3C0BA

Crystal structure of the conserved archaeal protein q6m145. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
331
structure length
316
Chain Sequence
MILGIDIGGANTKITELHENGEFKVHHLYFPMDKLAEVLKTYSNDVSHVALVTTAEEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray structure of the conserved archaeal protein Q6M145.
rcsb
molecule keywords Conserved archaeal protein Q6M145
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Methanococcus maripaludis s2
total genus 87
structure length 316
sequence length 331
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3c0bA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3c0bA02
1RDWX 4FWOA 1BDGA 1C0GA 5AQVA 5AQUA 1HX1A 4H0OA 3CJBA 2E8AA 5E84A 5AQSA 2ZWHA 5KQ8A 1YAGA 2FSJA 5BPMA 1XC3A 1NGFA 3KVGA 3LM9A 3FZMA 1NMDA 1P8ZA 4FWQA 3U8XA 4QS7A 1BG3A 1XQSC 5AQQA 3VESA 3BUZB 1BA1A 3O8MA 4A2AA 4H0PA 3LDNA 5FPEA 3JS6A 3L0QA 2YHYA 1BA0A 4JD2B 1T6DA 1U2VB 5EY4A 3VEWA 1WUAA 5ADXH 1KXPA 2DPNA 3ENOA 2QWLA 1K8KB 4LC9B 2P9UB 1BU6O 5BN8A 5LY3A 3I33A 5KPTA 2Q1NA 5EOYA 1DEJA 1NGBA 4CJ7A 3U4LA 1TUYA 3GOIA 3QMLA 4BGBA 5TKYA 1JCEA 2E2OA 3ATUA 2Q31A 4CBWA 3WT0A 1HKCA 3GDQA 1U6ZA 4CBXA 4B1UB 1X3NA 2GUPA 2P9SB 4J8FA 3DXKB 2Q0RA 3CJ9A 5AQGA 3VF2A 4FPBA 5BR9A 2ASPA 3RSEA 2NRHA 3CJ1A 3IMXA 4FOEA 3CQYA 3VERA 2FLOA 5AQZA 3MN9A 3BEXA 3UKRB 4B1ZA 4CZHA 4YDUC 4CBUA 2F9WA 2Q36A 3B8AX 2QWQA 1U2VA 5KPRA 4A2BA 4QS8A 3DXMB 3F9MA 4A62A 1GLLO 2V52B 4Y0WA 2KHOA 1K8KA 2P9UA 2QWRA 3VEOA 3VEVA 1CZAN 4IZ9A 2P9NA 2I7PA 4H5TA 4E1JA 5B8HA 4KBOA 2Q2RA 4NO7A 3QFUA 2D4WA 5EX5A 4BQZA 5BN9A 3SLCA 4RTFD 1ZC6A 5AQHA 3VF4A 2E1ZA 5LJWA 2P9SA 3R9PA 3GBTA 2EWSA 4I6MA 3MN7A 1QZ6A 3ZEUA 1MWKA 1Z05A 2A42A 4A61A 3VGKA 3FGUA 3UKRA 4BRCA 1HKGA 1MDUB 1T44A 1RFQA 2A41A 1MA9B 2A5XA 4BC2A 1GLJO 4BC5A 1ATRA 3DXMA 4EAHD 1NBWA 4CZLA 2CH5A 3QDKA 3J8AA 3FR0A 3ZETB 3S41A 1TYQB 4K41A 2GWJA 3A5NC 4H5VA 4O5FA 5F0XA 2FF3B 5AQLA 1YXQA 3IFRA 1YUWA 4BG9A 1HUXA 3LDPA 4B1WB 4IO8A 4JNEA 4M7XA 3CI5A 2P9IB 2VCPA 3H6EA 3AAPA 4CZFA 4MLEA 1JCGA 2CGKA 4IXCA 3R8EA 3WEEB 