The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
115
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structure length |
110
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Chain Sequence |
MRVAIPAEDDRGIKSNVSKHFGRSRYFVFVDIEGEDVKNVEVVEVPFGDLPNFIKDHGAKIVLTYGIGRRAIEYFNSLGISVVTGVYGRISDVIKAFIGGKLKIDYDWKE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of PH0822
rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical protein PH0822
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Pyrococcus horikoshii
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| total genus |
28
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| structure length |
110
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| sequence length |
115
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02579 | Nitro_FeMo-Co | Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1P90 A; 1T3V A; 2RE2 A; 2WFB A; 2QTD A; 2KLA A; 2YX6 A; 1RDU A; 1EO1 A; 1O13 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3MWT A; 3H46 O; 5JMV A; 3OHR A; 3NGZ A; 4LF4 K; 4L3Q A; 4BC4 A; 4PL8 A; 1A5X A; 2FC0 A; 4O5F A; 3V9Z A; 3QEV A; 5LJW A; 3NCI A; 4BY9 C; 3B6O A; 4B9U A; 1EO1 A; 4CBX A; 2UXD K; 5M1P A; 3MAQ A; 1T6C A; 3ZT4 A; 1C0F A; 2P5O A; 1QQO A; 3FFK B; 1K73 O; 3EKU A; 2RKI A; 4DV0 K; 5HBM A; 2DFH A; 1CZA N; 3ZEU A; 1J5E K; 3OYF A; 1KC8 O; 3DXM B; 3MCP A; 4NLB A; 3CJA A; 1BU6 O; 3AGR A; 3UKU A; 1VQ8 N; 3AVN A; 2GTD A; 5AQS A; 4GVM A; 4N47 A; 1EWR A; 1VAZ A; 3WNG A; 2QWO A; 4FLV A; 2O8E A; 3DYA A; 2P9I B; 4AHC A; 2QEX N; 3TSP A; 1VSI A; 5FPD A; 4BRE A; 4XH1 A; 4ZHR A; 2PBD A; 4DQI A; 3CJC A; 1S72 N; 1NOY A; 4H5T A; 4GMJ B; 1D4X A; 3AAR A; 5CY4 A; 3C0B A; 1ESV A; 2D1K A; 2VG5 A; 2FSN A; 1BIS A; 4FJN A; 3DLK A; 4W5T A; 2LSN A; 3MED A; 4JS5 A; 2A6A A; 1IBK K; 4EZ6 A; 1SS6 A; 4CVN E; 2G8H A; 3NF7 A; 1ZBS A; 4YDU A; 4BRA A; 4CD3 A; 3T3F A; 3D6R A; 2QWL A; 3NGY A; 3CME N; 4PA1 A; 1RTI A; 3CPW M; 2OYQ A; 3QNN A; 3SCX A; 3VTI A; 1QHA A; 1ASU A; 1ATS A; 1RDC A; 1YVN A; 