3AAPA

Crystal structure of lp1ntpdase from legionella pneumophila
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
353
structure length
353
Chain Sequence
KHSCIAVIDAGSTGSRLHIYSYDTDDTNTPIHIEEIWNKKIKPGFASIQPNSVTIDAYLTMLLADAPIHNIPVYFYATAGMRLLPQSQQKKYYDELEYWFRQQSQWQLVEAKTITGNDEALFDWLAVNYKLDTLKSVQNKSVGVMDMGGASVQIVFPMPKNAEISKHNQVELNIYGQNINLYVHSFLGLGQTEMSHQFLNSPSCFANDYPLPDGESGQGNAPSCKEEVTSLMNSVHKVNQQIQPLLALNPVNEWYSIGGISNLASSQLFHFENSELTNQSLLQQGDNQICHQQWDILNGQYPDDEYLYQYCLLSSYYYALMVDGYGINPNQTIHYIPPEQNLDWTIGVVLHRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Legionella pneumophila
publication title Crystal Structure of a Legionella pneumophila Ecto -Triphosphate Diphosphohydrolase, A Structural and Functional Homolog of the Eukaryotic NTPDases
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase I
total genus 105
structure length 353
sequence length 353
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3aapA01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3aapA02
3CQXA 1QQOA 3ULEB 4BVOA 3UKRA 2P9KA 4K42A 1Z6RA 3H46O 2E20A 3EKUA 3UKUB 5JLHA 4RWTA 4KBOA 3WXIA 3MCPA 1HKBA 4CD1A 1NWKA 4HTLA 2P9LA 2E1ZA 3A0IX 3VPZA 3EL2A 1HLUA 5I9EB 3QBWA 4FWQA 1HKGA 3ZX0A 2A6AA 1GLFO 3DJCA 2P9NA 2E88A 5E26A 2V7YA 3HI0A 5AQUA 2EWSA 3AY9A 3FZHA 4H0TB 3EO3A 3ENOA 2Q2RA 3JXUA 2GWKA 2H3GX 3F9MA 5AQSA 1MA9B 3U9ZA 3L0QA 4IZ9A 4XH5A 3MN6A 5ADXA 4EFHA 3GG4A 3CJ7A 1X3NA 5LJWA 4B1XB 1GLAG 1NGCA 1IG8A 2V52B 3O80A 2NLXA 2I7NA 3VEOA 3QMLA 4PKHA 1X9JA 2HF3A 2ZGYA 1HX1A 2BUPA 2CGKA 1QHAA 4AM6A 4NO7A 2NZTA 4XH4A 4I6MB 2P9PB 4BRGA 4CBXA 4BQZA 3C7NA 3A5OC 1BA1A 1U2VA 3KHYA 4F9OA 2Q31A 2P9UB 5AQYA 4BRIA 1T44A 1NGGA 5BPMA 4BVPA 3FFKB 4JD2B 3FZFA 4IJNA 5AQRA 4BRNA 1GLDG 2Q0UA 4JHDA 1RDWX 3VENA 2D0OA 1QQNA 4CZJA 5FPMA 1H1VA 5AQGA 2E1YA 2E2PA 3RSEB 1MWKA 3BP8A 3M1FA 4BGAA 4BR5A 1YUWA 5AQNA 3O6WA 4YDUA 5FPDA 5JMVA 4FOEA 1R59O 3IDHA 3U4LA 2YHWA 4BROA 4CI6A 5CE3A 5BN9A 3VEVA 1RGIA 3WUHA 2E2QA 1NGBA 3D2EB 4ISEA 3VEYA 3WEEB 5JICA 1TYQB 4L3QA 3VOVA 3W0LA 4A2AA 4FSVA 4BC4A 2GUPA 2PAVA 3MMVA 4QS9A 1GLBG 1RFQA 4B1WB 5FPEA 4BREA 3D2FA 4BG8A 4FWOA 4A2BA 4BRFA 