2Q2RA

Trypanosoma cruzi glucokinase in complex with beta-d-glucose and adp
Total Genus 124
50100150200250300350020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
373
structure length
370
Chain Sequence
APAGSHMNIKELSLHELCEELKTPAWNAPLTFVGDVGGTSARMGFVREGKNDSVHACVTRYSMKRKDITEIIEFFNEIIELMPASVMKRVKAGVINVPGPVTGGAVGGPFNNLKGIARLSDYPKALFPPGHSAILNDLEAGGFGVLAVSDAHVFSEYFGVMWEGTQWRTCEQEPAGSVIGRGRCLVLAPGTGLGSSLIYYNPQHIVVPLELGSQTLPMRKDIDYIQTLHAELKLFPNYENMVSGAGLEFHYRQVVRGSRPPCSAGEIAKLASEGDANACKAMKKYHEYLMRVGSEASMALLPLTIVLVGDNIVNNAFFYRNPQNLKEMHHEALNHEMERFGFQSRVSYLRQKKLLNLNLMGCYRCGLDLS
5010015020025030035035030025020015010050
020406080100120Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
S1 (1-5)EMPTYS4 (47-56)S2 (24-30)O1 (91-93)TI1 (31-34)AH2 (63-75)S3 (34-43)TI2 (57-60)TII2 (43-46)AH11 (354-366)AH3 (78-82)S6 (95-96)TI'2 (96-99)TIV1 (95-98)S7 (100-101)AH4 (131-145)TI3 (104-107)TI4 (117-120)TI5 (118-121)TIV3 (119-122)TIV8 (194-200)3H3 (148-150)S11 (178-183)S10 (152-156)TIV5 (154-157)TI6 (158-161)TII4 (168-171)TVIII2 (299-302)TIV6 (183-186)AH6 (241-252)S12 (187-194)3H5 (208-210)S13 (201-206)3H6 (235-238)TIV10 (215-218)AH8 (273-297)AH5 (219-229)AH7 (261-270)TVIII1 (254-257)TI'3 (252-255)S14 (301-304)S15 (344-348)AH10 (319-330)AH9 (307-317)3H8 (339-341)AH1 (8-15)S5 (84-91)S9 (126-130)TII3 (122-125)3H4 (161-163)3H7 (333-337)3H1 (18-20)3H2 (113-115)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Trypanosoma cruzi
publication title The Crystal Structure of Trypanosoma cruzi Glucokinase Reveals Features Determining Oligomerization and Anomer Specificity of Hexose-phosphorylating Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase 1, putative
total genus 124
structure length 370
sequence length 373
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2007-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q2rA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 2q2rA02
