2NRRA

Crystal structure of the c-terminal rnaseh endonuclase domain of uvrc
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
151
structure length
139
Chain Sequence
MEALEELMKLLNMKDFPYRIEGIDISHLYTVASLVVFEDGFPKKGDYRRYKIDDYESIRTVVKRRYSKHPLPNLLFVDGGIGQVNAAIEALKEIGKDCPVVGLATVVFENREIHLPHDHPVLRLLVQIRDETHRFAVSY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of the C-terminal half of UvrC reveals an RNase H endonuclease domain with an Argonaute-like catalytic triad.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UvrABC system protein C
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
total genus 44
structure length 139
sequence length 151
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrrA00
2NRVA 2NRZA 2NRWA 3C65A 2NRXA 2NRRA 2NRTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BRMA 2KFZA 1G15A 3P31A 2GEMA 4L3QA 2ZF5O 3PV8A 3OTOK 2I7PA 4IOXA 3AVJA 5I3UA 3UKUB 4DUYK 4F3OA 3AA4A 4FLXA 1KLMA 1K9MO 4JKEA 5KRSA 4FK2A 4OJRA 5HL7L 1IV0A 4FWKA 4YOYA 2XHBA 1NGIA 1HQUA 1XC9A 3VQBA 1RNHA 3KLIA 4FWQA 3JAMO 1HUXA 4H0PA 4B9MA 3CM6A 4AH9A 4FJMA 2DPNA 4PUOA 3Q7BA 3OS2A 1KAZA 3U9DA 1SKSA 4DLGA 2OPQA 5EOYA 4OLBA 3TAPA 4FWRA 3CI5A 3U9ZA 4WQ5C 4AILC 3J7ZO 5C25A 1VQ7N 5AQGA 3DOKA 3VPZA 2ASMA 4YDUA 1W97L 1YITN 4FJLA 3CQYA 1MWKA 3FR0A 5KPRA 1TKXA 2Q97A 4CZJA 2GX9A 4CF8A 2UXDK 4DG1A 4N76A 1JXEA 2NRVA 3DLEA 2UU9K 5SZTA 1ESVA 1ASWA 4G9ZA 3WEEB 3THWA 2B4JA 2BGGA 2P9NA 2F9WA 4BRQA 3KD1E 1BHLA 1FKOA 1W9HA 2QK9A 4DWIA 4JKFA 2E2NA 1SUQA 1U2VA 1C0MA 1HJRA 1VQ5N 1RDDA 3M8SA 4FWPA 2FSNA 3VGMA 2RF2A 5AQOA 3O3HA 3UE5A 1Q86O 3T3FA 1UAXA 3AO4A 2O8FB 2WTUA 5KRTA 4YY3K 1I94K 2QWOA 3E9LA 1Z25A 3MMVA 1GOBA 3AVGA 3ISNC 2D1KA 4W5QA 4BGBA 4LF5K 4IOAL 1BIZA 3SZ2A 1VSKA 1WBDA 3GG4A 4NYNA 4JI6K 2D0OA 1ATNA 5J2MA 1YJNN 1TK8A 4BDPA 1SQKA 4FPBA 4NCGA 4C8OA 4CJLA 1CLQA 1BQMA 1GLDG 2HBLA 3IRXA 2ZJRL 4CHOA 3LDSA 4LFAK 1YVUA 1BI4B 4CF1A 1UWBA 1TVRA 3CFPA 4K41A 2P9KB 1SKRA 1IKXA 4GW6A 2KZMA 1LW0A 3IFRA 5BPLA 1NGGA 3RMCA 1HJOA 4IO8A 3V6DA 1WB9A 4FJHA 2OZMA 3C94A 3LM9A 5AFUH 3VQCA 3VENA 1TAUA 4CFCA 1U47A 2E1ZA 