The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
115
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structure length |
110
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Chain Sequence |
MRVAIPAEDDRGIKSNVSKHFGRSRYFVFVDIEGEDVKNVEVVEVPFGDLPNFIKDHGAKIVLTYGIGRRAIEYFNSLGISVVTGVYGRISDVIKAFIGGKLKIDYDWKE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of PH0822
rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical protein PH0822
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Pyrococcus horikoshii
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| total genus |
28
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| structure length |
110
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| sequence length |
115
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02579 | Nitro_FeMo-Co | Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QTD A; 1O13 A; 2RE2 A; 1RDU A; 1EO1 A; 2WFB A; 1T3V A; 1P90 A; 2YX6 A; 2KLA A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CFO A; 1HJR A; 4JI5 K; 3O4W A; 4CFB A; 3J80 O; 3PSF A; 1KFD A; 3ENO A; 3DMJ A; 3FR0 A; 2NNW A; 4ID5 A; 4FLZ A; 4Z4I A; 3MN9 A; 5AQZ A; 4DSF A; 1TAQ A; 4JI7 K; 4DQ8 A; 1KAY A; 4DTM A; 4IG0 A; 2V7Z A; 3AO4 A; 3FZL A; 5AQM A; 1YUW A; 3KVG A; 1X3M A; 3N4Q A; 3B6P A; 3ZSX A; 3HL8 A; 2JWL A; 4O55 A; 3RSE A; 1V4S A; 4GV6 A; 3OYK A; 3LDN A; 5CR4 A; 3P39 A; 3ZCM A; 1XI1 A; 3VTI A; 4BC5 A; 5KGW A; 4JKG A; 3MN5 A; 3F73 A; 3QEW A; 1BU6 O; 4BE1 A; 2NRH A; 3EO3 A; 4B3R K; 2W6L A; 3VQE A; 1SV5 A; 1HNI A; 1TKX A; 1IBL K; 4H4O A; 2HBM A; 4CES A; 4JKC A; 1G99 A; 2Q97 A; 1QSL A; 2YHB A; 3H1Q A; 5AZI A; 3TPQ A; 4A5A A; 4HTU A; 4M3Z A; 3D45 A; 4HCC A; 3VEX A; 1Q9X A; 4CJ5 A; 1YJW N; 4FJ8 A; 4CJP A; 4IG3 A; 1K73 O; 3PY8 A; 2PBD A; 3CMA N; 2D0C A; 3KK1 A; 5C0Y A; 1SL2 A; 4ZTJ A; 3HPG A; 4E3S A; 1A5W A; 1SAZ A; 1YVU A; 4WQ5 C; 4FLX A; 4JKH A; 5HRP A; 2ZD1 A; 3RMD A; 3OYE A; 4B9V A; 1VRU A; 2KW4 A; 4O44 A; 1SZ2 A; 3MXJ A; 2EHG A; 3K9K A; 4A2B A; 3AVK A; 5MLC Q; 4DWI A; 1DEJ A; 1P90 A; 3VQA A; 4V19 S; 2ZQB A; 2F8S A; 1SL1 A; 2E2N A; 2Q0U A; 2HMP A; 3M6G A; 3CHW A; 1HMV A; 4RCH A; 3OYN A; 3R6M A; 4A62 A; 5CHI A; 2I7P A; 5AQN A; 3DXK B; 4E7L A; 3NE6 A; 4MO4 A; 3RMA A; 4IJN A; 5F2R A; 4M3U A; 1VSI A; 3THW B; 5CYM A; 2E6M A; 4JI4 K; 4YHH K; 4TSX A; 4H0T B; 3VQ5 A; 5JLF A; 4NLC A; 4CE9 A; 3NVM A; 4NXN K; 3ZET B; 4ILJ A; 4C8L A; 2QXF A; 3GE1 A; 4LF5 K; 3L2V A; 5AQJ A; 3UE5 A; 4DLE A; 4G9Z A; 1BOT O; 4FJK A; 1BHL A; 4WCE L; 3O9S A; 3QDK A; 3K57 A; 3HJF A; 3E66 A; 3TWH A; 4BWJ A; 4F2R A; 1SKW A; 1GLJ O; 5C24 A; 1NNE A; 3L4Q A; 1DTT A; 3AVI A; 2NRX A; 2HBJ A; 3TAQ A; 1X9W A; 4L8R B; 4LD0 A; 4ICL A; 3OJU A; 1UWB A; 3G71 N; 3G0Z A; 2O4I A; 1HNW K; 5AQQ A; 3VMF B; 5BPN A; 1C0F A; 4M7X A; 1I39 A; 2P5O A; 2YNG A; 2P51 A; 1KAZ A; 1T44 A; 1VQM N; 2HOE A; 2QWQ A; 3AY9 A; 1WSF A; 3Q7C A; 1JJ2 M; 4OLA A; 4DF8 A; 3DLL L; 4JI1 K; 1U49 A; 4FWR A; 3V9U A; 1K8K A; 1LWC A; 3SUO A; 1ATN A; 1B9D A; 4AHS A; 4JD2 A; 5FLX O; 1KLN A; 3CCR N; 3I56 N; 1GLA G; 1QHT A; 2IVP A; 3V1Q A; 2E1Z A; 1KVB A; 1WSG A; 2DFE A; 5F0X A; 3WNF A; 5GIP A; 4YY3 K; 2GWK A; 5AQI A; 2IVO A; 2IAJ A; 3CCU N; 2G8I A; 4BR7 A; 4QS9 A; 4W5O A; 4JI8 K; 3D2E B; 2E88 A; 1YI2 N; 2P9P A; 1JCG A; 3EE8 A; 1TGO A; 3K5N A; 1GLB G; 1XC3 A; 5E84 A; 1T6D A; 3I55 N; 2VWB A; 4IOA L; 1NMD A; 2IC3 A; 3F2K A; 3OYM A; 4BG9 A; 3VGL A; 3ZSV A; 1YIT N; 2VWK A; 4HTL A; 1VQ8 N; 3DM2 A; 4G1Q A; 1IJJ A; 2PZS A; 4UY8 O; 5J2M A; 4CEC A; 2OPS A; 3VOV A; 4WFN L; 3OYJ A; 4EZ9 A; 4QS8 A; 3B8A X; 4AHU A; 1RCH A; 2QWR A; 2V52 B; 4EP5 A; 4KI4 A; 1Q8I A; 3OS1 A; 4EP4 A; 1IBM K; 3SPZ A; 4CJK A; 4CGH A; 3D2F B; 3T1A A; 2E6L A; 1FKP A; 3MCP A; 3R1X A; 5EVZ A; 3J7Z O; 4DFK A; 4IEI A; 3M3Z A; 4LF8 K; 1NGJ A; 2HMI A; 3WXL A; 3QEV A; 3VF2 A; 3P4I A; 3E9O A; 4PWD A; 2NRR A; 1X9S A; 3TAE A; 2NRT A; 3MMV A; 3QML A; 3TAN A; 4DQS A; 1BI4 A; 4R5P A; 1QSY A; 3WEE B; 4B08 A; 5KPT A; 1S9E A; 1W9H A; 4C1N K; 4KAZ A; 4DR7 K; 4U7B A; 1EQY A; 2VGN A; 3K58 A; 4BAC A; 5LMN K; 3THV A; 5M1O A; 1X1P A; 1KVA A; 1JCF A; 2ZF5 O; 3L0Q