2FLOA 3D2FB 4FL9A 2V7ZA 1ATNA 3VF2A 3FGUA 5JICA 3GDQA 1BA1A 4M7YA 1BU6O 2YJFA 5BRDA 1QQMA 3A0IX 4BGBA 1BOTO 2E8AA 1GLJO 1YUWA 3ENHA 3O6WA 4RWTA 3TPQA 5FPDA 4BVPA 4GNIA 4CZFA 2IVNA 1Q18A 4RCHA 4BRDA 3HBTA 1BUPA 4M63C 4LC9B 5ADXA 3LDNA 5E84A 4XH5A 1BO5O 1HX1A 2FSKA 5EVZA 4ISFA 3QFPA 4BR2A 5F0XA 3FLCO 2P9NA 2YCHA 1QHAA 2P9NB 3CERA 5AQVA 4PKIA 5ADXH 5JLFA 2A5XA 3CJBA 5LJWA 5ELZA 4AM7A 1Z05A 5BN9A 2ASPA 1QZ6A 5AQTA 5AQUA 2E1ZA 3CJ7A 2Q97A 4H0TB 2Q1NA 3LDLA 4XEIA 4FWLA 1NGJA 4WQ5C 3GG4A 4BQZA 4JD2A 3UE5A 3HZ6A 2HF3A 4CBXA 4CD1A 4JD2B 3VEOA 1K8KA 1JCFA 4WYBA 5EOYA 1K8KB 3SLCA 4BRQA 2E20A 5AZIA 2NLXA 5LJVA 3FZMA 4GY2B 1IJJA 3KVGA 1WUAA 3L6QA 4FPAA 4MO4A 5F2RA 5AZIB 5JMVA 5TKYA 4CZMA 1NLVA 3FFKB 1RFQA 1ZC6A 3F9MA 3CHWA 5BRFA 3VEVA 2QWQA 3U8XA 4H5TA 1SQKA 1RDWX 3B8AX 4BRLA 4CZLA 4BG9A 1LCUA 2D1KA 3KZBA 3SK3A 3VERA 3FZLA 2QW9A 1GLDG 3TU5A 3C7NA 4J8FA 1KXPA 2NZTA 3BUZB 5BPMA 3CIPA 3VEZA 3C7NB 3M6GA 5AQYA 1NGHA 1BWFO 1SAZA 1HUXA 1XC3A 3U4LA 3QBWA 2OANA 1HLUA 2GTDA 4PL8A 4BC3A 5BN8A 1HPMA 4B1YB 5B8HA 3VPZA 2NRHA 4WQ4A 3HTVA 5AQWA 4H5VA 4BRFA 5AQLA 4EHUA 4YDUA 2BUPA 1NGCA 1SZ2A 4IZ9A 2HOEA 3EKSA 1BA0A 1HKGA 2I7PA 4HWIA 5KPTA 2W41A 3CJ9A 3LDPA 2E1YA 1T44A 4BR4A 4BRKA 4HTLA 3SMPA 2CH5A 1HKBA 3WQUA 4NB4A 3O5BA 4PKHA 3SJHA 1C0GA 2P9SA 4FWPA 2P9SB 3A5LC 4CD3A 3CETA 2ZGZA 2GWJA 3O80A 4KBOA 4DHYA 1BG3A 3CI5A 3QB0A 3DWLA 4CZHA 5LY3A 1OKJA 1ZXOA 3U9DA 5KQDA 3O8MA 1D4XA 5KPRA 1X9JA 2BTFA 3FZFA 2A3ZA 4WQ4C 3BF1A 4QS8A 4Y0WA 3QMLA 4BRNA 5AQRA 3ZX2A 4H5NA 2HF4A 2YJEA 2QM1A 2IVOA 3SMSA 4NO7A 1YAGA 4BR0A 3QFUA 5KPZA 4YDUC 1RGIA 2FSJA 4H0VB 2ZF5O 3WXJA 1WOQA 4MO5A 4FPBA 3ZEUA 1Y64A 1JCGA 1YXQA 4B1XB 3VENA 3ZEUB 2YHXA 3BF3A 3UKUA 3DXMA 2GUPA 3KHYA 3H3NO 4FOIA 4ISEA 3UKUB 3WXKA 3DXMB 3VEWA 3AY9A 1NGIA 3VF6A 3LDQA 3J8AA 3MN7A 4FWRA 2GEMA 2E2OA 5EY4A 1MWKA 