3CC7N

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation c2487u
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cc7N00
4WF9L 3CPWM 1YJ9N 3CC4N 1YITN 5JVHL 1VQON 1QVGM 1VQ5N 3CCLN 4UY8O 3CCJN 3G6EN 3DLLL 3CCVN 1KQSM 1Q86O 3CXCM 2ZJRL 2ZJQL 1VQ8N 1VQ9N 3CCQN 2ZJPL 3J7ZO 3CCSN 4WFNL 3CC2N 3CC7N 5HL7L 4IO9L 1M90O 2QA4N 1VQNN 5JVGL 5MLCQ 3CCEN 3CMAN 1VQ4N 1W2BM 1Q81O 2OTLN 1VQ7N 1YHQN 2OTJN 3G71N 5H1SQ 3G4SN 1KD1O 3I56N 1OVYA 4U67L 5GADP 4IOCL 4WFBL 1QVFM 1Q82O 5GAEP 5DM6L 1YJWN 5GAGP 1YIJN 1VQKN 4WFAL 1K73O 3CMEN 3PIPL 1ILYA 1YI2N 3PIOL 3CCUN 1K8AO 3CF5L 1NJIO 1VQPN 1N8RO 1VQMN 3CD6N 1M1KO 2QEXN 3CCRN 1VQ6N 3CCMN 1Q7YO 3I55N 1JJ2M 3OW2M 5DM7L 4IOAL 5GAHP 1S72N 4WCEL 1VQLN 1KC8O 1YJNN 1K9MO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YI1A 4FK0A 3CJCA 3CPWM 5HOOA 3CC4N 2O8EB 1RDUA 3KHYA 3WNFA 3O08A 2VQEK 4FPAA 4GV3A 1KVAA 3VQ7A 5CE3A 3FE1A 1NK4A 1GLFO 1TKDA 1FKOA 1HPZA 1QZ5A 2GWKA 3N4PA 3NBPA 4A62A 4JI0K 4NO7A 1LCUA 3P31A 1LOTB 1BA0A 1RT2A 1YT3A 4OKJA 5EOYA 3SAHA 4IG0A 4BY9C 1TAQA 1VRTA 2OZMA 2FSJA 5AQKA 2HF4A 1WSJA 4G1QA 2X6NA 5HP1A 3CC7N 1BA1A 5EU7A 3VEOA 3D7EO 4DLEA 3MN5A 4JD2A 3ZETA 4FYDA 3FZMA 3K57A 4JKCA 1VSMA 4DU3A 3WXLA 3EEQA 3K2PA 2G8FA 2HHHK 1N36K 4DSJA 2E88A 2UUAK 2HHXA 1HR0K 3AA2A 4FWLA 1NJZA 4QCLA 4JAXA 4EIAA 5KGXA 4CEAA 4QS7A 2QWNA 1TGOA 4MLEA 4W5NA 3B6OA 2FC0A 1K8KB 2HF3A 5GAEP 1VSKA 3K0SA 4B9MA 4BRNA 4IZ9A 4KTWA 1XHZA 4KHNA 2HVIA 1NGDA 4CFBA 4DWIA 2UU9K 3AO2A 5BRHA 3C7NB 3PIPL 5IT9O 3CYMA 3HM9A 3FZKA 5C25A 2O4IA 4KBOA 2PFUA 1RDDA 3NF6A 4Y1CA 4KH6A 4K43A 1SV5A 3WXIA 1FK9A 2QEXN 1Q8IA 4B1ZA 3CM5A 1RT3A 4M3TA 1S6PA 3EL2A 2VG5A 3KZBA 3OYIA 5DM7L 5AFUA 1VSHA 5BPNA 2YNHA 1KC8O 4AF1A 2GBZA 4JKDA 4H0YB 3VQAA 4KB1A 5AQPA 4FJGA 3Q7CA 4LC9B 4I9LA 2OANA 1RCHA 1NMNA 3T1HK 1NGAA 1ATSA 2GEMA 4WQ5A 5AR0A 1XC9A 4GNIA 2AP1A 3CHWA 3NCIA 3D2FB 3PX4A 3LZJA 4E7IA 4C8OA 3VQ8A 1KXPA 1S22A 3SV4A 4H0OA 4Z4CA 4B9UA 3JSMA 3P39A 4WFNL 1NKEA 1U2VA 2P5GA 3O9SA 1NK6A 5D3GA 4ILGB 1NKCA 3ZX2A 2E8AA 4X64K 4R79A 4YORA 4B9TA 4JKFA 