2YHWA

High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling.
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSVAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 106
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhwA02
4CZFA 3VETA 4BGAA 1SAZA 2E2OA 3A8YA 1JCFA 2W41A 3O80A 1KAZA 4WQ4A 1NGIA 1X3MA 3I8BA 2YHXA 3O8MA 2E2QA 1DEJA 4FO0A 2QW9A 3FE1A 5AQYA 1BA1A 1YVNA 2QM1A 3GE1A 3D2FB 4LC9B 2DPNA 4BRPA 3WXJA 3GBTA 3HTVA 4FWKA 3ZETB 5BRDA 4FWRA 2PBDA 3WQUA 2BUPA 3LDNA 3R9PA 4CZEA 1TUYA 4GY2B 5KPRA 2GELA 2I7NA 2P9IB 5AQUA 2ZWHA 3CETA 4H5WA 2QWRA 3O4WA 1T6CA 3SLCA 5ADXA 4FL9A 2FF6A 5AR0A 4WQ4C 3JXUA 3FGUA 3UE5A 2CGKA 1JCEA 1YUWA 4WQ5A 2F9TA 4AM6A 2E1ZA 3CQXA 3D2EB 3A5OC 1RFQA 1OKJA 3MN9A 1QHAA 2V52B 4BRNA 4EFHA 3J8AA 3BF1A 4FOEA 5BR9A 4CD3A 4MO4A 4BC3A 4H0OA 3D7EO 1G99A 1D4XA 4JAXA 3HI0A 3U9ZA 4RWTA 1YXQA 2P9NA 1QZ5A 4WYBA 4PKHA 4O8KA 2D4WA 1WUAA 2ASPA 5AQVA 3VF4A 2QWQA 3UKRA 4IZ9A 4XH5A 2GWKA 4HTLA 1GLJO 3HSCA 1Z05A 1ZBSA 4BRCA 2I7PA 1CZAN 1SZ2A 1KXPA 1P8ZA 2A40A 5JLHA 4FPAA 3VGLA 4CBUA 2BTFA 2FF3B 2A3ZA 3UKUB 3VEXA 2HF4A 3QBXA 1TUUA 4PL8A 4ISGA 3VENA 4A61A 4K43A 4JHDB 3DXKB 1T6DA 3EO3A 2P9PB 3VPZA 3ATVA 3SMPA 5AQIA 2CH5A 3DJCA 3CI5A 5AQSA 5AQKA 1GLEG 3VEOA 4IWVA 1BU6O 2ZF5O 3KVGA 3ZX0A 4FWQA 4EIAA 3H46O 4BQZA 3BP8A 2QWOA 1C0FA 2YHYA 1RDWX 3EL2A 3I33A 3EKUA 1IG8A 5AQZA 3IMXA 3GDQA 1DKGD 3QB0A 3VF2A 4CZKA 5ADXH 3A5LC 1ZXOA 4BROA 1NMDA 4XH1A 3FLCO 4CBWA 2D0OA 1U2VB 5EVZA 4M63C 4YDUA 3VEYA 3MMVA 4GNIA 3SMSA 1C0GA 4CD1A 1LOTB 2PAVA 3LM9A 2P9KA 1NM1A 1BUPA 2Q2RA 3DXMA 3U4LA 4DQ8A 4BR4A 3WXKA 2P9SA 1NGDA 3FZMA 4B1UB 1BDGA 2ZGZA 1NWKA 1GLBG 3FZKA 2YHWA 3H3NO 2AP1A 5BN8A 2UYTA 5BRFA 3KHYA 4CZLA 5LY3A 2QWMA 1KAXA 2E8AA 5AQWA 3ID8A 5JMVA 2CGLA 1BG3A 1V4TA 3MDQA 4QS7A 4B1VA 4PKIA 4FWNA 3EN9A 5FPMA 3QFPA 4CZGA 4YDUC 4NB4A 3WEEA 2P9LB 2IVPA 1K8KA 4FOIA 4AM7A 1HJOA 5AQHA 4J8FA 1LCUA 3WUHA 2ASOA 1NGHA 2VCPA 5AQFA 1Y64A 5AQPA 2OANA 4BC5A 