2ZGZA

Parm with gmppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
molecule keywords Plasmid segregation protein parM
molecule tags Structural protein
source organism Escherichia coli
total genus 98
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA01
4CZHA 4JD2A 3VENA 1WOQA 4IO8A 3VGMA 1X3MA 3LL3A 4IWVA 5FPNA 2DPNA 3BF3A 5F1XA 4HTLA 5JMVA 1NGCA 4KBOA 1QQOA 1GLLO 3QFPA 3BUZB 2Q1NA 3H45C 5F0XA 5AQNA 1BDGA 1G99A 3G25A 4CD3A 1Z05A 2P9IA 2QWMA 5KQDA 3F9MA 2P9SA 4CZJA 5BR9A 4BROA 2Q0RA 4BRIA 4BR9A 3WXIA 5AQYA 4BC3A 2F9WA 2YI1A 3AAPA 1BO5O 4WYBA 5EXWA 2QWRA 4EIAA 4FOIA 3UKUB 3LDPA 4E1JA 3DXMB 2J4RA 3A5NC 4BR2A 4FPBA 3O4WA 2P9LA 4I6MA 3LM2A 4FL9A 2V7YA 3ZETB 4H0OA 4B1VA 5E26A 4B1YB 2GTDA 3SK3A 4ISEA 4BRDA 4FWRA 3ULEB 5FPEA 3ATVA 3SJHA 1MDUB 3D2EA 2AP1A 4A2AA 3VERA 3CI5A 1HKCA 2BUPA 3MN9A 4FWQA 4JHDB 4BC4A 1KAZA 1MWMA 3J8AA 5LJVA 3QFUA 2Q97A 5EOYA 5CE3A 2QWOA 5JLHA 4RCHA 4H0PA 2E2OA 1GLDG 2GUPA 3MN7A 3H6EA 3UKRA 5FPMA 2ASMA 4GY2B 4RTFD 5E84A 3H3NO 3MDQA 4A61A 4BQZA 5AZIB 3O08A 1EQYA 3FGUA 1TYQB 2D1KA 1V4TA 4EFHA 4PKHA 3VETA 2ZF5O 3O6WA 3WXKA 1NGJA 2V52B 2HF3A 5AFUH 1TUUA 4CZEA 5AQVA 2HMPA 2WUSA 5BPLA 4BGAA 2NZTA 3A5MC 4BG9A 1IJJA 1HKBA 3QBXA 3WXLA 2P9PA 3CJ9A 3DXKB 3VEXA 4FPAA 5AQMA 4FWLA 4BRKA 1D4XA 4YDUA 1GLFO 2A3ZA 1JCFA 1XQSC 3AY9A 4FWOA 4DHYA 4H5TA 1U6ZA 4PKGA 3VEVA 2IVNA 3HZ6A 1HJOA 3QMLA 2E2QA 2P9UB 5AQPA 3ZX0A 2P9IB 3A0IX 1J6ZA 1U2VA 2P9KB 2HF4A 2P9NA 3D2FB 4L3QA 3IMXA 1OKJA 4ISFA 2E2NA 4BRMA 2VWBA 2CGKA 3ENHA 1DKGD 4DB3A 3H1QA 3HSCA 3LDNA 3SMSA 5AZJA 3AAQA 4A62A 5B8HA 4BC5A 3CJBA 1GLAG 3B8AX 4BRCA 3H46O 3FZLA 3WQTA 3O1WA 5I9EB 4WQ5A 1Z6RA 1XC3A 4BREA 5BRFA 3VGLA 3GG4A 2GELA 5AQOA 5KPTA 2ASOA 3HI0A 3CERA 4K43A 4O8KA 4BRHA 3ZX3A 4AM6A 1T6CA 3VGKA 1ZBSA 3FFKB 5AQRA 1QZ6A 2QWLA 5AQZA 2E8AA 1NM1A 5AQTA 2IIRA 1E4GT 3ZEUA 1HLUA 3VEZA 1SAZA 3L0QA 3KZBA 4H0XB 1HKGA 3WXJA 3FZFA 3UKRB 3R6MA 1HPMA 4MLHA 3VEOA 3BF1A 3HBTA 3CJ7A 5KPZA 2YHXA 