2YI1A

Crystal structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetyl mannosamine 6-phosphate and adp.
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 106
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yi1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yi1A02
1IJJA 1KAZA 3VPZA 4H5RA 4BGBA 2HF4A 1BA0A 1KAYA 4BC3A 4CBWA 2EWSA 5AQSA 1V4TA 2E2PA 3C7NA 2PBDA 3H1QA 5AQKA 4BREA 4BR9A 3EO3A 2ASPA 1E4FT 1IG8A 1T44A 1NGDA 1TUUA 1NLVA 2E8AA 4BC2A 4BRQA 1GLLO 4CZKA 3H46O 1NGCA 3GDQA 5AQMA 4BR7A 2HMPA 3BF1A 4B1YB 4QS8A 3CJ9A 3ATVA 3QDKA 4BRGA 3HI0A 3HZ6A 2VYPA 5F0XA 4ISFA 5LY3A 2YHWA 3ZETB 1KXPA 1LCUA 1G99A 5AQJA 4XH1A 5KPZA 2FSNA 5BN9A 2P9LB 2QWLA 2D0PA 4IXCA 3WEEA 3WT0A 3AAQA 1BUPA 2A5XA 3IDHA 1SZ2A 3UKUA 5JLHA 4MLHA 2D1KA 3AY9A 3AAPA 3M1FA 2Q0UA 2F9TA 4DB3A 3SK3A 4KBOA 1TYQB 4JD2A 4DCHA 5ELZA 2GWKA 2ITMA 1MWKA 4CD3A 4CZEA 2P9KA 1WOQA 5ADXH 5FPMA 5FPEA 5AQNA 3AARA 2IVNA 3LDQA 1NMDA 4LC9B 3ZX0A 2P9PA 4FWLA 3I33A 2V7YA 5AQTA 5BRHA 4H0OA 1Z05A 4NO7A 3RSEB 4FO0A 1NGBA 4CJ7A 4F9OA 2E2NA 3DXMB 3SLCA 2QWRA 4JN4A 3JS6A 1HX1A 5E84A 4CD1A 4H5WA 4PL8A 1ESVA 4CBUA 3BF3A 2ASOA 4FWRA 3U4LA 3LDPA 3U9DA 4A2BA 3ATUA 1V4SA 2F9WA 3C7NB 4FSVA 2A6AA 5I9EB 1NM1A 4BRNA 5AZJA 1MWMA 3VEZA 4B1UB 5AQYA 2GWJA 3IFRA 2UYTA 1XQSC 2YJEA 3D2EA 4CZHA 1DGKN 3KVGA 3MN5A 3M3ZA 4I6MA 1ATRA 3EKUA 2CGJA 4FWOA 3U9ZA 4B1WB 5AZIA 2P9LA 5KPTA 4AM6A 3FR0A 2QM1A 3H1VX 3FZMA 4IWVA 5AFUA 4H03B 3GBTA 5BR9A 1XUPO 4NB4A 4O8KA 1U2VA 4RWTA 5B8HA 3WEEB 3A5OC 1DEJA 5AQHA 3UKUB 1E4GT 3CJ1A 1S3XA 4O5FA 1QQOA 1XC3A 4CZGA 1BO5O 4QS9A 4JD2B 3A5NC 4BR5A 2DPNA 1H1VA 3CJAA 3DXMA 4J8FA 2GUPA 1TUYA 1BU6O 2E2QA 3CETA 4FWKA 4IZ9A 3HM8A 3GL1A 2AA4A 3MMVA 1GLJO 4IO8A 3VEYA 3H6EA 4H5TA 2VCPA 3LM2A 3VF4A 2CH5A 1JCFA 2P9PB 4BRAA 3FZFA 5JLFA 4RCHA 2IVPA 5BN8A 3BP8A 3H45C 3QFPA 2FF3B 4IJAA 3O08A 3FZHA 1U6ZA 3F9MA 2A40A 3H3NO 3VEXA 4BRDA 3QICA 2BTFA 4FL9A 4K43A 5AZJB 2VWBA 3VF6A 3KZBA 2P9SA 1C0FA 4H0XB 