3A0IX

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of novel 3,6-disubstituted 2-pyridinecarboxamide derivatives as GK activators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 167
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a0iX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3a0iX01
3FFKB 1ATSA 1LOTB 3GE1A 5BN9A 3TPQA 3VGMA 4FWOA 3MDQA 2H3GX 2FF3B 4K25A 2PAVA 4BREA 1NGGA 1JCEA 5JMVA 3H1VX 2VWBA 4H5TA 2A5XA 4K42A 3D2FA 3LDPA 5AR0A 3MN7A 2DPNA 3KVGA 3L0QA 1SZ2A 4FOEA 1U6ZA 4IZ9A 2W41A 5JLFA 4Z94A 2QWPA 5EXWA 3FLCO 2ITMA 1LCUA 3CI5A 3HM8A 4H03B 1HLUA 1BO5O 4O8KA 4PKHA 1HKCA 2ZGYA 3DAWA 3ZETB 3ATUA 2D0OA 1WOQA 2P9LA 4EIAA 5BREA 3ENHA 1Z6RA 2E1ZA 5AQRA 5F1XA 3QDKA 1QHAA 3FZKA 3MMVA 4FPAA 5BRFA 3QB0A 2UYTA 4BRQA 2A40A 3BEXA 3FZMA 3H3OB 3BF3A 3ZX0A 3G25A 1IJJA 1X3MA 3UKRA 3FZLA 4JAXA 3UKUA 2YJFA 4XEIA 1HKBA 4A2AA 1DGKN 3WUHA 1BA1A 2D0PA 3HZ6A 4BR5A 3O08A 5AQJA 1DKGD 1ZBSA 3AAQA 2IVOA 4AM6A 1Q18A 3D7EO 3QBXA 3CQXA 3JS6A 4BC2A 2ZGZA 1K8KA 1GLFO 2E2PA 3DXKA 2QWLA 2YHWA 2E2QA 1RDWX 3WXIA 1MA9B 4FPBA 5AZJA 2IIRA 2P9UB 4CZFA 2BUPA 3IFRA 5FPDA 1JCFA 1GLCG 4BRHA 3WEEB 4K41A 3IMXA 2P9KB 2V7ZA 2V7YA 3D2EB 4XH1A 3C7NB 3RSEB 3MCPA 4JHDB 4JD2A 3DWLA 1CZAN 2NZTA 4I6MA 3EZWA 1YAGA 4BRFA 3UE5A 3SLCA 4H0TB 5FPNA 3U9DA 3KZBA 2P9SA 4MO5A 4ISEA 4QS8A 3QMLA 5AQTA 2E1YA 1D4XA 1GLDG 2V52B 5AFUH 3VF4A 4CD1A 2FSKA 4FSVA 2QXLA 3VENA 4FWNA 4YDUC 5ADXH 4BG8A 4IJNA 2CH6A 1MDUB 4CZJA 1NMDA 3U8XA 1HPMA 1NGFA 5EVZA 3VGLA 3VF6A 4CD3A 3CERA 3VEYA 4A62A 4BVOA 3VF2A 3O6WA 4PKIA 1T6DA 3CJ7A 1SQKA 4AM7A 4BC3A 4BGBA 2CGLA 1QQOA 2HOEA 5LY3A 5AQGA 3GL1A 1U2VA 4RCHA 2NLXA 1GLLO 5BRDA 2P9IA 2P9PB 2I7PA 3WXJA 1HJOA 4E1JA 3AARA 2E2OA 3FE1A 4A2BA 1ATNA 2AA4A 3H45C 4EHUA 4BR4A 2FLOA 5AZIA 4B1VA 4BRIA 3LL3A 1C0FA 1V4SA 3W3DA 2P9NB 4BRNA 1BWFO 3CJ9A 1TYQA 4B1ZA 4MO4A 4O5FA 5AFUA 1GLBG 3IDHA 2ASMA 2FSNA 5EX5A 2E2NA 4CZMA 3L6QA 2ASOA 3IUCA 2QW9A 3ENOA 4BC4A 3FZHA 4FOIA 3BF1A 3ULEA 