3AARA

Crystal structure of lp1ntpdase from legionella pneumophila in complex with amppnp
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
352
structure length
352
Chain Sequence
HSCIAVIDAGSTGSRLHIYSYDTDDTNTPIHIEEIWNKKIKPGFASIQPNSVTIDAYLTMLLADAPIHNIPVYFYATAGMRLLPQSQQKKYYDELEYWFRQQSQWQLVEAKTITGNDEALFDWLAVNYKLDTLKSVQNKSVGVMDMGGASVQIVFPMPKNAEISKHNQVELNIYGQNINLYVHSFLGLGQTEMSHQFLNSPSCFANDYPLPDGESGQGNAPSCKEEVTSLMNSVHKVNQQIQPLLALNPVNEWYSIGGISNLASSQLFHFENSELTNQSLLQQGDNQICHQQWDILNGQYPDDEYLYQYCLLSSYYYALMVDGYGINPNQTIHYIPPEQNLDWTIGVVLHRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of a Legionella pneumophila Ecto -Triphosphate Diphosphohydrolase, A Structural and Functional Homolog of the Eukaryotic NTPDases
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase I
molecule tags Hydrolase
source organism Legionella pneumophila
total genus 111
structure length 352
sequence length 352
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3aarA01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3aarA02
2HMPA 3R8EA 4BG8A 3ULEA 4RTFD 4K41A 1QQMA 2OANA 4BR2A 2E88A 4FL9A 1NGEA 3EKUA 2V7YA 1NGDA 2A42A 3I8BA 4XEIA 1C0FA 4MLEA 4CBWA 3WEEA 4BR4A 1DGKN 1KAXA 2QWNA 3LDOA 4NO7A 5E84A 5ADXA 1JCEA 4PKHA 1IG8A 4WQ4C 5AQRA 3VPZA 5AZJA 4DCHA 3H1VX 4Z94A 2A6AA 5KPRA 2P9LA 4JHDA 4BRCA 2P9PB 4CBXA 4PL8A 4PL7A 4WQ5C 4BRAA 2NZTA 3SMPA 1WOQA 5EY4A 3VF2A 5JICA 3ZX0A 2BTFA 4NB4A 3DXMA 3CJAA 4BRQA 3ENHA 1E4FT 2FSNA 4QS9A 1HKCA 2GWJA 1DEJA 3FZMA 1QZ6A 3QB0A 1G99A 4BC5A 3I33A 4L3QA 1U2VA 4O8KA 4EIAA 3WEEB 1HKGA 3D2FB 1EQYA 2GTDA 4H0TB 5AZJB 3O4WA 4BRLA 1T6CA 1OKJA 2F9WA 4ISFA 5I9EB 3VF4A 4JHDB 3D2EA 4BQZA 2E20A 5AFUH 4M7YA 1J6ZA 3LDNA 5BREA 2E2PA 4BVOA 1XQSC 4B1ZA 3QFPA 3GBTA 4M7XA 5BN8A 1MWKA 4B1XB 3HZ6A 4C23A 2YHYA 3A5MC 1RDWX 5KQDA 1IJJA 2QW9A 2E8AA 5JMVA 2Q36A 3DXMB 1NMDA 5B8HA 1YUWA 4FPBA 2FF6A 3GDQA 3ATUA 4FOEA 3VERA 3LL3A 