2FF6A 3GOIA 3D2EB 2V52B 1D4XA 3R6MA 3L4IA 4K42A 3VETA 1GLCG 4I6MB 4C23A 2D0OA 3GG4A 1SQKA 2V7ZA 3WQTA 3LDNA 5ADXA 2GEMA 4CZIA 5AZIB 4EFHA 1Y64A 1NGIA 5AQXA 2FSJA 3GE1A 3R9PA 2D4WA 3CQXA 1NGHA 4M63C 4EHTA 2P9NA 4XH4A 1CZAN 3BUZB 5EOYA 5FPNA 4DHYA 3P4IA 1BA1A 3VF2A 4DQ8A 5KQDA 3ID8A 3CHWA 1T6DA 3WXKA 1HPMA 1MA9B 1U2VB 5EVZA 4MO5A 4B1XB 5JICA 2YHXA 3VEOA 5EY4A 4A62A 4FPBA 3WQUA 3O5BA 3QBWA 5BRFA 2FXUA 4CZFA 1GLEG 2E1YA 3UB5A 5AQIA 2GELA 4BC5A 2QWMA 1GLDG 3DWLA 3J8AA 4GY2B 4XEIA 3ULEA 5AQWA 4BR0A 1EQYA 1S22A 4FWPA 4EIAA 1QQNA 2P9IA 3FZLA 1ZC6A 3VOVA 3O4WA 2QXLA 3ZEUA 2A3ZA 3CJCA 3HTVA 2WUSA 4H0PA 4BQZA 4HWIA 3S41A 1QHAA 3SJHA 5KPRA 2HF3A 1NGFA 3U8XA 2H3GX 3VESA 2IIRA 4FOEA 4H5VA 4B1VA 4CZMA 1BOTO 3VENA 2AP1A 1NWKA 2PAVA 3CJBA 5F1XA 3EN9A 3WXIA 5F2RA 2QWNA 3MN7A 4FOIA 2P9SB 3EZWA 4H0YB 2YI1A 5AQVA 5CE3A 1HKBA 2A41A 2QWOA 4PL7A 4BVOA 1RFQA 5AQLA 2W40A 3W0LA 4CBXA 4FPAA 4L3QA 4BG8A 2I7PA 1ZBSA 3CJ7A 4BQLA 2P9NB 1ZXOA 3A0IX 1K8KA 3FFKB 3ENOA 4B9QA 4WQ4C 2CGLA 2E1ZA 3IUCA 4BRFA 2YJFA 1ATNA 1GLFO 1X3NA 3ZX3A 2CH6A 4K41A 3UE5A 3WUHA 1NGAA 1KAXA 3C0BA 1RGIA 4IJNA 4E1JA 4JAXA 2KHOA 3ULEB 3D2FA 2Q2RA 2Q97A 4BRCA 1BWFO 3D7EO 2QWQA 3LM9A 4BRKA 2P9IB 3TPQA 3R8EA 3ZEUB 5BPNA 4Z94A 3DJCA 4JHDA 1JCEA 3ZX2A 2W41A 1RDWX 2ZWHA 3O1BA 1GLAG 4BVPA 3M6GA 2Q1NA 4XH5A 3DXKA 3O6WA 5EXWA 2YHYA 3A5LC 3O80A 5AQPA 5E26A 3UKRA 3SMSA 4MO4A 1YXQA 4ISGA 5AQGA 3MK6A 3W3DA 2A42A 1WUAA 5BREA 5JMVA 2IVOA 4A61A 4WQ4A 3EL2A 4FWQA 3HSCA 4YDUC 2P9UA 4BRMA 1X9JA 3VGLA 2CGKA 3WXLA 4BC4A 4WQ5C 1BDGA 2J4RA 3IMXA 1HKGA 3FZKA 4PKGA 5BPLA 1OKJA 3O8MA 5AQUA 1K8KB 3CQYA 2ZGZA 1NGGA 2Q36A 2GTDA 5BPMA 1HUXA 3MN6A 3G25A 4MLEA 2ZGYA 1GLBG 4A2AA 3ENHA 2NZTA 3LL3A 3DAWA 3QFUA 3CIPA 1P8ZA 1QQMA 4H5NA 4QS7A 3B8AX 1YAGA 2Q31A 4FWNA 3SMPA 3A5MC 3A8YA 5AQQA 2OANA 5AQFA 4K25A 3TU5A 3JXUA 2E88A 4B1ZA 3D2FB 3L0QA 1JCGA 3KHYA 5LJVA 2BUPA 1T6CA 3QB0A 3VEWA 1SAZA 4CI6A 2FSKA 4JHDB 4YDUA 4M7YA 4BG9A 3HBTA 4CZLA 1J6ZA 