1KSP A; 1RFQ A; 1W0H A; 4B3M K; 1JXE A; 4PUO A; 3CCL N; 5LMN K; 4FM2 A; 4KBO A; 3ZSR A; 3WXJ A; 4JKF A; 1J6Z A; 3L2Q A; 1NK8 A; 4BRO A; 2UXC K; 1Q82 O; 2A42 A; 4B9L A; 3H3N O; 4FLZ A; 1Q9Y A; 4H0X B; 3HT3 A; 1X3N A; 4FJ5 A; 2FBX A; 3OY9 A; 1S3X A; 1NMN A; 4BRF A; 2Q0U A; 2GBZ A; 4KPY A; 1RGI A; 4IZ9 A; 4BVO A; 1VRU A; 4ELU A; 3DM2 A; 1HKC A; 2PYL A; 4CZF A; 4N76 A; 3SUO A; 2RE2 A; 4WFN L; 3TPQ A; 4RW4 A; 3OYD A; 3SPZ A; 2E1Z A; 4CBW A; 2KW4 A; 3G10 A; 4B3R K; 3A8Y A; 3TAR A; 3CI5 A; 4NYF A; 4JI3 K; 1QQM A; 1JKH A; 2GWJ A; 1IKV A; 4M7Y A; 1J5O A; 1YXQ A; 4BC2 A; 3GOI A; 4BR2 A; 3AVC A; 3U8X A; 5TKW A; 1NK0 A; 2CGJ A; 4F8R A; 3QBW A; 3V6D A; 2FBT A; 2Y1J A; 2NRH A; 5AQJ A; 4KKO A; 1BG3 A; 2IOC A; 3HRG A; 4DS4 A; 3CYM A; 1GLJ O; 4FLX A; 2ITG A; 3OBY A; 3C94 A; 2W41 A; 3EN9 A; 4I2P A; 2E1Y A; 2ZJQ L; 3RR7 A; 3HK2 A; 3IFR A; 1RBV A; 3PUF A; 4M45 A; 3H1V X; 3LDP A; 4M63 C; 1QTM A; 4YY3 K; 4FZZ A; 5DMR A; 4FWM A; 1BIU A; 4CF8 A; 4JI4 K; 4K8Z A; 2PAV A; 4DMN A; 4OPK A; 5JVH L; 1NGB A; 1BI4 A; 3OYA A; 4H03 B; 4WYB A; 3CFP A; 1VSH A; 2HHV A; 4B9S A; 4CJT A; 5KRS A; 4GV3 A; 4O0J A; 4YOV A; 4CJP A; 3W3D A; 3SI6 A; 1P90 A; 2QW9 A; 3ATU A; 3VOV A; 2GX9 A; 5CZ2 A; 3CCM N; 2XO7 A; 2AA4 A; 1WSI A; 4IG3 A; 2P9P A; 4CZL A; 4CJ4 A; 5AZI B; 4C1N I; 1JL2 A; 3CG7 A; 2O8F B; 1XC3 A; 3CC4 N; 2AP1 A; 4BDP A; 4JI8 K; 3SMS A; 4KV8 A; 3OYE A; 3VF6 A; 2HB5 A; 5J2P A; 3M5R A; 2HNZ A; 3I8B A; 4EHT A; 3M8Q A; 2NRZ A; 2PZS A; 1E3M A; 3VMF B; 1BO5 O; 4PKI A; 3H3O B; 3KZB A; 4CEZ A; 3V1R A; 3J7Y P; 4K41 A; 4Q0B A; 1NLV A; 3HO1 A; 1QZ5 A; 3OYM A; 4FZY A; 4AHV A; 1NGD A; 5FDL A; 1GLC G; 1HQE A; 1OVQ A; 5LY3 A; 5DM7 L; 2HHT A; 1I94 K; 4Z4F A; 4CJR A; 4JEP A; 3HPG A; 4CJE A; 1BA1 A; 1VQP N; 5K14 A; 1LWC A; 3PY8 A; 2E2P A; 4NYN A; 2CGK A; 1O1W A; 3MWP A; 3ULE B; 3ZET B; 1L3T A; 3O08 A; 2O4G A; 1JJ2 M; 5MLC Q; 3QB0 A; 4YHH K; 1VSF A; 3HJF A; 4BWJ A; 3O80 A; 3MN6 A; 2G8V A; 4YFU A; 1LV5 A; 1N34 K; 3AY9 A; 3ZSV A; 3DI6 A; 3PX4 A; 1U45 A; 3VEZ A; 4Y0W A; 3THW A; 1D5A A; 3HPH A; 3Q7C A; 4PKH