3B8AX

Crystal structure of yeast hexokinase pi in complex with glucose
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
471
structure length
470
Chain Sequence
SMADVPKELMDEIHQLEDMFTVDSETLRKVVKHFIDELNKGLTKKGGNIPMIPGWVMEFPTGKESGNYLAIDLGGTNLRVVLVKLSGNHTFDTTQSKYKLPHDMRTTKHQEELWSFIADSLKDFMVEQELLNTDTLPLGFTFSYPASQNKINEGILQRWTKGFDIPNVEGHDVVPLLQNEISKRELPIEIVALINDTVGTLIASYYTDPETKMGVIFGTGVNGAFYDVVSDIEKLEGKLADDIPSNSPMAINCEYGSFDNEHLVLPRTKYDVAVDEQSPRPGQQAFEKMTSGYYLGELLRLVLLELNEKGLMLKDQDLSKLKQPYIMDTSYPARIEDDPFENLEDTDDIFQKDFGVKTTLPERKLIRRLCELIGTRAARLAVCGIAAICQKRGYKTGHIAADGSVYNKYPGFKEAAAKGLRDIYGWTGDASKDPITIVPAEDGSGAGAAVIAALSEKRIAEGKSLGIIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
publication title Crystal structure of yeast hexokinase PI in complex with glucose: A classical "induced fit" example revised.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hexokinase-1
total genus 150
structure length 470
sequence length 471
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2007-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3b8aX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3b8aX03
2A42A 1BUPA 2E2OA 2HOEA 5AR0A 4CJ7A 3LDOA 4EHUA 3VEWA 3ZETA 2P9UA 2GWJA 2GEMA 1HX1A 3TPQA 4FSVA 4CBWA 2HF4A 3A5NC 2CGKA 3ZEUA 1GLCG 4CZLA 3VF2A 4CD1A 1YUWA 3JXUA 3A5OC 3A0IX 3UE5A 3DAWA 2AP1A 1ZXOA 4BGBA 1X9JA 3FGUA 3SMSA 4I6MA 4H5RA 2YHWA 3AY9A 4C23A 3AAQA 5AQKA 3QBWA 4FO0A 1HUXA 4WQ5C 3VPZA 4BRLA 3D2FA 4FWQA 5ELZA 5AQRA 2NLXA 2D4WA 2YJEA 4BREA 5BPMA 1NM1A 3MMVA 5AZIA 2V7ZA 1JCFA 1GLEG 3A5MC 5BRDA 4H0VB 1BOTO 3WXKA 2D0PA 1ATNA 2Q97A 2Q2RA 2W41A 4BR0A 3CJBA 3W3DA 1QZ6A 2D0OA 2ZF5O 4JN4A 3BEXA 4KBOA 5LY3A 2A6AA 5AQGA 3LDNA 5AQQA 4CZMA 2YJFA 5JLHA 4WQ4A 3FR0A 1BU6O 3M1FA 4BQZA 5EY4A 4CZKA 5BRHA 1BA1A 2QM1A 1NGHA 5KPZA 3D2EB 3CJAA 1YAGA 5FPDA 3H1VX 1HLUA 3WXJA 5AQUA 3VETA 3MN7A 1HJOA 4M63C 1NGBA 5AQTA 3B8AX 3JS6A 4CZGA 3H3OB 1NGGA 4XH4A 2UYTA 4K43A 1NGCA 2FLOA 1R59O 4CZIA 4BC3A 3QFPA 4BGAA 2P9KA 3ENHA 1QQOA 1ATSA 1IJJA 1Y64A 5EVZA 2I7NA 4BR7A 2VCPA 5AQHA 4BR5A 2BUPA 4O5FA 1GLFO 2NZTA 5AZJA 4B1ZA 4PL8A 4XH5A 4FWPA 3HM8A 1HPMA 4QS7A 1KXPA 2P9SB 4H5TA 4CBUA 4QS9A 