1SAZA 4JN4A 1HUXA 2F9TA 1ZXOA 1XC3A 1NGCA 4BGBA 5F0XA 4MO4A 3CETA 4AM6A 4FWSA 3HSCA 2P9SB 1T44A 2Q97A 5AQMA 3J8AA 5BRDA 4EHUA 1V4TA 4QS8A 5AQJA 3KHYA 4K42A 3FLCO 4Y0WA 4FPAA 3RSEA 1CZAN 3EO3A 2Q1NA 1GLDG 1V4SA 2GWKA 3FZKA 2ASOA 3AAQA 2IVPA 1BWFO 5AQSA 3M1FA 1ATNA 1NGJA 3U9ZA 1QQOA 3D2EB 2ZGZA 4BRIA 4BRGA 4IZ9A 5AQVA 4IJNA 3B8AX 3ZEUB 3SK3A 2I7NA 5ADXH 2P9UA 3VGLA 4BC3A 3QBWA 4WQ4A 3QBXA 4A61A 4CJ7A 1X3MA 5E26A 4H5RA 3BP8A 1P8ZA 1TUUA 3M6GA 3LDPA 4H0XB 1ATRA 3AAPA 5AQOA 4RWTA 2ASPA 3TU5A 2YJEA 4B1WB 3CJ7A 4A2AA 4WQ5A 2P9KA 2YJFA 3U4LA 3CHWA 1QHAA 1JCGA 4CI6A 4BR0A 3P4IA 4XH4A 3VEXA 4BRFA 1Z05A 2VYPA 3QICA 5FPEA 1MWMA 5BRFA 3EKSA 2FLOA 2V52B 3CJ9A 2CGLA 1HPMA 3H6EA 5FPNA 2VWBA 3TPQA 3VOVA 2GEMA 3GE1A 4FWPA 4BR7A 4J8FA 2QWLA 3VEYA 3SLCA 2BUPA 2ZWHA 1XUPO 5AQQA 1HX1A 2CH6A 3ULEB 1YAGA 1WUAA 2AP1A 1NM1A 3HI0A 5AQTA 4YDUC 3GOIA 3G25A 3FR0A 3CJ1A 3BUZB 2GELA 3DXKA 1KAZA 3H3OB 3MMVA 3ZX2A 2D0PA 3VEZA 3WUHA 4BRKA 3MK6A 1QZ5A 1HJOA 4BR9A 4XH1A 2QWQA 4GNIA 5TKYA 3VEWA 3UE5A 4H5TA 1NGGA 1E4GT 2P9NA 4JNEA 4EHTA 5KPTA 1BU6O 2A41A 3EN9A 4FOIA 5AQWA 2P9LB 3QMLA 5EXWA 4MLHA 2Q2RA 3CJBA 5AQZA 4JD2A 4FWRA 1SQKA 4CZFA 3EZWA 5EOYA 1KXPA 1K8KA 1YXQA 2FSJA 1ZC6A 2WUSA 3GG4A 3GL1A 3DAWA 1GLLO 2GUPA 4CZHA 5BPMA 3AY9A 3BEXA 4JAXA 2CH5A 3VEOA 3VEVA 2Q0UA 1TYQA 4B1VA 3DXKB 3LDLA 4BRDA 1NBWA 3VETA 1U2VB 3UKRA 2PAVA 1HKBA 1BA1A 4M63C 3ID8A 2D4WA 4A62A 5AQXA 5AR0A 3F9MA 2PBDA 4E1JA 2NLXA 3A8YA 2YI1A 2P9NB 1Z6RA 2QWPA 1GLCG 4IO8A 1HLUA 2Q0RA 3ZX3A 3A5OC 1LOTB 3FZFA 2V51B 1BO5O 2E2NA 2ZGYA 4JD2B 1DKGD 3WQTA 1BG3A 4H0VB 3SJHA 4BVPA 4CZGA 3AARA 4DHYA 1JCFA 4FWMA 4MO5A 4GY2B 4H0YB 3WXLA 3MN6A 5AFUA 4FWNA 2ZF5O 3O80A 3U9DA 5F1XA 4H03B 5AQGA 5LY3A 3QDKA 2IVOA 3HTVA 3IDHA 4FWKA 4BRNA 1TYQB 4CZMA 5LJWA 1NGFA 1X3NA 2V7ZA 3FZLA 3O8MA 4IXCA 3WXIA 4FO0A 3LM9A 3CQYA 3A5LC 4CZEA 4QS7A 3FGUA 3BF3A 5EVZA 3UKRB 1Y64A 5AQIA 1D4XA 2QWRA 2P9PA 4FWLA 