1E4FT 2V7ZA 3VEXA 4BR9A 5AFUA 1NGCA 3CHWA 3O08A 4DB3A 3MDQA 1NGDA 1NGIA 4ISFA 4FOIA 4BQLA 4CI6A 3HM8A 1ATNA 1ZXOA 1QQNA 3SMSA 4BR2A 3UB5A 2QXLA 3MCPA 2E2NA 3SK3A 3M1FA 1GLAG 4BRIA 3ZETA 3LL3A 1TYQA 1V4SA 3DAWA 5AQMA 4EIAA 1J6ZA 3JXUA 2E2PA 4CZMA 1GLFO 5F1XA 3EKUA 5FPDA 5CE3A 4BRMA 4AM6A 3MK6A 4PL8A 4FWPA 3CIPA 1E4GT 3GL1A 3ULEA 4BVPA 2Q0UA 2CH6A 5AR0A 2FSKA 3FE1A 3O6WA 4O8KA 2I7NA 3VGMA 4C23A 5AZJB 2YHXA 2BUPA 4K42A 2IIRA 3ID8A 1S22A 5AQKA 1JCFA 2AA4A 3TPQA 4BRNA 4BGAA 4NB4A 1Q18A 3M3ZA 2E2QA 1S3XA 3CJAA 3I8BA 1V4TA 4BR5A 1MWMA 4FWNA 1DKGD 3WXLA 4WQ4A 4BRFA 1KAXA 4PKHA 1Y64A 3VETA 4H5NA 3C0BA 2PBDA 3LDOA 2E20A 3VEZA 2ASOA 4CZGA 4BC4A 3W0LA 3ZX2A 2HF3A 3O80A 5AQYA 3UKUB 4JHDB 2GWKA 4B1XB 3ZX0A 4H0VB 4JD2A 1RGIA 3OHRA 3WQUA 3ATVA 4H03B 4JAXA 1NGHA 2OANA 5AQWA 5AZJA 1ZBSA 3A5LC 3H45C 3VPZA 5JLHA 2E1YA 3AARA 3KZBA 4H5WA 2H3GX 2D0PA 4FPAA 2YHWA 3CQXA 5BRDA 4B1VA 3EL2A 5AQOA 3FLCO 4K25A 4BRHA 4EHUA 4EHTA 1SAZA 1KAYA 5E26A 3H1QA 3R6MA 3W3DA 3HSCA 5AQFA 4IJAA 1LOTB 2ZGYA 3VENA 3AAQA 2E88A 1NLVA 1DGKN 3U9DA 1SZ2A 2V51B 3DXKA 5LJVA 4BVOA 3BP8A 4WQ5A 3C7NB 4BRAA 5EXWA 2HF4A 3TU5A 4CD1A 1QZ5A 3FZKA 1KAZA 4DQ8A 5JMVA 3UKUA 2A6AA 4B1YB 1QQOA 5AQXA 5AQJA 3ZX3A 1IG8A 3D2FB 4XEIA 4RCHA 1BUPA 2ZF5O 4MO4A 1NGGA 4M7YA 2VWBA 5AQIA 1SQKA 3QFPA 3IUCA 2IVPA 5BPNA 1QQMA 4FWSA 2GELA 3QBWA 4BR7A 4BR4A 3EN9A 2P9LB 3H3NO 3MN6A 2QWOA 3BF3A 1D4XA 3CJCA 4Z94A 4WYBA 3VEYA 2HMPA 2YCHA 4IJNA 3HBTA 3CETA 2VYPA 3QB0A 1GLDG 3EZWA 3LDLA 1G99A 3LDQA 3HZ6A 3WXJA 1IJJA 5AQTA 3GE1A 2UYTA 3D2FA 1TUUA 1GLEG 1NWKA 4ISGA 5KQDA 3H1VX 4QS9A 4FWKA 4PKIA 4BRQA 4GY2B 4M63C 3A5MC 4CZJA 4L3QA 4DCHA 4BRDA 2ZGZA 2A3ZA 3VGLA 3G25A 2P9IA 4PKGA 4BRGA 4CZKA 1X9JA 4ISEA 3WEEA 3O1BA 4YDUA 3DJCA 3RSEB 4XH5A 2FF6A 2P9PB 3A0IX 4FWLA 4H5RA 2QWMA 5FPMA 1YVNA 2IVOA 5F2RA 1HJOA 2YI1A 3H46O 1HPMA 3D7EO 4FO0A 2CGLA 1BWFO 3MMVA 1EQYA 1GLCG 2YJFA 4BRPA 3WQTA 3O5BA 1Z6RA 4BROA 4MLHA 3CJ7A 2P9NB 4FSVA 3A5OC 4MO5A 3CERA 3HTVA 3FZLA 4JN4A 2CGJA 1ESVA 3ENHA 1NM1A 4EFHA 4F9OA 4RWTA 2FSNA 5I9EB 2D0OA 2A40A 5JLFA 