2QM1A

Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
SNAMDKKIIGIDLGGTTIKFAILTTDGVVQQKWSIETNILEDGKHIVPSIIESIRHRIDLYNMKKEDFVGIGMGTPGSVDIEKGTVVGAYNLNWTTVQPVKEQIESALGIPFALDNDANVAALGERWKGAGENNPDVIFITLGTGVGGGIVAAGKLLHGVAGCAGEVGHVTVDPNGFDCTCGKRGCLETVSSATGVVRVARHLSEEFAGDSELKQAIDDGQDVSSKDVFEFAEKGDHFALMVVDRVCFYLGLATGNLGNTLNPDSVVIGGGVSAAGEFLRSRVEKYFQEFTFPQVRNSTKIKLAELGNEAGVIGAASLALQFSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Glucokinase from Enterococcus faecalis.
rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Enterococcus faecalis
total genus 104
structure length 324
sequence length 324
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A02
3MDQA 1BG3A 4DB3A 2V51B 2P9KA 3CJ7A 1LOTB 4H0XB 1NGCA 3A5OC 1GLAG 4B1WB 2P9IB 3VENA 4FWRA 2NLXA 3O1BA 4E1JA 1HLUA 2CGJA 3HBTA 2A41A 4KBOA 5JICA 2D0PA 2P9LA 4FWNA 3CJ9A 3O1WA 4A62A 5AQUA 2CGKA 2E8AA 4BGAA 1NWKA 4MO5A 3ENOA 1XQSC 3H45C 5KPZA 1J6ZA 3SLCA 4BREA 1NGDA 4BRCA 3WT0A 3A5MC 3TU5A 3ULEA 4H5VA 4BR0A 2P9NB 2V52B 5AZJA 3R6MA 5KQ8A 4PKGA 1NBWA 3AAQA 2FSNA 5BPNA 3QMLA 4EFHA 5AQVA 1V4SA 5AQRA 3BUZB 2Q1NA 4FWSA 4FOEA 1TYQA 1R59O 3DXMB 3WEEA 1P8ZA 3A8YA 2D1KA 3OHRA 4H5TA 3U9ZA 1HKGA 3LDLA 3S41A 4BR4A 4BRHA 1NGHA 3VF6A 3W3DA 5KPTA 2J4RA 4BRPA 3HZ6A 3DXKB 2F9TA 1JCFA 3R8EA 2A6AA 4FO0A 3F9MA 4IO8A 2EWSA 4L3QA 2VCPA 2Q31A 4M7XA 3QFPA 1T44A 1NLVA 3R9PA 4FPAA 4H0OA 3DJCA 1BO5O 2HMPA 4PL8A 4C23A 3L6QA 1ESVA 3EKUA 4CBUA 4JHDB 5AQPA 5AQJA 4BR7A 5BRDA 2FSJA 5KPRA 4CD3A 3FZFA 5AQQA 2DPNA 2AP1A 4CZKA 4PKIA 4MO4A 1XUPO 3H46O 3D2EB 1MWKA 4DHYA 4DQ8A 3KHYA 5CE3A 4XH1A 3ZETB 1Y64A 5FPEA 4CBWA 1NGJA 5BR9A 2QM1A 3D2FA 4O5FA 4QS7A 5BPLA 3GDQA 3CQXA 4AM6A 3WQUA 1T6DA 3LL3A 4BQLA 5EX5A 4JD2B 3O08A 3VF4A 5AR0A 2W41A 5AQWA 4B1VA 3FR0A 3EL2A 2YI1A 1BA1A 2HF4A 3QBWA 5EOYA 4A2AA 4BRQA 3WXJA 1NM1A 2FSKA 