3CC7N

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation c2487u
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cc7N00
3PIPL 4WCEL 2ZJPL 3CCEN 1YJWN 1Q81O 1Q86O 3CMEN 1VQ4N 3G6EN 5H1SQ 3DLLL 1M1KO 1K9MO 1KQSM 2ZJQL 3I55N 4WFAL 3CC7N 1YI2N 1VQLN 3I56N 1KC8O 3CCQN 1VQKN 1VQ5N 4WFBL 3CXCM 1QVGM 3CCJN 2QA4N 4UY8O 5DM6L 5JVHL 1VQPN 1YIJN 1KD1O 4U67L 4IOAL 4IO9L 1VQON 3CCSN 3CCRN 3CMAN 2OTJN 1NJIO 1YJNN 1K73O 1VQ9N 3CC2N 1W2BM 1VQNN 1M90O 3CCLN 3CD6N 1ILYA 1N8RO 1YHQN 3CCVN 1JJ2M 4IOCL 2OTLN 4WF9L 1K8AO 5DM7L 1YITN 3CC4N 1VQ7N 3G4SN 1Q82O 1VQMN 3OW2M 1YJ9N 1Q7YO 5HL7L 5JVGL 1VQ8N 2QEXN 1S72N 4WFNL 5GAHP 3PIOL 1VQ6N 5GAGP 3G71N 3J7ZO 3CPWM 3CF5L 2ZJRL 5GADP 1OVYA 3CCMN 3CCUN 5GAEP 5MLCQ 1QVFM
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EKEA 3EE8A 2ZJPL 2W41A 4BR2A 3U4LA 2CGKA 4IFEA 1M1KO 4JHDA 1LOTB 1QS4A 1VSMA 1XMOK 1YVNA 3BEXA 2DFEA 4EIAA 3VEOA 4OLAA 5J1EA 2HMIA 4WFAL 1C1AA 2ZGZA 4E7IA 1VK0A 1SL0A 4CIFA 1NGHA 4Z4CA 3CQYA 3C7NB 4DUZK 3DXMB 3RMCA 1NWKA 3DRPA 2QWLA 5ELZA 1DEJA 1L3UA 1TL3A 4UY8O 3NH1A 3W0LA 4Z4EA 4BRGA 2KHOA 3AVIA 1IBLK 4C8LA 5AQXA 4CESA 3T1AA 4LF6K 1RBRA 3CMAN 4BY9C 3V1QA 2F8TA 1JLBA 4M63C 1KLNA 3ZSYA 3ALYA 5KQ8A 3ZETB 1VQ9N 4BR9A 1VSDA 4CHZA 3CCVN 4BR0A 5SWMA 3SPYA 1S9GA 2OANA 3LPUA 2O8FB 3ZSQA 4B1XB 3HTVA 1QQMA 3E9LA 3F5TA 3MEGA 2UYTA 1GOBA 4YDUA 3HM9A 2QW9A 2FXUA 4HUEA 2GX9A 3H3OB 1NK6A 4Y0WA 5AQPA 4DR1K 5GAHP 4KHSA 2P9KA 3O9QA 1HKBA 3M5RA 1XQSC 2YHWA 4JYAK 1NK7A 4L8RB 3UKRB 3MAQA 3TTDA 3VEWA 2CGJA 1DKGD 1KVAA 1ATSA 4YHHK 3NF7A 1CXQA 1W9HA 4CZJA 1K8KB 3CCMN 3O80A 4G9ZA 4XH5A 1JLFA 1NM1A 4LFAK 4CJ7A 3V9UA 4UQGA 2HHUA 4JI7K 3JYTA 3TAPA 1O13A 2P9NA 3P39A 4I7FA 2FSJA 1N34K 3VQBA 1T8EA 1U45A 2E2OA 5M1NA 1JCGA 4CZKA 2VQEK 4LF7K 4FJXA 2NRHA 4DLEA 4JLHA 4LF9K 3CJ9A 1V4TA 4LH4A 1VAZA 4R79A 3FFKB 5C2DA 1BA0A 4YORA 1YTAA 4FJGA 