1NBWA 1QZ6A 4M7XA 4PKHA 4BRLA 5LJWA 1DKGD 5EX5A 3L6QA 3DXKB 4WQ5A 5KQ8A 3LDLA 4CZJA 5BRDA 3UKRB 1Q18A 3QMLA 2YCHA 1YVNA 1X3MA 3H3OB 3O1WA 4EHUA 3VEVA 2ASMA 1C0GA 4BR4A 2HOEA 4JNEA 3ZETA 4WYBA 3FLCO 1HKCA 3VERA 2V51B 4BR2A 1ATSA 3BEXA 5FPDA 3OHRA 2P9UB 1HJOA 5AR0A 4HTLA 4FWSA 4ISEA 3VGKA 4Y0WA 3FE1A 3FGUA 5AQRA 4BROA 4RTFD 4BRPA 2FLOA 3MCPA 4BRIA 5AQOA 3VGMA 1Z6RA 1MDUB 1NGEA 3MDQA 4FWMA 4GNIA 1TYQA 4H0VB 3EKSA 3WXJA 4AM7A 1HLUA 1BG3A 2E2OA 1LOTB 3LDOA 5TKYA 1QZ5A 2Q0RA 2QW9A 4H0TB 4PKIA 1YUWA 4BRHA 3I8BA 2NLXA 1R59O 2ZF5O 5AFUH 3QBXA 3MN9A 3CERA 4EAHD 3CI5A 2NRHA 3RSEA 1NGJA 5AQZA 2I7NA 2P9KB 2E20A 4BGAA 2QWPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TI0A 1LAWA 1KAZA 4KI4A 5C25A 3SAFA 2B6AA 3OS1A 2HBLA 2HF4A 3KLHA 3DLGA 3O3GA 4CECA 3AVHA 3O4NA 3KKRA 1VQ7N 3H1QA 4BREA 1HQEA 3V6DA 2HBMA 3K59A 1TUUA 3CPEA 3AO3A 3PX0A 5C10A 1FK9A 3H46O 2HBJA 1NOYA 4DU1A 4QS8A 4HHTA 3QDKA 1TVRA 1IBLK 1HNXK 4OKJA 3L3UA 4K8ZA 1LCUA 1WAFA 3CC7N 2QWLA 3FFIA 4IXCA 4ILGB 4CE9A 3WEEA 1L5UA 2GX9A 1BUPA 3V1RA 1K73O 3UKUA 3VQBA 5KTQA 4CFAA 2HHTA 1IKWA 3MXIA 3SK3A 4HUEA 1KCFA 4JD2A 4DCHA 2P51A 3R1XA 1L3SA 1WOQA 3AVJA 4BY9C 5AQNA 2IVNA 1YF5L 3NGYA 3AVKA 3ZX0A 2O8FB 4FWLA 1J5EK 4NO7A 4FO0A 4CJ7A 4E19A 2D0CA 3SLCA 4DG1A 4CF1A 2QKKA 5E84A 3WNHA 3SV4A 4RG8A 2KZMA 4CBUA 3BF3A 3U4LA 3C6UA 3U9DA 1VQMN 2FBXA 4X66K 2B4JA 1NKCA 1NM1A 4BRNA 4H4OA 4EP4A 3LALA 2YHBA 5AQYA 4BDYA 2YJEA 3CCUN 1JLQA 3F5TA 4CZHA 2Q3SA 3M3ZA 1BL3A 4PUOA 2VG6A 2P9LA 3SBGA 1KLNA 4IFYA 4JKDA 2RPIA 4GVEA 5AFUA 1HYSA 1VQKN 1RT4A 1W0HA 3U6FA 3K0SA 4JKAA 5D3GA 3DRSA 4JI2K 4CHPA 3MAQA 3M8SA 2QEXN 1NJWA 3VQPA 3QEIA 3K9JA 2NRWA 4CZGA 1TKZA 3HPOA 2O4IA 1VQON 1S1VA 4YOTA 2KFNA 3DXMA 2GUPA 3K5MA 2E2QA 1RTDA 2ATQA 1Z25A 3HM8A 4OGCA 2OZSA 2AA4A 2HNYA 4IO8A 3H6EA 3AA5X 3LM2A 4FJMA 2P9PB 4CJ3A 3FZFA 4CFDA 5JLFA 3H45C 2FF3B 1I3AA 2KZZA 3O08A 4HUGA 3AA3A 3CMEN 3P1GA 3TAFA 1HR0K 3NCIA 2YNGA 1RTJA 5DK5A 3KJVA 3TARA 4BRDA 4N41A 