3C0BA

Crystal structure of the conserved archaeal protein q6m145. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 87

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
331
structure length
316
Chain Sequence
MILGIDIGGANTKITELHENGEFKVHHLYFPMDKLAEVLKTYSNDVSHVALVTTAEEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEHHH
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS2 (11-17)TIV2 (44-47)S1 (3-8)TII'1 (8-11)TI6 (293-296)AH9 (301-305)TI1 (18-21)S3 (23-29)TIV1 (41-44)AH1 (72-81)TI2 (91-94)S5 (87-90)TIV3 (81-84)AH2 (99-104)TIV4 (83-86)S6 (96-97)AH3 (114-125)TIV6 (144-147)S9 (148-149)S7 (129-133)TVIII1 (126-129)S8 (139-145)TIV9 (178-181)3H2 (174-177)AH4 (155-159)S10 (164-165)TIV8 (168-171)S11 (180-183)TIV11 (206-209)3H3 (210-212)S12 (186-189)TIV10 (182-185)AH7 (245-274)AH6 (225-235)TI3 (217-220)TI4 (239-242)TIV12 (240-243)AH8 (286-293)S14 (297-300)TIV7 (159-163)AH5 (198-205)TI5 (283-286)S13 (278-281)AH10 (307-311)TIV5 (135-138)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Methanococcus maripaludis s2
publication title X-ray structure of the conserved archaeal protein Q6M145.
rcsb
molecule keywords Conserved archaeal protein Q6M145
total genus 87
structure length 316
sequence length 331
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3c0bA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3c0bA02
3ZX2A 3FE1A 3O8MA 5TKYA 1S22A 3L6QA 2GTDA 4JD2B 2YHWA 1KAZA 2P9KB 5BPNA 2WUSA 2AA4A 2Q31A 5JMVA 4BRMA 3QFPA 2E2PA 3A8YA 3JS6A 2I7PA 1SZ2A 3EKUA 4FWMA 3AAQA 4CZIA 4L3QA 3HM8A 3VESA 1X9JA 4JHDB 4EHUA 1BA0A 4PKHA 3LM9A 5EOYA 3QMLA 4CZGA 3M3ZA 3RSEB 1GLEG 3O6WA 5KQDA 4GNIA 3FZLA 4Z94A 1IG8A 1Y64A 3C7NA 1NGCA 3CJ7A 3MCPA 1CZAN 1HKCA 3SK3A 3O1BA 2GWJA 4BRIA 2CGJA 2YCHA 1MWKA 