3MN7A 3ZEUA 2VWBA 1NGIA 1GLCG 1SZ2A 4FWKA 2CH6A 3EN9A 3QBXA 5BPNA 1XC3A 4MO5A 4BRQA 3KZBA 3O08A 3AARA 3IMXA 2P9IA 4WQ4A 5FPNA 2PBDA 3FR0A 3VF6A 2OANA 1ATSA 4CZEA 2QWQA 2QW9A 4BRCA 1E4GT 1Q18A 2FLOA 4NB4A 5AQKA 4K25A 2IIRA 1XUPO 5LJVA 3R8EA 2AA4A 5AZJB 1KAYA 1K8KB 4B1YB 3ZETB 2FSNA 1T6DA 3IUCA 1V4SA 5F1XA 3VGMA 3O5BA 3C0BA 3FE1A 3I33A 3GL1A 1HUXA 3HBTA 4CZMA 2V51B 2AP1A 3SMSA 3UKRB 2P9KB 3VESA 2Q0RA 3QDKA 3BF3A 2D4WA 5EOYA 4CD3A 1P8ZA 3DXKA 3B8AX 4EHTA 3O4WA 2E2OA 1DGKN 1BO5O 1DKGD 4H5RA 3BUZB 2FSKA 2P9LB 3FZLA 2GELA 2ZWHA 3CI5A 2Q36A 1MWMA 3LDNA 3P4IA 2P9SA 3CQYA 1ATRA 5AR0A 4DB3A 3H3NO 4JAXA 2P9NB 3L6QA 4MLEA 4EAHD 3CERA 4CZKA 5AQHA 5TKYA 1BOTO 3VF4A 1QZ6A 4Z94A 3H6EA 3VERA 4FPAA 3BEXA 2HOEA 4FWNA 1BDGA 4BR7A 1BU6O 2WUSA 5AQLA 3TPQA 3M6GA 3ZX3A 4BR9A 4QS8A 1ZXOA 4B1UB 2J4RA 4FWMA 2QM1A 4FPBA 3QICA 1C0GA 4CBUA 1TUUA 3MN5A 3WXKA 1IJJA 1KAZA 4H0OA 4ISGA 3GE1A 2VCPA 2YHXA 2FSJA 5AQXA 5KQDA 3JS6A 3EZWA 5JLFA 5EVZA 3DXMA 2QWPA 3LM9A 4Y0WA 4CBWA 3EKSA 2ASMA 5AQVA 3UB5A 1ZC6A 4MO4A 2QXLA 2IVPA 2Q1NA 3C7NB 4BRDA 2A3ZA 1U2VB 4BRLA 5AZIA 2UYTA 1KAXA 3ATUA 4BRKA 3DAWA 5LY3A 1ATNA 2QWLA 2A40A 3A8YA 3GDQA 1G99A 4FWSA 3CJAA 1OKJA 4BQLA 5KQ8A 3H45C 4CZGA 3TU5A 4JHDB 1NGHA 3VETA 2D1KA 3IFRA 4BG9A 3CJCA 2GEMA 4JNEA 5KPZA 1YXQA 4CZLA 3AAPA 5AQZA 4PKIA 1JCGA 2ZF5O 3BF1A 1DEJA 5E84A 4H03B 4EIAA 2GTDA 1WOQA 3CETA 2KHOA 2V7ZA 4LC9B 4HWIA 4PL8A 3CHWA 3MN9A 4WQ5C 4GY2B 4BRMA 4M7XA 3A5LC 5BRFA 1Y64A 1GLJO 3WQTA 2YJFA 5BREA 3VEZA 4B1ZA 4H5WA 3A5NC 4K43A 4PL7A 4BR4A 5AFUH 4CJ7A 1NGJA 2NRHA 3D2FB 4CZHA 1U6ZA 1S3XA 2F9TA 3QB0A 4H0XB 5BPLA 3ZEUB 1BA0A 3GBTA 2E8AA 3LM2A 2E2NA 1GLEG 4BRHA 4DQ8A 3ULEA 3H1VX 3S41A 3CJ1A 4DCHA 3FZMA 4WYBA 2P9IB 3UKUA 4EHUA 4XH1A 4BR0A 2I7PA 2YJEA 5EXWA 3U8XA 1NLVA 4O5FA 4H0VB 1J6ZA 3CJ9A 3OHRA 3DWLA 1NGFA 2A42A 1ESVA 4IO8A 3VGLA 2VYPA 1SAZA 4BC2A 4QS7A 5AQIA 2QWMA 3QFUA 5BRDA 4BGBA 5BRHA 3HZ6A 3UE5A 1EQYA 2ASPA 1JCEA 2W41A 2A5XA 3FLCO 3FZKA 3ENHA 3DXKB 3J8AA 4CZFA 3KVGA 5AQOA 5AFUA 5ELZA 1HPMA 5AQTA 2ZGZA 4O8KA 3LDPA 4WQ5A 2FXUA 4M7YA 3CIPA 2P9SB 1NMDA 5AQPA 4YDUC 2CGLA 5AQQA 3WQUA 4GNIA 2BTFA 4H5NA 3ZX2A 4FWPA 3A5MC 3H1QA 