2RN2A

Structural details of ribonuclease h from escherichia coli as refined to an atomic resolution
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural details of ribonuclease H from Escherichia coli as refined to an atomic resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
total genus 51
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1992-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2rn2A00
5CYMA 1BIUA 3FFIA 3HJFA 4MQ3A 4CJTA 4Q5VA 4DFPA 4DFKA 5HLFA 3TAPA 1RTIA 2ZE2A 4Z4GA 2JLEA 3OVNA 5FROA 4H4OA 1S9EA 4ID5A 4M3TA 1J9AA 3SQ0A 3PO4A 1RT7A 2DFEA 1VSMA 2XY8A 4KHYA 2KTQA 4WE1A 3NH2A 4FJ7A 2X78A 4CJLA 3SV4A 1TK0A 1EKEA 2IC3A 4ELTA 1XWLA 3OYEA 1R0AA 3NDKA 4DTRA 4HUFA 1F21A 2HHTA 1C6VA 3G0ZA 4CGJA 3MXMA 4CERA 1BISA 1C1BA 2QXFA 3K2PA 4CESA 4CIEA 4PQUA 3V1RA 2HVIA 3TAMA 3ZT3A 3SUNA 3OYIA 4KI4A 4ZTFA 4CJ5A 3LP0A 4LSLA 1LWCA 3RTVA 1IKVA 1FKOA 2Z1JA 1Q9XA 3NHGA 1EXQA 1HNVA 1RILA 1VSEA 4FW1A 4DQSA 3HXMA 4FJJA 4M3RA 4KB1A 1CXQA 2HHWA 2P5OA 4CEEA 3HP6A 4DLEA 3THVA 1WLJA 2FBXA 3HL8A 3ZSZA 1KVAA 3OYGA 4AILC 3VQAA 3T19A 4CFAA 2YNHA 4CFCA 3TAQA 2WOMA 3SUOA 4E1MA 4FJKA 4M42A 4CECA 1D9FA 4KREA 3QNOA 3MECA 1B92A 3L3UA 2XO7A 4BWMA 4FJ9A 3NE6A 2DTUA 2HHXA 4W5QA 4I2QA 4CEFA 3TAFA 5E41A 2PYLA 1WAJA 3D45A 4G1QA 1TL3A 2KFZA 4KTQA 1WNSA 5FDLA 4DU3A 4DTXA 1SL0A 2EHGA 4C8NA 1T8EA 1L3SA 1JLAA 1JXEA 4OGEA 3DLRA 1IO2A 4CJSA 1RBRA 4KHUA 1J53A 2G8KA 1TL1A 3QESA 4KHNA 3V1OA 4FZZA 1TK8A 4CEAA 2F8SA 1S1TA 5DMRA 5J1EA 3WNEA 1YTAA 3TR8A 3NCIA 4BACA 3QEWA 3IG1A 2ATQA 1A5VA 3RRHA 1CZBA 4RW7A 4ZHRA 3EY1A 4O55A 4NYFA 2PZSA 2P5GA 3O3GA 1EP4A 1FXXA 4E89A 3VQ7A 4GW6A 3U3YA 1LAVA 4BE1A 3TWHA 4DS5A 1HNIA 4N56A 3QEVA 3TARA 4Z4EA 4FLZA 4DU4A 4Z4FA 3SQ2A 3VQPA 4W5NA 3P83D 1LWFA 4RW9A 1NK6A 2OZMA 3B6OA 4FJHA 4B3OA 3AVHA 2R7YA 1S1VA 4FLVA 1NJWA 1NK0A 3SQ4A 4F2RA 4LSNA 5KGXA 1HPZA 1U48A 3T3FA 1GOAA 2E6LA 2QKBA 4BWJA 