3C65A

Crystal structure of bacillus stearothermophilus uvrc 5' endonuclease domain
Total Genus 44

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
160
structure length
152
Chain Sequence
GSHMLGERLGIPAPRRIEAFDNSNIYGADPVSALVVFLDGKPAKKEYRKYKVKTVAGPNDYETMREVVRRRYTRVLKEGLPLPDLIIIDGGKGHLSAVRDVLENELGLDVPLAGLSELLAGDPPDVVPLDRQSQEFYLLQRIQDEVHRFAVM

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus stearothermophilus
publication title Crystal Structure of Bacillus stearothermophilus UvrC 5' endonuclease domain
rcsb
molecule keywords UvrABC system protein C
total genus 44
structure length 152
sequence length 160
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3c65A00
2NRVA 2NRTA 2NRRA 2NRXA 2NRWA 2NRZA 3C65A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZT1A 1J9AA 2YX6A 1I3AA 4E7JA 1NGCA 1DGKN 1VK0A 4FJHA 2Z1JA 1HKGA 4CJ4A 4CJ5A 3JYTA 1TL3A 4PKGA 1F21A 4KKOA 4NXMK 3M1FA 4LF5K 1WN7A 2BUPA 3CCRN 5DM6L 4QAGA 4YOXA 3RMAA 4O5BA 2IVOA 1Z6RA 3AGRA 1UA1A 1DLOA 1RTDA 3DLLL 1QHTA 3R9PA 1J5EK 2JWKA 3FGUA 4H0OA 4I2PA 2UXCK 4LFCK 4PUOA 3K57A 2ZF5O 2Q0UA 3FZMA 4MLHA 5M1KA 1VHXA 3EO3A 4K8ZA 5IWAK 2OPQA 2KKZA 3A5OC 5D3GA 1NGHA 4H5VA 1VQ4N 1EETA 4BRDA 2F96A 1JLGA 4A59A 4Y0WA 5JVGL 3U8XA 2VWBA 3SQ2A 1NK9A 4WYBA 2HHUA 2HNDA 3D2EB 4FLWA 4LF9K 1HLUA 2ZQBA 1Z26A 3CIPA 4DLGA 1HNZK 4WQ4C 2CGLA 3IDHA 4W5NA 1TKDA 2Y1JA 4BG8A 1K6YA 2GTDA 3J7ZO 4OLAA 4JKGB 3AGKA 1HKBA 3VQ5A 4AHRA 1RILA 2VG7A 1JJ2M 3LM9A 1J53A 1KVAA 4DTXA 4CJSA 2G8WA 5E41A 4DR1K 1FXXA 4N5SA 4A2AA 4KBOA 5CY4A 4HUEA 4YOTA 4PWDA 3OYCA 3JXUA 4DR5K 3GE1A 3UKUA 5M1OA 1B92A 2ITGA 4DTMA 2O4IA 4OPKA 2E2QA 2GUIA 3NGZA 1BWFO 4CECA 5JLHA 4M42A 3CFRA 1ATNA 2UUCK 1A5VA 4FO0A 4PL8A 5AQPA 3HVRA 4ICLA 2PZSA 2B4JA 1RBSA 1VSJA 3TU5A 5FRNA 4KTZA 2IVPA 4HHTA 4M41A 1BU6O 1RBVA 3V1RA 4DF8A 3OJUA 1DT9A 3RTVA 3NVMA 