2YI1A

Crystal structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetyl mannosamine 6-phosphate and adp.
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 106
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yi1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yi1A02
2GWJA 3I8BA 3VESA 1SAZA 3EO3A 4FPAA 4IZ9A 3ZX0A 1XUPO 1X3NA 3W3DA 4CBXA 2D0PA 3D2EB 1ZC6A 1IJJA 4H0OA 4A2BA 4BC2A 4BGBA 4BR7A 5EXWA 3SMSA 1Z05A 2ZGZA 5AQJA 1YVNA 1V4TA 3IFRA 3VEWA 4FWLA 1GLFO 1BWFO 1TYQA 2VCPA 3G25A 4LC9B 4BQZA 3SJHA 3GG4A 3U4LA 4FSVA 1KAYA 1YUWA 4CZEA 5AQHA 1GLEG 4XH4A 1U2VB 4IXCA 3VEVA 1BUPA 3VGLA 3VGKA 2ASMA 3CIPA 3FZFA 2CGJA 3LDPA 3MCPA 1K8KB 2ZGYA 4H5TA 4IO8A 1XQSC 3M3ZA 3QBWA 5AQMA 3A5MC 3LL3A 5EOYA 1D4XA 3D7EO 1C0GA 3D2FA 4H0TB 4EIAA 2YHXA 4CI6A 4BRHA 3R8EA 3M6GA 4BRGA 3AARA 5ELZA 4Y0WA 4CD3A 3EKSA 1NGJA 4M7YA 4CBUA 2P9SA 1KXPA 1E4FT 1SZ2A 3R9PA 1GLJO 3DXMA 2E88A 1HKCA 5AZIA 4IWVA 5KQ8A 2P9NB 1ESVA 5BPNA 3CI5A 2P9KB 3ULEB 4FWPA 4A61A 2AP1A 4IJNA 1ATRA 2FLOA 4M63C 3TU5A 4CZJA 3CHWA 5B8HA 1OKJA 1MWKA 4JNEA 4BG9A 4ISGA 1JCGA 2D1KA 3ZX2A 4K41A 3UKRA 5FPDA 3IMXA 3WXIA 1QHAA 2HF4A 1ZBSA 5AQGA 1LCUA 3VF6A 5BRDA 1X9JA 3ATUA 5AQWA 4BG8A 3HM8A 4H0VB 2QWNA 4FWQA 1ATNA 1H1VA 5AQVA 4BRCA 3FFKB 1GLCG 1YXQA 1NBWA 2Q1NA 2E2OA 3VF2A 5BPMA 4FOEA 4FWNA 3H46O 5AQOA 4FL9A 2V51B 4M7XA 4BRQA 4JHDA 1DKGD 1BDGA 1RFQA 4CZIA 5AZJA 5EX5A 2A3ZA 2HMPA 2YHYA 4CZHA 1JCEA 1NGAA 3ATVA 3CJCA 5F2RA 1BU6O 5I9EB 4GY2B 3DWLA 3O1BA 3MN5A 2I7NA 3DJCA 2V7YA 3H1VX 2BTFA 2E2NA 2P9UA 5E84A 3VF4A 2P9LB 4NB4A 2HOEA 4RCHA 4KBOA 2E8AA 3OHRA 5AQZA 3CJBA 3H3NO 2ZF5O 2EWSA 5AQSA 3WQTA 3CJ1A 4PL7A 2E2QA 4JD2A 2E2PA 4QS9A 4BR4A 4BRIA 5AQYA 1HKGA 3WXKA 3LDOA 4EFHA 1T6DA 3FGUA 4CD1A 5TKYA 3UE5A 5LJWA 3O4WA 2A6AA 4BRFA 4H5NA 1C0FA 4B1YB 4XEIA 1ATSA 5JLFA 2HF3A 5EVZA 3GL1A 3QFPA 2W41A 5AQPA 3O80A 2DPNA 1WUAA 4WYBA 1NGHA 4PKGA 3UKUB 4XH5A 1LOTB 3EN9A 2CGLA 3O8MA 1HKBA 1DGKN 4FWRA 4C23A 3FZMA 3KHYA 