2D1KA 4CZEA 3BF1A 3H3OB 4I6MB 4DHYA 4BC3A 2AP1A 2P9PA 2NZTA 2Q97A 3QICA 1GLBG 2GTDA 3ZEUB 5AQNA 2F9TA 3O1WA 2FXUA 4BR0A 4B9QA 5AFUH 1NGEA 4HWIA 2YJEA 4FWRA 3DWLA 4H0TB 5AZIB 2ASMA 3U9ZA 2W41A 4XH1A 2IVNA 2BTFA 5ADXA 3IDHA 2WUSA 4WQ4C 1BOTO 2QWPA 2V7YA 1HLUA 5KPZA 4JHDA 1R59O 1XUPO 5EVZA 2J4RA 3KHYA 2PAVA 5FPNA 2QWNA 5ELZA 5JICA 1WOQA 3D2EB 1NGJA 3HI0A 4BRKA 4FWMA 4FL9A 4AM7A 2P9KB 1C0FA 3SJHA 3MN5A 4H0YB 3VF6A 4BG8A 3O4WA 2QW9A 3SMPA 3A8YA 1ATSA 3LM2A 4K43A 5BRFA 3QBXA 1NGAA 4PL7A 4BRLA 1LCUA 3FFKB 1BO5O 4GNIA 3VOVA 3L6QA 1H1VA 3L4IA 4HTLA 4XH4A 1QHAA 5BPLA 3C7NA 1OKJA 5AZIA 3WUHA 2HOEA 3AY9A 4H0XB 4CZIA 5AQPA 3EO3A 1T6CA 4IWVA 3FZHA 2NLXA 4WQ5C 2GEMA 3FZFA 3EKSA 3ULEB 3D2EA 4BREA 5AQRA 2P9KA 2W40A 3WXKA 1HKBA 5BRHA 3WXIA 1X3MA 3P4IA 5BREA 2QM1A 2ITMA 4CD3A 3M6GA 3UE5A 3GG4A 2P9LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FWOA 4KV8A 4DSIA 3QEWA 4CFAA 3HVTA 2KKZA 3LM9A 1NMDA 3U8XA 4EP4A 5HRRA 4Z4HA 4Y1CA 5GAHP 3JS6A 3L0QA 2YHYA 1KD1O 3AO1A 1U2VB 1RT2A 4LF7K 3VQ7A 1KXPA 2QWLA 3NVKA 4B3TK 3VMFB 5KPTA 2Q1NA 1NGBA 1K73O 4CCHA 3QEPA 1O1WA 3A2FA 1MU2A 2NNWA 3ATUA 1JLQA 3MWTA 1U6ZA 2UXBK 1ZBIA 2IDOA 3RTVA 3AGRA 4CBXA 4JRQA 4CF1A 3SCXA 1TK0A 3AO3A 4FPBA 3CJ1A 5GAGP 4FOEA 3QNNA 1OH8A 4DWIA 2OPRA 3BEXA 4B1ZA 5CR4A 4OKJA 1BCMA 1XNRK 2Q36A 1U2VA 2OTLN 4QS8A 3DM2A 3DXMB 2G8WA 3V9XA 2KHOA 3O4NA 3WNFA 2QWRA 3VEVA 1HNXK 2VG5A 2P9NA 3TTDA 3G71N 2ZQBA 5KGXA 3HOSA 2KQ2A 5JVHL 1QTMA 3QFUA 5EX5A 2DFHA 3AVGA 3SV3A 5BN9A 3SLCA 1ZC6A 4DQPA 3ZT2A 4I6MA 3AVMA 4R5PA 3ZEUA 2DY4A 3DLKA 1MWKA 3NDKA 4CHYA 3LP0A 4KHWA 4DTJA 1QSYA 1RFQA 4CFCA 3KKRA 1SKSA 4KTWA 1HNVA 1WSIA 1ATRA 3DXMA 4JKAA 1NBWA 3KLFA 3CFRA 1WN7A 3QDKA 3FR0A 1JXBA 3S41A 2WOMA 4B9TA 1TKXA 4O5FA 2ZE2A 5AQLA 3F2KA 2KTQA 3N4QA 1IBKK 1YITN 2WFBA 1WSJA 4JS5A 4DV1K 3NE6A 3CI5A 1TKZA 3ZSZA 1REVA 3AAPA 1JCGA 2CGKA 3LP1A 3R8EA 1VQ6N 1E4FT 3P1GA 2YV0X 4BR9A 3LPTA 1SL2A 4C1NK 4N76A 3O08A 1K8AO 1NGDA 4DLEA 5GIPA 4BQLA 3OYFA 3CG7A 2X6SA 1ZXOA 2FBVA 1QQNA 3LANA 4YOVA 4DV5K 2RPIA 2F7TA 3MCPA 1S1UA 1A5WA 