2QI2A 1TVRA 2NRXA 1VQ7N 4ELVA 3SZ2A 3ZSQA 4YORA 1N5YA 1XHZA 4LF7K 4F3TA 1Q81O 5B8HA 1RT3A 3L0QA 3OYBA 2E88A 3AVFA 2G8UA 4CGJA 4CK3A 4J2EA 1FW6A 3K9KA 3OBWA 4B9NA 3ZSOA 4FJKA 1V4SA 2HBMA 2ZJPL 2G8IA 1VRTA 4O44A 4R79A 2P1JA 3O4QA 3C94A 3QO9A 2I7PA 2FBXA 3SYZA 3SBGA 1E4GT 4Z4GA 1VSMA 2RN2A 4DTSA 4XH4A 3IUCA 1J5OA 5AFUA 4FVUA 3U3YA 3P38A 1XUPO 1YJ9N 1NJIO 4BG9A 2HVIA 2Z1GA 4CJTA 5JLFA 1NOYA 3VETA 4C1NI 1JXEA 3G25A 1DTTA 3B6OA 3WEEA 2QWQA 1CLQA 2P9IB 1IKXA 3SV4A 1Z05A 4DUYK 3LZIA 1IBKK 4JHDB 3TANA 5KGXA 4NO7A 2NRZA 3ZYYX 4JKFA 3H1QA 3WUHA 4X62K 1QTMA 4DFKA 3K5NA 3NHGA 1ZYQA 3PSFA 1DTQA 1RDBA 4H4OA 3N4QA 3AO1A 2D4WA 4KI6A 1S9GA 4MLEA 3M8QA 3OYKA 2PY5A 3KKSA 5CR4A 2A5XA 4JRQA 3SMSA 3NDKA 1XWLA 4FPBA 1NK5A 4BC5A 3OYIA 1RDAA 4ID1A 4X65K 1T7PA 2OYQA 4IOXA 4C8KA 4BRKA 3LL3A 3TTCA 5BPMA 4GKJK 3BZCA 3EZWA 2Q3SA 3FZLA 2OTJN 1X3MA 2F4VK 4QS9A 4KI4A 3O9RA 3CCJN 1NM1A 5AQLA 4B1YB 3S3MA 3L2RA 4DTNA 5C10A 4BR4A 1NKCA 3JAMO 4FZYA 4CFAA 1JCGA 3S3OA 3ITHA 4DSLA 2P9PB 1TL1A 4RCHA 2CH6A 1TKTA 1HNIA 3O6WA 3E9LA 3SI6A 3O5BA 3IS9A 2ZJQL 3FLCO 1ATRA 2WUSA 1RTJA 3I8BA 3ULEB 4IO9L 3BZKA 3F73A 3OBYA 1M90O 1U45A 4IJAA 3TPQA 1Q9XA 1GOAA 4XH5A 1BOTO 4CD3A 1JXBA 3CFPA 2VQFK 4DR7K 4O8UA 5SZTA 3TSPA 5I9EB 3E1YA 3Q7BA 5DMRA 3NAEA 1GLEG 4IFYA 4BE2A 3V9ZA 3KLIA 4DR3K 4DR6K 4M3UA 1JLQA 5LY3A 3VOVA 4JI2K 3C65A 2G8KA 4OKJA 3VMFB 4Y1CA 4JV5K 3TTFA 1VQ9N 5KTQA 2QKBA 1BG3A 3KHYA 4LF6K 5AQOA 1VSKA 1QZ5A 2VG5A 4LF8K 4V19S 5FPDA 3PV8A 1SL1A 2CGJA 1G15A 5FROA 4AM6A 2RE2A 3MEGA 4ISFA 4DTJA 4GVEA 4CESA 2P9LA 5AQUA 3IMXA 3VEVA 4BRCA 1TKZA 3VQ7A 4FOEA 3T69A 5KPTA 4DSKA 3SUOA 3OA9A 4AQYK 1QHAA 3OJSA 2DTUA 4BDPA 4HUGA 2OTLN 3KK3A 3AVAA 2HF3A 5GADP 4JI1K 1N34K 1E4FT 5DM7L 3PIPL 4DR2K 2XY8A 2O8BB 2ZD1A 3CYMA 1WAJA 3ENHA 3RR7A 2VCPA 2JWLA 4K25A 3ZCMA 3VGLA 1X1PA 1A5WA 5BPLA 1CXUA 2ZGZA 2OANA 5AZIB 