4WYBA 4O5FA 3ZETA 4H5VA 2QWOA 3JXUA 4IJAA 3CJCA 3FE1A 1S3XA 1NGAA 3RSEB 4F9OA 1TUYA 4B9QA 1NWKA 3VESA 2A5XA 5JLFA 4YDUA 5AQFA 3VGKA 5BR9A 3R6MA 3SMSA 4FSVA 2NRHA 2D1KA 4BGAA 1NGHA 3O1BA 3MN9A 3WXKA 3IMXA 5EX5A 3FZHA 2W40A 3WXJA 2H3GX 3BF1A 1NGIA 2P9UB 2W41A 5AQLA 1BDGA 3MDQA 3CERA 5KPZA 2A3ZA 3LDQA 3CI5A 3D2FA 1X9JA 3IFRA 4CZJA 2P9IA 5AQYA 3FFKB 3HBTA 2QXLA 1BA0A 5FPMA 2YHWA 4EAHD 3A5NC 3W0LA 4FWQA 3VGMA 1KAYA 4A2BA 2P9KB 3WT0A 1MA9B 4K43A 4EFHA 2VCPA 3ZETB 2HF4A 1S22A 1GLAG 2QM1A 3D7EO 3MN5A 2ITMA 4BG9A 4ISEA 3KZBA 4PKGA 3LM2A 4BC2A 4CZIA 5FPDA 4PKIA 3QFUA 2YCHA 3O1WA 3O6WA 5LJVA 1BOTO 5BPNA 5AQHA 2ASMA 4CZLA 5JLHA 3C0BA 1ZBSA 2E1ZA 3O5BA 4BRMA 3H1QA 3W3DA 1H1VA 4H5NA 2UYTA 5KQ8A 1GLFO 3R9PA 1ATSA 4B1YB 2IVNA 4I6MA 3O08A 3L4IA 1U6ZA 4BROA 4DB3A 3MCPA 4IWVA 2I7PA 2P9SA 3VF6A 4H0OA 1R59O 3H45C 2FF3B 1BUPA 2IIRA 5BN9A 4B1UB 1GLEG 2E1YA 3C7NA 2P9IB 5ELZA 4BRPA 2FSKA 2KHOA 3CQXA 5AZIA 3S41A 4BR5A 5F2RA 1SZ2A 1NGBA 3DJCA 1NLVA 3UKUA 3M3ZA 1Q18A 3HM8A 3L0QA 4RCHA 5AQKA 2HOEA 3H3NO 1RGIA 3ZEUA 4CD1A 2CGJA 2D0OA 4H0PA 4HWIA 2J4RA 3MN7A 4HTLA 5AQPA 4FWOA 2HF3A 4BQLA 4BRHA 4K25A 2E2QA 4DQ8A 4BC4A 2E2OA 4AM7A 4CD3A 1YVNA 4I6MB 2YHXA 1MDUB 3DWLA 3UB5A 1K8KB 3CIPA 1T6DA 2EWSA 1GLBG 3ATVA 3IUCA 3VENA 2QWMA 3C7NB 3A0IX 5BPLA 4CBUA 4KBOA 3U8XA 5AZIB 2Q31A 3OHRA 4BREA 2CGKA 4ISGA 1ESVA 4LC9B 3JS6A 3UKUB 2A40A 5CE3A 5BRHA 1LCUA 2DPNA 1QQNA 2AA4A 4CZKA 4XH5A 5AQNA 3H46O 3L6QA 4H5WA 3WQUA 2FXUA 3ENOA 1RFQA 1C0GA 3EL2A 3KVGA 5AQUA 1GLJO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HMPA 4EP5A 3ULEA 1S1XA 4K41A 4IFEA 3KLEA 3J81O 4FL9A 1NGEA 2V7YA 2YNHA 3M8PA 1BQNA 2JWKA 4B3OA 1S9GA 4BR4A 1KAXA 1VRTA 3AVKA 5E84A 1EX4A 4WQ4C 3NCIA 3VPZA 3NBPA 1VQPN 1KVBA 3QESA 3NDKA 4CHNA 3HM9A 4JHDA 3ZT3A 3K9JA 2P9PB 4DU3A 2GBZA 2O8EA 4PL7A 3K5MA 3RTVA 3SMPA 1RT1A 3HP6A 1WOQA 3ZYYX 4O44A 4KKOA 3WNEA 3DOLA 3DXMA 1J5EK 3ALYA 2GUIA 2FSNA 