3SMPA 1C0FA 1ZBSA 3O1WA 3ID8A 3M3ZA 1D4XA 4M63C 4I6MA 2P9PA 5BR9A 3WT0A 4IJAA 5AQFA 3O1BA 1NBWA 1E4FT 4K41A 2P9UA 5F2RA 4FL9A 2A41A 4ISFA 3R6MA 1HJOA 2CH5A 2IVNA 5EX5A 3MK6A 1XQSC 4PKGA 4JD2A 2GWJA 3LDQA 4BC3A 3DXMB 1BWFO 2Q97A 4BRAA 5B8HA 3GOIA 2ITMA 4H0PA 2CGJA 3ATVA 1X3MA 4RCHA 3U9DA 3G25A 3HM8A 4WQ4C 3VEWA 2QWNA 1TUYA 3RSEA 1YVNA 1QQMA 3WXLA 1Z05A 4H5VA 5KPRA 2W40A 3CJBA 5AZIB 5AQMA 1GLLO 4FWRA 5BN8A 3D7EO 4J8FA 1MDUB 2DPNA 5F0XA 4C23A 1NGEA 1S22A 1BG3A 4AM7A 2ASOA 3D2EA 4IWVA 3WEEA 4FO0A 1NM1A 1TYQA 3LDLA 3L4IA 1JCFA 1CZAN 2YCHA 2YHYA 3SK3A 3SLCA 1LOTB 5EY4A 2D0PA 2HF4A 4RTFD 4FWLA 3SJHA 2HMPA 4H0YB 3I8BA 3LDOA 4MLHA 4DHYA 1KXPA 4B1VA 3HTVA 4B9QA 4IXCA 2FF6A 3VEXA 5AQWA 1LCUA 3AAQA 4A61A 1NGAA 2F9WA 4BC5A 3LL3A 5AQJA 3H3OB 1HKCA 4FOIA 1QZ5A 3FGUA 2QWOA 3VGKA 4BR2A 3R9PA 4H5TA 4CZIA 3VF2A 4E1JA 4JN4A 3QFPA 3W3DA 1WUAA 3WXJA 2IVOA 1NGDA 2FF3B 5KPTA 1YAGA 2QWRA 3HSCA 1BUPA 3MDQA 5AZJA 1K8KA 1SQKA 4XEIA 3ZETA 1V4TA 5ADXH 1T6CA 3O8MA 4A62A 2YI1A 4BRPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P9KA 2YNGA 4DSKA 2YNIA 2AJQA 3LWLA 3UKUB 5JLHA 4KTWA 3O9TA 3J7ZO 2HBLA 4NYFA 3SUQA 4KBOA 4IKFA 1WSIA 1HNWK 3MCPA 4IO9L 1S1UA 1IV0A 4GKKK 1NWKA 4OPHA 2P9LA 2E1ZA 4JI1K 3T1AA 3VPZA 1HLUA 4DV6K 1OH6A 3CCUN 4KTQA 3ZX0A 4KH5A 4AF1A 1GLFO 1T3VA 2P9NA 4IDHA 5E26A 4A57A 5AQUA 2IOCA 4W5QA 3S3MA 1EXQA 3TAMA 1IKYA 5T7BA 3VQPA 2F8SA 4H0TB 4FZXC 4WF9L 1LWFA 2A1SA 2HBJA 1A5XA 3ZLJA 3U9ZA 5LMUK 4IZ9A 4B08A 2BANA 3I0SA 2QA4N 1X3NA 4CHOA 1NGCA 3O80A 1GOBA 3VA3A 5JS2A 1DLOA 3TAGA 1X9JA 4H4OA 3AVGA 1M90O 1JLAA 3HVTA 4YOVA 4CBXA 4BE2A 3M5RA 3RR8A 4OLAA 1QQCA 4ILGB 4F9OA 4IFVA 4RW7A 4RG8A 1SS6A 4KTZA 1Q8IA 2DFFA 3V9WA 1T44A 4PHTX 4BVPA 4R79A 2IC3A 4JD2B 3FZFA 4IJNA 3DLHA 2O4IA 4AHSA 3QNOA 2Q0UA 3AVCA 3VENA 1B9FA 3HYFA 1QQNA 3SNNA 1H1VA 1SL1A 1OH8A 4KO0A 3LZIA 3E66A 4J2BA 3RVCA 3BP8A 2Y1JA 4BDYA 1J54A 4BGAA 5AQNA 4YDUA 1R59O 3V9ZA 4FK4A 4Q0BA 2YHWA 3LAKA 4CI6A 3VEVA 3ITHA 1RILA 3WXMB 3CF5L 1NGBA 1RTDA 5JICA 3M8PA 3W0LA 4BC4A 2GUPA 3CMEN 1X9SA 4U67L 3NAEA 4FJJA 1GLBG 2YHAA 1RFQA 4HTUA 4CEZA 1HR0K 2KTQA 4FJ8A 4BG8A 2B4JA 1VQNN 1QS4A 2P5GA 3E1YA 