3C0BA

Crystal structure of the conserved archaeal protein q6m145. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
331
structure length
316
Chain Sequence
MILGIDIGGANTKITELHENGEFKVHHLYFPMDKLAEVLKTYSNDVSHVALVTTAEEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray structure of the conserved archaeal protein Q6M145.
rcsb
molecule keywords Conserved archaeal protein Q6M145
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Methanococcus maripaludis s2
total genus 87
structure length 316
sequence length 331
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3c0bA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3c0bA02
3QFPA 3BUZB 2ZWHA 2GELA 1GLFO 3CQYA 4M63C 4DHYA 2AP1A 4H0XB 3DXMB 3GOIA 1NBWA 3I8BA 3MN7A 4RTFD 3D2EA 3ZETA 2E2PA 3R8EA 4B1VA 2D4WA 3DXKA 5AQFA 5EVZA 4BC2A 4H5TA 2J4RA 4CZMA 4YDUC 2GTDA 4LC9B 3ZETB 3DXKB 5ELZA 2QW9A 2A6AA 2YJFA 1RGIA 3BEXA 3EKSA 2Q97A 3FFKB 3HI0A 4Y0WA 3VEOA 3I33A 2P9PA 3U8XA 4H0PA 1GLJO 3CJCA 5AQHA 3SJHA 4FWQA 4O5FA 3M3ZA 1TYQA 2HOEA 2P9UA 1Z6RA 4H0TB 4ISEA 1X3MA 2P9PB 3C0BA 3B8AX 4FL9A 4NB4A 1GLBG 1GLDG 1Q18A 3QDKA 3VENA 5KPZA 2QXLA 1TYQB 2P9UB 5B8HA 4FWMA 4CZEA 3IMXA 4K43A 2FSJA 1YUWA 3SLCA 3IDHA 5AQVA 1U6ZA 5F0XA 1MDUB 2QWOA 3EL2A 4BC5A 4BR5A 5AQXA 2QWMA 3DWLA 2IVNA 5E26A 3VPZA 3CJ9A 4JN4A 1NLVA 3H45C 4BRPA 4DB3A 4BG9A 5AQPA 5AZIA 4BR2A 3D2FA 3ULEA 4Z94A 4B9QA 1GLAG 3AAQA 1ZXOA 3VGKA 2A42A 2F9WA 4PL8A 4DQ8A 4M7XA 5BPNA 4IJAA 4CBXA 1KXPA 2E1YA 1K8KB 3DJCA 4C23A 2P9LA 5AZIB 2QWRA 3ULEB 4EIAA 2I7NA 5AQYA 1LCUA 4BR0A 2HF3A 3CQXA 2P9NB 2ZGYA 1HKCA 3QICA 4BR7A 3FLCO 1Z05A 4BRDA 1S3XA 3H6EA 3LDLA 4ISGA 3ZX0A 5ADXH 5BR9A 3M1FA 4EAHD 3LM2A 3FGUA 4MO4A 2ITMA 3VF4A 2E8AA 3ENHA 1H1VA 1D4XA 3VEXA 2E2QA 3QFUA 4BRHA 2PBDA 5AQZA 4BRAA 2BTFA 3CJ7A 1KAZA 2PAVA 4PKHA 4XH4A 1SAZA 3HSCA 5FPDA 1J6ZA 1YAGA 4BG8A 4BC3A 4BQLA 5BN8A 5JICA 3WEEA 1BA1A 1G99A 2FLOA 4FO0A 4B1ZA 4H5WA 1NWKA 3U9ZA 3SMSA 3H1VX 3CJ1A 2I7PA 3P4IA 3WEEB 3KHYA 4WQ4C 3ID8A 5AQJA 4BRGA 4CBUA 3BF1A 5F2RA 3WT0A 2CH6A 3ZEUA 3W0LA 5JLHA 5BPMA 