4E3SA 4QS9A 4GVEA 3RMDA 3V1QA 3DRRA 4YORA 2LSNA 3QB0A 1QZ6A 1G99A 3I33A 5C42A 1C0TA 2W6LA 3QEWA 1NKCA 1C1BA 2WONA 3MEGA 3O3GA 3D2FB 1RCHA 1Q9XA 1KRPA 3SCXA 1B9FA 4A5AA 4BE2A 3MCAB 2F9WA 4LF6K 4DSEA 4CFAA 3AO3A 4GVMA 4M7YA 2E2PA 1A5XA 4AHVA 1XQSC 3GBTA 4B1XB 1D5AA 1YJ9N 1IJJA 2QW9A 5JMVA 3LZIA 2HHTA 3AA2A 1KVAA 2E6LA 1NOZA 3MXJA 3GDQA 3VERA 3HRGA 4FZZA 2RN2A 2F9TA 1ZXOA 4B3MK 1T44A 1NK5A 5BRDA 3RR8A 1HNVA 4CFDA 3KKSA 2YHBA 3C6UA 3SUNA 3FZKA 2ASOA 3AAQA 4OLAA 4JKGA 3SAHA 1BWFO 5AQSA 3M1FA 3CFPA 1NGJA 3B6OA 3QEXA 1BCMA 4IZ9A 3ZSOA 4FM2A 4WFBL 3VQAA 5DM7L 2D0AA 2HNYA 5SZTA 4DF8A 3NFAA 4FM1A 5ADXH 4C8MA 1VSDA 3LPTA 1P8ZA 3CCJN 4H0XB 3SZ2A 4IDHA 3AAPA 1F21A 4RWTA 2ASPA 3TU5A 4JRPA 4JK8A 3QO9A 2YJFA 1RBTA 4IO9L 4ID5A 1IH7A 3H08A 4BR0A 3P4IA 1U47A 3V81A 5C12A 2F8TA 4XH4A 3V4IA 2NRWA 3OYBA 1SL0A 4LD0A 1S5JA 3RWUA 5BRFA 2FLOA 2V52B 4LF4K 1ZBLA 4B9UA 3VN5A 2CGLA 2HVIA 4C8OA 2VWBA 3TPQA 1RBUA 1VSLA 2Z1IA 2ZE2A 3GE1A 4BR7A 3VEYA 2O8DB 2VG7A 3SAFA 1JLFA 1XUPO 4IFVA 1BI4A 4OLBA 5AQTA 3KLFA 4V19S 1D9FA 3G25A 4DFMA 3CJ1A 3BUZB 3QNNA 3I0RA 3MMVA 3T3FA 3CFOA 1JLBA 4BRKA 4AHSA 1QZ5A 1J5OA 5BR8K 2OTLN 3VEWA 4BWMA 1NGGA 2PY5A 4CF0A 3TANA 1BU6O 5C25A 4WFNL 3IAYA 4MDBA 1SL1A 5EXWA 4JI2K 2NRXA 2RE2A 5AJ3K 2Y1IA 4JEPA 4FWRA 2ATQA 3EZWA 3LAMA 2NRZA 2FSJA 2WUSA 3GG4A 5HL7L 3BEXA 4ZTFA 1NK6A 1L3TA 4FJKA 4CEEA 3DXKB 1NG9A 3LDLA 3CCMN 1NNEA 1BISA 1RNHA 3KWIA 1HKBA 1BA1A 3DMJA 4JKCA 4M63C 5FRMA 1NJXA 5AR0A 3F9MA 2PBDA 4E1JA 5IWAK 3A8YA 1U4BA 2P9NB 1K6YA 4O0IA 1HLUA 3ZX3A 1LOTB 2V51B 3RR7A 1BO5O 2ZGYA 1ASWA 3VMFB 4W5NA 1DKGD 4J2BA 2P1JA 2VG5A 3AARA 3OYLA 4FWMA 3ZSYA 3IG1A 2IGIA 4LY7A 3WXLA 5AFUA 3ENBA 3KK2A 2F8SA 1CXUA 3AA4A 4M45A 4H03B 3QDKA 4FWKA 3HTVA 1HNIA 3CCSN 4B9NA 2OPPA 1TK8A 1TYQB 4LSNA 4CZMA 4I9QA 5LJWA 4I7FA 1JLCA 3BF3A 4KH4A 5EVZA 1S9EA 1D4XA 3LDSA 3CCUN 2P9PA 1TV6A 1ASUA 4IJAA 3CJCA 5CZ2A 3RSEB 3K5OA 3SPYA 1NWKA 3RVCA 