2YHWA

High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling.
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSVAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 106
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhwA02
4FWMA 5AQFA 4M63C 2E1ZA 4BGBA 3BP8A 1P8ZA 1RGIA 2UYTA 4IO8A 5F2RA 2BTFA 3IMXA 4BR4A 1XQSC 3IDHA 4WQ5C 1K8KA 5AQIA 5BREA 3ZX2A 1BG3A 1TUUA 5BN9A 2W41A 3CQYA 3ATUA 4H03B 2YCHA 4FWSA 3FZKA 3TU5A 3UKUA 3LL3A 2Q1NA 1NWKA 4A61A 5AQOA 1NGEA 5BN8A 3L0QA 1KAYA 3D2EB 3B8AX 2QWRA 5KPRA 4BR9A 2HMPA 4FWLA 3H6EA 4FWPA 2E2OA 5AQGA 3VGKA 1YXQA 3QFPA 3H46O 1S22A 4FWRA 3VETA 3LM2A 5KPTA 1GLBG 2WUSA 3CJCA 4XH5A 3L6QA 3O1BA 3D2FB 3HZ6A 4CJ7A 4L3QA 3WEEB 1NGGA 2NLXA 4FPBA 5F1XA 2QM1A 3A5NC 3MMVA 3M1FA 3WT0A 3C0BA 2IVNA 2NZTA 2I7NA 3VF4A 3EZWA 1GLFO 4JD2B 3W3DA 4GY2B 1GLCG 4FPAA 4FL9A 4BRMA 5AZIB 2E2NA 3O08A 4WQ5A 4CD3A 4BVOA 2YI1A 3EKUA 4FWKA 4BQZA 2Q36A 3EL2A 1NGFA 4H0YB 2V7YA 4IJAA 2FSKA 4MO4A 4QS7A 3DJCA 1QQNA 2V51B 2P9UB 3HTVA 5AQPA 1CZAN 3KZBA 2GEMA 2E1YA 1H1VA 4BVPA 2BUPA 3JXUA 3WXIA 2VCPA 3MK6A 3GOIA 1J6ZA 1NMDA 1T44A 4C23A 4BQLA 4WQ4A 3MN5A 2Q2RA 3QBWA 3VOVA 2ASMA 2HF4A 4B1YB 1RFQA 1S3XA 2QWMA 3EO3A 4PKGA 1MWKA 1EQYA 1NBWA 4BR7A 5AQRA 2P9NB 1Q18A 2GUPA 1E4FT 2QWOA 4BRHA 2QWPA 3C7NB 1LCUA 4H5RA 5AQVA 3GBTA 2NRHA 3ID8A 3VEXA 2P9LA 1YAGA 3A5OC 4H0TB 1NGDA 4IZ9A 3DAWA 3FZMA 2A42A 4MO5A 3O6WA 2ASPA 1KXPA 1BDGA 4DHYA 4H0XB 5LJWA 5BPMA 5BR9A 2ZF5O 3TPQA 3VENA 4EIAA 3ZX3A 4HTLA 5KQDA 4IJNA 4JNEA 4AM6A 4FWNA 3CERA 5JLHA 1KAZA 2VYPA 3A5MC 3CQXA 3WXJA 4BR0A 4B1UB 3J8AA 4K42A 2YHWA 2OANA 5AQXA 2H3GX 4I6MA 5KQ8A 5CE3A 1Z05A 3FR0A 2A3ZA 1Y64A 2GWJA 3VERA 3U4LA 4ISGA 1QZ5A 3VEVA 3QFUA 1DGKN 4BRPA 1K8KB 2F9WA 1NGHA 3W0LA 2GELA 2E2PA 4NO7A 2FXUA 3F9MA 4CI6A 5BPNA 5AQNA 3VEOA 1X3NA 5AZJA 4B1ZA 2EWSA 5AFUH 3UKUB 3FLCO 5ADXA 2P9SA 3SMPA 5AQUA 3U8XA 3U9DA 1HJOA 4PL7A 3HI0A 2PAVA 3QICA 3VF6A 3BEXA 4YDUC 1ATRA 2QWNA 3A0IX 1ATNA 3CJ1A 