2ZF5O 3FZMA 3FZFA 4CZIA 1E4GT 1QHAA 4BVOA 1P8ZA 3ENOA 2VCPA 3ATVA 5TKYA 3QMLA 2GUPA 3ZEUB 3FE1A 1IG8A 1XUPO 4JNEA 1NMDA 1MWKA 4FPAA 2NRHA 4K42A 3H1QA 4BRMA 1EQYA 2Q0RA 2Q36A 2OANA 1DGKN 3GG4A 3ATUA 5BPLA 1BWFO 4BR4A 5KQDA 3D2EB 4QS8A 3MK6A 4H5NA 4IWVA 4FOIA 5LY3A 3SK3A 1QZ5A 1GLLO 1HPMA 3O5BA 5I9EB 1HKGA 1HLUA 3O6WA 2GEMA 2QWNA 4O8KA 4QS7A 1NGAA 2D0OA 3LDPA 2FXUA 1Y64A 4J8FA 3UKRA 5FPMA 4BVPA 4BQZA 4A2AA 3BP8A 4YDUA 2E2OA 3UKRB 1GLCG 1V4SA 2V7YA 4BRQA 4BRNA 4CZGA 1X9JA 3UB5A 2YHXA 1TUUA 4HWIA 3RSEA 1HJOA 1C0FA 2NLXA 4EFHA 4K25A 4B1YB 2WUSA 3A5LC 4EHTA 4BRLA 1HKBA 2W41A 4ISFA 4BC4A 4CZLA 1V4TA 3RSEB 5JMVA 3R9PA 2P9IA 3JXUA 1T6CA 1BG3A 4I6MA 2E2NA 1TUYA 4JAXA 2ASMA 2E88A 3HTVA 5AQGA 1BUPA 1NGCA 4H0OA 1KAXA 2P9IB 3LDNA 3S41A 4A2BA 1R59O 1QQOA 3D2FB 1KAYA 2P9SA 3IFRA 3VF6A 2YJEA 3WXJA 1DKGD 4JD2A 2P9LB 4MLEA 3FR0A 3UE5A 5FPNA 1T44A 2HF4A 1BO5O 4IO8A 1T6DA 3J8AA 3VEVA 2E20A 3LM9A 2IVOA 5CE3A 4JD2B 2FSNA 3GL1A 2W40A 3FZKA 2GWJA 1JCEA 4BGAA 3ZX2A 1QZ6A 4IJNA 1YXQA 4H0VB 5AQLA 3D7EO 4CBWA 4FWOA 2DPNA 4CZKA 2Q1NA 4K41A 1NM1A 5AQWA 4BRCA 1MA9B 1X3NA 4H03B 1ZBSA 2QWPA 4XEIA 2BUPA 1NGIA 1ATSA 3A5NC 4WYBA 5AQQA 3WQUA 4A62A 3MDQA 4CD1A 4AM6A 4GNIA 5AQMA 3C7NA 4BR9A 4KBOA 3VOVA 3O1WA 3LL3A 4FWRA 2F9TA 5AQTA 5EOYA 4IZ9A 3CERA 3C7NB 4BROA 3VGLA 2QWLA 3EO3A 2FF3B 3WXKA 4FOEA 1NGDA 3HZ6A 1WOQA 3LDOA 4E1JA 3FZLA 2A40A 1NGBA 3HM8A 3VETA 2YHYA 3VEZA 3CI5A 3WQTA 2YHWA 4BGBA 1BOTO 4WQ5A 3CJAA 1SZ2A 4FWPA 2YCHA 3AY9A 4CI6A 3EZWA 1ATNA 3HBTA 5E84A 5AR0A 1NGHA 3DXMA 3M6GA 5AQSA 3A5MC 2KHOA 2Q0UA 2Q31A 1RDWX 1HUXA 3GE1A 3TPQA 3EKUA 3A8YA 5AFUA 2CGLA 4DCHA 3QB0A 2D0PA 2ASOA 3WXLA 3ZX3A 3UKUA 2AA4A 1GLEG 3LDQA 3IUCA 5LJWA 5AQNA 4RCHA 4QS9A 3WXIA 4L3QA 1HX1A 2NZTA 1QQNA 2A41A 3DAWA 3CJBA 3UKUB 4CZFA 2ZGZA 2VWBA 2CH5A 4H5RA 2P9KA 3MN5A 4GY2B 3VGMA 3F9MA 3O4WA 5AQOA 3VEYA 4F9OA 2IIRA 3H46O 4B1XB 1BDGA 2YI1A 4XH1A 1XQSC 2CGJA 3EN9A 4IXCA 2P9KB 5AQRA 1ESVA 1U2VA 1CZAN 4FWNA 1BU6O 4BREA 3MN6A 4BRKA 5BRDA 5AQUA 1NGJA 3VEWA 4BRIA 1MWMA 3U4LA 3WUHA 2GWKA 1U2VB 1E4FT 4M7YA 