2RN2A

Structural details of ribonuclease h from escherichia coli as refined to an atomic resolution
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
publication title Structural details of ribonuclease H from Escherichia coli as refined to an atomic resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
total genus 51
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1992-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2rn2A00
1TK0A 3TAEA 4E7IA 4E89A 4FM2A 2JLEA 3SV4A 3DLBA 1VSFA 2F8SA 1KVCA 3HP9A 4JLHA 2D0AA 3OS2A 4E0DA 4E7LA 3VN5A 1EP4A 1WAFA 4OGCA 4IG0A 3ISNC 3LZJA 4NCBA 4M3WA 5J2MA 1HPZA 3LAMA 4H8KA 4FXDA 5HRSA 4CJWA 4N5SA 4YNQA 4N41A 2FBYA 4HUEA 1WNSA 4DLGA 2D0BA 3QIOA 4O4GA 1VSMA 4AHCA 3NF7A 4FK2A 4RW7A 4QCLA 1RTJA 2B4JA 3ZSYA 4LD0A 1BHLA 4CJSA 1KFSA 1WSEA 4FJXA 2ZQBA 4EP5A 3V9UA 3TI0A 3S9HA 4EP4A 1N6QA 5JS2A 3L2WA 4CEZA 3NF8A 5CZ1A 4CHYA 3JYTA 4DS4A 1KVBA 3DRSA 1ITGA 4O55A 3OYIA 1EX4A 4HUGA 2BANA 5KTQA 1NJYA 1SL2A 4KAZA 2XRIA 4K8XA 4FJMA 1BIZA 4BDPA 1A5VA 1RT1A 2KFNA 5HLFA 1KLNA 1NOZA 2X6NA 1TL3A 1D8YA 1JLCA 3AVLA 1HYVA 2P5OA 2Q3SA 1YTAA 4F2RA 4BACA 4CJEA 5CYMA 1HNIA 4B3OA 3ZSXA 3VQ6A 2YHAA 1NK7A 4M3RA 4HHTA 1RBUA 1KFDA 4N56A 4W5RA 4RW6A 1YTUA 4NCGA 1S1VA 4N76A 1XWLA 2NUBA 4PUOA 4CHZA 3AO5A 3SUNA 1B9DA 3OYLA 1UOCA 4KTZA 4HCBA 4J2BA 2WONA 4FJ9A 4KHUA 4DQIA 4CGFA 3AVAA 4CJPA 4CGGA 4FLZA 3F73A 4CEFA 4CK1A 1NK0A 1UAXA 3KLFA 1XI1A 3HPGA 4FLXA 4FJGA 4XIUA 1S1XA 4B8AB 2FBXA 4DTUA 2IGIA 1W0HA 4FLTA 1J53A 3OS1A 1LW0A 2VWKA 4DF8A 2Y1IA 1RTDA 1WAJA 1B9FA 3F9KA 4Q5VA 3OYMA 3IAYA 1ZBHA 1I3AA 2X74A 4PQUA 5KI6A 3MXIA 1RBVA 4CFDA 3NFAA 4PA1A 4KFBA 5I42A 4B9SA 2Z1JA 3LDSA 1C1CA 4M3TA 2GV9A 3VA3A 3O3GA 1S9GA 4W5QA 