2YHYA

Structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetylmannosamine and adp
Total Genus 105

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
5010015020025030030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
total genus 105
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhyA02
3FZHA 3GE1A 5BN9A 3CQYA 3SMPA 3UKUA 3A8YA 4FWLA 4XH4A 3ULEB 5F2RA 5EX5A 1KAYA 3QB0A 2GEMA 2YJFA 5ELZA 3SLCA 4IWVA 4BR5A 2QW9A 2VWBA 3W3DA 4PKHA 4J8FA 4YDUA 3SMSA 2E2OA 4JHDA 5AQWA 3VPZA 5KQDA 4CJ7A 4Z94A 4ISEA 3ZX0A 4K25A 4BRFA 4M7YA 1V4SA 3GBTA 4EHUA 5EY4A 2ZGYA 3RSEA 4K43A 3VF2A 4CZEA 1YXQA 5AQJA 3ZETB 1X9JA 3L4IA 1C0FA 2P9UA 4WYBA 5BPNA 4GNIA 1QZ5A 4M7XA 1YVNA 2QWPA 2D4WA 4FPAA 4K42A 2GTDA 3O8MA 1GLAG 4HTLA 3VGKA 3EN9A 3DXMA 2A5XA 3VEXA 1JCEA 3CJCA 5F1XA 3MCPA 5AQSA 4ISGA 1X3NA 3VEYA 3C7NA 5TKYA 1J6ZA 3D2EB 5AQGA 3EO3A 4BROA 2FSJA 2P9IA 3EKUA 3I8BA 4BREA 3HM8A 4H0PA 3CIPA 4H5NA 2HF4A 5BRHA 1ATSA 4H5VA 2GELA 5AQZA 1Z05A 2P9KB 5AQNA 1DKGD 3R9PA 4PL8A 2GWKA 3GOIA 1NGIA 1QQOA 4FWSA 4HWIA 2ITMA 3VOVA 4A61A 1RDWX 1BA0A 2FF6A 3UKRA 5FPDA 2NLXA 2HMPA 4I6MB 1YAGA 3VF6A 4NO7A 1HX1A 3CERA 3QICA 4H0TB 4BRNA 4CBUA 4FPBA 1XQSC 2E1YA 3AY9A 1T6CA 5AZJA 1HUXA 3JS6A 4IXCA 2A3ZA 2QWOA 3DXKA 5AFUH 5BRDA 2ASPA 3ZX3A 3KHYA 3KZBA 1CZAN 4B1UB 3WXJA 3O5BA 3VEVA 2AA4A 3LM9A 4B1ZA 3FGUA 2F9TA 3AAPA 2HF3A 1BU6O 5ADXH 5LY3A 4CZGA 5BPLA 3M3ZA 4O5FA 3F9MA 1TYQB 4JD2A 2P9NB 1BO5O 1BWFO 1NGBA 4QS9A 4QS8A 2E2NA 5B8HA 4AM6A 4DCHA 2QXLA 4H5WA 1TUUA 1U6ZA 4RCHA 2Q31A 2V51B 4BRIA 4WQ5C 3VGMA 3H1VX 2QM1A 5AR0A 2ASOA 2P9LA 1EQYA 4CZKA 1T6DA 4A2AA 5EXWA 1SQKA 3LDNA 2Q1NA 4YDUC 5BRFA 3DJCA 3A5MC 4FWKA 2A41A 5E26A 5LJVA 1KAXA 3ZEUA 5LJWA 5AQOA 4BC5A 3H46O 3I33A 3U9ZA 3JXUA 3MDQA 3MMVA 2V7ZA 3CI5A 4MLEA 4IJAA 5AQVA 4PKGA 3WUHA 2YHYA 1JCGA 3AAQA 4CZIA 2CGLA 1NGDA 1KXPA 4FSVA 3MN7A 2VCPA 5BN8A 4WQ5A 1G99A 2QWLA 3LDLA 4BRKA 4B1WB 4BQZA 4CZHA 3MN5A 5EVZA 2BUPA 3HTVA 1NLVA 2CGKA 3LL3A 1P8ZA 2QWMA 