4BRNA 3UKRB 4BC4A 3B8AX 3HBTA 2BUPA 2GEMA 3S41A 4DB3A 4CJ7A 5LY3A 3AY9A 2P9IA 3ZETB 2YCHA 4ISEA 4JAXA 3FR0A 2PBDA 5BN8A 2YJEA 3ZEUA 1S3XA 3HTVA 4I6MB 3C7NA 4B1VA 4CZLA 5BR9A 1JCFA 2PAVA 3WXJA 2QM1A 1HUXA 3AAQA 5BREA 3R6MA 5KPRA 2YI1A 1SQKA 5CE3A 3DXKB 4BRPA 1NGEA 3GOIA 2P9PB 2V52B 3QMLA 3SK3A 4BRLA 1J6ZA 3HSCA 4H0PA 4MO5A 4DQ8A 3LDQA 3ENHA 4QS7A 1QQOA 4PL8A 3RSEB 1QQNA 1GLBG 1GLAG 3GE1A 1Y64A 1KAXA 3CJ7A 3D2EA 3MDQA 3DAWA 1QQMA 2FSNA 2CGKA 2NZTA 4RWTA 2NRHA 4MLEA 1Z6RA 4L3QA 3IDHA 3ENOA 4B1UB 4BRAA 4B1WB 3CETA 1S22A 3A5NC 2Q0UA 3VEOA 5AFUA 1NMDA 2UYTA 2Q31A 3A5OC 3M1FA 4ISFA 3CJAA 3VEYA 3IUCA 4HWIA 2IVPA 1E4GT 1U2VA 3GBTA 3MN6A 3QFUA 3CQYA 5JLHA 3BUZB 5E26A 2A40A 2VWBA 3HI0A 5F1XA 2KHOA 3L6QA 4A2AA 1K8KA 3EL2A 1TYQB 2Q36A 4HTLA 1MA9B 4F9OA 2ZWHA 3QB0A 4QS8A 2YHWA 3LM9A 4MLHA 5AQKA 4RTFD 5AQQA 2ASOA 3FE1A 5AQNA 4BVPA 4WQ4A 2QWPA 4BRKA 3TPQA 4BROA 5BN9A 4B1XB 2GUPA 4AM7A 3LDNA 3O08A 3VOVA 2FSJA 2CH5A 1GLLO 2FSKA 3CQXA 2E1ZA 1NGGA 2QWRA 4WQ5C 3FZHA 4CZKA 3A8YA 3ULEA 2P9KA 4FWOA 2A41A 1RGIA 3WUHA 5ADXA 3D2FB 3H45C 2QWQA 2I7PA 3WT0A 1DEJA 4DHYA 5AQLA 3F9MA 3H3OB 1MDUB 2E20A 1BO5O 1XC3A 2P9SB 4O5FA 4H0XB 1T44A 3DXMB 3H1QA 1QZ5A 5AZIB 1BA1A 1U6ZA 2FXUA 3VEZA 2ASPA 2VYPA 4O8KA 2IVOA 1GLDG 1HLUA 1BOTO 1HX1A 3SLCA 4FPBA 4BRMA 3KVGA 2GWKA 4MO4A 4FWMA 2IIRA 5LJVA 2H3GX 3VEXA 2QW9A 2CH6A 4K25A 2YJFA 4WQ5A 4XH1A 3WEEA 4CZFA 4AM6A 4A62A 5BPLA 5AQTA 1G99A 4Z94A 3L4IA 1KAZA 3EKUA 4FO0A 1NGIA 2IVNA 3BF1A 5AQXA 3VERA 1NWKA 4FWKA 4BC3A 5ADXH 3MMVA 3FZLA 1WOQA 5AQIA 3A0IX 3BF3A 4PKHA 2P9LA 4K43A 2GELA 1EQYA 2A42A 3VPZA 3MN7A 1CZAN 4JHDB 2AA4A 5EY4A 5AZJB 3CERA 4FWSA 3ID8A 5FPEA 1HPMA 2Q0RA 3KZBA 4BVOA 2V7ZA 3P4IA 2D0OA 3BP8A 3SMPA 1NLVA 2F9TA 3LDLA 3AAPA 4FOIA 3W0LA 2QWMA 3O5BA 3FLCO 2J4RA 3O1WA 4K42A 1Q18A 2P9UB 2WUSA 5KPTA 3JXUA 4B9QA 4BQLA 4CZGA 1NGCA 2GTDA 4BR2A 4BR5A 1RDWX 4WQ4C 5AR0A 3GDQA 1T6CA 3U9ZA 1QZ6A 4H5RA 4JD2B 1P8ZA 2NLXA 1TUYA 5FPNA 4J8FA 3UKUA 3A5LC 