3A0IX

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of novel 3,6-disubstituted 2-pyridinecarboxamide derivatives as GK activators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 167
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a0iX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3a0iX01
3ZETA 2GTDA 3CERA 4BRGA 3LDOA 4WQ4A 2IVNA 4KBOA 5AQWA 1WUAA 2I7NA 1KAYA 3GOIA 4BRFA 3WXKA 3FZKA 4I6MA 4MO5A 3U9DA 4K25A 3I33A 2CGJA 1JCGA 1EQYA 5EY4A 4BR5A 2GEMA 4DCHA 4PL7A 3EL2A 2OANA 3A5LC 4BVOA 4IJAA 4GY2B 4H5RA 1BOTO 5ADXH 1KAXA 4XH4A 3UKUB 4H5VA 3GL1A 1GLAG 1X3NA 2E1YA 1NLVA 4H0OA 3EKSA 3U9ZA 3C0BA 4EIAA 4F9OA 3AAPA 3ZX3A 3KZBA 4JNEA 4BRLA 4B1YB 4BC4A 1D4XA 3GBTA 1S3XA 5AQXA 5AQZA 4BRPA 3A5NC 1T6DA 3D7EO 4CBXA 5AFUA 3FE1A 2P9IA 4FO0A 2W41A 4IXCA 1NGFA 2H3GX 4M7XA 4B1WB 3M6GA 2QWOA 4BR7A 1NGEA 2P9NA 3O4WA 1ATRA 5BRFA 3CQXA 4FSVA 3A5OC 3S41A 1K8KA 2CH6A 2ZGZA 4ISEA 2ASPA 3MMVA 3DAWA 3ZX2A 1NGCA 5BPNA 1E4GT 3CETA 4DQ8A 3FFKB 4O8KA 3H6EA 4QS9A 1NBWA 4RWTA 4AM6A 1QQNA 1V4SA 3D2FB 4BC5A 3MCPA 3WQTA 5JLFA 3MN6A 5JLHA 5BN8A 2BUPA 1NWKA 2CH5A 3ATVA 1IG8A 3UB5A 4H0PA 4YDUC 3ZX0A 5EVZA 2IVOA 2Q31A 2ZF5O 1GLFO 4O5FA 3WEEB 5E26A 3VEXA 3GG4A 2QWQA 1XC3A 5AZIA 5EX5A 3M1FA 2D0OA 2A40A 2YHYA 4BGBA 4WQ5C 1JCEA 1TYQB 3QBWA 2QM1A 3SMPA 3BF3A 3O1WA 4JHDA 3BUZB 3CIPA 3DWLA 5AZJA 1TUUA 3ZEUA 1V4TA 4EHTA 5FPMA 2P9UB 5F2RA 3DJCA 3LL3A 1HPMA 4IO8A 2J4RA 1HX1A 2P9SB 4WQ5A 5FPEA 4B1XB 4BR4A 5KPZA 3HM8A 5KPTA 3WUHA 3OHRA 1NMDA 3WXLA 3AARA 5AQYA 5LJVA 2QWRA 1X9JA 4FWNA 5JICA 2YJFA 1BA1A 1BO5O 1MWMA 4BREA 5I9EB 3LDNA 1TUYA 1ZC6A 1KXPA 5FPDA 2V51B 1ATNA 3ENOA 5B8HA 2NRHA 4H5NA 3WQUA 2VCPA 3UE5A 4H5TA 1HLUA 3DXKA 2PBDA 3ULEA 3D2EA 3VETA 2E2QA 1GLCG 3EN9A 3VENA 4L3QA 4EAHD 1KAZA 3C7NA 1QQOA 5AQLA 3VGKA 4Z94A 3EZWA 3UKRA 4JD2A 1H1VA 3SJHA 3SK3A 2FF6A 2KHOA 4MO4A 1XUPO 2E20A 3CJCA 1E4FT 3A5MC 2YI1A 3ZETB 4K43A 3IUCA 4E1JA 5AQKA 2FLOA 4I6MB 5AQRA 4FWMA 3BP8A 4CJ7A 4QS8A 1J6ZA 