3A0IX

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of novel 3,6-disubstituted 2-pyridinecarboxamide derivatives as GK activators
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glucokinase
total genus 167
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a0iX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3a0iX01
4CZJA 3UKUA 1MWKA 1C0FA 4XH1A 3SMSA 2WUSA 3KHYA 4FWNA 5BREA 4BR2A 4K25A 3H6EA 2J4RA 3VERA 4JD2A 3ENHA 4M7XA 1LOTB 5TKYA 4BR0A 1WUAA 1NMDA 1U2VB 2D4WA 5F2RA 4HTLA 1ZXOA 5JICA 3VPZA 2VYPA 4BR5A 4BC2A 1EQYA 1DGKN 4CZFA 4CZEA 1NGGA 4A61A 5BRDA 3A0IX 3BUZB 5AQUA 2ASPA 1ZC6A 3H1QA 2ZWHA 2BUPA 3B8AX 2E2NA 4FSVA 2DPNA 1HKCA 1SAZA 5AQXA 1BO5O 4BVOA 1DKGD 4MO5A 4BRFA 5KPRA 3R6MA 1RGIA 3U9DA 2CH6A 2VWBA 3UKRA 3QBWA 5EX5A 2A6AA 1YVNA 4H03B 1QHAA 4H5WA 3CQYA 3A5LC 4PL8A 2P9SB 4M63C 5AQHA 3WXKA 1BU6O 2D1KA 3LM2A 3MK6A 5ELZA 1YAGA 4Y0WA 2E2OA 3DXMA 3M6GA 5LJWA 1GLLO 3M3ZA 3DJCA 2QWRA 4BR4A 2F9WA 2GWKA 5BPNA 4H0TB 5JLFA 4BG9A 5AQIA 1GLDG 1MDUB 4BROA 4C23A 3I33A 4L3QA 3M1FA 4FOIA 3VEXA 3GL1A 4O5FA 3FLCO 3O5BA 3EKSA 4BRGA 3QICA 4DHYA 5KQDA 2Q2RA 3DXKB 1TUYA 3LDQA 3MMVA 2KHOA 4PKGA 4IJAA 1T44A 4WQ5C 1TYQB 3LDLA 4Z94A 1JCGA 3HM8A 1NGJA 3BF1A 5AR0A 3H45C 4ISGA 3WXIA 4K41A 2PAVA 4DB3A 3L6QA 3ZEUB 4CJ7A 4XH4A 3WXJA 4BREA 3WEEA 4MLEA 1QZ5A 3SK3A 3EO3A 3H3OB 2QWLA 3DXKA 5AQYA 3I8BA 3ZETA 2YHXA 4CZLA 2PBDA 4BRLA 1WOQA 4H5NA 3D2FB 4A62A 1GLCG 2E1YA 3CJAA 4BRMA 1JCFA 3WQTA 3ZEUA 3VEZA 4JNEA 3CIPA 5AQZA 1K8KA 4BRAA 1NBWA 4WQ5A 2P9KA 3LM9A 3SLCA 4FWMA 4CD3A 4CBWA 3MN7A 1IJJA 3FZMA 3UE5A 3AY9A 4PKHA 5AZIA 3C7NB 3ULEB 4CD1A 4DQ8A 4BGBA 1SZ2A 2F9TA 4K43A 3CHWA 3CI5A 4BQZA 1BA1A 2P9IA 1XQSC 3VETA 4BRCA 1HPMA 2FF6A 2IVPA 1NM1A 2GTDA 4ISFA 4I6MA 3BEXA 3VGMA 3VENA 4BRIA 4GNIA 2FLOA 3FFKB 2P9PB 1HUXA 2ZGYA 3H1VX 2HF4A 2Q0RA 4B1VA 1RFQA 3MCPA 3QBXA 2W41A 3ULEA 2CGKA 3VF6A 5BN8A 3CETA 3W3DA 1R59O 1QQMA 3QB0A 5AQVA 3GOIA 5AQWA 4H5VA 3VF2A 4EAHD 4FWQA 1NWKA 3AARA 5JMVA 