4H5NA 5EOYA 5FPMA 4CBXA 2A40A 2YJFA 1RDWX 1NGCA 4F9OA 2QW9A 3VEZA 3FZFA 3FFKB 3AARA 3O5BA 3R9PA 2P9PA 3ZEUA 1HX1A 3BUZB 1NGBA 3ZX0A 3UB5A 1U2VA 2E8AA 3KHYA 1WUAA 4H5WA 3IFRA 5AQMA 4B1WB 1JCGA 3O80A 2ITMA 3R8EA 4BRGA 3MN9A 1QHAA 3A8YA 3I33A 4O5FA 1HLUA 1BU6O 1SZ2A 2YHXA 2ASOA 4JHDA 4CZJA 3HBTA 4A62A 4BRFA 3LM9A 3M6GA 3HM8A 4BC5A 3JS6A 4XH4A 4BRLA 1XUPO 2P9KA 3H3OB 3RSEA 4DQ8A 5JMVA 4FWOA 5BRHA 1C0GA 2VWBA 1QQMA 3GE1A 5KPZA 3SMSA 4Z94A 5I9EB 1LOTB 4K25A 3GG4A 4H0VB 4BC2A 2E88A 1NGIA 1R59O 3ULEA 2A6AA 4BROA 1IG8A 4RCHA 5FPNA 4M7YA 4ISEA 2V7ZA 4LC9B 4MLHA 4CZFA 3SJHA 4FWQA 1GLEG 2J4RA 4B9QA 3KVGA 1ZXOA 3DXKA 3LDLA 4K41A 2P9IA 1BOTO 3H45C 4EAHD 3GL1A 4PKIA 5BRFA 2F9TA 1TYQA 3VPZA 3UE5A 4BRCA 5AQWA 2P9IB 1Z6RA 3R6MA 2IVOA 3IUCA 3AY9A 1DEJA 4A2BA 4DCHA 3LDOA 2FLOA 3UKRA 2CGLA 3O4WA 4FOIA 4CZMA 3DXMA 1MA9B 3L4IA 4EHUA 1ZBSA 3OHRA 4BG8A 2KHOA 2FSNA 3FZLA 3O8MA 3QBXA 3S41A 3LDPA 3CJAA 4BR5A 1HKGA 1XC3A 4HWIA 3SLCA 4B1VA 1NGJA 4IXCA 3CIPA 2P9LB 3I8BA 3LDQA 4DB3A 4EHTA 4EFHA 3D7EO 1GLAG 3ENHA 5AQKA 3FE1A 3VEYA 5AQLA 4BRDA 2CH6A 5AR0A 5AFUA 2YHYA 5E84A 4RTFD 4BREA 4I6MB 4PKHA 3VF2A 1YVNA 5AQYA 3AAQA 3MN6A 4JN4A 1SAZA 3ENOA 3WXLA 3SK3A 1QZ6A 3G25A 5JLFA 1DKGD 4NB4A 5EXWA 5BRDA 2FSJA 2ZGYA 4J8FA 1HKBA 2HF3A 1T6DA 4PL8A 3FZHA 1HPMA 1BO5O 5TKYA 4O8KA 3WXKA 3H3NO 3WUHA 1YUWA 3VEWA 4IWVA 5AZJB 3QB0A 4GNIA 3CJ7A 5AQTA 5F0XA 2E20A 3H1QA 3D2EA 2P9SB 4QS8A 1SQKA 1TUYA 1U6ZA 3WQTA 1KAXA 3MCPA 5AQQA 2QXLA 2I7PA 4CBUA 5AQJA 4H5TA 4FO0A 3HSCA 2P9PB 3D2FA 3ZEUB 3CJ9A 4WQ4C 1BUPA 3WEEA 3CI5A 1HKCA 2W40A 1U2VB 1G99A 3VGLA 1T6CA 2Q0RA 1E4GT 2IVPA 4BC3A 4CZIA 2DPNA 5LJVA 2CGKA 2D0OA 3FGUA 5FPEA 1WOQA 1V4TA 2AP1A 4JD2A 4CZHA 3MN7A 3A5LC 4XEIA 3GDQA 4JHDB 5AZIA 4H5VA 4K43A 5AQHA 1X9JA 5ADXH 3WQUA 2Q31A 2P9KB 3RSEB 4XH1A 4BRAA 1ATSA 1GLDG 2V52B 3MDQA 2P9UA 2D1KA 1QQOA 1ESVA 3M3ZA 4FOEA 2GWKA 2PBDA 5FPDA 1JCFA 1HUXA 1ZC6A 2ZWHA 4KBOA 1MDUB 4YDUA 2QWQA 4BGAA 3VGMA 3ULEB 