3AAPA

Crystal structure of lp1ntpdase from legionella pneumophila
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
353
structure length
353
Chain Sequence
KHSCIAVIDAGSTGSRLHIYSYDTDDTNTPIHIEEIWNKKIKPGFASIQPNSVTIDAYLTMLLADAPIHNIPVYFYATAGMRLLPQSQQKKYYDELEYWFRQQSQWQLVEAKTITGNDEALFDWLAVNYKLDTLKSVQNKSVGVMDMGGASVQIVFPMPKNAEISKHNQVELNIYGQNINLYVHSFLGLGQTEMSHQFLNSPSCFANDYPLPDGESGQGNAPSCKEEVTSLMNSVHKVNQQIQPLLALNPVNEWYSIGGISNLASSQLFHFENSELTNQSLLQQGDNQICHQQWDILNGQYPDDEYLYQYCLLSSYYYALMVDGYGINPNQTIHYIPPEQNLDWTIGVVLHRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of a Legionella pneumophila Ecto -Triphosphate Diphosphohydrolase, A Structural and Functional Homolog of the Eukaryotic NTPDases
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase I
molecule tags Hydrolase
source organism Legionella pneumophila
total genus 105
structure length 353
sequence length 353
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3aapA01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3aapA02
4BREA 1NGAA 3WXIA 4C23A 4BGAA 2HMPA 4JD2B 1WOQA 4JHDA 1D4XA 1JCFA 2FXUA 3DXKB 3MN7A 4DCHA 5KPTA 4ISEA 1LCUA 3RSEA 4BC3A 1S3XA 2QWRA 4BC2A 4QS9A 1E4GT 3FZKA 4WQ5A 5FPEA 4B1ZA 3AARA 5AFUA 1ZXOA 1HKBA 3EL2A 2BTFA 3VF4A 1TUYA 4H0VB 3ULEA 4H03B 4BRPA 3D2EB 3M3ZA 2OANA 4B1WB 4H5WA 1X3MA 3U9ZA 3JXUA 1U2VA 3BF1A 1V4TA 1KXPA 1K8KB 2FF6A 3H3NO 4BRGA 4CZEA 4BRFA 2FLOA 4JAXA 2FSKA 2QWOA 1G99A 3H46O 1JCEA 2V7ZA 3FZFA 3ZX3A 4FWNA 4FWQA 3WXKA 2HOEA 5AQSA 4XEIA 4BR9A 4O5FA 2ZGYA 5AQYA 3H45C 5AQMA 2ASOA 2Q2RA 4H5TA 4CZIA 5LJWA 5E84A 5FPMA 5EVZA 1BA1A 4RTFD 2V7YA 4WQ5C 3VGLA 4BC5A 1WUAA 3ZETB 3CQYA 2YI1A 1GLJO 4I6MA 2EWSA 4CI6A 3FZHA 3LDQA 4QS8A 1MA9B 2P9NA 4A62A 4AM7A 2ZWHA 4Y0WA 4MLEA 2ZGZA 3VENA 3MMVA 2CGKA 3SK3A 4M63C 1GLLO 3FGUA 3WQTA 4PL8A 3MDQA 3O4WA 4XH1A 3VGMA 3O8MA 1KAZA 3I33A 3VESA 2A5XA 1HPMA 5BRDA 3KVGA 3CQXA 1JCGA 3G25A 4FOIA 3UB5A 5JLFA 4M7YA 2E8AA 4CZKA 3FLCO 2DPNA 3VPZA 2QWPA 5E26A 4QS7A 4J8FA 3J8AA 2P9UA 4BRIA 4DB3A 2E1ZA 1ATSA 4BVPA 2F9WA 5AQVA 4BG8A 4H5RA 1GLFO 3O6WA 4CZLA 3LL3A 3R8EA 1J6ZA 5BREA 5AZJA 3WEEA 4BGBA 5TKYA 3HSCA 2F9TA 2QM1A 4K43A 