3B6PA 4FW2A 4LH4A 4DTSA 4O5BA 3LAKA 3AO4A 4NCBA 3SQ1A 4OLBA 4AHTA 4KTZA 4FM1A 3PX0A 4FJ8A 1DTTA 4YFUA 4N76A 1TKDA 4XIUA 4JLHA 4CK1A 2KW4A 4F8RA 4AHCA 3OS2A 4M3UA 4OLAA 1IG9A 3OYLA 3DRPA 4CJEA 4CFDA 2ZD1A 4I9QA 3NAEA 4DTMA 2BGGA 3AVMA 3NGZA 1EX4A 3WNGA 1REVA 2I5JA 2YKNA 3MXIA 1ZBFA 3L2RA 1KVBA 3LALA 4KHSA 2KZMA 1TAQA 3QEPA 5FRMA 4PUOA 5KGWA 3DI6A 1A5WA 2RF2A 4ZTJA 5C42A 4B8AB 1XHXA 3KJVA 4E7IA 1LV5A 5CZ2A 2G8WA 4Z4IA 3AA3A 4CF8A 1CZ9A 1RT1A 1RBVA 4IG3A 3ULDA 4OKKA 4CHZA 3OYCA 1S9GA 1TVRA 4FM2A 1SL1A 1HQEA 1SKSA 3DMJA 5SZTA 4C8KA 4IFYA 4DMNA 1DTQA 3AO5A 1XC9A 1S1XA 4I7FA 1FKPA 3M8RA 4FZXC 1YT3A 2RKIA 3KLFA 3AVJA 2EX3A 2YNFA 4M41A 4CEOA 3KKRA 3AA5X 3VQ6A 3ZSWA 3OYKA 2IS3A 3RMAA 4K8XA 1NK5A 3V6DA 3ITHA 3LP2A 1TKXA 3OYDA 1X1PA 1Q9YA 4FZYA 3AVBA 4KTWA 4DTNA 5J2MA 2IGIA 4F3OA 1K6YA 4KI6A 3L3VA 2KZZA 1KFDA 4E7KA 4DWIA 1RTHA 5J2NA 3EZ5A 1TV6A 1BIZA 3QLHA 5CZ1A 3RMDA 1WSEA 3AO3A 2ITGA 2VWJA 1JLGA 2E4LA 3TAGA 1X9SA 2YNIA 4DQRA 3CM6A 3VQBA 2GUIA 4B9VA 4DSLA 2KFNA 4BDYA 2YV0X 4BE2A 2AJQA 3NF9A 1RTJA 1QSLA 4W5RA 3LPTA 1VRTA 1RDDA 4K8ZA 4OKEA 4JS5A 1X9MA 3LPUA 4FYDA 4QAGA 3V81A 4QCLA 3HPOA 3OJSA 3KK3A 4B9TA 3F73A 5HRNA 4KHWA 3L2UA 4CEQA 2F8TA 4HUGA 4OJRA 1RDBA 3HM9A 3AO2A 3QEXA 4FJ5A 5K14A 3V9SA 3TAEA 3HPGA 3SYZA 4OVLA 4CJPA 3CM5A 4LY7A 4RW6A 3ZSYA 4OGCA 1HYSA 1KLNA 1WSHA 1S1UA 3ZT4A 2HW3A 1ASVA 1SUQA 1RBSA 4CHYA 1VSDA 3K5LA 5JS2A 4KV8A 3K5NA 3QETA 1RT3A 4OPKA 4DTOA 1RT2A 4M45A 3ZT0A 3QIOA 2XRIA 4CJUA 3V9XA 4OKJA 2G8UA 2OPRA 3K5OA 4E1NA 3E01A 3G10A 3ZSQA 1LW2A 1VSKA 4B9MA 3CG7A 1EETA 4H4MA 3KLEA 1HJRA 3VQEA 3SV3A 3QIPA 3S3NA 3PO5A 3AVGA 4I9LA 3NF7A 1B9FA 3NGIA 2O4IA 4DQQA 2NUBA 3DLBA 3NF6A 1S5JA 1Y97A 2FBTA 2X6SA 1RCHA 3DOLA 1RBUA 3RMBA 4JS4A 4DS4A 3C6UA 4I2PA 4J2BA 1QS4A 2HHSA 5HBMA 3SUQA 2VWKA 4FLTA 1VSLA 5HRRA 4E7LA 4FXDA 2O4GA 1DLOA 1QE1A 3PUFA 1NKBA 5HP1A 4FLYA 3LZIA 3OYJA 3LDSA 2D5RA 3HT3A 4E0DA 1S6QA 