3AAPA

Crystal structure of lp1ntpdase from legionella pneumophila
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
353
structure length
353
Chain Sequence
KHSCIAVIDAGSTGSRLHIYSYDTDDTNTPIHIEEIWNKKIKPGFASIQPNSVTIDAYLTMLLADAPIHNIPVYFYATAGMRLLPQSQQKKYYDELEYWFRQQSQWQLVEAKTITGNDEALFDWLAVNYKLDTLKSVQNKSVGVMDMGGASVQIVFPMPKNAEISKHNQVELNIYGQNINLYVHSFLGLGQTEMSHQFLNSPSCFANDYPLPDGESGQGNAPSCKEEVTSLMNSVHKVNQQIQPLLALNPVNEWYSIGGISNLASSQLFHFENSELTNQSLLQQGDNQICHQQWDILNGQYPDDEYLYQYCLLSSYYYALMVDGYGINPNQTIHYIPPEQNLDWTIGVVLHRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of a Legionella pneumophila Ecto -Triphosphate Diphosphohydrolase, A Structural and Functional Homolog of the Eukaryotic NTPDases
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase I
molecule tags Hydrolase
source organism Legionella pneumophila
total genus 105
structure length 353
sequence length 353
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3aapA01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3aapA02
3CJ9A 4XH5A 4BRFA 3LM2A 3EKSA 4C23A 3C7NB 3BF1A 1GLJO 4L3QA 4PKIA 3RSEA 2QWQA 1MWMA 5AQXA 4MLHA 4DQ8A 2FXUA 1K8KB 5JICA 4H0OA 4JN4A 4FL9A 4FPBA 2P9KB 3QBXA 3MDQA 4H5NA 4JNEA 4IO8A 3VGMA 1BG3A 1WUAA 1OKJA 3ZETB 2GELA 2YJEA 1MA9B 4B1UB 1U2VA 4I6MB 3KZBA 2DPNA 4BRPA 3IUCA 3UKUB 2YHXA 3M3ZA 1V4TA 2FLOA 3DXKB 5AQWA 4NO7A 3VEWA 4H5TA 1DGKN 4I6MA 4BR9A 3ENHA 5BN9A 4FO0A 3A5NC 5AQZA 2GUPA 3QB0A 4FOIA 2YI1A 3UKUA 2CGKA 1QQOA 3H1VX 3O4WA 3DXKA 4B1YB 5AQQA 4BRCA 3JXUA 3FZMA 2W40A 3IMXA 1HJOA 4PL8A 4QS9A 3S41A 3SJHA 3H46O 1ATRA 2P9PB 4MO4A 1XC3A 2ASOA 3VOVA 4BR7A 4FWKA 1YXQA 5AQLA 3U4LA 2I7NA 3R6MA 3MN7A 2Q97A 5AZJB 3EL2A 2UYTA 1KAZA 1BDGA 1BUPA 5LY3A 3HM8A 4CZJA 5AQVA 1QHAA 3WQTA 2E2PA 2P9PA 2W41A 4J8FA 4RCHA 3ZEUB 5AQIA 5BPMA 3GDQA 3SK3A 3MN6A 1T44A 1GLAG 4BVOA 3GG4A 5AZJA 2CH5A 5AQSA 1U6ZA 4LC9B 2D1KA 4PL7A 2BUPA 3DJCA 1NWKA 3ID8A 4B1ZA 5FPMA 1QZ6A 3DWLA 4FWSA 4CBWA 1HLUA 1HX1A 3A0IX 2ASPA 5KPTA 4Z94A 5BRHA 1Z05A 4H0VB 1DEJA 2QXLA 4JAXA 1R59O 1C0FA 3AARA 4ISFA 2E1YA 3A5MC 3LDNA 3WQUA 5AZIB 4KBOA 3VEOA 3BUZB 5AQKA 4H0PA 4XH1A 3D2FB 5AQJA 3QICA 4BRHA 3VEYA 