3CC7N

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation c2487u
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
molecule tags Ribosome
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cc7N00
4WF9L 3CC2N 5JVGL 1VQON 1VQ5N 1JJ2M 1VQMN 1K9MO 1VQPN 2ZJRL 5GAEP 3I56N 2QA4N 3CCSN 3CC4N 3CCVN 5GADP 3CMEN 4WFAL 5DM7L 1KC8O 1VQ6N 2OTLN 4WCEL 1Q86O 3CD6N 5HL7L 4IOAL 1Q7YO 4WFBL 1NJIO 5DM6L 3OW2M 3DLLL 1VQ4N 1QVGM 3CC7N 3J7ZO 5JVHL 1VQKN 1W2BM 5GAGP 5MLCQ 3CCLN 1YJ9N 3CPWM 1VQ9N 1OVYA 1YJWN 3G71N 1VQ8N 3CCMN 4IOCL 1M90O 3PIPL 3CXCM 2ZJPL 1S72N 5H1SQ 1ILYA 1YIJN 1K8AO 1YITN 2OTJN 4UY8O 1QVFM 3CCEN 5GAHP 1Q81O 3CCJN 3CCQN 4U67L 1KD1O 1YJNN 2ZJQL 1KQSM 1VQ7N 3CCUN 3G4SN 3PIOL 3CMAN 1K73O 3CF5L 3G6EN 1VQNN 4WFNL 1VQLN 2QEXN 1Q82O 3CCRN 1M1KO 4IO9L 3I55N 1YI2N 1YHQN 1N8RO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JVGL 3CM5A 1HJOA 1HQUA 3JXUA 2F7TA 4FJLA 1CZBA 4LC9B 1TGOA 1WLJA 5BR8K 4AHUA 4H0XB 3OJSA 3MCAB 1WAFA 5E84A 3CC4N 3ZSOA 1VHXA 2P9LB 2UUAK 1GLDG 4WFAL 4R79A 4FO0A 5DM7L 4FWMA 2Q97A 4CZGA 2PZSA 2RHKA 3E9PA 1K8KA 1VSIA 1YXQA 3ITHA 1I94K 4J2DA 3QINA 1Q7YO 4FZXC 2W6KA 1WBBA 2P9IB 3QERA 4BWJA 4F4KA 2P9UB 3D2EB 3VPZA 4XIUA 1U2VB 3DMJA 5AQVA 2DPNA 3QIOA 4BQLA 3KLGA 2VG5A 2P9NA 4C8KA 2HBJA 4FWKA 1BCMA 1S9GA 2AP1A 4FL9A 3RMBA 3BZCA 5CE3A 4A2AA 3LP2A 3ZETA 4IDKA 3ZEUB 4CEBA 2VWJA 1NK4A 1J6ZA 3W0LA 3FZFA 1U47A 4OLBA 2ZJPL 4LH5A 4DR5K 1X9MA 4JI2K 1LAWA 4JRQA 2FSKA 4CBXA 3QNNA 4CEDA 2KKZA 4FM1A 4B1WB 2X6SA 5AQNA 5KI6A 4E1MA 2NRWA 5BRDA 5J2NA 3AVMA 1OH6A 4JRPA 3WUHA 3CHWA 4CJPA 5C2FA 3IMXA 4BRNA 1T44A 3LDLA 5HP1A 1VQLN 3CCRN 3PO5A 3KK1A 4FLZA 2YX6A 1A5VA 2YNHA 3GL1A 4I9LA 1KLNA 2XO7A 1RTJA 3AAQA 2RKIA 4H5WA 1BDGA 3THYB 3JYTA 1XWLA 4KO0A 3T19A 1K9MO 1BO5O 1HLUA 1OH7A 2IAJA 1TV6A 1N34K 4X65K 3S3MA 4FYDA 1GOCA 2D1KA 3C94A 4JI6K 4JI8K 1TKTA 1QZ6A 4O8KA 4MDBA 1HNZK 4K25A 4OKKA 4PY5A 2D0PA 1FKPA 2JWKA 3KZBA 1LCUA 4JKGA 3P4IA 3QMLA 2EWSA 2OZMA 1KFDA 4Z4EA 1NGCA 4IBNA 4M7YA 1SKWA 3K5OA 3VTIA 4DHYA 3U4LA 2Q3SA 4C8OA 3GG4A 4CEAA 5J2MA 1NGAA 3T1YK 