3VERA 3MN9A 4AM7A 1IJJA 2Q2RA 4I6MB 3L6QA 3G25A 2ASPA 5KQ8A 3GDQA 1ATRA 2V7ZA 1LOTB 1JCFA 2FF6A 1K8KA 4FWKA 2P9SB 4CZJA 3W3DA 2FSKA 3VF2A 4H5VA 4CJ7A 3MMVA 2P9NA 4MO5A 4B1UB 5EY4A 1NGEA 4CD3A 1ZC6A 3KVGA 5KPTA 4FSVA 1SQKA 3JS6A 3O08A 3H3OB 1WUAA 3L0QA 3O1BA 3CHWA 3A5OC 2H3GX 4BRFA 4MLHA 1QQMA 2A5XA 1OKJA 3O8MA 4A61A 3VESA 1C0GA 3SMPA 5BREA 3FZHA 4JHDA 1XC3A 3U9DA 5KPRA 1S22A 3TU5A 1NGFA 2V52B 3CETA 2A3ZA 1DEJA 5BN9A 4JHDB 2QM1A 5BRHA 4NO7A 4FPBA 3QBWA 3OHRA 2VYPA 2QWQA 1NGGA 5AZJA 3BF3A 3O80A 4HTLA 3QBXA 4RWTA 4B1WB 2V51B 5FPEA 4H0YB 1RFQA 5EX5A 3AAPA 3H3NO 4PKGA 5ADXA 4PL7A 2EWSA 5AZJB 4WQ5C 2E1ZA 5AQIA 2IVPA 3CIPA 4CZHA 3AARA 3R6MA 5AFUH 3L4IA 2UYTA 4EHUA 4FWSA 2CGKA 2D1KA 4PKIA 2HMPA 4FWLA 1YVNA 5EXWA 4WQ4A 5LJVA 1BA0A 3A0IX 3GBTA 1JCGA 5F1XA 4XH5A 5BRFA 3KZBA 5JLFA 5AQKA 3MCPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QFPA 4YOXA 1LAVA 4DQPA 2ZWHA 5GAEP 4M63C 1U4BA 3PSFA 1S6PA 1VK0A 3LAMA 1YJWN 2F8TA 1WSFA 2QKKA 3ZETA 2E2PA 4Z4FA 4B1VA 2D4WA 3DXKA 3E01A 2GTDA 3ZETB 2W6LA 4LSNA 4WFNL 4CJWA 3DXKB 3PO4A 2A6AA 2YJFA 4CGIA 4EZ6A 3FFKB 2Q97A 4IFYA 4I2PA 4C1NK 2P9PA 4FLZA 1K73O 2HNZA 1QS4A 1JL2A 4H0PA 3MWTA 3CJCA 4DG1A 4PHTX 3SJHA 1IKXA 3P5JA 4C8LA 4O5FA 2P9UA 4ISEA 2P9PB 4J2DA 2UXCK 4B3SK 3CCRN 3QDKA 1VQ4N 1NNEA 5KPZA 2OPRA 2P9UB 4E7IA 4B3RK 3IMXA 3PIPL 2X74A 4KH6A 4BC5A 4JI4K 5AQXA 1HPZA 2IVNA 3DYAA 4JN4A 5CZ2A 5HROA 4DB3A 3Q7BA 3NF6A 4CJLA 3OYCA 3D2FA 1ZBIA 4B9QA 1GLAG 1GOCA 3AAQA 1ZXOA 4DU4A 4E7HA 4DWIA 1K8KB 4DSFA 4CJ4A 1QSYA 1A5VA 4BR0A 1VQ7N 3IRXA 4DR7K 3J80O 3QICA 4DR3K 5SZTA 5HP1A 4CHNA 5HOOA 1S3XA 3OYGA 3LDLA 5ADXH 4CF1A 2WBNA 3TABA 3T7ZA 3VF4A 1Q86O 4CF0A 5GAGP 2BTFA 3SAHA 1OH8A 2KFZA 3ZYYX 3E9PA 4BG8A 1QVGM 1EX4A 2FLOA 4B1ZA 1YTAA 4M45A 2LSNA 2W42A 4H5WA 2G8UA 4FJHA 4JI1K 4IDHA 3U9ZA 4K8XA 3CJ1A 1NOZA 4JKAA 4GMJB 2UXBK 3KHYA 4B9LA 2VGNA 4LH4A 3CF5L 4CBUA 1NOYA 3BF1A 5F2RA 3WT0A 3JAMO 3W0LA 3QIPA 4CHZA 3SNNA 1YHQN 1CZBA 3OYKA 4CZIA 1XMQK 3NHGA 1QHAA 3U3GA 3OTOK 1QVFM 5TKYA 3QMLA 3WNGA 1XUPO 4GVMA 1NMDA 4YHHK 4FPAA 4DQIA 