4CF0A 4OLBA 2HBKA 3HP9A 4A5BA 3ID8A 5H1SQ 1E3MA 4N47A 4BACA 1QVFM 3K5MA 1C1CA 3MEEA 4O0IA 1IKWA 2HHQA 1SS6A 1MDUB 1LW2A 4CBWA 4CEOA 5KPZA 2Y1IA 4DFMA 4KTQA 3CI5A 4B3TK 1NGDA 3PX4A 1GLBG 1YVNA 1LWEA 3HOSA 4C8MA 1OVYA 5J1EA 1VQNN 3VA3A 1KRPA 3GOIA 4TSXA 1ITGA 1L3SA 3LP2A 1GOBA 3U9ZA 3DLRA 1NGAA 3KZBA 1VSEA 3IAYA 5M1PA 3ZLJA 4X64K 1X3NA 1K8KA 1LCUA 3QESA 3ZSZA 5AQJA 4DU3A 4Z94A 1Q86O 1S9EA 4W5OA 5KGWA 4EHTA 3IRXA 1T03A 3LAKA 3RMBA 4H0YB 3DLEA 3AA5X 3KD5E 4B1ZA 1YTAA 3LAMA 3P4IA 2UYTA 5BRHA 3D7EO 3LP1A 4BRHA 4DTRA 3OYNA 4CFCA 1WSGA 4RW7A 1S1XA 2HBJA 3PLAA 3ZEUB 2ASMA 1RTIA 2HB5A 3L2QA 2YHBA 4M63C 3AVLA 5EOYA 4KV8A 4NYNA 5AQVA 3P5JA 5GAEP 3QFUA 1B9DA 3J81O 3CD6N 2O8FA 5BPNA 4AHUA 2E5LK 3DXMB 2XY6A 1EO1A 1HQEA 2J4RA 4IBNA 4YOWA 1VQ6N 4LFBK 3EEQA 4X66K 3OYGA 4MDAA 4OX9K 5FRMA 5C25A 4FOIA 1HYZA 4CF9A 1SKWA 3G4SN 3THWB 4F9OA 4KTWA 5EXWA 4CHQA 1ZBHA 3VF2A 2E2PA 2RPIA 1WSHA 1FKPA 1RBTA 3CXCM 3LM2A 3OS1A 3A8YA 3C0BA 3CQYA 3WNEA 3RVCA 1XI1A 4DV5K 1GOCA 4Q0BA 3WQUA 5ADXH 5KQ8A 2DFHA 2O8EB 3VEYA 2QA4N 1C1AA 3TSQA 4YY3K 5HP1A 2GUPA 3ATUA 1EP4A 1JLAA 1W7AA 4CE9A 4DSJA 1C0GA 1LWFA 4BE0A 1L5UA 5F2RA 4YOYA 3LANA 3TAPA 5C24A 3F9MA 1IG9A 1DKGD 3AVCA 4CEEA 2BE2A 1K9MO 4DQQA 2YV0X 3NF8A 4K8XA 3MX5A 2ATQA 1T05A 2IVNA 2V51B 1YITN 4W5RA 2E1ZA 4J8FA 1Q18A 2A42A 4CVNE 2ASOA 4N41A 4IFEA 4E19A 4FJ9A 4M3TA 2P9SA 2ZM6K 3C7NA 3GBTA 3AA2A 5J2PA 2DFFA 4ISGA 2KTQA 1GLLO 3ZT2A 1HYSA 5E26A 3ULDA 4GV6A 2XRIA 4EP4A 1U2VB 2UXDK 3WNGA 4NLCA 4PKIA 5BR8K 4CFBA 4MFBA 4B8AB 3A5MC 4FWNA 4JD2A 4KFBA 4CJLA 3V9WA 3QBXA 5AQYA 1UWBA 4BQZA 3TAGA 5GIPA 3RWUA 3DLHA 1S22A 3N4PA 1WLJA 4BE1A 3OYAA 3GL1A 3EZ5A 4IOCL 2A1SA 2XO7A 3C95A 2CGKA 2BH1A 3O9SA 2P9UB 3I0RA 3SQ0A 3NBPA 2GELA 1BI4A 1REVA 4RWTA 3CC7N 4FLYA 4HTUA 4CZLA 3HPHA 3CM6A 4FCYA 3FFKB 1HR0K 3ZETA 4E7KA 4Z4HA 1OH8A 3DXKA 4CIFA 1LOTB 3H3NO 