2A5XA 4ISFA 1X3MA 3QDKA 4BR2A 1NLVA 2ZGZA 5E26A 4BC4A 2A41A 1MWMA 4FSVA 4CZLA 1GLLO 2GTDA 3ATVA 3DXKB 4BRIA 3BF1A 2D4WA 5EX5A 2FF3B 4A2AA 4CZGA 5JICA 1D4XA 1BWFO 4CBWA 3DWLA 3P4IA 5LY3A 4Y0WA 1NGAA 5EY4A 4H0OA 4AM7A 1TYQB 3VESA 4BRKA 4CD1A 2CH5A 1IJJA 4B1XB 4CZKA 5B8HA 3BF3A 2P9NA 1C0FA 4CZEA 3CETA 2QWLA 4WYBA 5BPLA 3EKSA 3UKRB 4MLEA 1JCEA 4JAXA 2YJEA 5AQZA 3C7NA 3DXMB 4M7XA 1BA0A 3CJBA 1OKJA 4BRQA 4QS9A 4BG9A 4E1JA 2Q97A 5AQSA 1NM1A 3AAPA 2IIRA 2D0PA 4BRNA 3U9ZA 3QMLA 1GLJO 4RWTA 3H1VX 1BA1A 2Q0UA 3ZETA 2E2QA 3EN9A 3O1WA 5EVZA 2AA4A 3CHWA 4H0PA 1V4SA 5ELZA 2FF6A 2CGJA 3ZETB 2HOEA 3LDNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QVGM 2A1RA 3NCIA 1GOBA 1QHTA 1RGIA 3DOLA 4V19S 1KLNA 1C0UA 4CEAA 1NK0A 4AH9A 4CW7B 1M90O 1BL3A 3ZX2A 3OW2M 3C6AA 3E9OA 3ATUA 3WXMB 4IDHA 1B9FA 3QEVA 2XY5A 3FZKA 1YIJN 4ILJA 3LL3A 3K5OA 5AQOA 1NGEA 1CLQA 3D2EB 3V1RA 3OY9A 2IGIA 3UIQA 4JI4K 3J81O 1LV5A 2E2OA 3DYAA 1IKVA 5HOOA 3SPYA 1N33K 1Q82O 4YFUA 1B92A 4B9VA 1F21A 4B9NA 5KI6A 1QSYA 1YT3A 3E9PA 2HBMA 5K14A 5CHIA 2RKIA 2NLXA 4FPBA 3WT0A 3C0BA 1NOZA 2NZTA 3K5NA 1VQ7N 2I7NA 1CXUA 4Z4EA 5J2MA 5CY4A 1YTAA 3W3DA 3KWGA 4FPAA 4BDYA 4WQ5A 3HT3A 1RILA 4FZZA 3EKUA 4M3TA 2O8CA 1WBBA 3EL2A 1S6PA 1RBUA 2V7YA 2FSKA 3IKMA 4W5RA 1C1CA 2D0AA 5JS2A 1NK6A 3THWA 2W6KA 2GEMA 4BVPA 3AVKA 1YITN 2OTJN 4KHPK 4KREA 1J6ZA 3EY1A 1FK9A 2DFEA 2O8DA 1T44A 3VQQA 3F5TA 1HYSA 4BQLA 4I9LA 3OBYA 3G10A 2Q2RA 2HF4A 4B1YB 4C8MA 1S3XA 4PKGA 2HMIA 2VQEK 3AA5X 3NGYA 3ID6A 1HJRA 4W5OA 5AQRA 3B6OA 1Q18A 4U67L 5MLCQ 1E4FT 2QWOA 5GIOA 2UUAK 1K9MO 4ILHA 2NRHA 3LALA 2P9LA 4H0TB 1C0TA 3DAWA 3DLKA 2DFFA 5BR9A 4EIAA 5KQDA 3CXCM 4FWNA 3AVLA 5JLHA 3CCJN 2VYPA 3A5MC 3WXJA 4CJLA 2OANA 1OH8A 4A5BA 2H3GX 2A1SA 1TKXA 3ZLJA 3TABA 4NLBA 2HHXA 4KKOA 1FW6A 2GWJA 1I39A 2HB5A 1QZ5A 3VEVA 5AJ3K 1DGKN 1K8KB 3SUNA 1S9EA 2G8FA 3TTCA 2GELA 4B9MA 4CI6A 1ZBLA 5AQNA 3HPOA 1X3NA 5HRRA 5AZJA 2EWSA 4E89A 3S3MA 3FLCO 2YKNA 2Q3SA 