4DV2K 1N32K 2GV9A 3F5TA 3MECA 2I7NA 3HVRA 2P9IA 1Z25A 5E41A 1BCOA 2HMIA 4I6MA 4DV5K 1BHLA 2P9SB 1JLBA 4CCHA 1S1UA 4DB3A 3V1RA 1CLQA 1T8EA 1NGFA 4BRHA 4FCYA 1RGIA 3FGUA 3ZT0A 4BRIA 4IOCL 3U8XA 4OGCA 3QFPA 2YHWA 1N34K 1E4GT 3GDQA 1TK0A 1BIUA 2KZZA 4HUGA 4Y1DA 4IWVA 1WNSA 2G8KA 4C8KA 2F8TA 1JCGA 3PY8A 1GLDG 2CGLA 3D2EA 3CF5L 3S3MA 3L3VA 3UKRB 3HP9A 4OVLA 5AFUH 3C6TA 4BRGA 3ZSVA 1W97L 1N8RO 4F2RA 3O3FA 5AJ3K 1VQ6N 4C8LA 1T7PA 3M8SA 3BZCA 2A3ZA 5HRRA 3ULDA 4WCEL 3HSCA 4R5PA 3ZT4A 1Y97A 4FW2A 4Q5VA 2DY4A 2KW4A 4PY5A 1JLQA 2YJEA 2O8FA 2OPQA 4CK1A 2UXCK 2VWKA 3CJBA 4CD3A 1KFDA 4BRFA 4DR3K 1IKWA 3DJCA 3HL8A 3RR8A 3O3GA 1O13A 2NRTA 5M1FA 2ZJQL 3TR8A 3NF9A 4YHHK 1T03A 3TAMA 5F0XA 5KRTA 3MEEA 2D1KA 4ILHA 4OKKA 4GW6A 2O8CA 3MXJA 3DLGA 1HYZA 4CK2A 1HUXA 3TABA 3C65A 2O8EA 1ZBSA 1JKHA 2P1JA 3KD5E 3BUZB 5FPMA 2BGGA 2QA4N 4PL8A 2OPRA 1RBSA 1X9WA 3DLEA 3OTOK 2B6AA 3EKUA 5HRPA 3QEIA 3L3UA 3NGIA 3MCAB 4NCBA 1X3NA 2GWJA 1HYSA 4DFPA 1Y64A 5M1OA 4HWIA 3VF4A 3VTIA 3LDNA 1C1CA 4XH5A 2V7YA 5EVZA 4ELUA 3JAMO 4WYBA 1YXQA 3W0LA 3FLCO 4DQSA 4IBNA 1JCFA 2VG6A 3VQDA 1J6ZA 4BWJA 5GAGP 4BRKA 3V81A 3O9QA 1YIJN 1VQKN 1S9GA 4BRQA 3VQ6A 5ELZA 4DV0K 2RKIA 4LD0A 3DOLA 1S1XA 3QETA 3CIPA 5FROA 3VERA 2X74A 3NGYA 3CQYA 2EX3A 4H4MA 4AM7A 3HI0A 5HLFA 1WB9A 1A5WA 5GIPA 1I94K 1EXQA 1HJRA 1DLOA 1GLLO 1GOCA 1BDGA 3MX5A 3VEXA 3WXKA 4B1YB 4M7YA 4K42A 4DTUA 3SAFA 5CZ1A 4CVNE 2YNIA 4LSNA 3C7NA 3O8MA 3VQEA 3CQXA 4AM6A 3OYJA 3VEZA 4HUFA 3V4IA 4DR6K 1VAZA 2ZGZA 3I33A 3TTDA 4JI6K 1OH5A 1EO1A 3NMUA 3DRSA 2QW9A 4O0JA 4EFHA 4B9QA 2RF2A 4CEDA 3P83D 3A0IX 4FZXC 4HUEA 3MXMA 4B3TK 5BRFA 3OBWA 4F3OA 1F21A 4AHCA 4FM1A 3AARA 2YHYA 3ID6A 3M5RA 2UYTA 2ASMA 3VQPA 4AHRA 4F2SA 2E1ZA 3QB0A 3H1QA 4C23A 4KHPK 5BR9A 5LMNK 3RMCA 4MDAA 5AQJA 3PX0A 3VQ9A 1VQNN 1J5EK 3RVCA 3M8PA 3AGRA 1L3TA 4FOIA 3SUQA 1LAVA 4YOUA 1YVUA 3D45A 3HXMA 1L3SA 1VQ7N 4KI4A 4MO4A 1HNVA 4B1XB 1XMQK 3T69A 5AZIA 1XMOK 1E4FT 2FXUA 4CZIA 3LP0A 3V9WA 1SUQA 2FLOA 5FLXO 4CEQA 4PWDA 1UA0A 2G8VA 4DS5A 3HVTA 1TV6A 4A2BA 1SKWA 4KHQA 5GADP 