1O13A 2CH6A 3LDPA 5BREA 2O8EA 3CJ9A 3O1BA 3D7EO 2NNWA 1VSMA 1D4XA 4E7IA 2P9SB 3C6AA 4MO4A 5AQTA 1E3MA 3NCIA 4OGEA 4CGGA 1RFQA 2F96A 4CJUA 2DFEA 3LP3A 5EY4A 3MEEA 1CXQA 5AQLA 4LFCK 2O8CA 1ILYA 2GTDA 4FWPA 1RBSA 3VEWA 3DJCA 1HMVA 5HRPA 1WNSA 3ALYA 2GBZA 4IDHA 1YF5L 4CHOA 1UWBA 4KHNA 4FLXA 3K9JA 2YKNA 1C6VA 5DK5A 1L3SA 3NH1A 1EKEA 4YOYA 4DG1A 1YJNN 5CYMA 5C2DA 4FLTA 3O9SA 3ATVA 5KPRA 3O9UA 1DGKN 1WSJA 4DF4A 3TPQA 3KTQA 3HYFA 4XH4A 3KWGA 2HW3A 1ZXOA 2LSNA 1Q9YA 3FZHA 2PYLA 1GLEG 4FOIA 2HNZA 5AZJB 3T1HK 3MEDA 1VRUA 3MX2A 1IBMK 3KLEA 2ZM6K 4J8FA 1RILA 5GINA 3LAKA 1RGIA 1FKOA 2HVIA 1TAQA 3BEXA 4FSVA 4B1UB 3OYAA 3AVHA 1VSJA 4CEEA 4F9OA 5F0XA 2X78A 2I7PA 1KFSA 4B8AB 2VG6A 4H0PA 2HHVA 2YCHA 4DFJA 3CD6N 4DTJA 3LDQA 1P90A 3AARA 2P51A 1BOTO 3CC7N 5D3GA 3VN5A 4BACA 3K58A 3O6WA 3AVNA 5ELZA 2NRZA 2QWOA 3O4WA 1HYSA 4CZLA 1ASUA 2ITGA 4CF8A 1TK8A 4V19S 4RW8A 4DTNA 3QETA 4KHQA 4W5NA 1XMQK 5HLFA 1G99A 3CJAA 2QK9A 2YJFA 4JI7K 4B3SK 1YTAA 4DWIA 4DSEA 1EWRA 4MLHA 1XC3A 1YVNA 4FJHA 4BE0A 2O4IA 3CCEN 1Q81O 1JXBA 3AV9A 3U3GA 3L2VA 2WTUA 5LL6Z 1O1WA 3RMDA 2A1SA 4MQ3A 1QE1A 4LH4A 3FFKB 4BRCA 3WEEB 2W42A 4N5SA 4JI1K 4M45A 4W5QA 3RWUA 4CGHA 4X64K 2QWQA 2G8HA 1Y97A 1BWFO 4Q0BA 4BGAA 3E1YA 1RT4A 4BC5A 1H1VA 2I5JA 3NGYA 3QDKA 3QEVA 5EXWA 1CZ9A 1SKRA 2HHUA 4NCAA 3KLHA 3ASMA 1IV0A 3SUOA 3ATUA 2RPIA 2O8DA 4AILC 3IG1A 3PX0A 4JS4A 2HBMA 3DRRA 4KBOA 2FC0A 4OX9K 4H5TA 3CCSN 1JCEA 4JK8A 4KHWA 4WYBA 1XC9A 3G25A 1BI4A 3ZYYX 2P5GA 1Q18A 1VSDA 4ISEA 1K6YA 3ZSZA 1T03A 4H4MA 3V9UA 4DFKA 3F9MA 2HHXA 1K8KB 1D8YA 5J2QA 3MN5A 4DB3A 2G8WA 2Q1NA 2JWLA 4J2AA 4FJ8A 1YAGA 4FJ7A 4FLYA 4FVMA 3AGKA 1NGEA 3EKSA 4B9NA 4XH1A 2P9NB 4IOXA 3NF8A 3VMFB 1HJRA 2KW4A 4H0TB 4FJNA 3DLRA 5ADXH 1XHZA 1IKVA 3ZETB 4DV1K 4CHPA 4HWIA 3VEXA 5AQZA 4CZMA 4O8UA 4CGJA 3O80A 5KRTA 1KTQA 3LDSA 1S9EA 1UOCA 1C0UA 2F9WA 2P5OA 1NGDA 2XRIA 4UY8O 3IDHA 1NOZA 3SBTA 2ETJA 3A8YA 3AO1A 3OJUA 2E20A 1KD1O 4CZFA 2A1RA 1UA0A 4M3WA 3WNGA 1WOQA 3GOIA 4C1NK 3BUZB 4FPBA 4YY3K 3G4SN 4JKEA 4L3QA 3TSUA 1HKBA 4WQ4A 4DV0K 4LY7A 3NAEA 3VF6A 1K73O 3DWLA 