1IKYA 2FBXA 3AVKA 3RWUA 1NGCA 3M6GA 4AQYK 3EKUA 4AHTA 4M45A 5HRRA 3WT0A 4CFBA 1YIJN 4NCBA 4WQ5A 4CK3A 1NGIA 4KI4A 2NUBA 1HLUA 3IDHA 3I8DA 1BL3A 3MK6A 3GBTA 5FPMA 3E9OA 4OKKA 4JNEA 1GLFO 3QINA 3MEEA 1J5OA 4BRPA 1ZBFA 3AVLA 4DTPA 2D4WA 4WQ5C 1S1WA 4DKWA 3CQ8A 4ZHRA 4YOTA 4IOCL 5AQQA 2P9LA 4K0KK 3NVKA 4ICLA 1REVA 4CJTA 1Q8IA 1VQ7N 4LC9B 3J80O 2DPNA 2KKZA 5HL7L 4PKIA 4OX9K 2XY7A 4IFYA 3AA2A 3SYZA 4DFPA 3NHGA 2YJFA 1RBSA 3O4WA 1X9WA 2DTUA 3PIOL 2RKIA 5AQGA 4FPAA 3VGKA 4WE1A 2O8BA 5EU7A 4FJKA 2ZJRL 2FSKA 2ITGA 3KK1A 1WSHA 4E1NA 4KHNA 4DFJA 3RRHA 4KB0A 5C25A 3ZSOA 4FK2A 2VG5A 1ZBUA 2B6AA 5GIPA 3EYZA 1VRUA 1FK9A 3ZCMA 4BE0A 3LM9A 3AVJA 4O5FA 4KHYA 3MN7A 4CHQA 4O8KA 4K43A 1J5EK 3DLLL 4W5TA 1HNWK 2WONA 4A59A 4AHSA 4BRNA 3VEVA 3MCPA 3P38A 3D2FA 4BR7A 2HHVA 2V7ZA 3RVCA 4Z4HA 4CBWA 4O0IA 3NMUA 5CE3A 3T1HK 4JI5K 4H4OA 5M1KA 2QA4N 4JI0K 3ULEA 4PQUA 3A5MC 5CHIA 2O8CA 2I7PA 3TSPA 2E2NA 4RG8A 2W6KA 4KTZA 1S1VA 1VQON 1Q9XA 3DLHA 4H03B 4M3RA 3C6HA 3U6FA 4DR7K 1SL1A 3LDQA 4Z4GA 5LY3A 3VETA 3NH0A 4CF9A 4KKOA 4DQIA 2XO7A 1Y97A 3CD6N 3ZSWA 3HK2A 4I2PA 4FL9A 1E4FT 4OKEA 3VPZA 4FLXA 3SI6A 1NGGA 3CETA 3DJCA 2PBDA 2YHXA 3ZT4A 1VSEA 1OH5A 4CJLA 1E3MA 4ISFA 4K25A 4C8KA 4DR2K 1VQMN 4HVJA 3TI0A 3LPTA 1DTTA 4JRQA 1WNSA 3SV4A 4FWMA 4JKAA 4CFAA 5CYQA 1JLGA 3ATUA 3L2WA 1TV6A 4I6MB 1VHXA 4DHYA 5I42A 3H1VX 5J2PA 1S6QA 3P83D 2HBMA 5AQJA 1OVYA 4M42A 2P9UB 3NAEA 3CJAA 3NF6A 3K59A 4CEAA 3EO3A 5AZJA 3ZT3A 2DFFA 4FVMA 5AQRA 1FXXA 2YKMA 3EEQA 3HSCA 3MECA 1CLQA 5JLHA 1SZ2A 4YOYA 2VWKA 5I9EB 1JL1A 4B08A 3C7NA 3KK7A 3M1FA 2EWSA 2BANA 1FKPA 2NZTA 2V51B 1NKBA 2QKBA 1WBDA 4YOXA 2UXBK 4GMJB 4DF8A 4KHWA 3C65A 2O8EB 4WFBL 1CZBA 3HOTA 3SQ0A 3C94A 3FZHA 1YT3A 4FM0A 4DF4A 3ZETA 4JS5A 4B9UA 2YHAA 3CFPA 5AZIB 3ZT0A 2ZD1A 4JI4K 4KB1A 2WBNA 3DI6A 3CCRN 3N4QA 3PLAA 2UUCK 1W0HA 2FF6A 4AHCA 4CJVA 1ZYQA 2P9PB 