4QS9A 2E2QA 3ATVA 4H0YB 1GLBG 1XUPO 1ATNA 2E8AA 3L0QA 4K42A 5BRFA 5KQ8A 4HWIA 3MN5A 2P9PA 1ATRA 4DCHA 5JLHA 2E1ZA 2AP1A 3CJ7A 4IWVA 1V4TA 4FWRA 2Q0UA 1U2VA 3O08A 1ZBSA 3O1WA 3O80A 2V7YA 3QMLA 5KPZA 4B1WB 4YDUC 2ZF5O 2FSKA 4RTFD 4QS7A 5BR9A 2OANA 2P9UB 3ZX0A 4BRKA 1JCEA 4FOEA 2IVNA 4BR7A 4BVPA 4H0VB 2I7NA 3FZKA 4JHDB 1S3XA 1YXQA 4B1YB 4EHUA 1BUPA 3MN6A 4F9OA 3CJ1A 4H0OA 2FXUA 1NGHA 2IIRA 2NLXA 2NZTA 2P9NB 2D0OA 4CZHA 3VGKA 4BRPA 1DEJA 4XH5A 5EY4A 1RDWX 3DAWA 2CGLA 2P9UA 2E20A 5ADXH 2P9SA 4CZKA 5I9EB 2ASOA 3G25A 5AQPA 4YDUA 2VCPA 1J6ZA 1CZAN 3JS6A 3U4LA 4FL9A 3FGUA 1V4SA 3FE1A 5EXWA 3OHRA 3ZX3A 1YUWA 5AQNA 1TUUA 2H3GX 5EOYA 3BF3A 3GDQA 3IMXA 4RWTA 4KBOA 3A5MC 3WUHA 2ITMA 3UB5A 5AQFA 4QS8A 3A5NC 1KXPA 3VESA 3ID8A 2HMPA 2HOEA 2QWOA 2YCHA 4NB4A 2A3ZA 5BN9A 1GLJO 2A40A 2HF3A 1TYQA 3MN9A 1X3NA 5AQGA 1H1VA 4ISEA 5KPTA 4BC3A 4BGAA 2Q1NA 3L4IA 1KAYA 4M7YA 2YHYA 4BG8A 5AQQA 4B1ZA 1HX1A 2YJEA 5LJVA 3R8EA 3EN9A 4IZ9A 4CI6A 4BQLA 3AAQA 2QWNA 3VEVA 2FSNA 3HSCA 2AA4A 1C0GA 2V51B 4FWSA 4O8KA 4BRDA 4FWOA 4PKIA 1ESVA 3CJBA 2ZGZA 3D2FA 3R9PA 1NGCA 3C0BA 3UKUB 3CJCA 3EZWA 3MDQA 4J8FA 5CE3A 1NGBA 1NGDA 1QQNA 1P8ZA 1X3MA 4MLHA 3U9ZA 3HI0A 1HKGA 4IJNA 2IVOA 4JD2B 4IO8A 1IG8A 1NLVA 2YHWA 3GBTA 4CBUA 4EFHA 4AM7A 3C7NA 1D4XA 3W0LA 3BP8A 2QWPA 3CQXA 3ZX2A 4BC4A 1OKJA 4MO4A 2GELA 1ATSA 4IXCA 2V52B 1MA9B 2FF3B 3EKUA 3HTVA 3O6WA 1XC3A 1Z6RA 4EIAA 3ENOA 3EL2A 2EWSA 5LY3A 2Q36A 1KAZA 3SJHA 3S41A 1KAXA 3P4IA 4LC9B 2QM1A 3GE1A 1U6ZA 3UKRB 5AQOA 2QWQA 3A8YA 1Q18A 3AAPA 3J8AA 1GLEG 3FZHA 5BPLA 3DWLA 2P9LB 1G99A 5BPMA 5B8HA 1HJOA 3F9MA 5FPEA 3U8XA 5FPNA 2BTFA 3IDHA 4WYBA 3DXMB 3LDNA 4H5TA 3JXUA 2Q31A 3A5OC 3VEYA 5F1XA 1S22A 5BRHA 5ADXA 2GUPA 3FZLA 4FWKA 5E84A 4A2BA 4CZMA 2W40A 4CBXA 3GG4A 4PL7A 5AQLA 4JHDA 4BRNA 3VOVA 2UYTA 2P9LA 3SMPA 2ASMA 5AQRA 2P9NA 1T6CA 1GLFO 3H46O 2E88A 5AQTA 3RSEB 3IUCA 2A5XA 4BRQA 4EHTA 4GY2B 4CZIA 3D7EO 2Q97A 4NO7A 4A2AA 4BC5A 1NGEA 3IFRA 2QW9A 1BWFO 1NGFA 1Y64A 1BA0A 