4FWOA 4F9OA 4BACA 3CCLN 4CZFA 4BRKA 1K6YA 4FYDA 1ILYA 4GY2B 4I6MB 1XMQK 4A2AA 2FSKA 3V1QA 4BE0A 3TU5A 2HHVA 4EHTA 3OYGA 3THYA 4CGHA 4CJEA 2Z1IA 3KLFA 3SCXA 2UUCK 4WFNL 2HBJA 1NJXA 5GAGP 1LAVA 2VGNA 5EVZA 2RPIA 5AQXA 2YHYA 2E88A 3ULEA 2WUSA 5JICA 1JXBA 4BE2A 1HKGA 4DQSA 5HOOA 3LWLA 3THXA 5KQ8A 3QIPA 5JLHA 4QS8A 1J5OA 4BREA 2B5JA 1JLAA 3U3YA 3K58A 4CEEA 4CGDA 4CCHA 3AAQA 1WLJA 3OY9A 2HF3A 3NDKA 3DXMB 2FBTA 4DU3A 1NNEA 1QE1A 5I42A 1E3MA 4A62A 4BRHA 2DY4A 3JXUA 1F21A 4RTFD 1HX1A 4K8XA 3CJ9A 1T05A 4DLEA 4O5FA 3BDPA 2V7YA 4BR7A 2Q1NA 1C6VA 3TSUA 3R8EA 3ZLJA 5BRFA 1HNXK 4B08A 2G8VA 3WXJA 3H1QA 1N8RO 4FK4A 4YOWA 1QQMA 4GMJB 4CBXA 4CFDA 4BC5A 1NKCA 1SZ2A 2RE2A 3VEWA 3H46O 2IAJA 3QICA 4IFYA 3KHYA 1VK0A 2IC3A 1YF5L 3VETA 1TK5A 3O3GA 2HNDA 1LOTB 1Z6RA 3O08A 4BDZA 1VSMA 1JLEA 4H0OA 4DSJA 3H6EA 5B8HA 2Q2RA 3LZIA 1OH5A 4FVMA 5C42A 4RG8A 1Q82O 4Y0WA 2QWPA 4YDUC 1RDAA 2YKMA 4C1NI 4IOCL 2ASPA 3IG1A 4JHDA 4DR3K 3WQTA 2XY7A 5EY4A 1S1TA 3SMSA 4CJKA 1FXXA 4C1NK 4CEAA 4CK3A 3IAYA 4DV3K 3DRPA 1HR0K 1ZYQA 3W0LA 1I39A 1RBUA 4WQ4A 4I2QA 3D2EA 4C8LA 4PQUA 1D4XA 3PX0A 2DFEA 3BGRA 3AVIA 1N5YA 4NYFA 5F2RA 4CZLA 2CH6A 1TV6A 4HUEA 3E01A 4JAXA 4U7BA 4FLWA 1X3MA 2WFBA 3ID6A 5JS2A 2FBXA 1C0TA 4DU4A 2OCEA 4KH6A 4K8ZA 1NMDA 1VQ4N 4A5BA 3CG7A 3FFIA 4YORA 4CJWA 3D0PA 1OVYA 1Q7YO 3OYMA 2NRRA 4B1XB 3L2WA 3FE1A 1VQMN 3TAMA 4CVNE 4Z0UA 1RBSA 2JWLA 1M1KO 1B92A 3HZ6A 3HPHA 2VWKA 1NJIO 1NGHA 3E9PA 1RTHA 2VGMA 5LL6Z 3D2FA 3O4NA 4BC4A 1BU6O 2EHGA 4JKGB 1EKEA 2QWMA 3O3FA 3HM9A 2GBZA 1QZ6A 2QWRA 4DTPA 1KCFA 1WUAA 1OVQA 1HPMA 2O8EA 4BRGA 3IUCA 2HMIA 4DF8A 3QB0A 5AZIA 4LF8K 4HVJA 3R3LA 3CCQN 5CYMA 1VQNN 3CMEN 4DFJA 5AQRA 5FPNA 3CCMN 5AQUA 1NWKA 1HNIA 2E8AA 2G8UA 4CW7B 1LWCA 3D7EO 1JL1A 2BH1A 3VQ9A 3S41A 5H1SQ 3EL2A 3CM5A 3O4QA 5F0XA 4H5RA 1ZBHA 3FFKB 4ISFA 4CK2A 2E2PA 4JRPA 2A40A 3VQ7A 4DQPA 3C6UA 4LFCK 3VGLA 2FLOA 1VSJA 1RDBA 1GLJO 3I55N 4A5AA 2P9UA 2ZGYA 5JMVA 4BWMA 2JGUA 5BRDA 1YJ9N 4G1QA 1BCMA 2E20A 3ZSWA 1QS4A 3L2QA 3KVGA 2P9SB 4CIEA 4KRFA 3A5OC 1L5UA 4MO5A 1L3SA 5BRHA 4LH4A 4F2SA 3L6QA 4XEIA 2Q0UA 2YCHA 4FM0A 3P83D 3K57A 4AQYK 