4JD2A 5KQDA 1ATNA 4BRDA 4MLEA 3UKRB 3H1QA 2D1KA 4CBXA 4B9QA 1NGGA 3M3ZA 3OHRA 3BEXA 3MN6A 4CZIA 2E2NA 4B1XB 2QWNA 4BC2A 3TPQA 2A6AA 5F1XA 5F0XA 5BPLA 4XH4A 2E20A 3L0QA 3CJ7A 1MA9B 3IUCA 4BRHA 3C7NA 4RCHA 1KAYA 5FPDA 3CJ1A 5EY4A 2VYPA 4Y0WA 5LJWA 4H0YB 3C0BA 2E88A 4CZHA 1GLLO 3VGKA 2IVOA 4IJAA 4K25A 2H3GX 3JS6A 4A2AA 4DCHA 3ULEA 2NZTA 2QWPA 1T44A 3S41A 2Q97A 3VEZA 4E1JA 5AZIA 5E84A 3U9DA 3DAWA 4BR5A 3O1BA 3CIPA 4BQLA 2HF3A 4EHTA 5F2RA 4WQ5C 5AQXA 5EX5A 1HX1A 2YJEA 5BPNA 2P9KB 2FSJA 3H1VX 2FLOA 4I6MA 2P9UA 4BRMA 1QQMA 3ZX3A 4XEIA 4M7YA 2P9SB 2YJFA 4BR7A 4PL7A 2AA4A 5KPZA 2V7YA 5EOYA 3VOVA 4BREA 3AY9A 2F9WA 3KZBA 3AARA 1NGFA 4IO8A 2GEMA 3SJHA 1SQKA 2GWJA 1QZ6A 2FXUA 2IVNA 4BRIA 4K42A 4H0VB 2Q0UA 4H5NA 4BRLA 5AQOA 4FWOA 2EWSA 1X3NA 3GG4A 1HKBA 3WEEB 2VWBA 3M6GA 1ATSA 3BUZB 1K8KB 1HKCA 1MWMA 2GTDA 2WUSA 4BGBA 3A5MC 1R59O 1NGAA 3LDQA 3ZEUA 5AQTA 3L6QA 4QS9A 1BOTO 4JD2B 2D0PA 3R8EA 3W3DA 3CHWA 4C23A 1Z6RA 1NLVA 1BWFO 1GLDG 3VGMA 1NBWA 1V4SA 4KBOA 5AQGA 1BO5O 3ENHA 2CH6A 3W0LA 4B1WB 5CE3A 4BG9A 1QQNA 3L4IA 5AFUA 3QICA 4RTFD 5AQNA 3GOIA 3C7NB 3MCPA 3LDLA 3ZX2A 2E1YA 4JN4A 5AQJA 4FWMA 2Q0RA 2V51B 4DB3A 5KPTA 1E4GT 2FSKA 3IDHA 5LJVA 3LM2A 3ENOA 4CZMA 4L3QA 1HLUA 5BRHA 5EXWA 3QDKA 2P9NB 3WT0A 4F9OA 3CERA 4FWPA 1ESVA 3HM8A 3EZWA 4BVOA 3ULEB 1MDUB 1TYQA 1U2VA 4ISFA 1GLAG 3M1FA 5AZIB 5AZJA 4BG8A 4B1YB 5I9EB 3BF3A 4A2BA 2YCHA 3GL1A 4BR2A 3RSEA 5FPEA 4I6MB 3SK3A 3U8XA 1XQSC 4A62A 3CQYA 2P9UB 2FSNA 2A42A 2NRHA 3AAQA 3HBTA 1NGEA 1HKGA 3R6MA 4H03B 4HWIA 3F9MA 4CJ7A 2V7ZA 4CI6A 3H45C 1U6ZA 3VERA 2GUPA 2ITMA 1GLCG 3WXIA 3D2FA 3UB5A 4MO5A 1RGIA 1EQYA 2P9LA 3FZLA 4BVPA 3VESA 2HMPA 2J4RA 3ZETA 1HUXA 1WOQA 1HPMA 3HZ6A 4H0XB 5ELZA 2QXLA 5AFUH 3DWLA 4EAHD 4ISEA 2P9IA 2ZGYA 3DXMB 3A0IX 3FZHA 3H3OB 3ZEUB 2YI1A 3QMLA 4PKGA 5JICA 3FFKB 2Q1NA 2ASMA 4BR0A 2Q36A 1IJJA 4FWLA 4FSVA 4H0TB 4K41A 5B8HA 1ZC6A 2W40A 4H5VA 5AQQA 3O6WA 4JNEA 4BRKA 4BRAA 5E26A 3QBWA 4O5FA 3A5NC 