5AZIB 2P9NB 3CJCA 1DGKN 2QWPA 2FSNA 2QWQA 3WXJA 3CJ9A 5BRFA 4FWNA 5FPMA 4CI6A 4FWQA 1ATNA 2A6AA 2IVNA 3ATUA 5AQHA 3L0QA 3DXKB 3MDQA 3TU5A 2VWBA 3IFRA 1NGIA 4BG9A 1TUUA 1NGAA 1NGJA 3VEZA 2IIRA 1RGIA 2IVPA 4CBWA 4NB4A 2HMPA 4H0XB 3WXLA 3HSCA 2CGKA 4YDUC 1E4GT 4XEIA 2Q0RA 1SQKA 1WOQA 2P9UA 4B1WB 4QS9A 1MWMA 5ADXA 4RCHA 1XC3A 1ZXOA 5FPEA 1IJJA 4BRFA 4H5TA 1BDGA 1TUYA 3D2FB 4AM6A 2CGLA 4B1VA 5ADXH 5AZJA 2NLXA 5LJWA 4CBXA 1BO5O 2Q36A 3ATVA 1ZC6A 1DEJA 3W3DA 2YI1A 2E1ZA 4J8FA 4BRDA 4B1UB 1LCUA 2V7ZA 3WEEB 2D0PA 3EO3A 1OKJA 4BQZA 1C0GA 4FPBA 4GY2B 3M6GA 4K43A 2P9SB 2OANA 3A0IX 1TYQB 3JXUA 3EKSA 4IJNA 5FPNA 2E2NA 5E84A 3VF2A 2BUPA 3TPQA 1HKGA 1V4SA 2YJEA 5EX5A 3GE1A 1XQSC 2ZF5O 3BUZB 3VEOA 2HOEA 1BA1A 3SMPA 4I6MA 4H5WA 3UKUB 3MN9A 1BU6O 1ATSA 3VPZA 4KBOA 4ISFA 4BC4A 1QQOA 1JCEA 2P9PB 2QM1A 4FWSA 3ZEUB 5BN8A 1Z6RA 3GBTA 2A41A 3DXMA 5AQSA 5B8HA 3UKRB 4BGBA 1H1VA 4LC9B 1QQNA 3GOIA 1BG3A 2E20A 4DB3A 1SAZA 3O80A 5AQQA 4H5NA 1QZ5A 4BRGA 5E26A 4BRHA 2I7NA 3ULEA 1NGGA 4FOIA 4FWKA 2QWRA 4BR0A 1GLJO 4O8KA 1K8KA 2NRHA 1P8ZA 5AQVA 1YVNA 3FLCO 3KZBA 3M1FA 3WXKA 3LDQA 2YHYA 5AR0A 4H5RA 5BRDA 3J8AA 3VGMA 4BG8A 3ZETB 4PKIA 2F9WA 2Q0UA 4CZHA 4M63C 2PBDA 2VYPA 3IMXA 4CZJA 4CZFA 2P9LB 4BRKA 3P4IA 1NGEA 4BR9A 4RWTA 2V7YA 3O4WA 4BR4A 3LDNA 3SMSA 4BQLA 2FF3B 4DHYA 2YHXA 2GWKA 2E1YA 2P9IB 4FOEA 1V4TA 4WQ4A 4BR5A 4QS8A 1LOTB 3H45C 5AQWA 5BPLA 4BRCA 4FL9A 3D2EA 4H0TB 2V51B 3H3OB 5BREA 3VERA 3WUHA 4FO0A 3ENOA 3H6EA 2FF6A 2PAVA 5AQIA 2A3ZA 4NO7A 5AQLA 3CI5A 3FGUA 1HJOA 3O5BA 1QQMA 3LDOA 4C23A 1U2VA 5KQ8A 3CHWA 3LDLA 1QZ6A 1EQYA 2A42A 1KAXA 2HF4A 4HWIA 2D0OA 5BR9A 5KPTA 3C0BA 4M7YA 1RDWX 2CH5A 5BRHA 1QHAA 3HTVA 2GEMA 4JD2A 1Z05A 3CJBA 5AQPA 2P9KA 4A2AA 1GLAG 5AQZA 3CETA 3QB0A 2QXLA 3UB5A 1ATRA 3VENA 4IWVA 3H1VX 3VEXA 4BRAA 