3EZWA 4BREA 4H5WA 4EAHD 3HZ6A 4E1JA 2QWOA 1R59O 4YDUC 1MWMA 1YAGA 1NGDA 3CJ9A 3VENA 3U9DA 3WXLA 5F0XA 3ZX3A 2F9WA 1IG8A 2FF3B 3ZETA 3UB5A 4BR9A 4BRDA 4GNIA 4PKIA 5FPMA 4BGAA 1NM1A 5AQUA 4CBWA 3H6EA 4EHTA 3QDKA 4I6MA 2D4WA 4NO7A 4H5VA 3L0QA 3QBXA 3O6WA 3WQUA 3BEXA 1ZXOA 3WEEB 4B1ZA 3FZKA 4BR0A 5JICA 3VGMA 3DXKA 4H0YB 2E1YA 2W40A 2P9IB 2Q2RA 4EHUA 2P9NA 5BRHA 2P9PA 5KPZA 5AQFA 3J8AA 3U8XA 4IJAA 3QICA 1X3MA 2ITMA 3LM2A 2QWLA 2QXLA 3RSEA 4YDUA 3ZEUB 3MN9A 5JMVA 2Q97A 2OANA 3C7NB 5AFUH 1BG3A 1V4SA 1TUUA 4CZMA 4DCHA 3C0BA 3MK6A 4JN4A 2A5XA 2FF6A 1NGBA 5KQDA 1BA0A 1NGFA 4H03B 3JS6A 5AQRA 3VETA 1HJOA 5BRFA 3I33A 4BC5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CXCM 3AO5A 1BCOA 3VQ5A 3CCVN 2ATQA 2EX3A 1RDBA 5I42A 3AVKA 5EXWA 1SKWA 3DRSA 3E01A 3VEWA 1WBBA 4DUZK 1WSEA 4DSKA 4BQZA 1I94K 1WAFA 1RT7A 1GOCA 4CZEA 3TAGA 3VTHA 3OYCA 4M3YA 3LZIA 3VEVA 1TL1A 1NG9A 1T7PA 3NF6A 2RKIA 3VGKA 4CJFA 1RBSA 1JLQA 2CGJA 3LDPA 3MCPA 1K8KB 4BWMA 1RDAA 5AQMA 4FZXC 3KLFA 1NOZA 3D2FA 2FC0A 4JKCA 4C8KA 4BRHA 1RT6A 3ULDA 4DF8A 1LWEA 1YT3A 4Y0WA 4CD3A 1NGJA 3HO1A 3ZCMA 2XY7A 1T05A 2E88A 3O4QA 1XC9A 1VRTA 3DRRA 2UXDK 3CF5L 1VQKN 1OKJA 1MWKA 4BG9A 4ISGA 3ZSQA 1WBDA 3SUOA 3AVBA 3VA3A 4K41A 4JKGB 4DSEA 1QHAA 2HF4A 4DFJA 1TKDA 4B3SK 4DR2K 3KWGA 4EZ6A 1N32K 1U47A 4C8OA 5AQVA 1O13A 4IEEA 4CJUA 1GLCG 1NBWA 4AH9A 5BPMA 4AHVA 4BE0A 1QSSA 2P5GA 4JI3K 4FL9A 3NFAA 1DKGD 4FK4A 5AZJA 4CFDA 3MAQA 3AA5X 3AVFA 4CZHA 1JCEA 3CJCA 1JLEA 3G6EN 3THVA 1SL2A 4YOVA 3WXMB 3Q7CA 4F4KA 2I7NA 1HNWK 2V7YA 2P9UA 5E84A 4LSNA 3OBYA 4M3TA 2FBVA 4KBOA 2A1SA 4B9LA 5KGXA 2O8EB 3L2VA 1YTUA 1S1UA 1FKPA 4ZHRA 4KPYA 4KH6A 2ZF5O 2EWSA 4RW9A 3CJ1A 3NAEA 3T1YK 4JD2A 1EKEA 4BRIA 3LDOA 1HQEA 1VAZA 3NH2A 5CHIA 2RN2A 4JI7K 3FGUA 4CW7B 4CD1A 4IBNA 3UE5A 1TK0A 4L8RB 3O4WA 5LMNK 5CYMA 3NF7A 2A6AA 4BRFA 4WFNL 1NU0A 3AV9A 1JLAA 4B1YB 4GVEA 4KI6A 1ATSA 2G8FA 2HF3A 5EVZA 4CERA 4NXMK 1NJXA 1RBRA 1RTJA 3O80A 4NCGA 4WYBA 1JL1A 4BACA 