2YI1A

Crystal structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetyl mannosamine 6-phosphate and adp.
Total Genus 106

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
5010015020025030030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
total genus 106
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yi1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yi1A02
3O6WA 4BRFA 4ISFA 2P9IA 5BRHA 1T6DA 1T6CA 4FOIA 1NWKA 3DXMB 3UE5A 4CZKA 3H1VX 3FR0A 2ITMA 5AZIA 3BEXA 3H1QA 3WEEA 2A42A 4WYBA 2D0OA 2ASOA 1QQOA 5AQGA 4NO7A 3WT0A 1D4XA 3ID8A 4B1WB 1K8KB 5AQLA 1GLAG 3VEWA 4AM7A 4L3QA 4BG8A 4FWQA 5AQHA 4BR4A 3U4LA 3GE1A 2F9WA 1NGBA 2Q31A 1BG3A 2P9LB 3H46O 3AAPA 3H45C 4H0OA 2P9UB 5EY4A 3WQTA 4FWKA 1NGGA 3VGLA 2AP1A 1KAXA 5AQKA 4FWLA 3KVGA 3ZETB 3KZBA 4HTLA 2Q0RA 4EFHA 1YXQA 1ATSA 4BC4A 5KPZA 3FZFA 2P9LA 5EXWA 5AZJB 3WXIA 3M6GA 2DPNA 1BU6O 2P9KB 2FXUA 2P9UA 1MDUB 1NBWA 4YDUA 4DB3A 4CBWA 3TU5A 2HOEA 5EVZA 5AQFA 1NGCA 4DQ8A 1GLDG 1X3MA 3M1FA 3ZETA 2E2OA 5KPRA 1HKCA 5BRDA 3QBWA 4BREA 2E1ZA 3MMVA 4I6MA 3QICA 3GDQA 3ATUA 4B1UB 2P9KA 5AQOA 1XQSC 3EO3A 3ULEB 4EHUA 5AQIA 2V51B 4BR5A 3R9PA 2HF3A 2E2NA 2CGJA 1BOTO 1MWMA 4JHDB 5FPNA 4K41A 4JN4A 3QFPA 4LC9B 1V4SA 3F9MA 3O80A 2HF4A 3A0IX 5KQDA 3UKRA 4PKHA 4PKGA 3IMXA 2BTFA 5BR9A 5AQNA 2Q0UA 2I7PA 3MN7A 2YHYA 5LJWA 3VENA 4BRHA 3A5MC 5LY3A 4WQ5A 3H3NO 5LJVA 4M7XA 4FWOA 1X3NA 4BRPA 4Y0WA 4O8KA 4BC2A 2D4WA 4FPBA 4JHDA 1HKGA 3UKUA 2I7NA 2QWMA 5AQPA 3ZX3A 2A6AA 4F9OA 3VEOA 3IUCA 2QM1A 5AQSA 4BR7A 3H3OB 2HMPA 3CETA 3OHRA 1NMDA 2NLXA 3D2FB 1NLVA 2PAVA 3DAWA 1U2VA 3AAQA 1MA9B 4K43A 5AR0A 1YAGA 1ZXOA 1ZC6A 2AA4A 3EL2A 4BQLA 5FPEA 4O5FA 1BUPA 4BR2A 4YDUC 2YHWA 3FZMA 4E1JA 3W3DA 3FLCO 2IVNA 4CBUA 2E20A 3R6MA 1NGDA 2P9NA 3FZLA 5AFUH 3B8AX 4KBOA 3CJ7A 3CJ1A 4WQ4C 3VEYA 1TUUA 1IG8A 2VCPA 3I8BA 2IVOA 4H03B 5AQUA 3W0LA 3SK3A 5ADXH 3DXMA 1BA0A 3O8MA 3CJ9A 2V52B 4QS8A 1NGIA 3L0QA 3JS6A 5KQ8A 2P9SB 2QWLA 4EIAA 3BF1A 3U9ZA 1ATRA 3U9DA 5F0XA 3O08A 