2VCPA 1HPMA 3OHRA 3ENHA 4JHDA 4BRLA 5AFUA 3A5NC 4H5VA 5AQGA 5F0XA 3AARA 2ITMA 1G99A 4XH5A 5BN9A 3RSEA 2IVOA 3VEVA 4WYBA 3U4LA 4IO8A 2W41A 5AFUH 3VGKA 2D4WA 2GUPA 2FSJA 5KPZA 3FZFA 2EWSA 3LM2A 4FSVA 2H3GX 5AQUA 3LDPA 4FPAA 4M7XA 3VF4A 3FFKB 3KVGA 5AQOA 5AZIA 2P9NA 4K42A 1DKGD 3QBWA 4JNEA 4EIAA 1GLCG 1GLFO 2YJFA 1BUPA 3IUCA 4JN4A 4BRQA 4MLHA 4DCHA 1WUAA 3C7NB 3DXKA 5BPMA 4B9QA 3WXIA 3QBXA 1BWFO 3CIPA 3MMVA 3SJHA 5ELZA 4EAHD 4H0OA 4CZKA 2AP1A 4WQ5A 4CZEA 1JCGA 4BRPA 2ASMA 2FXUA 2V52B 3W0LA 3S41A 3A5MC 3HBTA 2ASOA 3B8AX 3KHYA 3MN7A 3D2FA 1JCFA 2QWLA 3U9ZA 2FLOA 5AQYA 4H03B 1X3NA 1YAGA 2ASPA 2E2QA 4IXCA 4IZ9A 1MDUB 2A40A 3EL2A 4WQ4C 1C0FA 2P9UB 3SLCA 4CZLA 2ZGYA 4PKGA 2UYTA 3BP8A 3GG4A 3I33A 5FPDA 1J6ZA 1YXQA 5JLFA 2HF3A 5CE3A 3EZWA 3WEEA 4A61A 5AZJB 3O08A 1RFQA 1T6CA 5I9EB 2KHOA 2P9SA 2W40A 5AQMA 1NGDA 5F2RA 4IJAA 3FZMA 1TYQA 1NGHA 3G25A 2A5XA 1Q18A 3VEWA 5KPRA 1NWKA 4A62A 1KXPA 4PL8A 3GL1A 2QWMA 3VETA 3D7EO 4PL7A 5AQFA 1ZBSA 3DAWA 4FWOA 1T6DA 3I8BA 5AQNA 3UKUA 4CD1A 2QWNA 5F1XA 4BC3A 3A5OC 2P9PA 4K25A 3ZEUA 4BR7A 4MO4A 3BEXA 2Q2RA 4ISEA 3BF1A 4FWLA 3U9DA 3UKRA 3VF6A 4B1ZA 1GLLO 1R59O 2QWOA 1U6ZA 5JLHA 3FZHA 4I6MB 2Q1NA 3BF3A 1NMDA 2QW9A 4B1XB 4A2BA 3UE5A 4B1YB 3QICA 4H0PA 2Q97A 4BVOA 2DPNA 3DXMB 3QFUA 4MO5A 1MA9B 1XUPO 3ID8A 2CH6A 5JICA 3H3NO 1GLBG 3CQYA 3WQUA 2ZGZA 4BC2A 4BVPA 3F9MA 4CBUA 3AAPA 3R9PA 3EN9A 3ZETA 2FSKA 3ULEB 3DWLA 2BTFA 2ZWHA 3O1WA 4RTFD 4XH1A 1GLDG 1T44A 1K8KB 4BROA 4BREA 2P9LA 4EHTA 3H1QA 3R6MA 2D1KA 1NGFA 1D4XA 1HLUA 3CJ1A 1YUWA 3FR0A 2E8AA 3FZKA 4YDUA 5EXWA 2P9IA 5EY4A 3WT0A 1E4FT 4AM7A 1NBWA 3MN6A 1S3XA 4WQ5C 4BC5A 4DQ8A 2E2OA 3LL3A 5LJVA 3ZX0A 3HZ6A 3HI0A 4MLEA 1NLVA 3ZX3A 1BOTO 4XH4A 2J4RA 5AQXA 5LY3A 4HTLA 1X3MA 4H0YB 3GDQA 4BR2A 5AQRA 3R8EA 3L4IA 1HX1A 4H0VB 