A; 3AVF A; 4DMN A; 5KRT A; 1VQ4 N; 5C42 A; 3RMC A; 3HYF A; 3V81 A; 5SZT A; 4CBU A; 1NK0 A; 3O4N A; 2LSN A; 4OPK A; 4FJ7 A; 4KFB A; 1ESV A; 3CJC A; 2OCE A; 2KFN A; 1W7A A; 1NWK A; 1T8E A; 3NF6 A; 3FFI A; 2ZGZ A; 3AVB A; 4O5F A; 4DTS A; 4LF4 K; 3DXK A; 2OTL N; 1WN7 A; 3KD1 E; 4CBX A; 4YOU A; 4ELT A; 1BUP A; 4JI3 K; 4EHT A; 5GIN A; 3IS9 A; 1GOB A; 3N4P A; 1CLQ A; 2Q0R A; 2Q2R A; 3DRP A; 3THW A; 1Z05 A; 1ATS A; 3PUF A; 4EAH D; 4Z4F A; 1HYZ A; 1WAF A; 4FK0 A; 3QER A; 3EEQ A; 3ZET A; 4EZ6 A; 1XC9 A; 2HW3 A; 4FWP A; 4B3S K; 1ZBS A; 3O9T A; 4BE0 A; 5C15 A; 2UU9 K; 2XRI A; 3HZ6 A; 2P1J A; 3GL1 A; 1KVC A; 3JSM A; 3AO3 A; 4F3O A; 4E7J A; 3KTQ A; 1XMQ K; 3SI6 A; 4AHV A; 1Q18 A; 4JAX A; 1RIL A; 1N5Y A; 2KZZ A; 3VEW A; 2KHO A; 4IKF A; 3SQ0 A; 3VA3 A; 4E89 A; 2YHW A; 1CZ9 A; 4LY7 A; 4FK4 A; 5C2D A; 4JI2 K; 4I2Q A; 4CJ4 A; 4F9O A; 3F5T A; 2W42 A; 3KLI A; 1M1K O; 1FW6 A; 1NK8 A; 3R8E A; 3WUH A; 1OH5 A; 3NFA A; 4DSL A; 4W5T A; 1D5A A; 1GLF O; 4GNI A; 3VQ9 A; 4FJH A; 3LM2 A; 3NGI A; 2P9N B; 2HF3 A; 5FPN A; 3VQ7 A; 1RT2 A; 1JLE A; 4F8R A; 4CJF A; 1NGH A; 4E19 A; 1BWF O; 3PO5 A; 3HVR A; 4DR2 K; 3I8D A; 4N5S A; 2UYT A; 2OZM A; 2NZT A; 2QWM A; 3O9Q A; 3CI5 A; 3K5O A; 4H0P A; 1J9A A; 5BN9 A; 5AJ3 K; 3CFR A; 4DR6 K; 3NVK A; 4E0D A; 1T6C A; 3K0S A; 4CJ3 A; 2E2Q A; 5EX5 A; 1ZYQ A; 5AQH A; 4LSN A; 4H5T A; 1JLF A; 3LP1 A; 1KSP A; 4F2S A; 3WXK A; 3NBP A; 1JL2 A; 2E2P A; 3EYZ A; 3MEC A; 4FWS A; 3JYT A; 5BR8 K; 4HHT A; 1VQ5 N; 1Q7Y O; 3MX2 A; 1Z25 A; 4GV9 A; 1TK8 A; 2JLE A; 5AR0 A; 2GEL A; 3D2E A; 4K0K K; 1VSD A; 1E4G T; 2HBL A; 3CF5 L; 3VQQ A; 5BRD A; 1IBK K; 4C1N I; 3VEN A; 3WT0 A; 4YDU A; 3NGZ A; 4B3T K; 4CW7 B; 4DS4 A; 1VQ6 N; 4H03 B; 4OKK A; 2VWJ A; 3KLF A; 4BRI A; 4CEQ A; 2PAV A; 4Z4C A; 3NDK A; 2AP1 A; 4KHP K; 4LFA K; 4NYF A; 1T3V A; 2F9W A; 3D6R A; 4LH4 A; 3OYH A; 3KK2 A; 3ZT2 A; 3V9Z A; 3OYF A; 2F9T A; 1RDW X; 2H3G X; 4CF8 A; 5JMV A; 3MXI A; 4IO8 A; 1XHX A; 4DB3 A; 4KRF A; 3SNN A; 1YVN A; 3CPE A; 3D2F A; 1MA9 B; 3FZH A; 3F9M A; 4CVN E; 3K5L A; 2OPQ A; 1L3S A; 1QQC