1E4GT 3KZBA 4E1JA 4WQ4C 4B1UB 4XEIA 5E26A 3VGLA 3WQUA 5EVZA 3D2EB 5AQMA 1X9JA 3O1BA 4JN4A 3WXLA 4BRHA 2FSJA 3QFUA 1Z05A 2CGJA 3WEEB 5AQSA 3RSEA 2GWJA 5FPDA 4B9QA 5AQKA 2NRHA 1LCUA 3ZETB 3LDPA 2QXLA 4H0XB 3VEWA 4H5RA 2CH5A 2YI1A 3FR0A 1SQKA 3D2EA 5F0XA 3FZFA 5AZJB 2I7PA 1NGIA 5AQJA 4FPAA 3WT0A 3LDOA 3TU5A 1K8KB 3LL3A 1E4FT 3KVGA 2P9KB 1BDGA 3CJ9A 1QQOA 4WQ4A 3VF4A 5AZIB 1NGAA 3TPQA 3O8MA 4H0PA 3QFPA 4AM6A 2D0PA 3O4WA 1BOTO 1MWMA 3HBTA 3QDKA 4FO0A 5AFUA 4BR9A 1BG3A 3ATUA 3HZ6A 2P9IB 2QWMA 3CERA 4FWLA 5AZJA 4FWPA 4B1XB 1HKBA 2GEMA 4I6MB 5AFUH 2YJFA 4CZGA 4FPBA 2V7ZA 1HLUA 1T6DA 2A41A 4RCHA 3H3NO 1GLAG 3VEOA 5FPMA 1QZ6A 2A42A 2E2PA 4JAXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4E3SA 4XIUA 1C0FA 3K5OA 4IEIA 2YV0X 4CEZA 4FWNA 1Z25A 3LP0A 3VERA 4CGIA 4JD2A 5GAHP 1VSEA 4DFKA 3S3OA 1LOTB 2D4WA 5F2RA 3J80O 4FJJA 4RW4A 3SJJA 4BC2A 1VSJA 1JLGA 1DGKN 4CZFA 3ISNC 3PSIA 1NGGA 4CZEA 4Z4CA 1T05A 3V9XA 1FK9A 2BUPA 4QCLA 4J2BA 4JKEA 2VWKA 1KQSM 5AQXA 1XMOK 1BO5O 3OBWA 3PX6A 1B9FA 4FJ8A 4JKFA 4KO0A 1IKYA 3VTHA 3R6MA 5EX5A 2OTLN 5M1QA 3THXA 2O8EA 1QHAA 4KHQA 4JI6K 2W6LA 4WF9L 3MK6A 1YAGA 2ZM6K 1GOCA 2FBYA 1NKEA 3CG7A 5HOOA 1FXXA 4WFBL 3DLBA 3O9UA 3M3ZA 1LW2A 3IKMA 5BPNA 3PLAA 3DRSA 5JLFA 2HB5A 4MQ3A 1GLDG 1K8AO 5FRNA 4C23A 4JEPA 2HBKA 4FOIA 3HK2A 3VEXA 2P5OA 1NOZA 3ZT0A 3TTFA 4ILHA 1RTJA 3QICA 4DHYA 2Q2RA 1OH6A 2F4VK 1TUYA 3RRHA 3MMVA 4CK1A 3DMJA 4CIEA 2KHOA 3LDLA 4Z94A 3QEVA 4M3RA 3HM8A 5AR0A 3ZSXA 1HR0K 3SPYA 4YOUA 2PAVA 3L6QA 3WXJA 4EZ9A 1HJRA 3R3LA 1TAUA 1OVQA 3WEEA 4HUEA 4J2DA 5C10A 3J7AP 3VQ5A 1KLNA 3SAFA 3ZETA 2YHXA 4ILJA 3ZLJA 3NVMA 3LAKA 4A62A 3CYMA 3O9RA 1RT4A 3AVHA 3C65A 2ZD1A 3CIPA 5AQZA 1K8KA 4FZYA 1SL2A 1ASUA 3LM9A 4FWMA 4JKGA 2OPSA 1VK0A 4LF8K 3PSFA 4PKHA 3ULEB 2O8FB 2OTJN 3CHWA 4E7LA 4Z4FA 1HYSA 2UUAK 4C8NA 3M8QA 2FF6A 1NM1A 4BE0A 3SQ0A 1U49A 3BEXA 4GNIA 2Z1JA 2OZMA 1TV6A 2UXDK 1HUXA 3EEQA 3MCPA 3QBXA 1VQ4N 2YHAA 4DSJA 4EAHD 5AQVA 3LWLA 3S3MA 4NLBA 4DSFA 