1FW6A 2Q31A 2O8FA 3C0BA 1JLEA 3V9SA 2D5RA 3BF3A 1RGIA 1HJOA 1NGFA 3BP8A 1XNRK 4AHRA 3C6UA 1JJ2M 1NKEA 5FPNA 4G1QA 1NK5A 1KFSA 3F73A 2YJEA 4H0VB 4IKFA 1BWFO 3UKRA 2GBZA 3G25A 3OY9A 3ASMA 1RT5A 1WSJA 3CJCA 1XI1A 2F7TA 4ELUA 2QEXN 2HHSA 1G99A 3ENOA 3HL8A 4NXMK 1RBVA 2CH6A 1TYQB 4ISGA 4BC2A 1I3AA 3NVMA 3SZ2A 1BU6O 1JCEA 3O3HA 4ILJA 4CBXA 4JI6K 3TSUA 2DY4A 4DQPA 5B8HA 4PKHA 3FR0A 1QVFM 2VWBA 3OYCA 1BI4A 3FE1A 3SQ4A 1ATRA 3AV9A 1NOYA 4AH9A 1Q18A 1Q86O 1X9MA 1VQ4N 2X6NA 1QHTA 5AQLA 3ZSVA 4AHUA 2PAVA 3JAMO 1NGAA 3IS9A 4BQZA 4J8FA 4HWIA 4LY7A 4KTWA 3NGIA 1TGOA 3A5NC 4BRDA 2W42A 4EP5A 1NK9A 4MDBA 4H0TB 3IAYA 4KHPK 4FK0A 3KK3A 1IKVA 1XWLA 1TKTA 3LALA 4O5BA 3HVRA 1BG3A 4HTUA 1HNVA 1IKXA 2OA8A 3OYBA 1J53A 1C0TA 4EHTA 3TAQA 1LWFA 4YOUA 2H3GX 3QICA 5BRDA 4JKBA 4KH5A 4DB3A 1VRTA 3F9MA 4BE2A 4IOAL 1ITGA 2JLEA 4CGIA 4N47A 3SBTA 1X9SA 2VGNA 5LMUK 4BC3A 4DTMA 3K58A 3HRGA 4E3SA 3WNEA 5AQNA 1DTQA 3M8RA 5AQIA 5F1XA 1SL2A 4OPAA 1B9FA 2Z1IA 3AVCA 3O1WA 4O4GA 3VQAA 1NGEA 2ZQBA 3S3MA 3QFUA 3D45A 1IJJA 4N5SA 3QMLA 4DU1A 2QWOA 1U2VB 3OYFA 5AQOA 1YITN 5LJWA 5C42A 4HHTA 3MCAB 3WNGA 4OPJA 2D0BA 1YJ9N 2R7YA 4NYFA 4XEIA 2VWJA 2RF2A 4CEQA 1EWRA 2Z1GA 3AGKA 3HPGA 1VQ6N 3LDPA 2EHGA 1LW0A 1Q9YA 3MWTA 4MDAA 2IAJA 4CVNE 1V4SA 3VEYA 4B3RK 3TR8A 3HYFA 2KFNA 1WSIA 4DV0K 3LZIA 4GKKK 4DSIA 1BUPA 4FJMA 2Q0RA 4CZLA 4EAHD 3PUFA 5AQUA 1HYSA 3DMJA 2WFBA 3CCEN 2RN2A 2QXLA 3LDLA 2Q36A 4E7HA 4OKJA 3UKUB 2IS3A 3SBGA 1U4BA 3WXLA 5BREA 3OYNA 2Z1JA 2J4RA 3VGLA 2YKNA 2PY5A 5AQTA 1QSSA 3LM2A 4CZGA 3VF6A 1QZ6A 1SKSA 2ZM6K 3MWPA 1P8ZA 5C0YA 4H0YB 3V1OA 4KRFA 2O8DB 4DS5A 3EN9A 1C6VA 4J2EA 3OYJA 4MLHA 3SAFA 4JI8K 3C6AA 3CCJN 1XC9A 3VQ6A 1RDUA 4FZXC 4CGFA 1SKWA 1B9DA 2QI2A 3V1RA 5BRHA 2GTDA 1J6ZA 5FPEA 5A2QO 4DSFA 3HO1A 4FWKA 1HUXA 4B9MA 1KLMA 3NCIA 3CM6A 1T05A 1ZXOA 1U48A 3MN9A 4C8MA 3VQ5A 2HB5A 2X78A 5E41A 4XH1A 