2NZTA 3CQXA 3BEXA 4BRGA 3H6EA 1YUWA 1TYQA 1HLUA 4IWVA 2P9UA 3QFUA 3DAWA 4CZMA 3L6QA 3QMLA 2P9SB 3U9DA 4JD2B 1QZ6A 2Q97A 2BTFA 3S41A 3WEEA 1BU6O 3F9MA 4BRMA 5AQYA 5AQXA 2F9TA 3C0BA 4IZ9A 2IIRA 3ENHA 3O1BA 1MWKA 4WQ4A 1QQOA 2YHWA 4FWLA 3UE5A 3H1QA 3AARA 3KVGA 5KPTA 4HTLA 1JCFA 4EHUA 3FGUA 3G25A 1ZC6A 4M63C 3QDKA 3C7NB 3VEZA 4CZJA 1KAZA 5AQHA 1DKGD 5E26A 1YVNA 3MMVA 4PKHA 2KHOA 1BA1A 3VEVA 4BRFA 4FWNA 3VEOA 4ISGA 4LC9B 3VGKA 4BRIA 3L0QA 4F9OA 2QM1A 4CBUA 2D1KA 3CIPA 4RWTA 2QWQA 2Q31A 3L4IA 2P9PB 2UYTA 3J8AA 1NGEA 2ITMA 3D2FB 1K8KB 5BPMA 2ZGYA 4PKGA 2NLXA 3CJ1A 3IFRA 5ELZA 4AM7A 4Z94A 3VPZA 1NGHA 5AQRA 4BC4A 1GLDG 3UKUA 3R8EA 3AY9A 4IJNA 3IUCA 1XC3A 1SQKA 3LM9A 5EVZA 1WOQA 3O8MA 3FLCO 2YJFA 1NGCA 4FPAA 5I9EB 2E8AA 1HJOA 2P9IA 1ATSA 4BRQA 2QWMA 4BG8A 3CERA 5ADXA 4BC5A 5AQSA 4BC2A 4XH1A 3BF3A 4BGBA 2A6AA 4DB3A 2E20A 2HF4A 4K41A 3ZETB 4GNIA 4K25A 3WQUA 4BRPA 3QB0A 1S3XA 1BUPA 4MLEA 2I7NA 2P9SA 3VF4A 4JD2A 4B9QA 1XUPO 1QZ5A 1U2VB 2P9KB 4IJAA 1QHAA 2V51B 5EXWA 4BRNA 3SMPA 3FZMA 4JNEA 3FZFA 2J4RA 2H3GX 3ZX2A 3QICA 4IO8A 4QS9A 3SK3A 2GTDA 4FL9A 4CZGA 5JLFA 2Q0UA 4FWPA 4H5NA 3C7NA 2BUPA 4XH5A 1NLVA 4JN4A 1NGFA 3A5NC 3GBTA 2P9IB 5EOYA 4M7YA 2ASMA 3QFPA 4MO5A 3I33A 4B1ZA 1NGIA 2QXLA 2E1YA 3CJBA 4K43A 5KQDA 1GLCG 5AQMA 1G99A 1Q18A 3EL2A 1Y64A 4FWMA 4Y0WA 4AM6A 1GLBG 3O6WA 3CJ7A 4FOIA 4WQ4C 5AQLA 5AQQA 1XQSC 5AZJB 2P9PA 3D2FA 2CGLA 1K8KA 4BR9A 1YXQA 3LDQA 1IJJA 1D4XA 2Q0RA 1BDGA 3MN9A 4BR2A 1BA0A 3B8AX 3MCPA 4QS8A 2FLOA 3VEXA 2QWRA 3LDOA 3LDNA 5BR9A 3H1VX 3O4WA 5AQWA 3M3ZA 3TU5A 1GLEG 3FZHA 3ENOA 4O8KA 3U8XA 4CBXA 1QQMA 2A3ZA 2OANA 3W3DA 5AQJA 3KHYA 1X9JA 4B1WB 4BRLA 2GUPA 5BRDA 2PBDA 4BQLA 2HMPA 1V4TA 2FF3B 4EFHA 3HI0A 1LCUA 5BPLA 3CJCA 5BRHA 4EIAA 4CI6A 1S22A 4H0VB 1RFQA 2E2OA 3FZLA 2Q2RA 5FPMA 3WXIA 2ZF5O 2QW9A 1GLAG 1C0FA 3FR0A 4PKIA 3ZETA 4H0XB 3VGMA 2P9NB 