5CE3A 3WQUA 5TKYA 2IVNA 5AQOA 1C0GA 4BQLA 4DHYA 3EO3A 5KPRA 3I8BA 4DQ8A 1GLEG 4EAHD 4RWTA 2A42A 2Q36A 3HSCA 2QM1A 4J8FA 1YVNA 2QWMA 3CJCA 5BN8A 3VEOA 2A3ZA 1ESVA 4PKGA 1KAYA 2E88A 4YDUA 3VEWA 1E4GT 3U4LA 2D4WA 1NLVA 1NGCA 3O8MA 4KBOA 3F9MA 3EKSA 1G99A 3EKUA 4NO7A 1QQMA 5AQXA 5F0XA 3FR0A 4M7YA 3OHRA 4IXCA 5F2RA 5E84A 3ZETA 1GLJO 4BC5A 1NGBA 1X9JA 3DXMB 5AQVA 1Z05A 2GUPA 1BOTO 4BRLA 4B1WB 1NBWA 4BQZA 1YUWA 1KAZA 1NGJA 3TU5A 3UB5A 4CZIA 3WXKA 1NGHA 1QZ6A 2ZWHA 5FPEA 5KPZA 4A61A 4BRGA 3O5BA 4MLHA 3R8EA 2NRHA 5KQ8A 1BA0A 4WYBA 1NGDA 5AQHA 3O1BA 5AQFA 4B9QA 1OKJA 2GWJA 1XC3A 3CIPA 4B1UB 5BPLA 2ZF5O 3CJBA 2ASPA 4PL8A 3U9ZA 3QFUA 3ATVA 3B8AX 3M1FA 1KAXA 1T6CA 3CETA 2E20A 3LDNA 4H0PA 4M63C 4BRMA 3HBTA 3ZEUB 4FWRA 1RFQA 3ID8A 4F9OA 4H5RA 2KHOA 1T44A 4DCHA 2FF6A 2P9UA 4GY2B 2CGKA 3VPZA 1WUAA 3FGUA 3W0LA 4FWLA 5JICA 2HF3A 2GWKA 3JXUA 2Q0RA 3H46O 3WEEA 3VESA 2P9KA 3L4IA 2WUSA 3D2EA 3C7NA 1DEJA 1YXQA 4HWIA 4JHDA 3FZFA 3RSEA 4H0XB 1HUXA 3VOVA 2AP1A 4ISGA 2YCHA 5I9EB 2GEMA 3AAPA 3GDQA 3D2FB 2QWQA 4IO8A 3VEZA 3R9PA 2GELA 3J8AA 2QWNA 1RGIA 5AQKA 3S41A 1ZXOA 5B8HA 3LDLA 4FWKA 4NB4A 1XUPO 4H0YB 5AQPA 2P9LB 3HI0A 1TUYA 2YHXA 4H5VA 3A0IX 2Q1NA 2F9WA 4RTFD 4CZLA 5JLHA 2YJEA 4DB3A 4QS9A 1BDGA 3VEVA 2CGJA 2IVPA 4FWPA 1JCGA 5ADXA 2HF4A 1EQYA 1BU6O 1V4TA 3UKUB 3UKRB 4FWMA 4CJ7A 3A5NC 4BR9A 3P4IA 2P9PA 5AQUA 3M6GA 2PBDA 3MN9A 1KXPA 1QZ5A 5ELZA 2F9TA 5AQQA 5AQMA 4HTLA 1MWMA 3KHYA 4BRDA 4WQ5C 5AQSA 1BG3A 5AQLA 3A5MC 4QS7A 2FSJA 2I7NA 3EN9A 4FO0A 1K8KB 3HTVA 2P9NA 4LC9B 3CJ1A 3VGKA 4BR0A 3DXKB 4L3QA 4BRAA 4JN4A 3SMPA 3GOIA 3SMSA 3VERA 5AZJB 4CZGA 5BRHA 3QBWA 2J4RA 4H5WA 2Q2RA 3WT0A 1S3XA 3I33A 5KQDA 3CQYA 2CH5A 2HMPA 4CZEA 1ZC6A 1BUPA 3LM9A 4WQ4C 1HX1A 4FWSA 4JD2B 1NGIA 4XH4A 1NGEA 1S22A 3QFPA 2E8AA 4I6MB 2EWSA 4PL7A 3ZX2A 3SK3A 4BRCA 1NWKA 1GLAG 4JNEA 2P9SB 3H6EA 3WQTA 3ZX3A 1NM1A 3MN6A 3M3ZA 5EY4A 3H3NO 5LJVA 3LM2A 3VETA 5KPTA 2Q31A 1SAZA 3MK6A 5AQNA 1E4FT 1P8ZA 5AQIA 3BUZB 4BR2A 