2W40A 3GBTA 3QBXA 4JNEA 4CI6A 3MMVA 4EAHD 1IG8A 2QWOA 3LDOA 2V51B 2FF6A 3IUCA 3BEXA 1BDGA 4H5RA 3EN9A 1DKGD 2Q0RA 3ATVA 3BP8A 4I6MA 3GOIA 3MCPA 4CBUA 4F9OA 4I6MB 3R6MA 5AQIA 3CJ1A 3ZETA 5AZJA 4BGAA 4JAXA 1NWKA 5AQHA 4BR7A 3ZETB 3ID8A 5AZJB 3IDHA 2QWRA 4CZJA 3VESA 4RTFD 3WUHA 2Q31A 1HJOA 4O8KA 4DQ8A 2QXLA 1GLBG 5E26A 3HM8A 3CQXA 2YHYA 4M7XA 2V7YA 3M1FA 1E4FT 3LM2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DM7L 4DLGA 1YIJN 1WSJA 2OA8A 4BRGA 4CHZA 2YX6A 4LF5K 4DR4K 4B08A 5AQKA 1NGDA 3ZLJA 3T1YK 2P9LB 3P4IA 1J54A 4L3QA 1JCEA 3FZKA 3SZ2A 4EP5A 2EWSA 3ULEA 3O1BA 1RDDA 1TUYA 2DPNA 2VYPA 4NCAA 2E2QA 4FWMA 2PBDA 4QAGA 4CBWA 3TAFA 5H1SQ 4DSLA 3O9UA 3H3OB 3CM6A 4FOEA 3MDQA 4C8KA 1K6YA 1RDUA 1W97L 1CZ9A 1E4GT 4B8CA 1ATSA 4KO0A 4DU4A 1VSKA 3R8EA 2HVHA 4RW7A 1K9MO 3HK2A 4BDYA 5M1OA 1TAQA 1XWLA 4H4MA 1KLMA 1UOCA 1YI2N 1BQNA 4JKBA 5TKWA 3VMFB 3O9TA 4KHQA 1JL2A 1WAFA 2X78A 4LSNA 2BANA 3O3HA 3OW2M 4B8AB 2GX9A 4LF8K 4IJNA 1B9DA 1ILYA 4KAZA 3CJAA 3AVCA 3AA3A 1VSDA 1WNSA 1A5XA 1X3NA 4CIGA 4F2SA 5AQGA 1XUPO 2ASMA 4YHHK 3K58A 4WFAL 1TL3A 4QS9A 5GINA 2QK9A 1HJRA 3PX4A 3KLHA 3JXUA 2DFFA 1QSSA 3VTIA 5CYQA 2D4WA 3RMCA 1BCMA 2XY6A 1NK4A 4A62A 3DXKB 4C1NK 3EZ5A 1ZBSA 1P90A 1QQOA 4ZHRA 1RDCA 1U6ZA 4CJ7A 1YJNN 3ZX3A 3NE6A 2ASOA 4DF4A 3T1HK 5GADP 4LFCK 4C23A 4EHTA 2ETJA 4BG8A 4YOVA 4OPKA 3QDKA 3VF4A 5AQPA 4DFMA 3EZWA 1VRUA 3NFAA 2OYQA 5LMUK 4A57A 1WAJA 5J2NA 3BY5A 4JN4A 3U6FA 2VQFK 3OS1A 1Q81O 2DY4A 2QTDA 3H46O 1JKHA 5AFUH 1BQMA 5HOOA 1R0AA 3ZX0A 1NNEA 3I8DA 5LMNK 3MECA 2YHBA 3H1VX 5C42A 4PKGA 2V52B 1XMOK 4B9QA 3VQ6A 3F73A 3CCVN 1MDUB 4CGHA 1XNRK 4FWSA 4A2AA 4BRAA 1GOAA 2X6SA 4CGIA 4CGDA 2YI1A 2JWKA 2KW4A 4FM2A 3V9XA 1U2VB 3A5NC 4PY5A 5K14A 2HHVA 3W0LA 3VQ8A 1GLCG 2A6AA 3V4IA 3KK7A 4J2DA 2J4RA 4FCYA 3HL8A 3HI0A 4BRCA 3DLBA 4B9LA 2HW3A 1S5JA 3WNHA 