3NH2A 4KRFA 1FKOA 4OVLA 4K8ZA 2DFEA 1D9DA 3VQQA 3LWLA 3L2UA 2RN2A 3ZSQA 3VA0A 4DQSA 1BI4A 4M45A 3KTQA 4F3TA 3SPYA 3IS9A 3MXMA 4FLYA 3QEXA 3CM6A 3EYZA 2QK9A 1VSLA 4HVJA 3PX6A 3SUPA 2G8KA 3K5NA 1S1TA 4KHWA 3LANA 3HVRA 4DSIA 4OJRA 1Q9YA 2RF2A 3OS0A 2IS3A 3OVNA 3T19A 1RT6A 4J2DA 1VSEA 3DYAA 4W5NA 2VG5A 1WN7A 4ZTFA 2XO7A 4Z4EA 2HVHA 3NGYA 4ELVA 2R7YA 3KLEA 1SV5A 3SQ1A 4JS5A 1U49A 1GOBA 2Z1GA 1HMVA 3LPUA 4M3YA 1RTHA 3M8QA 2X6SA 2KFZA 4CJRA 2EX3A 4ELUA 4KV8A 4QOZB 3TAMA 2G8FA 1QSYA 1C1AA 4EZ9A 3NAEA 1J5OA 1CXQA 4NCAA 5HBMA 4B9UA 1N5YA 4CHOA 3TAPA 1RT7A 4CGHA 4BDZA 1XHZA 2G8IA 4FJ8A 4FJ7A 4KHYA 1NK5A 4H4OA 2VG6A 4H4MA 4ICLA 1SKSA 4IFVA 1RBSA 1YT3A 5HRPA 4CHNA 3L3UA 2Y1JA 3LP2A 4CGIA 3K5MA 5KRTA 3BGRA 3QO9A 2DTUA 3C6UA 4C8MA 3VQ9A 3DOLA 1DTTA 2A1RA 3KK3A 4EZ6A 3AA2A 1A5XA 1KCFA 3K59A 4GVMA 3MEGA 1QSSA 1ASWA 1UWBA 1S6QA 2VG7A 4KPYA 1L5UA 1VSJA 4CIGA 1EETA 4AHTA 3PO5A 5CZ2A 1RNHA 3DLKA 4AHUA 1X9WA 1WSFA 3CQ8A 4MQ3A 2OZMA 1RT4A 1T8EA 4IDKA 4CE9A 1LW2A 1NK6A 3OYHA 3ULDA 1SKRA 4M3UA 3WNEA 3SPZA 3KK1A 1QQCA 1IH7A 4BDYA 4Y1DA 2HMIA 3SJJA 3AVGA 4KTQA 3QEPA 3NGZA 3B6OA 3HXMA 3TARA 4OPJA 4OLBA 1JXBA 1LWFA 4C8NA 3SQ2A 3NF6A 2OA8A 2XY6A 1TL1A 4B9TA 3EZ5A 1IKXA 3NBPA 4CK3A 3SV3A 1IKWA 2GBZA 4DFPA 4DS5A 4CESA 2OYQA 1T7PA 3AO4A 4UQGA 2YHBA 4JRQA 1Q9XA 1TGOA 4BE1A 4OKEA 4OGEA 3ZT2A 4Q0BA 1JL1A 2HHQA 3AVHA 3HP6A 3P83D 1TKZA 3MEEA 1IO2A 1LV5A 4FJ5A 3OYGA 3SZ2A 3SQ0A 4Z0UA 3SI6A 4J2AA 1S9EA 5E41A 3WNFA 1JLBA 4AH9A 3TWHA 4FM1A 3VQ8A 4DSKA 2D5RA 4CJKA 4FYDA 2G8UA 1T05A 3UIQA 4I2QA 4LY7A 4DTPA 4DSLA 4RW9A 3AVFA 2EHGA 5C42A 4B9VA 4KHSA 3V4IA 1G15A 3NHGA 4F4KA 4FJIA 3PV8A 3LP1A 3O4QA 4B9LA 1JXEA 4CEQA 4BWJA 2RKIA 2F8TA 3ZCMA 3AV9A 3HM9A 3OYAA 3QNNA 