A; 3NHG A; 3H6E A; 4EFH A; 1XI1 A; 4EAH D; 4O8U A; 3F5T A; 1U6Z A; 2ASO A; 2BH1 A; 3CCV N; 3WQT A; 3E9O A; 3DOK A; 3OYK A; 3EZW A; 5I42 A; 1ZBU A; 4QAG A; 5C10 A; 3VET A; 1ZXO A; 4OX9 K; 1ZBI A; 2HW3 A; 3OYB A; 2WOM A; 3LL3 A; 4QS9 A; 3KLH A; 4DR3 K; 2Q0R A; 2F4V K; 3NH1 A; 3EYZ A; 4R5P A; 2QI2 A; 4KB0 A; 3RWU A; 2OZM A; 4FWP A; 3E66 A; 3NVM A; 3HOT A; 3BF1 A; 2KQ2 A; 2VG6 A; 1EXQ A; 3AO4 A; 4IJA A; 4BRG A; 1U2V B; 4E1N A; 4CIE A; 1KAY A; 4JLH A; 1QVG M; 1U47 A; 3QFP A; 1LW2 A; 3HTV A; 4CGJ A; 3F2K A; 4NCB A; 1RT7 A; 3NGI A; 5GIN A; 2V52 B; 4AQY K; 3F73 A; 5AQW A; 4MO5 A; 3L2W A; 3DXM A; 3VQ7 A; 3LP0 A; 3I8D A; 1O13 A; 2WBN A; 5FPM A; 4OKK A; 3U9Z A; 3MEG A; 3QIN A; 5JLF A; 1IKY A; 3HI0 A; 2OCE A; 5DK5 A; 4W5N A; 3E01 A; 1RNH A; 1MU2 A; 3FE1 A; 2VQE K; 2NRX A; 2X74 A; 4BRQ A; 1UWB A; 2P9I A; 4FXD A; 4J2A A; 4BVP A; 3TAG A; 1XHZ A; 4OO1 J; 3RR8 A; 1KLM A; 3IAY A; 1HKB A; 3CM5 A; 4AHS A; 4CEF A; 3WQU A; 3LDO A; 4BRI A; 4DFK A; 1GLE G; 3ATV A; 4WFB L; 4KHS A; 3K9K A; 3ID8 A; 4FW2 A; 4CEQ A; 4BRH A; 3VF2 A; 3S9H A; 4M3R A; 3MN9 A; 1X3M A; 3LDQ A; 1GOC A; 2YJF A; 2D5R A; 3EO3 A; 3HM9 A; 3TR8 A; 3MXI A; 4OLB A; 5AFU H; 2YI1 A; 3FFI A; 4BR7 A; 4JRQ A; 3JAM O; 3SQ2 A; 5ADX A; 3AO1 A; 3S3O A; 3O9S A; 3VQQ A; 2YNF A; 5C12 A; 1WAF A; 3L4I A; 4I6M B; 2B6A A; 5AQT A; 3AAQ A; 3LDS A; 2YHY A; 3TAF A; 4JK7 A; 3CFR A; 5HRS A; 4F4K A; 4C8N A; 4I2Q A; 5AQV A; 2HF4 A; 4YOR A; 3SUN A; 3Q7B A; 2Q1N A; 4H0V B; 1CXU A; 5KRT A; 3O9U A; 2OZS A; 4FJ9 A; 3ZX2 A; 4E0D A; 1IV0 A; 2W6K A; 1ATN A; 1CLQ A; 3R6M A; 3C6U A; 3VQA A; 4CJL A; 1HNI A; 4CF9 A; 3QES A; 2G8K A; 4FVU A; 3PO5 A; 4NB4 A; 1TKD A; 3VQ5 A; 4FWL A; 4X64 K; 1KFS A; 3FZF A; 1HMV A; 1D8Y A; 4IEI A; 3A5N C; 2D0O A; 2GEM A; 1LWE A; 3LAM A; 3EEQ A; 5FLX O; 1EQY A; 5EX5 A; 3VEY A; 3O3H A; 1HQU A; 3PV8 A; 2ZD1 A; 3V1Q A; 4YOU A; 1KTQ A; 3ISN C; 4FJ7 A; 1R0A A; 3ZT3 A; 1C1C A; 3K9J A; 3FGU A; 4IOX A; 4NCA A; 3HXM A; 3SPY A; 1G99 A; 3O9Q A; 2P9P B; 2IS3 A; 1RT1 A; 1T3V A; 2YNI A; 1NJI O; 1Q81 O; 5F2R A; 5FPN A; 1ASV