3VESA 5J2MA 3AVNA 5JLFA 4C1NI 3VGKA 5BR9A 1T05A 4DUZK 4R79A 2NRHA 4J2DA 1EETA 3MN9A 2IDOA 4AQYK 5EX5A 1VSIA 1T3VA 2H3GX 2YX6A 2OTJN 5AQLA 3E1YA 3PX0A 3AVCA 3CERA 1TL3A 3CI5A 3LWMA 4FW1A 3D2FA 3SBGA 1CXQA 4CZJA 3THWB 3LP3A 5AQYA 4IG0A 4NLCA 4FWQA 4DUYK 2HMIA 2B4JA 2P9KB 4K43A 1GLAG 2QM1A 2ITMA 3CCQN 4JI0K 3VQ7A 3LM2A 1JLGA 5HRPA 4DV5K 4PKIA 1T7PA 4YOXA 3TSPA 2E6MA 2YCHA 5LJVA 5M1QA 1BOTO 4DV7K 1A5WA 4CZLA 1HYVA 4KTWA 3KK3A 4KTZA 4H5NA 3B6PA 3L4IA 2P51A 4C8KA 3VA3A 3EE8A 4CF9A 1R59O 1S6PA 4DV1K 2IIRA 1FJGK 3R1XA 4NXNK 2E1YA 3C7NA 3L2QA 3NH1A 1Y97A 2FSKA 2G8KA 5AZIA 4IDKA 4GKJK 1NLVA 3K5NA 4JKAA 5CY4A 4RCHA 5AQKA 1TKDA 1IG9A 1S1VA 3G0ZA 3K5LA 3OYHA 1VQ7N 2D0OA 2JGUA 4HWIA 2UXCK 2J4RA 5D3GA 4CK3A 2OPRA 3CMAN 3FFIA 4FWOA 4C8NA 2HF3A 4AH9A 4BQLA 4JI8K 4KHYA 1YTUA 2DFHA 4K0KK 1J54A 2IC3A 2E2OA 2VGMA 1K9MO 2E4LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1U6Z A;  3MCP A;  4KAZ A;  3H45 C;  3V9U A;  4MFB A;  1TK5 A;  4OKJ A;  5HRO A;  1GLE G;  2FBX A;  3P83 D;  2HHQ A;  4BRP A;  4KRE A;  2KHO A;  1SZ2 A;  1NGB A;  3CC2 N;  3UKU A;  4CJE A;  4DTN A;  3L0Q A;  4J2A A;  4NXM K;  4GV9 A;  2HOE A;  3LAL A;  3VQ8 A;  4CD1 A;  3OYE A;  4H0P A;  2G8V A;  5FDL A;  1D9D A;  1G15 A;  3LP2 A;  1OH7 A;  4HTL A;  5AQP A;  4K25 A;  1WLJ A;  2E2Q A;  1J9A A;  1VQ8 N;  4DQP A;  4DS4 A;  4CD3 A;  3OW2 M;  1YVN A;  2YHX A;  3LP1 A;  4FJ8 A;  3SBT A;  3AVJ A;  4CF8 A;  1C0U A;  1GLB G;  3OYM A;  2QWM A;  2KFN A;  3A0I X;  4FLV A;  1QVF M;  3U8X A;  1BIZ A;  1SKS A;  2Q31 A;  3O9T A;  1HYS A;  4BRE A;  2HNZ A;  4DR1 K;  1VSK A;  4OKE A;  2HHV A;  4A59 A;  4CEQ A;  1E3M A;  1JL1 A;  1IKV A;  3D6R A;  3VQ6 A;  5LMN K;  2XRI A;  2GV9 A;  3L6Q A;  4U67 L;  3ENO A;  5HP1 A;  1QE1 A;  3E9P A;  4DQS A;  4X65 K;  2JWL A;  2YHA A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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