3VGLA 2F9TA 3CERA 4K41A 4CD3A 3D2EB 4E1JA 5AQJA 3H46O 4JAXA 4O5FA 2E88A 3MN5A 3VEYA 3CQXA 4Y0WA 2NZTA 3AY9A 4ISGA 4FWRA 5AQTA 3VOVA 1NGBA 1HUXA 5AQKA 4F9OA 3U8XA 4BGAA 2GELA 4EFHA 3CJAA 4QS7A 1U2VB 1ESVA 1HKBA 1KAYA 3WQTA 3DJCA 3A5LC 3QDKA 3MK6A 3IDHA 4FWPA 5EVZA 1NM1A 4CJ7A 4BRNA 4CZMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OYHA 3H08A 3O8MA 5TKYA 4A5AA 1KAZA 4OPAA 1HJRA 4FM2A 5M1QA 5BPNA 4EZ9A 1S9GA 4BRMA 3DLBA 1SZ2A 4FWMA 4L3QA 3HPGA 5KGXA 4KAZA 3BZKA 4C8MA 2F4VK 3OA9A 3ZSXA 4PKHA 1WSEA 3LM9A 2IC3A 5M1NA 3OTOK 2ZJPL 4N56A 2Z1JA 4CZGA 5DM7L 3O6WA 3G4SN 5KQDA 4JRPA 4Z94A 1IG8A 3CJ7A 5HRSA 1Q81O 4LF4K 2HHVA 4MQ3A 2CGJA 2YCHA 3CJCA 4O0JA 1DGKN 2QWPA 2QWQA 3P38A 1EP4A 3CJ9A 1FW6A 4LFCK 1ZBUA 2IVNA 4KRFA 3LPUA 3DXKB 3AO2A 1HNWK 3ZT0A 4M3ZA 5CY4A 2IIRA 1RGIA 4DTMA 3TWHA 4JYAK 3V81A 3ZSWA 1E4GT 1KLNA 4XEIA 1HNZK 1WOQA 3BGRA 4B1WB 4OPHA 4B9MA 5ADXA 3CM6A 4CHZA 4FVMA 1XC3A 5FPEA 4BRFA 5SWMA 1SKSA 1XHXA 1TUYA 4KHUA 4ELTA 1B9DA 2XY5A 3MX5A 3THWA 1C0MA 2CGLA 4GVEA 1YI2N 5AZJA 1J9AA 2ETJA 2VWKA 4LH4A 1RT1A 3WNEA 1L3UA 5M1KA 4B1UB 2KW4A 2VQEK 4K43A 4DTPA 5HL7L 5DK5A 4M3UA 2OANA 4YOXA 3CCQN 1WBDA 2OPSA 1W0HA 2HHWA 1K6YA 4B9TA 4YOYA 2E2NA 2F96A 5KTQA 4LSNA 2E6MA 2YJEA 4E1MA 3LAKA 1FKPA 3AA4A 3AVLA 1BA1A 3SMPA 4I6MA 1VQON 3UKUB 3MN9A 1S1TA 1M90O 1OVYA 4ISFA 3I0RA 2XO7A 1K9MO 4DQIA 5AQSA 2VG5A 1S1UA 3OYGA 2VGNA 1QQNA 3VQ8A 4CJRA 1BG3A 2E20A 2FBXA 3QEPA 3RMAA 4BACA 4CFCA 4DFJA 2HBMA 1QZ5A 4BRHA 3ULEA 1C1BA 1NGGA 4CEOA 4FWKA 2QWRA 1OH8A 4BR0A 1GLJO 4O8KA 1K8KA 1TKDA 3D6RA 4N41A 3VQEA 4KHQA 3KZBA 1HYSA 1HYZA 1JKHA 3M1FA 4Z4CA 3K59A 3SBGA 1NJIO 4DR3K 4B9VA 1RDAA 3THVA 4PKIA 1JXEA 1RBSA 4CZJA 1CZ9A 1VHXA 3C6UA 4DU3A 1EKEA 4B8CA 4RWTA 2V7YA 4DSKA 3O4WA 3DRSA 3VN5A 4DV0K 2FF3B 4DQSA 4NCAA 2D0AA 4WQ4A 