3JS6A 3VEXA 2ASPA 2PAVA 3CERA 1HJOA 4H5VA 1BOTO 1NMDA 3HM8A 3HBTA 3R9PA 5BR9A 5F0XA 4B1YB 4H5NA 5AZIA 1T44A 3C7NB 4FSVA 1ESVA 3DJCA 1Q18A 5BRHA 5JICA 2VYPA 2IIRA 2ITMA 4AM6A 3ENHA 2P9LA 3LM2A 3VF6A 1QZ6A 1BWFO 5JMVA 1BU6O 2CGJA 1XQSC 3LM9A 3UKUB 3MN5A 3VETA 5FPNA 3CIPA 4BRNA 1NGGA 4A61A 4MLHA 5AQUA 4JD2A 1ZBSA 1BG3A 4H0XB 3ZX0A 2Q0RA 3DXKA 1E4FT 2P9KA 3BF3A 4XH5A 2A6AA 4CBUA 3FE1A 4JNEA 1NGJA 3WQUA 4WQ4A 1QHAA 4BR5A 3VEYA 5AQOA 2P9PB 3QBXA 3A5LC 3SLCA 3UKRB 1NGHA 3A8YA 3O5BA 3FZMA 3MN9A 1DEJA 2HF4A 4FWSA 2I7PA 3EO3A 4IWVA 2E2PA 2QXLA 1K8KA 3SMSA 1QZ5A 3B8AX 5KQDA 1NBWA 1BA0A 2QWNA 3KZBA 1T6CA 2Q31A 1U6ZA 1X9JA 2VWBA 3VEOA 3MK6A 4BRMA 4F9OA 4FWOA 4M7XA 1RFQA 2A42A 1GLEG 1S22A 2VCPA 4B1XB 4BRAA 1GLBG 4HWIA 4H0PA 1ZC6A 3LDNA 2NLXA 2WUSA 4GNIA 4L3QA 4WQ4C 3CJ9A 4FPBA 1GLAG 3ZETA 4CBWA 1ATNA 2E20A 4FL9A 3AAPA 5EOYA 5I9EB 2NRHA 1RGIA 5AQQA 1IG8A 3QICA 3O08A 2GWJA 3CJ1A 2YHYA 5AQJA 2NZTA 4EIAA 4BQLA 1XC3A 4A2AA 1TYQB 2A41A 3BEXA 3DAWA 4CD3A 5LY3A 2P9SB 3LDLA 4PKHA 2QWLA 4BRKA 5BPNA 3DXMB 3CJ7A 2E2NA 3QB0A 3ZEUA 4NB4A 4PL7A 4K25A 1NGDA 4B1UB 2A40A 5KPRA 5F1XA 2W41A 2H3GX 4FWRA 5EY4A 3CJAA 5AQKA 3VOVA 3BUZB 2Q97A 5AQPA 2IVPA 2V52B 5AQWA 3U8XA 2YHXA 4GY2B 3AAQA 2D1KA 4ISGA 4B1VA 3F9MA 3O1BA 4CD1A 4B9QA 2FSNA 1YAGA 1NM1A 2E2OA 3VEVA 1DKGD 4CZGA 2V51B 4IXCA 1T6DA 2YJFA 3ENOA 5AQHA 4BR7A 3FR0A 4Z94A 1MWMA 3C7NA 2P9IB 3O80A 5ELZA 3WXJA 4BG9A 1YUWA 3D2FB 3GDQA 3P4IA 3H1QA 3L4IA 4BRDA 1IJJA 4MO4A 1RDWX 3D7EO 3GL1A 5BN9A 2P9UB 3QDKA 3UKUA 3W0LA 5AQNA 3SMPA 3VEZA 4BQZA 1LOTB 4DQ8A 3R6MA 4NO7A 4FWLA 4XH4A 3QMLA 4BVOA 4CZFA 3LDOA 1QQOA 3QFUA 4CBXA 3TU5A 5B8HA 4IZ9A 2PBDA 4EAHD 3UE5A 1HLUA 4H0OA 1GLCG 3L0QA 5KPZA 3QBWA 1C0FA 3WXLA 4DHYA 5LJVA 4E1JA 4PKIA 2P9PA 3ATUA 3CJCA 3BP8A 1HKGA 2ZF5O 1BUPA 3UKRA 4YDUA 2QWQA 2I7NA 3D2EA 3O1WA 5BN8A 3CJBA 4WYBA 5AQIA 5BPMA 3I8BA 3H6EA 3IUCA 2IVNA 5AQTA 2W40A 3HZ6A 3A5MC 4BRLA 1P8ZA 2KHOA 2P9KB 3U4LA 5AQXA 4BR2A 2GELA 2IVOA 2YCHA 2A3ZA 3HTVA 4EHTA 4JN4A 2Q1NA 1KAYA 2E1YA 3AY9A 4JHDB 1NGFA 4BR0A 1KAXA 4KBOA 2QWMA 2QW9A 1SZ2A 2GEMA 2YJEA 4BRHA 3RSEB 3GG4A 3KHYA 3MCPA 3M6GA 4YDUC 3L6QA 3QFPA 4FPAA 1XUPO 