3ITHA 2JWKA 3DM2A 3C6TA 1OVYA 2B6AA 4FLVA 3TSUA 2F7TA 4CJUA 3CCJN 1XHZA 1K6YA 1Q8IA 1T8EA 5BPLA 5C0YA 2HHSA 4BR4A 3NMUA 1KTQA 3NH0A 4CCHA 1ASVA 3AVHA 4KAZA 1JLQA 5AJ3K 3PO5A 3O5BA 5I9EB 4DTJA 2QWNA 4O8KA 4QS7A 3V9SA 1KVCA 2FXUA 3TAMA 4NXNK 4CE9A 4KRFA 2ZE2A 4BQZA 4DU1A 4NCBA 3MEEA 3BP8A 4JK8A 4CHYA 1GLCG 4BRQA 4W5TA 5HRPA 1TUUA 3QETA 3LPUA 2NLXA 4EFHA 1LW2A 3J81O 2IDOA 2JWLA 4CHQA 2XY7A 4GV3A 3C65A 1T3VA 3CCSN 3JXUA 4KHQA 5KRTA 2E2NA 1TKXA 4JAXA 4MFBA 3TANA 2E88A 5FROA 2HNYA 2XY8A 3K5MA 3S41A 3LDNA 3HVRA 1R59O 3V81A 4OX9K 4FJ9A 1TV6A 3KK2A 2GV9A 4JK9A 4DMNA 3S9HA 4LF5K 4WF9L 4HCCA 3D0PA 1T6DA 2HBJA 4ID5A 3VEVA 4KTQA 3AVFA 4DFKA 2FSNA 1S9GA 2W40A 1J5OA 4FJMA 3AA2A 2GWJA 3MEGA 3LDSA 3CCVN 3EEQA 3D7EO 3TSPA 1IV0A 3SJJA 1NM1A 3OS0A 5AQWA 1MA9B 1X3NA 3TTDA 4G9ZA 2BUPA 1NGIA 3WQUA 1KCFA 1SKRA 1M90O 1RILA 4DV2K 4CFBA 3H08A 1IKVA 4CFAA 1HJRA 1U47A 4Z0UA 4DTOA 4FJIA 3CCEN 4DUZK 1NKCA 5A2QO 3SBGA 2HHVA 2FF3B 4CHPA 4KTWA 2OPQA 3HJFA 1BIUA 3HZ6A 4IG0A 1VQ8N 3T19A 3VA3A 4QOZB 1NGBA 1VQMN 3VETA 1VQ6N 4YORA 4JK7A 3VEZA 2HMIA 2QXFA 3WQTA 4BGBA 1BOTO 4DTXA 4FWPA 3THVA 3AY9A 3ID6A 4CI6A 1ZBUA 4X62K 5LMUK 1NG9A 1IBLK 3IAYA 4Q5VA 4EZ9A 3AO2A 1ATNA 3G71N 5D3GA 5E84A 5AR0A 1BI4A 5AQSA 5MLCQ 1BIZA 1S72N 3AA3A 3TPQA 4DSKA 2RN2A 3A8YA 2VWJA 1ZBLA 2CGLA 3OYHA 1BI4B 2YKMA 3OBYA 1JLGA 3T1YK 3QB0A 2D0PA 1HNIA 2ASOA 4OKKA 3CMAN 4DR2K 3LZJA 3L2WA 2BGGA 3LDQA 4OKEA 3WXIA 3TWHA 2UUAK 4IOCL 4YY3K 4NCAA 3CJBA 4JI6K 3P83D 4CZFA 2CH5A 1RT4A 4OGCA 4GY2B 5AQOA 3L2RA 2WFBA 4KB1A 3H46O 3PUFA 2GUIA 1HNXK 3SQ2A 3DLRA 1P90A 3AVCA 1U48A 4DS5A 3PIOL 3MN6A 4JI3K 5CZ1A 1L3SA 1NGJA 3NGIA 4IEEA 4BDYA 4FXDA 3WUHA 2VWKA 4M7YA 3R3LA 2Q2RA 3L2VA 3G25A 4DV0K 5KQ8A 4PQUA 2NRZA 3SV3A 1WBBA 1XNQK 4Q0BA 3PV8A 2VG6A 3N4QA 1M1KO 1KVBA 3ULDA 4CJ7A 3VQ9A 1NGEA 2VQFK 4YOVA 5HL7L 2KKZA 3C94A 2QKBA 3JS6A 1N8RO 3CHWA 1DLOA 4KREA 4N41A 1VSIA 3OVNA 1XC3A 1YTUA 2Z1JA 5KPRA 3F2KA 1C1AA 1TAQA 2V52B 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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