1LOTB 5BPLA 1Z25A 4BRCA 4I9QA 3CD6N 2O8EB 1VRUA 1VQ9N 4O55A 5BREA 2QI2A 3ZSZA 2NRTA 3OVNA 1XMOK 4CFAA 3LWMA 1VQLN 3O9TA 4NLBA 1D5AA 4E7LA 5AQIA 2A3ZA 3WXMB 4NCGA 3CCSN 4IBNA 5AQLA 3CI5A 4ZTFA 1WB9A 4DR7K 4C23A 2UXDK 4CF9A 4LSLA 2YNIA 4DLEA 4RW6A 4UQGA 3I56N 2D0OA 4M3YA 3NGYA 5BRHA 2GEMA 3TABA 1KVAA 1WSGA 3OS2A 4A2AA 4J2BA 3MXMA 5AQZA 3QLHA 1OH7A 2QXLA 4JI1K 1ATRA 4IWVA 5GINA 4BRAA 3C95A 1HPMA 1G15A 4B9UA 1RDCA 3HOSA 1RTJA 5HLFA 4B08A 3RR8A 5I3UA 3KLHA 4IO8A 2HHTA 5AFUH 3VGKA 3EZ5A 4FLZA 3FZFA 3LPTA 3HRGA 1Q82O 1UA1A 3IS9A 5H1SQ 4M7XA 3FFKB 3C6HA 3VQAA 4E7KA 3KK3A 4PY5A 1BQNA 4K42A 3V1OA 1DKGD 3RRHA 2XY7A 3LWLA 1GLCG 1BUPA 4MLHA 4FLTA 5J2NA 2G8KA 1NOZA 5BPMA 1Q9YA 4Q0BA 3DLHA 3OS1A 3MMVA 4RW4A 4CEDA 2AP1A 1LV5A 2NRVA 2ASMA 1EWRA 2A1SA 4CEFA 4HCBA 4KPYA 3R1XA 3LP3A 3W0LA 3V9ZA 4JKFA 5SZTA 2BGGA 2BANA 3QETA 1JLGA 3KLIA 2BE2A 2PFUA 2QWLA 3D2FA 1XC9A 3S3OA 1VQ5N 1MU2A 4RW8A 2E2QA 1C0FA 2P9UB 3OYDA 4OO1J 3GG4A 4CK2A 2XY8A 5JLFA 3MWPA 4OPJA 4DV1K 5CE3A 3EZWA 3WEEA 3CC4N 3AVKA 4JI6K 4ELUA 2P9SA 2W40A 1RT2A 5F2RA 3QO9A 3O3HA 4F4KA 5A2QO 2R7YA 4QOZB 3CYMA 3U6FA 3SAGA 2F7TA 2VQFK 4GV9A 4QCLA 5FRNA 3HXMA 1T05A 3HYFA 4H4OA 3NGZA 1J53A 2OZMA 1WAFA 3CM5A 3OYMA 3BEXA 4ISEA 3UKRA 4NYNA 1LAWA 1JL1A 1U6ZA 2X6NA 2YV0X 4AQYK 2Q1NA 3THYB 1L3TA 4C8OA 3HPHA 4KB0A 4CIGA 4B1YB 3SQ2A 2RKIA 4DV4K 4GKKK 3CCMN 3AO5A 4H8KA 2DPNA 3DXMB 4I9LA 4CESA 4CE9A 1SUQA 3ALYA 2YNGA 3ID8A 4OKEA 2E4LA 3NDKA 2ZGZA 3KD5E 4BVPA 1B92A 3BY5A 1YF5L 3EN9A 1T03A 3ZETA 1BCOA 4FJLA 1ASUA 1QE1A 2HBJA 4HVJA 1LWEA 3OYIA 4DS5A 3H1QA 3NE6A 3QEVA 3VQDA 1NGFA 5E41A 2O8DB 1S6QA 4DTXA 3CJ1A 3THXB 2E8AA 1SKRA 5EY4A 3WT0A 4M3WA 3LP2A 4KHPK 4AM7A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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