4PHTX 3DRPA 4CEZA 3KK7A 4JK8A 3NF6A 4FXDA 3E9OA 5F0XA 3CG7A 2OCEA 3AVBA 2NNWA 4RTFD 4WQ5A 2EWSA 5CYMA 4B1VA 2D0AA 4DHYA 1MU2A 4BRNA 3O9QA 3LDLA 3ALYA 1JLFA 1IJJA 2P9KA 4AH9A 1QSLA 4C8LA 3R6MA 3CPEA 4LSLA 2NRRA 3M8SA 3S9HA 2IDOA 4FJGA 3UKRB 3V1QA 3TAMA 3WXIA 2P9NA 1Q9YA 4NXNK 3VQQA 4DF4A 5BRDA 3KD1E 2Z1IA 1HJRA 1NGEA 1IBMK 2PYLA 3ZT3A 5HOOA 4DV4K 2FC0A 2BDPA 1JKHA 4DV7K 2XY7A 2KW4A 3WXLA 1B9FA 2DY4A 3BEXA 4I9QA 3KWGA 4FLUA 1CZAN 1K73O 3DMJA 2XY5A 4FWKA 4JKEA 2GX9A 4CGDA 2YHAA 4J2DA 2OZMA 4Z4IA 1W0HA 4IJNA 3MDQA 1LW0A 1KTQA 3ZSXA 1WBBA 1YI2N 3MXIA 1CZBA 5C2DA 1I94K 1Z25A 1BQMA 1HX1A 5AQRA 1U49A 4FW1A 4CEQA 4LD0A 3CJ1A 2RF2A 1TYQB 3O1BA 4FWLA 1IG8A 4O0JA 3CCEN 5AQMA 2ZWHA 4CIEA 5AQGA 3OYJA 4KHNA 4PKHA 4WFNL 1KAYA 3VQ6A 1X9WA 3D2FA 4JYAK 4UY8O 5JMVA 4H4MA 1JLCA 1BCMA 1NK7A 5GAHP 4KB0A 4NLBA 4CZFA 4M3RA 4FK4A 1BL3A 2DPNA 3BDPA 3QEWA 2QEXN 1EXQA 1HPZA 4CZJA 4KB1A 4A62A 5HBMA 4B9LA 4I9LA 4FJ5A 2E2OA 3SUNA 3AVMA 1HPMA 4FLZA 2GEMA 5JS2A 3KLEA 3OHRA 3KK2A 4ELTA 4JI4K 4NCAA 2O8DA 3RMDA 3CJ7A 3SV3A 1VQLN 4JK9A 3CJCA 1C0TA 2G8VA 4CHYA 5KRSA 3RR8A 3LDPA 4J2AA 3DYAA 3AVNA 2KQ2A 4JKDA 2G8FA 3P83D 2W6KA 3CERA 4JN4A 3NH0A 3OW2M 1NOZA 3HPOA 1EWRA 4BREA 5I42A 4FPAA 1NWKA 4ILGB 3SAGA 3G6EN 1ESVA 1YJWN 1KAXA 3U4LA 1TV6A 1XHXA 1KFSA 1TK0A 1CZ9A 1KQSM 3DI6A 2HNYA 2FF6A 1T6CA 4E1NA 4CZKA 5HROA 3EYZA 3CETA 4E1MA 4C8NA 1FJGK 3SBTA 3QICA 4CJFA 4B1XB 3MX2A 2HHTA 3GDQA 3AAQA 3QNOA 1OH6A 4DQSA 4LSNA 1XMOK 3M6GA 4CJ7A 1VQKN 1NGJA 2EX3A 1RFQA 4YOUA 2E2NA 3SJHA 1YJNN 4CEBA 2A6AA 3R8EA 2AA4A 3VEZA 3L2WA 3DLBA 4AHTA 2G8HA 3D0PA 4M3ZA 1HNVA 1U48A 2X6SA 4JRPA 1NK8A 1BI4B 4KH6A 2F9TA 3O3GA 4DCHA 1GLCG 3HRGA 4FM1A 4DU1A 4FLXA 3CJBA 1NGIA 3QINA 3PIOL 4CF2A 3CMAN 3MK6A 4PA1A 4H0PA 3UB5A 3C6HA 3MMVA 1D8YA 1D9FA 3S41A 3ISNC 3K2PA 1BIZA 1ZBFA 5J2MA 5AJ3K 1IBLK 4H0TB 1RT6A 3W3DA 4OPHA 