2QM1A

Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
SNAMDKKIIGIDLGGTTIKFAILTTDGVVQQKWSIETNILEDGKHIVPSIIESIRHRIDLYNMKKEDFVGIGMGTPGSVDIEKGTVVGAYNLNWTTVQPVKEQIESALGIPFALDNDANVAALGERWKGAGENNPDVIFITLGTGVGGGIVAAGKLLHGVAGCAGEVGHVTVDPNGFDCTCGKRGCLETVSSATGVVRVARHLSEEFAGDSELKQAIDDGQDVSSKDVFEFAEKGDHFALMVVDRVCFYLGLATGNLGNTLNPDSVVIGGGVSAAGEFLRSRVEKYFQEFTFPQVRNSTKIKLAELGNEAGVIGAASLALQFSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Glucokinase from Enterococcus faecalis.
rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Enterococcus faecalis
total genus 104
structure length 324
sequence length 324
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A02
2V7ZA 2HMPA 3EN9A 3O5BA 2ZGZA 4K42A 3CQXA 2D0PA 1SZ2A 4DHYA 1Z05A 3VERA 1KAZA 3U9ZA 4FWLA 3EKSA 2ASMA 5AQKA 2A40A 2AP1A 3ZEUA 4BRLA 3BEXA 3BP8A 3VEOA 1DKGD 2IVOA 4EIAA 3VF4A 4BRKA 1DGKN 3A0IX 4CZFA 4FSVA 4DQ8A 4BRAA 1HLUA 2E88A 3M1FA 4XH5A 2P9LB 2GWKA 4I6MA 5JLHA 3OHRA 4CZLA 3AY9A 5EOYA 3ZEUB 1GLDG 4B1UB 3VGLA 1U2VA 3A5LC 3IDHA 4BQLA 4PL7A 4WQ5C 3S41A 1NWKA 5F2RA 2QXLA 5BRFA 4JD2A 3DJCA 3ZETA 4I6MB 1NM1A 5FPMA 4BGBA 4CBXA 3GBTA 3ZX3A 1BWFO 1T6CA 5AQJA 3QFUA 3J8AA 3H3OB 3A5OC 1KAYA 1Q18A 4BRDA 2YI1A 3O4WA 4JD2B 3ZETB 2W41A 5LY3A 3GDQA 1NGHA 1XUPO 3W3DA 3BF1A 1HJOA 5AFUA 4MO4A 4BRGA 2QWQA 1MWKA 2QWLA 5EVZA 5I9EB 5AQUA 2FSNA 4H0TB 4BR4A 3A5MC 4FL9A 1X3NA 3HSCA 1JCGA 3SK3A 4BC3A 5AQZA 4JNEA 4BRCA 3U8XA 4RTFD 2FF3B 1HKCA 3QBWA 4AM7A 4XH4A 1NBWA 4BRPA 4CZJA 4FWPA 5AQIA 4XEIA 3HZ6A 3I8BA 5JMVA 5AZIB 5BPMA 2AA4A 2P9UA 3VENA 5KPZA 4H0YB 3H6EA 3H45C 3VF6A 1NGFA 4CD3A 3VEYA 4QS9A 5AQOA 3UKRB 5ELZA 4BRQA 1NGGA 1YUWA 3DAWA 3WXJA 3QB0A 4H0PA 3MCPA 1K8KA 2P9UB 4H5TA 1MWMA 2QWNA 3DXKA 4NO7A 2DPNA 3VESA 5EY4A 1KAXA 1TUYA 4FWKA 1IG8A 3O1WA 5F1XA 4WQ4A 2ITMA 5BPNA 5LJWA 1X3MA 1K8KB 3CI5A 4B1YB 4FWSA 1Y64A 3O1BA 4CD1A 4BRMA 1V4SA 3VOVA 3D2EB 2D1KA 4WYBA 4GNIA 5AQFA 1E4FT 3U4LA 1HUXA 3JS6A 2QM1A 1NGEA 5AZJA 2F9WA 3P4IA 1YXQA 3FZMA 1GLLO 2P9SA 1C0GA 3A8YA 2YJFA 5AQPA 3A5NC 2CGKA 5BPLA 2J4RA 3TU5A 3CQYA 5FPEA 