1RT6A 3U9ZA 1EX4A 3E1YA 1BCOA 4BRCA 3RMBA 3OHRA 3OJSA 4LSLA 1ILYA 2D0OA 3VQCA 5JS2A 4CJUA 1TKDA 4OJRA 1Y64A 3CQXA 1QQOA 4RW9A 2E20A 4E1JA 4B9SA 4BACA 4JI1K 2ATQA 4I6MA 4HTLA 4OLBA 1GOCA 1NJXA 2BUPA 2HBKA 3UB5A 4WFNL 2FBTA 2GV9A 5KRSA 5C10A 3OYHA 4KBOA 3ULDA 4F8RA 5FPDA 1T6DA 4KTQA 5GINA 2I5JA 4BG9A 1WSGA 1IKWA 2B4JA 1YTUA 4DQRA 4PY5A 3CFOA 2NRRA 4IEIA 5E84A 4DV6K 1XNQK 4H5NA 1MWMA 3BY5A 4W5RA 1RFQA 3FZLA 4FJLA 4E0DA 3MX5A 3LANA 4DR3K 3K5LA 4FK4A 3HP6A 4DV2K 3KD1E 4NB4A 2UUBK 4Z4FA 3V9WA 4LF4K 2F96A 4BRAA 3U9DA 3AVMA 3FGUA 1KQSM 5IWAK 2YCHA 2GUPA 3ZSRA 1TKXA 3K5MA 4L3QA 3HSTB 5AZIA 2HVIA 1IG8A 3CJ7A 1IBMK 4CZEA 4J2AA 2FLOA 5HRPA 4FW2A 1RT2A 1HYVA 3NF8A 5KQDA 2P9PA 1VQPN 3AO3A 4CEBA 4F2RA 4JKGA 5HLFA 4E7JA 3KLHA 2G8KA 1RCHA 1U6ZA 1SQKA 1TAUA 1JL2A 4CZFA 4PWDA 1BDGA 4U7BA 4X65K 4NO7A 2HSTA 4MFBA 3CC2N 4DQ8A 4DV5K 4IDKA 2HBLA 1D8YA 4DU4A 4IJAA 4DSJA 1RT3A 3BGRA 1EO1A 1YHQN 4CJRA 2OYQA 2HMPA 5FRMA 3K5OA 1YUWA 4KI6A 1BHLA 3I8BA 3SJJA 2IVNA 3DRRA 3WNHA 1VSFA 2NRZA 4JKDA 4BGAA 3B6PA 3UE5A 2QXFA 2I7NA 1VQ8N 2NRXA 4A2AA 1DGKN 5EVZA 3CM5A 4BC5A 2HHQA 5HP1A 2HF4A 4JKEA 3HP9A 5AQYA 3ID6A 3VF4A 3VQQA 4CZHA 1D5AA 3PO4A 4DR6K 2FF3B 3HT3A 1GOAA 3VERA 3UIQA 3WEEB 3MX2A 3L2VA 2G8HA 3KLFA 4BRMA 1QE1A 2F9TA 3LDNA 3QBXA 2LSNA 1GLBG 3V9XA 5J2NA 4LFBK 3S3NA 2CH5A 3ITHA 4QOZB 3E01A 3HOSA 4OVLA 4JD2B 3QEPA 3M3ZA 3LDSA 3O9SA 4IEEA 3WXMB 2NRVA 4BR4A 3LWLA 1KCFA 1TK8A 1HRHA 2E5LK 3NFAA 2P9IB 3SUOA 2WUSA 3L6QA 2WC9A 3LWMA 4CJFA 2VG7A 3KD5E 2D0PA 1JLCA 2A6AA 1CZAN 4I2QA 4PHTX 3MDQA 3ATVA 3ZSZA 1ZBHA 1OH6A 1NK8A 1D9FA 4FJIA 1WLJA 2KLAA 1QSYA 4K8ZA 5JVHL 4F2SA 3NGZA 5BPMA 4CEEA 5C15A 3L2UA 2PYJA 4GW6A 3OA9A 3MXMA 5TKWA 1C0UA 1U2VA 4E7KA 3ID8A 4DTUA 1YVUA 4A2BA 4PA1A 3WQUA 1W2BM 3SK3A 4MLEA 3AY9A 3RTVA 2GWKA 3A0IX 4Z0UA 3HBTA 2X74A 4FSVA 3CCLN 3AVBA 3OYDA 5DMRA 3O3FA 1RDWX 4E19A 