4EP4A 2RPIA 1KRPA 3I0SA 2VG5A 3DYAA 3OS0A 3L8BA 4LH5A 4O44A 5I42A 2OYQA 1TAUA 4B9SA 2RN2A 2YHBA 2Z1HA 4O0JA 4H8KA 3V1QA 5I3UA 3WNFA 4FJMA 1VSHA 3RWUA 3NFAA 3UIQA 4AHUA 1WSJA 3I8DA 4KHQA 1WSGA 1BI4B 1VRUA 2YHAA 2Z1GA 3OYNA 4HHTA 3SZ2A 5KTQA 1KLMA 1JLQA 4NCGA 4AHVA 1NOZA 1N5YA 2FC0A 4DSEA 3CYMA 4HVJA 1NKEA 1TK5A 3U6FA 2HHQA 4NYNA 4DLGA 3PV8A 1GOCA 3VA0A 3ZSXA 1VSFA 2Y1IA 3SCXA 4RW8A 2OPPA 1B9DA 4C8OA 1JLBA 3ZSVA 5EU7A 3O4QA 4JRQA 2HHUA 3RR7A 1UA1A 1QQCA 4Y1CA 3M8PA 4CF1A 3DOKA 1UA0A 1HYZA 4HCBA 2HHVA 3KIOA 1ITGA 3OJUA 1CXUA 3KK2A 4W5TA 2BANA 3QERA 3KLIA 3AVFA 3BDPA 4AH9A 4DTUA 4B9UA 3LP1A 2B6AA 4CE9A 3L2WA 5KI6A 3VQCA 3IRXA 1HQUA 3C95A 1RNHA 2JGUA 2A1SA 2G8FA 4CHPA 1KFSA 4FLXA 4OPJA 1HMVA 4KAZA 4DSKA 4GMJB 3SPYA 4PY5A 3HO1A 5HRPA 3BGRA 4KFBA 2XHBA 4CJRA 4PA1A 4J2EA 1TKTA 2Q3SA 3ALYA 4RW4A 1NK8A 3PY8A 1TKZA 2OPSA 3P1GA 4CJKA 4ELVA 5D3GA 4GVMA 3I0RA 1RT4A 2G8IA 1G15A 3HVTA 1BL3A 4CEZA 4Y1DA 1NK4A 2D0CA 3KLHA 1C1CA 1D5AA 3RRGA 3K59A 1SL2A 2F96A 3JSMA 3ZSOA 4CJQA 3CFOA 3OS1A 1ASUA 3PX6A 1JLCA 4EZ6A 3HPHA 1ASWA 4HTUA 4R5PA 3KTQA 2D0AA 3QINA 4ICLA 2GV9A 3U3GA 1U47A 4B9LA 1ZBHA 3VA3A 3VQQA 3ZSRA 2HNZA 1NK7A 4CF9A 1RT5A 3DLGA 4AHSA 4IDKA 5KRTA 3OYFA 2Y1JA 1T7PA 4NCAA 3HK2A 2YNGA 1NJZA 2FBVA 1QHTA 2IOCA 2VG7A 3TABA 2QK9A 1SKRA 4FCYA 3T1AA 3JYTA 1RDCA 4Z0UA 4DQPA 3KD5E 4EZ9A 4CJ3A 4CF2A 3WNHA 2P51A 4B8CA 3SPZA 5HRSA 4J2DA 3LANA 1LAWA 4MFBA 4IFVA 3AVKA 4DSIA 1UWBA 3MEDA 2Z1IA 4LD0A 3KLGA 4HCCA 1FK9A 5C24A 4KO0A 3AO1A 3SI6A 2FBYA 4DU1A 2G8VA 5CYQA 1BGXT 4KB0A 2PYJA 1JKHA 2OA8A 5JS1A 2X6NA 1MU2A 3AA2A 3AVIA 1WAFA 3AVNA 1RTDA 1YTUA 1KTQA 5T7BA 1Z25A 4RG8A 1ZBIA 4ID1A 3AVAA 1NOYA 1YVUA 1VSJA 1C1AA 3ZCMA 4DF4A 4IG0A 4CJ4A 1BCMA 1S1WA 2E6MA 3LZJA 1KSPA 4ELUA 3QNNA 4KRFA 3L2QA 1U04A 4O0IA 3O3FA 4FJNA 3HVRA 1C0MA 2BE2A 3OYBA 3TI0A 2B5JA 4M3ZA 3LP3A 1L5UA 4FK4A 4CIFA 3MEEA 4EP5A 2G8HA 4DTJA 1NKCA 1W9HA 4BDZA 4DSJA 