3EN9A 3ULEB 4CZHA 5AQRA 3H1VX 1YVNA 3CETA 1U2VB 4FWMA 1YXQA 1H1VA 2AP1A 4MO5A 1TYQA 2CGLA 1MWKA 2P9SA 1SQKA 3MN6A 4EFHA 1MDUB 3DXMA 1BO5O 1NGIA 4H0TB 3TPQA 3ZX2A 5JLHA 1OKJA 2HF3A 3WT0A 2GWKA 5ADXH 3VGKA 1HX1A 3IMXA 3EKSA 2ASMA 1NGCA 2CH5A 3EZWA 2AA4A 3A0IX 2Q0UA 5AQLA 2YHWA 1HUXA 2Q36A 4I6MB 5AQZA 2D0OA 4HTLA 1C0GA 1QQMA 3S41A 1X3NA 1HKCA 1NGBA 4H0YB 1DGKN 3FFKB 4K42A 5F2RA 2P9NB 4BRCA 3A5OC 3VERA 2UYTA 4A2BA 1ATRA 4BRQA 3CHWA 3GOIA 3FZLA 3SJHA 4BR4A 4RCHA 5AQFA 3U9DA 3VF2A 3VEWA 3A5NC 3ATVA 3M1FA 4IJAA 3ZEUB 5BRFA 4FWPA 4IJNA 2P9IA 3GBTA 3D2FA 5ADXA 1Z05A 5EXWA 2GTDA 2FSJA 4EHUA 5FPDA 3HI0A 2BUPA 3LDPA 3WUHA 3EKUA 4FWKA 4RWTA 3OHRA 4IO8A 1NGEA 3IDHA 5KQ8A 3W3DA 3H3OB 4CZJA 1NWKA 1V4SA 3DWLA 2E2QA 4PKGA 4FO0A 5AZJB 5EX5A 3GE1A 3WEEB 5CE3A 2GUPA 4CJ7A 1R59O 3ID8A 2FF3B 3C0BA 3CI5A 5AR0A 4LC9B 4CZMA 4BC4A 5AZIB 1BDGA 1EQYA 3IFRA 5AQGA 1QQNA 1Y64A 2P9LB 4K41A 5AFUH 4O8KA 4BROA 4ISFA 1SAZA 1GLDG 1NLVA 1CZAN 1TUUA 4FOEA 2E88A 5BPLA 1Z6RA 2J4RA 2CH6A 2D0PA 2D4WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KTQA 4HCCA 1VSKA 1JXBA 3CCEN 3NVMA 4LSLA 1WOQA 4CEEA 1D4XA 3DXKB 3CMAN 3DMJA 3MN7A 4DCHA 1HNXK 3U3YA 3JAMO 1ZBIA 2VQFK 4K8XA 2OA8A 3VQ9A 3K5NA 1LCUA 3RSEA 2FBTA 3TR8A 2QWRA 5JVGL 3VQPA 3SUNA 1HKBA 3EL2A 2BTFA 3FFIA 1KSPA 4H03B 4BRPA 3M3ZA 3VQQA 3U9ZA 3MAQA 4FXDA 4GMJB 2O8CA 4FJIA 1KQSM 4KHNA 4DS4A 3L4QA 1OH5A 3CCLN 4KV8A 1VQNN 2V7ZA 4DSIA 3FZFA 3WXKA 2HOEA 4XEIA 4AHSA 4O5FA 5AQYA 3H45C 2FBYA 2ASOA 5LJWA 3CPWM 3V9XA 4CF9A 2QK9A 4A57A 3CCUN 1IBMK 1KCFA 1GLJO 2E4LA 4ZHRA 4CHOA 3VN5A 2OTJN 4CI6A 3FZHA 3WNHA 2O8BA 3VA0A 1MA9B 3LP1A 4A5BA 4DR6K 4A62A 4B8AB 3PV8A 1BISA 2ZGZA 4NLBA 3LWMA 1GLLO 3E9PA 3VGMA 3O4WA 4OPHA 4CGDA 4IDKA 3O9TA 5BRDA 1N34K 3KVGA 3S3MA 4AH9A 3UB5A 4M7YA 4R5PA 4C8OA 3T69A 4CZKA 4DWIA 4FLWA 4IG3A 4NCAA 4KAZA 4ID1A 3CC2N 4BRIA 4DB3A 3IG1A 2E1ZA 4OKKA 4DQQA 4N76A 4CZLA 1K6YA 4V19S 3AVFA 4CJQA 2WONA 4BGBA 5CZ2A 4CJVA 4DS5A 5T7BA 4DTRA 4PY5A 2BH1A 4QAGA 4DV3K 3KD5E 3CERA 3V4IA 4KREA 3HM8A 4NYNA 3AO5A 3OS1A 4B1YB 3HP9A 5AZIA 3F5TA 3DJCA 5I3UA 2VYPA 4NXNK 2IIRA 4PA1A 2P9LA 3VF6A 5JMVA 3N4PA 3TSUA 1UWBA 3F9KA 1ZBUA 