A; 3AAP A; 1I94 K; 1XHZ A; 1L3T A; 3NAE A; 4KHU A; 4WYB A; 4H5W A; 4DSI A; 1DKG D; 2WTU A; 1TL1 A; 4DSK A; 5AQP A; 2QWP A; 1TK0 A; 2KKZ A; 4KHQ A; 2HF4 A; 1GLL O; 3NF8 A; 2CGK A; 3P38 A; 3P5J A; 5JVG L; 2W41 A; 4CEF A; 4QAG A; 3FFK B; 3DLB A; 1S6P A; 3WEE A; 4BRC A; 5EOY A; 5T7B A; 1XUP O; 3DYA A; 5AQS A; 2D0O A; 1N8R O; 3ZX2 A; 2F4V K; 1NKE A; 3TTC A; 3L2U A; 2JGU A; 4JKA A; 3C95 A; 4JYA K; 5EXW A; 1JLC A; 3HRG A; 3MN7 A; 4LF6 K; 3WXI A; 5FPM A; 3HM9 A; 3AA3 A; 1C0M A; 4JRP A; 3CCE N; 4JKD A; 3OW2 M; 5E41 A; 3HOS A; 4DFM A; 2Q1N A; 4OGC A; 2VG5 A; 3QFP A; 1VQK N; 3QNO A; 3KK7 A; 2BAN A; 3BP8 A; 3OYD A; 1KQS M; 3CM6 A; 3CER A; 4CJV A; 5M1K A; 1HNV A; 2QWN A; 3O9R A; 4BDZ A; 1ASW A; 4LH5 A; 1RTH A; 2ZWH A; 4OPJ A; 4FXD A; 3LPT A; 3SBT A; 4M41 A; 2VG7 A; 3VER A; 4ZHR A; 2KQ2 A; 3ASM A; 2KZM A; 3W3D A; 3DLH A; 3HXM A; 3D7E O; 4ELV A; 1NGD A; 3O08 A; 4BC2 A; 4EHU A; 1RDU A; 4RW4 A; 1VK0 A; 4OO1 J; 2HNY A; 5ADX H; 2A42 A; 4DTP A; 4QOZ B; 1LOT B; 1JXE A; 1RBV A; 1QVG M; 1YTU A; 2O4G A; 3SUN A; 1Y64 A; 3WQU A; 4DTR A; 4B1X B; 1FJG K; 1NK5 A; 3JAM O; 1KXP A; 4BRF A; 3TAG A; 1NLV A; 3LAL A; 3A0I X; 3ULE B; 4F4K A; 4AHC A; 1EWQ A; 3NH2 A; 2P9N A; 4HUE A; 1ZBF A; 4E1N A; 4CHY A; 2V51 B; 4CIF A; 5B8H A; 4YOV A; 4YOR A; 3J8A A; 4AQY K; 4W5Q A; 4RW8 A; 3E9P A; 4WFA L; 3OYL A; 2R7Y A; 5HLF A; 2G8V A; 2RPI A; 2HHW A; 5M1F A; 1O1W A; 1VSF A; 3WXJ A; 1VSH A; 5HRO A; 5DMR A; 2BH1 A; 3CIP A; 5BPL A; 1C0G A; 3S9H A; 2O8F B; 4JS5 A; 3I8B A; 3DOL A; 1LAW A; 4FW1 A; 1NJX A; 2XY5 A; 4E7K A; 2F96 A; 4PL7 A; 2IS3 A; 3MAQ A; 4IOC L; 4XH4 A; 1MWK A; 4CJL A; 4DG1 A; 1UOC A; 3BZK A; 1NG9 A; 3ZX3 A; 3C94 A; 4CGD A; 4BQL A; 3LP0 A; 3OHR A; 3EZ5 A; 2HB5 A; 3I0S A; 4BDY A; 1N6Q A; 4CGI A; 4EFH A; 3CJB A; 2VGM A; 4O0J A; 4RW7 A; 4FJL A; 3WNE A; 1ASV A; 3V1R A; 4YOW A; 4JK8 A; 4NCG A; 2HNZ A; 1UA0 A; 4GV3 A; 2X74 A; 4CJQ A; 2Z1H A; 1TUU A; 5AQO A; 3SQ1 A; 4FJX A; 3CCS N; 4FM1 A; 4MO5 A; 3NF9 A; 5HRS A; 5JS1 A; 2IDO A; 3LAN A; 2UUB K; 5TKW A; 2YHY A; 2KFZ A; 1BQN A; 3O3G A; 4DQQ A; 4CF0 A; 3DWL A; 4I7F A; 4BRE A; 3TTD A; 2P5G A; 2NRV A; 1HQE A; 2GUI A; 4KPY A; 1Y97 A; 4ISG A; 1KRP A; 4H0V B; 2D1K A; 1RDC A; 4J2E A; 3KJV A; 3DXM A; 3HSC A; 3KZB A; 1DTQ A; 3AV9 A; 2ZJQ L; 5J2N A; 1N32 K; 4KB0 A; 4PHT X; 4NLB A; 5LY3 A; 3C7N A; 3RR7 A; 4H0O A; 2X78 A; 1QQM A; 1VSM A; 1VSJ A; 3UIQ A; 3C6T A; 3CQ8 A; 4JNE A; 2BE2 A; 2YV0 X; 4IBN A; 3RWU A; 4WE1 A; 4B9U A; 3AA5 X; 3AGK A; 1OKJ A; 4BC3 A; 4YOT A; 1VHX A; 3L2W A; 4WQ4 A; 1EO1 A; 2P9K B; 4MFB A; 5HRN A; 3HP6 A; 3VET A; 3FZK A; 3Q7B A; 1NK7 A; 3CD6 N; 3QFU A; 3U9Z A; 3CCL N; 2GX9 A; 1RT4 A; 2X6N A; 4IFE A; 2A1R A; 4IDH A; 3IDH A; 2FSK A; 4M3W A; 1QQO A; 5BR9 A; 4BY9 C; 4JKF A; 1QHA A; 1QQN A; 1REV A; 4BRL A; 2ZM6 K; 4XEI A; 2GUP A; 4DUZ K; 4CK2 A; 3KLH A; 4Z4G A; 4NYN A; 3K9J A; 4H5N A; 3MDQ A; 4B1V A; 2ZGY A; 1FK9 A; 1HPZ A; 4A5B A; 3VGM A; 1OVY A; 3UKU B; 2GTD A; 3H3N O; 2BTF A; 4PY5 A; 4CZL A; 5I42 A; 4JK7 A; 1S1X A; 4RWT A; 4BE2 A; 5F1X A; 4CHQ A; 4M45 A; 1NJY A; 2D4W A; 4X66 K; 5I3U A; 4BC4 A; 3CJ7 A; 4DTX A; 1HR0 K; 4BR2 A; 4IXC A; 3ID6 A; 1UAX A; 3QIN A; 4ELU A; 5C10 A; 5EY4 A; 2E5L K; 1N36 K; 3I0R A; 2O8C B; 1IG8 A; 2XY8 A; 4OPA A; 2NLX A; 2I5J A; 4L3Q A; 2G8F A; 5LMU K; 2X6S A; 3VN5 A; 2A40 A; 2O8D B; 3OA9 A; 5CYQ A; 4JHD A; 1BCO A; 1XNQ K; 1NOZ A; 4HWI A; 2HHU A; 5J1E A; 3V9S A; 3WQT A; 3SMS A; 1WOQ A; 4WQ5 A; 3OVN A; 2NUB A; 4NB4 A; 2QM1 A; 3P83 D; 3AA4 A; 3GDQ A; 2E8A A; 3ZT0 A; 1HYV A; 3TI0 A; 1XWL A; 3MED A; 3VPZ A; 4M7Y A; 1MU2 A; 3TSU A; 1X9M A; 3CCJ N; 3THX B; 3ULE A; 5IT9 O; 1VQ7 N; 1WSE A; 1NMN A; 3ZYY X; 1KCF A; 2FF3 B; 2E4L A; 2OZS A; 2FBY A; 4BRN A; 3BDP A; 5AQX A; 4Z0U A; 4A59 A; 3O8M A; 4BRK A; 3AVC A; 2G8W A; 3G6E N; 5AQL A; 4CGJ A; 4KV8 A; 1SL0 A; 1KTQ A; 4J2D A; 3ZLJ A; 5AQY A; 3LM9 A; 1TK5 A; 1XQS C; 2CGL A; 2PFU A; 2YHX A; 4DU1 A; 3OY9 A; 3RRH A; 3CC4 N; 1NU0 A; 3NCI A; 4Z4H A; 1CZB A; 4KBO A; 2YJE A; 4M63 C; 3A5L C; 2QA4 N; 3SPY A; 3AAR A; 1WUA A; 1D9D A; 4YNQ A; 1IO2 A; 3UB5 A; 5LJW A; 4E7H A; 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