5AQYA 3UB5A 4CZJA 4BVPA 4RWTA 4GY2B 3ZX0A 1Q18A 3VEZA 3O5BA 3ZEUB 3L6QA 4H0XB 1K8KA 5AQMA 2FF3B 4K42A 1T44A 2Q2RA 3M3ZA 4CZFA 2YJEA 1HX1A 4HWIA 3VF2A 4QS7A 5AQRA 4C23A 4H0TB 5EOYA 1SZ2A 3HZ6A 5E26A 1RGIA 3DJCA 3VF6A 2Q36A 1JCGA 3DWLA 1S3XA 2VWBA 3CJAA 1OKJA 5ELZA 1J6ZA 5JLFA 2H3GX 1HJOA 4IXCA 3VETA 3VEVA 4CBXA 3GL1A 3HTVA 2OANA 2E2PA 3TPQA 1TYQB 4DCHA 4H5RA 3SJHA 3GG4A 4K25A 1BA1A 3C7NB 2FSKA 4FOEA 3R8EA 4BC5A 5AZJA 1GLBG 5AQQA 4CZLA 1BWFO 2J4RA 3EKUA 3ATVA 4BROA 2NZTA 3ENHA 4JNEA 5AQVA 4BRIA 5F2RA 3ENOA 1E4FT 1X9JA 2BUPA 4FWRA 1EQYA 4IJAA 4BGAA 1JCFA 2GUPA 1TYQA 1G99A 2WUSA 4B1YB 4B1VA 2GWKA 4A2BA 3C7NA 3VGMA 1LCUA 2PBDA 2CH5A 3G25A 5BPNA 3BUZB 3CI5A 3RSEB 4BC3A 5JMVA 3ULEA 4B1ZA 5JLHA 4H5VA 1QQNA 5BRFA 4BRQA 3I33A 3S41A 3MN6A 1DGKN 1GLEG 3FZHA 2A41A 3LDPA 3D2EB 5BN8A 4H0VB 4A2AA 1DEJA 3O1WA 3WUHA 5F1XA 4CJ7A 5BREA 2ASPA 2CGLA 2YCHA 2IIRA 4RCHA 3RSEA 3FZKA 1BO5O 4M63C 4CZHA 2D1KA 3GOIA 2UYTA 3D7EO 2IVPA 3MN9A 4CZGA 3LL3A 5EX5A 3VGKA 5BPMA 3FGUA 5JICA 1GLCG 2P9PB 2QWOA 3CHWA 4PL7A 3MDQA 4PL8A 4CD1A 3CERA 2W40A 3EN9A 3WEEB 3HBTA 3KHYA 2V7YA 4FL9A 2ASMA 1BDGA 2FSNA 2CH6A 1XC3A 4CZEA 3MCPA 2CGKA 1P8ZA 3J8AA 3QDKA 3CIPA 5AQTA 1Z6RA 3D2FA 3WXKA 3WQUA 3SLCA 4MO5A 4BGBA 4FSVA 4B9QA 3CJBA 4BRKA 3IFRA 2P9PA 3VEXA 1GLLO 4FWSA 1GLJO 4B1XB 4BQZA 2A3ZA 5FPMA 2QWQA 3EZWA 2V7ZA 4CZMA 2W41A 4A61A 3BF3A 5BN9A 3WXLA 1HLUA 5CE3A 4BRLA 3VESA 2ZGZA 3QFUA 3FFKB 5AFUA 2E88A 1C0GA 2Q97A 1YUWA 3ZX2A 4Z94A 3SMPA 2P9SA 4AM6A 4CD3A 1KAZA 2F9TA 4MLHA 5ADXA 3WXJA 2ZWHA 5TKYA 1NGFA 1R59O 1RDWX 4H5TA 3U8XA 4WQ5C 3DXKB 4JD2B 4CI6A 2QW9A 3ZEUA 1HPMA 4BRGA 1NGAA 4H5NA 1ESVA 2YJFA 3L4IA 4J8FA 2VYPA 3LDOA 1C0FA 3QMLA 3A8YA 5FPDA 1E4GT 3CQXA 5AQJA 1S22A 3A5OC 3MN5A 2ZGYA 3GBTA 4H0PA 4I6MB 4XEIA 4BRNA 4BR0A 3LM9A 1RFQA 1NM1A 3H6EA 5AQWA 1IJJA 4RTFD 2ZF5O 3QB0A 4MLEA 4EAHD 1ATNA 3DXKA 4JD2A 4ISEA 1HUXA 2KHOA 3JXUA 2D0PA 3LDLA 1SQKA 2EWSA 3SMSA 1ZBSA 1LOTB 2FLOA 2GELA 3LDNA 4QS9A 2QXLA 3VF4A 1JCEA 1CZAN 4FPAA 