3QFUA 3O5BA 5JLFA 3O08A 2A5XA 3FZFA 5AQMA 5BPMA 4DHYA 4BC4A 3D2EA 3ATUA 1E4FT 3AAPA 5KQ8A 1QQOA 1ATRA 3CJ9A 2E2PA 3MK6A 3WQTA 2CGJA 3TU5A 4M7XA 4FPBA 3EKSA 4IJNA 4CZJA 3MN7A 3LDOA 3LDPA 5AQRA 3CJBA 4MLHA 4NO7A 2QWLA 1NGBA 2HOEA 5BN9A 3VEVA 3P4IA 3IFRA 3CJCA 4FWSA 1JCGA 4QS8A 1Q18A 1YAGA 2NLXA 3H6EA 3FR0A 1H1VA 4H0PA 1DGKN 1NGCA 4H5TA 5FPNA 4BRQA 3G25A 4Z94A 1TYQB 4BRFA 4IXCA 3O1WA 1XUPO 3B8AX 5AZJB 4B1ZA 1MWKA 1XC3A 1GLFO 3UKUA 5TKYA 3VEWA 4EHUA 5AQLA 4BRGA 1X9JA 1S22A 3LL3A 4BR9A 4H5RA 2A41A 4JHDA 1S3XA 3DXKA 5BREA 2P9PA 3MN5A 3RSEB 3CJAA 1BA0A 3WXLA 2KHOA 3VF6A 2Q31A 1J6ZA 2IIRA 1NGJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QQCA 1VQON 4DR3K 4JKCA 4PUOA 4YOXA 3DLBA 3I8BA 3THYA 3IAYA 1I94K 4B3OA 2FC0A 1SV5A 5SWMA 1WAFA 4OLBA 3D2FB 4BRPA 5CZ1A 3KLHA 4YOUA 4DR4K 2PBDA 3WQUA 2IAJA 4Y1CA 3OYIA 2PY5A 4Z4EA 4OJRA 1TUYA 2I7NA 3Q7CA 1S1XA 2QKKA 4H5WA 3O4WA 3SLCA 1B9FA 2HHSA 2O8DA 4IFEA 4ELTA 2O8FA 3OYJA 2RKIA 3PSIA 1JCEA 4F3TA 1I39A 4AM6A 3LPTA 2E1ZA 3PX4A 4CGDA 1BI4B 4W5OA 1DT9A 4ICLA 2V52B 3AO2A 4BRNA 1RT4A 4AHVA 4CD3A 3PUFA 4DR1K 4DQIA 4CEFA 3VQ6A 1W97L 1S1UA 3U9ZA 3OYCA 1VSEA 1YXQA 3V9XA 4PKHA 4O8KA 2D4WA 5M1NA 2QWQA 3CFPA 3UKRA 4AHCA 4DQQA 1KVCA 5K14A 3QEVA 4K8ZA 2HB5A 2JLEA 4CHNA 4DQRA 4BRCA 2I7PA 1SZ2A 4W5QA 4CBUA 1CXUA 4MQ3A 2HHTA 3UKUB 4CECA 4PL8A 1TK0A 2WONA 3EO3A 1L5UA 1ZBLA 2P9PB 1YIJN 3SAGA 3ATVA 4B9VA 4W5TA 2WFBA 5KGWA 3MEGA 4M41A 1HNZK 4IWVA 4KHQA 3OYLA 3BP8A 1C0FA 2WOMA 3SQ4A 1IG8A 5AQZA 4B9SA 4DF8A 1BQNA 3VF2A 1ZXOA 3G0ZA 3OS1A 4XH1A 4CBWA 1U48A 4X64K 2RPIA 4GNIA 2YX6A 4DV6K 3SNNA 2P9KA 5CHIA 1KLNA 1NM1A 3V6DA 4LFBK 2ATQA 1S1VA 4LH5A 4AILC 1U49A 5FDLA 4DWIA 1XMQK 3FZMA 4O8UA 4J2AA 4CJUA 2QTDA 2YHWA 4WFNL 4B9MA 2UYTA 1JXEA 2F4VK 4IFYA 5CZ2A 2E8AA 1W7AA 2OZMA 4JK9A 3B6PA 1K6YA 3TI0A 2HBKA 1V4TA 2Z1GA 2NRVA 4CJEA 4OKKA 3HOSA 4BDZA 5CYMA 4CJTA 4NB4A 5CY4A 4AM7A 5AQHA 1JLCA 1W9HA 3DRRA 4CJSA 2VCPA 5AQFA 1Y64A 1BIZA 4B08A 