3VOVA 2NZTA 2GUPA 5ADXA 3VEZA 4A2AA 4FWKA 4FOIA 1P8ZA 2F9WA 2A41A 3ID8A 3TU5A 1LOTB 1S22A 5F1XA 4C23A 4GNIA 4H5WA 5BN9A 1DKGD 2A3ZA 5AQFA 2Q97A 2Q0UA 3R9PA 3LM2A 3WT0A 2IVPA 3CJAA 4FWLA 4BQLA 3O1BA 3CI5A 4CZKA 1HKGA 1XQSC 4BGAA 2I7PA 4FOEA 3HBTA 3LDPA 4XEIA 2F9TA 4BVPA 1R59O 4BC3A 2P9IB 4BG9A 4CD1A 1SQKA 3L4IA 3HI0A 3VGLA 2P9NB 2E2PA 3I8BA 5BPMA 3H3NO 4JAXA 3O08A 1K8KB 1Q18A 3F9MA 3HSCA 4RCHA 1NM1A 2V7ZA 1C0GA 3CJBA 2UYTA 4BRQA 1G99A 3BEXA 3AY9A 3VEYA 3KHYA 5BRDA 4CI6A 4BROA 4H0VB 2P9PA 1NGGA 1RFQA 2EWSA 2YHXA 3MK6A 2FF3B 2D1KA 2AP1A 3H3OB 2FSJA 3P4IA 1BUPA 5TKYA 3VF4A 2D4WA 1TYQA 3RSEA 2Q2RA 4CBUA 4BRNA 2V7YA 5AQNA 3H45C 2E2NA 5AZIB 4BG8A 3O8MA 3FR0A 3JXUA 2P9KA 3A8YA 4CZIA 4A61A 4PKHA 4BRDA 3AAQA 3MN9A 2GWKA 5AQJA 4JHDB 3MN5A 3VF2A 1GLEG 2HOEA 2QW9A 2P9LA 5AQUA 3ZEUB 5AQIA 1YUWA 3IFRA 2YCHA 5EOYA 4DHYA 4CZGA 5JMVA 3FZLA 4CD3A 2E88A 3DXMB 4J8FA 3QBXA 4LC9B 5KPRA 4DB3A 3FZMA 4BRHA 2DPNA 4ISFA 1HJOA 4BRMA 1BDGA 2VYPA 1GLLO 3L6QA 2IIRA 2GELA 1U2VA 3HZ6A 3WXIA 3FZHA 4CZLA 1HKBA 2E8AA 4K42A 1NGBA 4BC2A 4BR9A 1YXQA 1RGIA 1T6CA 2PAVA 4Y0WA 5LJWA 3O80A 1GLBG 2YHWA 4A62A 4CZEA 3SLCA 2HMPA 3TPQA 4BRAA 5BPLA 3R8EA 2CGLA 5ELZA 2WUSA 5AQSA 3VPZA 4BRCA 4PKIA 4CZMA 3QICA 3JS6A 3QFUA 1NGHA 1WOQA 1HUXA 2CGKA 3O5BA 1QQMA 4ISGA 3VEWA 3DXKB 3ULEB 3D2EB 4FWOA 4H0XB 1NGDA 3FLCO 4FWQA 2HF4A 3VESA 2ZWHA 1ZBSA 3GDQA 5AQGA 3UKRB 1QHAA 4JD2B 3GE1A 2GWJA 4BR2A 4PKGA 1BG3A 1LCUA 4CZFA 3UKUA 1MDUB 2ITMA 5KQ8A 3MDQA 1JCFA 3U4LA 4B1VA 3KVGA 1DGKN 1SZ2A 2E1ZA 3H46O 4FL9A 3W3DA 4BQZA 1MWKA 2V52B 5AQHA 1BWFO 2FXUA 3B8AX 2FSKA 4B1UB 3FGUA 3H1VX 3ENHA 3L0QA 5AQQA 4PL8A 3BF1A 5FPNA 4B9QA 4M7YA 4M63C 5AFUH 1CZAN 4CZJA 5BREA 1GLDG 2QWMA 1OKJA 2YJEA 4XH5A 2A42A 2FSNA 1IJJA 4IZ9A 5CE3A 1NGAA 1YAGA 2QWPA 3LDLA 4MLEA 4FPBA 4WYBA 2A6AA 5BR9A 3SMSA 2VWBA 1C0FA 2E2OA 3D2FA 2Q1NA 2BTFA 3CHWA 4IWVA 1Z05A 3EKUA 3EO3A 4BRIA 2QWLA 3U8XA 5AQPA 3WEEA 4A2BA 3QB0A 1SAZA 1NGJA 4FWRA 3LDQA 3QFPA 1ESVA 1GLJO 