5LJWA 3QICA 4GNIA 3A8YA 1XQSC 4MLEA 5FPMA 3SJHA 4Y0WA 4B1XB 2YHYA 3DXMA 2GTDA 1NGAA 4EHTA 3O1WA 4H0OA 1X3NA 1MWKA 4BRPA 3A5LC 4EFHA 4CZKA 4BGAA 2OANA 1QQNA 3BP8A 4CZHA 1HKGA 1U2VB 2QWRA 3LDQA 1R59O 2BTFA 1J6ZA 2P9IB 4H0VB 4BR7A 3WXLA 3O80A 2FXUA 4B1YB 5EOYA 4WQ5A 4C23A 1H1VA 3GG4A 2A41A 3A5OC 4H5NA 4CBXA 3CHWA 3EL2A 5AZIB 3H1QA 5AQWA 1TUUA 5AQZA 5BPMA 2A6AA 1TYQB 4K43A 2Q0UA 2Q97A 1IG8A 3CJAA 3MN5A 2YI1A 4BROA 5AQYA 5BR9A 2VYPA 5E26A 5BPNA 3LDOA 3AY9A 2W40A 3ZEUA 3O4WA 3R6MA 4WQ4A 4IWVA 4BRKA 4BG9A 4ISFA 2VCPA 3C0BA 3ULEB 2D1KA 1Y64A 3VEXA 4XH5A 4CBUA 4M7XA 4FL9A 4BVPA 2V51B 1ATRA 4IJAA 4CBWA 4FWQA 4CI6A 2QWOA 3DJCA 3GBTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BCMA 5CR4A 1LOTB 3VGMA 4K25A 1QQCA 2PAVA 4GMJB 2A5XA 4O0JA 4FM0A 3I56N 1B9FA 1KRPA 3KD5E 4R5PA 3E1YA 4Z94A 2BDPA 2QWPA 2ITMA 3S3MA 4FZZA 5HRSA 3KLGA 4E7HA 3ATUA 3ZSXA 3CCVN 2E1ZA 2O8DB 3FZKA 4DTPA 5BRFA 3PLAA 4DU1A 1SL2A 2HHXA 3HK2A 2UUCK 3LP0A 1IJJA 4FK0A 4DQSA 4CIGA 4QOZB 2YJFA 1QE1A 3OYCA 3NMUA 2JWLA 3ZSVA 3VQ4A 1RDDA 3EZ5A 1LAVA 1NG9A 2GUIA 4DUZK 1S72N 3G6EN 3SCXA 2IVOA 4AM6A 1Q18A 1JLFA 3C6TA 1VQMN 3CQXA 3B6OA 2O8BB 4PWDA 2ZGZA 3LPUA 3V9WA 4CHOA 4ELUA 4JRQA 4FJ7A 1MA9B 4FPBA 4DSLA 3TARA 3SAGA 5HLFA 4E0DA 3EY1A 3KLFA 4BRHA 4CJRA 4K41A 1WBBA 2P9KB 3RSEB 3D2EB 3C94A 4NYNA 3K0SA 3EZWA 3CC7N 4M3RA 3OS2A 3TANA 3SLCA 2WOMA 2P9SA 4FLWA 1Q9YA 4QS8A 1KD1O 1EO1A 1ZBFA 5AQTA 5M1KA 3WNGA 3TAQA 4A59A 4CD1A 3ZSYA 4DTRA 4PQUA 2G8VA 5ADXH 4IJNA 4B3MK 4CF0A 4CD3A 5EVZA 3VF6A 4KHPK 4BVOA 4I2QA 3ZSRA 3O6WA 3NVMA 4PKIA 1VSKA 3AVIA 4BC3A 4BGBA 1U45A 4LH4A 1S1TA 3PSIA 2X6SA 4C1NK 4FJ5A 1U2VA 3OYKA 1ZBIA 4ZHRA 1O1WA 5BRDA 1GLLO 5CZ1A 2HVHA 2P9PB 3WXJA 1JXEA 4QAGA 4CERA 1D5AA 4E1JA 4CF8A 3AVBA 3FE1A 3KKRA 1TK0A 4JI3K 2F4VK 1K73O 5KRTA 4RW6A 3MCAB 1C0FA 2Z1JA 5HBMA 3SBGA 1J54A 3QEWA 2P9NB 1TYQA 4B1ZA 4MO4A 5J2MA 3NF7A 5GAEP 1VSDA 1TVRA 3BDPA 3VQPA 3QNOA 3L6QA 1ZYQA 3SYZA 3IUCA 3ENOA 3RMDA 4KTQA 3HOSA 3ULEA 