4C23A 2W6LA 1TGOA 1S1UA 3K59A 3TPQA 4MQ3A 5C0YA 3O9UA 4FZYA 1TL1A 3ZT1A 3L2UA 3LDOA 3TAFA 3HPOA 1EO1A 4MLEA 2G8IA 3FLCO 4FJ5A 3U3GA 4OPKA 5AR0A 3CCSN 3T1HK 1RDCA 4YFUA 4KBOA 1IH7A 4OGEA 3V4IA 1BGXT 1C1AA 4E7LA 4ISEA 4PL8A 1N34K 4BRAA 3HM8A 4FZZA 1A5WA 1XWLA 1VQ8N 4NLBA 1QHTA 3KJVA 1IBMK 4BR2A 1GOCA 2YJEA 2WBNA 3VGKA 2FF3B 3H1VX 3L8BA 4LF4K 3NHGA 3ZETB 3AVCA 3BP8A 5EU7A 2P1JA 3UKRA 3B6PA 3PIOL 4KPYA 1U45A 3FZLA 1S1VA 5K14A 1RTIA 2EWSA 3SJHA 3FGUA 3A5MC 4NO7A 3PX4A 3QFUA 2CGJA 4O4GA 3SQ4A 4YHHK 4LF7K 4M41A 3NGZA 3AVHA 4CJQA 4FJ8A 1DTTA 4W5OA 3V1OA 2PAVA 1J53A 1X1PA 1BUPA 5TKWA 3CJCA 1RBVA 3AO5A 4C8KA 3CC7N 3K2PA 5KGWA 3O9TA 2X6SA 2P9LB 3P4IA 4FPAA 4M7YA 2E6MA 4KB1A 2E6LA 1S1XA 1U6ZA 4CF0A 4KHYA 1IBKK 2IGIA 3M6GA 2YX6A 3D45A 3LM2A 1JCGA 4RW9A 4O0IA 4DR1K 3AVNA 5KGXA 1VQPN 3QESA 3I8DA 4Z4HA 1BG3A 5FRMA 2YNGA 4ZTFA 1QQCA 3GOIA 2NRWA 4KHPK 3CFRA 1T44A 2P5OA 4CJFA 4FOIA 3KLHA 4H4OA 3OYAA 3U4LA 4EP4A 1BA1A 1MA9B 1DEJA 1KD1O 4B9NA 2HHXA 4MLHA 3R9PA 4FJKA 4CZMA 3HVRA 2BTFA 3F73A 4CEBA 1SS6A 4DSEA 1WOQA 1KVAA 3CQ8A 3F2KA 1LAWA 1HQEA 4HTUA 2HHSA 4DR6K 4E3SA 4PY5A 4BVOA 2Z1GA 4CJTA 1VQ6N 2PFUA 4B9QA 4BRIA 3P1GA 2D0AA 3MN5A 4OPHA 1B9DA 1RT3A 4JV5K 4J2AA 4H0TB 3ZT4A 1XC3A 4B1YB 3TANA 4JI8K 3V9WA 1A5XA 1JCFA 5KPTA 2QKBA 3TI0A 1SV5A 1NM1A 5FRNA 2O8DB 3V81A 2P9IB 1TKZA 3G6EN 1QSSA 4B9LA 3ATVA 1DLOA 3M3ZA 3QBWA 4V19S 4H03B 4IEIA 4OPAA 4FM1A 5AJ3K 5HRSA 1D9FA 4JD2A 3VQEA 4JRQA 4EFHA 4M3XA 3NAEA 2QXLA 4HUGA 4PL7A 2Q0RA 2B6AA 4OKKA 1NOZA 5AQTA 5C15A 3MWTA 2HVIA 1N6QA 5AQKA 4H4MA 3SBGA 4DTJA 3AGRA 4CEQA 2YNFA 3VTIA 3I8BA 5BPNA 3SPYA 3TABA 3TSQA 3K5OA 3ZCMA 4JNEA 4GVMA 3SAFA 1NKBA 4F8RA 4FZXC 4K0KK 5CYQA 3TAGA 1T6DA 5JLFA 4DTOA 4FLUA 3I0SA 4Y1CA 1TYQA 4DCHA 1YAGA 3DM2A 3VQ8A 3HOTA 4JKCA 1C0GA 4H0XB 1NK4A 4LSLA 2KQ2A 2ITMA 4EP5A 4F2RA 4FJ7A 4M3WA 3ITHA 3SPZA 1JLFA 1S6QA 3QLHA 4NCAA 2CH5A 4E7HA 5GIPA 3TWHA 3HP6A 4DV6K 3ZEUA 1JKHA 2KKZA 2HF4A 4DV5K 4KHSA 4J8FA 3OJSA 4BRFA 3VF2A 4DB3A 4KTQA 1XNQK 4KO0A 3L2VA 4BDYA 1DGKN 4JI1K 4CBUA 3PIPL 3TR8A 3R6MA 3H08A 1DT9A 4DSFA 1VSEA 3NCIA 5HRNA 1YHQN 3HRGA 4H5WA 