2Q36A 4LC9B 5LJWA 1DKGD 4PKHA 5BN8A 1YVNA 3VOVA 3GG4A 3VEOA 4XEIA 1TYQA 4MO4A 2DPNA 4K41A 3U9DA 2GELA 4IZ9A 3U4LA 2E2NA 5AQOA 3HI0A 1QZ5A 5AQIA 4PKGA 4JD2A 3CIPA 1KAXA 2P9UB 4FWMA 1HKGA 4BRNA 2QWRA 1RFQA 2A5XA 3L4IA 1CZAN 1BA0A 3ZEUB 4GY2B 5FPNA 3WXIA 1X3NA 3VGMA 5AFUH 2CGJA 2VYPA 1E4GT 4EHTA 4YDUC 1C0GA 3VENA 4B1VA 1BG3A 5BR9A 1J6ZA 4CBXA 1T6DA 4I6MB 2ZGYA 3MN5A 2E2PA 4H0XB 5JMVA 3O08A 2OANA 4FWNA 2E88A 4PKIA 4BRPA 3GDQA 3D2FB 5AQWA 4RWTA 5KQ8A 5AZIB 5BRFA 1NGDA 4IJNA 1T44A 3LM2A 2Q1NA 1RGIA 4FOIA 4H0OA 3WQUA 4BRFA 4HWIA 4CZEA 5KQDA 1QQMA 4FWSA 4XH1A 3SK3A 4FWRA 4MLHA 2A40A 3DXMB 3LDPA 4CZFA 4IWVA 5AQLA 4B1XB 4DB3A 3IMXA 2QW9A 2FF6A 3L6QA 1JCGA 3ATVA 1QHAA 2FSKA 4WQ4C 2Q31A 2E8AA 3MK6A 4BG8A 1Q18A 1QQNA 1H1VA 1XQSC 3CJ7A 3ID8A 2ASOA 2KHOA 4IO8A 5LJVA 1BDGA 3LM9A 4QS8A 3EKUA 1YXQA 2QWQA 3FZKA 4BRMA 2Q0UA 3CERA 1HKCA 4ISGA 3ULEA 3SLCA 2GTDA 4BRKA 4BR2A 2P9KB 3DXMA 3MCPA 4BR9A 1GLLO 1RDWX 4K42A 1X3MA 2V51B 5EOYA 4O8KA 3CI5A 5AQFA 3L0QA 5AZJB 4DQ8A 3LDQA 1S3XA 3QFUA 4JHDA 4H0TB 4AM7A 3A8YA 2IVPA 4M7XA 3H1QA 2A41A 2QWPA 3H46O 4BRDA 5CE3A 1GLDG 3KVGA 4BC5A 2ASMA 3M3ZA 3QDKA 4Z94A 3R6MA 3VF6A 4JAXA 3R8EA 3WXLA 3O8MA 5AQXA 4H5NA 1C0FA 4EFHA 1TYQB 2CH6A 2V52B 5EXWA 4FWLA 2QWLA 1NGJA 3M6GA 1SZ2A 3ENOA 2P9LA 4JD2B 3GL1A 4RTFD 4BRIA 1NBWA 3F9MA 3IDHA 1NGEA 3KHYA 1SQKA 3HSCA 1ATRA 2ITMA 4A61A 4BRHA 2QWNA 4NO7A 4H5VA 2F9TA 4BROA 3EZWA 2CGLA 1Z6RA 3SMPA 5KPRA 5ADXH 3MN6A 3C0BA 1ZC6A 3HZ6A 4FOEA 3I33A 3QMLA 2A3ZA 3WUHA 2GUPA 3BP8A 3HBTA 2P9NB 3BUZB 4ISFA 5AQVA 5AQSA 1XC3A 5B8HA 4AM6A 5E84A 5JLFA 3FZMA 3VEYA 2FXUA 3GE1A 2BTFA 2YHXA 5TKYA 2E1YA 1GLJO 3VEZA 4DCHA 3FE1A 2ASPA 5FPMA 3WEEA 3QBXA 4BC2A 3VEVA 4BRQA 2IIRA 2Q0RA 3OHRA 3VGKA 3UKRB 3ZX3A 3U8XA 2GWKA 1LCUA 3EKSA 4EIAA 3RSEA 5AQNA 2P9PA 4CD3A 1ESVA 4B1YB 1MDUB 2P9NA 1IG8A 3FZLA 4RCHA 3CJ1A 4NB4A 4BRGA 2IVNA 3J8AA 4FPBA 4K25A 2PBDA 3EN9A 4PL7A 3ULEB 2QXLA 3DXKA 4IXCA 4JNEA 1U6ZA 3C7NA 4A2BA 2E1ZA 2YI1A 4IJAA 3UKRA 4Y0WA 3CJCA 4E1JA 3W0LA 4F9OA 2P9IA 1ZBSA 4BG9A 2V7YA 4H0YB 4BC4A 4CI6A 3FZHA 1V4SA 1KAZA 3HTVA 3QICA 3VGLA 5AFUA 3P4IA 3CQYA 4FPAA 3VF4A 4GNIA 3O6WA 1SAZA 1K8KA 2VWBA 2ZWHA 3CETA 3FLCO 4JHDB 4BRCA 