4IJNA 2PAVA 1G99A 1RGIA 5AZJB 3GOIA 5AQMA 2P9LA 3WXIA 4M63C 1BO5O 1ATSA 2P9PA 3VEVA 2P9SB 1NGJA 1BA1A 4IXCA 2YHWA 3M6GA 4RWTA 5FPDA 2FXUA 3FZLA 3CJBA 4FWRA 2Q97A 2UYTA 3C7NB 4J8FA 3RSEA 2YJEA 4IZ9A 3ATUA 3JXUA 4A2BA 1XC3A 2P9PB 5AFUH 4PKIA 4A62A 4FPAA 4CBUA 3LDPA 3VEWA 4BVPA 3WQTA 4A2AA 4BGAA 4ISGA 4K43A 3ZX0A 3WQUA 3W0LA 2GELA 3D2FB 1QQOA 4H5NA 1HKGA 4H03B 5AQLA 1E4GT 1NGBA 3RSEB 3ZX2A 1BOTO 2FSJA 1QHAA 2E1YA 4B1WB 3GL1A 2P9KA 1TUUA 3KZBA 4BG8A 5JICA 1BU6O 2E2NA 4HWIA 3QICA 5E84A 1QZ5A 2KHOA 1JCEA 2PBDA 3TPQA 4FWMA 5TKYA 2E8AA 3H1QA 4YDUC 3SLCA 5E26A 5AQXA 4ISFA 4BC4A 4FWNA 1HX1A 4EHUA 3CJ9A 1GLFO 1ZXOA 3ATVA 2P9KB 4M7XA 3VETA 4CJ7A 3HTVA 4WQ4C 5BREA 5BRDA 5JLFA 2QW9A 4FO0A 2QWOA 4BR9A 1ESVA 2E1ZA 5AZIA 3UB5A 5LJVA 5KQ8A 2QWRA 3LM9A 4FPBA 3VEZA 1V4TA 1ATRA 2I7NA 3BF3A 4M7YA 2E2PA 3UKRA 5KPRA 2ZWHA 2V51B 4GY2B 3FZFA 4BR7A 4Y0WA 2IVNA 4EFHA 2E20A 4DB3A 4F9OA 4BQZA 2HF3A 4H0VB 3VF2A 2VWBA 3F9MA 3CJAA 3IUCA 4FWQA 3UKUA 3VEXA 2F9TA 3LDOA 2QWMA 3IFRA 3SJHA 2Q0RA 2H3GX 1H1VA 2ASOA 3H3NO 4H5WA 2IVPA 1BA0A 4A61A 3AAQA 3D2EA 2FSKA 4E1JA 1X9JA 4CBWA 2GTDA 3C0BA 5AQSA 3HI0A 3ENHA 1MA9B 4WQ5A 3L4IA 3UKUB 3FZKA 1GLCG 5BRHA 1R59O 3B8AX 3FR0A 4MLHA 1JCFA 5AR0A 4BRNA 5FPNA 4O5FA 2W40A 4CZGA 3WT0A 5AQRA 5AQTA 3SMSA 3WUHA 5EXWA 4MLEA 2NZTA 1SAZA 1MDUB 4IJAA 4C23A 3M3ZA 2QWPA 2OANA 4B1VA 2EWSA 4CZMA 2P9NB 4B1XB 1U6ZA 3CETA 4BVOA 2GEMA 2Q31A 3ULEB 4BR0A 1GLAG 3WXKA 2YHYA 3BUZB 4FOEA 3QFPA 3H1VX 2Q1NA 3CERA 1QZ6A 2YCHA 4BG9A 3FFKB 5AQHA 1RFQA 1NLVA 3MN5A 1IJJA 2D4WA 3CJCA 3ENOA 1WOQA 3D7EO 2HF4A 3C7NA 4B1ZA 5ADXA 3MDQA 3R8EA 2VYPA 4MO5A 1TYQA 1D4XA 3UE5A 2CGLA 5BN9A 4JN4A 3FLCO 3O6WA 3ID8A 4BC2A 1OKJA 3MN9A 3D2FA 1XQSC 3AAPA 5AQQA 3VGKA 3I33A 1T44A 1YAGA 1DEJA 5BN8A 1S22A 2GWJA 4BRFA 1TYQB 4BC5A 5AQWA 3HBTA 5CE3A 3L6QA 3FE1A 3R6MA 4LC9B 4CZEA 1GLBG 3LL3A 3CJ7A 4BRHA 4CZHA 2CGJA 3LDLA 4BROA 5F0XA 4BR5A 1NMDA 3WEEA 2BTFA 2CH6A 3KVGA 2BUPA 2IIRA 2I7PA 3FGUA 3CHWA 2FF6A 3G25A 4ISEA 1YVNA 3EZWA 4HTLA 2FLOA 3QDKA 4K41A 4BR2A 2VCPA 3MN7A 4QS8A 2V7YA 3CJ1A 3WEEB 2P9IA 