2CGLA 3EN9A 3SPYA 2GUIA 3M8RA 4FWRA 3FZMA 4BRNA 4BC4A 4U7BA 3B8AX 4DTSA 2BUPA 2GEMA 1Q82O 4Z0UA 4CJ7A 3TSQA 3QEIA 4JAXA 1EWQA 1NOYA 4KRFA 3BZKA 4M45A 3ZEUA 3HTVA 4HCCA 3WXJA 1S9GA 1KVBA 3R6MA 2YI1A 3OJSA 2P51A 4HHTA 3NDKA 3KLEA 1NKEA 1TAQA 3LPTA 1NGEA 1JL2A 4A59A 1N34K 2P9PB 3THWB 1C6VA 4BRLA 4O5BA 2OPPA 3VQEA 3HSCA 4H0PA 4ZTFA 1VSIA 4DQ8A 3SUQA 3LDQA 3C6HA 4B8CA 4JKBA 1P90A 2O4IA 4K8XA 1GLAG 2QKBA 3AVMA 4FVMA 1TKXA 4F2SA 3VTIA 3CCJN 3RMAA 4MLEA 4KO0A 3AVGA 3V9XA 3IDHA 4DFMA 4U67L 4DG1A 1S22A 3A5NC 4JI1K 3DLGA 4FLTA 3VEOA 2RF2A 3A5OC 4O55A 3IUCA 2YKMA 1U2VA 5SZTA 1VQ4N 1T3VA 4NYNA 1BGXT 3VQQA 1I39A 3HI0A 5F1XA 4LF9K 4DR5K 2KHOA 4A2AA 4CF2A 3TANA 4KREA 2YHWA 3LM9A 4KHSA 5AQKA 5AQNA 4WQ4A 3EYZA 4DQIA 2PYLA 3CC4N 3SAFA 4BROA 4FVUA 3NHGA 4B1XB 3AVLA 5AJ3K 4H8KA 1XHZA 4BE1A 3O08A 4CHZA 2FBYA 2G8VA 2CH5A 1C1BA 4MDBA 5GADP 1RT2A 1WSGA 2P9KA 4FWOA 2QXFA 3M5RA 2FBXA 3WUHA 4FJHA 3OYMA 2QWQA 2HHWA 3TTFA 2I7PA 4BE2A 5AQLA 4O0IA 1WAJA 4LFCK 1XC3A 3L4QA 3O3FA 4BDZA 4KTQA 3MEDA 3H1QA 1QZ5A 3SBTA 2W6KA 2ASPA 4DV3K 2IVOA 4HUFA 4FJ5A 1D5AA 4FJNA 4FPBA 4BRMA 3KVGA 3CD6N 3QIOA 4CGHA 3IS9A 3SCXA 4C8NA 4E1MA 4CEBA 2BDPA 1WSHA 1G99A 1N33K 3L4IA 4FJ9A 1IG9A 2Z1HA 2KKZA 3BF1A 4N76A 1M90O 3OYLA 3N4PA 3C6TA 4DSIA 2VG6A 4CEDA 3FZLA 4E19A 5AQIA 2GELA 1EQYA 2ZM6K 1S6PA 3MN7A 4DR1K 2O8BA 1BI4B 1T8EA 5FPEA 2ZJQL 1NJWA 2XRIA 1HPMA 3E66A 3DLRA 4QCLA 1WSFA 5GAGP 4DTXA 2UUCK 3BP8A 4A5BA 1OH5A 2YNIA 3HOSA 3LDLA 1RBUA 4B9UA 3AAPA 4FOIA 4KHYA 2DFHA 4OGCA 1Q18A 3AGRA 2WUSA 4M3UA 4JLHA 4B9QA 1GOBA 4CZGA 2HBLA 2NNWA 5M1KA 1NGCA 4BR5A 4WQ4C 5AR0A 3GDQA 1T6CA 3AVIA 2ZJRL 1BQNA 1QZ6A 3DM2A 3P38A 4CIFA 4C8MA 3AVCA 1IH7A 1SL1A 3SPZA 4OKKA 4EP5A 4EAHD 1X9WA 2Q3SA 4B9MA 2EHGA 3OS1A 5I3UA 5F0XA 3NGIA 5HL7L 2A1RA 4YOUA 2RE2A 1C0UA 3EEQA 3KD1E 3T1HK 1NK6A 1L5UA 3IKMA 4KFBA 2IS3A 5AQUA 4CBWA 3KK1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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