3U8XA 3E1YA 3U9DA 1BQNA 4X66K 4JI7K 3BEXA 4O55A 2QWNA 5EOYA 1J9AA 1C1AA 2A40A 4JI6K 1L3VA 1DTQA 2NRWA 4HUFA 3C6TA 3FFKB 4UQGA 3RR7A 3AARA 3KD5E 3SAFA 4AF1A 3ZEUA 3KWIA 4E7JA 2FBTA 3IFRA 5AQMA 4LF4K 2UUBK 4DFMA 3A8YA 2YHXA 3G71N 3HBTA 2IOCA 4A62A 1Z26A 2YKMA 3CCEN 4CF2A 4KI6A 2HVIA 3JS6A 3O9RA 4XH4A 4CJTA 3H3OB 1BISA 4CIFA 4CGFA 4E7HA 3SMSA 4R5PA 3QESA 4K8ZA 1QE1A 3O3HA 1W0HA 3ULEA 2PFUA 4BROA 4L8RB 2GV9A 4LF8K 4DFKA 2J4RA 1ZXOA 4OGCA 2P9IA 3KLHA 4FXDA 4EAHD 4RW8A 3NVKA 2G8UA 4DR4K 4PKIA 4DQRA 3ISNC 4HCCA 1TYQA 3VPZA 4BRCA 4JV5K 5LMUK 2YNGA 5TKWA 2NRTA 3IUCA 4DV5K 4DCHA 4HHTA 4BE2A 1KSPA 4IG0A 2FLOA 1LW2A 4W5NA 1WSGA 3N4QA 4DR7K 3OHRA 1SUQA 3FZLA 3O8MA 1T8EA 4BR5A 3CJAA 4E7LA 3HOSA 3NHGA 2E6LA 1IBLK 3THYA 3VA3A 4IXCA 1NNEA 4Z4IA 4BACA 1TK8A 2B4JA 4DMNA 4EFHA 4JK8A 5DK5A 3JYTA 1GLAG 2OPRA 4BRDA 4DS4A 2CH6A 5AR0A 2IDOA 1VQ9N 4O8UA 1QSSA 4B3TK 3KKRA 4PHTX 3V6DA 3AO5A 3LWMA 5AQYA 3AAQA 1ZYQA 1SAZA 1QZ6A 4RW9A 2FSJA 4J8FA 1RT6A 1T05A 3OYMA 1T6DA 3MEDA 4C1NK 3NH2A 3NE6A 1YJ9N 3FZHA 3ALYA 5TKYA 3O9TA 4GMJB 3I56N 4DLEA 2NRXA 3CC2N 4Q5VA 4FJXA 1RT1A 1HYVA 4FK2A 1ASUA 3EE9A 1EWRA 4GNIA 3SUQA 3D2EA 4QS8A 3QERA 3ZT4A 4AHSA 1TL1A 5CYQA 3WQTA 1KAXA 5AQQA 1IKWA 1IBMK 1REVA 4DQIA 3OYBA 1WAJA 1XC9A 1S1TA 4M41A 3PSIA 4H5TA 4Y1DA 4N41A 1HMVA 3V9ZA 3HSCA 2P9PB 4OPJA 3BGRA 2IVPA 4DU4A 1RT2A 3OYKA 4HUGA 3FGUA 3DLBA 5FPEA 1D9DA 1WOQA 3VQAA 2VG6A 4CJUA 3A5LC 4JHDB 4K43A 5AQHA 3KK7A 4R79A 1WLJA 4CEZA 5C25A 1Q9YA 1HR0K 1BCMA 3VQ4A 5DMRA 3M3ZA 4KBOA 1BCOA 3E66A 4DTMA 1VQNN 3R1XA 2A5XA 1KCFA 2QA4N 3DLGA 4JRPA 2G8KA 1NLVA 2ZGZA 4BC4A 2PZSA 3QIOA 4FSVA 1GLLO 2GTDA 4CZLA 3BF1A 4CGHA 2D0CA 4CZGA 4CHNA 2D5RA 5JICA 2JGUA 3I8DA 1HNXK 3PLAA 2RF2A 4CJKA 1KRPA 4H0OA 4DSEA 1P90A 5C15A 4DTXA 2DTUA 1XWLA 3BF3A 3CM5A 3LAKA 1C0FA 4CEDA 2G8IA 3CETA 1D9FA 4WYBA 4CHZA 2OPQA 4Z4FA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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