5M1FA 3JS6A 3MEDA 4K43A 3TI0A 4FJ8A 3L3VA 4OGEA 4KHWA 4BR0A 4CERA 2O8CA 1RT2A 3AVKA 3H3OB 4BGAA 1ASUA 1SL2A 2HMIA 1X9SA 3EN9A 4FJ7A 2QWPA 3VENA 3AV9A 3SK3A 3PSIA 3U3GA 1C0FA 1VAZA 3QEXA 4BRIA 4HTLA 2W41A 3R1XA 1YVUA 4BRPA 3VESA 4NCGA 5HRNA 4KH4A 3DM2A 4Z4CA 5AZJA 3J8AA 4O8KA 3FE1A 3PX6A 4R5PA 4UQGA 1WSFA 1KSPA 3VQAA 4IXCA 4DTOA 5TKWA 2UU9K 2BTFA 1A5XA 3SQ4A 3A0IX 3HO1A 2HHXA 2QM1A 1NGGA 3KLFA 1IH7A 4AHCA 2QXFA 4CHNA 3QDKA 1HQUA 4B9VA 3QETA 5JICA 4CJ3A 1NK0A 3UKUB 4HUFA 3NMUA 4KREA 3D45A 1VSIA 3CFOA 4NB4A 3SAHA 3AO3A 4CJEA 4HVJA 3QIOA 4FJIA 4MDBA 3THXA 2H3GX 2Z1HA 3O08A 3RSEA 4CK2A 4Z4EA 4C1NK 4B9QA 2ZE2A 3EE9A 3OY9A 4KRFA 4NYFA 2QWNA 3LWLA 3U6FA 3KJVA 4FWMA 2QWMA 3DLKA 3P39A 5JS1A 2YCHA 1IV0A 3R3LA 4FZXC 1LWCA 4F8RA 1LAVA 4DU4A 2HW3A 1X9JA 2FSNA 3THYA 4GV9A 4ZTFA 4BC3A 2D1KA 4YDUA 3GG4A 1NJWA 1S1VA 4FLTA 3O1WA 1GLDG 3C6TA 3ZSVA 4CGIA 3F2KA 1HYVA 3L8BA 3CPWM 1LAWA 3AA4A 3RRHA 4Z0UA 1ATSA 4WFAL 2D0PA 3O9TA 5AQQA 3QLHA 2WBNA 4CFDA 4BVPA 1RGIA 4QOZB 3H46O 4RG8A 4M3YA 2NRVA 3AARA 2B6AA 4CBXA 2PBDA 4CJVA 1ZBUA 1K8AO 3HK2A 3ASMA 3OTOK 3MCAB 2CH5A 4I6MA 3WEEB 5ADXA 1T3VA 1KLMA 1WSJA 3ID6A 4U67L 2UUBK 3HSTB 3VERA 4XEIA 3ZSWA 4CZGA 2HHHK 4BDYA 3WXKA 2WOMA 4O55A 3L2UA 1N32K 1KCFA 4CGFA 4YNQA 3OVNA 3VTHA 3MXMA 5EY4A 3K5OA 1BA1A 4ID5A 4C23A 5EX5A 3RRGA 5J2NA 4W5TA 1QQOA 2UUAK 1GLJO 1ZC6A 4BC4A 3EY1A 1HRHA 3EKSA 1SV5A 4BRLA 1KAZA 4CEDA 4JKBA 1QSYA 4NCBA 4ILHA 1I39A 4J2BA 5GIOA 4CGGA 3L4QA 3EKUA 4BR5A 2QKKA 3VQBA 2FLOA 1SZ2A 4CD1A 1KVCA 3DOLA 2KLAA 3CJ9A 4WQ4A 1NG9A 4DS4A 3O9UA 4CEFA 4N76A 1IO2A 4EFHA 2KFNA 4DV2K 3G71N 3P31A 3C6UA 4DB3A 1VSHA 3D2EA 3AO5A 4JKHA 4OKEA 4DQRA 3L6QA 4MO4A 3CCUN 1ZBIA 5AQSA 1MWMA 4ZHRA 3VF6A 3T1HK 4B1UB 2VGNA 4JKGA 3K58A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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