3DXMA 3EZWA 4HWIA 2CH6A 5B8HA 1YAGA 4I6MB 5ADXH 1GLCG 4H03B 4WYBA 4CZJA 4BC2A 3MN6A 5AQHA 4CZFA 4BC3A 3VGMA 3VERA 1HKBA 4NB4A 3BEXA 3VGKA 3D7EO 2P9SB 4BRFA 1JCGA 3IMXA 3LM2A 3KZBA 3VEOA 2QWQA 5BN8A 4XH5A 5EXWA 1KAZA 4K42A 1QZ6A 3VEZA 1G99A 3L0QA 3SMPA 1C0GA 3G25A 3VESA 2E2NA 4ISGA 2GEMA 2ASPA 4RTFD 2QWNA 1ATRA 4CZEA 4Z94A 2ZGZA 1NMDA 3LDPA 1NGEA 2D4WA 1U2VA 3M6GA 3WUHA 3MN9A 5TKYA 3CHWA 1HJOA 3HTVA 3U8XA 2D0OA 4FWKA 1BA0A 3KVGA 5BN9A 3WXLA 5AQZA 2ITMA 1KXPA 2FF6A 3U9DA 4QS8A 3FE1A 4IJAA 3H1VX 3H3OB 3FZLA 2ZF5O 1TUUA 3O80A 1BUPA 1DKGD 2BTFA 4H0YB 4RCHA 4BQZA 2UYTA 4CBXA 1K8KB 3GL1A 1BDGA 3EN9A 4ISEA 4B9QA 3GOIA 3I8BA 4BGBA 3DAWA 3MN5A 4B1UB 2QWLA 5AQGA 3QFUA 3SJHA 3L4IA 3UB5A 4I6MA 3W0LA 4YDUC 4JNEA 4K43A 3CERA 4FWPA 2GTDA 3CI5A 5FPNA 4BRAA 2YJEA 2E1ZA 1KAXA 3QDKA 3ENHA 2Q0RA 3UKUB 4BRKA 4IXCA 4NO7A 4MLHA 2ZGYA 2V7ZA 4J8FA 1GLBG 4BRIA 4BR9A 2YHYA 4FL9A 4CZIA 4ISFA 2NRHA 1ATSA 1JCEA 4QS9A 1Z05A 2P9IA 5FPMA 3ZEUB 4PL7A 4BRLA 3IDHA 4YDUA 5LY3A 1HUXA 3FZHA 5BREA 3GE1A 3QB0A 4FWLA 5LJVA 1DEJA 2CH5A 4EHTA 4H5WA 3C7NB 4CZHA 5AQSA 5F2RA 3HSCA 2OANA 2IVPA 3P4IA 3VEYA 4FWMA 2P9KB 1MWMA 4B1YB 5LJWA 1SQKA 1X3MA 2IVNA 1YUWA 3LDQA 4WQ5C 3CQYA 4WQ4C 1GLFO 2V7YA 1BWFO 2Q97A 3A5LC 2P9NA 3O6WA 1QQOA 4CJ7A 2A3ZA 3FLCO 3SK3A 3O4WA 3CETA 2ZWHA 4CD1A 4BRNA 1MA9B 1OKJA 2AA4A 1S22A 3J8AA 1YXQA 4HTLA 3WXIA 4IWVA 5AQTA 5AQYA 4A61A 5AQNA 3EKSA 2I7PA 1GLLO 1SAZA 2P9PB 3U4LA 1X3NA 2WUSA 3UKRB 3LM9A 1ZC6A 1BOTO 2A5XA 2ASMA 3CJBA 3EO3A 3C0BA 3DXKA 3B8AX 4M7YA 1S3XA 3CJAA 4K25A 3SMSA 4EIAA 5FPDA 4JN4A 1TYQB 3RSEB 1NGBA 2P9UB 3H1QA 4BRDA 3VGLA 2E88A 3A5NC 4K41A 3WEEB 3MN7A 5E26A 3FGUA 1KAYA 1D4XA 1TUYA 5JLHA 2GWJA 5AZIB 1NGGA 1NGAA 2FXUA 2IVOA 4GY2B 2QWOA 2KHOA 4JHDA 3AY9A 4M63C 5I9EB 3AARA 3O8MA 2HF3A 4MLEA 4BVPA 3C7NA 1ATNA 1HKCA 2IIRA 1BU6O 4A2BA 2QWMA 4H5RA 3D2EA 