1MWMA 2QWNA 3OHRA 4ISFA 4WQ5A 4BC3A 4CD1A 4E1JA 5KPRA 3VEWA 1U2VA 2P9KA 3A8YA 3VESA 1CZAN 3P4IA 3LL3A 3CHWA 2VYPA 5B8HA 3HBTA 1TUYA 3EKSA 1GLJO 2YJEA 1HUXA 4H0OA 4FWRA 4B1VA 5JICA 5LY3A 4H0PA 3U4LA 4B1YB 4B1XB 4FWKA 1LOTB 4GY2B 3MDQA 2VCPA 1DGKN 4RCHA 3DXKB 3GL1A 1BWFO 3M1FA 2NRHA 4WYBA 1ATNA 2FSJA 3EN9A 2CH5A 3H3OB 5JLHA 4FWSA 3SMSA 3VENA 2V7YA 2PAVA 4H5TA 4MLHA 4B1UB 3SJHA 4JAXA 2E88A 3JXUA 5AQIA 3WUHA 5AZJA 2A5XA 2CGJA 4CZLA 2CGKA 3MN6A 2ZWHA 4EHTA 1NGAA 2P9LB 2HOEA 4BVOA 3O5BA 1Z05A 4CZFA 5FPEA 1HKBA 3IDHA 5FPDA 3O1WA 3A5LC 4M7XA 1BO5O 2D4WA 4YDUA 5F1XA 3ZEUB 1KAXA 1IG8A 2Q1NA 5BPNA 5AQTA 5LJWA 2CH6A 4BRCA 3CJ9A 4I6MB 1BOTO 4H5VA 4IXCA 4H0YB 2V7ZA 3GOIA 3DXMB 3M6GA 4FPBA 1ESVA 4CBWA 4BREA 3FZKA 3O80A 5AR0A 4BRKA 3LDLA 4H03B 5AQZA 4FWQA 1MA9B 3MN5A 2DPNA 2W41A 3H3NO 4BR5A 4RTFD 2GWJA 2E2NA 5ADXH 3BP8A 5TKYA 2GELA 1KXPA 1EQYA 2P9NA 4BQZA 3FFKB 1ATRA 3QBWA 5AQUA 1JCGA 2FSKA 4C23A 2D0OA 5E84A 4JHDB 1E4GT 5CE3A 3FE1A 1NGBA 3WXLA 4BRAA 3WQTA 4O5FA 2YHXA 3UKRA 1NGJA 3ATVA 1OKJA 3VF6A 1KAYA 4BR7A 3VEYA 1NMDA 5AQKA 3SLCA 1ZXOA 1R59O 3MK6A 5AZIB 5AFUH 4FWOA 2HF3A 1C0GA 2GEMA 5FPNA 2GWKA 2E1ZA 4H5WA 5BN9A 4BG9A 1X3MA 3DXKA 3I8BA 3VERA 3VF2A 3ULEB 4DQ8A 3HTVA 1YAGA 4WQ5C 5AQNA 4BVPA 4CZEA 4QS7A 4A61A 2WUSA 3ID8A 1HKGA 1H1VA 3MN7A 3EZWA 5AQPA 3EKUA 2E2QA 1BG3A 4FO0A 4BROA 3LDPA 2EWSA 2A40A 4A2AA 3W0LA 1TUUA 1NGDA 3CETA 1P8ZA 3RSEB 2QWOA 2IVOA 3O08A 3GE1A 1SZ2A 2P9LA 3AAQA 1T6CA 4A62A 5BREA 4H0TB 3TPQA 3U9ZA 4BGAA 4BRDA 1JCEA 4CZKA 4K42A 5LJVA 3ZX0A 5BN8A 4EAHD 3EO3A 3UKRB 4CZIA 3CQYA 3VGLA 5AQFA 5AQGA 3ZEUA 3JS6A 3CI5A 2VWBA 3LM2A 5KPZA 3DJCA 1HX1A 3GG4A 4I6MA 5AQOA 4CJ7A 3HZ6A 3D2EB 3HSCA 3DXMA 2QWLA 3AAPA 1RGIA 2YHYA 3BF1A 4BRHA 1NM1A 1ZBSA 2ASOA 1TYQB 2P9UB 2IVPA 5AQVA 5KQ8A 1J6ZA 2E2PA 3QBXA 4MO4A 3WEEB 2FXUA 3BUZB 1E4FT 1GLFO 1MDUB 2W40A 5EY4A 4YDUC 1NWKA 4CZHA 3ZX3A 4XH4A 4ISEA 4JHDA 2QWPA 3D7EO 4DHYA 4KBOA 3H45C 