2A5XA 4CGDA 3QEPA 1D5AA 1YVUA 3ZSVA 1QZ5A 4E7HA 1L3UA 4BC4A 4K8XA 2Q31A 4IJAA 3JS6A 4A5AA 1TAUA 4JNEA 3M8QA 2YNGA 4DV5K 4GV9A 4H5VA 1FW6A 2P1JA 2BGGA 2WOMA 2ZF5O 4CZJA 5HOOA 2FBTA 4DR2K 1ATNA 1TKXA 4DTSA 2ATQA 3LL3A 2XY6A 1RT1A 5DMRA 2A42A 4Z4IA 2OA8A 1ESVA 4AM7A 3HM8A 3K57A 1S6PA 1ZBSA 4WE1A 1SL2A 1VQ6N 2A6AA 3V1QA 4OLAA 1X1PA 4DU3A 1N32K 4JKGB 4CJ4A 3K5LA 2QWPA 2QKBA 3ZCMA 3AO3A 2AJQA 1VSFA 4FZYA 3K5MA 4BR4A 3SPYA 4DTOA 3AO2A 3IRXA 3DLLL 4PQUA 3LM2A 3G10A 4K42A 1RDUA 3CJ1A 4U7BA 5JVHL 5AQXA 4AHTA 4PL7A 5KQDA 3AO4A 3CJ7A 3AVFA 3VF2A 2HHWA 4CJEA 4B9SA 2O8EB 1XHXA 4MLEA 4R5PA 3THVA 1YJWN 2VG7A 5FPDA 4BR2A 3VQ5A 3RRGA 5CR4A 4KKOA 4B8CA 3MXIA 3F5TA 2BUPA 3FE1A 4KPYA 3LALA 3PSFA 1ZBFA 3LP0A 3ENOA 3QEXA 1M90O 5FDLA 2G8VA 3H1QA 1KAYA 3KK2A 1S72N 3L4IA 2O8CB 4DKWA 4W5TA 3SAFA 3OYCA 1NMNA 4DTPA 3T1AA 4O4GA 4FWLA 4CIFA 1NK8A 1C1AA 2NLXA 5C0YA 3CCJN 4DS5A 1T6CA 3NF9A 1DLOA 1J9AA 4IJNA 2RE2A 3OS0A 4KH6A 2OPQA 4HVJA 4LF4K 2ZGYA 4JKDA 2YHAA 2Z1GA 5AQMA 1JCGA 3S3NA 1M1KO 4B08A 1B9FA 4IO9L 1GLFO 3I55N 2NRTA 3CIPA 5I3UA 3FZMA 3EL2A 3LWLA 3NF6A 3NGIA 1EETA 4N56A 4WQ4C 2YI1A 2HMIA 3HSTB 3I0RA 3NH2A 4TSXA 5M1QA 1C1CA 4DU4A 5EOYA 3OA9A 4Z4FA 2KFNA 5BPMA 1MU2A 2ASOA 1KC8O 2Z1HA 4CF0A 4JLHA 3UKUA 1RBUA 2E6MA 2IS3A 5J2PA 4B3TK 1F21A 4BRDA 1L5UA 2XY7A 4OPHA 5AQQA 4CEFA 4DV7K 1X3NA 4DQRA 3C0BA 4DQQA 5GAGP 3H3NO 3QFPA 5AQOA 3UIQA 4PKIA 4JD2A 1NK6A 4NYNA 3J7YP 3L8BA 3EY1A 1S1TA 5KQ8A 1D9FA 3VEYA 2BH1A 4CESA 1N6QA 4BY9C 4DV6K 3PLAA 4ISFA 1SV5A 3HOSA 3TAPA 3CJBA 4DV3K 1S3XA 1GLBG 4IKFA 4CJSA 3TAMA 1RDCA 3C6UA 4GV3A 1TKDA 1Z05A 1Z25A 3KLIA 4CHNA 3IUCA 5LMUK 3SQ0A 1BQNA 1NKBA 3ID6A 1IJJA 3V9WA 2WBNA 4OPJA 2HBLA 4PKGA 1EP4A 3EE9A 3OYFA 3AA2A 1WN7A 2FXUA 2WUSA 4IFEA 1SZ2A 2ASMA 3DOKA 3LANA 4CF2A 1Q82O 1NM1A 3VGLA 4H5NA 4GMJB 4BVOA 1Q8IA 1TVRA 4IEEA 3MK6A 3TAGA 2FBXA 4CZEA 3WXLA 3D2FA 5AQJA 4F3OA 3EEQA 1VQ5N 3M5RA 4QOZB 2GWKA 3VGKA 4HUFA 1TYQA 3TSQA 3CQYA 2O8DB 5AQHA 4DFMA 5GAEP 4YHHK 3P38A 2PYJA 4OVLA 5EVZA 3SNNA 3WXJA 3ZT2A 4B3OA 1BI4B 3ZT0A 1T7PA 4KAZA 3A5OC 3ZSQA 2CH5A 2WC9A 