3DWLA 3DJCA 2EWSA 1G99A 3EO3A 1TUYA 5BN9A 4YDUA 4CZJA 2F9WA 2FSJA 1GLBG 1P8ZA 3UKUA 3O4WA 4MO5A 1T6CA 3WQTA 3ATUA 1U2VA 3G25A 3IFRA 4BR4A 3VESA 2D1KA 2P9LB 3VERA 1MWKA 5EX5A 1NGIA 4M7YA 4H0PA 5AQYA 3MDQA 3O80A 1XUPO 3H45C 5E26A 4FWOA 3IUCA 4HTLA 4BRAA 2WUSA 1MWMA 5AQZA 3O5BA 1NLVA 3U9ZA 3SJHA 2E20A 5AQJA 3O1BA 1WUAA 3A5LC 5AQMA 4J8FA 3KZBA 3ZX2A 4WQ5A 1EQYA 3H6EA 3MN9A 5I9EB 1NWKA 1V4TA 3EL2A 4H03B 1TUUA 1LOTB 4EAHD 4A62A 1E4FT 5F1XA 3GBTA 3WEEB 3D7EO 2H3GX 1OKJA 2HMPA 1BO5O 3R9PA 2PAVA 1BWFO 3O1WA 3LDLA 3CJ9A 5F2RA 1S22A 3FZFA 3RSEB 3VEXA 2NRHA 3ZX0A 5BPNA 2P9PB 4CZHA 3BF1A 3LL3A 1NGFA 4WYBA 2HF3A 5JICA 3CQXA 1GLAG 4H5WA 2QWMA 4B1UB 2ZGZA 4B9QA 4B1WB 2QWOA 3D2EA 1DEJA 4FWKA 1JCEA 3S41A 4L3QA 5KPTA 3CHWA 3DXKB 2W40A 3TU5A 3C7NB 2YHYA 2P9IB 5BPLA 5F0XA 3QB0A 5BREA 1WOQA 1D4XA 4DHYA 1KAYA 4BVPA 3WT0A 1K8KB 1NMDA 3I8BA 4BQLA 3GOIA 3H3NO 3ZETB 2AA4A 1MA9B 5ADXA 1Z05A 4MLEA 3AAPA 2J4RA 3AARA 4A2AA 4FL9A 2FF3B 2P9SA 1DGKN 1NGAA 5FPEA 2CH5A 3UKUB 2FSNA 2E2QA 3BF3A 3UB5A 2I7PA 1HKBA 1U2VB 3FFKB 4ISEA 4BVOA 2IVOA 2YCHA 5AQPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DFFA 4DV2K 2KKZA 1BUPA 3Q7BA 3NE6A 1TKTA 5AR0A 4CJ7A 4EHUA 4PY5A 3VEWA 3TSPA 3ZETA 2GWJA 1RT5A 3CCEN 1JJ2M 3O4NA 4CZLA 1TKXA 2QI2A 3CCVN 4EZ9A 3A0IX 3UE5A 2AP1A 3LP2A 4K8XA 3AY9A 3THWA 4C23A 3PIOL 4W5NA 3AAQA 3E01A 3VQBA 3L8BA 4BRLA 5ELZA 4JRQA 1NM1A 3MMVA 5AZIA 3TTFA 4HCCA 5BRDA 1WSHA 3WXKA 4CF1A 2Q2RA 2O8EB 1YT3A 3NGZA 2D0OA 5LY3A 4B8AB 2YJFA 1RDUA 4FJ9A 3G4SN 2RN2A 3FR0A 5LMNK 4K8ZA 3ID6A 4CZKA 3SBGA 1BIUA 4DMNA 4MDBA 2YNIA 1YAGA 4BDZA 3H1VX 2KFNA 4JKAA 1RBUA 3QESA 3MN7A 4HVJA 3O9RA 1L5UA 5AQTA 4CZGA 1NGGA 2O8DA 4FYDA 4NXNK 1IG9A 3AGKA 1WLJA 2P9KA 1TK5A 1IJJA 5EVZA 3L3UA 2UXCK 2BUPA 4E89A 1YJNN 4H8KA 4PL8A 4XH5A 4M3WA 4O5BA 4CF0A 1HPMA 4FJHA 4H5TA 3S3NA 2Q36A 3AO2A 1ZBIA 4B3RK 4PKHA 1YVNA 3AO1A 3PSFA 4DUYK 2D0CA 4F8RA 3HVRA 5M1NA 1NK4A 4ELVA 4FLTA 4JRPA 3OYIA 2P5OA 2QWRA 1RFQA 1C6VA 4KHYA 2A5XA 3L4IA 4GKJK 5JS2A 3WXIA 3VGMA 4K0KK 4DSKA 2VYPA 4CE9A 4EHTA 4B1VA 3AVCA 4DLEA 3MEDA 4E7IA 4CBXA 3R1XA 1VQPN 5JMVA 4FWNA 4BRPA 1R0AA 4J2EA 4FJ7A 4KH6A 5BRFA 1L3UA 1T44A 4FZYA 4CJFA 3HYFA 3KWIA 3WQUA 