3C7NA 1HX1A 2I7NA 3MN6A 1SQKA 1NGFA 1YVNA 2PBDA 3CJCA 2E2PA 3MN5A 3WEEA 2QWNA 3KHYA 2A6AA 4QS9A 2CH5A 5AQHA 5LJWA 2V7ZA 5AQXA 1NGGA 1QHAA 3JXUA 1WUAA 5ELZA 2QW9A 5ADXA 4B1ZA 3QICA 3ENOA 4MLEA 2F9TA 3M3ZA 4CJ7A 3GE1A 2GWKA 5BRHA 4Y0WA 4H0TB 2YCHA 3LDQA 4H5RA 4CZIA 3O1BA 1GLEG 4PKIA 1E4FT 3RSEA 3VPZA 4JN4A 1SZ2A 3SMPA 1K8KA 4CZMA 3ZX2A 5AQWA 5TKYA 4NB4A 4GNIA 3U8XA 1U2VB 2P9NB 3UB5A 4B1XB 4XEIA 1XUPO 2A5XA 2D0PA 3EKUA 5BPMA 1IG8A 4M7XA 5JICA 3MK6A 2FSJA 4FWPA 2A40A 3DWLA 4CZLA 3IFRA 2FXUA 4FWSA 5KQ8A 1S22A 4AM7A 4JD2B 2AA4A 5LY3A 2YJFA 1X3NA 4H0VB 3CHWA 1JCEA 1BA0A 2EWSA 3FZHA 3WT0A 3UKUA 1GLJO 2PAVA 4XH1A 2VYPA 3DJCA 4WQ4C 4IXCA 3ZETA 1T6DA 3MMVA 1KXPA 1NGHA 3LDLA 3WUHA 3ZEUB 2ZGYA 2P9SB 3ULEA 2D0OA 1ATSA 5AQJA 4DCHA 4JHDA 3CQYA 5JLFA 3I8BA 3C0BA 3IUCA 5AQFA 1BG3A 3EO3A 1BA1A 1NGBA 3BP8A 1Y64A 1BWFO 2Q2RA 3ATUA 5BPNA 1DGKN 4K25A 4M7YA 4BRPA 2P9LB 4I6MB 2NLXA 5FPDA 5BN8A 3VF6A 1NGEA 2E1YA 3FR0A 4B1UB 4BR5A 5AR0A 5AQGA 2I7PA 3H1VX 5AZIA 3D2EB 3GBTA 4CBXA 2Q31A 2BTFA 1QZ5A 1TYQA 4M63C 3WQUA 4BR0A 5AFUA 3KVGA 4CZFA 3FE1A 5AQLA 2ITMA 5AQIA 3EN9A 2W40A 2YJEA 2E20A 1C0FA 1RDWX 3AARA 4PL8A 3RSEB 2QXLA 3VESA 1V4SA 3M1FA 3U9DA 3EKSA 4FWMA 1BU6O 1YAGA 3QBWA 2GEMA 3FLCO 2QM1A 4NO7A 3DXKA 4BR4A 1KAXA 1QQNA 2CGLA 1GLBG 4BRGA 4CBUA 1MWKA 4YDUC 4BRNA 4EHTA 4IJNA 4PL7A 1NGDA 5BREA 2KHOA 4MO4A 1NLVA 2YHWA 3D7EO 4B1WB 5KPRA 2W41A 3OHRA 3GOIA 2P9UA 4XH4A 1JCGA 1ATNA 3I33A 2HOEA 1P8ZA 2P9KA 2OANA 1ZXOA 4K41A 4ISGA 3D2FA 2ZGZA 1S3XA 2IVPA 5EY4A 4BGBA 5AQKA 3A8YA 2E1ZA 4RWTA 3HM8A 2P9PB 1R59O 3M6GA 4BR7A 3TU5A 4BQLA 4FOEA 3EL2A 4BRQA 2CH6A 1KAYA 4FWKA 4J8FA 4CZGA 4WQ4A 3R9PA 4H0YB 3W0LA 4A2BA 4WQ5C 3QB0A 2ASPA 4CBWA 3S41A 3UE5A 3CJAA 1GLCG 3ID8A 3MCPA 3GDQA 4BVPA 4EAHD 4H03B 1NGIA 3CJ1A 1LOTB 2GWJA 4C23A 3O80A 3FZKA 4DQ8A 2CGJA 1ATRA 2QWPA 1RFQA 5EVZA 5F2RA 5AZJB 4BRLA 4BG8A 2H3GX 3CETA 1RGIA 3VEWA 2A41A 1ESVA 1Q18A 2Q36A 4O5FA 4QS8A 3A5OC 2NRHA 3QDKA 3R8EA 3W3DA 