1SKSA 4BRDA 2O8BB 3SAHA 3PO4A 2VWKA 5GAGP 3M3ZA 4LF5K 4YORA 3ZSVA 5F0XA 1R0AA 5BPLA 1DTTA 2YHAA 3CJ7A 3HRGA 3J81O 1RTHA 4E7KA 4NCAA 1M90O 1UAXA 4RCHA 3I0SA 4C1NK 4JI8K 3MWPA 4JKFA 3C0BA 1QSYA 3THWA 4RW6A 3OTOK 3RR7A 4KHPK 4E1JA 5AZIA 2BANA 5E84A 3SQ1A 4KTZA 4FLYA 4BR5A 1F21A 4F4KA 3O1BA 3CIPA 1Q82O 3CFRA 3DOKA 1RDAA 4BDYA 4EHTA 4WQ5C 3CF5L 3TSPA 2FSJA 3H1VX 3KLGA 2HW3A 3KK3A 4E7HA 1C1CA 4M45A 4ZHRA 3ZX3A 4GKJK 4E1NA 3PSFA 1FW6A 2P9SB 2YJFA 3CCLN 3SAFA 1MU2A 1RT2A 3T1HK 4LF9K 2F9WA 3AO1A 1RT7A 3AARA 1NGFA 3K9JA 3PV8A 4YOTA 4NXMK 2QA4N 4JI0K 2XY6A 4LH4A 3TARA 2FXUA 4H0VB 2Q0UA 4A5AA 4FWOA 4BWMA 3L8BA 1RBUA 1N34K 1BQMA 3GG4A 3WEEB 2VWBA 3BUZB 3AO4A 1K8KB 1MWMA 2GTDA 3LALA 4BGBA 1W2BM 1NGAA 4CJRA 2WTUA 4JD2B 1KQSM 3TTCA 4DFMA 3NCIA 1YTAA 2O8EA 3ZSRA 3S9HA 3QIPA 3K59A 3VGMA 1NG9A 1GOCA 1RT3A 3QEWA 2G8WA 3SCXA 1YITN 4BG9A 4IG0A 1KTQA 3AA2A 1C0TA 5AFUA 4GVMA 3CC7N 3RR8A 2VQFK 4M3ZA 3GOIA 3MCPA 3LDLA 4AHUA 4DV0K 3THXB 3F9KA 4JN4A 3PIOL 4FWMA 2V51B 5KPTA 4ILHA 3TANA 1NJZA 3VQ5A 2E6LA 1YHQN 1VSMA 2FBTA 2HVIA 4DTUA 4W5RA 1TL3A 2XY5A 5EXWA 2P9NB 4X66K 3WT0A 5C2DA 1JLGA 3VQCA 4ILGB 1CZ9A 1T8EA 2ZQBA 3HM8A 1SL2A 4FK4A 3ULEB 4FW2A 1MDUB 4ISFA 3M1FA 4JI7K 5AZJA 3BZKA 2BDPA 4CEQA 5HRNA 3U6FA 3BF3A 2HHHK 5IT9O 5BR8K 4A2BA 2YCHA 3NVMA 4O4GA 2NRTA 3NGZA 4IFVA 4DKWA 4R5PA 3JSMA 4DV2K 4ZTFA 2QKBA 3VQQA 2A42A 4WFBL 4KFBA 4N5SA 4C8MA 4CGGA 3ZCMA 2I5JA 5HRPA 4CI6A 3VERA 1L3SA 4YOYA 3AVGA 4B3RK 3ZETA 3ZSOA 3NH0A 4CGFA 3LP1A 3HZ6A 2UXDK 2QXLA 5FRNA 4BWJA 3DWLA 3T1YK 2ZGYA 4B9TA 1M1KO 2O8BA 4IG3A 1QSSA 4F3OA 3FFKB 1VQNN 4K41A 5B8HA 1LWEA 2P1JA 4H5VA 3EY1A 2ETJA 4HCBA 3O6WA 4JNEA 2KFZA 3A5NC 4U67L 4DV1K 2A5XA 3TAEA 4DHYA 1L3TA 4BC4A 4CJ4A 1HYZA 1VSHA 3WXMB 1ATRA 4KO0A 3TR8A 4PY5A 4JLHA 3WQTA 3TU5A 4FCYA 3EKSA 3T3FA 2A1RA 3E01A 4NO7A 1NGBA 2RF2A 4DTJA 4FM2A 3VEVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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