4JHDB 3QMLA 1ATRA 4RTFD 3L6QA 4H03B 3CJAA 3U9DA 5CE3A 4EIAA 2I7PA 1KAZA 3W0LA 1HKBA 3H45C 1QQMA 1U2VB 2DPNA 3ENOA 3VERA 4BR2A 3O1WA 2VYPA 5JMVA 4A62A 4BG9A 1DGKN 1IJJA 5AQUA 4XH5A 3EL2A 2GWJA 4CZLA 2J4RA 3WT0A 5AZIA 3IUCA 4K41A 2YJEA 3C7NB 3A5NC 3D2FB 3FZKA 4CBWA 5E84A 2CGJA 4WQ4C 4PL7A 1C0GA 4IO8A 4BRDA 1LOTB 3SJHA 2P9IB 1NMDA 3R6MA 3C0BA 2YCHA 3LDPA 2KHOA 1TUYA 3AARA 2D0OA 4DB3A 3FZMA 2A6AA 2W40A 1JCFA 1WUAA 3IFRA 3DAWA 3OHRA 3QBWA 4JAXA 1K8KB 4CD1A 1BG3A 2HOEA 3HZ6A 3VEOA 2UYTA 3O6WA 5KPZA 5AFUA 5AQYA 3CETA 3O08A 3LDQA 1X3MA 2E88A 4H0XB 5AQKA 4L3QA 4EHTA 1NGJA 5BREA 5ADXA 4WQ4A 1XUPO 3VEZA 4DQ8A 4BC4A 2FSNA 4CD3A 3O4WA 5JLHA 1WOQA 4B1VA 1NGAA 1SZ2A 2IVOA 3ATUA 4FO0A 1NGEA 3EZWA 5AQIA 1LCUA 1NGGA 2E2QA 3GL1A 1BDGA 1GLCG 2P9SB 4E1JA 4FWMA 1YUWA 2Q36A 4CBXA 2Q0UA 5FPMA 4RWTA 3M6GA 5AQXA 2W41A 3CJ1A 3MN6A 2ZGZA 5AQLA 5EOYA 3LM2A 4BGAA 4JNEA 4DHYA 4CI6A 4PKIA 2YHWA 5F0XA 3VF4A 5I9EB 3WQTA 1TYQA 4BRCA 1BA1A 2P9NA 3L0QA 2CH5A 3IMXA 4BVPA 3ID8A 3U8XA 1GLJO 1NGHA 1Z6RA 4CZJA 4IZ9A 1H1VA 4H0OA 2E1ZA 2FXUA 3FR0A 3BF1A 2V7YA 4KBOA 5AQQA 1Q18A 3ATVA 3WXLA 4CZFA 3D7EO 3HSCA 3A0IX 3WEEB 1E4FT 3FLCO 1MWMA 1QHAA 3G25A 4XH1A 5BPMA 2P9PA 3QDKA 3UKUB 1MWKA 2E2PA 1S22A 1ZXOA 2Q97A 2PAVA 3ZX2A 4BRLA 2FSKA 4Y0WA 1QQNA 4CZMA 2ZF5O 1HKGA 2Q0RA 3SK3A 4B1YB 2FLOA 4ISFA 2NRHA 5AQFA 4BRPA 1XC3A 3A5LC 2F9WA 2ASMA 4BRHA 3J8AA 2E8AA 3VESA 3TPQA 1DEJA 1HKCA 3ULEA 3RSEB 1T44A 2H3GX 3VETA 5AQMA 1ESVA 3MK6A 4BR9A 2P9UB 3BUZB 3A5OC 3HI0A 3R8EA 4AM7A 5KPTA 3B8AX 2IIRA 3BEXA 2IVNA 3DXMB 4FWRA 2D1KA 3HBTA 4BG8A 2E20A 5KQ8A 3ENHA 5JICA 5AZIB 1RGIA 4XEIA 3ZETA 1GLDG 1BOTO 3DWLA 2QWNA 1U2VA 2OANA 3IDHA 1SAZA 1Y64A 3U4LA 5FPNA 4EAHD 2NZTA 1NM1A 5AQHA 4MO4A 2GUPA 1HJOA 3FZFA 2ZWHA 3QFUA 4BQLA 3WQUA 2FF3B 2I7NA 3H6EA 3QFPA 4F9OA 4FOIA 4H0YB 3D2FA 1ATNA 3VGLA 3D2EA 3UKRB 1E4GT 1RFQA 1ZBSA 4FOEA 4BRGA 4IJNA 2BTFA 3QBXA 3FZLA 2QWRA 2P9KA 1IG8A 1MA9B 3H3NO 3MN9A 2D0PA 3KVGA 1GLFO 1HPMA 5AQTA 1K8KA 