1T44A 4IZ9A 3BEXA 3U9ZA 4CI6A 2E88A 2A42A 2FSNA 4IJAA 1NBWA 4HWIA 2Q0UA 3O8MA 2V51B 4MO5A 3VEYA 3O5BA 3DXMA 4H5WA 2FSKA 2FF6A 3DAWA 4FO0A 1LCUA 4H5NA 3LM9A 1MA9B 4FSVA 5AQSA 4CZKA 1HUXA 2FLOA 1ZC6A 4BRAA 4CD1A 5BRDA 1X9JA 2VCPA 4B9QA 4Z94A 1NWKA 2UYTA 3EZWA 2IVOA 1YXQA 3SLCA 2ZWHA 4H5VA 3C7NB 5EX5A 3JS6A 3TPQA 4F9OA 3VOVA 3WEEB 2YHYA 5AQQA 3CQXA 4EHUA 1BUPA 4BVOA 3VF2A 1YUWA 3LDOA 3VF4A 4BRFA 5BN9A 4FWNA 1H1VA 4BC2A 2D4WA 4QS7A 3GL1A 1NGAA 3IDHA 1TUYA 1CZAN 3P4IA 4JNEA 5ADXH 1NMDA 2FF3B 1QQMA 4JAXA 4XH5A 3L6QA 1BOTO 4K42A 3FZMA 3H3OB 5AQUA 3A5LC 3L4IA 1K8KB 1DEJA 3U4LA 1C0GA 3CIPA 2QWQA 3HTVA 4LC9B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LSLA 1B92A 5C0YA 1S6QA 4JD2A 2W6LA 3LL3A 4DG1A 1WSHA 1NGCA 4OKKA 1VQKN 1GLLO 4PHTX 3BUZB 5C2FA 1KVBA 2KQ2A 2D0BA 2EX3A 3O3GA 2QWMA 4JS4A 2IAJA 1LWEA 4BROA 3WXIA 4ILGB 4WFBL 1U4BA 2G8KA 4DQPA 3ZSQA 3VQ5A 4LFBK 3M8QA 4Y1DA 4DFKA 4RW6A 4FPBA 1ASWA 4AQYK 3P31A 3PX6A 4FL9A 3AGKA 1O1WA 1O13A 3NHGA 4B1YB 3SK3A 4ISEA 3L2WA 5I42A 4FWRA 5M1PA 4AF1A 1JLQA 5FPEA 1OH5A 3ATVA 3SJHA 1NNEA 4ELTA 1MDUB 3D2EA 4B9MA 3VERA 1EX4A 4FWQA 3JAMO 3OS1A 4FJXA 3DRRA 3QEWA 3PV8A 3QFUA 3AV9A 3RMBA 1TV6A 5JLHA 2UUAK 2HHWA 3AA2A 3UKRA 4CGHA 5FPMA 5E84A 1Q8IA 3NBPA 2UUBK 4ZTFA 5GINA 4JK8A 1QVGM 1T05A 4M3ZA 1ILYA 4PKHA 3VETA 2ZF5O 3MXJA 1SL1A 2V52B 2HF3A 5AFUH 3QEPA 3PIOL 1KQSM 4J2AA 2NZTA 5DM7L 4BG9A 3SUNA 4DU1A 2B6AA 4FJHA 3QBXA 4NXMK 5AQMA 4FJIA 1GLFO 3OJUA 2VGMA 2B4JA 1IBKK 2JGUA 1XQSC 3AY9A 2X6NA 1U6ZA 3VEVA 2IVNA 1BHLA 1KRPA 3DRSA 3A0IX 1DT9A 1U2VA 4FK0A 4DR3K 3SQ0A 3IMXA 1OKJA 4J2EA 4J2DA 3CXCM 4ISFA 2YNFA 3ENHA 4CESA 4DB3A 4GV3A 4W5QA 4DLEA 5KGWA 4AHCA 1J53A 3HSCA 5AZJA 4DTPA 5B8HA 4B3SK 1KD1O 1GLAG 4BRCA 2OPSA 3WQTA 3DLRA 4DV6K 1S6PA 1MU2A 4NYNA 4E1MA 4WQ5A 2HNDA 1VQON 3VGLA 1RTDA 1BI4B 3LALA 1YTAA 1X9SA 3J7YP 5AQOA 5KPTA 3I56N 4DTRA 1U45A 2VQFK 4FXDA 2IS3A 3ZX3A 2QI2A 3VGKA 3MWPA 3FFKB 5AQRA 3CM6A 4C8LA 1C1AA 1NJWA 4LF8K 