4IJNA 3VERA 4QS7A 5AR0A 5LY3A 1BA0A 4HWIA 3CJ1A 2NLXA 2Q0RA 3ATUA 1Z6RA 2P9PB 1ATSA 5E84A 3H1QA 4CBWA 3FZFA 1T44A 2QWNA 3G25A 2A5XA 5AQVA 4BR0A 2P9UA 3QMLA 1BU6O 5AQMA 3CQYA 2W40A 4BRKA 3RSEB 5AZJB 1HKCA 1X3MA 2AA4A 4EHUA 2P9SA 3MN7A 2ASMA 3W0LA 2P9KB 3R6MA 3VGMA 4YDUA 1RDWX 3CJ7A 1MA9B 1Y64A 3QDKA 4XH1A 1YVNA 3CJ9A 4NO7A 3DXMA 5BRHA 2QXLA 5AQOA 3J8AA 3M3ZA 4JN4A 2P9LB 4MLHA 1U6ZA 4CZHA 4K41A 3IMXA 2D0PA 2ASOA 1QZ5A 3O6WA 2Q36A 5KQDA 4FWSA 4RTFD 5AQTA 1NGIA 5EXWA 2HF3A 4H03B 4FWPA 1ZXOA 2ZGYA 4WQ4C 3VF6A 3VEOA 1DEJA 1U2VB 4H0TB 1QZ6A 4HTLA 4EFHA 3IDHA 3VEVA 4FPAA 4H0YB 3WXJA 4NB4A 4B1ZA 4AM7A 5F0XA 3LM9A 3HTVA 3C7NB 3A0IX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L4QA 3ZETA 5KRTA 2GTDA 1BL3A 3ULDA 4WQ4A 5AQWA 3RMAA 4OKKA 3VQ8A 2OA8A 4B8AB 2HHHK 4CF2A 4BR5A 3NFAA 2ZJQL 3TTFA 3HVRA 4M3TA 1DT9A 4GY2B 4H5RA 2O8DB 3SBGA 4H5VA 4AILC 2HW3A 1RDAA 3C0BA 1VSMA 5IWAK 4A59A 4B1YB 4KAZA 1NJWA 4BWJA 3GBTA 1S3XA 5AQXA 1NKBA 2KTQA 3LPTA 3SQ2A 2OTLN 1Q81O 1B9DA 4FLTA 1NGEA 1BI4A 3PSIA 4E1MA 1NK0A 1K8KA 3QO9A 1HR0K 3KK2A 3O9SA 4KHUA 2KKZA 1WAJA 3JSMA 2O8BB 1WBDA 2RKIA 3E9OA 3CETA 2IC3A 1Q9XA 3KK7A 2W6LA 3AGKA 4O0IA 4BE2A 4L8RB 3C6UA 3IKMA 4B3TK 3MCPA 3WQTA 1RBTA 5JLFA 2NRRA 3HVTA 2CH5A 2B5JA 4YDUC 1SUQA 3ZT2A 1YI2N 3CC7N 4O5FA 3WEEB 3JAMO 3H08A 2KZZA 2QWQA 3I55N 4B3OA 2HVHA 1IBLK 1IO2A 3M1FA 2P1JA 4DV6K 4FLVA 3CPEA 1B92A 2JLEA 4CERA 4DV7K 3SMPA 3BF3A 2OZSA 4JHDA 4LF5K 4RW8A 3DWLA 5AZJA 3DOKA 4DKWA 3G71N 1V4TA 4EHTA 1J9AA 4CHQA 3LL3A 5C42A 1OH5A 4IO8A 2J4RA 2HBKA 2P9SB 4WE1A 4B1XB 5KPZA 1JLQA 2BGGA 5M1FA 2HSTA 3C6TA 5C2DA 1FJGK 1I94K 1X9JA 4AHRA 2FBYA 3VN5A 1BA1A 4A5AA 1BO5O 5I9EB 1YITN 4FM2A 4CEQA 4CGHA 3THYA 2KLAA 2V51B 3NGZA 3NH1A 1TK0A 5B8HA 3HPOA 4IBNA 3Q7CA 4JKBA 3WQUA 3TAMA 4B9MA 1WSFA 2D0BA 1WB9A 4I9QA 2F8TA 3CCSN 4EAHD 1QQOA 3CYMA 5AQLA 5DMRA 3TAPA 2X78A 4MO4A 4PY5A 3VQ6A 2BDPA 3MCAB 4E1JA 4Z4HA 1EETA 2FLOA 4FWMA 1J6ZA 2JWLA 2NZTA 1T05A 4FLWA 3HRGA 3CC4N 