4XIUA 5IWAK 3SQ1A 3AVAA 4CIGA 3MXMA 3IKMA 3VF6A 3KZBA 2P9SA 3V9ZA 1C0FA 4K42A 3GOIA 2V52B 5AJ3K 4I6MB 4CHOA 3E9LA 3LDNA 3DLRA 4QAGA 1VSHA 3OY9A 5DMRA 3CQXA 1TKXA 3HXMA 2O8CB 4I2PA 4C8LA 1RT5A 3BUZB 5KRTA 1BA1A 5KQDA 3CHWA 1T6DA 4AHCA 1HPMA 1BI4A 4BWJA 1U4BA 4DV5K 1TAUA 3VEOA 4ID5A 5EY4A 4A62A 3DI6A 1VSMA 1SV5A 3N4QA 2GELA 3CCRN 4GY2B 3ZSOA 3ULEA 5AQWA 4BDZA 2ZM6K 3E1YA 1W97L 3FZLA 3CJCA 4JI3K 3JSMA 3SQ0A 3S41A 3S3OA 2FBYA 2QI2A 4LY7A 3PO4A 4DSJA 2HF3A 3LP0A 4UQGA 2H3GX 4WF9L 2IIRA 4FOEA 4H5VA 2DY4A 4B1VA 4CZMA 1BOTO 1BCOA 1SKSA 4DR7K 1WN7A 2P1JA 4X64K 4CJTA 3SPZA 3QNNA 1IKVA 3MN7A 3I0SA 2ZJQL 3V1OA 2YI1A 4JS4A 2BGGA 5IT9O 1T3VA 5AQLA 3NFAA 4FPAA 2HHXA 2O8DA 4MQ3A 3ZSWA 4HUFA 1ZBSA 1Q82O 5K14A 1ZXOA 3A0IX 1K8KA 4C8KA 3ENOA 2KKZA 4BRFA 4KPYA 1Q8IA 2Z1IA 2YJFA 2YKNA 4K8XA 3O4QA 4A5BA 5HRPA 1X3NA 4JEPA 3ZX3A 3VMFB 3NF8A 4JKGB 4IOXA 3AO5A 2OCEA 3WUHA 1KAXA 5GAHP 3C0BA 4DV6K 4B9UA 2RHKA 2KQ2A 5KRSA 3L4QA 2WONA 3R3LA 2IS3A 3ZYYX 4YOVA 4DR4K 4DFKA 1YI2N 3NH0A 1BWFO 1JLBA 1S5JA 1ASWA 2P9IB 5HL7L 4GKKK 3L2WA 3Q7BA 1U49A 2W42A 3DJCA 1RCHA 5C2FA 1D9FA 1JCEA 1JL1A 3ZX2A 3NAEA 2X78A 4AILC 1RDWX 3O1BA 4CESA 3LAMA 2OPRA 3DMJA 3DXKA 3RR7A 3O80A 3NF6A 3O3FA 3OYHA 5E26A 3UKRA 3SMSA 1YITN 5HP1A 4W5QA 5AQGA 3IG1A 5BREA 4OLAA 3EL2A 1WSGA 2OPQA 5E41A 3O3HA 4Z4CA 1JL2A 3BZKA 1UAXA 1A5XA 4BC4A 4FJNA 3V81A 3TR8A 4CJQA 5M1KA 2J4RA 3IMXA 2G8KA 4PKGA 4DMNA 5AQUA 3AVCA 1VSIA 3CQYA 1XHZA 4E89A 3HP6A 2GTDA 4EZ9A 3ID6A 3MN6A 4KB0A 3G25A 3HVTA 4ID1A 2ZGYA 1GLBG 1LW2A 3U3GA 2NZTA 3TTCA 3LL3A 3DOLA 3OYJA 4JI8K 1P8ZA 1QQMA 4KH5A 4QS7A 3B8AX 4LFBK 2E6MA 3TAQA 2WBNA 3PV8A 1YAGA 4F3OA 1T8EA 3VQEA 1N32K 4WE1A 5AQQA 1HPZA 2OANA 4CEBA 3DLBA 4IKFA 1ITGA 3LP2A 3TU5A 3DM2A 3I55N 3D2FB 3TTDA 1JCGA 2E5LK 1XI1A 5LJVA 3OVNA 3NDKA 4B9MA 5FLXO 1CZ9A 2BH1A 4JHDB 4B3RK 4M7YA 1RDDA 4CK3A 4IO9L 1X9WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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