A; 2G8F A; 1JLG A; 1ZYQ A; 1X9M A; 4I9Q A; 2Z1J A; 3L0Q A; 5CR4 A; 4IOC L; 2VG7 A; 2Z1G A; 4H0T B; 3OJU A; 1UA1 A; 2O4I A; 3OYC A; 1Y97 A; 2P9K A; 4DR7 K; 4FWN A; 3ULD A; 3AVL A; 2GUI A; 4DFP A; 5I3U A; 2DTU A; 4FLY A; 5AZI A; 2O8F A; 4CED A; 1RDD A; 5M1K A; 4KHP K; 3CJ1 A; 3K0S A; 4C1N K; 2IC3 A; 2VGN A; 3AVG A; 4BGA A; 3AVM A; 3GDQ A; 3KLF A; 4KTZ A; 2UXB K; 2XY8 A; 4DSL A; 3ZLJ A; 1QQC A; 3NVK A; 1WSJ A; 4RWT A; 3ZYY X; 3VF4 A; 1J54 A; 3VEW A; 2DFF A; 4H5N A; 4FWK A; 3TAP A; 4GV6 A; 2NZT A; 3T1Y K; 2A3Z A; 2FSK A; 3OYL A; 2OA8 A; 1VQ4 N; 1VSL A; 3LM9 A; 2E4L A; 1TKX A; 2F8S A; 4IFE A; 4C8K A; 1YT3 A; 4A2A A; 2E2N A; 2I7P A; 4KTQ A; 1NWK A; 3AV9 A; 3EL2 A; 1YJ9 N; 1ZBH A; 1RCH A; 1S1U A; 1XWL A; 3KIO A; 3J80 O; 3ZSO A; 4X65 K; 4CJF A; 3SQ0 A; 3FZK A; 3ULE A; 3ZET A; 1NGJ A; 5J2M A; 3E9P A; 3DJC A; 1X9S A; 3KHY A; 3WEE B; 4CJK A; 5AQY A; 2XY7 A; 4DF8 A; 1E4F T; 4KB1 A; 2IDO A; 1OVY A; 3ID6 A; 3VQ8 A; 4CCH A; 1GLL O; 1JCG A; 1GLD G; 4XH5 A; 4CHZ A; 2VGM A; 1HYV A; 3HVR A; 1GOA A; 4JI2 K; 2O8B B; 5J1E A; 4BC5 A; 4ZTF A; 4A61 A; 3A2F A; 4FWR A; 3EKS A; 4TSX A; 5JS2 A; 3WNE A; 5C2D A; 2D0C A; 1N32 K; 2P9N B; 2OTL N; 3QET A; 3HOS A; 3IRX A; 1QQN A; 4KHQ A; 1L3S A; 2YV0 X; 1BL3 A; 2WC9 A; 3QNO A; 2I5J A; 3SV3 A; 1NBW A; 4BRK A; 3I0S A; 1NNE A; 2E20 A; 4E7J A; 4W5O A; 3K59 A; 5BPM A; 2E88 A; 4BC3 A; 2HBM A; 1W9H A; 1U2V A; 1IG8 A; 2XRI A; 4OGE A; 4KHN A; 4KI4 A; 5HRR A; 1B92 A; 3P83 D; 4DSE A; 3QO9 A; 4FCY A; 1RIL A; 4RW8 A; 4AF1 A; 3HZ6 A; 2HHH K; 4CFC A; 2QK9 A; 4B9V A; 4N5S A; 3LZI A; 3W0L A; 3O8M A; 3NF6 A; 3BGR A; 3I33 A; 4E7L A; 3TSU A; 4FJK A; 4DKW A; 1IBM K; 3TAE A; 2Q2R A; 1FJG K; 2GEL A; 1TUY A; 1FKO A; 3CC7 N; 3OS2 A; 4QCL A; 3AVH A; 1YIT N; 3SAF A; 5AQH A; 1K8A O; 4KTW A; 3U6F A; 2OAN A; 5HLF A; 2OTJ N; 4GV9 A; 2VWB A; 4JI6 K; 4M7X A; 4KI6 A; 3QIO A; 3LWM A; 3C6T A; 3MN7 A; 1NOZ A; 1HR0 K; 3O4W A; 1YAG A; 5LL6 Z; 4W5Q A; 3VTH A; 4NO7 A; 2O8D B; 4H5W A; 3SK3 A; 4PKG A; 3G4S N; 5A2Q O; 3LPU A; 3KWI A; 3SNN A; 4KH4 A; 2VYP A; 4JKG B; 1Z05 