3R6MA 3WXKA 5EX5A 1QQNA 2A42A 4PL7A 2ZGZA 5AZIA 2YCHA 4PL8A 3R9PA 4A2BA 5JMVA 1WUAA 4FSVA 2IVNA 3WT0A 4BR4A 2V52B 5F0XA 1NBWA 3ULEA 4DCHA 1HKCA 4NB4A 1HPMA 4XEIA 3CJAA 4CD3A 2AP1A 3UB5A 1Z6RA 5AFUA 1T6DA 1DEJA 4J8FA 4HWIA 2I7PA 3HM8A 3WXJA 3A0IX 3UKUB 4H5RA 3RSEA 4FOEA 2FSNA 1X3NA 4L3QA 2FF6A 3VETA 1V4SA 1NGGA 2ASPA 4NO7A 1RDWX 2AA4A 3H46O 3DWLA 4BR0A 2YI1A 5BRFA 2Q36A 3A5OC 3A5MC 2A41A 1SAZA 1GLLO 3IMXA 1U6ZA 3ATUA 2F9WA 3GDQA 3D2EA 3KZBA 5F2RA 1T44A 2D0PA 3VOVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2NZTA 1N36K 4JRQA 4NLBA 4IWVA 2P9UA 3DAWA 1XHZA 1QTMA 1QSLA 4LF8K 3QMLA 4IG0A 2NNWA 1EO1A 2X6SA 5J2PA 1VQ9N 5CZ1A 4DU4A 5E41A 4CF9A 2EX3A 3EE8A 3F2KA 1DTTA 4WQ4A 1QQOA 3UE5A 3WXMB 3H1QA 3AARA 3KVGA 3I8DA 1JCFA 4KTWA 2HHXA 4WCEL 2O4GA 4JK9A 3VEZA 3THYB 2P5OA 1YVNA 1NK9A 3VEVA 4FWNA 2B5JA 4DSEA 4RW9A 1HQUA 4CGIA 1NKBA 3VQ9A 3IKMA 2Q31A 2ITMA 2YV0X 3MWTA 3D2FB 4ELVA 5BPMA 2ZGYA 4PKGA 2O8DB 4CJ5A 4IBNA 4KB0A 4BC4A 1GLDG 3UKUA 4IJNA 1XC3A 3E1YA 1VSKA 4YOVA 3MXMA 4ZHRA 3LANA 5I9EB 4G1QA 3HYFA 3NAEA 1HNVA 1Q9YA 4BG8A 4RW4A 1VSJA 3ASMA 3CCJN 1DTQA 4BC2A 4RG8A 3AO4A 4E89A 1SL0A 4Q5VA 2HMIA 3BF3A 5DMRA 4CJ3A 3AVJA 3HO1A 3TSUA 4ELTA 5FROA 4K25A 3QB0A 2I7NA 2P9SA 3C6TA 4DUZK 3QEWA 3H08A 1U2VB 2P9KB 2YHBA 4AQYK 1NJXA 3V9XA 1NG9A 4O0JA 4DTOA 3FZFA 4CJUA 1O1WA 3ZX2A 4QS9A 3SK3A 5LL6Z 1HMVA 3OYNA 2EHGA 2BDPA 2BUPA 5GAHP 1IKXA 1NLVA 3A5NC 5EOYA 5C2DA 4H8KA 4HUFA 3QFPA 1EKEA 2F8SA 4DQRA 4WFAL 1YJ9N 1HNXK 5AQMA 4FLWA 1Q18A 1LAVA 4AM6A 3JAMO 3WNHA 1B9FA 4FVMA 3CJ7A 1TK0A 5AQLA 1XQSC 2P9PA 3HXMA 3CCEN 4HUEA 1IJJA 4PWDA 1BDGA 1U45A 3SUPA 3B8AX 5JS1A 3VQ6A 2QWRA 5TKWA 4FJ5A 3IG1A 1VQ5N 1VK0A 1XHXA 4O8KA 1KVAA 4DV4K 3V9ZA 4CFDA 3MEDA 4O8UA 4E1MA 3KHYA 4B1WB 3O9RA 3DRSA 3SZ2A 4IEEA 2YHAA 2PBDA 2HMPA 5I3UA 3PV8A 4EFHA 5BPLA 3CJCA 2B4JA 1ZBHA 4CI6A 2QI2A 4DQQA 4LFCK 2E2OA 3VQBA 1N5YA 1U47A 5FPMA 4CERA 2QW9A 1GLAG 2HBLA 1RCHA 