3M1FA 1GLAG 1VQPN 1V4SA 3PUFA 3DAWA 3THXB 4KB1A 4CZMA 1BISA 1VQ5N 1IKXA 3ZCMA 3CPEA 5HP1A 3AVIA 3CM5A 3VQEA 2Q0UA 1RBSA 1WLJA 2I7NA 3VGMA 3K0SA 5AZJB 4GV6A 2YHXA 3HXMA 1X1PA 3L3UA 3ID8A 1S22A 5AQKA 3TPQA 4W5OA 4BGAA 2OA8A 1Q18A 3T3FA 4KPYA 3M3ZA 3I8BA 1V4TA 4CF9A 1SKWA 3QEVA 1Q81O 4CFBA 1DKGD 2ETJA 1QVGM 4IBNA 1KAXA 4E7HA 1JLEA 3BDPA 3C0BA 4C8OA 3AGKA 1U47A 2E20A 4HCCA 3VEZA 1OH7A 2VG6A 4DV7K 2QI2A 3C6TA 5AQYA 2GWKA 3DLRA 1ILYA 3PLAA 3OHRA 5M1FA 4JAXA 2Y1JA 1S9EA 2OANA 5J1EA 5AZJA 3H45C 1CXQA 3VPZA 5JLHA 4FLYA 3KZBA 4CEAA 4FPAA 3CQXA 5BRDA 3CCVN 3MEEA 4B1VA 4CK1A 3RRGA 1HNIA 4EHUA 1KAYA 3EZ5A 3I0SA 1NLVA 2F96A 3RVCA 1SZ2A 2RKIA 1EXQA 3BP8A 2HF4A 3TU5A 3ZLJA 1QZ5A 3FZKA 3AVCA 4FK0A 4BDZA 3THYB 2GX9A 5AQJA 3F9KA 4CJKA 1GOBA 4K0KK 3P5JA 4MO4A 3T69A 4F2SA 5J2NA 5AQIA 3PO5A 4YNQA 4C8KA 5BPNA 1ZBFA 4DTSA 3OYAA 3O4QA 2GELA 1KLNA 3QIPA 3MN6A 1O13A 1D4XA 3JAMO 5FRMA 4F3OA 2HMPA 5JVGL 3QINA 1GLDG 4LSLA 3SUNA 4X65K 1NK9A 3LDSA 1LWFA 4FLTA 4LF5K 3RWUA 3WXJA 3N4PA 1CZ9A 5AQTA 4DSFA 3THYA 1KSPA 3OYIA 1TUUA 4CHNA 3OS1A 3KLHA 4NLBA 1NWKA 4JS4A 1RDCA 1BQMA 3MXJA 1BQNA 3ZT1A 2B5JA 2X6NA 3DLLL 4BRQA 1L3VA 4M3TA 4M63C 1NJXA 1J5EK 2ZGZA 4CGJA 4CECA 2YNFA 4KTQA 5DM6L 2P9IA 4PKGA 1FJGK 4DF4A 3K58A 3CD6N 4W5RA 4FZYA 2XY7A 3RSEB 2G8IA 2FF6A 2P9PB 1OVQA 3A0IX 4FWLA 3THWA 1ASUA 5AJ3K 4JRPA 2NRRA 5F2RA 3F5TA 3CXCM 4X62K 1U4BA 2OZMA 4FJ8A 3H46O 1HPMA 4FO0A 4XIUA 2CGLA 1BI4A 3MMVA 3V81A 1EQYA 1GLCG 4FJ7A 4BRPA 3WQTA 4HUEA 4DTUA 4JKBA 4BROA 4DTNA 4FSVA 3A5OC 4FJNA 1NKCA 1Q9XA 3BY5A 2FSNA 3L2VA 3LP3A 4MQ3A 4BWJA 1OH6A 4JKEA 2AP1A 2P9PA 2NZTA 1S72N 4DR7K 5AQNA 3O1WA 3LP2A 4DR5K 3ZSVA 4NXNK 1NGEA 5KGWA 4B08A 2Q3SA 3QETA 2ASMA 2G8VA 4CHZA 5ADXA 1XWLA 3M5RA 3SQ2A 2V7YA 3NMUA 3HP9A 3CPWM 2D0CA 3D0PA 4GKKK 4OO1J 4BRKA 4FWMA 4FL9A 1NJYA 4DMNA 3LPUA 2UUBK 3MN5A 4H0YB 3VF6A 4CGIA 4FK4A 4DV3K 1D9FA 2QW9A 4ELUA 3SMPA 3OYCA 2HW3A 1ATSA 3V1OA 2KFNA 1HYSA 3TI0A 3QBXA 4CGGA 1VSEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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