5F0XA 4CZLA 3VF2A 2W40A 4EHUA 3BF1A 3ATVA 3ZETA 4H0TB 1GLDG 1H1VA 3TPQA 1NGIA 2Q2RA 3ATUA 5EY4A 4RWTA 4O8KA 2Q0UA 3VETA 2YCHA 1LCUA 4H0PA 2E2OA 1SZ2A 4IZ9A 4H0VB 3H6EA 4DCHA 4JD2A 1DGKN 2GWKA 1QZ5A 5BRHA 2YHXA 2FF3B 3GBTA 1Q18A 1CZAN 4BVOA 4BRGA 4CZMA 1T6CA 2P9PA 3VPZA 4B1ZA 3D2FB 2F9WA 3VEVA 2ASOA 3UKRA 3CJ1A 1GLJO 3AAPA 3ID8A 1U6ZA 3H3NO 1HPMA 5AFUA 4BR5A 2H3GX 4B1XB 3VOVA 2P9SA 1QQMA 5EVZA 1X9JA 2CGLA 2E1YA 3RSEA 2P9UA 5AQKA 5AQIA 1E4FT 1IG8A 3DWLA 2QW9A 3CIPA 1C0FA 3IFRA 4FSVA 5E84A 1XC3A 3MCPA 5AZIA 3BF3A 5F1XA 3A0IX 3IUCA 4BG9A 2PBDA 2YHWA 3I33A 1MDUB 2A40A 4BC5A 5AQFA 4XH4A 2PAVA 3ZX3A 2BUPA 3GG4A 2YJFA 4CZGA 3MMVA 4JAXA 3HM8A 2QWRA 4BC4A 4BRMA 4BR2A 5AQOA 2QXLA 2I7NA 5ADXA 1ZXOA 1NGFA 4H5NA 4Y0WA 1WUAA 2FLOA 3LDNA 3QICA 3JS6A 4BG8A 1WOQA 4EAHD 3FZKA 4FWOA 3ZX2A 2P9LB 3QBXA 4FWQA 1IJJA 2GELA 3M3ZA 1U2VB 4PKHA 2A42A 4FOIA 5AQLA 2GUPA 5AFUH 1K8KA 2Q36A 3WQTA 5BPMA 3M1FA 3ZX0A 4WQ5A 4WQ4A 3ULEB 5BRFA 5KQDA 1QQNA 4AM7A 5AZJB 3VEWA 4IJNA 2E2PA 4BROA 1ZBSA 3HI0A 3MK6A 3UKUA 1RDWX 1E4GT 1Z6RA 4CI6A 4FPBA 4F9OA 2E2QA 2NZTA 1HX1A 3CJCA 2VWBA 3WXKA 1GLEG 3O5BA 3FFKB 5AQXA 3JXUA 3ZEUA 2VYPA 5ELZA 4GNIA 1V4TA 4LC9B 5JLFA 1RGIA 1RFQA 2E20A 3FZMA 3UE5A 2QWPA 4XEIA 5AQMA 3BP8A 1EQYA 2HOEA 1QHAA 3LDOA 5JMVA 3VEXA 1YVNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OH6A 3MDQA 1BG3A 2VGMA 4ICLA 3D0PA 1LOTB 4DS4A 1CXQA 2ZE2A 4JKCA 5I42A 3K5OA 4B1WB 2P9IB 4FWRA 4YNQA 3QEPA 1WB9A 4HHTA 2NRXA 1NOYA 3O1BA 4B08A 2P9LA 3THXA 2ITGA 3IS9A 3O1WA 4DV4K 3DRSA 3SPZA 1N36K 4BGAA 3TAQA 1NWKA 5M1NA 1MU2A 4JKFA 2NRWA 2HNDA 3O4QA 4KAZA 3ULEA 3ZCMA 5GAGP 2P5GA 4BR0A 4J2EA 3R6MA 1JLFA 1NMNA 4EFHA 4B3TK 3E01A 3L3UA 5AQRA 4KI4A 3J81O 1BCOA 1SV5A 4FOEA 1TYQA 3VMFB 2UUAK 2A1SA 3AVIA 2VWKA 1BI4B 1N5YA 3A8YA 1BHLA 3I0SA 1J5EK 4CJFA 1IBMK 1EP4A 3HZ6A 2F9TA 1JCFA 