3G4SN 2LSNA 2PYJA 2NNWA 3T3FA 4CFDA 4H0XB 3KZBA 3P1GA 1HPMA 4MLHA 2G8VA 1RTHA 3CJ7A 5HLFA 5KPZA 1UOCA 3NF7A 5HROA 3CJCA 3MN5A 3VMFB 3QEXA 3QIOA 4QS9A 1JKHA 5AQHA 1JL1A 1SL2A 3TTDA 2V7ZA 3OYJA 2KTQA 2XY6A 4DSKA 3LZIA 4GV9A 3P83D 5ELZA 4WE1A 1HYZA 3NGYA 3K0SA 5J2NA 3SCXA 4C8OA 1VRTA 3OYNA 3KKSA 1S1UA 3L3UA 3M3ZA 3GE1A 4GVMA 5BRHA 4Y0WA 2GUIA 3VQ6A 4PY5A 4PQUA 3O1BA 3THVA 2HVIA 3S3OA 1SZ2A 3ZX2A 5AQWA 1WN7A 5TKYA 1L3VA 3U8XA 3HPHA 4KB0A 4DTJA 4B9TA 2G8HA 2HB5A 1TKDA 1ZBIA 5C24A 1Y97A 4OGEA 2RF2A 2JWKA 4XEIA 2Y1JA 4DFJA 3VQ4A 5JVHL 2A5XA 2P5OA 5K14A 3L2VA 4CVNE 4F3OA 1IG8A 4FM1A 4B3OA 3LANA 4K8XA 3G0ZA 5JICA 5KRTA 2HNYA 4FJLA 1VQ8N 4H4MA 3IFRA 4BE2A 1ASVA 1BCOA 4DTOA 4AM7A 1OH7A 4BDYA 4Y1CA 5LY3A 3CCMN 1JCEA 2EWSA 4PA1A 2D0CA 3DJCA 1FJGK 3LDLA 5M1OA 1BIZA 2NRZA 3WUHA 2P9SB 1IG9A 4GKKK 4DCHA 2P5GA 5JLFA 3C95A 4FLTA 3IUCA 1I94K 4B9SA 3OS0A 1TL3A 1BA1A 3TARA 1NJZA 1XNRK 4M42A 1NK9A 1BWFO 4DSEA 5BPNA 4O5BA 1DGKN 3NF8A 2G8UA 3SUQA 4KTQA 2QEXN 2QKBA 4YOWA 4U67L 2NLXA 5FPDA 4M41A 3L8BA 3NVKA 1K8AO 1HNIA 4KHQA 2E1YA 4B1UB 1TL1A 2O4GA 3OBYA 1XNQK 4CBXA 2Q31A 2BTFA 2ZM6K 1QZ5A 4NCGA 5H1SQ 3A2FA 4CZFA 4CW7B 1IKXA 1RBVA 4Z4GA 2OPPA 3AARA 5C2DA 3R3LA 4PL8A 1HYSA 3D45A 3ASMA 3O4QA 4KFBA 1HNVA 2HHVA 3FLCO 4DR7K 5KI6A 1KAXA 4YOUA 3T69A 4CF0A 3OS2A 4FYDA 5BREA 3D7EO 2JWLA 1K73O 5KPRA 4IEIA 4FJGA 3GOIA 1YIJN 3PUFA 3ZSZA 1ATNA 2EHGA 5JVGL 1Q7YO 2HOEA 2Z1HA 1HNWK 4JKDA 3MAQA 4PUOA 3OYFA 5AQKA 1VSMA 4RWTA 4JKHA 1R59O 3TAMA 1TKTA 4FLUA 4DTMA 5KTQA 3CMEN 4FZYA 4BQLA 3EL2A 4E19A 2CH6A 3RR8A 4WQ4A 4DTSA 5M1QA 4FCYA 2HSTA 2HHXA 4WQ5C 3OJSA 3SYZA 1BI4A 1JL2A 1TK0A 3S41A 3UE5A 4OPJA 1A5WA 2FBVA 3GDQA 3AVHA 4H03B 3LWLA 4OKJA 1T8EA 4O0IA 3T19A 2UUCK 1DLOA 4BRLA 1N8RO 5M1KA 2ZQBA 4DF8A 1RGIA 4CEQA 3NE6A 1YITN 1JLEA 4O5FA 1LAVA 3A5OC 3RWUA 1J5OA 2Z1IA 1D9FA 3G10A 4B9VA 4HWIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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