4CK3A 4CCHA 1SV5A 2LSNA 1JL1A 4E7HA 4B9NA 4CHNA 1A5XA 1D9DA 4PWDA 3CQ8A 3KK1A 4CHOA 3OY9A 4BDPA 4CIGA 2XY5A 2DY4A 4CEBA 1JLFA 2GBZA 3MEGA 3VQDA 5SWMA 4CGHA 3TANA 4FLWA 1L3TA 4M3YA 2IDOA 3KKSA 4CK2A 1L3UA 4IBNA 3DRRA 3SUPA 4J2AA 4FJGA 1BI4A 1Z26A 4FVMA 1X9WA 2KQ2A 4CJVA 4FLUA 2HVHA 3OYHA 2BDPA 3IS9A 1KVCA 3D0PA 4L8RB 4M3WA 4E19A 1JLEA 4Z4CA 1WSIA 1U45A 2QKKA 4CJFA 1W0HA 1QTMA 3KD1E 2DFFA 5HROA 3LWMA 4O4GA 3CFRA 2WONA 1S6PA 1NK9A 4DQIA 5C25A 3NH1A 3OYMA 3HSTB 1ZBUA 1LWEA 3ISNC 3V4IA 1C0TA 2OPQA 1NJXA 1VSIA 3M8SA 4CGGA 1Q8IA 1JL2A 1O1WA 1JXBA 3NH0A 3O3HA 1N6QA 2PY5A 3S3OA 1HRHA 3DLKA 3HP9A 2W42A 4UQGA 2D0BA 3NGYA 4CGIA 2P1JA 4CEDA 3OYAA 5DK5A 3VN5A 4F2SA 4M3XA 1WSFA 1IH7A 3HYFA 4CJWA 3VQ8A 4N5SA 3V9UA 2HNDA 3AV9A 3VQ9A 4N47A 1J5OA 3F9KA 4CGDA 4DG1A 3MAQA 4FM0A 4FJXA 3MXJA 1NJYA 3ZT1A 3EYZA 4FJLA 1IKXA 3ZT2A 3ASMA 3PX4A 1SKWA 1QSSA 1D8YA 1U4BA 3IAYA 5J2PA 2HNYA 5FRNA 3SNNA 4AHRA 4DF8A 3K5MA 3RR8A 4IKFA 4CHQA 3VQ5A 5KRSA 4DFMA 3P5JA 4E7JA 3C6TA 1RT6A 1L3VA 4F3TA 2IAJA 3QO9A 3K57A 3A2FA 4DSFA 5J2QA 1U49A 1XI1A 3LAMA 2OZSA 4F4KA 1HYVA 3H08A 4FK0A 3NF8A 4CFBA 1XHZA 3AVCA 3DM2A 1LW0A 3SJJA 1BHLA 4QOZB 3AA4A 1T05A 3DRSA 4TSXA 3NBPA 3V9WA 1KCFA 2VG6A 2ETJA 3M8QA 4JRPA 2HB5A 1T03A 1RDAA 4Z4HA 1UOCA 3S3MA 4KPYA 2A1RA 2X74A 3QEIA 3V9ZA 4BE0A 1I39A 4E3SA 4KKOA 4DTPA 4YNQA 2DFHA 4HUEA 1ZYQA 4N41A 4W5OA 1IKYA 3AVLA 2XY6A 3CFPA 4Q0BA 3C94A 3K58A 1ZBLA 5CY4A 1GOBA 1UAXA 4FJIA 1WN7A 1IKWA 3DLEA 1BQNA 1TGOA 3LWLA 3DLHA 2B4JA 3L2VA 2HMIA 4C8MA 4DFJA 3RMCA 1C0UA 1I3AA 1J54A 4B08A 2XY7A 1QSYA 1RBTA 1BCOA 2ZQBA 3O4NA 1CLQA 1VK0A 4CF0A 3VQ4A 4CGFA 1BQMA 3S9HA 2YKMA 4C8LA 4FK2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CYMA 4CJTA 4Q5VA 1SQKA 3BF3A 1VQ8N 2HBJA 5EXWA 2ZE2A 4U7BA 5KPTA 4Z4GA 5FROA 3SQ0A 5AFUA 2V7ZA 4OX9K 3NH2A 1XNQK 5EY4A 5M1FA 4CJLA 1EKEA 4ELTA 1T6CA 5JLFA 1F21A 4BRNA 1BISA 1C1BA 2GWJA 4KH5A 