5CE3A 4CF1A 3CFRA 1L5UA 4CFAA 4DHYA 4BQLA 5KPRA 3EO3A 4CIFA 4EAHD 3CFPA 2A42A 1T7PA 3OBYA 3ZYYX 2QWMA 3N4PA 4CE9A 5BN8A 1HYSA 5SWMA 1REVA 3ZT4A 1KAYA 1E4GT 3U4LA 2D4WA 3I0SA 3LWMA 3PV8A 2QXFA 4H4MA 1EWQA 1G99A 3EKUA 1SL0A 3HVTA 2NUBA 1QQMA 5AQXA 4M7YA 3HO1A 1BQNA 3MXJA 2DFHA 4CEBA 3V4IA 3ALYA 4N41A 2O8DA 4GV6A 3UB5A 2AJQA 1JL2A 1N8RO 4DFKA 2ETJA 3G71N 4IEIA 5FPEA 4OPJA 4A61A 5A2QO 4Z4CA 3O9QA 4MLHA 2NRHA 2VG6A 1DTQA 1BA0A 4DUYK 1UAXA 3TAPA 4C8NA 3OA9A 4DR1K 5CYQA 4B9QA 3RRHA 5CHIA 3E01A 4DQPA 3V9XA 4PY5A 3CJBA 4LY7A 1RBUA 3O9UA 4EZ6A 4JI2K 1LAWA 3ZSWA 5H1SQ 1RCHA 2F7TA 4CFCA 1U4BA 3CETA 3KTQA 1Q86O 1BGXT 2HB5A 4DTXA 2HHHK 2O8BA 4CEOA 3ZEUB 3ID8A 3K9KA 3THVA 1ILYA 1T44A 4JKFA 2FF6A 3VPZA 2OZMA 3W0LA 4EP5A 2HNZA 2GWKA 2QTDA 5HL7L 2BGGA 3VESA 2P9KA 3TSUA 3RSEA 3D2EA 1YXQA 4F3TA 5AJ3K 4ILHA 2KKZA 2AP1A 3V9UA 4DTOA 5GINA 3AAPA 3GDQA 3D2FB 4YOVA 1QVGM 1TGOA 2QWQA 3VEZA 3CCJN 3ZCMA 3SQ0A 1IBMK 4FJJA 2QWNA 3L3VA 1EX4A 4CJSA 1TKZA 5B8HA 4BE0A 4CJLA 4M3YA 3HI0A 1RBTA 3S9HA 1ZBLA 2Q1NA 4DR7K 4CZLA 4CJKA 4DU3A 3VQAA 3DM2A 1VSIA 2CGJA 2IC3A 2IVPA 1JCGA 3L8BA 5ADXA 4A57A 4CGFA 1EQYA 3IKMA 1V4TA 3UKUB 1HYVA 1W7AA 4LF8K 4FWMA 4CJ7A 4BR9A 4CHNA 2P9PA 4CJ4A 4OLAA 1KXPA 1LW2A 5AQQA 4B9TA 3KHYA 4JI0K 3R3LA 3V6DA 5AQSA 3CPEA 3TWHA 3VQQA 5AQLA 5T7BA 3DLRA 1UWBA 4FO0A 3PX4A 4Z4HA 1K8KB 2P9NA 3NGYA 4AHSA 4BRAA 4JI8K 4FYDA 4O55A 2JLEA 1W97L 3VERA 3AVGA 4CZGA 1S3XA 1HRHA 3O3GA 4NXNK 2UUAK 1SUQA 4CZEA 1ZC6A 1BUPA 3VQEA 3RMCA 3ZSQA 3CM6A 2OA8A 4WQ4C 4DG1A 3L2VA 4JD2B 1NGIA 1VAZA 3P1GA 4I6MB 3ZX2A 4JI6K 3H6EA 1VQ6N 1S9GA 1NM1A 2XO7A 5EY4A 3O4QA 3J7ZO 4UY8O 3THXB 3VETA 1JKHA 2Q31A 3VA0A 3KWGA 3ASMA 1BISA 2G8UA 4BE2A 2HSTA 1P8ZA 3TAMA 3BUZB 4BR2A 5GAHP 2RE2A 4LF9K 4GNIA 3BY5A 4DFMA 4V19S 3ISNC 2QKKA 4MLEA 4Y0WA 2KQ2A 4IFEA 4B1XB 3AVAA 4CF9A 3CCUN 3AA5X 3O1WA 4JRPA 1X3NA 1MWKA 2ZJQL 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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