3TAGA 2P5GA 4Z4GA 1C0MA 3I0SA 3ZSOA 4J2EA 4M3XA 4OPKA 4O0IA 3OYCA 2HHXA 4W5OA 4CCHA 5DK5A 3HPOA 4FW2A 4AHVA 4DF4A 4RW8A 4DTXA 4CGDA 3AVMA 1VSHA 3V81A 4DTOA 4L8RB 4KI4A 4I9QA 3V1QA 3CFPA 3IG1A 1FK9A 2DY4A 4FLWA 3DRPA 1EKEA 1DTQA 1U04A 3VQ7A 3CG7A 1BQNA 4O5BA 3ZSWA 3ZT1A 4BWMA 3KLGA 4DFKA 4HTUA 5KRSA 1RDDA 1TVRA 3TABA 2RPIA 1UA0A 3AVBA 1RT2A 2G8WA 4DSJA 3NF9A 3VQDA 4FZZA 2PYJA 1NJWA 1QSLA 4O44A 4M41A 4DQRA 3RR7A 1ASUA 4JRPA 4E7KA 3RMAA 3VQ5A 3ZSVA 1LAVA 3G0ZA 3MEDA 3OYBA 3VQ4A 3L8BA 3KJVA 4HUFA 1LWCA 5EU7A 4FLUA 3QESA 1SL1A 4KB1A 1NJZA 4DMNA 4Z4IA 2OPRA 2YKMA 2BE2A 2D0CA 3PUFA 2Z1IA 3ZT4A 4F2SA 4QAGA 3K2PA 3MAQA 3NE6A 1J9AA 3RTVA 4CIFA 4DFJA 1LAWA 4FJLA 2HHWA 3LAKA 1BQMA 5J2NA 2QKBA 4R5PA 3WNGA 3AVCA 1SKWA 4O0JA 3T1AA 1C1BA 1UA1A 3RWUA 4FZXC 2E6MA 4IG3A 3K5LA 1NK8A 1RT5A 4BE0A 2XY7A 4E19A 4DQPA 1WLJA 2P1JA 3LP0A 3LP3A 3NCIA 3P1GA 4DFMA 4I2PA 1RT3A 4CFCA 4CERA 3RMBA 2PZSA 4CHQA 3VQEA 3NH0A 3P5JA 3HJFA 1JLQA 2FC0A 3AA4A 4FK0A 1VSDA 4E7HA 3AO1A 2HHSA 4OKKA 1QE1A 2I5JA 5K14A 4CJLA 4DTNA 4NYFA 3K5OA 1JLEA 1C0TA 4E1MA 4DSFA 5J2PA 3ZT3A 3V9SA 1BCMA 4GMJB 3QIPA 2PYLA 4ELTA 1Q8IA 5JS1A 2XY5A 4CJ3A 3BDPA 2ZD1A 3DOKA 4Y1CA 3T3FA 5D3GA 3AVIA 3KLHA 4E7JA 4PWDA 2E4LA 3TR8A 1KSPA 3HPHA 3LWMA 3AO2A 1JL2A 4FZYA 1YVUA 1C6VA 4FLVA 4Z4FA 1NJXA 1REVA 5C25A 2IC3A 4LH4A 3K58A 4CFAA 2HNDA 1ZBLA 4F3OA 4G1QA 1RBRA 1S6PA 4KHNA 2X78A 1K6YA 3QEIA 1HRHA 3IRXA 1IG9A 1DLOA 1BL3A 1TAQA 4E1NA 3CFRA 3M8RA 1RDCA 5DMRA 3HVTA 1TK5A 4C8OA 3KKSA 4M42A 5HRRA 1S5JA 4CEBA 1GOCA 2F96A 1NK4A 3SYZA 3RRHA 5I3UA 1C0UA 3LPTA 4CJTA 2DFFA 4NYNA 1J54A 3VQBA 2G8VA 1BCOA 4DWIA 3DLEA 1IKYA 4ZHRA 3VQAA 1D5AA 3AA5X 5J1EA 3S3NA 3CYMA 3L2VA 2YNGA 3SUOA 1S1UA 4IFYA 1BIUA 5SZTA 