4H0TB 2HVIA 3CMEN 4DV6K 4BR2A 3LP0A 5BRFA 1RDWX 5E84A 4FW1A 4DV4K 4FJJA 3KWIA 4IZ9A 1WLJA 2FBXA 2ASPA 4AILC 3T19A 3TAQA 4JD2A 3SUOA 3QNOA 2HHXA 4W5QA 1K9MO 3R1XA 3W3DA 1TL3A 3CCJN 3HTVA 2KFZA 4OO1J 3VEXA 5FDLA 1SL0A 1T8EA 1JLAA 3THXA 4FZZA 1S1TA 5EVZA 3NCIA 3QEWA 3IG1A 4RW7A 5C0YA 4O55A 4DV7K 1EP4A 2GELA 4FWRA 4GW6A 3TARA 4Z4EA 4FLZA 2E2NA 2UXDK 4EFHA 4QS9A 2OZMA 5JVHL 3B6OA 2O8FB 5HL7L 3CCEN 3AVHA 4FLVA 2GEMA 4BGAA 3SQ4A 4LSNA 2ASMA 1U48A 3I8BA 3T3FA 1GOAA 2BTFA 3EKSA 1Q82O 3RSEB 4NCBA 3FZHA 3ID8A 4B3SK 1DTTA 4YFUA 3CC4N 1TKDA 2GX9A 3J7ZO 1DEJA 4M3UA 4OLAA 3ZEUB 2W6LA 3CJ9A 4CJEA 4CFDA 4YOUA 3AVMA 5BPLA 3NGZA 4DR2K 2I5JA 2O8BA 2CH6A 3MXIA 3LALA 2KZMA 1WOQA 1TAQA 1VAZA 3DI6A 2RF2A 3KJVA 5CZ2A 4CF8A 4IG3A 3ULDA 3O08A 4OKKA 1JCEA 3OYCA 4JKGA 1SL1A 4BRDA 4DR1K 1DTQA 5AQXA 3M8RA 1YT3A 2RKIA 3AVJA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1ATR A;  2KLA A;  3NH1 A;  1ZBU A;  3ISN C;  1O1W A;  2F7T A;  2PY5 A;  4KBO A;  4CBU A;  3NGY A;  4JI2 K;  5AQP A;  4CGI A;  4F2S A;  4CBX A;  1WSF A;  3HYF A;  3PIO L;  4L3Q A;  2P9I A;  3V9U A;  3AV9 A;  3VQ9 A;  4N47 A;  4RTF D;  3MAQ A;  2ZJR L;  4R79 A;  1NJY A;  4DR7 K;  3EYZ A;  3A5L C;  4NLC A;  3CJ1 A;  3VTI A;  2BH1 A;  5LY3 A;  5JMV A;  3RR8 A;  3VEW A;  3WXI A;  4DFM A;  3P5J A;  4E7J A;  3C6T A;  3MWT A;  4F3T A;  4DSF A;  1JCG A;  3LAM A;  4FK0 A;  1LOT B;  1YJW N;  4YOT A;  2VQE K;  1T05 A;  1DKG D;  4TSX A;  3V9W A;  1E4G T;  4BVP A;  4X65 K;  2ETJ A;  1RDA A;  3U8X A;  2A1R A;  1I39 A;  2CGK A;  1SS6 A;  4KKO A;  4HWI A;  4N41 A;  4BC4 A;  3HI0 A;  4JI4 K;  3M1F A;  3C94 A;  3K58 A;  2P9K B;  1Z6R A;  1BQN A;  3LWL A;  2B4J A;  3N4Q A;  2FLO A;  4DFJ A;  1C0U A;  1RBT A;  3O4N A;  4DV0 K;  4CF0 A;  4CGF A;  1BQM A;  3OBY A;  2NLX A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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