3EL2A 2Q2RA 4JHDA 1HPMA 4FWOA 1BUPA 5AQYA 3WXLA 2ASPA 4B9QA 4BRIA 3DXMA 4PL8A 2A3ZA 4JAXA 1NGIA 3FZHA 2CH5A 2ZGYA 2P9IB 4RCHA 5AQGA 1U2VB 1LCUA 4JHDB 4CI6A 1ATNA 1NGDA 2GUPA 3O80A 1C0FA 4EAHD 1J6ZA 4IWVA 1HKBA 3DWLA 1BDGA 4PKGA 3DXMB 1QQNA 4O8KA 1T6DA 3L0QA 3O8MA 1ZC6A 1Z6RA 1WUAA 4QS7A 4DCHA 2NRHA 3O08A 4EHTA 3EO3A 3GG4A 4FOIA 2A6AA 5AQVA 1EQYA 2E2OA 3GE1A 2Q0UA 2Q36A 3LM2A 1NGCA 2HOEA 4KBOA 1GLJO 4PKHA 5AQNA 1CZAN 3LDQA 1SQKA 2ZF5O 1GLEG 1NGAA 2A42A 3IMXA 5KQDA 3SMPA 3QBXA 2V52B 3MK6A 1S3XA 1P8ZA 3VGMA 3CIPA 4BREA 3VPZA 4CZIA 1QQMA 2A41A 3EKUA 5ADXH 2P9NA 1LOTB 2E2QA 3ULEA 5B8HA 3U9DA 1BG3A 4Z94A 2WUSA 1ZBSA 4CZKA 5BR9A 3MMVA 1KXPA 4XH1A 3R9PA 4IO8A 2A5XA 3AARA 4AM6A 2D0OA 4H0XB 4YDUA 4NB4A 3KHYA 4L3QA 4H5RA 3LDNA 4H0OA 3H46O 3HM8A 5EX5A 4H5VA 2YHXA 3DXKB 4K25A 2NLXA 1RDWX 5KPTA 3QMLA 3MN6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HMPA 2ETJA 2NRWA 3CCJN 1QS4A 4AHUA 2AJQA 1WAJA 4FK0A 5GAEP 1Q86O 4YOWA 1JL2A 5GAHP 1YTAA 2IC3A 1BIZA 2QTDA 1IBLK 4HTUA 3HPHA 4OGEA 3OYEA 2E6MA 3U9ZA 3ZYYX 4CFCA 2G8WA 3KK7A 4FWLA 3VQ7A 1VQMN 1DT9A 3BP8A 3VEOA 1DKGD 2IVOA 4K0KK 4BRKA 3OYBA 1VSFA 4CJ4A 4DTOA 3NGIA 4B8AB 1WBBA 1WN7A 3OS1A 4B1UB 2QKKA 4PL7A 1ASUA 3OY9A 4UY8O 4XIUA 3THVA 2QXFA 2QXLA 5BRFA 4O8UA 3ZETA 5FPMA 3K5NA 2G8HA 3N4QA 3TARA 3HRGA 2PFUA 3ZX3A 3KLHA 1BWFO 3VTHA 5C10A 3QETA 5AQJA 4CF2A 1HQUA 1Q18A 4IFEA 4PUOA 5C2DA 4KV8A 2HHXA 1Q8IA 2RF2A 2QWLA 3AVCA 5AQUA 1LWCA 3PSFA 2PYLA 4QCLA 4FL9A 3L2RA 1BQNA 3HSCA 3IKMA 5AQZA 3RVCA 4FVMA 3MX5A 3RTVA 1J54A 3CFRA 4ELVA 4DV4K 1NJYA 3TI0A 1SUQA 3DLHA 3AO3A 3QBWA 4AM7A 1NBWA 4CE9A 3Q7CA 4PY5A 4CEDA 3I8BA 4Z4FA 4LY7A 2VWJA 1RT7A 4E7JA 1WSEA 3OYCA 1NKBA 3VF6A 3V9SA 1YHQN 4CD3A 4CF1A 5CYQA 4CIGA 1YUWA 3THXB 3C95A 2G8IA 3QB0A 4DV5K 4KRFA 3MCPA 2GUIA 2P9UB 4M3UA 3QESA 1MWMA 3CCEN 5FROA 4KH4A 4CF0A 2Z1IA 1VSMA 4Z4GA 4O5BA 3NFAA 4WFNL 3BY5A 4R79A 4B3MK 1X3MA 4JI5K 1K8KB 2A1SA 1HNVA 4HUFA 3VQPA 1SL1A 1ITGA 2BE2A 3CI5A 3DLKA 3FFIA 4DFJA 1V4SA 3VOVA 1KLMA 4PA1A 1X9SA 1NOYA 3ZSXA 1NK4A 3O9UA 1NKCA 2HHTA 4AHCA 