4A2AA 1JCEA 1BU6O 1QQMA 2BTFA 1ZBSA 3L4IA 4BRMA 5AZIA 4FWRA 4A62A 1BO5O 2D0PA 4HWIA 4CI6A 3FZHA 1RDWX 5EXWA 3MN9A 2P9IB 1TYQB 2E2QA 2A6AA 4BC5A 5BRFA 5AQNA 1XQSC 2AA4A 2P9LB 4H5WA 2NZTA 3FFKB 3SMPA 4DB3A 3DXMB 3U9ZA 2CGJA 2Q0UA 3MK6A 5AFUA 5AQPA 3SLCA 4BRIA 5BR9A 1Z6RA 2A42A 3AY9A 4JHDB 4FWMA 1MWKA 1BA1A 1ESVA 2P9IA 2QWLA 3ULEA 3VEZA 1TYQA 2F9TA 1WOQA 4HTLA 2E1ZA 5EX5A 3C7NA 2P9LA 3FE1A 4FPAA 3OHRA 3DXMA 4E1JA 4RWTA 3IFRA 4JHDA 4BGBA 1K8KA 4BQZA 4A2BA 2P9KA 2V7ZA 3WXLA 2YCHA 5AQTA 1Y64A 2EWSA 4WQ5A 2P9SB 1YUWA 3CIPA 4FOEA 4K41A 5B8HA 3ZX2A 2HF4A 3VEVA 3ZETA 3I8BA 3GL1A 5AQFA 3VGKA 1SZ2A 4CZHA 1T6CA 2E2NA 2E8AA 3FZKA 3KHYA 1MDUB 2VWBA 5TKYA 3LL3A 4BG8A 5AQUA 2NLXA 3HZ6A 2J4RA 2P9SA 4BC2A 2YJFA 3W3DA 3HI0A 4PKHA 4XEIA 3DAWA 1X3MA 3C0BA 1T6DA 2QWPA 4YDUA 3CQXA 1NGAA 3H6EA 3WXIA 3FLCO 1GLLO 3QFUA 2GTDA 3CERA 3QFPA 4QS8A 4H0TB 5AFUH 3O1BA 5BPNA 1NGBA 4BG9A 5F1XA 5ADXA 2KHOA 2NRHA 5BN8A 4EIAA 5E26A 4O8KA 3ATVA 4FWLA 2YHYA 1RFQA 3AAPA 3FGUA 3FZLA 3AAQA 3R8EA 2ZWHA 3HBTA 2IVNA 3H1QA 3LDOA 3EZWA 3VETA 2QM1A 3D7EO 4JD2B 3WEEB 3O5BA 4WQ5C 3ZEUA 3M1FA 1NMDA 4BRDA 4XH4A 4RTFD 4IJAA 1S22A 4BR4A 3U9DA 5BPLA 3HTVA 3BEXA 2ITMA 3CQYA 5AQGA 1E4GT 4K42A 3G25A 4B9QA 5AQOA 4JD2A 3WEEA 4B1VA 3LDPA 4K43A 1ZXOA 1NGCA 3CJBA 1D4XA 3R9PA 4CJ7A 5JLHA 3O6WA 4YDUC 4CZGA 4AM7A 3D2EB 1V4SA 3QMLA 1HKGA 2HF3A 3QBWA 4BRLA 1H1VA 4H0XB 2QWNA 4NB4A 3WXJA 1HPMA 2V52B 4BR5A 4F9OA 1J6ZA 1LOTB 4CBXA 1HUXA 3JS6A 3LDLA 3ATUA 3EN9A 2Q0RA 5BREA 3D2FA 4M7XA 4CZLA 2V51B 3ZX0A 3D2EA 1TUYA 4CZKA 2Q31A 4MLEA 1QQNA 5I9EB 4EHTA 1SAZA 5ADXH 2ZGYA 1JCGA 3VF6A 3VERA 1NGDA 3BF3A 2IVOA 3P4IA 2P9UB 3WT0A 3TU5A 1NM1A 3ENOA 4IXCA 5AQYA 1GLFO 4EAHD 2CGLA 4BR0A 5JLFA 3RSEB 3L6QA 1NGJA 1Q18A 5EOYA 5ELZA 1DKGD 4B1WB 4QS7A 2VCPA 3GOIA 5E84A 2P9UA 1NGFA 1NGEA 1P8ZA 2E20A 3CJCA 4CD1A 1X3NA 4BR2A 3VESA 4M7YA 1LCUA 1S3XA 1BOTO 5FPNA 4H5VA 4GNIA 1U2VB 4FWQA 3UE5A 1QZ5A 3O08A 4CBUA 2QWRA 1YVNA 4H03B 3IDHA 1XUPO 4BRKA 4A61A 4WYBA 1KAXA 2Q1NA 2Q2RA 4Y0WA 2HMPA 2E2OA 1CZAN 3QDKA 4WQ4A 3VGLA 2FSJA 1TUUA 4FWNA 2AP1A 2FF3B 3O80A 3WUHA 3H45C 3H3NO 1IJJA 2A3ZA 3CJAA 1X9JA 1GLBG 1IG8A 4FWOA 2ASMA 