3E9OA 1YI2N 5CZ1A 1Q9XA 5HRSA 4MLHA 3ZSVA 4JD2A 1P90A 1ZBSA 1BG3A 3AVHA 1XMQK 1UA0A 4OKEA 2ZE2A 2Q0RA 1E4FT 2B6AA 2RE2A 4FLTA 3AV9A 2A6AA 4XH5A 3QO9A 3WQUA 4DV6K 3E66A 1LAVA 2QI2A 4MDAA 2YNGA 3VEYA 3C6TA 1Q8IA 3AVIA 3QBXA 1U4BA 1RBRA 1Z26A 3S3NA 2IGIA 3FZMA 5DM6L 4I2QA 4FWSA 3LAMA 4IWVA 4DLEA 1K8KA 3DLKA 2E5LK 3SMSA 1QZ5A 3B8AX 4O8UA 1LW0A 4JRQA 1W2BM 1SS6A 5C24A 2VWBA 2FC0A 1EX4A 1F21A 4BRMA 3M8SA 2QA4N 4OO1J 4B9MA 3G4SN 1RFQA 3VMFB 3CF5L 1YTAA 1TK5A 4YORA 2DFHA 4WQ4C 4FPBA 1NK7A 4DF8A 3NGIA 2XHBA 4KI4A 5GAEP 4C8KA 3CYMA 4JS5A 1ZYQA 4QCLA 3VQ7A 3TAMA 3AVMA 1NU0A 2GWJA 3CJ1A 3L3VA 1HQUA 4FYDA 2VG7A 5K14A 1YF5L 4LH5A 3LANA 2A41A 2P9SB 2QWLA 4BRKA 4CHQA 5C12A 3ZEUA 1NK8A 3PX6A 4PL7A 3TTDA 3CCVN 3S3OA 4PHTX 1WN7A 3VOVA 3BUZB 3KWIA 4DQPA 5HLFA 4Z0UA 4I2PA 2D1KA 4ISGA 4CD1A 3RMAA 2W6KA 2X6SA 4HUFA 2QEXN 4NCGA 1YAGA 2XO7A 4FK4A 3R1XA 2G8WA 3VEVA 3CCQN 2V51B 1BL3A 1HJRA 2YJFA 3RWUA 1T8EA 3QINA 2G8KA 4B3SK 3FR0A 3ZLJA 4BG9A 3K5MA 1YUWA 3D2FB 4W5QA 3L4IA 3OYAA 1IJJA 3C94A 3LDSA 1A5VA 3VQCA 1N6QA 3D7EO 4X65K 5FRNA 3D0PA 3UKUA 4BQZA 1EETA 4B8CA 3OA9A 4NCBA 4OGEA 1SL2A 1B9FA 4E7HA 2QXFA 1QQOA 1WAJA 3OYIA 2LSNA 4CE9A 3OYHA 3QIOA 3ZT4A 3UE5A 4H0OA 5KPZA 2VGNA 5LJVA 4DHYA 3SBGA 4E1JA 3QETA 2UXDK 4B9VA 2P9PA 3O3FA 1BHLA 2HNDA 3LP3A 1YVUA 2QWQA 3I55N 3SCXA 4AHUA 2BANA 3O1WA 5BN8A 2NRXA 4WYBA 2KZMA 4FK0A 1WNSA 4BDYA 2GV9A 5M1QA 5AQTA 4R79A 3VQEA 2X74A 4JI8K 4LF7K 3ISNC 1WAFA 2P5GA 4DSLA 3HTVA 2A3ZA 4RW6A 2Q1NA 4FJ8A 3T19A 4JHDB 2JWKA 4BR0A 4KBOA 3V81A 2HNYA 4AHRA 1SKRA 2QW9A 1SZ2A 3THYB 4BRHA 1QTMA 4FM2A 4YDUC 3EN9A 3ULEB 4CF8A 3H1VX 2RF2A 2UXBK 5EU7A 1KVCA 4FWMA 1J54A 1Q7YO 1HNIA 2E6MA 3DXMA 4CK3A 3PLAA 4FJJA 1CXQA 3TPQA 3ZX2A 1IKYA 5JLHA 4FZZA 2HF3A 3IKMA 3AA5X 4IDHA 1XHZA 2O8DA 3LPUA 4CJFA 3AGRA 3VGKA 1RT4A 2VWKA 4AHTA 3TSPA 4KH4A 2WOMA 1WB9A 1S6PA 3THWA 4E0DA 2YHWA 3AVGA 5AQZA 4HTLA 1X3NA 1NGBA 4H0YB 3T1AA 1WSEA 2UYTA 4A2BA 3VQBA 4B9LA 2D0BA 3GOIA 5AQFA 3U9DA 3ZEUB 5BRFA 5IWAK 3ATVA 3DI6A 4FWPA 4IJNA 2P9IA 3K9JA 4B08A 4CVNE 1UA1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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