3VQ5A 2A6AA 2QKKA 3DOLA 2VWJA 4DTXA 3L4QA 4L3QA 3RVCA 3QEIA 4M7XA 1I94K 4BDPA 3ZSWA 3HP9A 3R9PA 4L8RB 4DUYK 4BACA 3NH2A 2QK9A 3EKUA 4JHDB 4BR7A 3OW2M 4RW7A 2FSJA 3C6TA 3NF8A 4GV9A 3MXJA 1LV5A 4CZKA 4B9UA 3D2EB 3OYAA 5TKWA 4A57A 1Y64A 5M1OA 4HUGA 4H4MA 3P83D 3RWUA 4QS7A 5BPLA 4FLTA 1U04A 4O0IA 4KV8A 1XMQK 4FJ7A 5LMNK 1NOZA 3RRHA 3LL3A 4KRFA 4JD2B 3VF4A 3HK2A 3MCAB 1BA1A 5EOYA 1NM1A 1BI4A 4CEZA 3V4IA 1YAGA 1GLCG 3QERA 4KTZA 2GBZA 4FJMA 3QLHA 3D7EO 4FJGA 1JCGA 1RT1A 3SCXA 4OPJA 2QWQA 4MDBA 4XH5A 1IKVA 5E41A 4ID1A 5M1PA 3ZSOA 1TVRA 3C65A 3ZT3A 4ISGA 4B9NA 1NK5A 4IOXA 1NK4A 4DFMA 3S3NA 5FLXO 1ATRA 1IH7A 4CZEA 2ZGZA 1NMDA 4LSNA 4LD0A 3LDPA 1U2VA 3OS0A 3WUHA 3I55N 3CHWA 1G15A 3HTVA 4Z4HA 3E9PA 1KXPA 3AA4A 2G8HA 4DTMA 4KHNA 3FZLA 4OPHA 2ZF5O 2BTFA 3V1QA 4E7LA 4J2AA 2BANA 2D5RA 1RDUA 5HP1A 1TL3A 3MN5A 2HVHA 5AQGA 3CERA 3DYAA 4GKJK 1CZ9A 3O4NA 5FPNA 4BRAA 1KAXA 2Q0RA 1KRPA 3IRXA 1VSMA 3L2WA 4FK0A 4NO7A 2ZQBA 1B9DA 4KHSA 3ZT1A 2YHYA 5HL7L 2QXFA 1RNHA 3NCIA 3ZEUB 4PL7A 5JVGL 3CCEN 3ZSYA 4FWLA 3LALA 2CH5A 3NHGA 2ZJRL 5AQSA 3HSCA 4B3SK 4K8XA 2IVPA 4J2DA 3LWLA 3P4IA 3VEYA 3O3HA 1T05A 3OY9A 2P9KB 1HR0K 3DLBA 3PIOL 4IKFA 2IVNA 1YUWA 5C10A 3CQYA 4WQ4C 1HNIA 1CZBA 1Q8IA 1GLFO 4B9TA 5M1FA 3AA3A 4UQGA 1NKEA 1BWFO 1S5JA 3O6WA 4CJ7A 2A3ZA 4WF9L 3K5LA 3SK3A 2ZWHA 4JI3K 4CD1A 3TANA 1N33K 3LP1A 1S1UA 3HYFA 1YVUA 1C1BA 4DFKA 5HRPA 2RE2A 4EP5A 4HCBA 2KZMA 4LF7K 4DR5K 2B4JA 4V19S 4DTRA 1J54A 4IO9L 3P5JA 3CJBA 3OYJA 3C0BA 4QOZB 3SQ2A 5GAHP 4Q5VA 3PLAA 3CJAA 3NBPA 3SMSA 2KTQA 2EHGA 1JKHA 4Q0BA 3H1QA 2X74A 3N4QA 4CHPA 4JI7K 5JLHA 1WSIA 2GWJA 1NGGA 1NGAA 5AZIB 2FXUA 1TKTA 4GY2B 2UXBK 3AY9A 3OA9A 2HF3A 3K2PA 1HKCA 1RBVA 2HBJA 5EU7A 4A2BA 4YY3K 5FRNA 4JS5A 3BF1A 3ATVA 4JK8A 1L3UA 3PUFA 1RCHA 2Q2RA 4O8KA 3VETA 2OPPA 3THYA 4JI4K 1IV0A 5C0YA 3NGYA 1SZ2A 4W5NA 4JYAK 4FW1A 