4IOCL 3CQYA 4IOAL 3I55N 1TKTA 4HUGA 1RGIA 1T3VA 3WXIA 1KD1O 1RDDA 3ITHA 3M8PA 2ZQBA 1TK0A 3OYDA 4RWTA 1FW6A 5J2NA 3FZLA 1IKVA 1T7PA 1N5YA 4DKWA 4JI7K 1YTUA 4GV6A 4IZ9A 1NJIO 3JXUA 4R5PA 3AA2A 4M45A 4CBUA 4C1NK 2OTLN 4A2AA 4JI3K 1HNWK 3ZX0A 4IKFA 4KH6A 2GELA 2OZMA 1T8EA 1E4GT 1NGBA 4RG8A 4AILC 1JJ2M 1BOTO 3V1RA 2P9KA 1TUUA 4BG8A 1BCMA 4M3RA 4FYDA 5E84A 3HK2A 4CJFA 4DR6K 3MXJA 2E8AA 2X74A 5E26A 1VSIA 4M7XA 4CJPA 4HCBA 1XHXA 3HTVA 5BRDA 4BR9A 3IRXA 1ESVA 3QINA 4FVUA 4NXNK 4ICLA 1RDCA 2XO7A 2QWRA 3VEZA 4DV0K 5HRNA 4NCAA 1V4TA 4CHQA 1VQPN 2I7NA 2FBVA 3QEXA 3QLHA 4YOXA 3THXA 2WFBA 1Y97A 4BR7A 3SBGA 4Y0WA 4EFHA 4U67L 4BQZA 1XMQK 1D9DA 3WNEA 3J7ZO 4NLBA 4FWQA 3LDOA 3SJHA 4GKJK 4LF6K 4H5WA 1RTIA 2DFEA 4FW1A 4E1JA 1X9JA 1HNZK 3EY1A 3C0BA 1N32K 3ENHA 5HOOA 3UKUB 2O8CB 3TABA 3F73A 5BRHA 3OYKA 1R59O 3PUFA 5FPNA 4CZGA 4PWDA 1YF5L 5AQTA 3K5OA 3ULDA 1NOZA 4CF8A 4MFBA 1SAZA 4C23A 1VQ4N 5HROA 2OANA 4B1VA 4OO1J 2G8VA 2P9NB 5IT9O 2GEMA 3WXKA 4FOEA 3QFPA 4F2RA 3DOLA 3H1VX 1B9FA 3L8BA 2YCHA 1YJWN 5AQHA 1G15A 1RFQA 4I7FA 1IKYA 4HUEA 3ENOA 3IG1A 4B1ZA 1C1BA 1TKZA 2YNFA 2VYPA 1D4XA 4RW9A 3FLCO 3O6WA 4I9QA 3ID8A 2VWKA 5D3GA 4OPJA 1WLJA 3QIOA 2VG7A 3AVGA 3I33A 3DRPA 4BRFA 4TSXA 1TYQB 4FLVA 4DFPA 4CJLA 3FE1A 3R6MA 3CCSN 3ZSQA 1BL3A 3LANA 1SV5A 3C6AA 3AV9A 2YNIA 4CZHA 2CGJA 4WF9L 4F3TA 2WONA 1N8RO 5CYMA 2BTFA 4WFAL 3NH2A 4CEBA 2OZSA 1UA0A 2BUPA 3G25A 4ISEA 4I2PA 3ZCMA 2FLOA 5I3UA 3QDKA 3LPUA 4YFUA 4LFCK 3QEWA 3K58A 5FRMA 1EETA 4LH4A 3WEEB 2Y1JA 2Q2RA 1ILYA 3OA9A 4FJKA 5M1OA 1NKEA 4RCHA 1LCUA 4JHDB 1ATNA 2GUPA 1C0FA 5FDLA 4IWVA 1VQON 4PKGA 4CCHA 3MXMA 1T6DA 3O8MA 4QS7A 3F9KA 2XY7A 1RBTA 4FOIA 3LWLA 2A6AA 4WFBL 1NGCA 3SPZA 2HOEA 1RBRA 1RNHA 3OYLA 3M8SA 2HHQA 4GW6A 3L2WA 4OVLA 4C8NA 1SQKA 2ZF5O 4OKKA 3SZ2A 3E66A 2A42A 3IMXA 3SMPA 1X9WA 4JI8K 2V52B 2EX3A 3CC4N 3DM2A 3VPZA 2YX6A 4EP4A 2O4GA 2P9NA 1VQKN 3U9DA 3P1GA 2HMIA 2WUSA 1JLBA 4JKCA 3CXCM 4LFAK 1L5UA 2ZJRL 2P5OA 3CPEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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