1MA9B 1HQEA 3MWTA 3HP6A 3SBGA 4G9ZA 4WCEL 3FZLA 4Z4HA 4KRFA 1JL2A 3LWMA 1NGJA 4CEQA 1ATRA 2ASPA 3LDNA 4YOXA 4DTUA 3OW2M 4E1NA 1QVGM 1U6ZA 3KD1E 3HO1A 3CM6A 4IZ9A 2KFZA 5GIPA 4QCLA 4FWRA 2PFUA 4FK0A 3MX5A 4BE2A 4B1XB 1S5JA 4BDZA 3K2PA 1N33K 5EU7A 2NRHA 2QW9A 1QS4A 1S6QA 3G71N 1T05A 1KLMA 4OKJA 1V4TA 5FPEA 3DLBA 1G15A 1TUUA 4C8MA 5ADXA 1DKGD 1GOAA 4CZHA 5B8HA 4DSLA 3O9TA 1IG8A 3SAGA 4EZ9A 2IOCA 2E6LA 3OY9A 1HRHA 2Q36A 4LF9K 5GAHP 2D0AA 3KJVA 4GKKK 1SL0A 3OYEA 3OS2A 3VOVA 1OKJA 4CJWA 1NGIA 1GLAG 5KGWA 4DF8A 3FLCO 1VQ7N 3FR0A 3CCUN 4DCHA 3MDQA 4AH9A 3ZSWA 3PX4A 1J54A 1EQYA 1SS6A 4CEZA 3MN9A 4IFVA 1UAXA 3EO3A 1MWMA 3ZX3A 3KWIA 1YT3A 1N8RO 2VGNA 5AQRA 4EHUA 3AGRA 3HPHA 4CK1A 5C25A 1ZC6A 4PHTX 5J1EA 3AA3A 4CK3A 3QLHA 4BR0A 2QA4N 4JKFA 1JLGA 2V7ZA 2F9TA 2X74A 2FSNA 3VEVA 4DU1A 1SL1A 3HVTA 2GWJA 4C23A 2VQEK 1FK9A 2X6NA 4HTLA 3UKRA 5C12A 4DQIA 2QI2A 5FPNA 1RTHA 3BF3A 4H5RA 3VGMA 3C6HA 5DM6L 1NJWA 1Z26A 4G1QA 4CI6A 4PWDA 3S9HA 3ZLJA 3VQPA 1R59O 4MFBA 5M1FA 1C0FA 2D5RA 5KPTA 5CY4A 4BGBA 1RT7A 4M41A 3K0SA 3NVKA 2O8BA 3WQTA 1N36K 4GKJK 4B9MA 4FLVA 3V1OA 1FXXA 1BUPA 1T6DA 1NGHA 1VQ8N 4K8ZA 3AA4A 2E5LK 1WBDA 4KTZA 3PV8A 4DV4K 2NUBA 4ILGB 4J2BA 2P9KA 4FZZA 1W0HA 2OZSA 5FRMA 2YJEA 4ID5A 1B92A 4O5BA 2G8KA 3FZKA 3R1XA 4ISGA 1ZBIA 2XHBA 4N76A 1IKYA 2FSJA 3CCQN 2FF3B 4BRFA 1IG9A 3WQUA 1IKXA 3LM9A 3HJFA 2UXDK 2FLOA 3G0ZA 3U3YA 2AA4A 5BPLA 2KZZA 2HMPA 2JGUA 1CZAN 3VQCA 3L2QA 1VSHA 4BRAA 1RT5A 4H8KA 2DTUA 4A2BA 1P8ZA 3P5JA 5T7BA 4M3XA 3TTCA 4DTMA 4NO7A 5M1PA 2E8AA 3OYIA 1KCFA 3WXKA 4MDAA 3C95A 1DTQA 3AA5X 3QB0A 3VQQA 2YNIA 3U9DA 5BR9A 5A2QO 4DMNA 3NGZA 1NGFA 4FJJA 1LW0A 3R8EA 3HPGA 3Q7CA 1E4GT 5CHIA 2ZJRL 3CPEA 4FJXA 1JLAA 4CCHA 1WAJA 2NRRA 1UA1A 2CGJA 3B8AX 1KAZA 1J53A 2QWNA 1TUYA 3ZT4A 4O0IA 1HR0K 4LF7K 2ZD1A 4OPAA 3ZX2A 3NHGA 2HHTA 2PY5A 3UKUB 4DR1K 3HOTA 1XNQK 1L3VA 4BDPA 4Z94A 1JLBA 1HKCA 1X3MA 3VQ8A 5SWMA 3VQ6A 3SK3A 1LW2A 2KHOA 4PKHA 3RMCA 4JD2B 1SAZA 2FBYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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