4BDPA 3QIPA 1D9DA 1QQMA 1QVGM 4DSFA 4KI4A 1RBSA 5AQLA 1W9HA 5C10A 2AJQA 1TL1A 3IMXA 1NK0A 3J7ZO 3ATVA 1VQMN 4B8CA 4LY7A 4E1MA 3VQDA 1UWBA 5GADP 3VN5A 4QS8A 3LM9A 3EKUA 3C65A 2D5RA 3FZKA 3LALA 4BRMA 4FM1A 2G8HA 3P83D 1HKCA 3ULEA 4C8NA 3MCPA 1RDWX 4OPAA 4KREA 1FK9A 1F21A 4IEIA 5CZ2A 4NLBA 4O8KA 5AQFA 4DFJA 4DQPA 1UA1A 2OZSA 3LDQA 1S3XA 3O4QA 4JHDA 2IVPA 3D45A 2O8FB 3H46O 5CE3A 1QE1A 1X9WA 4G9ZA 3QDKA 3P38A 2ZQBA 4JAXA 3R8EA 3WXLA 4JS4A 2P51A 4FWLA 1NGJA 4KO0A 3VMFB 4DU3A 3ENOA 2P9LA 4FK4A 4E7KA 3AA5X 1NBWA 2F8TA 2G8VA 3IDHA 3KHYA 4FJNA 1EWRA 3VA3A 4DTRA 4DTMA 1ATRA 2ITMA 1U49A 3CM6A 4A61A 3WXMB 1HRHA 3PO4A 4CJ5A 4KB1A 2CGLA 5ADXH 3MN6A 1DTQA 1WAFA 3C0BA 3K59A 3OY9A 3I33A 1SKSA 1D5AA 3HM9A 4QCLA 3WNFA 3IAYA 2P9NB 5AQVA 1JLGA 4EP5A 1XC3A 4AM6A 4DR4K 5JLFA 5GAGP 3THYB 4CJUA 2BTFA 4DSEA 4DCHA 4YOUA 4FK2A 5FPMA 3WEEA 3QBXA 4OKJA 4BC2A 1BGXT 3VEVA 4N41A 1U4BA 3ZX3A 1EX4A 4M45A 4A57A 4OKKA 4ELTA 3ZLJA 4CHOA 3DM2A 1HNVA 4KTWA 2HHQA 1LCUA 2ATQA 4WFAL 4JKGA 4CEBA 3RSEA 2OPRA 3I55N 2HSTA 1MDUB 1IG8A 4RCHA 1A5VA 2IVNA 1A5XA 3J8AA 3KLIA 4BWMA 3J7YP 2X6NA 2HBMA 4PL7A 2O4GA 3K58A 4IXCA 4JNEA 1RT4A 1ZYQA 1NKCA 4A2BA 2E1ZA 3WNEA 4O4GA 2A1RA 4CHPA 2KQ2A 4CI6A 3QICA 4A59A 3DLEA 4CEOA 3CETA 3FLCO 4DLGA 3DWLA 2VQEK 2O4IA 1RBVA 4IDHA 3NHGA 3UKUA 3AVIA 1S1TA 1T6CA 1VQLN 3WQTA 1U2VA 3F9KA 1HYZA 1S6QA 1S1WA 3T69A 3HJFA 3VERA 4CIEA 3OYMA 5EX5A 4H0PA 4X66K 2RPIA 2RF2A 4N56A 1RDCA 4HTLA 3V4IA 2WUSA 4CJQA 3O5BA 4DTSA 2E4LA 3BY5A 3RVCA 4NYFA 4J8FA 3RTVA 4JI5K 3TR8A 3TWHA 4FZZA 1EQYA 5HRRA 2WC9A 3MN9A 4GVEA 4DU1A 1OH6A 2P1JA 4ID1A 1QQCA 4H03B 1TUUA 3THXA 2JWLA 3MX2A 3TABA 3DI6A 4JKEA 3GBTA 3D7EO 4LF7K 3BGRA 1VSHA 4I2PA 1RDBA 3NBPA 1REVA 3CJ9A 4KHSA 3AO3A 3FZFA 3MXMA 1ASWA 4YOTA 1TVRA 2LSNA 2P9PB 3LL3A 3IKMA 3DLKA 4WYBA 1YIJN 2XY7A 1KQSM 2OTLN 3G6EN 4JI0K 1RTIA 1T8EA 2W42A 3S41A 5KPTA 3DXKB 2W40A 2XO7A 2UUAK 2YHYA 5J2MA 2WOMA 2DY4A 2HBJA 1T03A 5DM7L 3O9QA 3I8BA 3T3FA 3H3NO 5ADXA 2XHBA 3CD6N 3AO5A 3OS2A 4A2AA 3SI6A 1NJXA 5HOOA 3DMJA 4CGGA 4FJJA 3EYZA 3AA2A 3UB5A 3FFKB 1HKBA 1LW2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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