4YY3K 3BDPA 3ATUA 2E4LA 3SPYA 3MCPA 1WLJA 3FFIA 4BR4A 4BG9A 5BPMA 4IFVA 1RTJA 3MEGA 3KVGA 3NH1A 4DSIA 1JLCA 3SI6A 1T6CA 4B1UB 3LDLA 4H0VB 4CZLA 4C1NI 3UIQA 4BRCA 3SQ4A 2NRRA 1C1BA 4CJSA 3O1BA 2R7YA 1BISA 4CFAA 4ISEA 3CCUN 3WQUA 3NH0A 4GV9A 3K9JA 2P9SA 3LDQA 1KCFA 1IO2A 4HCBA 2P9PB 3B8AX 5LJWA 3KTQA 3GBTA 5K14A 4V19S 1ATNA 4IOAL 3ZT3A 3F73A 3AO5A 4H0XB 4KRFA 3O9UA 4DLGA 1YJNN 1RTDA 1RBTA 4CJEA 4Z0UA 2UUBK 3T1YK 4CF8A 1Q18A 4KHUA 2HNDA 4PL7A 4GVMA 3T3FA 1JL2A 4K41A 4DR4K 4J2EA 1DGKN 4JKHA 2JWLA 2XRIA 3MEDA 4YDUC 5KRSA 4PQUA 4YOYA 1RDAA 1VSFA 3W3DA 3WXJA 1VQ8N 3MDQA 1DEJA 1WSFA 3KK1A 3HP6A 4DF8A 2JLEA 1WBBA 3R3LA 3LWLA 5AQSA 2PZSA 4B9VA 2GUPA 1NGCA 3H3NO 1XI1A 1X3MA 3GG4A 3L2UA 2YCHA 4KV8A 3QEVA 3TSQA 4KH4A 4CW7B 5JS2A 5CZ2A 1HMVA 3KLGA 1QTMA 3CMAN 3KIOA 3CPEA 2BUPA 3VGLA 3VF2A 2D0PA 2F96A 4CJPA 3OS1A 1IKVA 3AGKA 3LDPA 2W41A 3KKSA 4PKIA 3IUCA 5H1SQ 2XY5A 4A57A 1JLEA 2GTDA 3QBWA 3AA5X 1MWMA 5CYQA 1RFQA 1Q82O 3LP3A 1XHXA 4C8MA 3H08A 3TAGA 4B08A 3QEXA 5CY4A 4ISFA 4Z4HA 3OYMA 2HMPA 4K0KK 1X1PA 2OCEA 4FK4A 3L0QA 4FXDA 3CJ7A 5ADXA 1NGEA 4E1NA 4H5NA 2A41A 2QTDA 3NFAA 4EP4A 1UA1A 5M1KA 1RBRA 3AAPA 3ASMA 4CIFA 2ZE2A 4OKEA 2BH1A 4FWNA 3CCMN 4DTRA 1VK0A 4BR0A 1ZBLA 3I55N 3KK3A 3VQ4A 5CYMA 2G8HA 4JI8K 2D0AA 3ITHA 1N5YA 4KAZA 1NK7A 4CGIA 4EP5A 3E9LA 3IS9A 4BE2A 3ATVA 3S41A 3H1VX 4ZHRA 5I42A 1RBVA 2CH6A 4M3RA 2O8DA 1A5VA 3IG1A 5AQYA 2QM1A 3DLLL 1C0TA 4DF4A 3THXB 1QSYA 3TTFA 4BDZA 3Q7BA 4B9NA 4CGJA 3A8YA 3J7AP 3P4IA 5BN9A 3MN6A 1GLCG 3LWMA 3MXIA 4CFDA 3U3YA 4NYNA 4EZ6A 1B9DA 3DRPA 2KLAA 2VCPA 4LF9K 4JNEA 2QWPA 1BO5O 4FZZA 4FLUA 1SZ2A 3GL1A 3NGZA 3WEEB 4OX9K 1J53A 2NRZA 3PSIA 4CECA 2QWQA 4EHUA 1GLEG 4FWQA 1NOYA 1IBKK 1FW6A 3ZSXA 3CQ8A 2P9UA 4DR2K 1J54A 1J5OA 2GUIA 3NVMA 5BREA 4DFKA 4N5SA 1NK8A 5JS1A 3P38A 4AHTA 2FF3B 5ADXH 4A2AA 3SMPA 5AQGA 4KPYA 3VA3A 3DOKA 4IEIA 3V6DA 4FJIA 1P8ZA 4CHZA 3U3GA 3RTVA 1ILYA 2ITGA 3NE6A 4YNQA 2Q0RA 3P1GA 5KPTA 2PY5A 4F9OA 2YKNA 4FVUA 4JKAA 1KLMA 4FVMA 2DTUA 4DV7K 3EE9A 1BI4A 1SKRA 1XWLA 4LH4A 3SUNA 1TKXA 4BWMA 1Q7YO 