5AZJB 3VEWA 3DXKB 1NGFA 1NBWA 2A42A 4H5RA 4FWQA 4QS7A 4BR4A 4I6MA 4BR0A 2IVPA 3UE5A 3TU5A 3GDQA 1GLEG 1QZ6A 4BRMA 4JD2B 3M1FA 1OKJA 1NGCA 4BGBA 4B9QA 5AQPA 4A2BA 4B1XB 2Q2RA 2CH6A 2EWSA 3GG4A 5JLFA 3O80A 4EFHA 3CJ9A 4M63C 4FWPA 2P9LB 4BRQA 4MLHA 3H3OB 4BVOA 2P9SA 4JN4A 3CJBA 1ZC6A 3BP8A 2WUSA 3EKSA 4BC2A 3CJ7A 3LDOA 3ZEUB 2PBDA 4FL9A 1BUPA 5KPRA 2A40A 4GY2B 5AQRA 1R59O 1MDUB 4NB4A 2V52B 4H5TA 4BRAA 4FWOA 5FPEA 4FWNA 4O8KA 1HLUA 1D4XA 3H1QA 2P9PB 1GLBG 2AP1A 3WXIA 4C23A 4H0VB 3WXKA 5BR9A 3CHWA 4BR7A 1NWKA 1S3XA 3BF3A 3CQXA 1GLLO 3VENA 1V4TA 3S41A 3FFKB 4LC9B 4BC3A 2QWQA 3UB5A 3O1BA 3FE1A 2YHXA 4MO5A 3WEEA 2YI1A 3P4IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YHQN 4CEZA 1JXEA 1IH7A 3SMPA 3AVJA 1VSKA 2GEMA 3SLCA 4IWVA 2FBTA 4GV9A 4BR5A 1TKXA 3AO2A 3CPEA 3W3DA 4KB0A 5GAHP 3SQ4A 5KQDA 4C8NA 1CLQA 4CEDA 3ZX0A 4K25A 1V4SA 4G1QA 2ZGYA 3RSEA 2FBXA 3K5NA 4N76A 4CZEA 5AQJA 4CFAA 1X9JA 4FJLA 1D8YA 4WYBA 2EX3A 4YFUA 3ALYA 2D4WA 4K42A 4HTLA 3VGKA 4JI7K 3EN9A 3DXMA 3VEXA 4CGDA 1JCEA 3VN5A 4NLCA 5JVHL 3TAMA 5TKYA 4DV0K 3VQCA 3QEWA 4DSEA 1J6ZA 3D2EB 4DV7K 1YITN 3EO3A 3HXMA 3KIOA 3EKUA 3OBYA 4CHYA 3CIPA 2GUIA 5BRHA 3HP6A 3RWUA 2HHVA 4DSKA 3OBWA 1A5XA 4PL8A 4IEEA 2BH1A 4FWSA 5GINA 3CFRA 2G8IA 4E89A 4M3RA 3P83D 4BWJA 4PY5A 1VSMA 2YNHA 3T1AA 1TK8A 2HHTA 4MFBA 4ELVA 4NO7A 4H0TB 4BRNA 3F9KA 3V81A 5M1KA 1C1CA 2G8HA 1N32K 3MX5A 5AZJA 1HUXA 3JS6A 4IXCA 5AFUH 2ASPA 3V1QA 1C0TA 3ZX3A 4AHVA 3K5MA 2AA4A 5A2QO 4YY3K 3FGUA 1UWBA 5DMRA 2HF3A 3CCJN 4CEOA 3L2WA 3NBPA 4OPAA 3F9MA 3SAGA 4JD2A 4JEPA 3ZT3A 5D3GA 4DCHA 1U6ZA 3HSTB 5MLCQ 4HUFA 4I2PA 2QM1A 2Y1IA 1RDUA 3NF9A 3KLHA 4DG1A 1T6DA 4A2AA 1SQKA 1XMQK 2Q1NA 3ZT1A 4AF1A 5BRFA 4ILJA 4FWKA 2UU9K 4AQYK 2ZD1A 5M1PA 2NUBA 1HNVA 4B8CA 4W5QA 1ZYQA 4MDBA 4KHYA 3H46O 3QEIA 3OYEA 3U9ZA 3SQ2A 3LANA 4DR4K 4FK4A 4Y1DA 5K14A 2G8VA 1P90A 4RG8A 3OW2M 5AQVA 4O44A 3AAQA 1KVBA 2WFBA 4W5OA 1YIJN 2NRTA 1Q82O 4Q0BA 1WB9A 4FSVA 4O4GA 3AGRA 5FROA 2VCPA 