3ZETA 4H0XB 1YF5L 2P9NB 3OYFA 3KLIA 5SWMA 4BC3A 4CEDA 1NOYA 4E1JA 2KKZA 5KPRA 3AVCA 3DYAA 4NYFA 1CZAN 3P4IA 3RTVA 1HNWK 3CHWA 3MEGA 1BL3A 2UUAK 5FDLA 4M3UA 3PX0A 3TSQA 3U4LA 2OPPA 1BCOA 2VCPA 4B9VA 4BDPA 2XO7A 5C2FA 1BIUA 1BWFO 5DM6L 3PUFA 1TL3A 3S3NA 2CH5A 4FWSA 4LFAK 1QSSA 1BGXT 2PAVA 3N4QA 3SJHA 3SNNA 4JAXA 2E88A 3AA5X 2QK9A 4DF4A 4OLBA 1TKZA 3O9SA 1ZBLA 4M3ZA 3MX5A 3O5BA 3IDHA 2OTJN 3I0RA 4E7JA 2HNYA 3EZ5A 3O1WA 1BO5O 1RT6A 4DTXA 3SQ1A 3NDKA 1WAJA 1IV0A 1KAXA 1SKWA 2UXCK 4A5BA 4E0DA 3C6HA 1HNIA 4C1NK 1ZBFA 4DUYK 3GOIA 4JS5A 3M6GA 4JI0K 1XMOK 5AQZA 1NJWA 1MA9B 2ZQBA 3H3NO 2W41A 4IFYA 2HHUA 2NRZA 2GWJA 5TKYA 1NNEA 4JI7K 1YTAA 1QE1A 3CMAN 4FLTA 5CE3A 3OYCA 4GMJB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2NZT A;  1N36 K;  4JRQ A;  4NLB A;  4IWV A;  2P9U A;  3DAW A;  1XHZ A;  1QTM A;  1QSL A;  4LF8 K;  3QML A;  4IG0 A;  2NNW A;  1EO1 A;  2X6S A;  5J2P A;  1VQ9 N;  5CZ1 A;  4DU4 A;  5E41 A;  4CF9 A;  2EX3 A;  3EE8 A;  3F2K A;  1DTT A;  4WQ4 A;  1QQO A;  3UE5 A;  3WXM B;  3H1Q A;  3AAR A;  3KVG A;  3I8D A;  1JCF A;  4KTW A;  2HHX A;  4WCE L;  2O4G A;  4JK9 A;  3VEZ A;  3THY B;  2P5O A;  1YVN A;  1NK9 A;  3VEV A;  4FWN A;  2B5J A;  4DSE A;  4RW9 A;  1HQU A;  4CGI A;  1NKB A;  3VQ9 A;  3IKM A;  2Q31 A;  2ITM A;  2YV0 X;  3MWT A;  3D2F B;  4ELV A;  5BPM A;  2ZGY A;  4PKG A;  2O8D B;  4CJ5 A;  4IBN A;  4KB0 A;  4BC4 A;  1GLD G;  3UKU A;  4IJN A;  1XC3 A;  3E1Y A;  1VSK A;  4YOV A;  3MXM A;  4ZHR A;  3LAN A;  5I9E B;  4G1Q A;  3HYF A;  3NAE A;  1HNV A;  1Q9Y A;  4BG8 A;  4RW4 A;  1VSJ A;  3ASM A;  3CCJ N;  1DTQ A;  4BC2 A;  4RG8 A;  3AO4 A;  4E89 A;  1SL0 A;  4Q5V A;  2HMI A;  3BF3 A;  5DMR A;  4CJ3 A;  3AVJ A;  3HO1 A;  3TSU A;  4ELT A;  5FRO A;  4K25 A;  3QB0 A;  2I7N A;  2P9S A;  3C6T A;  4DUZ K; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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