4ZTJA 2ZE2A 3EEQA 4BY9C 5BPMA 3HVTA 2O8CA 3A5NC 2KHOA 2YHAA 5CY4A 3ZSRA 2UXCK 1Q81O 2I7NA 2Q36A 5I9EB 2ITGA 2KLAA 4FLZA 3THVA 2YHXA 3MX5A 2Q31A 1HPZA 1CXUA 3LP0A 2GUPA 2G8KA 4CJRA 5FPDA 5DM6L 3GBTA 2QA4N 3CJAA 3EE8A 4L8RB 3C7NA 1T8EA 3S3MA 4I7FA 4CGFA 4B9VA 4ELVA 1RBTA 4OX9K 4CZHA 1YXQA 3SQ0A 3AVMA 3ZT0A 3ENOA 3TAQA 4QOZB 4M42A 1BL3A 3S3OA 4J2BA 5EX5A 3F9MA 5A2QO 3DLLL 2X78A 2OPRA 1NK7A 2UUBK 4H5TA 3HT3A 3BF3A 1RT6A 1S5JA 4PKIA 4LC9B 1Y64A 1KAYA 2F4VK 3DLKA 4CJPA 2FSJA 3QO9A 3W3DA 4AM7A 1YJWN 2OPPA 1HYVA 3THWB 3LAKA 3TSPA 4RWTA 2P9NB 3CQXA 3RTVA 3CMAN 5BN8A 3ID8A 4CF9A 4FJXA 2PYJA 3O5BA 4BG9A 1U2VB 4CJVA 1WNSA 3DXKA 3MAQA 2G8FA 4FOEA 2ZD1A 2P5GA 3VQ4A 3OS0A 5TKYA 4AHRA 1NLVA 4JS5A 2Q3SA 1L3TA 3AVFA 2YNIA 4YNQA 3QFPA 1Z05A 2RN2A 4B9UA 5AQNA 2VYPA 4YOXA 2EX3A 3VA0A 3G71N 1RDWX 3BZKA 3CCVN 1J6ZA 3FZKA 1LWEA 1IO2A 3OS1A 2GWKA 2YNHA 3F5TA 2D0CA 3RMAA 3LP3A 4DV1K 3ULDA 3CCEN 4CI6A 1FW6A 2A42A 3DLBA 2RHKA 1NK0A 1Y97A 4GNIA 3NH2A 1LCUA 4DSKA 4I9QA 2BANA 4CIGA 1YTUA 4BR0A 3AV9A 4X65K 5AQSA 4MFBA 5AQZA 4BGAA 4X66K 2DTUA 1NK8A 3B6OA 3AA5X 3ASMA 1QSLA 4N41A 3ZT2A 3IS9A 4ISGA 3L4QA 3VQPA 4B1UB 1ZXOA 3VA3A 2BE2A 2F7TA 4C8MA 2P51A 4Z4EA 3BUZB 4GVEA 1S72N 1OH8A 3OA9A 3CIPA 4CD3A 4B3MK 4LF6K 1SL0A 4H0YB 3LDQA 1T03A 2BUPA 5CR4A 3C65A 4UQGA 1X9SA 4KI6A 3IKMA 5HROA 1RFQA 4O8UA 4JI2K 5ADXA 5M1NA 2UUAK 4IFEA 3QINA 3RRGA 3SV3A 2V52B 1BISA 4CJ4A 5KPZA 3AO2A 2AP1A 4DFPA 3KTQA 3G0ZA 4O44A 3THYB 3CC2N 3I33A 1VQ9N 1U04A 2H3GX 4CZIA 3VQ6A 1NK9A 3MEEA 1VQKN 3LDNA 3U6FA 4CECA 3H45C 3LDPA 3SNNA 1Q9YA 4OVLA 3ULEB 3O9SA 1NGFA 1NBWA 1WSHA 1TUUA 2E4LA 3BY5A 3THXB 4ID5A 3RVCA 1KAXA 2YKNA 1KVBA 1ZBIA 1QTMA 1FK9A 4B8CA 4EHUA 4BVPA 1J9AA 4DR2K 4DQQA 1NGDA 2A6AA 3VESA 3I0RA 3RSEA 4B9SA 4Z94A 1REVA 5BN9A 3AVAA 1BIUA 1RBRA 4CEOA 5M1QA 3DYAA 3VEYA 4M3TA 2OTJN 3LP2A 2PZSA 1KTQA 4LD0A 3CJ1A 3K9JA 3KK2A 4IJNA 2IVPA 2HMPA 5LJVA 2PY5A 1GLBG 3TAEA 1HLUA 4ILHA 3V9XA 1QVFM 2F8TA 2A5XA 3AARA 1K8KA 4X64K 4ELUA 3ZSXA 3QDKA 3O1BA 4E1NA 2W40A 1OH7A 3DWLA 3AO1A 1ZBLA 4KFBA 3NF9A 3MXIA 2D5RA 4CIFA 1GLCG 1N32K 2W41A 3NH0A 4KHWA 2XY8A 