4CJVA 3LZIA 1K8AO 1S9GA 1LWFA 3KD1E 3HRGA 3VQBA 3OYLA 2FF3B 5CY4A 4ID5A 4BVOA 4CZMA 2NUBA 2OZMA 4CERA 3V9ZA 2ZJQL 3L3VA 3VEVA 1LWEA 3CC7N 3CJ1A 2X6NA 4ILHA 1OH7A 1TKXA 3D6RA 4DR2K 4DV1K 1EO1A 2ETJA 2IS3A 2NRVA 4C1NI 4BR5A 5CYQA 1KD1O 1SL2A 2E1YA 2NRRA 4CK1A 3KK2A 1E4FT 3QNNA 3DWLA 2QW9A 5KRTA 4DQSA 3O9SA 4CFDA 1NKCA 3LP2A 5K14A 4W5OA 1FJGK 5AZIA 3ZLJA 3TTFA 3ULDA 2YHWA 4CGHA 2PAVA 3KLFA 2YJFA 4JKHA 4BC4A 4FVMA 4R5PA 1YT3A 4BRMA 3QESA 4JI0K 5AQOA 3JYTA 3VA3A 3OYFA 2VG5A 3G0ZA 1CLQA 2FLOA 3LDNA 1HPZA 2KLAA 3AO1A 1J5OA 3JS6A 4IOAL 1W0HA 4BG8A 3VQQA 2R7YA 3QBXA 4FVUA 1W9HA 1IJJA 3FFIA 4PA1A 4CFCA 1TK0A 3CF5L 1N6QA 1HQUA 1J9AA 1NJXA 3CCVN 1IKWA 1NK6A 2Q36A 4FJ8A 2HBLA 4IOCL 2B6AA 4RW8A 4W5TA 5BPMA 4W5RA 3M1FA 3ZX0A 4WQ5A 1C0TA 3AO2A 2O8DB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3IUC A;  4PQU A;  1MDU B;  3LZJ A;  3PO5 A;  4LF4 K;  5CZ2 A;  2BUP A;  4JAX A;  1XMO K;  3HM8 A;  4KB1 A;  2DY4 A;  4CEQ A;  2Z1G A;  3AVB A;  3G6E N;  3CM6 A;  4BR2 A;  1S6P A;  1NJI O;  4U67 L;  1ZXO A;  1JL1 A;  3C6U A;  3PSI A;  2JLE A;  4Z4G A;  1WOQ A;  4FWO A;  4DSF A;  2P9L B;  1WNS A;  2GEL A;  3C6H A;  4DV0 K;  1WSJ A;  2W6L A;  3PO4 A;  3OVN A;  1REV A;  3NF7 A;  5AQL A;  4C8N A;  1K8K A;  3RTV A;  2O4G A;  1VSD A;  2XY5 A;  4WQ4 A;  4N56 A;  3ULE B;  5BRF A;  5KQD A;  1ITG A;  1YTA A;  4AM7 A;  3B6O A;  3KIO A;  4K8Z A;  4DLE A;  3VEW A;  3U6F A;  2E2P A;  3NGZ A;  4BRO A;  4DV7 K;  1HYZ A;  3MEG A;  1ILY A;  4M3X A;  1Z6R A;  4M3Z A;  4FPB A;  2XY7 A;  4F9O A;  1QTM A;  2NZT A;  3CJC A;  2O8C A;  4EP4 A;  2HHU A;  1JL2 A;  3LAK A;  3JXU A;  1TGO A;  1NJY A;  4LF6 K;  1B9F A;  2E20 A;  3EE9 A;  3SNN A;  3KWI A;  4DF8 A;  4M3T A;  1ZBF A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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