2E8AA 5BRFA 2D0BA 2P9PA 1ATRA 2O4GA 3ZSQA 2G8HA 5D3GA 1V4TA 4J2AA 3CCSN 3VMFB 2KTQA 3KKRA 1TAQA 4YHHK 4KTZA 3VQ7A 1X9MA 3TAGA 3KJVA 1QTMA 1KVBA 2UUBK 1G15A 4Z4EA 1BQNA 1RBRA 4GKKK 1W0HA 4OKKA 4PQUA 4F9OA 3AVFA 3CJ1A 3SPZA 2NZTA 1T3VA 5C12A 3SAHA 1W7AA 3DRRA 4CZHA 2D5RA 4BRPA 4RW8A 1DEJA 2PYJA 3SNNA 3ZT3A 2CGLA 4HUFA 2P9UA 3E1YA 3HVRA 2NRWA 2ASOA 2O8CB 5AQPA 4OPKA 4OVLA 2VCPA 3C94A 4JI7K 2BDPA 4AHSA 1WSFA 2Q3SA 4GV3A 3AVKA 1VSIA 3AO1A 1HYZA 4KHNA 4KBOA 3UB5A 1VSLA 2HNDA 4I7FA 3VQ4A 5HLFA 4KI6A 1FW6A 3VESA 2HMPA 3DLEA 4FXDA 4X66K 1JLCA 2PYLA 3P31A 4DQPA 1BCMA 3KLFA 2A3ZA 1LAVA 3CCLN 4BDYA 1X3NA 4DF8A 3CCEN 4ISEA 5FROA 4BC3A 4M7YA 4B9UA 3DLGA 1TGOA 5AQQA 4B1ZA 4FK4A 2YJEA 5LJVA 4IZ9A 1EXQA 3EE8A 3AAQA 1XHZA 3BZCA 3VEVA 1HNVA 4BRDA 4FWOA 3R9PA 1EP4A 4DMNA 5GADP 3C0BA 3HP6A 3I0RA 3CJCA 3TANA 1NGDA 1QQNA 1X3MA 3CF5L 2G8IA 3OYAA 4FK0A 3ITHA 2NRVA 4IEEA 1X9WA 3C7NA 1NK4A 2QWPA 1C0MA 3QINA 4AHCA 4KREA 2E6MA 1BISA 3ASMA 4MO4A 4CJFA 4Z4HA 4IXCA 5KTQA 4BY9C 1Q9XA 4IG0A 1XC3A 1VQ5N 4EIAA 5LY3A 4LD0A 2YNIA 1KAZA 3V1RA 3C6AA 3A2FA 2WBNA 5JVGL 1IBKK 3WNFA 3J7ZO 3UKRB 2VG7A 4FLTA 2IOCA 5DMRA 3SCXA 2E6LA 4B3MK 3Q7BA 3VQEA 3AO2A 3AAPA 3J8AA 1ZBIA 1RBVA 3L4QA 5B8HA 2KKZA 3MCAB 3U8XA 1S1WA 1W2BM 3IDHA 4H5TA 4FYDA 1EWQA 5KGXA 3A5OC 3VEYA 5F1XA 1S22A 3I8DA 3FZLA 1JXBA 2FBXA 4CZMA 2W40A 4CBXA 3GG4A 1U4BA 5JVHL 4B9LA 4FM2A 4M3ZA 2P9NA 1T6CA 2IS3A 1GLFO 1N5YA 3SUQA 5AQTA 3RSEB 2HNZA 2A5XA 2W6KA 4GY2B 2ATQA 1B9DA 1NGEA 4W5OA 4JI0K 1BA0A 4W5TA 4E1JA 3ZT2A 4FW1A 3C6UA 5E26A 4YNQA 4PA1A 5EVZA 2XRIA 3TAPA 4JN4A 3O1BA 3WXLA 4BRHA 3OS2A 4A57A 4CECA 4IFVA 1I39A 4JI1K 3C95A 3QO9A 1UA1A 1QVGM 1O13A 2NRHA 1NJXA 4CF2A 4CK3A 2QXLA 3VQQA 4E89A 3SZ2A 4DR3K 4KHSA 5A2QO 3K59A 5AQJA 1NGIA 1RT6A 3ZSWA 4FPAA 3LDOA 3TU5A 3LL3A 4RG8A 4DU3A 2P9KB 4DU4A 1BDGA 3CJ9A 4JI3K 4WQ4A 1FKOA 4M3WA 5AZIB 2B4JA 4IOXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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