3LM9A 3J8AA 2VYPA 4BRNA 2D0OA 3I33A 1ATNA 2QW9A 4EHUA 5F0XA 3SMSA 5AR0A 2QWMA 4CZMA 2IVPA 3UB5A 3VENA 2GWJA 3U8XA 4BC3A 4H0YB 2A41A 2ZF5O 1KAYA 4M63C 5BRDA 2GEMA 4BVPA 3WXKA 2E88A 2V7YA 4BRAA 2HOEA 4BQLA 2F9WA 3VPZA 2A5XA 4FSVA 4FWPA 4BROA 2WUSA 4DCHA 4ISEA 1NGIA 2YHWA 1NGGA 4K25A 3H3OB 2PAVA 4GY2B 1HKCA 4H5RA 4MO5A 2P9NB 3GBTA 3FZFA 5AQMA 1YAGA 3MCPA 4BREA 4O5FA 3HSCA 5F2RA 2QWOA 5CE3A 5LJVA 3A5OC 2FF6A 4IZ9A 4WQ4C 2H3GX 3F9MA 3EO3A 4CZEA 4CD3A 1SQKA 3A5LC 3UKRB 3VF2A 3CETA 3CI5A 5JMVA 4EFHA 1GLCG 1E4FT 1NBWA 3VF4A 2P9NA 1RGIA 4AM6A 4IJNA 3A8YA 3LDQA 2Q36A 3CJ7A 5AQHA 5LJWA 2FSKA 3B8AX 1HKBA 3VEXA 2ZGZA 3KVGA 4DHYA 5FPEA 2FSNA 1GLDG 4CZIA 1GLEG 4BRQA 3O8MA 3UKRA 5KPZA 3CJ1A 3MMVA 3MN5A 4BRGA 5KQ8A 1NLVA 1BWFO 3L0QA 3ZX3A 1BA0A 4IWVA 1ATSA 2GWKA 2PBDA 1G99A 3BP8A 5AQRA 1NGHA 1C0GA 3ULEB 4CZFA 4ISGA 4BC4A 3M6GA 2I7PA 2D4WA 2IIRA 2CH6A 5FPDA 1EQYA 3O1WA 1KXPA 5EVZA 5EY4A 3W0LA 2OANA 3FR0A 5KPRA 4PKGA 3CHWA 3GE1A 1ZC6A 4B1XB 3TPQA 1JCFA 2A40A 5KQDA 3EKUA 4BGAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DLBA 5IT9O 1NK9A 1S6PA 1GLJO 4L3QA 4PKIA 2EHGA 4A57A 4JKAA 3RSEA 3MAQA 1MWMA 4FJMA 3V9WA 2VWJA 4FPBA 1NK4A 3PX4A 3VGMA 1BG3A 3ZETB 2QA4N 4I6MB 3KZBA 2Z1IA 3AO2A 4DQIA 1IO2A 3M3ZA 3KLHA 1IBMK 4CFAA 4DFPA 2P51A 4YFUA 4JI0K 5LL6Z 1NNEA 3SUPA 4I6MA 4OJRA 1NG9A 3NF7A 4LSLA 5AQZA 3A5NC 4PUOA 3QB0A 4FOIA 3QEVA 2KFNA 1VAZA 3SQ1A 4DV3K 3H1VX 3O4WA 4B1YB 4O0IA 1KLMA 3FZMA 3S41A 4LFBK 2HHWA 1ATRA 3ZSQA 4LF4K 3U4LA 1NKBA 5HBMA 5CZ1A 2UYTA 4CZJA 5AQVA 1B92A 4BE2A 1WSGA 3BGRA 4J8FA 3AVBA 4LH5A 4RCHA 2Z1HA 5BPMA 3GDQA 3RRGA 3MN6A 2HHSA 4BVOA 1KQSM 1TV6A 3M8PA 1HYVA 2OPQA 3LWLA 4DF4A 3THWB 2ZJRL 4CK3A 4KKOA 4PL7A 3DJCA 3AVHA 1KFDA 3AA4A 1QZ6A 1BIZA 2ATQA 1LW0A 3OYIA 4Z94A 1Z05A 2HBKA 3HL8A 3THWA 4CJKA 4JAXA 5GAGP 3OS0A 3A2FA 3MEEA 5AZIB 1OH5A 1I39A 1QS4A 3OYNA 4H0PA 4F2SA 3NCIA 3V1QA 3ASMA 3VEYA 3OYBA 1D8YA 4FXDA 1BU6O 1QQMA 4Y1DA 5AJ3K 3O9QA 1OH7A 2HNDA 5AZIA 3KK3A 1S5JA 2UXBK 4LH4A 5C15A 4A62A 4C8OA 3HO1A 1VQ9N 2WFBA 4CI6A 4CEOA 2NNWA 2UU9K 2P9IB 4KI6A 1L3UA 2AA4A 2G8HA 4H5WA 3FFKB 3DXMB 3U9ZA 1KCFA 2Q0UA 4N41A 5AFUA 1VSKA 2A42A 4FWMA 