2PY5A 1RDAA 4CF1A 1TKDA 1NKEA 1HQEA 3OYNA 5FDLA 2OPSA 4CF9A 3D0PA 2P51A 4CFBA 4Z4HA 1L3UA 4WE1A 4CJQA 3HT3A 2YNHA 4HCCA 4FVMA 5KGXA 1SL0A 2IOCA 3ZSZA 1NKBA 2G8HA 4JS4A 3O4NA 1CZBA 2OPPA 4DQQA 3AA3A 4LSNA 4CGJA 3V6DA 3V9XA 4OLAA 3MECA 3HYFA 1JKHA 1XC9A 3S3MA 3TANA 4KHQA 1IKVA 1GOAA 2B6AA 3K57A 1L3SA 1RCHA 4M3ZA 2BGGA 3AO3A 1HYSA 3G10A 3SNNA 3C95A 2QXFA 3AVKA 4FJNA 4DG1A 5HROA 1L3TA 5FRNA 1ZBFA 1WSJA 3D45A 4I7FA 5CY4A 2KQ2A 3PO4A 4KB0A 1BGXT 2ITGA 1RBTA 3SCXA 5HP1A 2BDPA 2YNFA 3CM5A 3THVA 1T03A 4KI6A 2Z1HA 3NDKA 2O4IA 4CEEA 3ZT0A 3HSTB 3WNHA 4CECA 4I9LA 3MXJA 2O4GA 3VQPA 4ZTJA 2XHBA 4Z4CA 4DTMA 3U3YA 4KREA 4FJHA 2IDOA 1ASVA 3QEVA 2KTQA 1X9MA 3HO1A 4KKOA 3EY1A 4FM0A 4CJVA 3A2FA 4RG8A 1QTMA 1CZ9A 3OJUA 3U6FA 2HHVA 3M8SA 1RILA 4MFBA 4CF8A 1CXUA 1VSIA 4RW4A 4DTSA 3V1RA 3OYJA 3L3VA 1U48A 1LWEA 3L2RA 3DM2A 3LZIA 4DLEA 2FBVA 4FCYA 2OPQA 3L2QA 3M8PA 3LALA 1FKPA 3FFIA 1NKCA 4AHSA 4CIEA 1VRUA 3VQCA 2QKKA 1HQUA 3AVJA 1KTQA 4CEDA 3OY9A 3NH1A 3TAFA 3SQ4A 3QINA 3PX4A 1B92A 1EXQA 3I0RA 2WOMA 3H08A 4ID1A 2LSNA 1JLFA 4IKFA 1U45A 1R0AA 1S1WA 2KZMA 4DTJA 4B9NA 3KD1E 4CF2A 2KZZA 4TSXA 3OJSA 3ITHA 2HW3A 4FK4A 3CFOA 3KLIA 4BE2A 2B5JA 3QEWA 1MU2A 4FW1A 5SWMA 2FBTA 5T7BA 3TAQA 4E3SA 4PY5A 3O3FA 3OYKA 3QERA 4B8CA 4CJFA 5FRMA 4DU3A 4LSLA 5J2QA 1ZBUA 3HK2A 1NK9A 2YKNA 4YFUA 3V9WA 3ASMA 4CK2A 2HHUA 3KIOA 1TKTA 1Z26A 3V9ZA 1ZYQA 1U47A 3V1OA 1VSKA 1F21A 4DTRA 1QS4A 1TKXA 3DRRA 4N47A 4AILC 5KGWA 1CLQA 1O1WA 1W9HA 2HB5A 3RMDA 4GW6A 4FJKA 2HHTA 3AVNA 1RDBA 1HJRA 4W5TA 2W42A 4DSEA 3QNOA 1WSIA 3ALYA 3C94A 3DMJA 3QLHA 4CJUA 3SUQA 2OZSA 2HNYA 3PX0A 2AJQA 1BI4B 1KRPA 1JLAA 1TV6A 4OKJA 1XHXA 4CHPA 5HRNA 3I8DA 1D9FA 3PY8A 1L3VA 1KVAA 1BISA 4DU1A 3DLHA 1NOYA 