1RT7A 4CHYA 3LAMA 2I5JA 4GKKK 2QM1A 2Y1JA 4JYAK 2JLEA 3KKRA 4I2PA 4BQZA 4F3TA 3MN6A 4BROA 3LWMA 1VRTA 4CEDA 3S3NA 2AA4A 2YJFA 4JHDB 3RWUA 5DMRA 1WAFA 3M5RA 3PSFA 4BR9A 3CHWA 5AZJA 4B3OA 3D6RA 3QNOA 4EZ9A 3VQ5A 1ZBFA 2OANA 3MWPA 5M1OA 3D2EB 4CHNA 3GE1A 1S9EA 3TTCA 3ZX2A 4R79A 4EZ6A 4CK1A 1UA1A 3KD5E 2LSNA 4BQLA 5E41A 1QVGM 2E5LK 4FLYA 4OLAA 4WQ5A 3EYZA 3QEVA 3BF1A 4DFKA 4CGGA 4FWLA 2O8BA 3E1YA 4B8AB 1RT2A 1XHXA 3V1RA 1WSEA 2KFNA 1VAZA 1XHZA 3HJFA 4FW2A 4DU1A 1VSHA 3DMJA 1P90A 2HNZA 1NG9A 4PA1A 1TAQA 4DKWA 4IJAA 1NGBA 5E26A 1T6CA 5MLCQ 4FXDA 2P9PA 4W5RA 1KXPA 2J4RA 3NFAA 2VCPA 3M8QA 2OZSA 1HNZK 3GDQA 3LPUA 3VN5A 2QXFA 3AGKA 3OJUA 5EXWA 4OPJA 1KRPA 4BG8A 1TKDA 3K0SA 2AJQA 1NMNA 1WSFA 3WNGA 4AHUA 3L2RA 3D2FB 3UKUA 4CJUA 2W42A 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 2NRV A;  2NRZ A;  2NRW A;  3C65 A;  2NRX A;  2NRR A;  2NRT A; 
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 4BRM A;  2KFZ A;  1G15 A;  3P31 A;  2GEM A;  4L3Q A;  2ZF5 O;  3PV8 A;  3OTO K;  2I7P A;  4IOX A;  3AVJ A;  5I3U A;  3UKU B;  4DUY K;  4F3O A;  3AA4 A;  4FLX A;  1KLM A;  1K9M O;  4JKE A;  5KRS A;  4FK2 A;  4OJR A;  5HL7 L;  1IV0 A;  4FWK A;  4YOY A;  2XHB A;  1NGI A;  1HQU A;  1XC9 A;  3VQB A;  1RNH A;  3KLI A;  4FWQ A;  3JAM O;  1HUX A;  4H0P A;  4B9M A;  3CM6 A;  4AH9 A;  4FJM A;  2DPN A;  4PUO A;  3Q7B A;  3OS2 A;  1KAZ A;  3U9D A;  1SKS A;  4DLG A;  2OPQ A;  5EOY A;  4OLB A;  3TAP A;  4FWR A;  3CI5 A;  3U9Z A;  4WQ5 C;  4AIL C;  3J7Z O;  5C25 A;  1VQ7 N;  5AQG A;  3DOK A;  3VPZ A;  2ASM A;  4YDU A;  1W97 L;  1YIT N;  4FJL A;  3CQY A;  1MWK A;  3FR0 A;  5KPR A;  1TKX A;  2Q97 A;  4CZJ A;  2GX9 A;  4CF8 A;  2UXD K;  4DG1 A;  4N76 A;  1JXE A;  2NRV A;  3DLE A;  2UU9 K;  5SZT A;  1ESV A;  1ASW A;  4G9Z A;  3WEE B;  3THW A;  2B4J A;  2BGG A;  2P9N A;  2F9W A;  4BRQ A;  3KD1 E;  1BHL A;  1FKO A;  1W9H A;  2QK9 A;  4DWI A;  4JKF A;  2E2N A;  1SUQ A;  1U2V A;  1C0M A;  1HJR A;  1VQ5 N;  1RDD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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