5BN8A 1VSHA 1R0AA 1G99A 4WF9L 1VQMN 2HMIA 1RT3A 2VGNA 4DWIA 5M1FA 3VQ6A 2QWMA 5KRSA 2DY4A 3QMLA 3O3HA 4CF1A 4H03B 1W0HA 3U9DA 4Z4CA 5CE3A 4EIAA 2Q3SA 2Z1JA 1NJZA 4PHTX 1HKBA 4RW9A 1QQMA 3VERA 4DQRA 3TAPA 1VQPN 5JMVA 3KK3A 4E1NA 4E7HA 1EETA 2O8BA 1TL1A 1DGKN 1IJJA 5AQUA 1S72N 3EYZA 3D0PA 1HRHA 4CGJA 4M3YA 4BDYA 3CCUN 3L2QA 1JKHA 3FZKA 3EZ5A 2X6NA 1XI1A 4JKGA 4PL7A 1C0GA 1TK5A 1NMDA 3C0BA 1X9SA 1L3SA 3O4NA 1TUYA 4HUGA 1WBBA 1EX4A 2W40A 4J2BA 4JAXA 3OHRA 3ZSVA 1N33K 4CJ5A 4R79A 4DU1A 1IG9A 1X3MA 2E88A 1K73O 4H0XB 5AQKA 3U3YA 1LV5A 2O4IA 4HVJA 3C6AA 5ADXA 3VEZA 4DQ8A 2FSNA 3O4WA 4BE0A 1WOQA 1RT7A 4FCYA 3KWGA 1NGEA 3EZWA 1NGGA 4DV6K 1GLCG 1I39A 2P9SB 1C1BA 4FWMA 1KSPA 2Q0UA 4DFMA 1TV6A 5AQXA 2B5JA 5CZ1A 5AQLA 3LM2A 4JNEA 2QKBA 4DHYA 4NCAA 2YHWA 1NK9A 2KQ2A 1JXBA 3NH0A 1HJRA 3R1XA 3NGYA 1ITGA 3PX6A 4KH5A 4BVPA 3L8BA 4CIGA 3U8XA 1Z6RA 1C6VA 2P51A 1H1VA 3THXA 1HNWK 2FXUA 3BF1A 1LWCA 4KBOA 1B92A 4DQQA 3WXLA 4CZFA 3RRGA 3D7EO 4FZZA 3MWTA 3WEEB 3HVRA 4CIFA 3TSQA 4DTMA 4ZHRA 4AHTA 1OVQA 2P9PA 3CQ8A 3LZJA 3QEPA 3C6HA 2Q97A 1XHZA 4OPJA 1EWRA 4GKJK 5HL7L 3CC7N 4B3RK 4ISFA 4NYNA 5AQFA 3T1YK 1XC3A 2XY7A 4CJLA 5GAGP 1VQ6N 4BRHA 4FLXA 2UUBK 2RKIA 3HRGA 4LSNA 3TPQA 2JWLA 1DEJA 4KHQA 4RW4A 1WSJA 5CHIA 2H3GX 4ILHA 5AQMA 4X64K 1Q9YA 3PY8A 4EP5A 3BUZB 2HSTA 5KPTA 2IIRA 1D5AA 3T69A 2IVNA 4CECA 4B9LA 4FWRA 2F8TA 4BG8A 1RT2A 1S9EA 4Z4IA 3TAEA 3LALA 4NLBA 1U2VA 2QWNA 1SAZA 3SQ1A 4JKGB 1YT3A 4X66K 2YX6A 1XNRK 4KV8A 2KFZA 3ID6A 1U48A 2RE2A 5JS1A 4BQLA 3QESA 2I7NA 4YHHK 3H6EA 4F9OA 4FOIA 3D2FA 3KK1A 4JRQA 4OLBA 2KKZA 1RTIA 1E4GT 4CFBA 1EO1A 2BTFA 1KD1O 3KLEA 4DMNA 1WSEA 1IG8A 3ZT4A 4CHZA 2B4JA 1JLBA 4LH4A 1GLFO 1HPMA 1ZBHA 3CYMA 2VQEK 1JJ2M 2QK9A 2D0CA 3DXKB 4JI2K 1NGFA 2WONA 3DOKA 1NBWA 2BE2A 3WNHA 3I55N 4H5RA 3ZSWA 4FWQA 3ZSOA 4BR0A 2IVPA 4B3SK 3GDQA 3VQBA 4U7BA 2GX9A 3PIPL 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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