4CEAA 3C6TA 4C8KA 1KLMA 2A1SA 3QETA 1ZBIA 1TAUA 3KKRA 3OYFA 2ETJA 1WSHA 4B08A 3KK2A 2JGUA 4CF0A 5CYQA 1Y97A 1QHTA 3O3HA 2E6LA 4CJ4A 3NGIA 1X9SA 4F8RA 4CJ5A 3B6PA 4CEOA 2HVIA 4DU4A 1A5WA 1RTIA 2GUIA 5C24A 1VRTA 5FROA 1U4BA 3KD5E 1HNVA 1WSGA 1JLGA 2YNIA 3DLGA 3HL8A 3RMCA 3OYDA 4C8LA 4FJJA 4B9MA 1VK0A 1FXXA 3E01A 3RR8A 1X1PA 2ATQA 2VWJA 3RRGA 1I39A 2YV0X 3JSMA 4AHRA 3OYEA 3DLRA 2HNZA 2ZE2A 3ZSRA 2XY8A 1SUQA 4LH5A 1TK8A 4KTWA 3U3GA 3S3OA 4ID5A 1HYZA 3DI6A 4IBNA 1Z25A 2DFHA 2KW4A 2IAJA 4KO0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AQVA 5MLCQ 3DLBA 1VSFA 2IIRA 4JLHA 4E0DA 2V52B 3VN5A 1HNWK 4OGCA 1HNXK 4M3WA 4BC2A 4YDUC 5J2MA 3E66A 4HWIA 3MN7A 5AZJB 1WNSA 4O4GA 4FK2A 1VSMA 3NVKA 3NF7A 5AZIB 4LF6K 3FZFA 4FPAA 4RW7A 1M1KO 4QCLA 3ZSYA 1BHLA 5AR0A 1WSEA 3D6RA 4DR4K 3VEZA 1C0FA 4IOXA 1N6QA 1NGCA 4CHYA 3JXUA 1KVBA 3ATVA 4BQZA 3HOTA 3M5RA 3SBTA 1T6CA 4BRGA 1KLNA 1NOZA 2X6NA 3HZ6A 3AVLA 3THYA 4U67L 5C0YA 3FFKB 4M3RA 1KFDA 3RSEA 4N56A 4W5RA 1T6DA 1S1VA 3G25A 3BZKA 4BR9A 3CF5L 3ID8A 4IOCL 1V4TA 1XQSC 4CEFA 1NK0A 4FJGA 3CJ1A 1S1XA 4B8AB 2FBXA 4B1ZA 1J53A 2VWKA 3AGRA 4Q5VA 3HSCA 1ZBHA 1K8AO 3PIPL 3CETA 3BZCA 4WQ5A 3OBWA 3NFAA 4PA1A 1FW6A 1DT9A 2PAVA 1C1CA 4K0KK 2ASMA 4BRFA 3ZSQA 3VA0A 4F3TA 4JI1K 4CVNE 3MXMA 1IBLK 1VSLA 4HVJA 2WUSA 2G8KA 1OH7A 2QWQA 2YHWA 2F4VK 3OS0A 1HUXA 1WN7A 2HBKA 3QFUA 2XO7A 4Z4EA 1Q7YO 2JWKA 1S3XA 3SQ1A 1SV5A 1GOBA 1U2VA 3CJAA 1BWFO 4H0XB 3CCEN 1GLAG 2UUCK 2W6LA 2P9UA 4BVPA 3TSQA 3EE9A 5EXWA 2QWRA 4QOZB 1QSYA 4EZ9A 3NAEA 1CXQA 4NCAA 5GAHP 5AQQA 3CCJN 3QBWA 4FJ8A 4BC3A 3O9RA 5EVZA 1NK5A 4H4OA 2HF4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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