4BR9A 1NGFA 2GELA 4E1JA 4M3TA 1E3MA 2OPPA 3O9SA 3VQ9A 4K8XA 1NK8A 1QVFM 3T3FA 2P9IA 4H0YB 5AQQA 4H0XB 4B9UA 1ZYQA 4YORA 3LDSA 4FO0A 1S1VA 5M1NA 2ZGYA 3HVTA 1EETA 1J6ZA 5AQNA 1BI4A 3JYTA 4DB3A 4CZKA 4DQPA 4FLTA 5HL7L 1QHTA 3GDQA 5BRDA 2XY8A 3Q7CA 4YOXA 1WSGA 1YITN 2E8AA 5JS1A 3ENHA 1C0MA 4GNIA 3RRHA 3KLFA 1U45A 3VTHA 5E41A 4LC9B 1IKXA 2UUBK 1S9EA 2NRZA 5E84A 4XH5A 1EX4A 2FSKA 4ZTJA 4ISFA 3DMJA 5I42A 1A5VA 1WLJA 3OYIA 1EKEA 1QHAA 1LV5A 2P9NB 3CERA 1NG9A 3PLAA 5JLFA 2VGNA 1FKOA 2D5RA 5M1PA 2HHHK 3SYZA 4FLXA 3CJBA 5LJWA 3RMDA 4R79A 4LFAK 4AM7A 3PSIA 1Z05A 5BN9A 1X1PA 5AQTA 5AQUA 1NK9A 4WQ5C 1HNZK 3CXCM 3TAGA 2HF3A 2Q3SA 3VEOA 3MXMA 1T7PA 4JS5A 5EOYA 3BZKA 4I2PA 2E20A 4FJ9A 4W5OA 4HUGA 1YHQN 4JV5K 1IBKK 4GY2B 2A1SA 4MO4A 1WUAA 4FJNA 1LW0A 4CZMA 4DUZK 1Z26A 3FFKB 2KLAA 4AHCA 4F8RA 4CJUA 3CC2N 5KRTA 3L2RA 3SQ2A 4C8LA 5HROA 3KZBA 1C1BA 3B6PA 3LZJA 3HO1A 4GVMA 4DQIA 1XMQK 3BUZB 5C2DA 3VEZA 3C7NB 1NGHA 1SAZA 2BDPA 3SBTA 4PUOA 1HLUA 3HPGA 1EP4A 2YKNA 2I5JA 5BN8A 4KI4A 1HPMA 4EP4A 4E3SA 3BDPA 4B1YB 1IKVA 2P5OA 2NRHA 1RDAA 4X62K 2BE2A 4KFBA 4JKCA 4B9SA 5AQWA 3TAQA 4BRFA 3K0SA 2NRRA 3N4PA 3U3GA 2HOEA 4PHTX 4YFUA 5KGXA 4HWIA 3NMUA 2UUCK 3P1GA 2HSTA 4CW7B 4DSIA 4A5BA 1ASVA 3LDPA 4E7IA 3TSPA 2O8BA 1VSHA 1T44A 3CPWM 3OYEA 4NB4A 3RWUA 4N47A 3SJHA 1C0GA 2ATQA 2B5JA 3AO2A 4OPJA 3T1AA 3SUNA 2P9SB 1HNIA 3A5LC 3OYHA 4CD3A 3NH2A 2ZGZA 1KLNA 2OTJN 4DHYA 1BG3A 3KK2A 2RKIA 3QB0A 3ZSYA 4CZHA 3TR8A 3L3VA 1ZXOA 3AVJA 3U9DA 3V1RA 4CJWA 4BE0A 2A3ZA 4WQ4C 3NH1A 4Y0WA 3OY9A 1TKTA 4H5NA 4HCBA 4AHTA 2IVOA 1YAGA 5KPZA 1JLAA 3QO9A 2HNDA 3IKMA 2FSJA 4NLCA 4ILGB 2P1JA 2ZF5O 3O3FA 1WOQA 3THWA 4ELVA 1Y64A 4IFYA 1NJYA 3VENA 3DLEA 2O4IA 5C0YA 4E19A 3S3OA 1X9MA 3UKUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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