1SZ2A 4FWKA 4JI2K 2CH6A 4YHHK 5J2NA 5BPNA 4DTMA 1VSEA 1IKXA 4F2SA 3O08A 4DSEA 1XC9A 4WQ4A 3S9HA 1NJZA 4J2DA 4CIEA 1CZ9A 4BRCA 2FLOA 2WFBA 3MXMA 3NF6A 4Z4IA 1DT9A 3IUCA 5F1XA 4JI3K 3FE1A 3CCVN 4CZMA 2V51B 4JI8K 4I7FA 2P9KB 1KCFA 2D4WA 3T69A 2ZJQL 1UOCA 4CEBA 3PX0A 3AVAA 3V9UA 1SL2A 1DGKN 1G15A 1DKGD 4H5RA 3BUZB 2FSKA 2ZQBA 2P9LB 3L2VA 1NOYA 3KJVA 1A5WA 3T1HK 2FC0A 4O0JA 3H3NO 4JAXA 1VQ9N 2P9NB 3L6QA 4IG3A 4FJXA 3CERA 1VSIA 1VSKA 1IBKK 4CZKA 4EZ9A 1BOTO 1CZBA 1J53A 4Z94A 3MEDA 4DV7K 3BEXA 4OKKA 3TSQA 4JKHA 1UA0A 1NJXA 2X6SA 5DK5A 3U3GA 4BR7A 1LAWA 4ELTA 5AQLA 3TPQA 3ZX3A 4ELVA 4W5NA 1ZXOA 1VRTA 2QM1A 4O55A 3QICA 1TUUA 3ZSXA 3WXKA 3OYCA 2XRIA 1VQKN 4H0OA 1VQ6N 3MAQA 2VCPA 1IH7A 4FJ9A 5AQXA 3JS6A 3EZWA 4OGCA 3LM9A 3K5OA 3KK2A 3RWUA 3O4NA 3EKSA 2ASMA 4MO4A 3DI6A 2A3ZA 4NCAA 5HL7L 4DF4A 3CCSN 1C1AA 2HNYA 1RT2A 4NLCA 4EZ6A 3HPOA 1D5AA 4FJ7A 1YIJN 5LY3A 2A40A 4LSNA 3A8YA 4M45A 1G99A 3C6HA 3CJAA 4BQLA 4NLBA 4YOTA 1JJ2M 4JI6K 4JYAK 3PIPL 4BG9A 4WFBL 3CJCA 3THVA 3DYAA 4GV6A 5KPZA 1YXQA 1LWCA 4YOUA 3QEPA 4CESA 1F21A 4KHYA 4CEOA 5KGWA 1JCGA 4CJEA 5GAGP 4CJTA 4CGJA 5E84A 4LSLA 5FLXO 4YORA 1WOQA 3V6DA 4IFYA 2BH1A 4WQ5C 3SV3A 2EX3A 3A5LC 1RT7A 1Y64A 5HRNA 3TAQA 4C1NI 3LAMA 3KLIA 2HHWA 5CYMA 1XMQK 1EP4A 4FJIA 4J2EA 3K5MA 2F9TA 4H0XB 3Q7BA 3VQAA 3LM2A 4DR1K 2E2NA 5J1EA 5C2DA 1GLEG 2HHHK 4DQ8A 3CJ1A 1XMOK 4WYBA 1KLNA 2KKZA 1HNIA 3LPTA 1K9MO 1WSGA 2G8VA 2WTUA 4B8AB 3SJJA 2VYPA 4BC2A 5AQIA 4DTJA 1HYZA 3NGYA 2OTJN 1VSFA 1QE1A 2HNZA 1W0HA 2HHXA 3VQ8A 3OW2M 3FLCO 3HPHA 3J8AA 4OGEA 1N6QA 4DWIA 3F73A 2ZGZA 4FLYA 4M3RA 4OJRA 4GVMA 1RNHA 2HSTA 1TVRA 2VG5A 3LALA 1VSMA 4GNIA 4N41A 4DQRA 4ICLA 4CJQA 3ID8A 3M3ZA 4OVLA 2P9PA 3MEEA 2UXDK 3WT0A 1RDDA 4JKCA 1XNRK 1LAVA 1NBWA 4KAZA 2YX6A 3BZCA 3HXMA 1TKTA 2FBTA 4FL9A 5FROA 3SQ4A 1QTMA 4MFBA 1RBRA 3AO4A 3SUNA 3TANA 3MK6A 1ASUA 3QIOA 3QO9A 4CF9A 1TK5A 3DMJA 3GOIA 2RKIA 4CJVA 4GKJK 3HM8A 3VEWA 3WNEA 2GBZA 4JS4A 3K58A 4RW6A 3RSEA 2F7TA 3P83D 3OS0A 4CJUA 1X1PA 4CGIA 1ZBUA 4J8FA 3VTIA 2DPNA 5F0XA 3U3YA 3E9OA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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