1T7PA 1K8AO 4C23A 1DT9A 3GOIA 3CC4N 3TPQA 4DMNA 4LF5K 1S1UA 5JVGL 1XMQK 3VQ9A 4KAZA 4B9QA 1SUQA 4Y1DA 5GAGP 2Q0UA 3G71N 2GUIA 4FWQA 2QM1A 3MMVA 3J7ZO 1HX1A 4DCHA 1XHZA 4A5AA 3CPWM 3CF5L 1EETA 3DRSA 4BGBA 4DFKA 3NGYA 4ID1A 2EX3A 3UKUA 3C95A 3AVGA 3S9HA 3V4IA 1RDCA 2F8SA 2VG6A 2YNIA 4YOWA 3KLEA 1WAFA 3AO4A 4O8UA 3S3OA 4ZTJA 3BDPA 1X9JA 1YJWN 5BPLA 1IH7A 2A1SA 1NNEA 4CJQA 5IT9O 1G15A 1KVBA 2P1JA 2OPPA 4DG1A 5HRSA 2O8DA 5H1SQ 4CEZA 3WXJA 4ELTA 1N32K 3A5LC 3L4IA 3NDKA 4QS9A 2W40A 3TU5A 1WAJA 4B9TA 1WB9A 3CC7N 3RRGA 1I94K 3I56N 4K42A 1R59O 3R8EA 3VQ7A 1OKJA 3VEZA 3TWHA 3TAFA 1KAYA 3KVGA 4W5QA 4FJ5A 4Z94A 1KFDA 5BN8A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1EKE A;  3EE8 A;  2ZJP L;  2W41 A;  4BR2 A;  3U4L A;  2CGK A;  4IFE A;  1M1K O;  4JHD A;  1LOT B;  1QS4 A;  1VSM A;  1XMO K;  1YVN A;  3BEX A;  2DFE A;  4EIA A;  3VEO A;  4OLA A;  5J1E A;  2HMI A;  4WFA L;  1C1A A;  2ZGZ A;  4E7I A;  1VK0 A;  1SL0 A;  4CIF A;  1NGH A;  4Z4C A;  3CQY A;  3C7N B;  4DUZ K;  3DXM B;  3RMC A;  1NWK A;  3DRP A;  2QWL A;  5ELZ A;  1DEJ A;  1L3U A;  1TL3 A;  4UY8 O;  3NH1 A;  3W0L A;  4Z4E A;  4BRG A;  2KHO A;  3AVI A;  1IBL K;  4C8L A;  5AQX A;  4CES A;  3T1A A;  4LF6 K;  1RBR A;  3CMA N;  4BY9 C;  3V1Q A;  2F8T A;  1JLB A;  4M63 C;  1KLN A;  3ZSY A;  3ALY A;  5KQ8 A;  3ZET B;  1VQ9 N;  4BR9 A;  1VSD A;  4CHZ A;  3CCV N;  4BR0 A;  5SWM A;  3SPY A;  1S9G A;  2OAN A;  3LPU A;  2O8F B;  3ZSQ A;  4B1X B;  3HTV A;  1QQM A;  3E9L A;  3F5T A;  3MEG A;  2UYT A;  1GOB A;  4YDU A;  3HM9 A;  2QW9 A;  2FXU A;  4HUE A;  2GX9 A;  3H3O B;  1NK6 A;  4Y0W A;  5AQP A;  4DR1 K;  5GAH P;  4KHS A;  2P9K A;  3O9Q A;  1HKB A;  3M5R A;  1XQS C;  2YHW A;  4JYA K;  1NK7 A;  4L8R B;  3UKR B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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