1YVNA 2Q1NA 4FO0A 3FE1A 4H5WA 4M7YA 1SAZA 3VOVA 5I9EB 4WQ4A 3HI0A 5KPTA 4BR9A 3O1BA 4XH5A 4NB4A 3UKRB 1QQMA 2QWPA 1V4TA 2GTDA 2E2QA 2QWNA 4JAXA 4DHYA 3AARA 4BG9A 4XH1A 3IDHA 1XUPO 4XH4A 1QZ5A 4MO4A 1QHAA 2FF6A 3MK6A 3CJCA 2YI1A 1Z05A 1NGHA 1Y64A 1WUAA 4FWNA 3A5LC 5BPLA 5AQZA 3UKUB 4BRDA 1HKBA 4PKIA 4IO8A 1TUYA 3QBXA 3O4WA 2QWRA 4CZIA 2GWJA 4BRMA 5B8HA 4A62A 4IJNA 4H0YB 5E84A 1KAYA 1GLFO 3HSCA 1U6ZA 1KXPA 4BRAA 3BP8A 3LDQA 1NGJA 1QZ6A 1DKGD 1NGEA 2P9IB 2YHXA 1U2VB 2A40A 4IZ9A 3LM2A 3HM8A 2NRHA 2FSJA 2E1YA 2GEMA 3AY9A 1MWKA 3D2EA 5AZIB 3VERA 5AQXA 3EKSA 4FWMA 2A5XA 2E8AA 4EHTA 3C0BA 3VPZA 4FWPA 4BVOA 4GNIA 3P4IA 4IWVA 1WOQA 2P9NB 3CQYA 1H1VA 4BRCA 3A5NC 4ISGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OPPA 2PY5A 3O9RA 4DTMA 4JI1K 2P9IA 1E3MA 4FOIA 1U48A 2OPSA 3BEXA 5CZ1A 2B6AA 4CEDA 2A42A 5KGXA 2QI2A 5AQGA 4JV5K 4NO7A 3ID8A 3TTFA 4CFAA 2HNDA 2NRXA 5AQLA 4L3QA 2GV9A 1L3UA 4FWQA 3EY1A 1BL3A 2Q31A 1WBDA 4LF8K 3ZSXA 1TGOA 3AAPA 4H0OA 3ZSQA 4RW8A 4FLTA 1W9HA 1EP4A 3Q7CA 3P31A 1QHTA 2HHTA 3KVGA 4KTWA 1YIJN 4FJ7A 5LMNK 2ZJPL 3SQ0A 1ATSA 5KPZA 1N6QA 4AH9A 4Z4GA 2P9LA 4ELVA 2ITGA 2DPNA 5I3UA 1WB9A 2P9KB 2F4VK 1NBWA 5FRNA 3WXMB 3MX2A 4CF8A 4BDPA 3O3GA 5KRSA 5EVZA 1GLDG 4FW2A 3ZETA 4OPJA 1KLMA 5KPRA 4DV1K 5BRDA 3DMJA 4WFBL 3MMVA 4I6MA 4CHYA 4YOVA 3ID6A 1BIUA 2ZM6K 1XNQK 1TV6A 4H4MA 3EO3A 3ULEB 2O8DA 5AQIA 2KZMA 2OTLN 4BR5A 4B9MA 3CF5L 1IBKK 1RTHA 4DLGA 1MWMA 5C2DA 4JN4A 3QFPA 1V4SA 3F9MA 3O80A 4R79A 5KQDA 4E7JA 3KTQA 1RT6A 1WN7A 3NGYA 5CYMA 4DR5K 1SKRA 3C6UA 5J2NA 2BTFA 5AQNA 3D0PA 1A5XA 3MN7A 1NJWA 4F2SA 5LJWA 3VQPA 3A5MC 3V9UA 3OW2M 4U7BA 3THWA 1IO2A 4Y0WA 4BC2A 4BACA 5AQPA 4LFAK 4DSIA 1C1CA 5EU7A 4QOZB 4NYFA 4DV6K 4CJFA 4FLUA 3V9XA 4BR7A 4DU1A 3H3OB 2HMPA 1Z25A 3CCMN 3OHRA 2HBKA 3OBYA 3TAGA 4BQLA 5FPEA 1ZXOA 1HJRA 4CEEA 4O5FA 1HQEA 3RRHA 4CK1A 1VAZA 4B9UA 4LFBK 1HNXK 1RCHA 4DTSA 3CCQN 3TSUA 4ZTJA 4Z4FA 2O8EB 4CGFA 1NGDA 1EXQA 2P9NA 1EWQA 1KVCA 3WNGA 3CCUN 1XMQK 2VCPA 3I8BA 3S3OA 4YOTA 2RPIA 3DXMA 1BA0A 3LP2A 4DV5K 3CJ9A 1J53A 1NGIA 3JS6A 2QWLA 1IH7A 4EIAA 3BF1A 2D0BA 3U3GA 4KTQA 2G8UA 5AQYA 2NRRA 3MAQA 4RWTA 4KB1A 3E1YA 1WSJA 3O5BA 3CMEN 3L6QA 3JAMO 4H0XB 1K8KA 4K42A 2O8CA 1T44A 3SUNA 1ZYQA 3M3ZA 3HM9A 4CZFA 4HWIA 3NF7A 3DOKA 4AILC 4C1NK 3HP9A 4QS7A 1VSJA 1NJIO 3RMDA 3HZ6A 5E26A 4AHUA 4OJRA 3DWLA 3SI6A 1OH8A 1C0MA 4KREA 4CJQA 1N34K 4CBXA 3VEVA 3OYKA 4FJHA 1C0UA 3KLFA 4DS4A 2NUBA 4CHPA 4GKKK 2OANA 4DCHA 4ELUA 2NRTA 3SJHA 3GG4A 4CGIA 4K25A 2WFBA 1BA1A 2FSKA 3R8EA 5FLXO 2E4LA 1NNEA 3E66A 3DI6A 4BROA 2NZTA 3RMBA 3ENHA 1L3TA 1VQ7N 4I9QA 4BRIA 2BE2A 1KFSA 4FWRA 4IJAA 2WUSA 1I39A 3HO1A 3CMAN 3F9KA 3OVNA 4F4KA 4M3XA 3C7NA 3OYHA 1T8EA 2P5OA 3VGMA 3UIQA 4NLCA 2PBDA 1CXQA 2CH5A 3G25A 3CCEN 3F5TA 4JK7A 4W5OA 3RSEB 4X65K 4H4OA 2FBTA 3I0SA 4B1ZA 5JLHA 1N32K 1J9AA 2ETJA 4PWDA 3I33A 2E6MA 1DGKN 4LH4A 3IAYA 1SL0A 1GLEG 1M1KO 2A41A 4ZTFA 4KFBA 4H0VB 1DEJA 4DV7K 4QAGA 3CCLN 3DRPA 2HNYA 4CJ7A 4CEFA 5BREA 2QEXN 5HBMA 4M63C 3MX5A 1LW0A 4CERA 3GOIA 4DTUA 4CHNA 3AA2A 4L8RB 5BPMA 2O8FA 2QWOA 4PL7A 1LAVA 4OKKA 4CD1A 3CXCM 4KPYA 3LP1A 2QKBA 4M3WA 3VQ6A 3V6DA 4JS5A 1SV5A 2CH6A 4CZEA 3L3UA 4NCBA 4Z4IA 1XWLA 3CYMA 4CEOA 5AQTA 2R7YA 3D2FA 2B5JA 3WXKA 4BGBA 1N5YA 3KLIA 4FSVA 3JSMA 4B9QA 4CEBA 4BRKA 3IFRA 4PHTX 1VSMA 1GLJO 1W7AA 4BQZA 3NAEA 5C24A 2A3ZA 5FPMA 4B3TK 4IFVA 3AVMA 3KK1A 4O4GA 2V7ZA 4CF1A 4FVMA 4JI8K 4XIUA 1BQMA 3HPGA 3L2QA 3ZT1A 1VSIA 5BN9A 3S3NA 4M3ZA 2ZGZA 4Q5VA 4N76A 3HK2A 4FLZA 1D8YA 3FFIA 2UXDK 2BH1A 1U04A 1TKXA 1YUWA 4IG3A 5DK5A 3BDPA 2F9TA 1SL2A 1KSPA 2ZWHA 5TKYA 1NGFA 3U8XA 4WQ5C 3ZEUA 4FW1A 1HPMA 1RBUA 1RDUA 2YJFA 3LDOA 4YOWA 4PUOA 1E4GT 4PA1A 1ILYA 4CEAA 2ZGYA 2A1RA 1VSHA 4I6MB 3SQ2A 3NCIA 4B9TA 1RFQA 3TAFA 3NH0A 4JKGA 4C8MA 4DWIA 4MLEA 4EAHD 1LV5A 3NF9A 3LANA 4ISEA 2KHOA 3V4IA 3QO9A 1N33K 2EWSA 1YT3A 2JWKA 2W6LA 3LP0A 2GELA 3LDNA 4UQGA 4QS9A 1K73O 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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