A; 4M41 A; 2NRV A; 3QML A; 4YOW A; 1M1K O; 2Q36 A; 4JI1 K; 1NGC A; 1J53 A; 2ZE2 A; 5AQP A; 3NF9 A; 3EE8 A; 3V4I A; 3RRG A; 2QKK A; 1GLA G; 3OJS A; 3GBT A; 2BDP A; 3KK7 A; 1JL1 A; 4HTL A; 2NRW A; 1UAX A; 3CFO A; 4I6M A; 5GIP A; 2B5J A; 3CXC M; 4B9M A; 1WSF A; 3B8A X; 3AVA A; 4Z4H A; 4I7F A; 1VQO N; 4BRL A; 1HYZ A; 4CJ5 A; 5GAD P; 4JI5 K; 1IBL K; 2F8T A; 5GAG P; 3HVT A; 3BY5 A; 1UA0 A; 4ILG B; 4M3X A; 4GVE A; 4Z4G A; 1OH7 A; 1TYQ B; 3WXI A; 1JLE A; 3TTD A; 1DTT A; 4DTU A; 1DT9 A; 1VQL N; 1T8E A; 3C6H A; 2HBJ A; 3LP2 A; 3KKR A; 2ZM6 K; 4BDZ A; 1DLO A; 3DLH A; 2AJQ A; 2FBV A; 4C8M A; 1UOC A; 3T1H K; 3SBT A; 4F9O A; 4IO8 A; 4ELT A; 3SBG A; 5DM6 L; 2Q3S A; 2P5G A; 3L8B A; 4CEE A; 4A62 A; 3CJ7 A; 4DLE A; 3F9K A; 2ZGY A; 3BF3 A; 4FPA A; 3RSE B; 2ASM A; 1NGA A; 3VN5 A; 3TAM A; 4MLE A; 5B8H A; 2YHB A; 1NGI A; 2RPI A; 2D0B A; 1G15 A; 1OH5 A; 2P9K B; 1OKJ A; 4DQS A; 2UYT A; 4Y1C A; 4LD0 A; 1RBR A; 1FW6 A; 2E5L K; 1TUU A; 4JV5 K; 3K5L A; 3KWG A; 2HHS A; 3TAQ A; 5C0Y A; 3AAP A; 1NGG A; 2IVN A; 1HX1 A; 2V7Z A; 4B1Y B; 4CZJ A; 5KQ8 A; 1MA9 B; 4CW7 B; 3VA0 A; 4GY2 B; 1NGH A; 1RT3 A; 4CFB A; 4CZG A; 2FBY A; 4V19 S; 5AR0 A; 5FPE A; 4WQ5 C; 3M8R A; 1HNW K; 3RMD A; 2H3G X; 3NBP A; 3G0Z A; 1YUW A; 5CHI A; 5HL7 L; 1QSL A; 3ZSY A; 3UKR B; 4FLT A; 2P9L B; 1TL3 A; 4IDH A; 2QA4 N; 1TK5 A; 1VQ9 N; 4JS4 A; 4IFY A; 1CXQ A; 3JSM A; 1BHL A; 4M3W A; 3MCA B; 4C23 A; 4CER A; 1SKW A; 3E1Y A; 3FLC O; 1ILY A; 4DQ8 A; 4UQG A; 4LSN A; 3I0R A; 4DR5 K; 2IIR A; 3OYN A; 4F3O A; 3WNF A; 1N6Q A; 1REV A; 1K9M O; 4CI6 A; 3G25 A; 4A59 A; 1RDU A; 3UIQ A; 3CMA N; 2UUB K; 3M1F A; 3VA3 A; 3AA4 A; 5FRO A; 3K57 A; 5AQZ A; 1L3V A; 3VQ6 A; 1SQK A; 4B1X B; 3RTV A; 1KD1 O; 4FWS A; 3HP6 A; 3CJB A; 2NRR A; 3A5M C; 5EXW A; 3LP3 A; 1IKX A; 5KGX A; 1NKB A; 4CHO A; 1S6Q A; 1WLJ A; 4BE1 A; 4B3S K; 4WCE L; 5EU7 A; 2WTU A; 4B1U B; 4DF4 A; 3RMC A; 4B08 A; 2GWK A; 3J81 O; 4XH4 A; 3KK1 A; 4A57 A; 4RTF D; 4FK4 A; 4DV4 K; 1BOT O; 4CJ3 A; 2VCP A; 2KZM A; 2QWN A; 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