4BWMA 2F9WA 2RHKA 2WBNA 3ASMA 2XHBA 1FK9A 3ID8A 4CCHA 1ZBLA 4C23A 4DV0K 3QESA 4DV5K 1TKZA 2A3ZA 3ITHA 5AQFA 5DM7L 3CG7A 4FWLA 4BQLA 3OYJA 3O1BA 1UA0A 4ILGB 2DFEA 2WC9A 1HKGA 1XQSC 3LP2A 4BGAA 3TI0A 2HHVA 4FOEA 4LD0A 1BQNA 1LWFA 1Q7YO 3LDPA 4DWIA 3WNEA 4CD1A 3L4IA 1KVBA 3DLLL 4QAGA 2P9NB 1KQSM 1VSIA 3I8BA 4CJ5A 5BPMA 4JAXA 3OS2A 3K5NA 5FDLA 3HSCA 4RCHA 3RMDA 1NM1A 1C0GA 3WNHA 3BEXA 4H4OA 4CJQA 1CLQA 3DLHA 3CCQN 3VQEA 1UOCA 4I9LA 4CW7B 2Q3SA 4Z4GA 4H0VB 4RW7A 2P9PA 1VQ7N 4E7HA 3MK6A 2FF3B 1T3VA 4DQQA 4MQ3A 1NNEA 4DV4K 4I2PA 4LF6K 4DR6K 5TKYA 4ICLA 1TYQA 4CHPA 3S3OA 4M3RA 4BRNA 2UXDK 5AQNA 1A5VA 1WSHA 3RTVA 3HPGA 4PKHA 1K6YA 3MN9A 1VSLA 4JI6K 1P90A 1XHZA 3ZEUB 1YUWA 3CCRN 3QEPA 5HRRA 4B9TA 3V6DA 3DXMB 4M3XA 4O8UA 1WNSA 3KTQA 5KPRA 5M1QA 4CJFA 1TL3A 5GADP 4DTRA 2IGIA 3L6QA 4JKDA 2GELA 4CZLA 3FZHA 1U47A 4BC2A 4Q5VA 2PAVA 4DTMA 2XY7A 2PYLA 1GLBG 4K8ZA 4O44A 3TPQA 5BPLA 4FJXA 2RPIA 3AO4A 2CGLA 5AQSA 4CF9A 3NF7A 1VQPN 4CZMA 3DLGA 1HUXA 3QIPA 1VSDA 3OW2M 3CCJN 4KV8A 1JL1A 3D2EB 4H0XB 4FJ8A 1NGDA 2HB5A 4ILHA 4KTWA 2ZWHA 1GOCA 2YNFA 4LF9K 4ID5A 4A57A 4DU1A 3M8PA 1HJRA 3UKRB 1QHAA 2QI2A 4JD2B 3GE1A 2GWJA 4PKGA 1BG3A 2ITGA 4CZFA 4UY8O 4FZYA 2G8KA 4WF9L 4PHTX 1JXBA 1QSYA 1ZBUA 3AVAA 4B1VA 3KVGA 3VQ5A 3W3DA 4JV5K 4DLGA 3PY8A 4CEZA 4DFPA 3PV8A 3NMUA 4KB0A 3OJSA 1CXQA 4QCLA 4M63C 1HYSA 4WFAL 1CZAN 4CJRA 3OYMA 1GLDG 1QS4A 4DTUA 5GINA 2QWMA 3EEQA 2O8BA 4XH5A 2A42A 1W2BM 4IZ9A 1VAZA 1NGAA 3AO5A 4OLAA 1N5YA 1C0FA 1SKRA 2HNDA 3CHWA 1BIUA 1Z05A 2PYJA 3EKUA 3ZCMA 1LW2A 4DV3K 3WEEA 1W7AA 4JI3K 1NKCA 1RTJA 3QB0A 3ZSXA 4FWRA 1GLJO 3VERA 4CEAA 4HWIA 2NLXA 2Q0RA 1Z6RA 4JKFA 4DQRA 1ATSA 5E84A 4J2BA 3H1QA 4ZTJA 2QWNA 5AQVA 3AA4A 3O9TA 4WCEL 4OLBA 5AZJB 3VQPA 1HKCA 1X3MA 3NCIA 2P9SA 4PUOA 4AQYK 3L3VA 2P9KB 4N76A 1RDWX 1OVYA 1YVNA 3CJ9A 1NOZA 3K58A 5BRHA 4JN4A 3M3ZA 4DG1A 2P9LB 4MLHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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