3C6HA 1EX4A 3OBYA 4X62K 4LF5K 4GVEA 3HT3A 1KTQA 3EYZA 3LP2A 1T05A 4J2DA 2QXLA 1LWFA 4CHOA 5JMVA 1VQ5N 4DS4A 2HHVA 2FBXA 4DR1K 4DR5K 5AQIA 4BRLA 1ATRA 1RDCA 3IMXA 2P9PA 1NK0A 4M3UA 4AQYK 3NVKA 3CFPA 4N47A 4LSLA 3ZSZA 3H6EA 4DUZK 3ID8A 4M3XA 4XH4A 3RMAA 2E2OA 1JL1A 1FKPA 2P9NB 2P9KA 4N76A 2DFFA 3SPZA 1ZBHA 3QICA 2HOEA 4JS4A 3RRGA 3RSEB 3ULEA 3SQ1A 5J2QA 5CR4A 2QWMA 3ENBA 3OS2A 1BCMA 2G8WA 1YTAA 3L2QA 1RBUA 4IJNA 4CZJA 4I9QA 1BWFO 1K6YA 1IV0A 1NG9A 3HOTA 1FXXA 1NGJA 4HCCA 4O5BA 3C0BA 5FPNA 3QNOA 2ZWHA 2EHGA 3WNHA 1NJYA 3RMBA 3PV8A 4PA1A 3KLIA 3TSUA 5AQFA 3RMDA 4GKJK 5SZTA 4WFAL 3HSTB 3CMEN 3VQCA 4W5RA 3DAWA 1C1AA 3A5OC 1NGIA 3DXMB 3E9PA 4KHWA 1NLVA 3SUOA 1R59O 4M63C 4DQ8A 2ZGYA 2YKMA 5TKWA 3QIPA 4BG8A 3VETA 3TANA 2HHUA 1HNXK 1JJ2M 4M41A 1HKGA 3TU5A 5KPZA 4F3TA 5GAHP 4CGFA 3MWTA 1SAZA 1OVQA 4YDUA 3AO1A 4E3SA 3TSPA 4H5RA 4WF9L 4YFUA 1V4TA 3T19A 2A6AA 5BRDA 5JVHL 3SJJA 4WE1A 1QHAA 1B9FA 4BREA 3VTHA 1CZBA 4JYAK 4AHUA 1QZ6A 3A5NC 2GX9A 1Q9YA 3J80O 1KLNA 1KVBA 1D9DA 4IG3A 3AO3A 3G0ZA 1DKGD 3DLBA 1WN7A 3D6RA 3RRHA 1NKBA 4GMJB 3ZSWA 4LH5A 1N6QA 1WUAA 4CI6A 2VGMA 1EQYA 2Y1JA 4JI4K 4CJUA 2EWSA 4KHYA 3K5LA 4A61A 2PAVA 3AVJA 1HYVA 1LW0A 2YNGA 4NLCA 2ITMA 1Q81O 2IS3A 5HBMA 3ENHA 1Q9XA 2OTLN 3C94A 1NNEA 3K58A 2P51A 1QSLA 1BG3A 2WUSA 3E66A 4LF8K 3OYBA 4DFJA 4DCHA 4Z4EA 1A5XA 4E7JA 1RT5A 4CGGA 3S3NA 4BQZA 3R6MA 4H0TB 4FM0A 2BE2A 4JK8A 5AQLA 4BR5A 1RILA 4DTSA 5HRSA 4E19A 4JKEA 1YJWN 4H8KA 1SKSA 3KLFA 3IRXA 5A2QO 1VSJA 5J2PA 2KHOA 3SJHA 3CFRA 4IO8A 4Q0BA 4B8CA 3UB5A 3WEEA 1GOBA 2X78A 5KPRA 1BOTO 3OJSA 4NYFA 4IFYA 2Q0UA 3PX6A 2E6LA 5FPDA 4CJWA 3O6WA 2B4JA 1U4BA 2DFEA 4WQ4C 3U9ZA 1N33K 4H0PA 1RNHA 4CIGA 2CGKA 1M1KO 4FL9A 4O8UA 3H45C 3PO4A 3SQ0A 3QEWA 4CD1A 3SUPA 1MWKA 3SCXA 4JRQA 1Z05A 1HX1A 3U6FA 3SLCA 4CF0A 4CZMA 4FO0A 3QIOA 1MDUB 4Y0WA 2D0BA 2YV0X 4AH9A 1BQNA 2YJFA 4DTOA 1HLUA 1QVGM 4JKGB 1IBLK 3OY9A 1UWBA 1WSIA 1NK5A 3V9UA 2I5JA 4I2PA 4JV5K 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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