3V9SA 1XHZA 3EYZA 1ESVA 1RDAA 2P9IA 2QWLA 3ULEA 5HP1A 1FK9A 2FBVA 4Z4FA 3VQDA 3KK2A 4HTLA 1DTTA 2E1ZA 4JI1K 5KI6A 3DXMA 4PHTX 3AA3A 4WFNL 3LPUA 4A2BA 2P9KA 3MEGA 4DSFA 2V7ZA 5IWAK 2YCHA 2YNIA 5AQTA 3V9UA 1WSJA 4DTMA 2HSTA 1Y64A 2P9SB 2OPRA 4B9UA 1WNSA 2WBNA 1SZ2A 2KZMA 4O8UA 4FVMA 2E8AA 3AV9A 4QAGA 4OVLA 3HZ6A 2P9SA 2YJFA 3W3DA 2ZM6K 4YHHK 1T6DA 2QWPA 4IG0A 4C8MA 3CFOA 3WXIA 3CERA 4DTRA 1CZ9A 5AFUH 3M8SA 1NGBA 3DOLA 4BG9A 3TSPA 5F1XA 5ADXA 4HHTA 1NOYA 5E26A 4O8KA 2XO7A 1U49A 4E3SA 2G8IA 2HNZA 4BDYA 3FGUA 4KB1A 1GOAA 1ASUA 4ILJA 3HBTA 1SUQA 1XHXA 2IVNA 3TSUA 1I94K 1ZBLA 1BCOA 4JI3K 2YX6A 1Q9XA 3SV3A 4KRFA 4BRDA 1Z25A 4GV9A 4XH4A 1S22A 2YNHA 4YOWA 4XIUA 5BPLA 3BEXA 4OLBA 3DI6A 1E4GT 1DLOA 3BZCA 3U3GA 4B1VA 3LDPA 2GX9A 4W5OA 1NGCA 3R9PA 4RW4A 4JRQA 4CZGA 4EZ6A 5HRPA 2VG7A 1V4SA 3QMLA 1HKGA 4M45A 2VG5A 1HPMA 2FBTA 5C42A 1J6ZA 3VQQA 1TK8A 4NXNK 3LDLA 3EN9A 1FKPA 2E6MA 2VGMA 1TAQA 4CZKA 2Q31A 5I9EB 4EHTA 5ADXH 2YHAA 3WNHA 4TSXA 2O8FB 3OYMA 1C0UA 3T1HK 1YJ9N 1KVCA 1ZBHA 2IVOA 4FJ7A 4FLVA 1RBVA 4ILHA 4RW7A 2P9UB 3SJJA 4ICLA 4HVJA 3KTQA 2OPPA 1X9MA 1KVBA 3QIOA 1W97L 4O4GA 1Q18A 5GIPA 1DKGD 4B1WB 2R7YA 2IAJA 4J2AA 3E66A 4CEAA 3ZT0A 3CMAN 1RNHA 3GOIA 2P9UA 1NGFA 1P8ZA 4BWMA 4DMNA 3SBGA 4OPAA 3HT3A 4C8KA 2ZD1A 3ZT3A 5CR4A 3VESA 3CG7A 1NU0A 1BOTO 1U2VB 1ZBIA 1P90A 4JI7K 3O08A 3F73A 1Q86O 4CBUA 1JLGA 1YVNA 4DR7K 4V19S 1XUPO 2F7TA 4M42A 4A61A 2WTUA 3LWMA 2WC9A 4RW6A 5J2QA 1WSFA 4W5RA 4FM0A 3NH2A 2F4VK 2Q1NA 3QEIA 3TAPA 4NLBA 3QDKA 3VGLA 1BQNA 4QOZB 2FSJA 1IBKK 2IC3A 4IFYA 3NDKA 4GKJK 3UIQA 3QINA 2B6AA 2FF3B 3O80A 2VG6A 3AVNA 3R1XA 4CHQA 2XY7A 4F8RA 1IJJA 3AVMA 4KI4A 2KLAA 2DFFA 4FWOA 1C6VA 4A5BA 1OH8A 3J8AA 2VYPA 1VQ5N 3S3OA 4I9QA 1HJRA 4EHUA 5F0XA 5FROA 2IVPA 3C6AA 3U8XA 2A1RA 2ZF5O 1EP4A 4WCEL 3L2QA 3O9RA 4OGEA 1VQPN 3VA3A 1NKEA 4CGFA 1SKRA 2F9WA 5CYQA 3VPZA 2A5XA 1C1AA 1RDBA 1NGGA 1B9FA 2PAVA 4ZTJA 2P9NB 1HR0K 4DSLA 3V1RA 3FZFA 1NOZA 5AQMA 3PLAA 3TR8A 5CE3A 4ELVA 3OYHA 3SYZA 1T8EA 3I55N 4IZ9A 2YKNA 1Q81O 1S1UA 1S9EA 3F9MA 4F2RA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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